source/unres/src_MD-M-newcorr/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES with MD for single chains
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # build the xdrf library
   9 #================================
  10 #add_subdirectory(xdrf)
  11
  12 #================================
  13 # Set source file lists
  14 #================================
  15 set(UNRES_MDM_SRC0
  16         add.f
  17         arcos.f
  18         banach.f
  19         bank.F
  20         blas.f
  21         bond_move.f
  22         cartder.F
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         check_bond.f
  26         checkder_p.F
  27         check_sc_distr.f
  28         compare_s1.F
  29         contact.f
  30         convert.f
  31         cored.f
  32         csa.f
  33         dihed_cons.F
  34         diff12.f
  35         distfit.f
  36         djacob.f
  37         econstr_local.F
  38         elecont.f
  39         energy_split-sep.F
  40         entmcm.F
  41         fitsq.f
  42         gauss.f
  43         gen_rand_conf.F
  44         geomout.F
  45         gnmr1.f
  46         indexx.f
  47         initialize_p.F
  48         intcartderiv.F
  49         intcor.f
  50         intlocal.f
  51         int_to_cart.f
  52         kinetic_lesyng.f
  53         lagrangian_lesyng.F
  54         local_move.f
  55         map.f
  56         matmult.f
  57         mc.F
  58         mcm.F
  59         MD_A-MTS.F
  60         minimize_p.F
  61         minim_jlee.F
  62         minim_mcmf.F
  63         misc.f
  64         moments.f
  65         MP.F
  66         MREMD.F
  67         muca_md.f
  68         newconf.f
  69         parmread.F
  70         permut.F
  71         pinorm.f
  72         printmat.f
  73         q_measure.F
  74         ran.f
  75         randgens.f
  76         rattle.F
  77         readpdb.F
  78         readrtns_CSA.F
  79         refsys.f
  80         regularize.F
  81         rescode.f
  82         rmdd.f
  83         rmsd.F
  84         sc_move.F
  85         shift.F
  86         sort.f
  87         stochfric.F
  88         sumsld.f
  89         surfatom.f
  90         test.F
  91         thread.F
  92         timing.F
  93         together.F
  94         unres.F
  95 )
  96
  97 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  98   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng.f )
  99 elseif(Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "mpif90")
 100   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng.f )
 101 else()
 102   set(UNRES_MDM_SRC0 ${UNRES_MDM_SRC0} prng_32.F )
 103 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 104
 105 set(UNRES_MDM_SRC2 eigen.f)
 106 set(UNRES_MDM_SRC3 energy_p_new_barrier.F energy_p_new-sep_barrier.F gradient_p.F )
 107
 108 set(UNRES_MDM_PP_SRC
 109         bank.F
 110         cartder.F
 111         chainbuild.F
 112         checkder_p.F
 113         compare_s1.F
 114         cored.f
 115         csa.f
 116         dihed_cons.F
 117         diff12.f
 118         econstr_local.F
 119         energy_p_new.F
 120         energy_p_new_barrier.F
 121         energy_p_new-sep_barrier.F
 122         energy_split-sep.F
 123         entmcm.F
 124         gen_rand_conf.F
 125         geomout.F
 126         gradient_p.F
 127         intcor.f
 128         initialize_p.F
 129         intcartderiv.F
 130         lagrangian_lesyng.F
 131         matmult.f
 132         mc.F
 133         mcm.F
 134         MD_A-MTS.F
 135         minimize_p.F
 136         minim_jlee.F
 137         minim_mcmf.F
 138         MP.F
 139         MREMD.F
 140         newconf.f
 141         parmread.F
 142         permut.F
 143         q_measure1.F
 144         q_measure3.F
 145         q_measure.F
 146         ran.f
 147         rattle.F
 148         readpdb.F
 149         readrtns_CSA.F
 150         regularize.F
 151         rmdd.f
 152         rmsd.F
 153         sc_move.F
 154         shift.F
 155         stochfric.F
 156         sumsld.f
 157         test.F
 158         thread.F
 159         timing.F
 160         together.F
 161         unres.F
 162         proc_proc.c
 163 )
 164
 165
 166 if(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 167   set(UNRES_MDM_PP_SRC "${UNRES_MDM_PP_SRC} prng_32.F")
 168 endif(NOT Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 169
 170
 171 #================================================
 172 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 173 #================================================
 174 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 175   set(FFLAGS0 "-CB -g -ip -w" )
 176   set(FFLAGS1 "-w -g " )
 177   set(FFLAGS2 "-w -g -00 ")
 178   set(FFLAGS3 "-CB -g -w -ipo  " )
 179 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 180   set(FFLAGS0 "-std=legacy -I. " )
 181   set(FFLAGS1 "-std=legacy -g -I. " )
 182   set(FFLAGS2 "-std=legacy -I. ")
 183   set(FFLAGS3 "-std=legacy -I. " )
 184 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 185
 186
 187 # Add MPI compiler flags
 188 if(UNRES_WITH_MPI)
 189   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 190   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 191   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 192   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 193 endif(UNRES_WITH_MPI)
 194
 195 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC0} APPEND PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 196 set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 197 set_property(SOURCE ${UNRES_MD_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 198 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 199
 200 #=========================================
 201 # Settings for GAB force field
 202 #=========================================
 203 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 204   # set preprocesor flags
 205   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB -DNEWCORR" )
 206
 207 #=========================================
 208 #  Settings for E0LL2Y force field
 209 #=========================================
 210 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 211   # set preprocesor flags
 212   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DSCCORPDB -DNEWCORR" )
 213 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 214
 215
 216 #=========================================
 217 # System specific flags
 218 #=========================================
 219 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 220   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 221 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 222
 223
 224 #=========================================
 225 # Compiler specific flags
 226 #=========================================
 227
 228 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 229   # Add ifort preprocessor flags
 230   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 231 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 232   # Add new gfortran flags
 233   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 234 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 235   # Add old gfortran flags
 236   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 237 else (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 238   # Default preprocessor flags
 239   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 240 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 241
 242
 243 #=========================================
 244 # Add MPI preprocessor flags
 245 #=========================================
 246 if (UNRES_WITH_MPI)
 247   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 248 endif(UNRES_WITH_MPI)
 249
 250
 251 # add 64-bit specific preprocessor flags
 252 if (architektura STREQUAL "64")
 253   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 254 endif (architektura STREQUAL "64")
 255
 256
 257
 258 # Apply preprocesor flags to *.F files
 259 set_property(SOURCE ${UNRES_MDM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 260
 261 # Apply preprocesor flags to proc_proc.c
 262 set_property(SOURCE proc_proc.c PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS "SGI" )
 263
 264
 265 #========================================
 266 #  Setting binary name
 267 #========================================
 268 if(UNRES_WITH_MPI)
 269   # binary with mpi
 270   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPICH_${UNRES_FF}.exe")
 271 else(UNRES_WITH_MPI)
 272   # binary without mpi
 273   set(UNRES_BIN "unres_${Fortran_COMPILER_NAME}_single_${UNRES_FF}.exe")
 274 endif(UNRES_WITH_MPI)
 275
 276 #=========================================
 277 # cinfo.f workaround for cmake
 278 #=========================================
 279 # get the current date
 280 TODAY(DATE)
 281 # generate cinfo.f
 282 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 283 FILE(WRITE ${CINFO}
 284 "C CMake generated file
 285        subroutine cinfo
 286        include 'COMMON.IOUNITS'
 287        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 288        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 289 ")
 290
 291 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 292 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 293 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 294 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 295 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 296 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 297 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 298
 299 FILE(APPEND ${CINFO}
 300 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 301        return
 302        end ")
 303
 304
 305 # add include path
 306 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}")
 307
 308 #=========================================
 309 # Set full unres MD-M sources
 310 #=========================================
 311 set(UNRES_MDM_SRCS ${UNRES_MDM_SRC0} ${UNRES_MDM_SRC2} ${UNRES_MDM_SRC3} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c )
 312
 313 #=========================================
 314 # Build the binary
 315 #=========================================
 316 add_executable(UNRES_BIN-MD-M ${UNRES_MDM_SRCS} )
 317 set_target_properties(UNRES_BIN-MD-M PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 318
 319 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 320 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 321
 322 #=========================================
 323 # Link libraries
 324 #=========================================
 325 # link MPI library (libmpich.a)
 326 if(UNRES_WITH_MPI)
 327   target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M ${MPIF_LIBRARIES} )
 328 endif(UNRES_WITH_MPI)
 329 # link libxdrf.a
 330 #message("UNRES_XDRFLIB=${UNRES_XDRFLIB}")
 331 target_link_libraries( UNRES_BIN-MD-M xdrf )
 332
 333 #=========================================
 334 # TESTS
 335 #=========================================
 336
 337 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 338 #SET(UNRES_TEST_FILES
 339 #       ala10.inp
 340 #    )
 341
 342 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 343 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 344 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 345 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 346 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 347 #          POST_BUILD
 348 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 349 #      )
 350 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 351
 352 #=========================================
 353 # Generate data test files
 354 #=========================================
 355
 356 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 357
 358 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 359
 360 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 361