c0a3592e798609724945dfe7b72d0df86941e3a2
[unres.git] / source / unres / src_CSA / CMakeLists.txt
1 #
2 # CMake project file for UNRES CSA version
3
4
5 enable_language (Fortran)
6
7 #================================
8 # Set source file lists
9 #================================
10 set(UNRES_CSA_SRC0 
11         arcos.f
12         banach.f
13         bank.F
14         cartder.F
15         cartprint.f
16         chainbuild.F
17         checkder_p.F
18         contact.f
19         convert.f
20         cored.f
21         csa.F
22         dfa.F
23         diff12.f
24         distfit.f
25         djacob.f
26         econstr_local.F
27         elecont.f
28         energy_p_new_barrier.F
29         fitsq.f
30         gen_rand_conf.F
31         geomout_min.F
32         gradient_p.F
33         indexx.f
34         initialize_p.F
35         intcartderiv.F
36         intcor.f
37         intlocal.f
38         int_to_cart.f
39         local_move.f
40         matmult.f
41         minimize_p.F
42         minim_jlee.F
43         minim_mult.F
44         misc.f
45         MP.F
46         newconf.F
47         parmread.F
48         pinorm.f
49         printmat.f
50         prng_32.F
51         randgens.f
52         ran.f
53         readpdb.F
54         readrtns_csa.F
55         refsys.f
56         rescode.f
57         rmdd.f
58         rmsd.F
59         sc_move.F
60         shift.F
61         sumsld.f
62         test.F
63         timing.F
64         TMscore_subroutine.f
65         together.F
66         unres_csa.F
67         gnmr1.f        
68 )
69
70 set(UNRES_CSA_SRC3 energy_p_new_barrier.F gradient_p.F )
71
72 set(UNRES_CSA_PP_SRC
73         bank.F
74         cartder.F
75         chainbuild.F
76         checkder_p.F
77         csa.F
78         dfa.F
79         econstr_local.F
80         energy_p_new_barrier.F
81         gen_rand_conf.F
82         geomout_min.F
83         gradient_p.F
84         initialize_p.F
85         intcartderiv.F
86         minimize_p.F
87         minim_jlee.F
88         minim_mult.F
89         MP.F
90         newconf.F
91         parmread.F
92         prng_32.F
93         readpdb.F
94         readrtns_csa.F
95         rmsd.F
96         sc_move.F
97         shift.F
98         test.F
99         timing.F
100         together.F
101         unres_csa.F
102
103
104
105 #================================================
106 # Set comipiler flags for different sourcefiles  
107 #================================================
108 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
109   set(FFLAGS0 "-c -ip -w" ) 
110   set(FFLAGS1 "-c -w -g -d2 -CA -CB" ) 
111   set(FFLAGS2 "-c -w -g -00 ")
112   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
113   set(FFLAGS3 "-c -w -ipo " )
114 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
115   set(FFLAGS0 "-std=legacy -cpp -c -I. ") 
116   set(FFLAGS1 "-std=legacy -cpp -c -g -I. " ) 
117   set(FFLAGS2 "-std=legacy -cpp -c -I. ")
118   set(FFLAGS3 "-cpp -c -I. " )
119 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
120
121
122 # Add MPI compiler flags
123 if(UNRES_WITH_MPI)
124   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
125   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
126   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
127   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
128 endif(UNRES_WITH_MPI)
129
130 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
131 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
132 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
133 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
134
135 #=========================================
136 # Settings for CSA force fields 
137 #=========================================
138
139 if(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP3" )
140   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DCRYST_TOR" )
141 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "ALPHA")
142   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
143 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "BETA")
144   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
145 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "ALPHABETA")
146   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
147 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP5")
148   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
149 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "3P")
150   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DSCCORPDB" )
151 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "4P")
152   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DSCCORPDB" )
153 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "GAB" )
154   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
155 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "E0LL2Y" )
156   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0" )
157 endif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP3")
158
159 #=========================================
160 # System specific flags
161 #=========================================
162 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
163   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX") 
164 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
165
166 #=========================================
167 # Compiler specific flags
168 #=========================================
169
170 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
171   # Add ifort preprocessor flags
172   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI") 
173 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
174   # Add new gfortran flags
175   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77") 
176 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
177   # Add old gfortran flags
178   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77") 
179 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
180
181 #=========================================
182 # Add MPI preprocessor flags
183 #=========================================
184 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI") 
185
186 #=========================================
187 # add 64-bit specific preprocessor flags
188 #=========================================
189 if (architektura STREQUAL "64")
190   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
191 endif (architektura STREQUAL "64")
192
193 # Apply preprocesor flags to *.F files
194 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )  
195
196
197 #========================================
198 #  Setting binary name
199 #========================================
200 set(UNRES_BIN "unresCSA_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPI_${UNRES_CSA_FF}.exe")
201
202 #=========================================
203 # cinfo.f workaround for CMake
204 #=========================================
205 # get the current date  
206 TODAY(DATE)
207 # generate cinfo.f
208
209 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
210 FILE(WRITE ${CINFO}
211 "C CMake generated file
212        subroutine cinfo
213        include 'COMMON.IOUNITS'
214        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
215        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
216 ")
217
218 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
219 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
220 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
221 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
222 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
223 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
224 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
225
226 FILE(APPEND ${CINFO} 
227 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'  
228        return 
229        end ")
230
231 # set include path
232 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
233
234 #=========================================
235 # Set full unres CSA sources
236 #=========================================
237 set(UNRES_CSA_SRCS ${UNRES_CSA_SRC0} ${UNRES_CSA_SRC3} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f )
238
239 #=========================================
240 # Build the binary
241 #=========================================
242 add_executable(UNRES_BIN-CSA ${UNRES_CSA_SRCS} )
243 set_target_properties(UNRES_BIN-CSA PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
244 set_property(TARGET UNRES_BIN-CSA PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
245 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
246
247 #=========================================
248 # Link libraries
249 #=========================================
250 # link MPI library (libmpich.a)  
251 target_link_libraries( UNRES_BIN-CSA ${MPI_Fortran_LIBRARIES} )
252 # link libxdrf.a 
253 #target_link_libraries( ${UNRES_BIN} xdrf )
254
255 #=========================================
256 # Install Path
257 #=========================================
258 install(TARGETS UNRES_BIN-CSA DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/unres/CSA)
259
260
261 #=========================================
262 # TESTS 
263 #=========================================
264
265 if(UNRES_CSA_FF STREQUAL "4P")
266
267 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1l2y_csa_4P.inp
268         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
269
270 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1l2y_csa_local_4P.inp
271         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
272
273 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1l2y_csa_local_4P.CSA.native.int
274         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
275
276
277 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/csa_energy_check.sh
278         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}
279         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
280 )
281
282
283 #=========================================
284 #  test_csa_4P.sh
285 #=========================================
286
287 FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/test_csa_4P.sh
288 "#!/bin/sh
289 export POT=GB
290 export FGPROCS=1
291 export PREFIX=$1
292 #-----------------------------------------------------------------------------
293 UNRES_BIN=${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/${UNRES_BIN}
294 #-----------------------------------------------------------------------------
295 DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
296 export BONDPAR=$DD/bond.parm
297 export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
298 export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
299 export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
300 export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
301 export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
302 export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.4P5_iter33_3r
303 export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
304 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
305 export SCCORPAR=$DD/sccor_am1_pawel.dat
306 export SCPPAR=$DD/scp.parm
307 export PATTERN=$DD/patterns.cart
308 export PRINT_PARM=NO
309 #-----------------------------------------------------------------------------
310 echo CTEST_FULL_OUTPUT
311 $UNRES_BIN
312 ./csa_energy_check.sh $1
313 ")
314
315 #
316 # File permissions workaround
317 #
318 FILE(   COPY ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/test_csa_4P.sh
319         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}
320         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
321 )
322 endif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "4P")
323
324 if(UNRES_CSA_FF STREQUAL "E0LL2Y")
325
326 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1l2y_csa.inp
327         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
328
329 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1l2y_csa_local.inp
330         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
331
332 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1l2y_csa_local.CSA.native.int
333         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
334
335
336 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/csa_energy_check.sh
337         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}
338         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
339 )
340
341
342 #=========================================
343 #  test_csa_E0LL2Y.sh
344 #=========================================
345
346 FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/test_csa_E0LL2Y.sh
347 "#!/bin/sh
348 export POT=GB
349 export FGPROCS=1
350 export PREFIX=$1
351 #-----------------------------------------------------------------------------
352 UNRES_BIN=${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/${UNRES_BIN}
353 #-----------------------------------------------------------------------------
354 DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
355 export BONDPAR=$DD/bond_AM1.parm
356 export THETPAR=$DD/theta_abinitio.parm
357 export ROTPAR=$DD/rotamers_AM1_aura.10022007.parm
358 export THETPARPDB=$DD/thetaml.5parm   
359 export ROTPARPDB=$DD/scgauss.parm
360 export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
361 export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
362 export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
363 export SIDEPAR=$DD/scinter_$POT.parm
364 export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
365 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
366 export SCCORPAR=$DD/sccor_am1_pawel.dat
367 export SCPPAR=$DD/scp.parm
368 export PATTERN=$DD/patterns.cart
369 export PRINT_PARM=NO
370 #-----------------------------------------------------------------------------
371 echo CTEST_FULL_OUTPUT
372 $UNRES_BIN
373 ./csa_energy_check.sh $1
374 ")
375
376 #
377 # File permissions workaround
378 #
379 FILE(   COPY ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/test_csa_E0LL2Y.sh
380         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}
381         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
382 )
383 endif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "E0LL2Y")
384
385
386
387 # Add tests
388
389 #  MESSAGE (STATUS "${MPI_Fortran_LIBRARIES}")
390   if ("${MPI_Fortran_LIBRARIES}"  MATCHES "lam")
391      MESSAGE (STATUS "LAM MPI library detected")
392      set (boot_lam "-boot")
393   else()
394      set (boot_lam "")
395   endif()
396
397
398   if (UNRES_SRUN)
399    set (np "-n")
400    set (mpiexec "srun")
401   elseif(UNRES_MPIRUN)
402    set (np "-np")
403    set (mpiexec "mpirun")
404   else()
405    set (np "-np")
406    set (mpiexec "mpiexec")
407   endif()
408
409
410 if(UNRES_CSA_FF STREQUAL "4P")
411     add_test(NAME UNRES_CSA_global COMMAND ${mpiexec} ${boot_lam} ${np} 4 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_csa_4P.sh 1l2y_csa_4P )
412     add_test(NAME UNRES_CSA_local COMMAND ${mpiexec} ${boot_lam} ${np} 4 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_csa_4P.sh 1l2y_csa_local_4P )
413 endif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "4P")
414
415 if(UNRES_CSA_FF STREQUAL "E0LL2Y")
416     add_test(NAME UNRES_CSA_global_E0LL2Y COMMAND ${mpiexec} ${boot_lam} ${np} 4 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_csa_E0LL2Y.sh 1l2y_csa )
417     add_test(NAME UNRES_CSA_local_E0LL2Y COMMAND ${mpiexec} ${boot_lam} ${np} 4 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_csa_E0LL2Y.sh 1l2y_csa_local )
418 endif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "E0LL2Y")
419
420