source/unres/src-HCD-5D/DIMENSIONS

   1 ********************************************************************************
   2 * Settings for the program of united-residue peptide simulation in real space  *
   3 *                                                                              *
   4 *                -------  As of 6/23/01 -----------                            *
   5 *                                                                              *
   6 ********************************************************************************
   7 C Max. number of processors.
   8       integer maxprocs
   9       parameter (maxprocs=2048)
  10 C Max. number of fine-grain processors
  11       integer max_fg_procs
  12 c      parameter (max_fg_procs=16)
  13       parameter (max_fg_procs=256)
  14 C Max. number of coarse-grain processors
  15       integer max_cg_procs
  16       parameter (max_cg_procs=maxprocs)
  17 C Max. number of AA residues
  18       integer maxres
  19       parameter (maxres=10000)
  20 C Max. number of AA residues per chain
  21       integer maxres_chain
  22       parameter (maxres_chain=1200)
  23 C Max. number of cysteines and other bridging residues
  24       integer max_cyst
  25       parameter (max_cyst=100)
  26 C Appr. max. number of interaction sites
  27       integer maxres2,maxres6,maxres2_chain,mmaxres2_chain
  28       parameter (maxres2=2*maxres,maxres6=6*maxres)
  29       parameter (maxres2_chain=2*maxres_chain,
  30      &           mmaxres2_chain=maxres2_chain*(maxres2_chain+1)/2)
  31 C Max number of symetric chains
  32       integer maxchain
  33       parameter (maxchain=50)
  34       integer maxperm
  35       parameter (maxperm=5040)
  36 C Max. number of variables
  37       integer maxvar
  38       parameter (maxvar=6*maxres)
  39 C Max. number of groups of interactions that a given SC is involved in
  40       integer maxint_gr
  41       parameter (maxint_gr=2)
  42 C Max. number of derivatives of virtual-bond and side-chain vectors in theta
  43 C or phi.
  44       integer maxdim
  45 c      parameter (maxdim=(maxres_chain-1)*(maxres_chain-2)/2)
  46       parameter (maxdim=(maxres-1)*(maxres-2)/2)
  47 C Max. number of SC contacts
  48       integer maxcont
  49       parameter (maxcont=12*maxres)
  50 C Max. number of contacts per residue
  51       integer maxconts
  52       parameter (maxconts=maxres)
  53 c      parameter (maxconts=50)
  54 C Max. number of interactions within cutoff per residue
  55       integer maxint_res
  56       parameter (maxint_res=200)
  57 C Max. number od residues within distance cufoff from a given residue to
  58 C     include in template-based/contact distance restraints.
  59       integer maxcont_res
  60       parameter (maxcont_res=200)
  61 C Max. number of distance/contact-distance restraints
  62       integer maxdim_cont
  63       parameter (maxdim_cont=maxres*maxcont_res)
  64 C Number of AA types (at present only natural AA's will be handled
  65       integer ntyp,ntyp1
  66       parameter (ntyp=24,ntyp1=ntyp+1)
  67 C Max. number of types of dihedral angles & multiplicity of torsional barriers
  68 C and the number of terms in double torsionals
  69       integer maxtor,maxterm,maxlor,maxtermd_1,maxtermd_2,maxtor_kcc,
  70      & maxval_kcc
  71       parameter (maxtor=4,maxterm=10,maxlor=3,maxtermd_1=8,maxtermd_2=8)
  72       parameter (maxtor_kcc=6,maxval_kcc=6)
  73 c Max number of new valence-angle (only) terms
  74       integer maxang_kcc
  75       parameter (maxang_kcc=36)
  76 C Max. number of residue types and parameters in expressions for
  77 C virtual-bond angle bending potentials
  78       integer maxthetyp,maxthetyp1,maxtheterm,maxtheterm2,maxtheterm3,
  79      &  maxsingle,maxdouble,mmaxtheterm
  80       parameter (maxthetyp=3,maxthetyp1=maxthetyp+1,maxtheterm=20,
  81      & maxtheterm2=6,maxtheterm3=4,maxsingle=6,maxdouble=4,
  82      & mmaxtheterm=maxtheterm)
  83 c Max number of torsional terms in SCCOR
  84       integer maxterm_sccor
  85       parameter (maxterm_sccor=6)
  86 C Max. number of lobes in SC distribution
  87       integer maxlob
  88       parameter (maxlob=4)
  89 C Max. number of S-S bridges and other links
  90       integer maxss
  91 c      parameter (maxss=20)
  92       parameter (maxss=max_cyst*(max_cyst-1)/2)
  93 C Max. number of dihedral angle constraints
  94       integer maxdih_constr
  95       parameter (maxdih_constr=maxres)
  96 C Max. number of patterns in the pattern database
  97       integer maxseq
  98       parameter (maxseq=10)
  99 C Max. number of residues in a peptide in the database
 100       integer maxres_base
 101       parameter (maxres_base=10)
 102 C Max. number of threading attempts
 103       integer maxthread
 104       parameter (maxthread=20)
 105 C Max. number of move types in MCM
 106       integer maxmovetype
 107       parameter (maxmovetype=4)
 108 C Max. number of stored confs. in MC/MCM simulation
 109       integer maxsave
 110       parameter (maxsave=20)
 111 C Max. number of energy intervals
 112       integer max_ene
 113       parameter (max_ene=10)
 114 C Max. number of conformations in Master's cache array
 115       integer max_cache
 116       parameter (max_cache=10)
 117 C Max. number of conformations in the pool
 118       integer max_pool
 119       parameter (max_pool=10)
 120 C Number of energy components
 121       integer n_ene,n_ene2
 122       parameter (n_ene=31,n_ene2=2*n_ene)
 123 C Number of threads in deformation
 124       integer max_thread,max_thread2
 125       parameter (max_thread=4,max_thread2=2*max_thread)
 126 C Number of structures to compare at t=0
 127       integer max_threadss,max_threadss2
 128       parameter (max_threadss=8,max_threadss2=2*max_threadss)
 129 C Maxmimum number of angles per residue
 130       integer mxang
 131       parameter (mxang=4)
 132 C Maximum number of groups of angles
 133       integer mxgr
 134       parameter (mxgr=2*maxres)
 135 C Maximum number of chains
 136       integer mxch
 137       parameter (mxch=1)
 138 C Maximum number of generated conformations
 139       integer mxio
 140       parameter (mxio=2)
 141 C Maximum number of n7 generated conformations
 142       integer mxio2
 143       parameter (mxio2=2)
 144 C Maximum number of moves (n1-n8)
 145       integer mxmv
 146       parameter (mxmv=18)
 147 C Maximum number of seed
 148       integer max_seed
 149       parameter (max_seed=1)
 150 C Maximum number of timesteps for which stochastic MD matrices can be stored
 151       integer maxflag_stoch
 152       parameter (maxflag_stoch=0)
 153 C Maximum number of backbone fragments in restraining
 154       integer maxfrag_back
 155       parameter (maxfrag_back=4)
 156 C Maximum number of SC local term fitting function coefficiants
 157       integer maxsccoef
 158       parameter (maxsccoef=65)
 159 C Maximum number of terms in SC bond-stretching potential
 160       integer maxbondterm
 161       parameter (maxbondterm=3)
 162 C Maximum number of conformation stored in cache on each CPU before sending
 163 C to master; depends on nstex / ntwx ratio
 164       integer max_cache_traj
 165       parameter (max_cache_traj=10)
 166 C Maximum number of bins in SAXS restraints
 167       integer MaxSAXS
 168       parameter (MaxSAXS=1000)
 169 C Maximum number of templates in homology-modeling restraints
 170       integer max_template
 171       parameter(max_template=50)
 172 c Maximum number of clusters of templates containing same fragments
 173       integer maxclust
 174       parameter(maxclust=1000)