examples/unres/CSA/4P/start.mat

   1 #PBS -N global_1l2y_csa
   2 #PBS -q special
   3 #PBS -l nodes=8:ppn=4
   4 #PBS -l walltime=168:00:00
   5
   6 setenv MPIRUN "/users/software/mpich2-1.4.1p1_gnu/bin/mpirun "
   7 setenv NPROCS `cat $PBS_NODEFILE | wc -l`
   8
   9 cd $PBS_O_WORKDIR
  10
  11 setenv FGPROCS 1
  12 setenv POT GB
  13 setenv PREFIX 1l2y_csa
  14 setenv OUT1FILE NO
  15 #-----------------------------------------------------------------------------
  16 setenv UNRES_BIN /users2/czarek/UNRES/GIT/unres/bin/unres/CSA/unres_csa_gfort_MPICH_4P.exe
  17 setenv LD_LIBRARY_PATH /users/software/mpich2-1.4.1p1_gnu/lib:$LD_LIBRARY_PATH
  18 #-----------------------------------------------------------------------------
  19 setenv DD /users2/czarek/UNRES/GIT/unres/PARAM
  20 setenv BONDPAR $DD/bond.parm
  21 setenv THETPAR $DD/thetaml.5parm
  22 setenv ROTPAR $DD/scgauss.parm
  23 setenv TORPAR $DD/torsion_631Gdp.parm
  24 setenv TORDPAR $DD/torsion_double_631Gdp.parm
  25 setenv ELEPAR $DD/electr_631Gdp.parm
  26 setenv SIDEPAR $DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
  27 setenv FOURIER $DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
  28 setenv SCCORPAR $DD/rotcorr_AM1.parm
  29 setenv SCPPAR $DD/scp.parm
  30 setenv PATTERN $DD/patterns.cart
  31 setenv PRINT_PARM NO
  32 #-----------------------------------------------------------------------------
  33
  34 $MPIRUN -rmk pbs $UNRES_BIN
  35