FC = ifort
OPT = -O3 -ip -w
OPT = -CB -g
-FFLAGS = ${OPT} -c -I. -I../src_MD_T-sccor/include_unres -I../src_MD_T-sccor -I/users/adam/MEY_MD/src_Tc-czarek -I$(INSTALL_DIR)/include
+<<<<<<< HEAD
+FFLAGS = ${OPT} -c -I. -Iinclude_unres -I$(INSTALL_DIR)/include
CPPFLAGS = -DLINUX -DPGI -DSPLITELE -DPROCOR -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DMP -DMPI
-LIBS = -L$(INSTALL_DIR)/lib -lmpich ../../../wham/src/xdrf/libxdrf.a -g -d2 -CA -CB
+LIBS = -L$(INSTALL_DIR)/lib -lmpich xdrf/libxdrf.a -g -d2 -CA -CB
+=======
+FFLAGS = ${OPT} -c -I. -I./include_unres -I../src_MD_T-sccor -I/users/adam/MEY_MD/src_Tc-czarek -I$(INSTALL_DIR)/include
+CPPFLAGS = -DLINUX -DPGI -DSPLITELE -DPROCOR -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DMP -DMPI
+LIBS = -L$(INSTALL_DIR)/lib -lmpich ./xdrf/libxdrf.a -g -d2 -CA -CB
+>>>>>>> devel
.c.o:
cc -c -DLINUX -DPGI $*.c
geomout.o readpdb.o read_coords.o parmread.o probabl.o fitsq.o hc.o \
track.o wrtclust.o srtclust.o noyes.o contact.o printmat.o \
int_from_cart1.o energy_p_new.o icant.o proc_proc.o work_partition.o \
- setup_var.o read_ref_str.o
+ setup_var.o read_ref_str.o gnmr1.o
unres_clust: $(objects)
$(FC) ${OPT} ${objects} ${LIBS} -o ${BIN}/unres_clustMD_MPI-oldparm