wham/src-M/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM multichain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_M_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         permut.F
  36         pinorm.f
  37         printmat.f
  38         rescode.f
  39         setup_var.f
  40         slices.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         read_dist_constr.F
  46         readpdb.f
  47         fitsq.f
  48         contact.f
  49         elecont.f
  50         contfunc.f
  51         cont_frag.f
  52         conf_compar.F
  53         match_contact.f
  54         angnorm.f
  55         odlodc.f
  56         promienie.f
  57         qwolynes.f
  58         read_ref_str.F
  59         rmscalc.f
  60         secondary.f
  61         proc_cont.f
  62         define_pairs.f
  63         mysort.f
  64         ssMD.F
  65 )
  66
  67 set(UNRES_WHAM_M_PP_SRC
  68         bxread.F
  69         chainbuild.F
  70         conf_compar.F
  71         cxread.F
  72         enecalc1.F
  73         energy_p_new.F
  74         geomout.F
  75         initialize_p.F
  76         make_ensemble1.F
  77         molread_zs.F
  78         mygetenv.F
  79         openunits.F
  80         parmread.F
  81         permut.F
  82         read_ref_str.F
  83         read_dist_constr.F
  84         readrtns_compar.F
  85         readrtns.F
  86         slices.F
  87         store_parm.F
  88         timing.F
  89         wham_calc1.F
  90         wham_multparm.F
  91         xread.F
  92         proc_proc.c
  93 )
  94
  95
  96 #================================================
  97 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  98 #================================================
  99 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 100   set(FFLAGS0 "-g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 101 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 102   set(FFLAGS0 "-std=legacy -g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 103 else ()
 104   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 105 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 106
 107
 108 #=========================================
 109 # Add MPI compiler flags
 110 #=========================================
 111 if(UNRES_WITH_MPI)
 112   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 113 endif(UNRES_WITH_MPI)
 114
 115 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 116
 117 #=========================================
 118 #  Settings for GAB force field
 119 #=========================================
 120 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 121   # set preprocesor flags
 122   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 123
 124
 125 #=========================================
 126 #  Settings for E0LL2Y force field
 127 #=========================================
 128 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 129   # set preprocesor flags
 130   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
 131 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 132
 133 #=========================================
 134 # Additional flags
 135 #=========================================
 136 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DUNRES -DISNAN")
 137
 138 #=========================================
 139 # System specific flags
 140 #=========================================
 141 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 142   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 143 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 144
 145 #=========================================
 146 # Compiler specific flags
 147 #=========================================
 148
 149 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 150   # Add ifort preprocessor flags
 151   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 152 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 153   # Add new gfortran flags
 154   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 155 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 156   # Add old gfortran flags
 157   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 158 else (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 159   # Default preprocessor flags
 160   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 161 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 162
 163 #=========================================
 164 # Add MPI preprocessor flags
 165 #=========================================
 166 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 167
 168 #=========================================
 169 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 170 #=========================================
 171 if (architektura STREQUAL "64")
 172   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 173 endif (architektura STREQUAL "64")
 174
 175 #=========================================
 176 # Apply preprocesor flags to *.F files
 177 #=========================================
 178 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_M_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 179
 180
 181 #========================================
 182 #  Setting binary name
 183 #========================================
 184 set(UNRES_WHAM_M_BIN "wham_M_${Fortran_COMPILER_NAME}_${UNRES_MD_FF}.exe")
 185
 186 #=========================================
 187 # cinfo.f workaround for CMake
 188 #=========================================
 189 # get the current date
 190 TODAY(DATE)
 191 # generate cinfo.f
 192
 193 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 194 FILE(WRITE ${CINFO}
 195 "C CMake generated file
 196        subroutine cinfo
 197        include 'COMMON.IOUNITS'
 198        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 199        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 200 ")
 201
 202 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 203 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 204 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 205 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 206 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 207 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 208 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 209
 210 FILE(APPEND ${CINFO}
 211 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 212        return
 213        end ")
 214
 215 # set include paths
 216 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}"  )
 217
 218 #=========================================
 219 # Set full unres CSA sources
 220 #=========================================
 221 set(UNRES_WHAM_M_SRCS ${UNRES_WHAM_M_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 222
 223 #=========================================
 224 # Build the binary
 225 #=========================================
 226 add_executable(UNRES_WHAM_M_BIN ${UNRES_WHAM_M_SRCS} )
 227 set_target_properties(UNRES_WHAM_M_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_M_BIN})
 228 set_property(TARGET UNRES_WHAM_M_BIN PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
 229 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 230
 231 #=========================================
 232 # Link libraries
 233 #=========================================
 234 # link MPI library (libmpich.a)
 235 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN ${MPI_Fortran_LIBRARIES} )
 236 # link libxdrf.a
 237 target_link_libraries( UNRES_WHAM_M_BIN xdrf )
 238
 239
 240 #=========================================
 241 # Install Path
 242 #=========================================
 243 install(TARGETS UNRES_WHAM_M_BIN DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/wham)
 244
 245
 246 #=========================================
 247 # TESTS
 248 #=========================================
 249
 250 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 251 #SET(UNRES_TEST_FILES
 252 #       ala10.inp
 253 #    )
 254
 255 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 256 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 257 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 258 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 259 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 260 #          POST_BUILD
 261 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 262 #      )
 263 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 264
 265 #=========================================
 266 # Generate data test files
 267 #=========================================
 268 #  test_single_ala.sh
 269 #=========================================
 270
 271 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 272 #"#!/bin/sh
 273 #export POT=GB
 274 #export PREFIX=ala10
 275 #-----------------------------------------------------------------------------
 276 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 277 #-----------------------------------------------------------------------------
 278 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 279 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 280 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 281 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 282 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 283 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 284 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 285 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 286 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 287 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 288 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 289 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 290 #-----------------------------------------------------------------------------
 291 #$UNRES_BIN
 292 #")
 293
 294 #=========================================
 295 #  ala10.inp
 296 #=========================================
 297
 298 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 299 #"ala10 unblocked
 300 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 301 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 302 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 303 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 304 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 305 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 306 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 307 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 308 #12
 309 #XAAAAAAAAAAX
 310 # 0
 311 # 0
 312 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 313 #   90.0000   90.0000
 314 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 315 #  180.0000
 316 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 317 #  110.0000  110.0000
 318 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 319 # -120.0000 -120.0000
 320 #")
 321
 322
 323 # Add tests
 324
 325 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 326
 327 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 328
 329 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)