source/wham/src-restraints/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM single chain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.f
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         pinorm.f
  36         printmat.f
  37         rescode.f
  38         setup_var.f
  39         slices.F
  40         ssMD.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         readpdb.f
  46         fitsq.f
  47         contact.f
  48         elecont.f
  49         contfunc.f
  50         cont_frag.f
  51         conf_compar.F
  52         match_contact.f
  53         angnorm.f
  54         odlodc.f
  55         promienie.f
  56         qwolynes.f
  57         read_ref_str.F
  58         rmscalc.f
  59         secondary.f
  60         proc_cont.f
  61         define_pairs.f
  62         mysort.f
  63 )
  64
  65 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
  66         bxread.F
  67         chainbuild.F
  68         conf_compar.F
  69         cxread.F
  70         enecalc1.F
  71         energy_p_new.F
  72         geomout.F
  73         initialize_p.F
  74         make_ensemble1.F
  75         molread_zs.F
  76         mygetenv.F
  77         openunits.F
  78         parmread.F
  79         read_ref_str.F
  80         readrtns_compar.F
  81         readrtns.F
  82         slices.F
  83         ssMD.F
  84         store_parm.F
  85         timing.F
  86         wham_calc1.F
  87         wham_multparm.F
  88         xread.F
  89         proc_proc.c
  90 )
  91
  92
  93 #================================================
  94 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  95 #================================================
  96 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  97   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  98 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  99   set(FFLAGS0 "-std=legacy -g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 100 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 101
 102
 103 #=========================================
 104 # Add MPI compiler flags
 105 #=========================================
 106 if(UNRES_WITH_MPI)
 107   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 108 endif(UNRES_WITH_MPI)
 109
 110 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 111
 112 #=========================================
 113 #  Settings for GAB force field
 114 #=========================================
 115
 116 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 117   # set preprocesor flags
 118   set(CPPFLAGS "PROCOR -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 119
 120 #=========================================
 121 #  Settings for E0LL2Y force field
 122 #=========================================
 123 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 124   # set preprocesor flags
 125   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
 126 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 127
 128
 129 #=========================================
 130 # Additional flags
 131 #=========================================
 132 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DUNRES -DISNAN -DWHAM ")
 133
 134
 135 #=========================================
 136 # System specific flags
 137 #=========================================
 138 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 139   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 140 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 141
 142 #=========================================
 143 # Compiler specific flags
 144 #=========================================
 145
 146 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 147   # Add ifort preprocessor flags
 148   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 149 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 150   # Add new gfortran flags
 151   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 152 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 153   # Add old gfortran flags
 154   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 155 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 156
 157 #=========================================
 158 # Add MPI preprocessor flags
 159 #=========================================
 160 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 161
 162 #=========================================
 163 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 164 #=========================================
 165 if (architektura STREQUAL "64")
 166   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 167 endif (architektura STREQUAL "64")
 168
 169 #=========================================
 170 # Apply preprocesor flags to *.F files
 171 #=========================================
 172 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 173
 174
 175 #========================================
 176 #  Setting binary name
 177 #========================================
 178 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
 179
 180 #=========================================
 181 # cinfo.f workaround for CMake
 182 #=========================================
 183 # get the current date
 184 TODAY(DATE)
 185 # generate cinfo.f
 186
 187 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 188 FILE(WRITE ${CINFO}
 189 "C CMake generated file
 190        subroutine cinfo
 191        include 'COMMON.IOUNITS'
 192        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 193        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 194 ")
 195
 196 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 197 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 198 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 199 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 200 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 201 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 202 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 203
 204 FILE(APPEND ${CINFO}
 205 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 206        return
 207        end ")
 208
 209 # set include path
 210 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
 211
 212 #=========================================
 213 # Set full unres CSA sources
 214 #=========================================
 215 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 216
 217 #=========================================
 218 # Build the binary
 219 #=========================================
 220 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
 221 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
 222
 223 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 224 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 225
 226 #=========================================
 227 # Link libraries
 228 #=========================================
 229 # link MPI library (libmpich.a)
 230 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
 231 # link libxdrf.a
 232 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
 233
 234 #=========================================
 235 # TESTS
 236 #=========================================
 237
 238 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 239 #SET(UNRES_TEST_FILES
 240 #       ala10.inp
 241 #    )
 242
 243 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 244 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 245 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 246 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 247 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 248 #          POST_BUILD
 249 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 250 #      )
 251 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 252
 253 #=========================================
 254 # Generate data test files
 255 #=========================================
 256 #  test_single_ala.sh
 257 #=========================================
 258
 259 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 260 #"#!/bin/sh
 261 #export POT=GB
 262 #export PREFIX=ala10
 263 #-----------------------------------------------------------------------------
 264 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 265 #-----------------------------------------------------------------------------
 266 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 267 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 268 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 269 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 270 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 271 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 272 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 273 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 274 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 275 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 276 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 277 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 278 #-----------------------------------------------------------------------------
 279 #$UNRES_BIN
 280 #")
 281
 282 #=========================================
 283 #  ala10.inp
 284 #=========================================
 285
 286 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 287 #"ala10 unblocked
 288 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 289 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 290 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 291 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 292 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 293 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 294 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 295 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 296 #12
 297 #XAAAAAAAAAAX
 298 # 0
 299 # 0
 300 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 301 #   90.0000   90.0000
 302 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 303 #  180.0000
 304 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 305 #  110.0000  110.0000
 306 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 307 # -120.0000 -120.0000
 308 #")
 309
 310
 311 # Add tests
 312
 313 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 314
 315 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 316
 317 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)