Adam's changes
[unres.git] / source / wham / src-restraints / CMakeLists.txt
1 #
2 # CMake project file for WHAM single chain version 
3
4
5 enable_language (Fortran)
6
7 #================================
8 # Set source file lists
9 #================================
10 set(UNRES_WHAM_SRC0 
11         wham_multparm.F
12         bxread.F
13         xread.F
14         cxread.F
15         enecalc1.F 
16         energy_p_new.F
17         initialize_p.F
18         molread_zs.F
19         openunits.F
20         readrtns.F
21         arcos.f
22         cartder.f
23         cartprint.f
24         chainbuild.f
25         geomout.F
26         gnmr1.f
27         icant.f
28         intcor.f
29         int_from_cart.f
30         make_ensemble1.F
31         matmult.f
32         misc.f
33         mygetenv.F
34         parmread.F
35         pinorm.f
36         printmat.f
37         rescode.f
38         setup_var.f
39         slices.F
40         ssMD.F
41         store_parm.F
42         timing.F
43         wham_calc1.F
44         readrtns_compar.F
45         readpdb.f
46         fitsq.f 
47         contact.f
48         elecont.f
49         contfunc.f
50         cont_frag.f
51         conf_compar.F
52         match_contact.f
53         angnorm.f
54         odlodc.f
55         promienie.f
56         qwolynes.f
57         read_ref_str.F
58         rmscalc.f
59         secondary.f
60         proc_cont.f
61         define_pairs.f
62         mysort.f
63 )
64
65 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
66         bxread.F
67         chainbuild.F
68         conf_compar.F
69         cxread.F
70         enecalc1.F
71         energy_p_new.F
72         geomout.F
73         initialize_p.F
74         make_ensemble1.F
75         molread_zs.F
76         mygetenv.F
77         openunits.F
78         parmread.F
79         read_ref_str.F
80         readrtns_compar.F
81         readrtns.F
82         slices.F
83         ssMD.F
84         store_parm.F
85         timing.F
86         wham_calc1.F
87         wham_multparm.F
88         xread.F
89         proc_proc.c
90
91
92
93 #================================================
94 # Set comipiler flags for different sourcefiles  
95 #================================================
96 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
97   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" ) 
98 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
99   set(FFLAGS0 "-std=legacy -g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" ) 
100 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
101
102
103 #=========================================
104 # Add MPI compiler flags
105 #=========================================
106 if(UNRES_WITH_MPI)
107   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
108 endif(UNRES_WITH_MPI)
109
110 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
111
112 #=========================================
113 #  Settings for GAB force field
114 #=========================================
115
116 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
117   # set preprocesor flags   
118   set(CPPFLAGS "PROCOR -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
119
120 #=========================================
121 #  Settings for E0LL2Y force field
122 #=========================================
123 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
124   # set preprocesor flags   
125   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
126 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
127
128
129 #=========================================
130 # Additional flags
131 #=========================================
132 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DUNRES -DISNAN -DWHAM ") 
133
134
135 #=========================================
136 # System specific flags
137 #=========================================
138 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
139   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX") 
140 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
141
142 #=========================================
143 # Compiler specific flags
144 #=========================================
145
146 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
147   # Add ifort preprocessor flags
148   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI") 
149 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
150   # Add new gfortran flags
151   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77") 
152 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
153   # Add old gfortran flags
154   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77") 
155 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
156
157 #=========================================
158 # Add MPI preprocessor flags
159 #=========================================
160 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI") 
161
162 #=========================================
163 # Add 64-bit specific preprocessor flags
164 #=========================================
165 if (architektura STREQUAL "64")
166   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
167 endif (architektura STREQUAL "64")
168
169 #=========================================
170 # Apply preprocesor flags to *.F files
171 #=========================================
172 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )  
173
174
175 #========================================
176 #  Setting binary name
177 #========================================
178 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
179
180 #=========================================
181 # cinfo.f workaround for CMake
182 #=========================================
183 # get the current date  
184 TODAY(DATE)
185 # generate cinfo.f
186
187 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
188 FILE(WRITE ${CINFO}
189 "C CMake generated file
190        subroutine cinfo
191        include 'COMMON.IOUNITS'
192        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
193        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
194 ")
195
196 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
197 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
198 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
199 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
200 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
201 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
202 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
203
204 FILE(APPEND ${CINFO} 
205 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'  
206        return 
207        end ")
208
209 # set include path
210 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
211
212 #=========================================
213 # Set full unres CSA sources
214 #=========================================
215 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
216
217 #=========================================
218 # Build the binary
219 #=========================================
220 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
221 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
222
223 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
224 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
225
226 #=========================================
227 # Link libraries
228 #=========================================
229 # link MPI library (libmpich.a)  
230 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
231 # link libxdrf.a 
232 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
233
234 #=========================================
235 # TESTS 
236 #=========================================
237
238 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
239 #SET(UNRES_TEST_FILES
240 #       ala10.inp
241 #    )
242
243 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
244 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
245 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
246 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
247 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
248 #          POST_BUILD
249 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
250 #      )
251 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
252
253 #=========================================
254 # Generate data test files
255 #=========================================
256 #  test_single_ala.sh
257 #=========================================
258
259 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
260 #"#!/bin/sh
261 #export POT=GB
262 #export PREFIX=ala10
263 #-----------------------------------------------------------------------------
264 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
265 #-----------------------------------------------------------------------------
266 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
267 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
268 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
269 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
270 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
271 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
272 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
273 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
274 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
275 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
276 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
277 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
278 #-----------------------------------------------------------------------------
279 #$UNRES_BIN
280 #")
281
282 #=========================================
283 #  ala10.inp
284 #=========================================
285
286 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
287 #"ala10 unblocked
288 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
289 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
290 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
291 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
292 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
293 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
294 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
295 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
296 #12
297 #XAAAAAAAAAAX 
298 # 0
299 # 0
300 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000 
301 #   90.0000   90.0000
302 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
303 #  180.0000
304 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000 
305 #  110.0000  110.0000
306 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
307 # -120.0000 -120.0000
308 #")
309
310
311 # Add tests
312
313 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
314
315 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
316
317 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)