source/wham/src/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM single chain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.F
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         pinorm.f
  36         printmat.f
  37         rescode.f
  38         setup_var.f
  39         slices.F
  40         ssMD.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         readpdb.F
  46         fitsq.f
  47         contact.f
  48         elecont.f
  49         contfunc.f
  50         cont_frag.f
  51         conf_compar.F
  52         match_contact.f
  53         angnorm.f
  54         odlodc.f
  55         promienie.f
  56         qwolynes.f
  57         read_ref_str.F
  58         rmscalc.f
  59         secondary.f
  60         proc_cont.f
  61         define_pairs.f
  62         mysort.f
  63         dfa.F
  64 )
  65
  66 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
  67         bxread.F
  68         chainbuild.F
  69         conf_compar.F
  70         cxread.F
  71         enecalc1.F
  72         energy_p_new.F
  73         geomout.F
  74         initialize_p.F
  75         make_ensemble1.F
  76         molread_zs.F
  77         mygetenv.F
  78         openunits.F
  79         parmread.F
  80         read_ref_str.F
  81         readrtns_compar.F
  82         readrtns.F
  83         slices.F
  84         ssMD.F
  85         store_parm.F
  86         timing.F
  87         wham_calc1.F
  88         wham_multparm.F
  89         xread.F
  90         proc_proc.c
  91 )
  92
  93
  94 #================================================
  95 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  96 #================================================
  97 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  98   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  99 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 100   set(FFLAGS0 "-std=legacy -g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 101 else ()
 102   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 103 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 104
 105
 106 #=========================================
 107 # Add MPI compiler flags
 108 #=========================================
 109 if(UNRES_WITH_MPI)
 110   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 111 endif(UNRES_WITH_MPI)
 112
 113 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 114
 115 #=========================================
 116 #  Settings for GAB force field
 117 #=========================================
 118
 119 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 120   # set preprocesor flags
 121   set(CPPFLAGS "PROCOR -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 122
 123 #=========================================
 124 #  Settings for E0LL2Y force field
 125 #=========================================
 126 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 127   # set preprocesor flags
 128   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
 129 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 130
 131
 132 #=========================================
 133 # Additional flags
 134 #=========================================
 135 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DUNRES -DISNAN -DWHAM ")
 136
 137
 138 #=========================================
 139 # System specific flags
 140 #=========================================
 141 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 142   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 143 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 144
 145 #=========================================
 146 # Compiler specific flags
 147 #=========================================
 148
 149 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 150   # Add ifort preprocessor flags
 151   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 152 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 153   # Add new gfortran flags
 154   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 155 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 156   # Add old gfortran flags
 157   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 158 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 159
 160 #=========================================
 161 # Add MPI preprocessor flags
 162 #=========================================
 163 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 164
 165 #=========================================
 166 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 167 #=========================================
 168 if (architektura STREQUAL "64")
 169   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 170 endif (architektura STREQUAL "64")
 171
 172 #=========================================
 173 # Apply preprocesor flags to *.F files
 174 #=========================================
 175 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 176
 177
 178 #========================================
 179 #  Setting binary name
 180 #========================================
 181 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
 182
 183 #=========================================
 184 # cinfo.f workaround for CMake
 185 #=========================================
 186 # get the current date
 187 TODAY(DATE)
 188 # generate cinfo.f
 189
 190 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 191 FILE(WRITE ${CINFO}
 192 "C CMake generated file
 193        subroutine cinfo
 194        include 'COMMON.IOUNITS'
 195        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 196        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 197 ")
 198
 199 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 200 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 201 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 202 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 203 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 204 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 205 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 206
 207 FILE(APPEND ${CINFO}
 208 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 209        return
 210        end ")
 211
 212 # set include path
 213 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
 214
 215 #=========================================
 216 # Set full unres CSA sources
 217 #=========================================
 218 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 219
 220 #=========================================
 221 # Build the binary
 222 #=========================================
 223 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
 224 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
 225
 226 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 227 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 228
 229 #=========================================
 230 # Link libraries
 231 #=========================================
 232 # link MPI library (libmpich.a)
 233 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPIF_LIBRARIES} )
 234 # link libxdrf.a
 235 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
 236
 237 #=========================================
 238 # TESTS
 239 #=========================================
 240
 241 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 242 #SET(UNRES_TEST_FILES
 243 #       ala10.inp
 244 #    )
 245
 246 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 247 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 248 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 249 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 250 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 251 #          POST_BUILD
 252 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 253 #      )
 254 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 255
 256 #=========================================
 257 # Generate data test files
 258 #=========================================
 259 #  test_single_ala.sh
 260 #=========================================
 261
 262 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 263 #"#!/bin/sh
 264 #export POT=GB
 265 #export PREFIX=ala10
 266 #-----------------------------------------------------------------------------
 267 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 268 #-----------------------------------------------------------------------------
 269 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 270 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 271 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 272 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 273 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 274 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 275 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 276 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 277 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 278 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 279 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 280 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 281 #-----------------------------------------------------------------------------
 282 #$UNRES_BIN
 283 #")
 284
 285 #=========================================
 286 #  ala10.inp
 287 #=========================================
 288
 289 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 290 #"ala10 unblocked
 291 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 292 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 293 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 294 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 295 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 296 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 297 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 298 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 299 #12
 300 #XAAAAAAAAAAX
 301 # 0
 302 # 0
 303 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 304 #   90.0000   90.0000
 305 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 306 #  180.0000
 307 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 308 #  110.0000  110.0000
 309 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 310 # -120.0000 -120.0000
 311 #")
 312
 313
 314 # Add tests
 315
 316 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 317
 318 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 319
 320 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)