saxs and adam's corrections to multichain
[unres.git] / source / wham / src / CMakeLists.txt
1 #
2 # CMake project file for WHAM single chain version 
3
4
5 enable_language (Fortran)
6
7 #================================
8 # Set source file lists
9 #================================
10 set(UNRES_WHAM_SRC0 
11         wham_multparm.F
12         bxread.F
13         xread.F
14         cxread.F
15         enecalc1.F 
16         energy_p_new.F
17         initialize_p.F
18         molread_zs.F
19         openunits.F
20         readrtns.F
21         arcos.f
22         cartder.f
23         cartprint.f
24         chainbuild.F
25         geomout.F
26         gnmr1.f
27         icant.f
28         intcor.f
29         int_from_cart.f
30         make_ensemble1.F
31         matmult.f
32         misc.f
33         mygetenv.F
34         parmread.F
35         pinorm.f
36         printmat.f
37         rescode.f
38         setup_var.f
39         slices.F
40         ssMD.F
41         store_parm.F
42         timing.F
43         wham_calc1.F
44         readrtns_compar.F
45         readpdb.F
46         fitsq.f 
47         contact.f
48         elecont.f
49         contfunc.f
50         cont_frag.f
51         conf_compar.F
52         match_contact.f
53         angnorm.f
54         odlodc.f
55         promienie.f
56         qwolynes.f
57         read_ref_str.F
58         rmscalc.f
59         secondary.f
60         proc_cont.f
61         define_pairs.f
62         mysort.f
63         dfa.F
64 )
65
66 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
67         bxread.F
68         chainbuild.F
69         conf_compar.F
70         cxread.F
71         enecalc1.F
72         energy_p_new.F
73         geomout.F
74         initialize_p.F
75         make_ensemble1.F
76         molread_zs.F
77         mygetenv.F
78         openunits.F
79         parmread.F
80         read_ref_str.F
81         readrtns_compar.F
82         readrtns.F
83         slices.F
84         ssMD.F
85         store_parm.F
86         timing.F
87         wham_calc1.F
88         wham_multparm.F
89         xread.F
90         proc_proc.c
91
92
93
94 #================================================
95 # Set comipiler flags for different sourcefiles  
96 #================================================
97 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
98   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -shared-intel  -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" ) 
99 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
100   set(FFLAGS0 "-std=legacy -mcmodel=medium -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
101 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "pgf90")
102   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -Mlarge_arrays -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
103 else ()
104   set(FFLAGS0 " -mcmodel=medium -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
105 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
106
107
108 #=========================================
109 # Add MPI compiler flags
110 #=========================================
111 if(UNRES_WITH_MPI)
112   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
113 endif(UNRES_WITH_MPI)
114
115 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
116
117 #=========================================
118 #  Settings for GAB force field
119 #=========================================
120
121 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
122   # set preprocesor flags   
123   set(CPPFLAGS "PROCOR -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
124
125 #=========================================
126 #  Settings for E0LL2Y force field
127 #=========================================
128 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
129   # set preprocesor flags   
130   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
131 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "4P")
132   set(CPPFLAGS "SPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DSCCORPDB" )
133 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
134
135
136 #=========================================
137 # Additional flags
138 #=========================================
139 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DUNRES -DISNAN -DWHAM ") 
140
141
142 #=========================================
143 # System specific flags
144 #=========================================
145 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
146   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX") 
147 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
148
149 #=========================================
150 # Compiler specific flags
151 #=========================================
152
153 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
154   # Add ifort preprocessor flags
155   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI") 
156 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
157   # Add new gfortran flags
158   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77") 
159 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
160   # Add old gfortran flags
161   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77") 
162 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "pgf90")
163   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
164   FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/source/lib/isnan_pgi.f DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
165   list(APPEND UNRES_WHAM_SRC0 ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/isnan_pgi.f)
166   set(CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS "-Bdynamic")
167 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
168
169 #=========================================
170 # Add MPI preprocessor flags
171 #=========================================
172 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI") 
173
174 #=========================================
175 # Add 64-bit specific preprocessor flags
176 #=========================================
177 if (architektura STREQUAL "64")
178   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
179 endif (architektura STREQUAL "64")
180
181 #=========================================
182 # Apply preprocesor flags to *.F files
183 #=========================================
184 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )  
185
186
187 #========================================
188 #  Setting binary name
189 #========================================
190 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPI_${UNRES_MD_FF}.exe")
191
192 #=========================================
193 # cinfo.f workaround for CMake
194 #=========================================
195 # get the current date  
196 TODAY(DATE)
197 # generate cinfo.f
198
199 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
200 FILE(WRITE ${CINFO}
201 "C CMake generated file
202        subroutine cinfo
203        include 'COMMON.IOUNITS'
204        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
205        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
206 ")
207
208 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
209 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
210 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
211 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
212 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
213 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
214 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
215
216 FILE(APPEND ${CINFO} 
217 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'  
218        return 
219        end ")
220
221 # set include path
222 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
223
224 #=========================================
225 # Set full unres CSA sources
226 #=========================================
227 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
228
229 #=========================================
230 # Build the binary
231 #=========================================
232 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
233 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
234 set_property(TARGET UNRES_WHAM_BIN PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
235 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
236
237 #=========================================
238 # Link libraries
239 #=========================================
240 # link MPI libraries
241 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPI_Fortran_LIBRARIES} )
242 # link libxdrf.a 
243 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
244
245 #=========================================
246 # Install Path
247 #=========================================
248 install(TARGETS UNRES_WHAM_BIN DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/wham)
249
250
251 #=========================================
252 # TESTS 
253 #=========================================
254
255 #  MESSAGE (STATUS "${MPI_Fortran_LIBRARIES}")
256   if ("${MPI_Fortran_LIBRARIES}"  MATCHES "lam")
257      MESSAGE (STATUS "LAM MPI library detected")
258      set (boot_lam "-boot")
259   else()
260      set (boot_lam "")
261   endif()
262
263   if (UNRES_SRUN)
264    set (np "-n")
265    set (mpiexec "srun")
266   elseif(UNRES_MPIRUN)
267    set (np "-np")
268    set (mpiexec "mpirun")
269   else()
270    set (np "-np")
271    set (mpiexec "mpiexec")
272   endif()
273
274
275 FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/wham_mpi_E0LL2Y.sh
276 "#!/bin/sh
277 export POT=GB
278 export PREFIX=$1
279 #-----------------------------------------------------------------------------
280 WHAM_BIN=${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/${UNRES_WHAM_BIN}
281 #-----------------------------------------------------------------------------
282 DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
283 export BONDPAR=$DD/bond_AM1.parm
284 export THETPAR=$DD/theta_abinitio.parm
285 export ROTPAR=$DD/rotamers_AM1_aura.10022007.parm
286 export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
287 export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
288 export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
289 export SIDEPAR=$DD/scinter_$POT.parm
290 export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
291 export SCPPAR=$DD/scp.parm
292 export SCCORPAR=$DD/sccor_am1_pawel.dat
293 export THETPARPDB=$DD/thetaml.5parm
294 export ROTPARPDB=$DD/scgauss.parm
295 export PATTERN=$DD/patterns.cart
296 export CONTFUNC=GB
297 export SIDEP=$DD/contact.3.parm
298 export SCRATCHDIR=.
299 #-----------------------------------------------------------------------------
300 echo CTEST_FULL_OUTPUT
301 ${mpiexec} ${boot_lam} ${np} $2 $WHAM_BIN 
302 ./wham_check.sh $1 
303 ")
304
305 #
306 # File permissions workaround
307 #
308 FILE(   COPY ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/wham_mpi_E0LL2Y.sh 
309         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}
310         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
311 )
312
313 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/wham_check.sh
314         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} 
315         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
316 )
317
318 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1L2Y_wham.inp
319         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
320
321 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1L2Y_remd_MD000.cx
322         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
323
324 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1L2Y.pdb
325         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
326
327 if(UNRES_DFA)
328 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/dfa
329         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
330
331 FILE(COPY ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/wham_mpi_E0LL2Y.sh
332         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/dfa
333         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
334 )
335
336
337 endif()
338
339
340
341 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
342     add_test(NAME WHAM_remd COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/wham_mpi_E0LL2Y.sh 1L2Y_wham 2 )
343     if(UNRES_DFA)
344      add_test(NAME WHAM_remd_dfa COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/dfa/wham_mpi_E0LL2Y.sh dfa_wham 2  WORKING_DIRECTORY ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/dfa )
345     endif()
346
347
348 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")