xdrf2pdb-M.F: corrected order of reading
[unres.git] / source / unres / src_MD / src / Makefile_galera
1 CPPFLAGS = -DPROCOR -DLINUX -DUNRES -DMP -DMPI -DPGI -DISNAN \
2            -DSPLITELE -DAMD64 -DLANG0 
3 #           -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC 
4 #-DCRYST_TOR
5 # -DPROCOR
6 #           -DTSCSC
7 #-DTIMING \
8 # -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC 
9 # -DMOMENT
10 #-DPARVEC 
11 #-DPARINT -DPARINTDER  
12
13 #INSTALL_DIR = /users/local/mpi64/mpich-1.2.7p1/
14 #INSTALL_DIR = /users/software/mpich-1.2.7p1_intel-10.1_em64_ssh
15 #INSTALL_DIR = /users/software/mpich2.x86_64/
16 #INSTALL_DIR = /opt/mpi/mvapich2
17 INSTALL_DIR = /opt/mpi/mvapich
18
19 FC= ifort
20 FCL= ${INSTALL_DIR}/bin/mpif77
21
22 OPT =  -O3 -ip -w -xHost
23
24 FFLAGS = -c ${OPT} -I$(INSTALL_DIR)/include 
25 FFLAGS1 = -c -w -g -d2 -CA -CB -I$(INSTALL_DIR)/include 
26 FFLAGS2 = -c -w -g -O0 -I$(INSTALL_DIR)/include  
27 FFLAGSE = -c -w -xHost -O3 -ipo -ipo_obj -no-prec-div -opt_report -I$(INSTALL_DIR)/include
28
29
30 BIN = ../bin/unres_Tc_procor_new_em64_hremd_mpich1.exe
31 LIBS = -L$(INSTALL_DIR)/lib -lmpich xdrf_em64/libxdrf.a -lpthread 
32
33 ARCH = LINUX
34 PP = /lib/cpp -P
35
36
37 all: unres
38
39 .SUFFIXES: .F
40 .F.o:
41         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} $*.F
42
43
44 object = unres.o arcos.o cartprint.o chainbuild.o convert.o initialize_p.o \
45         matmult.o readrtns_CSA.o parmread.o gen_rand_conf.o printmat.o map.o \
46         pinorm.o randgens.o rescode.o intcor.o timing.o misc.o intlocal.o \
47         cartder.o checkder_p.o econstr_local.o energy_p_new_barrier.o \
48         energy_p_new-sep_barrier.o gradient_p.o minimize_p.o sumsld.o \
49         cored.o rmdd.o geomout.o readpdb.o regularize.o thread.o fitsq.o mcm.o \
50         mc.o bond_move.o refsys.o check_sc_distr.o check_bond.o contact.o djacob.o \
51         eigen.o blas.o add.o entmcm.o minim_mcmf.o \
52         together.o csa.o minim_jlee.o shift.o diff12.o bank.o newconf.o ran.o \
53         indexx.o MP.o compare_s1.o prng_32.o \
54         test.o banach.o distfit.o rmsd.o elecont.o dihed_cons.o \
55         sc_move.o local_move.o \
56         intcartderiv.o lagrangian_lesyng.o\
57         stochfric.o kinetic_lesyng.o MD_A-MTS.o moments.o int_to_cart.o \
58         surfatom.o sort.o muca_md.o MREMD.o rattle.o gauss.o energy_split-sep.o \
59         q_measure.o gnmr1.o
60
61 unres: ${object} 
62         cc -o compinfo compinfo.c
63         ./compinfo | true
64         ${FC} ${FFLAGS} cinfo.f
65         ${FCL} ${OPT} ${object} cinfo.o ${LIBS}  -o ${BIN}
66
67
68 clean:
69         /bin/rm *.o *.il
70
71 newconf.o: newconf.f
72         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} newconf.f
73
74 bank.o: bank.F
75         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} bank.F
76
77 diff12.o: diff12.f
78         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} diff12.f
79
80 csa.o: csa.f
81         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} csa.f
82
83 shift.o: shift.F
84         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} shift.F
85
86 ran.o: ran.f
87         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ran.f
88
89 together.o: together.F
90         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} together.F
91
92 test.o: test.F
93         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} test.F
94
95 chainbuild.o: chainbuild.F
96         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} chainbuild.F
97
98 matmult.o: matmult.f
99         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} matmult.f
100
101 parmread.o : parmread.F
102         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} parmread.F
103
104 intcor.o : intcor.f
105         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} intcor.f
106
107 cartder.o : cartder.F
108         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} cartder.F
109
110 readpdb.o : readpdb.F
111         ${FC} ${FFLAGS2} ${CPPFLAGS} readpdb.F
112
113 sumsld.o : sumsld.f
114         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} sumsld.f
115         
116 cored.o : cored.f
117         ${FC} ${FFLAGS1} ${CPPFLAGS} cored.f
118  
119 rmdd.o : rmdd.f
120         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} rmdd.f
121
122 energy_p_new_barrier.o : energy_p_new_barrier.F
123         ${FC} ${FFLAGSE} ${CPPFLAGS} energy_p_new_barrier.F
124
125 gradient_p.o : gradient_p.F
126         ${FC} ${FFLAGSE} ${CPPFLAGS} gradient_p.F
127
128 energy_p_new-sep_barrier.o : energy_p_new-sep_barrier.F
129         ${FC} ${FFLAGSE} ${CPPFLAGS} energy_p_new-sep_barrier.F
130
131 lagrangian_lesyng.o : lagrangian_lesyng.F
132         ${FC} ${FFLAGSE} ${CPPFLAGS} lagrangian_lesyng.F
133
134 MD_A-MTS.o : MD_A-MTS.F
135         ${FC} ${FFLAGSE} ${CPPFLAGS} MD_A-MTS.F
136
137 blas.o : blas.f
138         ${FC} ${FFLAGS1} blas.f
139
140 add.o : add.f
141         ${FC} ${FFLAGS1} add.f
142
143 eigen.o : eigen.f
144         ${FC} ${FFLAGS2} eigen.f
145
146 proc_proc.o: proc_proc.c
147         ${CC} ${CFLAGS} proc_proc.c