source/unres/src_CSA/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES CSA version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_CSA_SRC0
  11         arcos.f
  12         banach.f
  13         bank.F
  14         cartder.F
  15         cartprint.f
  16         chainbuild.F
  17         checkder_p.F
  18         contact.f
  19         convert.f
  20         cored.f
  21         csa.f
  22         dfa.F
  23         diff12.f
  24         distfit.f
  25         djacob.f
  26         econstr_local.F
  27         elecont.f
  28         energy_p_new_barrier.F
  29         fitsq.f
  30         gen_rand_conf.F
  31         geomout_min.F
  32         gradient_p.F
  33         indexx.f
  34         initialize_p.F
  35         intcartderiv.F
  36         intcor.f
  37         intlocal.f
  38         int_to_cart.f
  39         local_move.f
  40         matmult.f
  41         minimize_p.F
  42         minim_jlee.F
  43         minim_mult.F
  44         misc.f
  45         MP.F
  46         newconf.F
  47         parmread.F
  48         pinorm.f
  49         printmat.f
  50         prng_32.F
  51         randgens.f
  52         ran.f
  53         readpdb.F
  54         readrtns_csa.F
  55         rescode.f
  56         rmdd.f
  57         rmsd.F
  58         sc_move.F
  59         shift.F
  60         sumsld.f
  61         test.F
  62         timing.F
  63         TMscore_subroutine.f
  64         together.F
  65         unres_csa.F
  66 )
  67
  68 set(UNRES_CSA_SRC3 energy_p_new_barrier.F gradient_p.F )
  69
  70 set(UNRES_CSA_PP_SRC
  71         bank.F
  72         cartder.F
  73         chainbuild.F
  74         checkder_p.F
  75         dfa.F
  76         econstr_local.F
  77         energy_p_new_barrier.F
  78         gen_rand_conf.F
  79         geomout_min.F
  80         gradient_p.F
  81         initialize_p.F
  82         intcartderiv.F
  83         minimize_p.F
  84         minim_jlee.F
  85         minim_mult.F
  86         MP.F
  87         newconf.F
  88         parmread.F
  89         prng_32.F
  90         readpdb.F
  91         readrtns_csa.F
  92         rmsd.F
  93         sc_move.F
  94         shift.F
  95         test.F
  96         timing.F
  97         together.F
  98         unres_csa.F
  99 )
 100
 101
 102 #================================================
 103 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 104 #================================================
 105 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 106   set(FFLAGS0 "-c -ip -w" )
 107   set(FFLAGS1 "-c -w -g -d2 -CA -CB" )
 108   set(FFLAGS2 "-c -w -g -00 ")
 109   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 110   set(FFLAGS3 "-c -w -ipo " )
 111 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 112   set(FFLAGS0 "-std=legacy -cpp -c -I. ")
 113   set(FFLAGS1 "-std=legacy -cpp -c -g -I. " )
 114   set(FFLAGS2 "-std=legacy -cpp -c -I. ")
 115   set(FFLAGS3 "-cpp -c -I. " )
 116 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 117
 118
 119 # Add MPI compiler flags
 120 if(UNRES_WITH_MPI)
 121   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 122   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 123   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 124   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 125 endif(UNRES_WITH_MPI)
 126
 127 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 128 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 129 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 130 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 131
 132 #=========================================
 133 # Settings for CSA force fields
 134 #=========================================
 135
 136 if(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP3" )
 137   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_TOR -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DMOMENT" )
 138 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "ALPHA")
 139   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 140 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "BETA")
 141   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 142 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "ALPHABETA")
 143   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 144 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP5")
 145   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 146 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "3P")
 147   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 148 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "4P")
 149   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 150 endif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP3")
 151
 152 #=========================================
 153 # System specific flags
 154 #=========================================
 155 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 156   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 157 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 158
 159 #=========================================
 160 # Compiler specific flags
 161 #=========================================
 162
 163 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 164   # Add ifort preprocessor flags
 165   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 166 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 167   # Add new gfortran flags
 168   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 169 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 170   # Add old gfortran flags
 171   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 172 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 173
 174 #=========================================
 175 # Add MPI preprocessor flags
 176 #=========================================
 177 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 178
 179 # Apply preprocesor flags to *.F files
 180 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 181
 182
 183 #========================================
 184 #  Setting binary name
 185 #========================================
 186 set(UNRES_BIN "unresCSA_${Fortran_COMPILER_NAME}_${UNRES_CSA_FF}.exe")
 187
 188 #=========================================
 189 # cinfo.f workaround for CMake
 190 #=========================================
 191 # get the current date
 192 TODAY(DATE)
 193 # generate cinfo.f
 194
 195 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 196 FILE(WRITE ${CINFO}
 197 "C CMake generated file
 198        subroutine cinfo
 199        include 'COMMON.IOUNITS'
 200        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 201        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 202 ")
 203
 204 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 205 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 206 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 207 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 208 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 209 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 210 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 211
 212 FILE(APPEND ${CINFO}
 213 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 214        return
 215        end ")
 216
 217 # set include path
 218 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
 219
 220 #=========================================
 221 # Set full unres CSA sources
 222 #=========================================
 223 set(UNRES_CSA_SRCS ${UNRES_CSA_SRC0} ${UNRES_CSA_SRC3} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f )
 224
 225 #=========================================
 226 # Build the binary
 227 #=========================================
 228 add_executable(UNRES_BIN-CSA ${UNRES_CSA_SRCS} )
 229 set_target_properties(UNRES_BIN-CSA PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 230
 231 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 232 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 233
 234 #=========================================
 235 # Link libraries
 236 #=========================================
 237 # link MPI library (libmpich.a)
 238 target_link_libraries( UNRES_BIN-CSA ${MPIF_LIBRARIES} )
 239 # link libxdrf.a
 240 #target_link_libraries( ${UNRES_BIN} xdrf )
 241
 242 #=========================================
 243 # TESTS
 244 #=========================================
 245
 246 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 247 #SET(UNRES_TEST_FILES
 248 #       ala10.inp
 249 #    )
 250
 251 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 252 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 253 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 254 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 255 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 256 #          POST_BUILD
 257 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 258 #      )
 259 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 260
 261 #=========================================
 262 # Generate data test files
 263 #=========================================
 264 #  test_single_ala.sh
 265 #=========================================
 266
 267 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 268 #"#!/bin/sh
 269 #export POT=GB
 270 #export PREFIX=ala10
 271 #-----------------------------------------------------------------------------
 272 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 273 #-----------------------------------------------------------------------------
 274 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 275 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 276 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 277 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 278 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 279 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 280 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 281 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 282 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 283 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 284 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 285 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 286 #-----------------------------------------------------------------------------
 287 #$UNRES_BIN
 288 #")
 289
 290 #=========================================
 291 #  ala10.inp
 292 #=========================================
 293
 294 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 295 #"ala10 unblocked
 296 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 297 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 298 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 299 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 300 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 301 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 302 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 303 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 304 #12
 305 #XAAAAAAAAAAX
 306 # 0
 307 # 0
 308 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 309 #   90.0000   90.0000
 310 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 311 #  180.0000
 312 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 313 #  110.0000  110.0000
 314 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 315 # -120.0000 -120.0000
 316 #")
 317
 318
 319 # Add tests
 320
 321 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 322
 323 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 324
 325 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 326