source/unres/src_CSA/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES CSA version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_CSA_SRC0
  11         arcos.f
  12         banach.f
  13         bank.F
  14         cartder.F
  15         cartprint.f
  16         chainbuild.F
  17         checkder_p.F
  18         contact.f
  19         convert.f
  20         cored.f
  21         csa.F
  22         dfa.F
  23         diff12.f
  24         distfit.f
  25         djacob.f
  26         econstr_local.F
  27         elecont.f
  28         energy_p_new_barrier.F
  29         fitsq.f
  30         gen_rand_conf.F
  31         geomout_min.F
  32         gradient_p.F
  33         indexx.f
  34         initialize_p.F
  35         intcartderiv.F
  36         intcor.f
  37         intlocal.f
  38         int_to_cart.f
  39         local_move.f
  40         matmult.f
  41         minimize_p.F
  42         minim_jlee.F
  43         minim_mult.F
  44         misc.f
  45         MP.F
  46         newconf.F
  47         parmread.F
  48         pinorm.f
  49         printmat.f
  50         prng_32.F
  51         randgens.f
  52         ran.f
  53         readpdb.F
  54         readrtns_csa.F
  55         refsys.f
  56         rescode.f
  57         rmdd.f
  58         rmsd.F
  59         sc_move.F
  60         shift.F
  61         sumsld.f
  62         test.F
  63         timing.F
  64         TMscore_subroutine.f
  65         together.F
  66         unres_csa.F
  67 )
  68
  69 set(UNRES_CSA_SRC3 energy_p_new_barrier.F gradient_p.F )
  70
  71 set(UNRES_CSA_PP_SRC
  72         bank.F
  73         cartder.F
  74         chainbuild.F
  75         checkder_p.F
  76         csa.F
  77         dfa.F
  78         econstr_local.F
  79         energy_p_new_barrier.F
  80         gen_rand_conf.F
  81         geomout_min.F
  82         gradient_p.F
  83         initialize_p.F
  84         intcartderiv.F
  85         minimize_p.F
  86         minim_jlee.F
  87         minim_mult.F
  88         MP.F
  89         newconf.F
  90         parmread.F
  91         prng_32.F
  92         readpdb.F
  93         readrtns_csa.F
  94         rmsd.F
  95         sc_move.F
  96         shift.F
  97         test.F
  98         timing.F
  99         together.F
 100         unres_csa.F
 101 )
 102
 103
 104 #================================================
 105 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 106 #================================================
 107 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 108   set(FFLAGS0 "-c -ip -w" )
 109   set(FFLAGS1 "-c -w -g -d2 -CA -CB" )
 110   set(FFLAGS2 "-c -w -g -00 ")
 111   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 112   set(FFLAGS3 "-c -w -ipo " )
 113 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 114   set(FFLAGS0 "-std=legacy -cpp -c -I. ")
 115   set(FFLAGS1 "-std=legacy -cpp -c -g -I. " )
 116   set(FFLAGS2 "-std=legacy -cpp -c -I. ")
 117   set(FFLAGS3 "-cpp -c -I. " )
 118 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 119
 120
 121 # Add MPI compiler flags
 122 if(UNRES_WITH_MPI)
 123   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 124   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 125   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 126   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 127 endif(UNRES_WITH_MPI)
 128
 129 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 130 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 131 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 132 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 133
 134 #=========================================
 135 # Settings for CSA force fields
 136 #=========================================
 137
 138 if(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP3" )
 139   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DCRYST_TOR" )
 140 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "ALPHA")
 141   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 142 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "BETA")
 143   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 144 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "ALPHABETA")
 145   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 146 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP5")
 147   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 148 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "3P")
 149   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DSCCORPDB" )
 150 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "4P")
 151   set(CPPFLAGS "UNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DSCCORPDB" )
 152 endif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP3")
 153
 154 #=========================================
 155 # System specific flags
 156 #=========================================
 157 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 158   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 159 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 160
 161 #=========================================
 162 # Compiler specific flags
 163 #=========================================
 164
 165 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 166   # Add ifort preprocessor flags
 167   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 168 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 169   # Add new gfortran flags
 170   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 171 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 172   # Add old gfortran flags
 173   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 174 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 175
 176 #=========================================
 177 # Add MPI preprocessor flags
 178 #=========================================
 179 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 180
 181 #=========================================
 182 # add 64-bit specific preprocessor flags
 183 #=========================================
 184 if (architektura STREQUAL "64")
 185   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 186 endif (architektura STREQUAL "64")
 187
 188 # Apply preprocesor flags to *.F files
 189 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 190
 191
 192 #========================================
 193 #  Setting binary name
 194 #========================================
 195 set(UNRES_BIN "unresCSA_${Fortran_COMPILER_NAME}_${UNRES_CSA_FF}.exe")
 196
 197 #=========================================
 198 # cinfo.f workaround for CMake
 199 #=========================================
 200 # get the current date
 201 TODAY(DATE)
 202 # generate cinfo.f
 203
 204 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 205 FILE(WRITE ${CINFO}
 206 "C CMake generated file
 207        subroutine cinfo
 208        include 'COMMON.IOUNITS'
 209        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 210        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 211 ")
 212
 213 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 214 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 215 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 216 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 217 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 218 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 219 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 220
 221 FILE(APPEND ${CINFO}
 222 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 223        return
 224        end ")
 225
 226 # set include path
 227 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
 228
 229 #=========================================
 230 # Set full unres CSA sources
 231 #=========================================
 232 set(UNRES_CSA_SRCS ${UNRES_CSA_SRC0} ${UNRES_CSA_SRC3} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f )
 233
 234 #=========================================
 235 # Build the binary
 236 #=========================================
 237 add_executable(UNRES_BIN-CSA ${UNRES_CSA_SRCS} )
 238 set_target_properties(UNRES_BIN-CSA PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 239 set_property(TARGET UNRES_BIN-CSA PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
 240 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 241
 242 #=========================================
 243 # Link libraries
 244 #=========================================
 245 # link MPI library (libmpich.a)
 246 target_link_libraries( UNRES_BIN-CSA ${MPI_Fortran_LIBRARIES} )
 247 # link libxdrf.a
 248 #target_link_libraries( ${UNRES_BIN} xdrf )
 249
 250 #=========================================
 251 # Install Path
 252 #=========================================
 253 install(TARGETS UNRES_BIN-CSA DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX})
 254
 255
 256 #=========================================
 257 # TESTS
 258 #=========================================
 259
 260 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 261 #SET(UNRES_TEST_FILES
 262 #       ala10.inp
 263 #    )
 264
 265 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 266 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 267 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 268 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 269 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 270 #          POST_BUILD
 271 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 272 #      )
 273 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 274
 275 #=========================================
 276 # Generate data test files
 277 #=========================================
 278 #  test_single_ala.sh
 279 #=========================================
 280
 281 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 282 #"#!/bin/sh
 283 #export POT=GB
 284 #export PREFIX=ala10
 285 #-----------------------------------------------------------------------------
 286 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 287 #-----------------------------------------------------------------------------
 288 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 289 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 290 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 291 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 292 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 293 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 294 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 295 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 296 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 297 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 298 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 299 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 300 #-----------------------------------------------------------------------------
 301 #$UNRES_BIN
 302 #")
 303
 304 #=========================================
 305 #  ala10.inp
 306 #=========================================
 307
 308 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 309 #"ala10 unblocked
 310 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 311 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 312 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 313 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 314 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 315 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 316 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 317 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 318 #12
 319 #XAAAAAAAAAAX
 320 # 0
 321 # 0
 322 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 323 #   90.0000   90.0000
 324 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 325 #  180.0000
 326 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 327 #  110.0000  110.0000
 328 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 329 # -120.0000 -120.0000
 330 #")
 331
 332
 333 # Add tests
 334
 335 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 336
 337 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 338
 339 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 340