source/unres/src_CSA/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for UNRES CSA version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_CSA_SRC0
  11         arcos.f
  12         banach.f
  13         bank.F
  14         cartder.F
  15         cartprint.f
  16         chainbuild.F
  17         checkder_p.F
  18         cinfo.f
  19         contact.f
  20         convert.f
  21         cored.f
  22         csa.f
  23         dfa.F
  24         diff12.f
  25         distfit.f
  26         djacob.f
  27         econstr_local.F
  28         elecont.f
  29         energy_p_new_barrier.F
  30         fitsq.f
  31         gen_rand_conf.F
  32         geomout_min.F
  33         gradient_p.F
  34         indexx.f
  35         initialize_p.F
  36         intcartderiv.F
  37         intcor.f
  38         intlocal.f
  39         int_to_cart.f
  40         local_move.f
  41         matmult.f
  42         minimize_p.F
  43         minim_jlee.F
  44         minim_mult.F
  45         misc.f
  46         MP.F
  47         newconf.F
  48         parmread.F
  49         pinorm.f
  50         printmat.f
  51         prng_32.F
  52         randgens.f
  53         ran.f
  54         readpdb.F
  55         readrtns_csa.F
  56         rescode.f
  57         rmdd.f
  58         rmsd.F
  59         sc_move.F
  60         shift.F
  61         sumsld.f
  62         test.F
  63         timing.F
  64         TMscore_subroutine.f
  65         together.F
  66         unres_csa.F
  67 )
  68
  69 set(UNRES_CSA_SRC3 energy_p_new_barrier.F gradient_p.F )
  70
  71 set(UNRES_CSA_PP_SRC
  72         bank.F
  73         cartder.F
  74         chainbuild.F
  75         checkder_p.F
  76         dfa.F
  77         econstr_local.F
  78         energy_p_new_barrier.F
  79         gen_rand_conf.F
  80         geomout_min.F
  81         gradient_p.F
  82         initialize_p.F
  83         intcartderiv.F
  84         minimize_p.F
  85         minim_jlee.F
  86         minim_mult.F
  87         MP.F
  88         newconf.F
  89         parmread.F
  90         prng_32.F
  91         readpdb.F
  92         readrtns_csa.F
  93         rmsd.F
  94         sc_move.F
  95         shift.F
  96         test.F
  97         timing.F
  98         together.F
  99         unres_csa.F
 100 )
 101
 102
 103 #================================================
 104 # Set comipiler flags for different sourcefiles
 105 #================================================
 106 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 107   set(FFLAGS0 "-c -ip -w" )
 108   set(FFLAGS1 "-c -w -g -d2 -CA -CB" )
 109   set(FFLAGS2 "-c -w -g -00 ")
 110   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 111   set(FFLAGS3 "-c -w -ipo " )
 112 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 113   set(FFLAGS0 "-c -I. " )
 114   set(FFLAGS1 "-c -g -I. " )
 115   set(FFLAGS2 "-c -I. ")
 116   #set(FFLAGS3 "-c -w -O3 -ipo -ipo_obj -opt_report" )
 117   set(FFLAGS3 "-c -I. " )
 118 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 119
 120
 121 # Add MPI compiler flags
 122 if(UNRES_WITH_MPI)
 123   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 124   set(FFLAGS1 "${FFLAGS1} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 125   set(FFLAGS2 "${FFLAGS2} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 126   set(FFLAGS3 "${FFLAGS3} -I${MPIF_INCLUDE_DIRECTORIES}")
 127 endif(UNRES_WITH_MPI)
 128
 129 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 130 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC1} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS1} )
 131 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC2} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS2} )
 132 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_SRC3} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS3} )
 133
 134 #=========================================
 135 # Settings for CSA force fields
 136 #=========================================
 137
 138 if(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP3" )
 139   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_TOR -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DMOMENT" )
 140 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "ALPHA")
 141   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 142 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "BETA")
 143   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 144 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "ALPHABETA")
 145   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DMOMENT -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 146 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP5")
 147   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 148 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "3P")
 149   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 150 elseif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "4P")
 151   set(CPPFLAGS "PROCOR -DUNRES -DISNAN -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC" )
 152 endif(UNRES_CSA_FF STREQUAL "CASP3")
 153
 154 #=========================================
 155 # System specific flags
 156 #=========================================
 157 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 158   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 159 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 160
 161 #=========================================
 162 # Compiler specific flags
 163 #=========================================
 164
 165 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 166   # Add ifort preprocessor flags
 167   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 168 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 169   # Add new gfortran flags
 170   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 171 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 172   # Add old gfortran flags
 173   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 174 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 175
 176 #=========================================
 177 # Add MPI preprocessor flags
 178 #=========================================
 179 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMP -DMPI")
 180
 181 # Apply preprocesor flags to *.F files
 182 set_property(SOURCE ${UNRES_CSA_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 183
 184
 185 #========================================
 186 #  Setting binary name
 187 #========================================
 188 set(UNRES_BIN "unresCSA_${Fortran_COMPILER_NAME}_${UNRES_CSA_FF}.exe")
 189
 190 #=========================================
 191 # cinfo.f stupid workaround for cmake
 192 #  - shame on me ]:)
 193 #=========================================
 194 set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
 195 add_executable(compinfo-csa compinfo.c)
 196 set_target_properties(compinfo-csa PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
 197
 198 set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
 199 add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 200         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
 201         COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
 202         COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
 203         DEPENDS compinfo-csa )
 204 set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 205
 206 #=========================================
 207 # Set full unres CSA sources
 208 #=========================================
 209 set(UNRES_CSA_SRCS ${UNRES_CSA_SRC0} ${UNRES_CSA_SRC3} ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f )
 210
 211 #=========================================
 212 # Build the binary
 213 #=========================================
 214 add_executable(UNRES_BIN-CSA ${UNRES_CSA_SRCS} )
 215 set_target_properties(UNRES_BIN-CSA PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_BIN})
 216
 217 #set_property(TARGET ${UNRES_BIN} PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/unres/MD )
 218 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 219
 220 #=========================================
 221 # Link libraries
 222 #=========================================
 223 # link MPI library (libmpich.a)
 224 target_link_libraries( UNRES_BIN-CSA ${MPIF_LIBRARIES} )
 225 # link libxdrf.a
 226 #target_link_libraries( ${UNRES_BIN} xdrf )
 227
 228 #=========================================
 229 # TESTS
 230 #=========================================
 231
 232 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 233 #SET(UNRES_TEST_FILES
 234 #       ala10.inp
 235 #    )
 236
 237 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 238 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 239 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 240 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 241 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 242 #          POST_BUILD
 243 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 244 #      )
 245 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 246
 247 #=========================================
 248 # Generate data test files
 249 #=========================================
 250 #  test_single_ala.sh
 251 #=========================================
 252
 253 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 254 #"#!/bin/sh
 255 #export POT=GB
 256 #export PREFIX=ala10
 257 #-----------------------------------------------------------------------------
 258 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 259 #-----------------------------------------------------------------------------
 260 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 261 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 262 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 263 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 264 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 265 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 266 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 267 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 268 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 269 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 270 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 271 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 272 #-----------------------------------------------------------------------------
 273 #$UNRES_BIN
 274 #")
 275
 276 #=========================================
 277 #  ala10.inp
 278 #=========================================
 279
 280 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 281 #"ala10 unblocked
 282 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 283 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 284 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 285 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 286 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 287 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 288 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 289 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 290 #12
 291 #XAAAAAAAAAAX
 292 # 0
 293 # 0
 294 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 295 #   90.0000   90.0000
 296 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 297 #  180.0000
 298 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 299 #  110.0000  110.0000
 300 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 301 # -120.0000 -120.0000
 302 #")
 303
 304
 305 # Add tests
 306
 307 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 308
 309 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 310
 311 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)
 312