source/ga/input-templates/matrix-2p/start_all.pbs

   1 #PBS -N single-test
   2 #PBS -q dque
   3 #PBS -l nodes=32:ppn=8
   4 #PBS -l walltime=1:00:00
   5
   6 set NPROCS=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l`
   7
   8 cd $PBS_O_WORKDIR
   9
  10 ./unresga
  11
  12 cat $PBS_NODEFILE|uniq > nody
  13
  14 time /users/software/mpich_ssh/bin/mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS -p4wd $PBS_O_WORKDIR  $PBS_O_WORKDIR/unres_p1.csh
  15 time /users/software/mpich_ssh/bin/mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS -p4wd $PBS_O_WORKDIR  $PBS_O_WORKDIR/unres_p2.csh
  16
  17 time /users/software/mpich_ssh/bin/mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np 16 -p4wd $PBS_O_WORKDIR  $PBS_O_WORKDIR/wham_p1.csh
  18 time /users/software/mpich_ssh/bin/mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np 16 -p4wd $PBS_O_WORKDIR  $PBS_O_WORKDIR/wham_p2.csh
  19
  20 time /users/software/mpich_ssh/bin/mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np 16 ./opt.csh
  21
  22 set DATA=`date +%Y-%m-%d-%H%M%S`
  23 mkdir ceiksy-$DATA
  24 mv *.cx ceiksy-$DATA
  25
  26 #mail -s "Scheraga - wyniki dla single-test sa dostepne" lightnir@gmail.com
  27