source/cluster/unres/src/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for cluster analysis from UNRESMD
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_CLUSTER_UNRES_SRC0
  11         arcos.f
  12         cartprint.f
  13         chainbuild.f
  14         contact.f
  15         convert.f
  16         fitsq.f
  17         geomout.F
  18         hc.f
  19         initialize.f
  20         intcor.f
  21         main_clust.f
  22         matmult.f
  23         misc.f
  24         noyes.f
  25         pinorm.f
  26         readpdb.f
  27         readrtns.F
  28         rescode.f
  29         srtclust.f
  30         timing.F
  31         track.F
  32         wrtclust.f
  33 )
  34
  35 set(UNRES_CLUSTER_PP_SRC
  36         geomout.F
  37         readrtns.F
  38         timing.F
  39         track.F
  40 )
  41
  42
  43 #================================================
  44 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  45 #================================================
  46 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  47   set(FFLAGS0 "-ip -w -I." )
  48 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  49   set(FFLAGS0 "-I. " )
  50 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  51
  52
  53 set_property(SOURCE ${UNRES_CLUSTER_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
  54
  55
  56 #=========================================
  57 # System specific flags
  58 #=========================================
  59 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
  60   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} LINUX")
  61 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
  62
  63
  64
  65 #=========================================
  66 # Apply preprocesor flags to *.F files
  67 #=========================================
  68 set_property(SOURCE ${UNRES_CLUSTER_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
  69
  70
  71 #========================================
  72 #  Setting binary name
  73 #========================================
  74 set(UNRES_CLUSTER_BIN "unres_clustMD.exe")
  75
  76 #=========================================
  77 # cinfo.f stupid workaround for cmake
  78 #  - shame on me ]:)
  79 #=========================================
  80 #set_property(SOURCE compinfo.c PROPERTY CMAKE_C_FLAGS "-c" )
  81 #add_executable(compinfo-wham-m compinfo.c)
  82 #set_target_properties(compinfo-wham-m PROPERTIES OUTPUT_NAME compinfo)
  83
  84 #set(UNRES_CINFO_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}" )
  85 #add_custom_command(OUTPUT ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
  86 #       COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/cinfo.f ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f
  87 #       COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/COMMON.IOUNITS ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/COMMON.IOUNITS
  88 #       COMMAND ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/compinfo | true
  89 #       DEPENDS compinfo-wham-m )
  90 #set_property(SOURCE ${UNRES_CINFO_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
  91
  92 #=========================================
  93 # Set full unres CLUSTER sources
  94 #=========================================
  95 set(UNRES_CLUSTER_SRCS ${UNRES_CLUSTER_UNRES_SRC0} )
  96
  97 #=========================================
  98 # Build the binary
  99 #=========================================
 100 add_executable(UNRES_CLUSTER_BIN ${UNRES_CLUSTER_SRCS} )
 101 set_target_properties(UNRES_CLUSTER_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_CLUSTER_BIN})
 102
 103
 104 #=========================================
 105 # TESTS
 106 #=========================================
 107
 108 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 109 #SET(UNRES_TEST_FILES
 110 #       ala10.inp
 111 #    )
 112
 113 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 114 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 115 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 116 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 117 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 118 #          POST_BUILD
 119 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 120 #      )
 121 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 122
 123 #=========================================
 124 # Generate data test files
 125 #=========================================
 126 #  test_single_ala.sh
 127 #=========================================
 128
 129 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 130 #"#!/bin/sh
 131 #export POT=GB
 132 #export PREFIX=ala10
 133 #-----------------------------------------------------------------------------
 134 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 135 #-----------------------------------------------------------------------------
 136 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 137 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 138 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 139 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 140 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 141 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 142 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 143 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 144 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 145 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 146 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 147 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 148 #-----------------------------------------------------------------------------
 149 #$UNRES_BIN
 150 #")
 151
 152 #=========================================
 153 #  ala10.inp
 154 #=========================================
 155
 156 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 157 #"ala10 unblocked
 158 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 159 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 160 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 161 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 162 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 163 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 164 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 165 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 166 #12
 167 #XAAAAAAAAAAX
 168 # 0
 169 # 0
 170 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 171 #   90.0000   90.0000
 172 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 173 #  180.0000
 174 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 175 #  110.0000  110.0000
 176 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 177 # -120.0000 -120.0000
 178 #")
 179
 180
 181 # Add tests
 182
 183 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 184
 185 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 186
 187 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)