source/cluster/unres/src/CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for cluster analysis from UNRESMD
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_CLUSTER_UNRES_SRC0
  11         arcos.f
  12         cartprint.f
  13         chainbuild.f
  14         contact.f
  15         convert.f
  16         fitsq.f
  17         geomout.F
  18         hc.f
  19         initialize.f
  20         intcor.f
  21         main_clust.F
  22         matmult.f
  23         misc.f
  24         noyes.f
  25         pinorm.f
  26         readpdb.f
  27         readrtns.F
  28         rescode.f
  29         srtclust.f
  30         timing.F
  31         track.F
  32         wrtclust.f
  33         cxread.F
  34 )
  35
  36 set(UNRES_CLUSTER_PP_SRC
  37         geomout.F
  38         readrtns.F
  39         timing.F
  40         track.F
  41 )
  42
  43
  44 #================================================
  45 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  46 #================================================
  47 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  48   set(FFLAGS0 "-ip -w -I." )
  49 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  50   set(FFLAGS0 "-std=legacy -I. " )
  51 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  52
  53
  54 set_property(SOURCE ${UNRES_CLUSTER_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
  55
  56
  57 #=========================================
  58 # System specific flags
  59 #=========================================
  60 set(CPPFLAGS "NEWUNRES")
  61 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
  62   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
  63 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
  64
  65
  66
  67 #=========================================
  68 # Apply preprocesor flags to *.F files
  69 #=========================================
  70 set_property(SOURCE ${UNRES_CLUSTER_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
  71
  72
  73 #========================================
  74 #  Setting binary name
  75 #========================================
  76 set(UNRES_CLUSTER_BIN "cluster_unres_${Fortran_COMPILER_NAME}.exe")
  77
  78 #=========================================
  79 # Set full unres CLUSTER sources
  80 #=========================================
  81 set(UNRES_CLUSTER_SRCS ${UNRES_CLUSTER_UNRES_SRC0} )
  82
  83 #=========================================
  84 # Build the binary
  85 #=========================================
  86 add_executable(UNRES_CLUSTER_BIN ${UNRES_CLUSTER_SRCS} )
  87 set_target_properties(UNRES_CLUSTER_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_CLUSTER_BIN})
  88 set_property(TARGET UNRES_CLUSTER_BIN PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
  89
  90 #=========================================
  91 # Link libraries
  92 #=========================================
  93 # link libxdrf.a
  94 target_link_libraries( UNRES_CLUSTER_BIN xdrf )
  95
  96
  97 #=========================================
  98 # Install Path
  99 #=========================================
 100 install(TARGETS UNRES_CLUSTER_BIN DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/cluster)
 101
 102
 103 #=========================================
 104 # TESTS
 105 #=========================================
 106
 107 FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/cluster_int.sh
 108 "#!/bin/sh
 109 export INPUT=$1
 110 export INTIN=1l2y_csa_GB000
 111 export OUTPUT=1l2y_csa_GB000
 112 #-----------------------------------------------------------------------------
 113 CLUSTER_BIN=${CMAKE_BINARY_DIR}/bin/${UNRES_CLUSTER_BIN}
 114 #-----------------------------------------------------------------------------
 115 echo CTEST_FULL_OUTPUT
 116 $CLUSTER_BIN
 117 ./cluster_check.sh $1
 118 ")
 119
 120 #
 121 # File permissions workaround
 122 #
 123 FILE(   COPY ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/scripts/cluster_int.sh
 124         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}
 125         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
 126 )
 127
 128 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/cluster_check.sh
 129         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}
 130         FILE_PERMISSIONS OWNER_READ OWNER_WRITE OWNER_EXECUTE GROUP_READ GROUP_EXECUTE WORLD_READ WORLD_EXECUTE
 131 )
 132
 133 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1l2y_clust_int.inp
 134         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
 135
 136 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1l2y_csa_GB000.int
 137         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
 138
 139 FILE(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/ctest/1L2Y.pdb
 140         DESTINATION ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR} )
 141
 142
 143 add_test(NAME CLUSTER_INT COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cluster_int.sh 1l2y_clust_int )