fixed broken (by adasko) alignment in COMMON.SCCOR
[unres.git] / examples / unres / MD / ff_e0g / 1lq7.out_GB
1 --------------------------------------------------------------------------------
2                               FILE ASSIGNMENT
3 --------------------------------------------------------------------------------
4  Input file                      : 1lq7.inp
5  Output file                     : 1lq7.out_GB
6
7  Sidechain potential file        : 
8  ../../PARAM/sc_GB_opt.1e0g-52-17k-2k-newclass-shan1e9_gap8g-sc
9  SCp potential file              : ../../PARAM/scp.parm
10  Electrostatic potential file    : ../../PARAM/electr_631Gdp.parm
11  Cumulant coefficient file       : ../../PARAM/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
12  Torsional parameter file        : ../../PARAM/torsion_631Gdp.parm
13  Double torsional parameter file : ../../PARAM/torsion_double_631Gdp.parm
14  Bond & inertia constant file    : ../../PARAM/bond.parm
15  Bending parameter file          : ../../PARAM/thetaml.5parm
16  Rotamer parameter file          : ../../PARAM/scgauss.parm
17  Threading database              : ../../PARAM/patterns.cart
18 --------------------------------------------------------------------------------
19 ********************************************************************************
20 United-residue force field calculation - serial job.
21 ********************************************************************************
22  ### LAST MODIFIED  6/23/05 7:29PM by czarek
23  ++++ Compile info ++++
24  Version 2.3 build 2522
25  compiled Wed Feb  7 10:22:35 2007
26  compiled by adam@matrix
27  OS name:    Linux 
28  OS release: 2.4.20-28.7smp 
29  OS version: #1 SMP Thu Dec 18 11:18:31 EST 2003 
30  flags:
31  FC= mpif90
32  OPT =  -fast -pc 64 -tp p6  \
33  -Minline=name:scalar2,scalar,transpose2,matvec2...
34  OPT1 = -C -g -fast -pc 64 -tp p6 
35  FFLAGS = -c ${OPT} 
36  FFLAGS1 = -c ${OPT1}
37  BIN = ../bin/unres_MD_Tc-pgf90.exe
38  LIBS = -L../xdrf -lxdrf
39  CPPFLAGS = -DLINUX -DUNRES -DMP -DMPI -DPGI -DS...
40  ARCH = LINUX
41  PP = /lib/cpp -P
42  objectCSA = unres_CSA.o arcos.o cartprint.o cha...
43  ++++ End of compile info ++++
44
45 Potential is GB , exponents are   6 12
46
47 Disulfide bridge parameters:
48 S-S bridge energy:      -5.50
49 d0cm:      3.78 akcm:     15.10
50 akth:     11.00 akct:     12.00
51 v1ss:     -1.08 v2ss:      7.61 v3ss:     13.70
52 Random seed:           -3059743.            -3059743
53  ran_num   0.9302273140895307     
54 RMSDBC =        3.0
55 RMSDBC1 =        0.5
56 RMSDBC1MAX =        1.5
57 DRMS    =        0.1
58 RMSDBCM =        3.0
59 Time limit (min):      60.0
60  RESCALE_MODE            2
61 Library  routine used to diagonalize matrices.
62
63 =========================== Parameters of the MD run ===========================
64
65 The units are:
66 positions: angstrom, time: 48.9 fs
67 velocity: angstrom/(48.9 fs), acceleration: angstrom/(48.9 fs)**2
68 energy: kcal/mol, temperature: K
69
70                                        Number of time steps:     10000
71                  Initial time step of numerical integration:   0.10000 natural units
72                                                                4.89000 fs
73  Maximum acceleration threshold to scale down the time step:   4.00000
74       Maximum predicted energy drift to reduce the timestep:  10.00000
75             Maximum velocity threshold to reduce velocities:  20.00000
76                                Frequency of property output:       100
77                              Frequency of coordinate output:      1000
78 Berendsen bath calculation
79                                                 Temperature: 300.00000
80                                     Coupling constant (tau):   1.00000
81 Momenta will be reset at zero every      1000 steps
82
83 ============================== End of MD run setup =============================
84
85
86 Energy-term weights (unscaled):
87
88 WSCC=     1.709050 (SC-SC)
89 WSCP=     2.183100 (SC-p)
90 WELEC=    1.066840 (p-p electr)
91 WVDWPP=   0.270440 (p-p VDW)
92 WBOND=    1.000000 (stretching)
93 WANG=     1.175360 (bending)
94 WSCLOC=   0.220700 (SC local)
95 WTOR=     2.657980 (torsional)
96 WTORD=    2.006460 (double torsional)
97 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
98 WEL_LOC=  0.427890 (multi-body 3-rd order)
99 WCORR4=   0.235410 (multi-body 4th order)
100 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
101 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
102 WTURN3=   1.681260 (turns, 3rd order)
103 WTURN4=   0.750800 (turns, 4th order)
104 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
105
106 Hydrogen-bonding correlation between contact pairs of peptide groups
107
108 Scaling factor of 1,4 SC-p interactions:   0.400
109 General scaling factor of SC-p interactions:   1.000
110
111 Energy-term weights (scaled):
112
113 WSCC=     1.709050 (SC-SC)
114 WSCP=     2.183100 (SC-p)
115 WELEC=    1.066840 (p-p electr)
116 WVDWPP=   0.270440 (p-p VDW)
117 WBOND=    1.000000 (stretching)
118 WANG=     1.175360 (bending)
119 WSCLOC=   0.220700 (SC local)
120 WTOR=     2.657980 (torsional)
121 WTORD=    2.006460 (double torsional)
122 WSTRAIN=  1.000000 (SS bridges & dist. cnstr.)
123 WEL_LOC=  0.427890 (multi-body 3-rd order)
124 WCORR4=   0.235410 (multi-body 4th order)
125 WCORR5=   0.000000 (multi-body 5th order)
126 WCORR6=   0.000000 (multi-body 6th order)
127 WTURN3=   1.681260 (turns, 3rd order)
128 WTURN4=   0.750800 (turns, 4th order)
129 WTURN6=   0.000000 (turns, 6th order)
130  Reference temperature for weights calculation:    300.0000000000000     
131  Parameters of the SS-bond potential:
132  D0CM    3.780000000000000       AKCM    15.10000000000000       AKTH 
133     11.00000000000000       AKCT    12.00000000000000     
134  V1SS   -1.080000000000000       V2SS    7.610000000000000       V3SS 
135     13.70000000000000     
136  EBR   -5.500000000000000     
137 PDB data will be read from file 1lq7.pdb                                                        
138   1 10  GLY  -8.202 -15.036  -3.535
139   2 12  SER  -5.756 -12.694  -5.224
140   3 18  ARG  -5.747  -9.983  -2.583
141   4  6  VAL  -3.156  -8.094  -4.594
142   5 19  LYS  -6.011  -7.405  -6.981
143   6  9  ALA  -8.198  -5.679  -4.419
144   7  5  LEU  -4.933  -4.076  -3.371
145   8 15  GLU  -3.823  -2.772  -6.748
146   9 15  GLU  -6.783  -0.461  -6.269
147  10 19  LYS  -5.661   0.889  -2.915
148  11  6  VAL  -2.044   1.098  -4.011
149  12 19  LYS  -3.004   2.831  -7.236
150  13  9  ALA  -4.915   5.197  -4.984
151  14  5  LEU  -1.916   5.462  -2.690
152  15 15  GLU   0.021   6.500  -5.773
153  16 15  GLU  -1.962   9.436  -7.103
154  17 19  LYS  -2.668  10.626  -3.580
155  18  6  VAL   0.771  10.106  -2.088
156  19 19  LYS   2.036  11.865  -5.191
157  20  9  ALA  -0.745  14.427  -5.026
158  21  5  LEU   0.489  15.375  -1.575
159  22 10  GLY   2.488  18.560  -2.002
160  23 10  GLY   5.232  16.484  -0.427
161  24 10  GLY   8.481  17.952   0.843
162  25 10  GLY   8.902  15.964   4.036
163  26 18  ARG   5.810  14.005   5.001
164  27  4  ILE   5.136  11.529   2.219
165  28 15  GLU   8.682  10.217   2.041
166  29 15  GLU   8.039   8.100   5.112
167  30  5  LEU   4.758   6.589   3.979
168  31 19  LYS   6.298   6.555   0.522
169  32 19  LYS   9.057   4.423   1.995
170  33 19  LYS   6.737   1.749   3.337
171  34  7  TRP   4.597   2.250   0.255
172  35 15  GLU   7.687   1.056  -1.577
173  36 15  GLU   8.084  -1.981   0.647
174  37  5  LEU   4.338  -2.519   0.595
175  38 19  LYS   3.766  -2.464  -3.146
176  39 19  LYS   6.675  -4.878  -3.329
177  40 19  LYS   4.708  -7.100  -0.979
178  41  4  ILE   1.506  -6.910  -2.989
179  42 15  GLU   3.681  -8.195  -5.807
180  43 15  GLU   4.922 -11.365  -4.152
181  44  5  LEU   1.423 -11.691  -2.747
182  45 10  GLY   0.909 -15.357  -3.540
183  46 10  GLY   3.203 -17.845  -1.848
184  47 10  GLY   1.644 -17.131   1.526
185  48 10  GLY  -1.599 -15.646   2.793
186  49 15  GLU   0.309 -13.118   4.864
187  50  6  VAL  -1.486 -10.307   3.074
188  51 19  LYS  -2.537  -9.161   6.525
189  52 19  LYS   0.805  -7.395   6.335
190  53  6  VAL   0.280  -5.707   2.988
191  54 15  GLU  -3.134  -4.380   3.944
192  55 15  GLU  -1.979  -3.130   7.324
193  56 15  GLU   0.812  -1.550   5.314
194  57  6  VAL  -1.578   0.130   2.908
195  58 19  LYS  -3.463   1.283   5.981
196  59 19  LYS  -0.587   3.105   7.635
197  60  5  LEU  -0.837   5.201   4.493
198  61 15  GLU  -4.549   5.919   4.315
199  62 15  GLU  -4.418   6.878   7.974
200  63 15  GLU  -1.436   9.178   7.596
201  64  4  ILE  -2.377  10.304   4.107
202  65 19  LYS  -5.844  11.023   5.445
203  66 19  LYS  -4.093  13.130   8.056
204  67  5  LEU  -1.690  14.592   5.524
205  Nres:    67
206   1 10  GLY  -8.202 -15.036  -3.535       -8.202 -15.036  -3.535
207   2 12  SER  -5.756 -12.694  -5.224       -5.823 -12.486  -6.482
208   3 18  ARG  -5.747  -9.983  -2.583       -6.547 -12.158   0.219
209   4  6  VAL  -3.156  -8.094  -4.594       -2.204  -8.664  -5.544
210   5 19  LYS  -6.011  -7.405  -6.981       -7.559  -7.494  -9.254
211   6  9  ALA  -8.198  -5.679  -4.419       -8.597  -6.043  -3.877
212   7  5  LEU  -4.933  -4.076  -3.371       -4.114  -4.625  -1.777
213   8 15  GLU  -3.823  -2.772  -6.748       -4.095  -2.889  -9.387
214   9 15  GLU  -6.783  -0.461  -6.269       -8.761   0.596  -6.147
215  10 19  LYS  -5.661   0.889  -2.915       -6.689   0.819  -0.448
216  11  6  VAL  -2.044   1.098  -4.011       -1.093   0.001  -4.169
217  12 19  LYS  -3.004   2.831  -7.236       -3.873   3.113  -9.896
218  13  9  ALA  -4.915   5.197  -4.984       -5.544   4.995  -4.597
219  14  5  LEU  -1.916   5.462  -2.690       -2.200   4.542  -0.918
220  15 15  GLU   0.021   6.500  -5.773        1.151   6.134  -7.975
221  16 15  GLU  -1.962   9.436  -7.103       -4.048  10.344  -8.580
222  17 19  LYS  -2.668  10.626  -3.580       -5.346   9.989  -2.114
223  18  6  VAL   0.771  10.106  -2.088        1.497   8.913  -1.660
224  19 19  LYS   2.036  11.865  -5.191        2.026  12.098  -7.838
225  20  9  ALA  -0.745  14.427  -5.026       -1.489  14.255  -4.964
226  21  5  LEU   0.489  15.375  -1.575        0.016  13.736  -0.419
227  22 10  GLY   2.488  18.560  -2.002        2.488  18.560  -2.002
228  23 10  GLY   5.232  16.484  -0.427        5.232  16.484  -0.427
229  24 10  GLY   8.481  17.952   0.843        8.481  17.952   0.843
230  25 10  GLY   8.902  15.964   4.036        8.902  15.964   4.036
231  26 18  ARG   5.810  14.005   5.001        3.498  17.056   5.852
232  27  4  ILE   5.136  11.529   2.219        4.625  12.502   0.651
233  28 15  GLU   8.682  10.217   2.041       10.801  10.233   1.365
234  29 15  GLU   8.039   8.100   5.112        6.963   7.571   7.374
235  30  5  LEU   4.758   6.589   3.979        3.411   8.054   3.243
236  31 19  LYS   6.298   6.555   0.522        6.592   7.883  -1.784
237  32 19  LYS   9.057   4.423   1.995       11.401   5.557   2.644
238  33 19  LYS   6.737   1.749   3.337        7.039   1.350   6.047
239  34  7  TRP   4.597   2.250   0.255        3.310   3.456  -2.833
240  35 15  GLU   7.687   1.056  -1.577        9.435   1.439  -3.090
241  36 15  GLU   8.084  -1.981   0.647        9.874  -1.235   2.570
242  37  5  LEU   4.338  -2.519   0.595        2.426  -1.645   0.706
243  38 19  LYS   3.766  -2.464  -3.146        4.190  -0.833  -5.529
244  39 19  LYS   6.675  -4.878  -3.329        9.726  -5.272  -3.075
245  40 19  LYS   4.708  -7.100  -0.979        5.659  -6.383   1.888
246  41  4  ILE   1.506  -6.910  -2.989        0.341  -5.401  -2.786
247  42 15  GLU   3.681  -8.195  -5.807        4.890  -7.512  -7.814
248  43 15  GLU   4.922 -11.365  -4.152        7.232 -12.325  -3.099
249  44  5  LEU   1.423 -11.691  -2.747        0.247 -10.316  -1.732
250  45 10  GLY   0.909 -15.357  -3.540        0.909 -15.357  -3.540
251  46 10  GLY   3.203 -17.845  -1.848        3.203 -17.845  -1.848
252  47 10  GLY   1.644 -17.131   1.526        1.644 -17.131   1.526
253  48 10  GLY  -1.599 -15.646   2.793       -1.599 -15.646   2.793
254  49 15  GLU   0.309 -13.118   4.864        2.642 -14.123   5.951
255  50  6  VAL  -1.486 -10.307   3.074       -2.419 -10.381   1.953
256  51 19  LYS  -2.537  -9.161   6.525       -4.203 -11.082   7.074
257  52 19  LYS   0.805  -7.395   6.335        3.296  -8.992   7.239
258  53  6  VAL   0.280  -5.707   2.988        0.109  -6.148   1.606
259  54 15  GLU  -3.134  -4.380   3.944       -5.251  -5.694   3.338
260  55 15  GLU  -1.979  -3.130   7.324       -1.511  -3.840   9.882
261  56 15  GLU   0.812  -1.550   5.314        2.800  -1.875   5.720
262  57  6  VAL  -1.578   0.130   2.908       -2.083  -0.512   1.697
263  58 19  LYS  -3.463   1.283   5.981       -5.586  -0.123   7.438
264  59 19  LYS  -0.587   3.105   7.635        1.712   3.997   7.909
265  60  5  LEU  -0.837   5.201   4.493        0.374   4.674   2.787
266  61 15  GLU  -4.549   5.919   4.315       -6.399   4.810   2.982
267  62 15  GLU  -4.418   6.878   7.974       -5.157   5.019   9.157
268  63 15  GLU  -1.436   9.178   7.596        1.229   9.527   7.571
269  64  4  ILE  -2.377  10.304   4.107       -2.051   9.346   2.487
270  65 19  LYS  -5.844  11.023   5.445       -8.126  10.319   7.256
271  66 19  LYS  -4.093  13.130   8.056       -2.925  13.297  10.885
272  67  5  LEU  -1.690  14.592   5.524        0.009  13.524   4.817
273  68 21  D     0.061  16.699   8.135        0.061  16.699   8.135
274 nsup= 67 nstart_sup=  0
275  ITEL
276             1           10            1
277             2           12            1
278             3           18            1
279             4            6            1
280             5           19            1
281             6            9            1
282             7            5            1
283             8           15            1
284             9           15            1
285            10           19            1
286            11            6            1
287            12           19            1
288            13            9            1
289            14            5            1
290            15           15            1
291            16           15            1
292            17           19            1
293            18            6            1
294            19           19            1
295            20            9            1
296            21            5            1
297            22           10            1
298            23           10            1
299            24           10            1
300            25           10            1
301            26           18            1
302            27            4            1
303            28           15            1
304            29           15            1
305            30            5            1
306            31           19            1
307            32           19            1
308            33           19            1
309            34            7            1
310            35           15            1
311            36           15            1
312            37            5            1
313            38           19            1
314            39           19            1
315            40           19            1
316            41            4            1
317            42           15            1
318            43           15            1
319            44            5            1
320            45           10            1
321            46           10            1
322            47           10            1
323            48           10            1
324            49           15            1
325            50            6            1
326            51           19            1
327            52           19            1
328            53            6            1
329            54           15            1
330            55           15            1
331            56           15            1
332            57            6            1
333            58           19            1
334            59           19            1
335            60            5            1
336            61           15            1
337            62           15            1
338            63           15            1
339            64            4            1
340            65           19            1
341            66           19            1
342            67            5            0
343  ns=            0  iss:
344 Boundaries in phi angle sampling:
345 GLY    1    -180.0     180.0
346 SER    2    -180.0     180.0
347 ARG    3    -180.0     180.0
348 VAL    4    -180.0     180.0
349 LYS    5    -180.0     180.0
350 ALA    6    -180.0     180.0
351 LEU    7    -180.0     180.0
352 GLU    8    -180.0     180.0
353 GLU    9    -180.0     180.0
354 LYS   10    -180.0     180.0
355 VAL   11    -180.0     180.0
356 LYS   12    -180.0     180.0
357 ALA   13    -180.0     180.0
358 LEU   14    -180.0     180.0
359 GLU   15    -180.0     180.0
360 GLU   16    -180.0     180.0
361 LYS   17    -180.0     180.0
362 VAL   18    -180.0     180.0
363 LYS   19    -180.0     180.0
364 ALA   20    -180.0     180.0
365 LEU   21    -180.0     180.0
366 GLY   22    -180.0     180.0
367 GLY   23    -180.0     180.0
368 GLY   24    -180.0     180.0
369 GLY   25    -180.0     180.0
370 ARG   26    -180.0     180.0
371 ILE   27    -180.0     180.0
372 GLU   28    -180.0     180.0
373 GLU   29    -180.0     180.0
374 LEU   30    -180.0     180.0
375 LYS   31    -180.0     180.0
376 LYS   32    -180.0     180.0
377 LYS   33    -180.0     180.0
378 TRP   34    -180.0     180.0
379 GLU   35    -180.0     180.0
380 GLU   36    -180.0     180.0
381 LEU   37    -180.0     180.0
382 LYS   38    -180.0     180.0
383 LYS   39    -180.0     180.0
384 LYS   40    -180.0     180.0
385 ILE   41    -180.0     180.0
386 GLU   42    -180.0     180.0
387 GLU   43    -180.0     180.0
388 LEU   44    -180.0     180.0
389 GLY   45    -180.0     180.0
390 GLY   46    -180.0     180.0
391 GLY   47    -180.0     180.0
392 GLY   48    -180.0     180.0
393 GLU   49    -180.0     180.0
394 VAL   50    -180.0     180.0
395 LYS   51    -180.0     180.0
396 LYS   52    -180.0     180.0
397 VAL   53    -180.0     180.0
398 GLU   54    -180.0     180.0
399 GLU   55    -180.0     180.0
400 GLU   56    -180.0     180.0
401 VAL   57    -180.0     180.0
402 LYS   58    -180.0     180.0
403 LYS   59    -180.0     180.0
404 LEU   60    -180.0     180.0
405 GLU   61    -180.0     180.0
406 GLU   62    -180.0     180.0
407 GLU   63    -180.0     180.0
408 ILE   64    -180.0     180.0
409 LYS   65    -180.0     180.0
410 LYS   66    -180.0     180.0
411 LEU   67    -180.0     180.0
412 D     68    -180.0     180.0
413 nsup= 67
414  nsup=           67  nstart_sup=            1  nstart_seq=            1
415  NZ_START=            1  NZ_END=           67
416  IZ_SC=            0
417  Contact order:   0.3193590869183494     
418  Shifting contacts:            1            1
419             1  LEU             7  VAL             4
420             2  VAL            11  LEU             7
421             3  LEU            14  LYS            10
422             4  LEU            14  VAL            11
423             5  VAL            18  LEU            14
424             6  LEU            21  VAL            18
425             7  ILE            27  VAL            18
426             8  ILE            27  LEU            21
427             9  ILE            27  GLY            23
428            10  LEU            30  VAL            18
429            11  LEU            30  ILE            27
430            12  LYS            31  VAL            18
431            13  LYS            31  ILE            27
432            14  LYS            32  GLU            28
433            15  TRP            34  VAL            11
434            16  TRP            34  LEU            14
435            17  TRP            34  VAL            18
436            18  GLU            36  LYS            33
437            19  LEU            37  VAL            11
438            20  LYS            38  VAL            11
439            21  LYS            38  TRP            34
440            22  LYS            40  LEU            37
441            23  ILE            41  VAL             4
442            24  ILE            41  LEU             7
443            25  ILE            41  VAL            11
444            26  ILE            41  LEU            37
445            27  LEU            44  VAL             4
446            28  LEU            44  ILE            41
447            29  VAL            50  ARG             3
448            30  VAL            50  LEU            44
449            31  LYS            52  GLU            49
450            32  VAL            53  LEU             7
451            33  VAL            53  LEU            37
452            34  VAL            53  LYS            40
453            35  VAL            53  ILE            41
454            36  VAL            53  LEU            44
455            37  VAL            53  VAL            50
456            38  GLU            54  LEU             7
457            39  GLU            54  VAL            50
458            40  GLU            56  LYS            33
459            41  GLU            56  LEU            37
460            42  VAL            57  LEU             7
461            43  VAL            57  LYS            10
462            44  VAL            57  VAL            11
463            45  VAL            57  LEU            14
464            46  VAL            57  LEU            37
465            47  VAL            57  VAL            53
466            48  LEU            60  LEU            14
467            49  LEU            60  VAL            18
468            50  LEU            60  LEU            30
469            51  LEU            60  VAL            57
470            52  GLU            61  LYS            10
471            53  GLU            61  LEU            14
472            54  GLU            62  LYS            58
473            55  GLU            63  LEU            30
474            56  ILE            64  LEU            14
475            57  ILE            64  LYS            17
476            58  ILE            64  VAL            18
477            59  ILE            64  LEU            21
478            60  ILE            64  LEU            30
479            61  ILE            64  LEU            60
480            62  LEU            67  LEU            21
481            63  LEU            67  ARG            26
482            64  LEU            67  ILE            27
483            65  LEU            67  LEU            30
484            66  LEU            67  GLU            63
485            67  LEU            67  ILE            64
486
487 Geometry of the virtual chain.
488   Res           d     Theta       Phi       Dsc     Alpha      Omega
489 GLY   1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
490 SER   2     3.784     0.000     0.000     1.276   144.939   -94.284
491 ARG   3     3.785    97.666     0.000     3.636   132.847  -136.663
492 VAL   4     3.785    89.333   177.476     1.461   120.485   -67.491
493 LYS   5     3.785    84.811    71.708     2.751   151.871    -7.605
494 ALA   6     3.785    95.278    58.423     0.765   132.978   -83.541
495 LEU   7     3.785    83.231    41.781     1.874   159.456  -117.163
496 GLU   8     3.786    98.730    52.453     2.655   127.393   -42.771
497 GLU   9     3.786    82.425    68.389     2.246   139.933   -10.602
498 LYS  10     3.786    95.627    54.877     2.673   164.411   -81.368
499 VAL  11     3.785    92.658    40.616     1.461   137.613   -78.366
500 LYS  12     3.785    91.698    47.994     2.812   149.544   -30.888
501 ALA  13     3.784    84.681    51.646     0.765   130.308   -80.013
502 LEU  14     3.785    90.248    46.537     2.017   152.909  -147.404
503 GLU  15     3.786    86.046    55.069     2.502   139.867   -30.986
504 GLU  16     3.784   103.344    54.915     2.712   142.391   -46.710
505 LYS  17     3.785    90.833    37.628     3.118   147.778   -92.352
506 VAL  18     3.785    98.873    42.913     1.460   140.342   -74.863
507 LYS  19     3.785    85.218    47.394     2.658   127.030   -40.335
508 ALA  20     3.785    91.907    41.951     0.766   126.974   -76.135
509 LEU  21     3.786    88.266    58.560     2.061   155.447  -157.937
510 GLY  22     3.785   106.265   101.124     0.000     0.000     0.000
511 GLY  23     3.784    82.782  -122.635     0.000     0.000     0.000
512 GLY  24     3.785   123.323  -168.063     0.000     0.000     0.000
513 GLY  25     3.785   100.070   139.318     0.000     0.000     0.000
514 ARG  26     3.785   113.331   -11.596     3.921   126.029  -109.245
515 ILE  27     3.785   107.256    61.845     1.915   121.565   -93.204
516 GLU  28     3.785    95.422    48.830     2.224   158.348   -19.209
517 GLU  29     3.785    89.803    78.416     2.560   123.110   -30.298
518 LEU  30     3.786    97.334    48.356     2.122   102.856   -71.033
519 LYS  31     3.785    85.659    36.445     2.678   159.703   -52.243
520 LYS  32     3.785    86.916    58.012     2.683   156.818  -116.068
521 LYS  33     3.786    95.112    55.594     2.756   151.563  -138.866
522 TRP  34     3.785    87.957    36.487     3.556   129.060   -19.927
523 GLU  35     3.785    83.732    62.879     2.344   161.223   -20.594
524 GLU  36     3.785    93.115    50.005     2.731   132.834  -114.702
525 LEU  37     3.785    90.124    40.742     2.105   125.264   -41.593
526 LYS  38     3.785    99.270    51.927     2.919   132.849   -53.798
527 LYS  39     3.785    85.547    48.115     3.086   147.472   -52.556
528 LYS  40     3.785    86.846    56.607     3.105   138.553  -118.164
529 ILE  41     3.785    94.614    49.064     1.917   143.243  -104.324
530 GLU  42     3.785    83.812    56.085     2.440   160.828   -41.860
531 GLU  43     3.785    98.465    56.994     2.714   158.179   -74.861
532 LEU  44     3.785    86.063    38.858     2.074   176.659   102.329
533 GLY  45     3.786    97.537   133.746     0.000     0.000     0.000
534 GLY  46     3.784   117.437    63.081     0.000     0.000     0.000
535 GLY  47     3.785    91.425    68.516     0.000     0.000     0.000
536 GLY  48     3.785   136.496    20.218     0.000     0.000     0.000
537 GLU  49     3.784    90.762  -125.179     2.763   152.424  -134.490
538 VAL  50     3.785    89.897   122.644     1.460   142.703   -83.682
539 LYS  51     3.785    85.720   124.240     2.601   134.737  -146.671
540 LYS  52     3.785    81.391    86.531     3.094   143.151   -99.233
541 VAL  53     3.785    97.470    51.282     1.461   134.249   -62.621
542 GLU  54     3.786    93.331    48.720     2.564   146.346   -99.045
543 GLU  55     3.784    93.790    46.265     2.696   150.633   -59.911
544 GLU  56     3.785    83.606    49.391     2.055   169.300  -167.852
545 VAL  57     3.785    93.281    52.240     1.460   144.237   -96.089
546 LYS  58     3.785    86.192    47.933     2.934   153.109   -85.425
547 LYS  59     3.785    97.066    57.243     2.481   125.481   -24.034
548 LEU  60     3.785    81.584    62.431     2.157   146.082   -95.013
549 GLU  61     3.785   102.055    48.277     2.536   154.995   -88.741
550 GLU  62     3.785    88.204    47.695     2.324   141.973  -124.114
551 GLU  63     3.785    94.858    49.253     2.688   141.300   -43.881
552 ILE  64     3.785    94.414    33.242     1.910   142.265   -87.362
553 LYS  65     3.785    87.615    50.150     2.997   129.513   -40.349
554 LYS  66     3.785    85.747    53.802     3.065   150.194   -47.165
555 LEU  67     3.785    92.709    41.921     2.128   119.269    71.699
556 D    68     3.785    92.709   180.000     0.000     0.000     0.000
557 MD calculation.
558
559 ********************************************************************************
560
561  MODECALC           12
562  Calling hpb_partition
563  Calling chainbuild
564  Calling MD
565 ====================MD calculation start====================
566  Initial velocities randomly generated
567  Initial backbone velocities
568    1.4324862923909696E-002   2.3060954008253298E-002  -6.3792993845931081E-002
569   -8.2464915343916019E-002  -0.2516070235700686        4.4210010401026594E-002
570    0.2349723051592712        0.2200841538295040        4.5251610843760908E-002
571   -0.2124003419082547        9.9285486849185425E-002   0.2048035611662629     
572    7.7626734156010748E-002  -8.7230774321129179E-004  -0.1852910092927067     
573   -0.2054954346205523       -0.1736398459036022       -0.1193947039305000     
574    0.1245242224603375        6.3589487597254690E-002   0.1871120037722356     
575    0.1085692605935111       -0.1211347283374747        0.1589635466612328     
576   -4.1993868126625458E-002   0.1494245316364686       -0.1751136041361389     
577    4.5499187413129132E-002   0.1391643290712960       -7.4924978376189770E-002
578   -0.1007527144082593       -9.4770335703041155E-002   0.1192507570729570     
579    1.0302646343144954E-002  -0.1824544980594764        1.8806866372040909E-002
580    2.0920028362883287E-002   0.1805078120910424       -5.5851440541906729E-002
581    9.6207778982298642E-002  -0.1173909006237467       -4.5240357604825476E-002
582   -0.1736090004471858        0.1442184294965889        0.1982043058289817     
583    0.1365034893907223       -0.2585507088530808       -0.3188849711363511     
584    3.8504939006249179E-002   0.3885919699737705        0.2140040568464722     
585   -0.1996533930470889       -0.3021906086559044       -0.1429297339109604     
586    0.2830864519465333        0.1942072909175117        0.1668972686226336     
587   -2.5009110398121850E-002  -0.1539663305831705        3.3125498973123864E-002
588   -0.2653534518187957        6.1246273825734745E-003  -0.2663425789513554     
589    0.2529927552203436       -7.4900893793449832E-002  -3.9971525892193362E-002
590   -6.7692636535053996E-003   9.1640203290961288E-002   0.2491945749530819     
591    8.1769287238506418E-002   0.1179761144772420       -0.1075641534792496     
592   -0.1841692201730904       -0.3264267273744005        5.4570659943695441E-002
593    4.1238341075337495E-002   0.2405756127240131       -4.8771487282703943E-002
594   -0.2664516807513628        3.8162468731331490E-002  -8.7024812610697850E-002
595    0.1137450010151328       -0.3054768712991176        0.1254392056874121     
596    0.3359856337659916        0.4426830872672881       -6.4215589266313717E-002
597   -0.3526852108897527       -0.2408695468759505       -2.6312053658507315E-002
598    7.3320948943808526E-002   8.9674050567894366E-002  -1.1802459078917398E-002
599   -7.2232355171641398E-002  -6.8739843663328042E-002   2.5730488351662428E-002
600    0.1537769336776298        5.1857314862080406E-002   0.2496355296054797     
601    5.5522849531431522E-002  -0.1430972561023301       -0.1724678616847149     
602   -8.0152042427708139E-002   5.1330201710993943E-002  -0.1034222576511945     
603   -0.2161382408049898        2.3714173188312260E-002   0.1450511752151215     
604   -7.0702143282625833E-002  -0.2032552225947245       -5.3383170509769133E-002
605    0.2803041114876157        0.4099920435667419       -1.4534174653823706E-002
606    0.1554655731402295       -0.1391127764084042       -6.4258060429209269E-002
607   -0.1061706970394590        4.9847514907587041E-002   8.7304170916669861E-002
608   -6.9085697736055511E-002  -5.4006746284531246E-002   0.1382242009203001     
609   -4.0584273036952272E-002  -5.2253546214015776E-002   9.2317122367434852E-002
610    2.6860664384564585E-002   8.5372093073488244E-002  -0.2196757024153906     
611   -3.6456741755643449E-002   1.0807500708798075E-003   0.1924485456589615     
612    0.1644027537813116       -0.1666843335352830       -0.3047295562241932     
613   -0.2599736951431796       -7.0257738133479180E-002   0.1202962972943074     
614    0.1002373729663723        0.2069018377216206        4.0519440049336009E-002
615    0.1303563337877069       -0.4032569439569553       -0.1485839395410882     
616   -0.3610502679332219        0.2716616193314436        4.8680677699585946E-002
617    0.1928913804582157        8.7014226042097516E-002   1.0602403660423989E-002
618   -6.0147145259960997E-003   6.5918170015397237E-002  -1.5541285740241397E-002
619    5.3788648985821466E-002  -0.2318059904911159       -2.4765346405761060E-002
620    3.1546153241568797E-002   0.2036388793504332        0.2035443175573332     
621    4.8880784251840064E-002  -9.1849026940734912E-002  -0.2640105127434449     
622   -0.1664864397727329       -0.1644399360070172        0.2714500887463680     
623    0.1254803538812205        0.2905681902197779       -0.2677371159394383     
624   -8.0014734334484388E-002   7.9170110496708981E-002  -5.4238640366009294E-002
625    0.1280872346094246       -0.4081061838591050        0.2956054696767141     
626   -0.1235050569467009        0.2559044578781554       -0.2070043511404440     
627    0.3624319212495557        0.1812129646683664        0.2023685570588290     
628   -0.4691434326433293       -0.1297979531903272       -0.1350928301820909     
629    0.1945932776131060        1.4914424954272758E-002   7.7448936624335785E-002
630   -1.3755367963486167E-002   0.1057457714064048        0.1888182761468886     
631   -0.2079280387445719       -0.2504600248204472       -0.2891337828028493     
632    0.1804651015531500        0.2493889640084464        9.4962876224487598E-002
633   -0.1539821604243660       -0.2014391684545395        1.3572701889875609E-002
634  Initial side-chain velocities
635    0.0000000000000000        0.0000000000000000        0.0000000000000000     
636   -0.1128976735269540       -0.1965949792386982        0.2211441217084325     
637    3.0840424159487507E-002   0.2281020550113027        0.1238616378424910     
638   -3.1040253760719612E-002  -0.1501844388511035        3.8672254960298460E-002
639    4.8246430378742033E-003  -0.1015911880843303       -0.1040537234213796     
640    0.1772133216510695       -8.2857931766127972E-002   7.4564862035412709E-002
641   -5.3140401556500354E-003   7.8579529839689730E-002   0.3066032664047404     
642    2.1471828522848875E-002   5.3502638228185599E-003  -4.1247651069860218E-002
643   -0.1971600402464241       -1.9954576732187446E-002  -9.3622111683778808E-002
644   -0.1240074247131901       -8.7658046078999625E-002   2.3115291660446142E-002
645    6.3929983382066791E-002  -0.1761331732204543       -2.4122050369819807E-002
646    3.9066335309932789E-002  -6.5708451172283464E-003  -1.9752318162502769E-003
647   -0.1872309227414096        9.6209937168067743E-002  -0.2987487502193678     
648   -6.4872837326460777E-002  -0.1522866020207292       -2.7497036638504957E-002
649   -9.4802064151263021E-002   6.1872894468107962E-002   0.1027506447796682     
650    6.4531225453570507E-003  -4.9885412379387128E-002  -0.1550494987688242     
651   -2.2513286095570235E-002   0.1148300140079759        0.1464987194810843     
652   -0.1474138469234483       -0.1104214711490018        9.2516503944193058E-002
653    0.1604253882373028        0.1003029138674276        3.3910225144852730E-002
654   -0.1480451857506935       -0.2378844165105173        3.5090183973688394E-002
655   -0.2440578360316706        8.8335333812237522E-002  -2.5691870356172615E-002
656    0.0000000000000000        0.0000000000000000        0.0000000000000000     
657    0.0000000000000000        0.0000000000000000        0.0000000000000000     
658    0.0000000000000000        0.0000000000000000        0.0000000000000000     
659    0.0000000000000000        0.0000000000000000        0.0000000000000000     
660   -4.1691606533965651E-002   0.1820899617638935       -0.1547176386442052     
661    9.1566092684170872E-002   2.8981350251546560E-002  -9.0136233570203892E-002
662    5.8503395041750199E-002  -1.2899282930997089E-002   0.1023277278845082     
663   -1.4266343423712360E-002   0.1530244339164073        0.1318802229635456     
664   -0.1649931724100239       -0.2433842458246506        9.2231934180517801E-002
665    0.1166768375589941       -0.1302673672831547        9.1487215849938970E-002
666    9.0856949488808709E-003  -0.1052101603064049       -2.7281596920403173E-003
667    6.8220369646984436E-003   9.3747825697828109E-002  -1.6355302908142386E-003
668   -1.0534363894661591E-002  -1.0819613667425065E-002  -9.6410871012427855E-002
669   -0.1039749136265033        3.6199636814580738E-002  -1.6460015453868191E-002
670   -0.1319310491862090        5.8724270593085750E-002   0.1192202875752651     
671    0.1007618987639446        1.9336570278769926E-003  -3.4142489774448497E-002
672    0.1162438828399469        9.0538895467218357E-002   6.6254369783463005E-002
673   -0.1018561820556906       -0.2111554657171823       -6.0460853031793889E-002
674   -0.1506674375211980       -0.1204734189820305       -9.0545767572239484E-003
675    1.1614897982892078E-003   5.1554037897888332E-002  -5.2907901984905257E-002
676   -1.8333084465663507E-003  -6.2459150645534569E-002  -0.1284673786598817     
677    8.8120568813547013E-002   2.3247913917364142E-002  -0.2760670594013803     
678    7.7578377221085937E-002  -7.7807224412136042E-002  -1.0306570558009995E-002
679    0.0000000000000000        0.0000000000000000        0.0000000000000000     
680    0.0000000000000000        0.0000000000000000        0.0000000000000000     
681    0.0000000000000000        0.0000000000000000        0.0000000000000000     
682    0.0000000000000000        0.0000000000000000        0.0000000000000000     
683    3.7306513760719140E-003   0.2830265456103908        0.1479120392363028     
684    0.1853307997081223        0.1635165519528208       -0.3517909332220863     
685    1.4051459178707981E-002   4.3512471795343117E-002   6.0872311857795349E-004
686    1.2868148363352661E-002  -3.2281503343216942E-002   6.6542301536674309E-002
687    7.4176333239815264E-002   2.2515981030951098E-002  -1.8694740029181549E-002
688   -0.1225191232346091       -0.1032499261762106        4.4129444585356072E-002
689   -6.0095842877336345E-002   2.3636181620223597E-002   9.7312033439731334E-002
690    4.5591139018909743E-002   0.2353208404783136       -0.1965741124709957     
691   -9.7003323149892005E-002  -0.1041592116719632        0.1707224339787879     
692    1.7728960574588033E-002  -0.1225938955576677        0.1890948450611761     
693   -9.7917828477334865E-002   0.2573138955404320       -6.9142137648953961E-002
694    1.1305196229803758E-002   2.7361458839471791E-002   0.1876208252212528     
695   -0.1811543402677132       -4.2039185431163038E-002  -0.1421901131548191     
696    7.4421998096865760E-002  -1.6472472460452674E-002   0.1137278111643500     
697   -9.7160397210836553E-002  -5.8307027338373141E-002  -8.7150987686124655E-002
698    3.7773615249674375E-002  -0.1662975819391843       -0.1860983042430830     
699    0.3317992931711260       -5.0067177269952552E-002  -1.7276023488628245E-002
700    0.1506033179782202       -0.1396242439187054       -9.6047876411386000E-002
701    5.7642615805661883E-002   5.0647958430279676E-002  -5.4442329630573374E-002
702  Calling the zero-angular                           momentum subroutine
703  vcm right after adjustment:
704    3.8017267830930992E-018   3.7512350992551431E-017   3.1965691017999598E-017
705
706
707               alpha-carbon coordinates            centroid coordinates
708              X           Y           Z          X           Y           Z
709 GLY(  1)     0.00000     0.00000     0.00000     0.00000     0.00000     0.00000
710 SER(  2)     3.78426     0.00000     0.00000     4.43080     0.82260     0.73120
711 ARG(  3)     4.28912    -3.75095     0.00000     1.17596    -4.56902    -1.69032
712 VAL(  4)     8.03046    -3.20295    -0.16665     8.71726    -2.03177    -0.70567
713 LYS(  5)     7.67688    -2.06100     3.42423     7.63590    -0.39832     5.61546
714 ALA(  6)     6.18799    -5.30750     4.67698     5.46322    -5.52299     4.56134
715 LEU(  7)     8.82268    -6.85717     2.44425     8.30071    -7.65506     0.83086
716 GLU(  8)    11.85440    -5.01653     3.76993    12.78377    -2.94825     5.15151
717 GLU(  9)    11.15761    -7.11075     6.84573    10.47899    -8.04696     8.77080
718 LYS( 10)    11.22135   -10.44209     5.04884     9.41268   -12.36911     4.64720
719 VAL( 11)    14.17775    -9.43223     2.91169    14.18390    -8.52940     1.76357
720 LYS( 12)    16.06915    -8.15719     5.93202    16.86946    -6.37844     7.95788
721 ALA( 13)    15.29311   -11.55269     7.41177    14.58882   -11.77210     7.61579
722 LEU( 14)    16.37169   -13.22143     4.19018    14.82802   -14.01166     3.16079
723 GLU( 15)    19.64210   -11.36540     4.63048    21.12868    -9.35274     4.63264
724 GLU( 16)    20.77100   -12.39425     8.09289    20.64392   -12.02303    10.77656
725 LYS( 17)    19.47874   -15.90707     7.53054    16.69929   -16.84643     8.58747
726 VAL( 18)    20.71385   -16.42375     3.99066    20.25391   -15.92687     2.69702
727 LYS( 19)    24.00505   -15.07034     5.27876    25.32372   -13.19691     6.62558
728 ALA( 20)    23.71944   -17.06997     8.47954    23.10453   -17.07064     8.93579
729 LEU( 21)    23.56349   -20.20890     6.36917    21.72754   -20.08478     5.44187
730 GLY( 22)    27.01728   -21.75015     6.50501    27.01728   -21.75015     6.50501
731 GLY( 23)    26.80315   -21.39406     2.74372    26.80315   -21.39406     2.74372
732 GLY( 24)    29.24486   -23.02840     0.35816    29.24486   -23.02840     0.35816
733 GLY( 25)    26.86154   -24.16153    -2.35485    26.86154   -24.16153    -2.35485
734 ARG( 26)    23.21990   -23.90783    -1.35311    23.23427   -26.70438     1.39581
735 ILE( 27)    22.49358   -20.25567    -0.67596    23.46555   -19.72284     0.88527
736 GLU( 28)    24.05305   -18.98070    -3.88059    25.73426   -18.29546    -5.16547
737 GLU( 29)    20.95661   -20.02812    -5.78878    18.92408   -21.50966    -6.26736
738 LEU( 30)    18.40646   -18.47368    -3.46237    18.77058   -18.96191    -1.42967
739 LYS( 31)    20.92375   -15.67995    -3.03587    22.96491   -14.74211    -1.57849
740 LYS( 32)    20.73018   -15.20884    -6.78658    22.65712   -16.23130    -8.34856
741 LYS( 33)    16.97677   -14.72072    -6.87198    15.71556   -16.51030    -8.54531
742 TRP( 34)    17.27918   -12.86697    -3.58542    18.57215   -11.38701    -0.62121
743 GLU( 35)    19.35516   -10.44211    -5.62020    21.39750    -9.38283    -6.06652
744 GLU( 36)    16.73961   -10.16601    -8.34229    17.49995   -11.96145   -10.25497
745 LEU( 37)    14.00858   -10.09915    -5.72280    13.26441   -10.90414    -3.92609
746 LYS( 38)    15.34260    -7.32398    -3.52186    17.68958    -6.50947    -1.98989
747 LYS( 39)    15.81057    -5.39441    -6.74381    17.42532    -5.07894    -9.35494
748 LYS( 40)    12.11516    -5.93573    -7.36012    11.89380    -8.50464    -9.08945
749 ILE( 41)    11.06021    -4.79214    -3.90928    11.15078    -6.01058    -2.43172
750 GLU( 42)    12.92852    -1.63304    -4.83254    15.02804    -0.43388    -4.50309
751 GLU( 43)    11.03014    -0.76567    -7.99037    11.45913    -0.76128   -10.66997
752 LEU( 44)     7.93968    -1.92687    -6.13997     7.57759    -3.68108    -5.09351
753 GLY( 45)     5.69258     0.97986    -7.05322     5.69258     0.97986    -7.05322
754 GLY( 46)     4.88038     1.47192   -10.71568     4.88038     1.47192   -10.71568
755 GLY( 47)     2.80869    -1.69482   -10.77893     2.80869    -1.69482   -10.77893
756 GLY( 48)     1.06608    -3.88695    -8.23228     1.06608    -3.88695    -8.23228
757 GLU( 49)     2.93953    -6.92465    -9.49038     3.34039    -6.91563   -12.22399
758 VAL( 50)     4.31790    -7.50616    -6.01334     4.16953    -6.68130    -4.81745
759 LYS( 51)     2.80755   -10.96500    -6.30062     0.29724   -10.29715    -6.16950
760 LYS( 52)     6.14544   -11.66636    -7.94087     6.36396   -11.12483   -10.97951
761 VAL( 53)     8.34461   -10.23252    -5.21413     8.57856    -8.90902    -4.64191
762 GLU( 54)     6.53250   -12.10043    -2.46506     4.62177   -10.97604    -1.17678
763 GLU( 55)     6.54407   -15.38490    -4.34469     5.26559   -16.84589    -6.21499
764 GLU( 56)    10.22301   -14.62316    -4.80443    11.12609   -14.55747    -6.64892
765 VAL( 57)    10.79177   -14.06105    -1.10526    10.60859   -12.76802    -0.45154
766 LYS( 58)     8.91540   -17.30608    -0.58087     6.02291   -17.69997    -0.29064
767 LYS( 59)    11.16372   -19.49178    -2.70090    13.07946   -20.07683    -4.16430
768 LEU( 60)    13.70165   -18.45222    -0.09205    14.92000   -16.70965    -0.45665
769 GLU( 61)    11.82615   -19.08936     3.13328    10.53872   -17.51765     4.65129
770 GLU( 62)    10.87124   -22.48758     1.76750     8.71512   -22.26535     0.92859
771 GLU( 63)    14.39082   -23.41720     0.73138    16.34028   -23.39571    -1.11935
772 ILE( 64)    16.03667   -21.55066     3.58335    16.37728   -19.67258     3.65382
773 LYS( 65)    13.64353   -23.32618     5.91738    10.92453   -24.45260     6.48320
774 LYS( 66)    14.91394   -26.52060     4.33482    14.51007   -28.69022     2.20786
775 LEU( 67)    18.50204   -25.31733     4.35856    19.25535   -23.95034     2.91243
776 D  ( 68)    19.77245   -28.51176     2.77600    19.77245   -28.51176     2.77600
777
778 Geometry of the virtual chain.
779   Res           d     Theta       Phi       Dsc     Alpha      Omega
780 GLY   1     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000     0.000
781 SER   2     3.784     0.000     0.000     1.276   144.939   -94.284
782 ARG   3     3.785    97.666     0.000     3.636   132.847  -136.663
783 VAL   4     3.785    89.333   177.476     1.461   120.485   -67.491
784 LYS   5     3.785    84.811    71.708     2.751   151.871    -7.605
785 ALA   6     3.785    95.278    58.423     0.765   132.978   -83.541
786 LEU   7     3.785    83.231    41.781     1.874   159.456  -117.163
787 GLU   8     3.786    98.730    52.453     2.655   127.393   -42.771
788 GLU   9     3.786    82.425    68.389     2.246   139.933   -10.602
789 LYS  10     3.786    95.627    54.877     2.673   164.411   -81.368
790 VAL  11     3.785    92.658    40.616     1.461   137.613   -78.366
791 LYS  12     3.785    91.698    47.994     2.812   149.544   -30.888
792 ALA  13     3.784    84.681    51.646     0.765   130.308   -80.013
793 LEU  14     3.785    90.248    46.537     2.017   152.909  -147.404
794 GLU  15     3.786    86.046    55.069     2.502   139.867   -30.986
795 GLU  16     3.784   103.344    54.915     2.712   142.391   -46.710
796 LYS  17     3.785    90.833    37.628     3.118   147.778   -92.352
797 VAL  18     3.785    98.873    42.913     1.460   140.342   -74.863
798 LYS  19     3.785    85.218    47.394     2.658   127.030   -40.335
799 ALA  20     3.785    91.907    41.951     0.766   126.974   -76.135
800 LEU  21     3.786    88.266    58.560     2.061   155.447  -157.937
801 GLY  22     3.785   106.265   101.124     0.000     0.000   180.000
802 GLY  23     3.784    82.782  -122.635     0.000     0.000   180.000
803 GLY  24     3.785   123.323  -168.063     0.000     0.000   180.000
804 GLY  25     3.785   100.070   139.318     0.000     0.000   180.000
805 ARG  26     3.785   113.331   -11.596     3.921   126.029  -109.245
806 ILE  27     3.785   107.256    61.845     1.915   121.565   -93.204
807 GLU  28     3.785    95.422    48.830     2.224   158.348   -19.209
808 GLU  29     3.785    89.803    78.416     2.560   123.110   -30.298
809 LEU  30     3.786    97.334    48.356     2.122   102.856   -71.033
810 LYS  31     3.785    85.659    36.445     2.678   159.703   -52.243
811 LYS  32     3.785    86.916    58.012     2.683   156.818  -116.068
812 LYS  33     3.786    95.112    55.594     2.756   151.563  -138.866
813 TRP  34     3.785    87.957    36.487     3.556   129.060   -19.927
814 GLU  35     3.785    83.732    62.879     2.344   161.223   -20.594
815 GLU  36     3.785    93.115    50.005     2.731   132.834  -114.702
816 LEU  37     3.785    90.124    40.742     2.105   125.264   -41.593
817 LYS  38     3.785    99.270    51.927     2.919   132.849   -53.798
818 LYS  39     3.785    85.547    48.115     3.086   147.472   -52.556
819 LYS  40     3.785    86.846    56.607     3.105   138.553  -118.164
820 ILE  41     3.785    94.614    49.064     1.917   143.243  -104.324
821 GLU  42     3.785    83.812    56.085     2.440   160.828   -41.860
822 GLU  43     3.785    98.465    56.994     2.714   158.179   -74.861
823 LEU  44     3.785    86.063    38.858     2.074   176.659   102.329
824 GLY  45     3.786    97.537   133.746     0.000     0.000   180.000
825 GLY  46     3.784   117.437    63.081     0.000     0.000   180.000
826 GLY  47     3.785    91.425    68.516     0.000     0.000   180.000
827 GLY  48     3.785   136.496    20.218     0.000     0.000   180.000
828 GLU  49     3.784    90.762  -125.179     2.763   152.424  -134.490
829 VAL  50     3.785    89.897   122.644     1.460   142.703   -83.682
830 LYS  51     3.785    85.720   124.240     2.601   134.737  -146.671
831 LYS  52     3.785    81.391    86.531     3.094   143.151   -99.233
832 VAL  53     3.785    97.470    51.282     1.461   134.249   -62.621
833 GLU  54     3.786    93.331    48.720     2.564   146.346   -99.045
834 GLU  55     3.784    93.790    46.265     2.696   150.633   -59.911
835 GLU  56     3.785    83.606    49.391     2.055   169.300  -167.852
836 VAL  57     3.785    93.281    52.240     1.460   144.237   -96.089
837 LYS  58     3.785    86.192    47.933     2.934   153.109   -85.425
838 LYS  59     3.785    97.066    57.243     2.481   125.481   -24.034
839 LEU  60     3.785    81.584    62.431     2.157   146.082   -95.013
840 GLU  61     3.785   102.055    48.277     2.536   154.995   -88.741
841 GLU  62     3.785    88.204    47.695     2.324   141.973  -124.114
842 GLU  63     3.785    94.858    49.253     2.688   141.300   -43.881
843 ILE  64     3.785    94.414    33.242     1.910   142.265   -87.362
844 LYS  65     3.785    87.615    50.150     2.997   129.513   -40.349
845 LYS  66     3.785    85.747    53.802     3.065   150.194   -47.165
846 LEU  67     3.785    92.709    41.921     2.128   119.269    71.699
847 D    68     3.785    92.709   180.000     0.000     0.000   180.000
848  Potential energy and its components
849     4223.069527427199         1417.156941757942         245.1229503015478      
850    -576.8404853557735        -443.4646226713600        0.0000000000000000      
851    0.0000000000000000        -28.72282448527260         123.1100688267006      
852    -29.22028710422527        0.0000000000000000        -77.01397934788042      
853     107.3231863733070         90.31391374517578         8.996107713480077      
854    0.0000000000000000        -45.58016651021919         1634.047527117884      
855    0.0000000000000000        0.0000000000000000        0.0000000000000000      
856    0.0000000000000000     
857  Initial: Kinetic energy    110.2732342277786       potential energy 
858     4223.069527427199       total energy    4333.342761654978      
859   maximum acceleration     139.9965487157773     
860 Momenta zeroed out, time               76.79
861 Momenta zeroed out, time              176.79
862 Momenta zeroed out, time              276.79
863 Momenta zeroed out, time              376.79
864 Momenta zeroed out, time              475.70
865 Momenta zeroed out, time              575.70
866 Momenta zeroed out, time              675.70
867 Momenta zeroed out, time              775.70
868 Momenta zeroed out, time              873.76
869 Momenta zeroed out, time              973.76
870
871
872 ===================================  Timing  ===================================
873
874                   MD calculations setup:    4.05000E+00
875            Energy & gradient evaluation:    1.40690E+02
876                     Stochastic MD setup:    0.00000E+00
877                Stochastic MD step setup:    0.00000E+00
878                                MD steps:    1.42890E+02
879
880
881 ============================  End of MD calculation  ===========================
882
883
884 ***** Computation time:    0 hours  2 minutes 27 seconds *****