4 #PBS -l walltime=48:00:00
6 setenv MPIRUN "/users/software/mpich2-1.4.1p1_intel/bin/mpirun "
7 setenv NPROCS `cat $PBS_NODEFILE | wc -l`
13 setenv PREFIX unres_dock
15 #--------------------------------------------------------
16 setenv UNRES_BIN /users2/vetinari/unres_hom_m/unres/build/bin/unresMD-mult_ifort_MPI_E0LL2Y.exe
18 setenv LD_LIBRARY_PATH /users/software/mpich2-1.4.1p1_intel/lib:$LD_LIBRARY_PATH
19 #-----------------------------------------------------------------------------
20 setenv DD /users2/vetinari/unres_hom_m/unres/PARAM
21 setenv BONDPAR $DD/bond_AM1_ext_dum.parm
22 setenv THETPAR $DD/pot_theta_G631_DIL_ext.parm
23 setenv THETPARPDB $DD/thetaml_ext.5parm
24 setenv ROTPAR $DD/rotamers_AM1_aura_ext.10022007.parm
25 setenv ROTPARPDB $DD/scgauss_ext.parm
26 setenv TORPAR $DD/tor_opt_iter1_7p_old-ext.parm
27 setenv TORDPAR $DD/pot_tord_G631_DIL_ext.parm
28 setenv ELEPAR $DD/electr_631Gdp_ext.parm
29 setenv SIDEPAR ${DD}/sc_GB_opt_iter1_7p_old-ext_lip.parm
30 setenv FOURIER $DD/fourier_opt_iter1_7p_old-ext.parm
31 setenv SCPPAR $DD/scp_ext.parm
32 setenv SCCORPAR $DD/sccor_am1_pawel_ext.dat
33 setenv LIPTRANPAR $DD/Lip_tran_initial_ext.parm
34 setenv PATTERN $DD/patterns.cart
36 #----------------------------------------------------------------------------
37 $MPIRUN -rmk pbs $UNRES_BIN