ctest/cluster_wham_check.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 if [ "$1" == "1L2Y_clust" ]; then
   4  file=1L2Y_wham_T280K_ave.pdb
   5 else
   6  exit 1
   7 fi
   8
   9 # Check if file exist
  10 if [ ! -f $file ]; then
  11     echo "CRITICAL: out $file does not exist"
  12     exit 2
  13 fi
  14
  15 fam=`grep THERE 1L2Y_clust_clust.out_000|awk '{print $3}'`
  16 grep THERE 1L2Y_clust_clust.out_000
  17 grep REMARK 1L2Y_wham*[1-9].pdb
  18
  19  if [ "$fam" != "5" ]; then
  20   echo 'ERROR: number of families not equal 5'
  21   exit 1
  22  fi
  23