ctest/cluster_check.sh

   1 #!/bin/bash
   2
   3 if [ "$1" == "1l2y_clust_int" ]; then
   4  file=1l2y_csa_GB000_clust.int
   5 else
   6  exit 1
   7 fi
   8
   9 # Check if file exist
  10 if [ ! -f $file ]; then
  11     echo "CRITICAL: out $file does not exist"
  12     exit 2
  13 fi
  14
  15 fam=`grep THERE 1l2y_csa_GB000_clust.out|head -1|awk '{print $3}'`
  16 grep THERE 1l2y_csa_GB000_clust.out
  17 grep REMARK 1l2y_csa*[0-9][0-9][1-9].pdb
  18
  19  if [ "$fam" != "6" ]; then
  20   echo 'ERROR: number of families not equal 6'
  21   exit 1
  22  fi
  23