bin/wham/wham.csh

   1 #!/bin/csh -f
   2 #set echo
   3 # Script to run the program zscorezi_MPI on linux with MPICH (parallel version).
   4 #
   5 if ("$3" != "-p4amslave") then
   6 cd $4
   7 endif
   8
   9 echo "This job is running on host `hostname` "
  10 if ($#argv<2) then
  11   echo "You must supply potential type and input/output filename prefix."
  12   exit (1)
  13 endif
  14
  15 set DD = /users/adam/UNRES/PARAM
  16 set BIN = /users/adam/ZSCOREZ/bin
  17
  18 set POT = GB
  19 setenv POT GB
  20 setenv SCRATCHDIR /tmp
  21
  22 setenv PREFIX 2hep_wham_last
  23
  24 #
  25 # Is the specified potential in the list of valid force fields?
  26 #
  27 if (($POT != "LJ") && ($POT != "LJK") && ($POT != "BP") && ($POT != "GB") \
  28 && ($POT != "GBV") ) then
  29   echo "Unknown potential type $POT"
  30   exit(1)
  31 endif
  32
  33 # Check for the existence of the input file
  34
  35 #if (!(-e $2.inp)) then
  36 #  echo "Error: The input file $2.inp does not exist."
  37 #  exit(1)
  38 #endif
  39
  40 # 5/17/97 parameter file assignment was changed from link to SETENV statements
  41 #
  42 setenv BONDPAR $DD/bond.parm
  43 setenv THETPAR $DD/thetaml.5parm
  44 setenv ROTPAR $DD/scgauss.parm
  45 setenv TORPAR $DD/torsion_631Gdp.parm
  46 setenv TORDPAR $DD/torsion_double_631Gdp.parm
  47 setenv ELEPAR $DD/electr_631Gdp.parm
  48 setenv SIDEPAR ${DD}/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
  49 setenv FOURIER $DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
  50 setenv SCPPAR $DD/scp.parm
  51 setenv SCCORPAR $DD/rotcorr_AM1.parm
  52 # Define contact function for classification
  53 setenv CONTFUNC GB
  54 if (${CONTFUNC} == "GB") then
  55   setenv SIDEP ${DD}/contact.3.parm
  56 else if (${CONTFUNC} == "SCDIST") then
  57   setenv SIDEP ${DD}/cend.3.45.parm
  58 else if (${CONTFUNC} == "CEN") then
  59   setenv SIDEP ${DD}/cen.parm
  60 else if (${CONTFUNC} == "ODC") then
  61   setenv SIDEP ${DD}/odc.parm
  62 else if (${CONTFUNC} != "SIG") then
  63   echo "Unknown sidechain contact function ${CONTFUNC}"
  64   exit
  65 endif
  66
  67 # Set parallel environment, depending on job type (interactive or batch).
  68
  69 set DEBUG = 0
  70
  71 limit coredumpsize 0
  72 $BIN/wham_multparm-T-sccor-oldparm-small $*
  73 #$BIN/wham_multparm-OPTERON-T-sccor-oldparm $*
  74 #$BIN/wham_multparm-T-sccor-contmap-oldparm $*