Fixed the "***" issue in PDB output format by shifting the center of each molecule...
[unres.git] / source / wham / src /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 9258 CMakeLists.txt
-rw-r--r-- 4502 COMMON.ALLPARM
-rw-r--r-- 496 COMMON.CHAIN
-rw-r--r-- 2016 COMMON.COMPAR
-rw-r--r-- 261 COMMON.CONTACTS1
-rw-r--r-- 832 COMMON.CONTROL
-rw-r--r-- 439 COMMON.CONTROL.org
-rw-r--r-- 3829 COMMON.DFA
-rw-r--r-- 697 COMMON.DISTFIT
-rw-r--r-- 105 COMMON.ENEPS
-rw-r--r-- 214 COMMON.ENERGIES
-rw-r--r-- 817 COMMON.FREE
-rw-r--r-- 1428 COMMON.HOMRESTR
-rw-r--r-- 2847 COMMON.IOUNITS
-rw-r--r-- 376 COMMON.MPI
-rw-r--r-- 161 COMMON.OBCINKA
-rw-r--r-- 265 COMMON.PEPTCONT
-rw-r--r-- 95 COMMON.PROT
-rw-r--r-- 448 COMMON.PROTFILES
-rw-r--r-- 1401 COMMON.VAR
-rw-r--r-- 5451 DIMENSIONS
-rw-r--r-- 682 DIMENSIONS.COMPAR
-rw-r--r-- 393 DIMENSIONS.FREE
-rw-r--r-- 336 DIMENSIONS.FREE.old
-rw-r--r-- 1517 DIMENSIONS.ZSCOPT
lrwxrwxrwx 20 Makefile -> Makefile_MPICH_ifort
-rw-r--r-- 1717 Makefile-pgi
-rw-r--r-- 1228 Makefile1_jump
-rw-r--r-- 1908 Makefile_0
-rw-r--r-- 1954 Makefile_MPICH_ifort
-rw-r--r-- 2084 Makefile_jubl
-rw-r--r-- 1382 Makefile_jump
-rw-r--r-- 1434 Makefile_matrix
-rw-r--r-- 1890 Makefile_matrix_PGI
-rw-r--r-- 1944 Makefile_matrix_PGI-SCT-oldparm
-rw-r--r-- 1946 Makefile_matrix_PGI-SCTF-oldparm
-rw-r--r-- 1918 Makefile_matrix_PGI-oldparm
-rwxr-xr-x 98 a.sh
-rw-r--r-- 15415 angnorm.f
-rw-r--r-- 216 arcos.f
-rw-r--r-- 3490 bxread.F
-rw-r--r-- 8323 cartder.f
-rw-r--r-- 684 cartprint.f
-rw-r--r-- 7232 chainbuild.F
-rw-r--r-- 2113 compinfo.c
-rw-r--r-- 13200 conf_compar.F
-rw-r--r-- 3364 cont_frag.f
-rw-r--r-- 5741 contact.f
-rw-r--r-- 2946 contfunc.f
-rw-r--r-- 10921 cxread.F
-rw-r--r-- 10920 cxread.F.org
-rw-r--r-- 4226 define_pairs.f
-rw-r--r-- 117991 dfa.F
-rw-r--r-- 7148 elecont.f
-rw-r--r-- 30303 enecalc1.F
-rw-r--r-- 294000 energy_p_new.F
-rw-r--r-- 229762 energy_p_new.F.org
-rw-r--r-- 23590 fitsq.f
-rw-r--r-- 5635 geomout.F
-rw-r--r-- 1373 gnmr1.f
-rw-r--r-- 160 icant.f
drwxr-xr-x - include_unres
-rw-r--r-- 17268 initialize_p.F
-rw-r--r-- 15408 initialize_p.F.org
-rw-r--r-- 2002 int_from_cart.f
-rw-r--r-- 2690 intcor.f
-rw-r--r-- 12429 make_ensemble1.F
-rw-r--r-- 12984 match_contact.f
-rw-r--r-- 411 matmult.f
-rw-r--r-- 5904 misc.f
-rw-r--r-- 30235 molread_zs.F
-rw-r--r-- 1766 mygetenv.F
-rw-r--r-- 1223 mysort.f
-rw-r--r-- 1658 odlodc.f
-rw-r--r-- 3598 openunits.F
-rw-r--r-- 32344 parmread.F
-rw-r--r-- 928 pinorm.f
-rw-r--r-- 414 printmat.f
-rw-r--r-- 5598 proc_cont.f
-rw-r--r-- 1853 proc_proc.c
-rw-r--r-- 1460 promienie.f
-rw-r--r-- 6759 qwolynes.f
-rw-r--r-- 4777 read_ref_str.F
-rw-r--r-- 15461 readpdb.F
-rw-r--r-- 26280 readrtns.F
-rw-r--r-- 22823 readrtns.F.org
-rw-r--r-- 7308 readrtns_compar.F
-rw-r--r-- 626 rescode.f
-rw-r--r-- 4733 rmscalc.f
-rw-r--r-- 22626 secondary.f
-rw-r--r-- 754 setup_var.f
-rw-r--r-- 2862 slices.F
-rw-r--r-- 62944 ssMD.F
-rw-r--r-- 14289 store_parm.F
-rw-r--r-- 4480 timing.F
-rw-r--r-- 51863 wham_calc1.F
-rw-r--r-- 40743 wham_calc1.F.safe
-rw-r--r-- 7944 wham_multparm.F
-rw-r--r-- 6865 xread.F