dissulfides in md movie and putty
authorCezary Czaplewski <czarek@chem.univ.gda.pl>
Tue, 12 Sep 2017 20:31:11 +0000 (22:31 +0200)
committerCezary Czaplewski <czarek@chem.univ.gda.pl>
Tue, 12 Sep 2017 20:31:11 +0000 (22:31 +0200)
files/fluct.py
files/movie.pml

index 760edae..6865492 100644 (file)
@@ -21,6 +21,7 @@ for line in inFile.readlines():
 
 cmd.show_as("cartoon",mol)
 cmd.cartoon("putty", mol)
+cmd.show("sticks","(cys/ca+cb+sg) and byres (cys/sg and bound_to cys/sg)")
 cmd.set("cartoon_putty_scale_min", min(bfacts),obj)
 cmd.set("cartoon_putty_scale_max", max(bfacts),obj)
 cmd.set("cartoon_putty_transform", 7,obj)
index 0039b2e..a0dc731 100644 (file)
@@ -5,6 +5,7 @@ load file_MD000.pdb,md
 smooth md,2,2
 hide all
 show stick, md and name CA
+show sticks,(CYS/CA+CB) and byres (CYS/CB and bound_to CYS/CB)
 bg_color white
 spectrum count,rainbow,md