Adding MARTINI

author Adam Sieradzan <adasko@piasek4.chem.univ.gda.pl>

Wed, 19 Jan 2022 09:28:05 +0000 (10:28 +0100)

committer Adam Sieradzan <adasko@piasek4.chem.univ.gda.pl>

Wed, 19 Jan 2022 09:28:05 +0000 (10:28 +0100)
author Adam Sieradzan <adasko@piasek4.chem.univ.gda.pl>
Wed, 19 Jan 2022 09:28:05 +0000 (10:28 +0100)
committer Adam Sieradzan <adasko@piasek4.chem.univ.gda.pl>
Wed, 19 Jan 2022 09:28:05 +0000 (10:28 +0100)
diff --git a/PARAM/DNA-PROT_scbase.parm.bak b/PARAM/DNA-PROT_scbase.parm.bak

index 104b598..ae11edd 100644 (file)
--- a/PARAM/DNA-PROT_scbase.parm.bak
+++ b/PARAM/DNA-PROT_scbase.parm.bak
@@ -141,7 +141,7 @@ esp_scbase(i,j),sigma_scbase(i,j),chi_scbase(i,j),&
  0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
  0.0 0.0                                           !TrpG
  1.00 3.73 0.101 0.040 -0.478 0.027
-1.06 2.66 0.03 1.94
+1.06 2.66 0.03 1.94 1.86 2.47 0.699 0.459
  0.0 0.0 0.0 0.0
  0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
  0.0 0.0                                           !TrpC
diff --git a/PARAM/DNA_PROT_pepbase.parm2 b/PARAM/DNA_PROT_pepbase.parm2

new file mode 100644 (file)

index 0000000..f23ba7f
--- /dev/null
+++ b/PARAM/DNA_PROT_pepbase.parm2
@@ -0,0 +1,30 @@
+   1.80000000000000        3.10000000000000       0.254000000000000     
+ -0.129000000000000      -1.600000000000000E-002 -0.828000000000000     
+  0.580000000000000        14.4900000000000       5.000000000000000E-002
+   2.27000000000000        2.24000000000000        1.88000000000000     
+  0.528000000000000       0.490000000000000     
+   1.48000000000000        35.1100000000000        33.6300000000000     
+   1.60000000000000        3.07000000000000       0.398000000000000     
+ -0.114000000000000       7.000000000000001E-002 -0.899999976158142     
+  0.500000000000000        14.5500000000000       2.000000000000000E-002
+   2.27000000000000        2.24000000000000        1.88000000000000     
+  0.514000000000000       0.515000000000000     
+   4.88000000000000        35.4900000000000        34.5300000000000     
+   1.20000000000000        3.50000000000000       0.233000000000000     
+ -4.000000000000000E-003 -0.337000000000000       0.395000000000000     
+  0.420000000000000        14.5800000000000       0.200000000000000     
+   2.34000000000000        1.67000000000000        1.40000000000000     
+  0.975000000000000       0.123000000000000     
+   3.59000000000000        35.8900000000000        35.1300000000000     
+  0.920000000000000        3.54000000000000       0.115000000000000     
+ -0.274000000000000      -0.526000000000000      -7.000000000000000E-003
+  0.400000000000000        14.5700000000000       0.780000000000000     
+   2.32000000000000        1.98000000000000        1.66000000000000     
+  0.790000000000000       0.423000000000000     
+  8.599999999999999E-002   35.5300000000000        33.9500000000000     
+  0.920000000000000        3.54000000000000       0.115000000000000     
+ -0.274000000000000      -0.526000000000000      -7.000000000000000E-003
+  0.400000000000000        14.5700000000000       0.780000000000000     
+   2.32000000000000        1.98000000000000        1.66000000000000     
+  0.790000000000000       0.423000000000000     
+  8.599999999999999E-002   35.5300000000000        33.9500000000000     
diff --git a/PARAM/DNA_PROT_scbase.parm2 b/PARAM/DNA_PROT_scbase.parm2

new file mode 100644 (file)

index 0000000..3f8022b
--- /dev/null
+++ b/PARAM/DNA_PROT_scbase.parm2
@@ -0,0 +1,1350 @@
+   1.20000000000000        3.37000000000000      -0.167000000000000     
+ -8.699999999999999E-002 -0.899999976158142      -4.600000000000000E-002
+   1.62000000000000        3.33000000000000       1.000000000000000E-002
+   1.91000000000000        1.84000000000000        2.45000000000000     
+  0.561000000000000       0.241000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.43000000000000      -0.151000000000000     
+ -2.300000000000000E-002 -0.840000000000000      -7.300000000000000E-002
+   1.60000000000000        3.12000000000000       4.000000000000000E-003
+   1.90000000000000        1.90000000000000        2.53000000000000     
+  0.538000000000000       0.173000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.900000000000000        3.77000000000000      -0.127000000000000     
+ -0.166000000000000      -0.892000000000000       2.400000000000000E-002
+   1.39000000000000        2.71000000000000       1.000000000000000E-003
+   1.95000000000000        1.77000000000000        2.35000000000000     
+  0.703000000000000       0.215000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.00000000000000        3.73000000000000      -0.148000000000000     
+  0.173000000000000      -0.761000000000000       0.475000000000000     
+   2.26000000000000        3.30000000000000        1.26000000000000     
+   1.98000000000000        1.37000000000000        1.82000000000000     
+  0.914000000000000       3.600000000000000E-002
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.00000000000000        3.73000000000000      -0.148000000000000     
+  0.173000000000000      -0.761000000000000       0.475000000000000     
+   2.26000000000000        3.30000000000000        1.26000000000000     
+   1.98000000000000        1.37000000000000        1.82000000000000     
+  0.914000000000000       3.600000000000000E-002
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.00000000000000        3.55000000000000      -4.200000000000000E-002
+  4.400000000000000E-002 -0.899999976158142       5.400000000000000E-002
+   1.73000000000000        2.97000000000000       4.000000000000000E-004
+   1.94000000000000        1.67000000000000        2.22000000000000     
+  0.745000000000000       0.404000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.47000000000000       3.200000000000000E-002
+  0.195000000000000      -0.761000000000000      -2.000000000000000E-002
+   2.07000000000000        3.30000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.87000000000000        1.86000000000000        2.47000000000000     
+  0.630000000000000       0.433000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.71000000000000       0.138000000000000     
+  9.000000000000000E-002 -0.359000000000000       0.578000000000000     
+   1.49000000000000        2.97000000000000       6.000000000000000E-002
+   2.01000000000000        1.36000000000000        1.81000000000000     
+  0.966000000000000       0.107000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.52000000000000        3.67000000000000       6.800000000000000E-002
+  4.900000000000000E-002 -0.557000000000000       0.316000000000000     
+   1.80000000000000        3.18000000000000       2.000000000000000E-003
+   1.99000000000000        1.43000000000000        1.90000000000000     
+  0.930000000000000       0.149000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.52000000000000        3.67000000000000       6.800000000000000E-002
+  4.900000000000000E-002 -0.557000000000000       0.316000000000000     
+   1.80000000000000        3.18000000000000       2.000000000000000E-003
+   1.99000000000000        1.43000000000000        1.90000000000000     
+  0.930000000000000       0.149000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.69000000000000      -5.300000000000000E-002
+  0.131000000000000      -0.899999976158142       5.200000000000000E-002
+   1.27000000000000        2.81000000000000       0.380000000000000     
+   1.98000000000000        1.65000000000000        2.19000000000000     
+  0.771000000000000       0.449000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   2.00000000000000        3.59000000000000      -1.000000000000000E-002
+  8.799999999999999E-002 -0.869000000000000      -7.000000000000000E-003
+   2.03000000000000        3.27000000000000       4.000000000000000E-002
+   1.86000000000000        1.97000000000000        2.61000000000000     
+  0.650000000000000       0.187000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.68000000000000       0.196000000000000     
+  0.171000000000000      -0.278000000000000       0.238000000000000     
+  0.750000000000000        2.60000000000000       7.000000000000001E-002
+   2.00000000000000        1.70000000000000        2.25000000000000     
+  0.710000000000000       0.640000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.65000000000000       0.220000000000000     
+ -0.275000000000000       5.300000000000000E-002 -0.845000000000000     
+   1.51000000000000        3.00000000000000       1.000000000000000E-002
+   1.95000000000000        1.94000000000000        2.57000000000000     
+  0.380000000000000       0.464000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.65000000000000       0.220000000000000     
+ -0.275000000000000       5.300000000000000E-002 -0.845000000000000     
+   1.51000000000000        3.00000000000000       1.000000000000000E-002
+   1.95000000000000        1.94000000000000        2.57000000000000     
+  0.380000000000000       0.464000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.75000000000000      -0.132000000000000     
+  7.099999999999999E-002 -0.845000000000000       4.000000000000000E-002
+   1.85000000000000        3.00000000000000       4.000000000000000E-002
+   1.87000000000000        2.01000000000000        2.67000000000000     
+  0.572000000000000       0.216000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.78000000000000      -0.183000000000000     
+  0.109000000000000      -0.899999976158142       7.900000000000000E-002
+   1.93000000000000        3.21000000000000       1.000000000000000E-002
+   1.88000000000000        1.93000000000000        2.57000000000000     
+  0.619000000000000       0.201000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        4.08000000000000      -0.121000000000000     
+ -3.000000000000000E-003 -0.678000000000000       0.108000000000000     
+   1.74000000000000        2.94000000000000       0.920000000000000     
+   1.96000000000000        1.68000000000000        2.23000000000000     
+  0.839000000000000       0.126000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.99000000000000      -0.265000000000000     
+  0.135000000000000      -0.760000000000000       0.179000000000000     
+   2.11000000000000        3.21000000000000       8.000000000000000E-002
+   1.95000000000000        1.49000000000000        1.98000000000000     
+  0.904000000000000       5.400000000000000E-002
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.99000000000000      -0.265000000000000     
+  0.135000000000000      -0.760000000000000       0.179000000000000     
+   2.11000000000000        3.21000000000000       8.000000000000000E-002
+   1.95000000000000        1.49000000000000        1.98000000000000     
+  0.904000000000000       5.400000000000000E-002
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.83000000000000      -5.200000000000000E-002
+  0.222000000000000      -0.707000000000000       0.472000000000000     
+  0.570000000000000        14.4800000000000        3.35000000000000     
+   2.23000000000000        1.40000000000000        1.86000000000000     
+  0.945000000000000       7.199999999999999E-002
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   4.00000000000000        3.51000000000000       0.143000000000000     
+  5.100000000000000E-002 -0.161000000000000      -0.196000000000000     
+  0.670000000000000        14.7600000000000       1.000000000000000E-002
+   1.86000000000000        2.35000000000000        3.12000000000000     
+  0.318000000000000       0.241000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        4.05000000000000       0.161000000000000     
+  0.127000000000000      -0.114000000000000       0.208000000000000     
+   1.14000000000000        2.46000000000000        1.59000000000000     
+   1.98000000000000        1.95000000000000        2.59000000000000     
+  0.623000000000000       0.604000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.87000000000000        3.95000000000000      -5.200000000000000E-002
+  0.180000000000000      -0.468000000000000       0.278000000000000     
+  0.680000000000000        14.7300000000000        1.94000000000000     
+   2.05000000000000        1.55000000000000        2.06000000000000     
+  0.864000000000000       0.141000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.87000000000000        3.95000000000000      -5.200000000000000E-002
+  0.180000000000000      -0.468000000000000       0.278000000000000     
+  0.680000000000000        14.7300000000000        1.94000000000000     
+   2.05000000000000        1.55000000000000        2.06000000000000     
+  0.864000000000000       0.141000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.67000000000000      -8.599999999999999E-002
+  3.200000000000000E-002 -0.724000000000000       8.999999999999999E-003
+   1.83000000000000        3.03000000000000       0.120000000000000     
+   1.85000000000000        2.09000000000000        2.78000000000000     
+  0.478000000000000       0.232000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.72000000000000      -9.700000000000000E-002
+  6.700000000000000E-002 -0.688000000000000       2.600000000000000E-002
+   1.73000000000000        3.00000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.86000000000000        2.06000000000000        2.74000000000000     
+  0.495000000000000       0.296000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.91000000000000      -1.000000000000000E-003
+ -4.800000000000000E-002 -0.428000000000000       6.000000000000000E-003
+   1.34000000000000        2.79000000000000       1.000000000000000E-002
+   1.85000000000000        2.23000000000000        2.97000000000000     
+  0.435000000000000       0.303000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.99000000000000      -9.800000000000000E-002
+  0.225000000000000      -0.597000000000000       0.759000000000000     
+   1.45000000000000        2.81000000000000       7.000000000000001E-002
+   2.03000000000000        1.37000000000000        1.83000000000000     
+  0.974000000000000      -2.500000000000000E-002
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.99000000000000      -9.800000000000000E-002
+  0.225000000000000      -0.597000000000000       0.759000000000000     
+   1.45000000000000        2.81000000000000       7.000000000000001E-002
+   2.03000000000000        1.37000000000000        1.83000000000000     
+  0.974000000000000      -2.500000000000000E-002
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.00000000000000        3.68000000000000       0.200000000000000     
+  0.219000000000000       5.000000000000000E-002  0.348000000000000     
+  0.300000000000000        1.00000000000000       5.000000000000000E-005
+   2.08000000000000        1.66000000000000        2.21000000000000     
+  0.788000000000000       0.759000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.70000000000000      -4.000000000000000E-002
+  6.500000000000000E-002 -0.874000000000000      -1.300000000000000E-002
+   1.97000000000000        2.90000000000000       6.000000000000000E-003
+   1.92000000000000        1.85000000000000        2.47000000000000     
+  0.721000000000000       0.260000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.00000000000000        3.73000000000000       0.101000000000000     
+  4.000000000000000E-002 -0.478000000000000       2.700000000000000E-002
+   1.06000000000000        2.66000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.94000000000000        1.86000000000000        2.47000000000000     
+  0.699000000000000       0.459000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.64000000000000       0.132000000000000     
+  0.276000000000000       7.099999999999999E-002  0.420000000000000     
+  0.890000000000000        2.72000000000000       3.000000000000000E-003
+   1.97000000000000        1.80000000000000        2.20000000000000     
+  0.462000000000000       0.537000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.64000000000000       0.132000000000000     
+  0.276000000000000       7.099999999999999E-002  0.420000000000000     
+  0.890000000000000        2.72000000000000       3.000000000000000E-003
+   1.97000000000000        1.80000000000000        2.20000000000000     
+  0.462000000000000       0.537000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.00000000000000        3.58000000000000       0.114000000000000     
+  0.129000000000000      -0.216000000000000       0.206000000000000     
+  0.930000000000000        2.54000000000000        1.13000000000000     
+   2.09000000000000        1.50000000000000        2.00000000000000     
+  0.811000000000000       0.609000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   2.00000000000000        3.57000000000000       0.195000000000000     
+ -6.400000000000000E-002  4.300000000000000E-002 -0.899999976158142     
+   2.39000000000000        3.43000000000000       4.000000000000000E-003
+   1.90000000000000        1.75000000000000        2.33000000000000     
+  0.205000000000000       0.778000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.600000000000000        3.64000000000000       0.302000000000000     
+  0.354000000000000      -1.700000000000000E-002  0.899999976158142     
+  0.100000000000000        1.42000000000000        3.29000000000000     
+   2.18000000000000        1.32000000000000        1.75000000000000     
+  0.451000000000000       0.533000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   2.40000000000000        3.51000000000000      -8.100000000000000E-002
+  0.119000000000000      -0.878000000000000       9.400000000000000E-002
+   2.97000000000000        3.49000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.84000000000000        1.73000000000000        2.30000000000000     
+  0.705000000000000       0.161000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   2.40000000000000        3.51000000000000      -8.100000000000000E-002
+  0.119000000000000      -0.878000000000000       9.400000000000000E-002
+   2.97000000000000        3.49000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.84000000000000        1.73000000000000        2.30000000000000     
+  0.705000000000000       0.161000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.25000000000000      -5.200000000000000E-002
+  2.500000000000000E-002 -0.449000000000000      -8.000000000000000E-002
+   1.65000000000000        2.99000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.93000000000000        2.00000000000000        2.66000000000000     
+  0.383000000000000       0.166000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.28000000000000      -1.600000000000000E-002
+  7.700000000000000E-002 -0.540000000000000      -2.500000000000000E-002
+   1.63000000000000        2.93000000000000       0.100000000000000     
+   1.91000000000000        2.01000000000000        2.68000000000000     
+  0.401000000000000       0.301000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.50000000000000      -1.600000000000000E-002
+ -0.290000000000000      -0.427000000000000      -9.400000000000000E-002
+   1.71000000000000        2.99000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.88000000000000        2.05000000000000        2.72000000000000     
+  0.402000000000000       0.148000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.41000000000000       1.800000000000000E-002
+ -0.238000000000000      -0.393000000000000      -0.110000000000000     
+   1.63000000000000        2.88000000000000       2.000000000000000E-002
+   1.93000000000000        2.03000000000000        2.70000000000000     
+  0.390000000000000       0.227000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.41000000000000       1.800000000000000E-002
+ -0.238000000000000      -0.393000000000000      -0.110000000000000     
+   1.63000000000000        2.88000000000000       2.000000000000000E-002
+   1.93000000000000        2.03000000000000        2.70000000000000     
+  0.390000000000000       0.227000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.550000000000000        3.13000000000000      -0.217000000000000     
+ -3.700000000000000E-002 -0.899999976158142       1.900000000000000E-002
+   1.00000000000000        2.63000000000000       5.000000000000000E-002
+   1.98000000000000        1.84000000000000        2.44000000000000     
+  0.337000000000000       0.292000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        2.91000000000000      -3.100000000000000E-002
+  3.200000000000000E-002 -0.594000000000000       8.000000000000000E-003
+   1.45000000000000        2.68000000000000       0.170000000000000     
+   2.10000000000000        1.96000000000000        2.61000000000000     
+  0.248000000000000       0.225000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.240000000000000        3.63000000000000      -8.799999999999999E-002
+ -0.323000000000000      -0.899999976158142       7.099999999999999E-002
+   1.95000000000000        2.66000000000000        1.92000000000000     
+   2.07000000000000        1.37000000000000        1.82000000000000     
+  0.142000000000000       0.780000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.500000000000000        3.51000000000000      -0.336000000000000     
+  8.200000000000000E-002 -0.899999976158142       0.369000000000000     
+   1.35000000000000        2.94000000000000        1.21000000000000     
+   2.08000000000000        1.12000000000000        1.48000000000000     
+  0.967000000000000       1.200000000000000E-002
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.500000000000000        3.51000000000000      -0.336000000000000     
+  8.200000000000000E-002 -0.899999976158142       0.369000000000000     
+   1.35000000000000        2.94000000000000        1.21000000000000     
+   2.08000000000000        1.12000000000000        1.48000000000000     
+  0.967000000000000       1.200000000000000E-002
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.68000000000000      -0.159000000000000     
+ -2.500000000000000E-002 -0.899999976158142      -0.500000000000000     
+  0.380000000000000        14.5800000000000       0.430000000000000     
+   2.28000000000000        1.85000000000000        2.20000000000000     
+  0.685000000000000       0.307000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   5.78200000000000        35.8760000000000        35.0530000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.80000000000000        3.48000000000000      -4.800000000000000E-002
+ -2.900000000000000E-002 -0.528000000000000      -8.200000000000000E-002
+  0.490000000000000        14.5500000000000       3.000000000000000E-002
+   2.19000000000000        2.28000000000000        2.71000000000000     
+  0.401000000000000       0.223000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   3.79400000000000        35.8890000000000        35.4740000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.92000000000000      -0.110000000000000     
+ -0.137000000000000      -0.899999976158142       4.600000000000000E-002
+  0.350000000000000        14.5400000000000       1.000000000000000E-002
+   2.24000000000000        2.06000000000000        2.45000000000000     
+  0.630000000000000       0.265000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   6.38600000000000        35.9720000000000        34.5050000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.400000000000000        3.97000000000000      -3.100000000000000E-002
+  0.152000000000000      -0.899999976158142       0.270000000000000     
+  0.130000000000000        14.5500000000000       5.000000000000000E-002
+   2.25000000000000        2.05000000000000        2.45000000000000     
+  0.557000000000000       0.636000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   5.01000000000000        35.2650000000000        32.8210000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.400000000000000        3.97000000000000      -3.100000000000000E-002
+  0.152000000000000      -0.899999976158142       0.270000000000000     
+  0.130000000000000        14.5500000000000       5.000000000000000E-002
+   2.25000000000000        2.05000000000000        2.45000000000000     
+  0.557000000000000       0.636000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   5.01000000000000        35.2650000000000        32.8210000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.600000000000000        3.53000000000000      -0.115000000000000     
+ -0.128000000000000      -0.899999976158142       7.000000000000000E-003
+  0.280000000000000        14.5700000000000       3.000000000000000E-002
+   2.29000000000000        1.77000000000000        2.11000000000000     
+  0.685000000000000       0.328000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   3.24000000000000        35.3430000000000        33.7580000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.51000000000000      -0.209000000000000     
+ -3.300000000000000E-002 -0.899999976158142      -3.000000000000000E-004
+  0.320000000000000        14.6000000000000       4.000000000000000E-002
+   2.24000000000000        1.87000000000000        2.23000000000000     
+  0.642000000000000       0.209000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  1.800000000000000E-002   35.2840000000000        32.6780000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.68000000000000      -7.000000000000001E-002
+ -0.158000000000000      -0.745000000000000      -6.000000000000000E-002
+  0.280000000000000        14.2600000000000       0.170000000000000     
+   2.31000000000000        1.95000000000000        2.33000000000000     
+  0.662000000000000       0.190000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.148000000000000        29.3300000000000       0.755000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.600000000000000        3.68000000000000      -0.121000000000000     
+ -9.000000000000000E-002 -0.899999976158142       4.100000000000000E-002
+  0.250000000000000        14.6800000000000       8.000000000000000E-002
+   2.16000000000000        1.81000000000000        2.15000000000000     
+  0.714000000000000       0.302000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   1.38400000000000        33.4370000000000        21.9060000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.600000000000000        3.68000000000000      -0.121000000000000     
+ -9.000000000000000E-002 -0.899999976158142       4.100000000000000E-002
+  0.250000000000000        14.6800000000000       8.000000000000000E-002
+   2.16000000000000        1.81000000000000        2.15000000000000     
+  0.714000000000000       0.302000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   1.38400000000000        33.4370000000000        21.9060000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.51000000000000       4.100000000000000E-002
+  0.100000000000000      -0.899999976158142       1.500000000000000E-002
+  0.500000000000000        14.4300000000000       1.000000000000000E-002
+   2.29000000000000        1.92000000000000        2.29000000000000     
+  0.705000000000000       0.356000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  3.000000000000000E-002   35.0980000000000        31.3230000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.57000000000000      -9.000000000000000E-002
+  6.600000000000000E-002 -0.899999976158142      -1.000000000000000E-003
+  0.530000000000000        14.5800000000000       0.210000000000000     
+   2.27000000000000        1.82000000000000        2.17000000000000     
+  0.764000000000000       0.190000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  1.000000000000000E-003   35.6310000000000        35.0770000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.81000000000000      -5.900000000000000E-002
+ -4.300000000000000E-002 -0.831000000000000       4.000000000000000E-004
+  0.450000000000000        14.5600000000000       2.000000000000000E-002
+   2.31000000000000        1.79000000000000        2.14000000000000     
+  0.836000000000000       0.135000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   1.11300000000000        35.3470000000000        34.5020000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.71000000000000      -5.700000000000000E-002
+ -5.000000000000000E-002 -0.899999976158142      -3.200000000000000E-002
+  0.490000000000000        14.5800000000000       0.550000000000000     
+   2.29000000000000        1.77000000000000        2.11000000000000     
+  0.841000000000000       0.141000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  1.600000000000000E-002   35.6410000000000        34.4210000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.71000000000000      -5.700000000000000E-002
+ -5.000000000000000E-002 -0.899999976158142      -3.200000000000000E-002
+  0.490000000000000        14.5800000000000       0.550000000000000     
+   2.29000000000000        1.77000000000000        2.11000000000000     
+  0.841000000000000       0.141000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  1.600000000000000E-002   35.6410000000000        34.4210000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.48000000000000      -0.214000000000000     
+  6.500000000000000E-002 -0.899999976158142      -2.400000000000000E-002
+  0.480000000000000        14.5800000000000       0.730000000000000     
+   2.28000000000000        1.86000000000000        2.22000000000000     
+  0.684000000000000       0.212000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  3.000000000000000E-003   35.8900000000000        35.7250000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.52000000000000      -0.253000000000000     
+  1.000000000000000E-002 -0.899999976158142      -1.700000000000000E-002
+  0.480000000000000        14.5700000000000       0.880000000000000     
+   2.29000000000000        1.86000000000000        2.22000000000000     
+  0.682000000000000       0.164000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  3.800000000000000E-002   35.9450000000000        35.7910000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.74000000000000      -1.900000000000000E-002
+ -0.231000000000000      -0.738000000000000      -7.800000000000000E-002
+  0.350000000000000        14.5600000000000       7.000000000000001E-002
+   2.22000000000000        2.12000000000000        2.53000000000000     
+  0.623000000000000       0.278000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  1.100000000000000E-002   36.0330000000000        34.9680000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.57000000000000      -8.300000000000000E-002
+ -7.199999999999999E-002 -0.759000000000000      -0.110000000000000     
+  0.430000000000000        14.5600000000000        1.11000000000000     
+   2.25000000000000        2.07000000000000        2.47000000000000     
+  0.587000000000000       0.165000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  3.000000000000000E-003   35.9360000000000        35.8020000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.57000000000000      -8.300000000000000E-002
+ -7.199999999999999E-002 -0.759000000000000      -0.110000000000000     
+  0.430000000000000        14.5600000000000        1.11000000000000     
+   2.25000000000000        2.07000000000000        2.47000000000000     
+  0.587000000000000       0.165000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  3.000000000000000E-003   35.9360000000000        35.8020000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.80000000000000      -0.106000000000000     
+  6.300000000000000E-002 -0.899999976158142       3.000000000000000E-002
+  0.470000000000000        14.5200000000000        3.10000000000000     
+   2.12000000000000        1.90000000000000        2.53000000000000     
+  0.618000000000000       0.377000000000000     
+  4.700000000000000E-002  6.500000000000000E-002   2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.44800000000000        2.79400000000000     
+  1.800000000000000E-003  0.600000000000000     
+  0.800000000000000        3.83000000000000       0.141000000000000     
+ -4.800000000000000E-002 -4.500000000000000E-002 -0.899999976158142     
+  0.400000000000000        14.4700000000000        3.20000000000000     
+   2.13000000000000        2.02000000000000        2.69000000000000     
+  0.354000000000000       0.653000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.106000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   9.59700000000000        2.53100000000000     
+  5.400000000000000E-003  0.600000000000000     
+   1.00000000000000        3.95000000000000       9.000000000000000E-002
+ -2.100000000000000E-002 -0.524000000000000      -6.200000000000000E-002
+  0.350000000000000        14.5400000000000        2.93000000000000     
+   2.06000000000000        2.12000000000000        2.82000000000000     
+  0.544000000000000       0.383000000000000     
+  1.000000000000000E-002  4.800000000000000E-002   2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   3.48700000000000        2.52700000000000     
+  1.100000000000000E-003  0.600000000000000     
+  0.800000000000000        4.02000000000000      -6.200000000000000E-002
+ -5.900000000000000E-002 -0.899999976158142       2.000000000000000E-003
+  0.520000000000000        14.4900000000000        3.22000000000000     
+   2.16000000000000        1.91000000000000        2.41000000000000     
+  0.688000000000000       0.388000000000000     
+  0.792000000000000       0.212000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   6.12600000000000        2.68600000000000     
+  2.200000000000000E-003  0.600000000000000     
+  0.800000000000000        4.02000000000000      -6.200000000000000E-002
+ -5.900000000000000E-002 -0.899999976158142       2.000000000000000E-003
+  0.520000000000000        14.4900000000000        3.22000000000000     
+   2.16000000000000        1.91000000000000        2.41000000000000     
+  0.688000000000000       0.388000000000000     
+  0.792000000000000       0.212000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   6.12600000000000        2.68600000000000     
+  2.200000000000000E-003  0.600000000000000     
+  0.800000000000000        3.74000000000000      -0.184000000000000     
+ -0.558000000000000      -0.899999976158142      -0.151000000000000     
+  0.560000000000000        14.4700000000000        3.36000000000000     
+   2.12000000000000        2.06000000000000        2.74000000000000     
+  0.428000000000000       0.139000000000000     
+  0.124000000000000       0.625000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  5.000000000000000E-003   2.14000000000000     
+  1.330000000000000E-002  0.600000000000000     
+  0.400000000000000        3.99000000000000       5.700000000000000E-002
+ -2.200000000000000E-002 -0.106000000000000      -0.899999976158142     
+  0.260000000000000        14.7500000000000       1.000000000000000E-002
+   1.96000000000000        1.91000000000000        2.53000000000000     
+  0.149000000000000       0.834000000000000     
+   1.02200000000000       0.779000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   15.4120000000000       1.200000000000000E-002
+  0.000000000000000E+000  0.610000000000000     
+  0.800000000000000        3.98000000000000       5.700000000000000E-002
+ -4.300000000000000E-002 -4.200000000000000E-002 -0.753000000000000     
+  0.370000000000000        14.4600000000000        3.42000000000000     
+   2.12000000000000        2.09000000000000        2.78000000000000     
+  0.510000000000000       0.300000000000000     
+  2.500000000000000E-002  0.617000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000   2.08300000000000     
+  1.520000000000000E-002  0.600000000000000     
+  0.200000000000000        4.18000000000000       1.500000000000000E-002
+ -1.200000000000000E-002 -0.899999976158142       6.300000000000000E-002
+   1.41000000000000        14.5600000000000        3.29000000000000     
+   2.22000000000000        1.21000000000000        1.60000000000000     
+  0.497000000000000       0.739000000000000     
+  8.000000000000000E-003  0.426000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  2.000000000000000E-003   2.56600000000000     
+  4.700000000000000E-003  0.600000000000000     
+  0.200000000000000        4.18000000000000       1.500000000000000E-002
+ -1.200000000000000E-002 -0.899999976158142       6.300000000000000E-002
+   1.41000000000000        14.5600000000000        3.29000000000000     
+   2.22000000000000        1.21000000000000        1.60000000000000     
+  0.497000000000000       0.739000000000000     
+  8.000000000000000E-003  0.426000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  2.000000000000000E-003   2.56600000000000     
+  4.700000000000000E-003  0.600000000000000     
+   1.20000000000000        3.54000000000000      -1.400000000000000E-002
+  0.168000000000000      -0.899999976158142       5.900000000000000E-002
+   1.52000000000000        2.87000000000000       4.000000000000000E-002
+   1.95000000000000        1.71000000000000        2.28000000000000     
+  0.730000000000000       0.384000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.80000000000000        3.54000000000000      -2.200000000000000E-002
+  9.100000000000000E-002 -0.899999976158142      -3.600000000000000E-002
+   2.08000000000000        3.34000000000000       1.000000000000000E-002
+   1.88000000000000        1.88000000000000        2.50000000000000     
+  0.670000000000000       0.153000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.69000000000000       0.114000000000000     
+  1.300000000000000E-002 -0.497000000000000       1.400000000000000E-002
+   1.21000000000000        2.75000000000000       7.000000000000001E-002
+   1.98000000000000        1.75000000000000        2.33000000000000     
+  0.737000000000000       0.399000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.40000000000000        3.65000000000000       0.240000000000000     
+  0.183000000000000      -0.138000000000000       9.100000000000000E-002
+  0.460000000000000        2.56000000000000       0.110000000000000     
+   1.99000000000000        1.84000000000000        2.45000000000000     
+  0.666000000000000       0.660000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.40000000000000        3.65000000000000       0.240000000000000     
+  0.183000000000000      -0.138000000000000       9.100000000000000E-002
+  0.460000000000000        2.56000000000000       0.110000000000000     
+   1.99000000000000        1.84000000000000        2.45000000000000     
+  0.666000000000000       0.660000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.41000000000000       0.261000000000000     
+  5.000000000000000E-003  3.000000000000000E-002 -0.899999976158142     
+  0.640000000000000        14.5900000000000        2.63000000000000     
+   2.09000000000000        1.84000000000000        2.44000000000000     
+  0.528000000000000       0.563000000000000     
+  1.000000000000000E-003  0.942000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  1.400000000000000E-002   3.09100000000000     
+  1.800000000000000E-003  0.600000000000000     
+   1.10000000000000        3.41000000000000       0.284000000000000     
+ -0.146000000000000       4.800000000000000E-002 -0.899999976158142     
+  0.560000000000000        14.5700000000000        2.73000000000000     
+   2.13000000000000        1.69000000000000        2.25000000000000     
+  0.426000000000000       0.643000000000000     
+  0.454000000000000       0.792000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  2.500000000000000E-002   4.33400000000000     
+  3.000000000000000E-005  0.600000000000000     
+   1.20000000000000        3.26000000000000       0.332000000000000     
+ -6.400000000000000E-002  1.000000000000000E-002 -0.899999976158142     
+  0.520000000000000        14.4600000000000        2.30000000000000     
+   2.07000000000000        1.79000000000000        2.38000000000000     
+  0.555000000000000       0.511000000000000     
+  0.238000000000000        1.83000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  3.000000000000000E-003   3.59600000000000     
+  7.000000000000000E-004  0.600000000000000     
+  0.800000000000000        3.56000000000000       0.154000000000000     
+ -0.134000000000000      -0.102000000000000      -0.799000000000000     
+  0.470000000000000        14.4800000000000        3.33000000000000     
+   2.20000000000000        1.68000000000000        2.23000000000000     
+  0.613000000000000       0.518000000000000     
+  6.600000000000000E-002  0.671000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.194000000000000        2.30200000000000     
+  1.020000000000000E-002  0.600000000000000     
+  0.800000000000000        3.56000000000000       0.154000000000000     
+ -0.134000000000000      -0.102000000000000      -0.799000000000000     
+  0.470000000000000        14.4800000000000        3.33000000000000     
+   2.20000000000000        1.68000000000000        2.23000000000000     
+  0.613000000000000       0.518000000000000     
+  6.600000000000000E-002  0.671000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.194000000000000        2.30200000000000     
+  1.020000000000000E-002  0.600000000000000     
+  0.800000000000000        3.17000000000000       0.248000000000000     
+  0.167000000000000      -0.113000000000000      -0.326000000000000     
+   1.63000000000000        1.70000000000000        14.5800000000000     
+   3.29000000000000        1.21000000000000        1.61000000000000     
+  0.315000000000000       0.443000000000000     
+  1.000000000000000E-002  0.546000000000000        3.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.93900000000000       1.500000000000000E-002
+  1.930000000000000E-002  0.600000000000000     
+  0.700000000000000        3.55000000000000       0.146000000000000     
+ -0.141000000000000      -8.200000000000000E-002 -0.899999976158142     
+  0.390000000000000        14.3300000000000        3.44000000000000     
+   2.28000000000000        1.70000000000000        2.26000000000000     
+  0.629000000000000       0.572000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.704000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  3.200000000000000E-002   2.72100000000000     
+  3.000000000000000E-003  0.600000000000000     
+  0.450000000000000        3.90000000000000       8.400000000000001E-002
+ -0.189000000000000      -0.203000000000000      -0.715000000000000     
+  0.410000000000000        14.4900000000000        3.25000000000000     
+   2.22000000000000        1.49000000000000        1.98000000000000     
+  0.819000000000000       0.555000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.893000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  6.200000000000000E-002   3.31800000000000     
+  1.300000000000000E-003  0.600000000000000     
+  0.700000000000000        4.03000000000000       8.799999999999999E-002
+ -0.517000000000000      -0.899999976158142      -0.143000000000000     
+  0.490000000000000        14.4700000000000        3.37000000000000     
+   2.15000000000000        1.94000000000000        2.58000000000000     
+  0.696000000000000       0.410000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.789000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  2.200000000000000E-002   2.31100000000000     
+  1.050000000000000E-002  0.600000000000000     
+  0.700000000000000        4.03000000000000       8.799999999999999E-002
+ -0.517000000000000      -0.899999976158142      -0.143000000000000     
+  0.490000000000000        14.4700000000000        3.37000000000000     
+   2.15000000000000        1.94000000000000        2.58000000000000     
+  0.696000000000000       0.410000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.789000000000000        2.00000000000000     
+   1.00000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  2.200000000000000E-002   2.31100000000000     
+  1.050000000000000E-002  0.600000000000000     
+   1.60000000000000        3.51000000000000      -0.131000000000000     
+  1.100000000000000E-002 -0.742000000000000      -3.400000000000000E-002
+   1.88000000000000        3.04000000000000       0.130000000000000     
+   1.88000000000000        1.96000000000000        2.61000000000000     
+  0.520000000000000       0.271000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.53000000000000      -1.000000000000000E-003
+ -8.000000000000000E-003 -0.463000000000000      -0.115000000000000     
+   1.61000000000000        2.94000000000000       4.000000000000000E-002
+   1.88000000000000        2.05000000000000        2.72000000000000     
+  0.465000000000000       0.235000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.83000000000000      -2.700000000000000E-002
+ -4.500000000000000E-002 -0.473000000000000       1.200000000000000E-002
+   1.32000000000000        2.84000000000000       7.000000000000001E-002
+   1.91000000000000        1.97000000000000        2.62000000000000     
+  0.547000000000000       0.377000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.00000000000000        3.80000000000000      -5.600000000000000E-002
+  0.114000000000000      -0.599000000000000       0.409000000000000     
+   1.49000000000000        2.84000000000000       5.000000000000000E-002
+   2.02000000000000        1.39000000000000        1.85000000000000     
+  0.908000000000000       0.109000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.00000000000000        3.80000000000000      -5.600000000000000E-002
+  0.114000000000000      -0.599000000000000       0.409000000000000     
+   1.49000000000000        2.84000000000000       5.000000000000000E-002
+   2.02000000000000        1.39000000000000        1.85000000000000     
+  0.908000000000000       0.109000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.00000000000000        3.55000000000000      -4.200000000000000E-002
+  4.400000000000000E-002 -0.899999976158142       5.400000000000000E-002
+   1.73000000000000        2.97000000000000       4.000000000000000E-004
+   1.94000000000000        1.67000000000000        2.22000000000000     
+  0.745000000000000       0.404000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.47000000000000       3.200000000000000E-002
+  0.195000000000000      -0.761000000000000      -2.000000000000000E-002
+   2.07000000000000        3.30000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.87000000000000        1.86000000000000        2.47000000000000     
+  0.630000000000000       0.433000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.20000000000000        3.71000000000000       0.138000000000000     
+  9.000000000000000E-002 -0.359000000000000       0.578000000000000     
+   1.49000000000000        2.97000000000000       6.000000000000000E-002
+   2.01000000000000        1.36000000000000        1.81000000000000     
+  0.966000000000000       0.107000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.52000000000000        3.67000000000000       6.800000000000000E-002
+  4.900000000000000E-002 -0.557000000000000       0.316000000000000     
+   1.80000000000000        3.18000000000000       2.000000000000000E-003
+   1.99000000000000        1.43000000000000        1.90000000000000     
+  0.930000000000000       0.149000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.52000000000000        3.67000000000000       6.800000000000000E-002
+  4.900000000000000E-002 -0.557000000000000       0.316000000000000     
+   1.80000000000000        3.18000000000000       2.000000000000000E-003
+   1.99000000000000        1.43000000000000        1.90000000000000     
+  0.930000000000000       0.149000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.69000000000000      -5.300000000000000E-002
+  0.131000000000000      -0.899999976158142       5.200000000000000E-002
+   1.27000000000000        2.81000000000000       0.380000000000000     
+   1.98000000000000        1.65000000000000        2.19000000000000     
+  0.771000000000000       0.449000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   2.00000000000000        3.59000000000000      -1.000000000000000E-002
+  8.799999999999999E-002 -0.869000000000000      -7.000000000000000E-003
+   2.03000000000000        3.27000000000000       4.000000000000000E-002
+   1.86000000000000        1.97000000000000        2.61000000000000     
+  0.650000000000000       0.187000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.68000000000000       0.196000000000000     
+  0.171000000000000      -0.278000000000000       0.238000000000000     
+  0.750000000000000        2.60000000000000       7.000000000000001E-002
+   2.00000000000000        1.70000000000000        2.25000000000000     
+  0.710000000000000       0.640000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.65000000000000       0.220000000000000     
+ -0.275000000000000       5.300000000000000E-002 -0.845000000000000     
+   1.51000000000000        3.00000000000000       1.000000000000000E-002
+   1.95000000000000        1.94000000000000        2.57000000000000     
+  0.380000000000000       0.464000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.65000000000000       0.220000000000000     
+ -0.275000000000000       5.300000000000000E-002 -0.845000000000000     
+   1.51000000000000        3.00000000000000       1.000000000000000E-002
+   1.95000000000000        1.94000000000000        2.57000000000000     
+  0.380000000000000       0.464000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.25000000000000      -5.200000000000000E-002
+  2.500000000000000E-002 -0.449000000000000      -8.000000000000000E-002
+   1.65000000000000        2.99000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.93000000000000        2.00000000000000        2.66000000000000     
+  0.383000000000000       0.166000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.28000000000000      -1.600000000000000E-002
+  7.700000000000000E-002 -0.540000000000000      -2.500000000000000E-002
+   1.63000000000000        2.93000000000000       0.100000000000000     
+   1.91000000000000        2.01000000000000        2.68000000000000     
+  0.401000000000000       0.301000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.50000000000000      -1.600000000000000E-002
+ -0.290000000000000      -0.427000000000000      -9.400000000000000E-002
+   1.71000000000000        2.99000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.88000000000000        2.05000000000000        2.72000000000000     
+  0.402000000000000       0.148000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.41000000000000       1.800000000000000E-002
+ -0.238000000000000      -0.393000000000000      -0.110000000000000     
+   1.63000000000000        2.88000000000000       2.000000000000000E-002
+   1.93000000000000        2.03000000000000        2.70000000000000     
+  0.390000000000000       0.227000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.41000000000000       1.800000000000000E-002
+ -0.238000000000000      -0.393000000000000      -0.110000000000000     
+   1.63000000000000        2.88000000000000       2.000000000000000E-002
+   1.93000000000000        2.03000000000000        2.70000000000000     
+  0.390000000000000       0.227000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.25000000000000      -5.200000000000000E-002
+  2.500000000000000E-002 -0.449000000000000      -8.000000000000000E-002
+   1.65000000000000        2.99000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.93000000000000        2.00000000000000        2.66000000000000     
+  0.383000000000000       0.166000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.28000000000000      -1.600000000000000E-002
+  7.700000000000000E-002 -0.540000000000000      -2.500000000000000E-002
+   1.63000000000000        2.93000000000000       0.100000000000000     
+   1.91000000000000        2.01000000000000        2.68000000000000     
+  0.401000000000000       0.301000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.50000000000000      -1.600000000000000E-002
+ -0.290000000000000      -0.427000000000000      -9.400000000000000E-002
+   1.71000000000000        2.99000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.88000000000000        2.05000000000000        2.72000000000000     
+  0.402000000000000       0.148000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.41000000000000       1.800000000000000E-002
+ -0.238000000000000      -0.393000000000000      -0.110000000000000     
+   1.63000000000000        2.88000000000000       2.000000000000000E-002
+   1.93000000000000        2.03000000000000        2.70000000000000     
+  0.390000000000000       0.227000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.60000000000000        3.41000000000000       1.800000000000000E-002
+ -0.238000000000000      -0.393000000000000      -0.110000000000000     
+   1.63000000000000        2.88000000000000       2.000000000000000E-002
+   1.93000000000000        2.03000000000000        2.70000000000000     
+  0.390000000000000       0.227000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.00000000000000        3.58000000000000       0.114000000000000     
+  0.129000000000000      -0.216000000000000       0.206000000000000     
+  0.930000000000000        2.54000000000000        1.13000000000000     
+   2.09000000000000        1.50000000000000        2.00000000000000     
+  0.811000000000000       0.609000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   2.00000000000000        3.57000000000000       0.195000000000000     
+ -6.400000000000000E-002  4.300000000000000E-002 -0.899999976158142     
+   2.39000000000000        3.43000000000000       4.000000000000000E-003
+   1.90000000000000        1.75000000000000        2.33000000000000     
+  0.205000000000000       0.778000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.600000000000000        3.64000000000000       0.302000000000000     
+  0.354000000000000      -1.700000000000000E-002  0.899999976158142     
+  0.100000000000000        1.42000000000000        3.29000000000000     
+   2.18000000000000        1.32000000000000        1.75000000000000     
+  0.451000000000000       0.533000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   2.40000000000000        3.51000000000000      -8.100000000000000E-002
+  0.119000000000000      -0.878000000000000       9.400000000000000E-002
+   2.97000000000000        3.49000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.84000000000000        1.73000000000000        2.30000000000000     
+  0.705000000000000       0.161000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   2.40000000000000        3.51000000000000      -8.100000000000000E-002
+  0.119000000000000      -0.878000000000000       9.400000000000000E-002
+   2.97000000000000        3.49000000000000       3.000000000000000E-002
+   1.84000000000000        1.73000000000000        2.30000000000000     
+  0.705000000000000       0.161000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.68000000000000      -0.159000000000000     
+ -2.500000000000000E-002 -0.899999976158142      -0.500000000000000     
+  0.380000000000000        14.5800000000000       0.430000000000000     
+   2.28000000000000        1.85000000000000        2.20000000000000     
+  0.685000000000000       0.307000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   5.78200000000000        35.8760000000000        35.0530000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+   1.80000000000000        3.48000000000000      -4.800000000000000E-002
+ -2.900000000000000E-002 -0.528000000000000      -8.200000000000000E-002
+  0.490000000000000        14.5500000000000       3.000000000000000E-002
+   2.19000000000000        2.28000000000000        2.71000000000000     
+  0.401000000000000       0.223000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   3.79400000000000        35.8890000000000        35.4740000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.92000000000000      -0.110000000000000     
+ -0.137000000000000      -0.899999976158142       4.600000000000000E-002
+  0.350000000000000        14.5400000000000       1.000000000000000E-002
+   2.24000000000000        2.06000000000000        2.45000000000000     
+  0.630000000000000       0.265000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   6.38600000000000        35.9720000000000        34.5050000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.400000000000000        3.97000000000000      -3.100000000000000E-002
+  0.152000000000000      -0.899999976158142       0.270000000000000     
+  0.130000000000000        14.5500000000000       5.000000000000000E-002
+   2.25000000000000        2.05000000000000        2.45000000000000     
+  0.557000000000000       0.636000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   5.01000000000000        35.2650000000000        32.8210000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.400000000000000        3.97000000000000      -3.100000000000000E-002
+  0.152000000000000      -0.899999976158142       0.270000000000000     
+  0.130000000000000        14.5500000000000       5.000000000000000E-002
+   2.25000000000000        2.05000000000000        2.45000000000000     
+  0.557000000000000       0.636000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   5.01000000000000        35.2650000000000        32.8210000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.600000000000000        3.53000000000000      -0.115000000000000     
+ -0.128000000000000      -0.899999976158142       7.000000000000000E-003
+  0.280000000000000        14.5700000000000       3.000000000000000E-002
+   2.29000000000000        1.77000000000000        2.11000000000000     
+  0.685000000000000       0.328000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   3.24000000000000        35.3430000000000        33.7580000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.51000000000000      -0.209000000000000     
+ -3.300000000000000E-002 -0.899999976158142      -3.000000000000000E-004
+  0.320000000000000        14.6000000000000       4.000000000000000E-002
+   2.24000000000000        1.87000000000000        2.23000000000000     
+  0.642000000000000       0.209000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  1.800000000000000E-002   35.2840000000000        32.6780000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.800000000000000        3.68000000000000      -7.000000000000001E-002
+ -0.158000000000000      -0.745000000000000      -6.000000000000000E-002
+  0.280000000000000        14.2600000000000       0.170000000000000     
+   2.31000000000000        1.95000000000000        2.33000000000000     
+  0.662000000000000       0.190000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+  0.148000000000000        29.3300000000000       0.755000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.600000000000000        3.68000000000000      -0.121000000000000     
+ -9.000000000000000E-002 -0.899999976158142       4.100000000000000E-002
+  0.250000000000000        14.6800000000000       8.000000000000000E-002
+   2.16000000000000        1.81000000000000        2.15000000000000     
+  0.714000000000000       0.302000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   1.38400000000000        33.4370000000000        21.9060000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.600000000000000        3.68000000000000      -0.121000000000000     
+ -9.000000000000000E-002 -0.899999976158142       4.100000000000000E-002
+  0.250000000000000        14.6800000000000       8.000000000000000E-002
+   2.16000000000000        1.81000000000000        2.15000000000000     
+  0.714000000000000       0.302000000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000
+   1.38400000000000        33.4370000000000        21.9060000000000     
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
+  0.000000000000000E+000  0.000000000000000E+000
diff --git a/PARAM/base-GB-Yi-20110420-corr-thermo-pp.parm b/PARAM/base-GB-Yi-20110420-corr-thermo-pp.parm

new file mode 100644 (file)

index 0000000..8bdd07e
--- /dev/null
+++ b/PARAM/base-GB-Yi-20110420-corr-thermo-pp.parm
@@ -0,0 +1,23 @@
+2
+3.448E+00  3.234E+00  5.968E-01  6.212E-01  2.786E-01  4.409E-01 -1.058E-01  0.475E+00 -0.001E+00  0.000E+00 2.992E-02  2.992E-02  ! A-A
+3.271E+00  3.215E+00  6.358E-01  6.656E-01  3.303E-01  4.624E-01 -2.033E-01  0.086E+00 -0.001E+00  0.000E+00 2.992E-02  3.054E-02  ! A-G
+2.851E+00  3.251E+00  5.841E-01  6.552E-01  2.830E-01  4.741E-01 -6.024E-02  0.840E+00 -0.001E+00  0.000E+00 2.992E-02  5.985E-02  ! A-C
+3.448E+00  3.125E+00  6.956E-01  6.481E-01  4.801E-01  5.648E-01  0.000E+00  0.000E+00 -0.820E+00  0.000E+00 2.992E-02  1.461E-01  ! A-T
+3.448E+00  3.125E+00  6.956E-01  6.481E-01  4.801E-01  5.648E-01  0.000E+00  0.000E+00 -0.820E+00  0.000E+00 2.992E-02  1.461E-01  ! A-U
+3.794E+00  3.168E+00  6.424E-01  6.696E-01  3.915E-01  4.515E-01 -7.988E-02  0.000E+00 -0.228E+00  0.000E+00 3.054E-02  3.054E-02  ! G-G
+3.332E+00  3.130E+00  6.468E-01  6.698E-01  3.557E-01  4.221E-01  0.000E+00  0.000E+00 -2.200E+00  0.000E+00 3.054E-02  5.985E-02  ! G-C
+2.906E+00  3.214E+00  6.287E-01  6.616E-01  3.386E-01  4.956E-01 -2.259E-01  0.000E+00 -0.007E+00  0.000E+00 3.054E-02  1.461E-01  ! G-T
+2.906E+00  3.214E+00  6.287E-01  6.616E-01  3.386E-01  4.956E-01 -2.259E-01  0.000E+00 -0.007E+00  0.000E+00 3.054E-02  1.461E-01  ! G-U
+2.366E+00  3.241E+00  6.939E-01  7.101E-01  3.766E-01  5.576E-01  0.000E-13  0.968E+00 -0.001E+00  0.000E+00 5.985E-02  5.985E-02  ! C-C
+3.068E+00  3.248E+00  5.086E-01  5.928E-01  2.417E-01  4.332E-01  0.000E-16  0.714E+00 -0.001E+00  0.000E+00 5.985E-02  1.461E-01  ! C-T
+3.068E+00  3.248E+00  5.086E-01  5.928E-01  2.417E-01  4.332E-01  0.000E-16  0.714E+00 -0.001E+00  0.000E+00 5.985E-02  1.461E-01  ! C-U
+2.864E+00  3.188E+00  6.657E-01  6.873E-01  4.198E-01  4.553E-01  0.000E-15  0.525E+00 -0.001E+00  0.000E+00 1.461E-01  1.461E-01  ! T-T
+2.864E+00  3.188E+00  6.657E-01  6.873E-01  4.198E-01  4.553E-01  0.000E-15  0.525E+00 -0.001E+00  0.000E+00 1.461E-01  1.461E-01  ! T-U
+2.864E+00  3.188E+00  6.657E-01  6.873E-01  4.198E-01  4.553E-01  0.000E-15  0.525E+00 -0.001E+00  0.000E+00 1.461E-01  1.461E-01  ! U-U
+
+
+
+*****************************************************************************************************************************************
+*epsi0      sigma0      chi1       chi2       chip1      chip2       Dij        Aij        Bij       Cij       d1         d2            *
+*                         Thymine parameters was used for temperarilly instead of Uridine!                                              *
+*****************************************************************************************************************************************
diff --git a/PARAM/base-GB-Yi-adasko-test.parm b/PARAM/base-GB-Yi-adasko-test.parm

new file mode 100644 (file)

index 0000000..9d648e9
--- /dev/null
+++ b/PARAM/base-GB-Yi-adasko-test.parm
@@ -0,0 +1,23 @@
+2
+3.448E+00  3.234E+00  5.968E-01  6.212E-01  2.786E-01  4.409E-01 -7.000E-05  3.410E+00 -7.000E-05  0.000E+00 2.992E-02  2.992E-02  ! A-A
+3.271E+00  3.215E+00  6.358E-01  6.656E-01  3.303E-01  4.624E-01 -7.000E-05  3.170E-01 -0.898E+00  0.000E+00 2.992E-02  3.054E-02  ! A-G
+2.851E+00  3.251E+00  5.841E-01  6.552E-01  2.830E-01  4.741E-01 -2.110E-01  1.730E+00 -7.000E-05  0.000E+00 2.992E-02  5.985E-02  ! A-C
+3.448E+00  3.125E+00  6.956E-01  6.481E-01  4.801E-01  5.648E-01 -1.760E-01  0.250E+00 -1.320E+00  0.000E+00 2.992E-02  1.461E-01  ! A-T
+3.448E+00  3.125E+00  6.956E-01  6.481E-01  4.801E-01  5.648E-01  0.000E+00  0.000E+00 -0.820E+00  0.000E+00 2.992E-02  1.461E-01  ! A-U
+3.794E+00  3.168E+00  6.424E-01  6.696E-01  3.915E-01  4.515E-01 -2.670E-01  2.490E+00 -7.000E-05  0.000E+00 3.054E-02  3.054E-02  ! G-G
+3.332E+00  3.130E+00  6.468E-01  6.698E-01  3.557E-01  4.221E-01 -7.000E-05  0.818E+00 -1.730E+00  0.000E+00 3.054E-02  5.985E-02  ! G-C
+2.906E+00  3.214E+00  6.287E-01  6.616E-01  3.386E-01  4.956E-01 -4.750E-01 -0.102E+00 -0.862E+00  0.000E+00 3.054E-02  1.461E-01  ! G-T
+2.906E+00  3.214E+00  6.287E-01  6.616E-01  3.386E-01  4.956E-01 -4.950E-01  0.000E+00 -0.007E+00  0.000E+00 3.054E-02  1.461E-01  ! G-U
+2.366E+00  3.241E+00  6.939E-01  7.101E-01  3.766E-01  5.576E-01 -4.950E-01  0.224E+00 -7.001E-05  0.000E+00 5.985E-02  5.985E-02  ! C-C
+3.068E+00  3.248E+00  5.086E-01  5.928E-01  2.417E-01  4.332E-01 -7.000E-05  1.170E+00 -0.517E+00  0.000E+00 5.985E-02  1.461E-01  ! C-T
+3.068E+00  3.248E+00  5.086E-01  5.928E-01  2.417E-01  4.332E-01  0.000E-16  0.714E+00 -0.001E+00  0.000E+00 5.985E-02  1.461E-01  ! C-U
+2.864E+00  3.188E+00  6.657E-01  6.873E-01  4.198E-01  4.553E-01 -1.680E-01  0.708E+00 -7.001E-05  0.000E+00 1.461E-01  1.461E-01  ! T-T
+2.864E+00  3.188E+00  6.657E-01  6.873E-01  4.198E-01  4.553E-01  0.000E-15  0.525E+00 -0.001E+00  0.000E+00 1.461E-01  1.461E-01  ! T-U
+2.864E+00  3.188E+00  6.657E-01  6.873E-01  4.198E-01  4.553E-01  0.000E-15  0.525E+00 -0.001E+00  0.000E+00 1.461E-01  1.461E-01  ! U-U
+
+
+
+*****************************************************************************************************************************************
+*epsi0      sigma0      chi1       chi2       chip1      chip2       Dij        Aij        Bij       Cij       d1         d2            *
+*                         Thymine parameters was used for temperarilly instead of Uridine!                                              *
+*****************************************************************************************************************************************
diff --git a/PARAM/bond_nucl.parm b/PARAM/bond_nucl.parm

new file mode 100644 (file)

index 0000000..09b24ed
--- /dev/null
+++ b/PARAM/bond_nucl.parm
@@ -0,0 +1,6 @@
+5.77 20.0  99.0  33.0 5.0  ! sugar-sugar
+4.5  50.0 285.0  95.0 5.4  ! sugar-adenine
+4.6  50.0 302.0 100.7 5.0  ! sugar-guanine
+3.81 50.0 259.0  86.3 4.0  ! sugar-cytosine
+4.18 50.0 259.0  86.3 4.0  | sugar-thymine
+3.81 50.0 262.0  87.3 4.0  | sugar-uracil
diff --git a/PARAM/cation_nucl_param.parm b/PARAM/cation_nucl_param.parm

index 6e0cfcf..0177e4a 100644 (file)
--- a/PARAM/cation_nucl_param.parm
+++ b/PARAM/cation_nucl_param.parm
@@ -23,4 +23,9 @@
       0.0      0.0  0.0     1.0     1.0     0.0     0.0      0.0     1.0   0.0       0.0      0.0      0.0        0.0 C-Cl
       0.0      0.0  0.0     1.0     1.0     0.0     0.0      0.0     1.0   0.0       0.0      0.0      0.0        0.0 T-Cl
       0.0      0.0  0.0     1.0     1.0     0.0     0.0      0.0     1.0   0.0       0.0      0.0      0.0        0.0 U-Cl
+     0.0      0.0  0.0     1.0     1.0     0.0     0.0      0.0     1.0   0.0       0.0      0.0      0.0        0.0 A-Zn
+     0.0      0.0  0.0     1.0     1.0     0.0     0.0      0.0     1.0   0.0       0.0      0.0      0.0        0.0 G-Zn
+     0.0      0.0  0.0     1.0     1.0     0.0     0.0      0.0     1.0   0.0       0.0      0.0      0.0        0.0 C-Zn
+     0.0      0.0  0.0     1.0     1.0     0.0     0.0      0.0     1.0   0.0       0.0      0.0      0.0        0.0 T-Zn
+     0.0      0.0  0.0     1.0     1.0     0.0     0.0      0.0     1.0   0.0       0.0      0.0      0.0        0.0 U-Zn
        w1       w2 epslj   pis1  sigma0   epsi0    chi1    chip1     sig    b1        b2       b3       b4      chis1
diff --git a/PARAM/ions_fin_4_12_20.parm b/PARAM/ions_fin_4_12_20.parm

index 391be3f..1b02535 100644 (file)
--- a/PARAM/ions_fin_4_12_20.parm
+++ b/PARAM/ions_fin_4_12_20.parm
@@ -1,9 +1,10 @@
  2 0 0 0 0 0 0 2 0 0 2 2 2 2 -1 -1 2 1 1 0 0 0 0 0 -1 -1 -1
-23 23 1
-24 24 2
-39 39 1
-40 40 2
-35.5 35.5 -1
+23 3 1
+24 3 2
+39 3 1
+40 3 2
+35.5 3 -1
+65 3 2
  5.69891E-02 3.17002E+00 4.95421E-01 0.00000E+00 8.09856E-01 0.00000E+00 5.95645E-01 5.61069E+00 2.58276E+00 5.23464E+00 4.42980E+00 0.00000E+00 4.14020E-01 0.00000E+00 1 0 0 0 0 4.12992E-02 0 0.00000E+00 0 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0 1.00000E+00 7.55619E-02 -9.04131E+00 3.62811E-02 9.69329E-01 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.35052E+00 0.00000E+00
  2.79444E+00 2.91727E+00 8.33501E-01 0.00000E+00 9.99999E-01 0.00000E+00 9.81661E-01 6.93235E+00 5.97322E-01 4.87889E+00 4.43795E+00 0.00000E+00 4.32100E-01 0.00000E+00 1 0 0 0 0 0.00000E+00 0 0.00000E+00 0 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0 1.00000E+00 1.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 0.00000E+00
  1.45596E+00 2.83670E+00 7.43295E-01 0.00000E+00 9.99920E-01 0.00000E+00 5.98655E-01 6.55996E+00 3.46739E-02 4.74838E+00 4.56099E+00 0.00000E+00 3.76099E-01 0.00000E+00 1 0 0 0 0 0.00000E+00 0 0.00000E+00 0 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0 1.00000E+00 1.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 1.00000E+00 0.00000E+00
diff --git a/PARAM/lipid_LJ_nonbond.parm b/PARAM/lipid_LJ_nonbond.parm

new file mode 100644 (file)

index 0000000..22432e0
--- /dev/null
+++ b/PARAM/lipid_LJ_nonbond.parm
@@ -0,0 +1,39 @@
+1 1 -1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0   !this is charge\r
+       Qda     Qd      Qa      Q0      P5      P4      P3      P2      P1      Nda     Nd      Na      N0      C5      C4      C3      C2      C1\r
+Qda 5.6  5.6  5.6  4.5  5.6  5.6  5.6  5.0  5.0  5.0  5.0  5.0  3.5  3.1  2.7  2.3  2.0  2.0 \r
+Qd 5.6  5.0  5.6  4.5  5.6  5.6  5.6  5.0  5.0  5.0  4.0  5.0  3.5  3.1  2.7  2.3  2.0  2.0 \r
+Qa 5.6  5.6  5.0  4.5  5.6  5.6  5.6  5.0  5.0  5.0  5.0  4.0  3.5  3.1  2.7  2.3  2.0  2.0 \r
+Q0 4.5  4.5  4.5  3.5  5.0  5.6  5.0  4.5  4.0  4.0  4.0  4.0  3.5  3.1  2.7  2.3  2.0  2.0 \r
+P5 5.6  5.6  5.6  5.0  5.6  5.6  5.6  5.6  5.6  5.0  5.0  5.0  3.5  3.1  2.7  2.7  2.3  2.0 \r
+P4 5.6  5.6  5.6  5.6  5.6  5.0  5.0  4.5  4.5  4.0  4.0  4.0  3.5  3.1  2.7  2.7  2.3  2.0 \r
+P3 5.6  5.6  5.6  5.0  5.6  5.0  5.0  4.5  4.5  4.5  4.5  4.5  3.5  3.5  3.1  3.1  2.7  2.3 \r
+P2 5.0  5.0  5.0  4.5  5.6  4.5  4.5  4.5  4.5  4.5  4.5  4.5  4.0  3.5  3.5  3.1  2.7  2.3 \r
+P1 5.0  5.0  5.0  4.0  5.6  4.5  4.5  4.5  4.5  4.5  4.5  4.5  4.0  3.5  3.5  3.5  3.1  2.7 \r
+Nda 5.0  5.0  5.0  4.0  5.0  4.0  4.5  4.5  4.5  4.5  4.5  4.5  3.5  3.5  3.1  2.7  2.7  2.7 \r
+Nd 5.0  4.0  5.0  4.0  5.0  4.0  4.5  4.5  4.5  4.5  4.0  4.5  3.5  3.5  3.1  2.7  2.7  2.7 \r
+Na 5.0  5.0  4.0  4.0  5.0  4.0  4.5  4.5  4.5  4.5  4.5  4.0  3.5  3.5  3.1  2.7  2.7  2.7 \r
+N0 3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  4.0  4.0  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.1  2.7 \r
+C5 3.1  3.1  3.1  3.1  3.1  3.1  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.1  3.1 \r
+C4 2.7  2.7  2.7  2.7  2.7  2.7  3.1  3.5  3.5  3.1  3.1  3.1  3.5  3.5  3.5  3.5  3.1  3.1 \r
+C3 2.3  2.3  2.3  2.3  2.7  2.7  3.1  3.1  3.5  2.7  2.7  2.7  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5  3.5 \r
+C2 2.0  2.0  2.0  2.0  2.3  2.3  2.7  2.7  3.1  2.7  2.7  2.7  3.1  3.1  3.1  3.5  3.5  3.5 \r
+C1 2.0  2.0  2.0  2.0  2.0  2.0  2.3  2.3  2.7  2.7  2.7  2.7  2.7  3.1  3.1  3.5  3.5  3.5 \r
+       Qda     Qd      Qa      Q0      P5      P4      P3      P2      P1      Nda     Nd      Na      N0      C5      C4      C3      C2      C1\r
+Qda 0.47  0.47  0.47  0.49  0.47  0.47  0.47  0.48  0.48  0.48  0.48  0.48  0.51  0.52  0.53  0.54  0.62  0.62 \r
+Qd 0.47  0.48  0.47  0.49  0.47  0.47  0.47  0.48  0.48  0.48  0.50  0.48  0.51  0.52  0.53  0.54  0.62  0.62 \r
+Qa 0.47  0.47  0.48  0.49  0.47  0.47  0.47  0.48  0.48  0.48  0.48  0.50  0.51  0.52  0.53  0.54  0.62  0.62 \r
+Q0 0.49  0.49  0.49  0.51  0.48  0.47  0.48  0.49  0.50  0.50  0.50  0.50  0.51  0.52  0.53  0.54  0.62  0.62 \r
+P5 0.47  0.47  0.47  0.48  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.48  0.48  0.48  0.51  0.52  0.53  0.53  0.54  0.55 \r
+P4 0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.48  0.48  0.49  0.49  0.50  0.50  0.50  0.51  0.52  0.53  0.53  0.54  0.55 \r
+P3 0.47  0.47  0.47  0.48  0.47  0.48  0.48  0.49  0.49  0.49  0.49  0.49  0.51  0.51  0.52  0.52  0.53  0.54 \r
+P2 0.48  0.48  0.48  0.49  0.47  0.49  0.49  0.49  0.49  0.49  0.49  0.49  0.50  0.51  0.51  0.52  0.53  0.54 \r
+P1 0.48  0.48  0.48  0.50  0.47  0.49  0.49  0.49  0.49  0.49  0.49  0.49  0.50  0.51  0.51  0.51  0.52  0.53 \r
+Nda 0.48  0.48  0.48  0.50  0.48  0.50  0.49  0.49  0.49  0.49  0.49  0.49  0.51  0.51  0.52  0.53  0.53  0.53 \r
+Nd 0.48  0.50  0.48  0.50  0.48  0.50  0.49  0.49  0.49  0.49  0.50  0.49  0.51  0.51  0.52  0.53  0.53  0.53 \r
+Na 0.48  0.48  0.50  0.50  0.48  0.50  0.49  0.49  0.49  0.49  0.49  0.50  0.51  0.51  0.52  0.53  0.53  0.53 \r
+N0 0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.50  0.50  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.52  0.53 \r
+C5 0.52  0.52  0.52  0.52  0.52  0.52  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.52  0.52 \r
+C4 0.53  0.53  0.53  0.53  0.53  0.53  0.52  0.51  0.51  0.52  0.52  0.52  0.51  0.51  0.51  0.51  0.52  0.52 \r
+C3 0.54  0.54  0.54  0.54  0.53  0.53  0.52  0.52  0.51  0.53  0.53  0.53  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51  0.51 \r
+C2 0.62  0.62  0.62  0.62  0.54  0.54  0.53  0.53  0.52  0.53  0.53  0.53  0.52  0.52  0.52  0.51  0.51  0.51 \r
+C1 0.62  0.62  0.62  0.62  0.55  0.55  0.54  0.54  0.53  0.53  0.53  0.53  0.53  0.52  0.52  0.51  0.51  0.51 \r
diff --git a/PARAM/lipids_bonds_DryMartini.parm b/PARAM/lipids_bonds_DryMartini.parm

new file mode 100644 (file)

index 0000000..fbdcd5b
--- /dev/null
+++ b/PARAM/lipids_bonds_DryMartini.parm
@@ -0,0 +1,20 @@
+       Qda     Qd      Qa      Q0      P5      P4      P3      P2      P1      Nda     Nd      Na      N0      C5      C4      C3      C2      C1\r
+Qda    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+Qd     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+Qa     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+Q0     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+P5     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+P4     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+P3     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+P2     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+P1     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+Nda    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+Nd     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+Na     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+N0     0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.45    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+C5     0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+C4     0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+C3     0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+C2     0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+C1     0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48    0.48\r
+\r
diff --git a/PARAM/lipids_bonds_Martini.parm b/PARAM/lipids_bonds_Martini.parm

new file mode 100644 (file)

index 0000000..6ac893a
--- /dev/null
+++ b/PARAM/lipids_bonds_Martini.parm
@@ -0,0 +1,19 @@
+    Qda  Qd   Qa   Q0   P5   P4   P3   P2   P1   Nda  Nd   Na   N0   C5   C4   C3   C2   C1\r
+Qda 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+Qd  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+Qa  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+Q0  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+P5  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+P4  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+P3  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+P2  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+P1  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+Nda 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+Nd  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+Na  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.37 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+N0  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+C5  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+C4  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+C3  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+C2  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
+C1  0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47 0.47\r
diff --git a/PARAM/lipids_dryMARTINI_nonbond.parm b/PARAM/lipids_dryMARTINI_nonbond.parm

new file mode 100644 (file)

index 0000000..a123e77
--- /dev/null
+++ b/PARAM/lipids_dryMARTINI_nonbond.parm
@@ -0,0 +1,39 @@
+1 1 -1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0   !this is charge\r
+       Qda     Qd      Qa      Q0      P5      P4      P3      P2      P1      Nda     Nd      Na      N0      C5      C4      C3      C2      C1\r
+Qda    2.7     2.7     2.7     2.0     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     2.0     2.0\r
+Qd     2.7     2.3     2.7     2.0     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     2.0     2.0\r
+Qa     2.7     2.7     2.3     2.0     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     2.0     2.0\r
+Q0     2.0     2.0     2.0     2.0     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     2.0     2.0\r
+P5     0.5     0.5     0.5     0.5     3.1     3.1     3.1     3.1     1.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5\r
+P4     0.5     0.5     0.5     0.5     3.1     2.7     2.7     2.3     1.5     1.0     1.0     1.0     1.0     1.0     1.0     1.0     0.5     0.5\r
+P3     0.5     0.5     0.5     0.5     3.1     2.7     2.7     2.3     1.5     1.0     1.0     1.0     1.5     1.5     1.5     1.5     1.5     1.0\r
+P2     0.5     0.5     0.5     0.5     3.1     2.3     2.3     2.3     2.0     1.0     1.0     1.0     2.0     2.7     2.7     2.3     2.0     1.5\r
+P1     0.5     0.5     0.5     0.5     1.5     1.5     1.5     2.0     2.3     2.3     2.3     2.3     2.3     2.7     2.7     2.7     2.7     2.3\r
+Nda    0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     1.0     1.0     1.0     2.3     2.7     2.7     2.7     2.3     2.7     2.7     2.7     2.7     2.7\r
+Nd     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     1.0     1.0     1.0     2.3     2.7     2.3     2.7     2.3     2.7     2.7     2.7     2.7     2.7\r
+Na     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     1.0     1.0     1.0     2.3     2.7     2.7     2.3     2.3     2.7     2.7     2.7     2.7     2.7\r
+N0     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     1.0     1.5     2.0     2.3     2.3     2.3     2.3     3.1     3.1     3.5     3.5     3.5     3.5\r
+C5     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     1.0     1.5     2.7     2.7     2.7     2.7     2.7     3.1     4.0     4.0     4.0     4.0     4.0\r
+C4     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     1.0     1.5     2.7     2.7     2.7     2.7     2.7     3.5     4.0     4.5     4.5     4.0     4.0\r
+C3     0.5     0.5     0.5     0.5     0.5     1.0     1.5     2.3     2.7     2.7     2.7     2.7     3.5     4.0     4.5     4.5     4.5     4.5\r
+C2     2.0     2.0     2.0     2.0     0.5     0.5     1.5     2.0     2.7     2.7     2.7     2.7     3.5     4.0     3.0     4.5     4.5     4.5\r
+C1     2.0     2.0     2.0     2.0     0.5     0.5     1.0     1.5     2.3     2.7     2.7     2.7     3.5     4.0     3.0     4.5     4.5     4.5\r
+       Qda     Qd  Qa    Q0    P5    P4    P3    P2    P1    Nda   Nd    Na    N0    C5    C4    C3    C2      C1\r
+Qda    0.60  0.60  0.60  0.60  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.62  0.62 \r
+Qd     0.60  0.60  0.60  0.60  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.62  0.62 \r
+Qa     0.60  0.60  0.60  0.60  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.62  0.62 \r
+Q0     0.60  0.60  0.60  0.60  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.62  0.62\r
+P5     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+P4     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+P3     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+P2     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.62  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+P1     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+Nda    0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+Nd     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+Na     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+N0     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.62  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+C5     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+C4     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+C3     0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+C2     0.62  0.62  0.62  0.62  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
+C1     0.62  0.62  0.62  0.62  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47  0.47 \r
diff --git a/PARAM/nmr.parm b/PARAM/nmr.parm

new file mode 100644 (file)

index 0000000..d345a03
--- /dev/null
+++ b/PARAM/nmr.parm
@@ -0,0 +1,86 @@
+*** Parameters for distance restraints form NMR-data ***
+14 **** HN for all types
+  1    a1y             -0.52804E+00
+  2    a2y             -0.13290E+01
+  3    a3y             0.15368E+00
+  4    a1z             0.19909E+00
+  5    a2z             0.16324E+01
+  6    a3z             0.10702E+01
+  7    b1y             0.25855E+00
+  8    b2y             0.15256E+00
+  9    b3y             -0.71847E+00
+ 10    b1z             0.11586E+00
+ 11    b2z             -0.43965E+00
+ 12    b3z             -0.43010E-01
+ 13    delta           0.21388E+01
+ 14    epsil           0.11464E+01
+2 **** HA for glycines
+  1    alpha           0.17959E+03
+  2    bondLength      0.55574E+00
+8 **** HA for prolines
+  1    alpha           0.11056E+03
+  2    a1              -0.19851E+01
+  3    a2              0.18497E+00
+  4    a3              -0.10107E+01
+  5    a4              0.27010E+00
+  6    a5              -0.27306E+00
+  7    a6              0.29012E+00
+  8    bondLength      0.10333E+01
+8 **** HA for others amino-acids
+  1    alpha           0.11240E+03
+  2    a1              -0.23584E+00
+  3    a2              -0.82378E-01
+  4    a3              -0.95702E-01
+  5    a4              -0.16562E+00
+  6    a5              -0.92429E-01
+  7    a6              0.67481E-01
+  8    bondLength      0.10650E+01
+21 **** HB for all types
+  1    alpha0          0.13675E+03
+  2    a1              0.20380E+00
+  3    a2              0.25507E+00
+  4    a3              0.44817E+00
+  5    a4              0.51953E+00
+  6    a5              0.30544E+00
+  7    a6              0.11575E+00
+  8    beta            0.25797E+01
+  9    b1              -0.14925E+01
+ 10    b2              -0.16393E+01
+ 11    b3              -0.21575E+01
+ 12    b4              -0.78699E+00
+ 13    b5              -0.43214E+00
+ 14    b6              0.25522E+00
+ 15    c1              0.16876E+01
+ 16    c2              0.16691E+01
+ 17    c3              0.12863E+01
+ 18    c4              0.11205E+01
+ 19    c5              0.58898E+00
+ 20    c6              0.27280E+00
+ 21    bondLength      0.18145E+01
+  3   2.740                                  ! Cys, HG 
+  5   0.924   0.000   2.059                  ! Met, HE
+  6   0.000   0.888   1.653   2.026          ! Phe, HZ
+  4   1.090   2.167                          ! Ile, HD
+  4   1.182   1.638                          ! Leu, HD
+  3   1.602                                  ! Val, HG
+  7   0.000   0.945   1.089   1.547   1.807  ! Trp, HH
+  7   0.000   0.785   1.485   0.000   1.877  ! Tyr, HH
+  2                                          ! Ala, HB
+  1                                          ! Gly, HA
+  3   1.797                                  ! Thr, HD
+  3   2.600                                  ! Ser, HG
+  5   0.821   0.000   1.456                  ! Gln, HD
+  4   0.000   1.123                          ! Asn, HD
+  5   0.823   0.000   1.796                  ! Glu, HG
+  4   0.000   1.646                          ! Asp, HD
+  5   0.000   1.089   2.109                  ! His, HE
+  7   0.594   0.961   1.152   0.000   1.770  ! Arg, HH
+  6   0.760   1.246   1.548   2.130          ! Lys, HZ
+  4   2.325   1.505                          ! Pro, HD
+  5   0.924   0.000   2.059                  ! Sme, HD
+  5   1.00    1.500   2.000                  ! Dbz, HD
+  2                                          ! Aib, HB
+  3   2.090                                  ! Abu, HG
+  5   1.00    1.500   2.000                  ! Dbz, HD
+  2                                          ! Aib, HB
+  3   2.090                                  ! Abu, HG
diff --git a/PARAM/rotamers_nucl.parm b/PARAM/rotamers_nucl.parm

new file mode 100644 (file)

index 0000000..5f836d8
--- /dev/null
+++ b/PARAM/rotamers_nucl.parm
@@ -0,0 +1,50 @@
+A
+ -2.64140
+ -1.68868
+ -0.43595
+ -8.22842
+ 17.39517
+ -7.16584
+  0.52942
+ -9.36683
+ -0.49699
+G
+ -2.07779
+  0.68827
+ -1.15190
+ -8.30975
+ 16.84263
+ -6.53283
+  0.87973
+ 11.17491
+ -3.44086
+C
+ -3.27488
+  6.41963
+ -1.14186
+ 12.01927
+ 24.76888
+ 10.74909
+ -0.44955
+-17.30452
+ -5.05825
+T
+ -2.72466
+  3.21837
+ -0.36953
+-10.67864
+ 21.62880
+ -8.95037
+  3.33905
+-14.12924
+ -1.12965
+U
+ -2.34800
+ -6.87484
+ -1.19578
+-12.44285
+ 25.80487
+-11.36233
+ -2.78069
+  0.03054
+ -1.67636
diff --git a/PARAM/scparm.adam_12_05_2021 b/PARAM/scparm.adam_12_05_2021

new file mode 100644 (file)

index 0000000..2202a0b
--- /dev/null
+++ b/PARAM/scparm.adam_12_05_2021
@@ -0,0 +1,380 @@
+4 6 0                                         
+2 0 0 0 0 0 0 2 0 0 2 2 2 2 -1 -1 2 1 1 0 0 0 0 0 -1 -1 -1                 
+0.000197 7.877 0.080 0.080 -0.212 -0.212 0.3271 10.9336 9.3925 32.1007 5.930 5.930 0.080 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.95 183.96 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Cys Cys
+0.006280 5.701 0.286 0.003 0.207 -0.998 0.1875 10.4300 10.8900 4.4000 7.570 4.030 0.043 -0.039 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Cys
+0.222400 4.390 0.587 0.587 0.892 0.892 9.1300 -0.2700 0.6570 33.0700 9.590 0.000 0.210 0.210 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Met
+0.000080 7.550 0.167 -0.011 -0.036 -0.998 0.1100 0.1380 6.2041 4.6801 6.670 3.550 0.203 0.027 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Cys
+0.003194 6.010 0.370 0.374 0.078 -0.487 0.2127 12.9137 11.7580 4.5435 3.784 7.777 0.172 0.279 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Met
+0.235600 4.760 0.581 0.581 0.914 0.914 0.8380 2.8800 2.8400 33.0900 10.830 0.000 0.157 0.157 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Phe
+0.000290 7.360 -0.030 0.186 -0.998 0.225 0.2800 12.9400 12.4300 4.4000 3.730 7.020 0.040 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ile Cys
+0.010800 5.450 0.444 0.464 0.419 0.960 13.5000 -0.2200 0.6900 32.7000 6.900 7.040 0.270 0.210 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ile Met
+0.000600 6.790 0.346 0.279 -0.372 0.371 0.2700 13.2400 11.8100 4.5000 8.000 3.890 0.250 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ile Phe
+0.042804 6.204 0.322 0.322 0.546 0.546 135.4970 -0.5891 0.4237 14.3730 10.360 0.000 0.171 0.171 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ile Ile
+0.001160 7.365 0.186 -0.003 0.225 -0.998 0.3000 12.9400 12.4300 4.4000 7.017 3.733 0.080 0.041 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Leu Cys
+0.043412 5.454 0.464 0.444 0.960 0.419 13.4913 -0.2275 0.6761 32.7382 7.040 6.897 0.213 0.267 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Leu Met
+0.002156 6.778 0.278 0.346 0.371 -0.372 0.2682 13.2550 11.8186 4.4958 3.893 8.000 0.128 0.254 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Leu Phe
+0.042804 6.204 0.322 0.322 0.546 0.546 135.4970 -0.5891 0.4237 14.3730 10.360 0.000 0.171 0.171 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Leu Ile
+0.042804 6.204 0.322 0.322 0.546 0.546 135.4970 -0.5891 0.4237 14.3730 10.360 0.000 0.171 0.171 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Leu Leu
+0.009880 6.210 0.009 0.001 0.078 -0.998 0.3500 12.6700 11.7100 4.4000 6.760 3.600 0.053 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Cys
+0.067200 5.210 0.586 0.253 0.969 0.531 4.5500 1.4100 2.1100 11.0000 4.630 6.420 0.060 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Met
+0.007200 6.020 0.308 0.414 0.734 0.314 0.3300 8.3600 7.5100 3.8000 4.280 8.040 0.040 0.200 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Phe
+0.094380 5.685 0.425 0.245 0.990 0.250 9.6350 0.1459 0.9445 31.8673 5.686 7.894 0.067 -0.198 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Ile
+0.094380 5.685 0.425 0.245 0.990 0.250 9.6350 0.1459 0.9445 31.8673 5.686 7.894 0.067 -0.198 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Leu
+0.009271 7.054 0.158 0.158 0.267 0.267 149.7620 -0.5569 0.4477 5.8356 8.890 0.000 0.105 0.105 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Val
+0.000108 7.106 0.112 0.089 -0.998 -0.032 0.1223 11.8285 11.0475 4.0572 4.828 9.076 -0.098 -0.126 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Cys
+0.007200 5.460 0.481 0.411 -0.505 0.191 0.2072 12.7699 12.4181 4.4804 8.160 3.970 0.220 0.150 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Met
+0.179176 4.690 0.589 0.664 0.849 0.993 0.1885 13.8793 12.6256 4.2956 9.020 4.389 0.167 0.349 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Phe
+0.024976 5.334 0.547 0.445 0.428 0.978 0.2044 13.2230 12.1844 4.4618 8.227 4.003 0.234 0.017 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Ile
+0.024976 5.334 0.547 0.445 0.428 0.978 0.2044 13.2230 12.1844 4.4618 8.227 4.003 0.234 0.017 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Leu
+0.009600 5.720 0.505 0.310 0.424 0.779 0.2000 13.1600 12.2500 4.5000 8.230 4.000 0.190 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Val
+0.756400 3.864 0.750 0.750 0.992 0.992 6.8186 -1.0347 0.3512 32.7335 8.716 0.000 0.002 0.002 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Trp
+0.003008 5.596 0.103 0.148 -0.997 0.121 0.1128 12.8934 13.3251 4.2332 4.299 8.082 -0.099 -0.065 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 1.69 179.36 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Cys
+0.000140 7.130 0.062 0.203 -0.998 0.074 0.2000 12.8000 11.0300 3.9000 5.220 9.810 -0.200 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Met
+0.000116 8.160 0.015 0.129 -0.998 0.056 0.1625 15.3200 13.7100 3.8000 5.230 9.830 -0.010 -0.360 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Phe
+0.000400 7.300 0.084 0.196 -0.998 0.199 0.1925 14.1200 13.2400 4.1000 4.580 8.610 -0.080 -0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Ile
+0.000400 7.300 0.084 0.196 -0.998 0.199 0.1925 14.1200 13.2400 4.1000 4.580 8.610 -0.080 -0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Leu
+0.000200 7.847 0.083 0.081 -0.998 0.059 0.1695 13.5461 13.3751 4.1859 4.368 8.210 -0.043 -0.009 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Val
+0.000057 8.490 0.091 0.027 -0.024 -0.998 0.1510 16.4500 13.8400 3.4000 10.950 5.820 -0.326 -0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Trp
+0.000324 7.329 0.063 0.063 -0.304 -0.304 0.2174 14.2600 11.6496 32.0500 8.598 8.598 -0.232 -0.232 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.58 183.50 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Tyr
+0.008364 5.626 0.013 0.186 -0.998 0.118 0.3450 11.8400 11.0800 4.6000 3.240 6.080 0.090 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Cys
+0.029696 4.997 0.377 0.383 0.821 0.386 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 5.388 7.464 0.099 0.831 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Met
+0.000272 7.170 0.142 0.206 -0.006 -0.750 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 3.899 7.330 0.074 0.092 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Phe
+0.001472 7.202 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.341 7.415 0.096 0.126 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ile
+0.000400 7.200 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.340 7.410 0.100 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Leu
+0.002052 7.006 0.317 0.111 0.869 0.121 9.3652 0.2400 0.9894 32.0718 7.046 5.075 0.066 0.081 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Val
+0.000236 7.034 0.103 0.324 -0.290 -0.096 0.1648 13.1732 11.7606 4.4984 3.898 8.010 0.084 -0.175 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Trp
+0.000165 7.120 0.100 0.099 0.023 -0.998 0.1400 13.1600 12.7400 4.2000 8.010 4.260 -0.100 -0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Tyr
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+0.016040 5.080 0.005 0.097 0.024 -0.588 0.3150 11.7200 10.8400 4.5815 3.104 5.835 0.105 -0.003 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Cys
+0.000002 9.490 0.124 -0.006 -0.997 -0.085 12.1500 -0.3600 0.5900 31.3000 5.160 7.160 0.230 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Met
+0.000010 6.930 0.423 0.033 -0.997 0.225 15.3800 -1.3100 -0.0500 31.4000 3.330 4.620 0.530 -0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Phe
+0.000020 8.790 0.018 -0.011 -0.997 -0.042 12.6200 -0.1500 0.7300 31.3000 4.940 6.860 0.150 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Ile
+0.000020 8.790 0.018 -0.011 -0.997 -0.042 12.6200 -0.1500 0.7300 31.3000 4.940 6.860 0.150 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Leu
+0.000100 7.690 -0.036 0.007 -0.997 0.000 12.8800 -0.0900 0.7700 31.3000 4.800 6.660 0.110 -0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Val
+0.000002 8.050 0.132 0.004 -0.997 0.014 15.6200 -1.0900 0.0900 31.4000 3.140 4.360 0.620 -0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Trp
+0.001400 5.530 -0.013 0.143 -0.062 -0.998 0.1175 11.1700 10.9600 4.3751 7.506 3.993 -0.075 0.004 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Tyr
+0.000020 7.920 0.039 0.005 -0.997 0.002 13.6700 -0.0500 0.8100 31.3000 4.240 5.880 0.190 0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Ala
+0.004000 5.130 0.000 0.000 0.000 0.000 90.0000 -39.9000 50.6000 0.0100 0.001 0.000 0.000 0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Gly
+0.013480 5.828 -0.032 0.161 -0.997 0.084 0.2731 11.9626 11.5580 4.5258 3.356 6.309 0.134 0.075 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.61 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Cys
+0.005600 6.080 -0.032 0.240 -0.998 0.063 0.2100 10.4100 10.6400 4.4000 3.930 7.380 0.090 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Met
+0.000078 8.080 -0.019 0.146 -0.998 -0.056 0.1125 0.1100 5.9200 4.7000 3.430 6.450 0.160 0.210 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Phe
+0.018120 6.100 -0.008 0.232 -0.998 0.259 0.3550 10.4200 10.3000 4.5000 3.720 7.000 0.110 0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Ile
+0.018120 6.100 -0.008 0.232 -0.998 0.259 0.3550 10.4200 10.3000 4.5000 3.720 7.000 0.110 0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Leu
+0.020280 6.130 0.043 0.078 -0.553 0.012 0.3600 12.7700 11.6800 4.4000 3.620 6.800 0.120 0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Val
+0.000024 8.230 0.115 0.128 0.073 -0.998 0.1120 0.0400 6.8500 4.7000 6.780 3.610 0.090 0.300 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Trp
+0.009648 5.192 0.030 0.326 -0.997 0.249 0.0859 10.2929 14.4122 4.4484 3.827 7.194 0.037 0.068 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.48 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Tyr
+0.014760 5.570 0.042 0.176 -0.732 0.079 0.3500 11.9100 11.2500 4.5000 3.250 6.100 0.150 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Ala
+0.015080 5.400 0.045 -0.036 -0.669 -0.071 0.3500 11.7900 10.8400 4.6000 3.100 5.830 0.170 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Gly
+0.000688 7.762 0.048 0.048 -0.250 -0.250 0.3906 11.4382 9.2197 32.0969 6.086 6.086 0.142 0.142 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 1.61 184.04 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Thr
+0.015776 5.424 0.024 0.177 -0.997 0.124 0.2647 12.1584 11.1709 4.5274 3.318 6.237 0.103 0.081 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.59 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Cys
+0.000480 7.040 -0.008 0.220 -0.998 0.061 0.1700 12.7200 12.4300 4.4000 3.770 7.080 0.010 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Met
+0.000060 7.910 -0.063 0.109 -0.998 -0.248 0.1100 0.0300 5.9500 4.7000 3.430 6.450 0.060 0.270 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Phe
+0.002000 6.990 0.003 0.199 -0.998 0.262 0.2900 12.6200 12.1800 4.5000 3.580 6.730 0.060 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Ile
+0.002000 6.990 0.003 0.199 -0.998 0.262 0.2900 12.6200 12.1800 4.5000 3.580 6.730 0.060 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Leu
+0.026800 5.730 0.092 0.082 -0.410 0.019 0.3525 12.3500 11.5600 4.5000 3.460 6.500 0.100 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Val
+0.000087 7.110 0.100 0.108 -0.041 -0.998 0.1000 0.1600 5.7473 4.7378 6.290 3.350 0.490 0.470 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Trp
+0.000112 7.362 -0.032 0.190 -0.997 0.030 0.0685 9.1227 14.8259 4.5192 3.679 6.916 -0.025 0.059 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 1.56 179.40 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Tyr
+0.016000 5.390 0.093 0.158 -0.554 -0.061 0.4400 11.7300 10.9400 4.6000 3.070 5.770 0.140 0.110 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Ala
+0.024400 4.970 0.109 -0.032 -0.545 -0.079 0.3700 11.6600 10.5500 4.6000 2.980 5.600 0.160 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Gly
+0.010352 5.840 -0.001 0.131 -0.997 0.067 0.2772 12.0542 11.2851 4.5199 3.342 6.282 0.101 0.137 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.42 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Thr
+0.000528 7.070 0.068 0.068 -0.324 -0.324 0.3661 10.8060 8.7194 32.1058 5.522 5.522 0.134 0.134 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 2.30 184.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Ser
+0.010052 5.703 0.257 -0.013 0.249 -0.997 0.1875 12.1825 12.1306 4.4446 6.843 3.640 0.033 0.014 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.42 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Cys
+0.000400 7.400 0.044 0.201 -0.998 0.217 0.2000 11.4100 10.8600 4.2000 4.420 8.310 -0.000 -0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Met
+0.000093 7.683 0.086 0.148 -0.998 -0.042 0.1150 7.8500 11.6600 4.4000 4.090 7.700 0.020 0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Phe
+0.007320 6.360 0.105 0.218 -0.998 0.336 0.3100 11.0100 10.6000 4.4000 4.010 7.530 0.070 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Ile
+0.007320 6.360 0.105 0.218 -0.998 0.336 0.3100 11.0100 10.6000 4.4000 4.010 7.530 0.070 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Leu
+0.000800 7.690 0.069 0.081 -0.998 0.109 0.3500 10.7100 10.2600 4.5000 3.750 7.050 0.090 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Val
+0.000288 6.720 0.255 0.109 0.289 -0.998 0.1750 12.8300 10.9800 3.8000 9.900 5.270 -0.100 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Trp
+0.000180 7.336 0.186 0.037 0.044 -0.997 0.1452 14.4248 13.2877 4.0013 8.985 4.780 -0.051 -0.081 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.013 179.48 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Tyr
+0.003600 6.010 0.074 0.154 -0.998 0.109 0.2450 12.5600 11.6400 4.4300 3.640 6.850 0.060 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Ala
+0.003360 5.790 0.113 -0.112 -0.755 -0.409 0.2200 12.4000 11.2600 4.5000 3.460 6.500 0.150 0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Gly
+0.015524 5.754 0.278 -0.027 0.265 -0.997 0.2006 12.2612 11.9510 4.4501 6.780 3.610 0.121 0.125 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.51 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Thr
+0.009616 5.714 0.231 -0.015 0.182 -0.997 0.1950 12.1742 11.8768 4.4644 3.563 6.797 0.049 0.053 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.30 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Ser
+0.000697 7.245 0.118 0.118 -0.228 -0.228 0.2061 12.2797 11.0383 32.0897 6.725 6.725 0.060 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.014 183.35 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Gln
+0.006096 5.806 0.164 -0.009 -0.039 -0.997 0.1973 12.1786 11.7390 4.4732 6.628 3.526 0.094 0.063 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.424 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Cys
+0.007708 5.605 0.043 0.296 -0.998 0.285 0.1800 10.5948 10.7968 4.3661 4.070 7.660 0.000 0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Met
+0.000106 7.428 0.014 0.158 -0.998 -0.051 0.1175 0.2640 6.2841 4.6946 3.510 6.600 0.055 0.198 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Phe
+0.011252 6.000 0.041 0.216 -0.998 0.217 0.2500 12.2800 12.4400 4.4000 3.666 6.874 0.086 0.061 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Ile
+0.011252 6.000 0.041 0.216 -0.998 0.217 0.2500 12.2800 12.4400 4.4000 3.666 6.874 0.086 0.061 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Leu
+0.006752 6.267 0.037 0.089 -0.998 0.058 0.2850 12.9700 11.8700 4.4000 3.720 6.980 0.120 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Val
+0.000143 7.175 0.117 0.082 0.035 -0.998 0.1450 12.6300 11.2200 3.9000 9.850 5.240 -0.050 -0.200 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Trp
+0.003332 5.556 0.192 0.106 0.140 -0.997 0.1008 11.2155 14.0582 4.3836 7.448 3.962 0.009 -0.002 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.35 179.43 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Tyr
+0.009459 5.433 0.123 0.148 -0.495 -0.052 0.2551 11.9224 11.4828 4.5211 3.356 6.309 0.127 0.024 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Ala
+0.009383 5.171 0.120 -0.062 -0.474 -0.218 0.2150 12.4599 10.8459 4.5009 3.365 6.326 0.163 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Gly
+0.011308 5.747 0.195 -0.019 0.081 -0.997 0.2110 11.9417 11.8032 4.4950 6.518 3.467 0.116 0.128 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.40 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Thr
+0.007644 5.648 0.184 0.006 0.031 -0.997 0.2223 12.1536 11.4410 4.4967 6.448 3.430 0.130 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.31 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Ser
+0.006264 5.872 0.022 0.231 -0.997 0.136 0.1547 11.3067 12.8547 4.828 3.597 6.762 0.085 0.066 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.016 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Gln
+0.000215 7.676 0.079 0.079 -0.270 -0.270 0.3700 2.9643 4.5246 32.1181 5.584 5.584 0.108 0.108 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.021 183.35 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Asn
+0.000090 7.820 0.033 0.126 -0.998 0.130 0.3700 12.4900 11.4300 4.5000 3.460 6.510 0.010 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 2.860000 1.14 2.08 0.00 1.15 0.00 0.69 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Cys
+0.006550 6.004 -0.311 0.205 -0.998 0.011 2.4000 1.1648 1.9383 13.5638 4.412 7.954 -0.250 0.150 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 2.80 3.52 0.00 0.00 0.00 1.26 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Met
+0.003800 6.250 -0.422 0.150 -0.998 -0.300 2.4600 0.0900 1.3900 13.6000 4.060 7.320 -0.230 0.260 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 2.07 2.72 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Phe
+0.001900 7.340 -0.150 0.195 -0.998 0.348 2.6200 1.6200 2.3200 13.6000 4.190 7.550 0.350 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 2.76 3.49 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Ile
+0.001900 7.340 -0.150 0.195 -0.998 0.348 2.6200 1.6200 2.3200 13.6000 4.190 7.550 0.350 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 2.76 3.49 0.00 0.00 0.00 1.29 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Leu
+0.000470 8.250 -0.117 0.079 -0.998 0.148 2.5000 1.8500 2.4300 13.6000 4.070 7.330 -0.080 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 1.86 2.96 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Val
+0.003250 5.950 -0.587 0.202 -0.998 -0.335 1.6500 0.1000 1.5500 13.7000 4.130 7.440 -0.290 0.290 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 1.45 2.63 0.00 0.00 0.00 1.16 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Trp
+0.000068 7.844 -0.048 0.165 -0.998 -0.014 0.0568 6.4976 15.7526 4.6377 3.459 6.502 -0.069 0.290 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 2.753050 1.01 2.01 -0.045 1.07 0.00 0.07 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Tyr
+0.000960 7.010 -0.149 0.139 -0.998 0.184 2.5500 1.4600 2.1500 13.6000 3.790 6.830 -0.130 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 1.68 2.70 0.00 0.00 0.00 0.98 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Ala
+0.000760 6.830 -0.140 -0.031 -0.998 -0.110 2.7000 1.4300 1.9500 13.6000 3.540 6.390 -0.050 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 1.60 2.65 0.00 0.00 0.00 0.82 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Gly
+0.000210 7.520 0.042 0.098 -0.998 0.129 0.2900 12.6400 11.5200 4.5000 3.550 6.670 0.040 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 2.960000 0.93 1.96 0.01 1.12 0.00 0.08 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Thr
+0.000270 6.910 0.050 0.098 -0.998 -0.026 0.2600 12.5900 11.0500 4.5000 3.410 6.420 0.110 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 3.370000 0.96 1.98 5.29 1.24 0.00 0.09 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Ser
+0.000150 7.510 0.035 0.195 -0.998 0.187 0.2500 13.1800 11.6900 4.4000 3.820 7.180 -0.010 0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 2.820000 1.05 2.03 0.00 1.19 0.00 0.18 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Gln
+0.002240 5.760 0.072 0.211 -0.998 0.162 0.2500 12.3600 11.7800 4.5000 3.570 6.720 -0.040 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 2.960000 1.04 2.02 0.01 1.16 0.00 0.63 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Asn
+0.000002 5.543 -0.991 -0.991 -0.990 -0.990 1.3764 2.6088 5.6220 1.3378 4.376 4.376 0.077 0.077 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.50 0.00 0.60 0.60 0.0166 4.917740 0.34 0.34 0.00 0.00 0.00 0.88 0.88 -2.6781 1.7077 2.6394 1.9437 8.025 0.000 1.00 0 Glu Glu
+0.002000 5.940 -0.019 0.151 -0.998 0.067 0.3800 12.2300 11.0100 4.5000 3.260 6.130 0.100 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 3.600000 2.96 3.97 0.13 0.99 0.00 0.86 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Cys
+0.007600 5.530 -0.594 0.266 -0.998 -0.224 2.3150 0.0300 1.3700 13.7000 3.630 6.540 -0.110 0.340 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 2.53 3.29 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Met
+0.003590 6.230 -0.445 0.162 -0.998 -0.255 1.9500 0.1500 1.5700 13.7000 3.810 6.860 -0.070 0.310 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 2.08 2.99 0.00 0.00 0.00 1.25 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Phe
+0.011110 6.150 -0.232 0.249 -0.998 0.356 2.5000 0.0000 1.4900 13.7000 3.580 6.450 -0.050 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 2.68 3.54 0.00 0.00 0.00 1.30 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Ile
+0.011110 6.150 -0.232 0.249 -0.998 0.356 2.5000 0.0000 1.4900 13.7000 3.580 6.450 -0.050 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 2.68 3.54 0.00 0.00 0.00 1.30 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Leu
+0.001800 7.270 -0.152 0.069 -0.998 0.084 2.6500 1.9100 2.4600 13.6000 3.880 6.990 0.010 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 0.42 2.19 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Val
+0.000100 6.890 -0.556 0.100 -0.599 -0.998 1.8500 0.0300 1.3500 13.7000 7.210 4.000 -0.150 0.370 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 0.56 2.36 0.00 0.00 0.00 1.11 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Trp
+0.000019 8.712 -0.089 0.140 -0.998 -0.108 0.0369 1.1387 16.2194 4.8019 3.053 5.740 0.132 0.549 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 4.683640 3.02 4.02 -0.039 0.9107 0.00 0.06 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Tyr
+0.000640 7.240 -0.166 0.136 -0.998 0.102 2.6000 1.6500 2.2700 13.7000 3.540 6.380 0.010 0.110 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 2.16 3.14 0.00 0.00 0.00 1.02 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Ala
+0.000560 6.950 -0.138 -0.017 -0.998 -0.047 2.7000 1.6200 2.1200 13.7000 3.320 5.980 0.060 0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 0.29 2.29 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Gly
+0.003760 5.730 -0.054 0.189 -0.998 0.123 0.2500 13.0500 11.2200 4.5000 3.490 6.880 0.080 0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 3.180000 3.05 3.82 1.69 1.18 0.00 0.10 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Thr
+0.000090 7.650 -0.019 0.123 -0.998 0.039 0.3400 12.4100 10.9500 4.5000 3.290 6.180 0.100 0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 2.810000 2.25 3.47 0.00 0.97 0.00 0.75 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Ser
+0.002110 5.890 -0.026 0.246 -0.998 0.156 0.2200 12.4800 11.4700 4.5000 3.520 6.610 0.030 0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.30 0.00 0.50 0.00 0.0100 4.070000 3.04 4.03 0.10 1.00 0.00 0.32 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Gln
+0.002910 5.530 0.030 0.199 -0.998 0.091 0.2300 12.0100 11.1100 4.5000 3.290 6.180 0.120 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 2.900000 2.05 3.03 0.16 1.08 0.00 0.35 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Asn
+0.917580 3.967 0.083 0.059 0.992 0.395 2.3800 0.9900 1.6900 13.7000 3.500 6.300 0.480 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.50 0.00 0.50 0.60 0.0001 4.990000 4.37 0.68 0.00 0.00 0.00 0.04 0.64 79.7000 51.2000 34.5000 4.6000 0.610 0.690 1.00 0 Asp Glu
+0.000002 5.549 -0.279 -0.279 -0.990 -0.990 0.0300 -156.3600 15.7600 13.0000 4.440 4.440 0.070 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.50 0.00 0.50 0.50 0.0009 5.000000 0.34 0.34 0.00 0.00 0.00 0.94 0.94 13.2341 -1.0427 0.0983 33.2754 9.290 0.000 1.00 0 Asp Asp
+0.005160 5.560 0.216 0.002 0.024 -0.997 0.1350 6.9300 9.7000 4.6000 6.780 3.610 0.130 0.003 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.43 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Cys
+0.003400 5.670 0.081 0.294 -0.998 0.160 0.1175 11.9600 13.7300 4.3200 4.090 7.700 -0.090 -0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Met
+0.004080 5.550 0.100 0.299 -0.998 0.325 0.1400 10.5400 11.5200 4.3000 4.410 8.280 -0.150 -0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Phe
+0.004880 6.160 0.070 0.230 -0.998 0.209 0.1725 12.0700 13.2900 4.4000 3.960 7.430 0.020 -0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Ile
+0.004880 6.160 0.070 0.230 -0.998 0.209 0.1725 12.0700 13.2900 4.4000 3.960 7.430 0.020 -0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Leu
+0.000376 7.810 0.045 0.068 -0.998 0.034 0.2100 13.2400 12.2400 4.3000 4.030 7.570 0.050 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Val
+0.000360 7.000 0.168 0.073 0.190 -0.998 0.2400 10.4400 11.0000 4.3000 7.940 4.220 -0.360 -0.260 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Trp
+0.005976 5.487 0.244 0.115 0.291 -0.997 0.1560 12.4536 13.3776 4.3034 7.721 4.107 -0.175 -0.119 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.43 179.43 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Tyr
+0.003216 5.682 0.089 0.150 -0.998 0.072 0.1450 11.8531 12.1434 4.4212 3.775 7.096 0.129 -0.065 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Ala
+0.000056 7.620 0.055 -0.036 -0.998 -0.147 0.1350 6.7100 9.4100 4.7000 3.100 5.840 0.210 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Gly
+0.330940 4.205 0.439 0.092 0.886 -0.997 0.0246 -0.1247 17.0179 4.7732 6.062 3.225 0.335 0.096 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 1.88 179.43 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Thr
+0.000328 7.070 0.152 -0.026 0.002 -0.997 0.1238 11.8770 12.6687 4.4350 3.714 6.982 0.038 0.028 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.37 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Ser
+0.005392 5.709 0.204 0.108 0.130 -0.997 0.1300 11.7871 13.4240 4.3840 7.352 3.910 -0.013 0.013 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.36 179.43 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Gln
+0.000428 6.873 0.164 0.027 0.025 -0.997 0.1008 5.2468 10.7848 4.6802 6.349 3.477 0.140 0.111 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 -0.017 179.45 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Asn
+0.000090 7.800 0.005 0.160 -0.998 0.080 0.2100 13.5300 11.8900 4.3000 4.010 7.540 -0.100 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.00 0.60 0.0100 2.570000 1.15 2.08 0.00 1.07 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Glu
+0.000090 7.670 -0.043 0.153 -0.998 0.017 0.1800 12.8100 11.4700 4.4000 3.660 6.870 0.040 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.00 0.50 0.0100 2.610000 1.09 2.05 0.00 1.08 0.00 0.03 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Asp
+0.000774 6.590 0.140 0.140 -0.155 -0.155 0.1475 13.9418 11.2867 32.0631 8.023 8.023 -0.033 -0.033 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.088 183.37 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His His
+0.000266 6.268 0.149 0.144 -0.998 0.138 0.1314 13.1833 12.5436 4.2357 4.222 7.937 0.051 -0.110 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 2.905420 1.02 2.01 -0.047 1.38 0.00 0.14 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Cys
+0.000080 7.830 -0.131 0.130 -0.998 -0.346 2.4000 0.3700 1.1600 13.4000 5.360 9.660 -0.110 -0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 4.28 4.87 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Met
+0.000060 7.502 0.105 0.161 -0.998 0.244 2.5900 0.4000 1.3100 13.5000 4.503 8.119 -0.084 -0.076 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.53 2.18 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Phe
+0.000290 7.740 0.112 0.143 -0.998 0.355 2.3300 0.8200 1.5000 13.5000 5.160 9.300 0.020 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.53 2.18 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Ile
+0.000290 7.740 0.112 0.143 -0.998 0.355 2.3300 0.8200 1.5000 13.5000 5.160 9.300 0.020 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.53 2.18 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Leu
+0.000220 7.818 0.162 0.068 -0.998 0.115 2.4700 0.7000 1.4900 13.6000 4.460 8.040 0.163 -0.018 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.53 2.18 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Val
+0.000049 7.006 0.151 0.023 -0.001 -0.998 2.7300 1.1100 1.9300 13.6000 7.510 4.160 0.057 -0.074 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 5.02 4.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Trp
+0.000100 6.420 0.154 0.087 -0.998 0.060 0.2400 12.0400 12.6500 4.3000 3.950 7.430 0.040 -0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 3.280000 1.01 2.00 0.09 3.42 0.00 0.02 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Tyr
+0.000260 6.863 0.122 0.083 -0.998 0.396 2.2500 0.2500 1.1000 13.5000 4.780 8.610 0.030 -0.220 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.28 2.13 0.00 0.00 0.00 0.59 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Ala
+0.000075 7.150 0.141 -0.060 -0.998 -0.259 2.1500 0.1500 1.0200 13.6000 4.150 7.480 0.180 -0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.39 2.15 0.00 0.00 0.00 0.59 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Gly
+0.000058 7.383 0.129 0.109 -0.998 0.077 0.4945 3.4266 4.1466 1.6660 3.906 7.343 0.096 0.025 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 2.928930 0.53 2.18 0.0001 1.36 0.00 0.20 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Thr
+0.000141 6.477 0.145 0.152 -0.998 0.172 0.1312 12.5793 12.5274 4.3168 4.021 7.559 0.043 -0.176 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 2.829920 1.02 2.01 -0.024 1.45 0.00 0.16 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Ser
+0.000230 6.640 0.106 0.227 -0.998 0.340 0.1600 13.5100 12.6900 4.2000 4.390 8.250 0.030 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 3.100000 1.01 2.01 0.00 1.58 0.00 0.10 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Gln
+0.000059 7.222 0.010 0.146 -0.998 0.163 2.5624 0.0021 1.0296 13.5889 4.379 7.186 0.130 -0.052 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 2.866620 0.54 2.18 0.03 1.32 0.00 0.42 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Asn
+0.080000 4.170 -0.279 0.227 0.000 0.000 5.6100 -0.1800 0.7600 13.2100 3.290 6.000 0.430 -0.990 4 1.24 0.47 1.00 1.00 0.10 2.27 0.50 1.84 0.03 0.83 0.0100 5.740000 3.34 2.51 0.00 0.00 39.77 1.55 1.34 0.1500 0.1500 0.1500 16.3800 4.000 7.790 2.28 0 Arg Glu
+0.010000 3.517 0.050 -0.924 0.000 0.000 3.6900 -0.4100 0.8800 13.6000 5.860 3.220 0.660 0.050 4 1.16 0.18 1.00 1.00 0.14 1.40 0.20 2.35 0.53 0.13 0.0100 5.537210 3.72 2.00 0.00 0.00 18.31 1.50 1.62 1.0000 1.0000 1.0000 34.0100 8.287 4.000 2.32 0 Arg Asp
+0.000210 6.210 0.134 0.215 -0.998 0.320 0.1300 13.6300 12.6500 4.1000 4.450 8.360 0.030 -0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 3.030000 1.01 2.00 0.00 1.75 0.00 0.04 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg His
+0.000022 7.578 0.146 0.146 -0.107 -0.107 0.3600 7.8000 7.9600 33.0000 6.470 0.000 0.170 0.170 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.80 0.00 0.30 0.30 0.0100 3.180000 0.41 0.41 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 87.6000 0.7301 0.4193 21.2000 1.210 0.000 1.00 0 Arg Arg
+0.001410 6.110 0.119 0.163 -0.998 0.230 0.1100 11.3400 12.6400 4.5000 3.580 6.720 -0.150 -0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 2.950000 0.98 1.99 0.04 1.16 0.00 0.40 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Cys
+0.150000 4.810 -0.206 -0.152 -0.998 -0.566 2.3000 0.5100 1.3000 13.4000 10.260 5.730 -1.000 -0.660 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 2.41 0.17 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Met
+0.000045 7.980 0.002 0.125 -0.998 0.067 2.7000 0.2000 1.0800 13.4000 4.880 8.800 -0.330 -0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.16 2.12 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Phe
+0.009900 6.219 -0.072 0.206 -0.998 0.353 2.4863 0.1000 1.3347 13.6170 3.920 7.068 -0.160 0.028 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.56 2.18 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Ile
+0.009900 6.219 -0.072 0.206 -0.998 0.353 2.4863 0.1000 1.3347 13.6170 3.920 7.068 -0.160 0.028 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.56 2.18 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Leu
+0.005015 6.461 -0.030 -0.062 -0.998 0.096 2.7200 0.1000 1.3300 13.6000 3.900 7.030 -0.090 0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.50 2.17 0.00 0.00 0.00 1.03 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Val
+0.253010 3.820 0.150 0.296 -0.998 0.997 3.2000 0.3100 1.2900 13.6000 3.830 6.910 -1.000 -0.140 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 4.46 5.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Trp
+0.000040 7.140 0.131 0.202 -0.998 0.223 0.2000 13.2200 12.8900 4.2000 4.300 8.080 -0.250 0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 3.070000 1.00 1.20 1.10 1.72 0.00 0.04 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Tyr
+0.000450 7.300 -0.080 0.120 -0.998 0.263 2.6250 0.7100 1.5400 13.6000 4.070 7.340 -0.170 -0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.37 2.14 0.00 0.00 0.00 0.88 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Ala
+0.000270 7.141 -0.065 -0.057 -0.998 -0.161 2.5000 0.7400 1.4800 13.6000 3.773 6.801 -0.033 0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.22 2.12 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Gly
+0.023936 5.047 0.047 -0.052 -0.419 -0.998 0.0917 4.3851 15.5174 4.7736 5.724 3.045 -0.997 -0.033 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 2.976480 3.45 3.84 -0.147 1.63 0.00 1.03 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Thr
+0.000042 7.558 0.112 0.147 -0.998 0.139 0.0849 7.9696 14.3032 4.6636 3.225 6.068 0.070 -0.001 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 3.145200 0.92 1.96 1.15 1.37 0.00 0.64 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Ser
+0.000040 8.120 0.097 0.149 -0.998 0.225 0.1100 11.3600 13.1300 4.4000 3.730 7.010 -0.070 -0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 2.780000 1.40 2.23 3.29 1.23 0.00 0.72 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Gln
+0.000060 7.640 0.122 0.151 -0.998 0.182 0.1400 11.8600 12.4900 4.4000 3.840 7.210 -0.050 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 3.460000 4.83 5.09 3.02 2.50 0.00 1.16 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Asn
+0.010000 5.489 0.200 -0.859 0.000 0.000 5.7400 -0.0300 0.9700 13.0400 6.790 3.730 0.230 0.010 4 0.20 1.41 1.00 1.00 0.20 2.25 1.30 2.25 0.13 1.13 0.0100 4.600000 3.43 2.00 0.00 0.00 43.61 1.72 1.80 0.0332 1.0000 1.0000 15.0452 3.350 4.000 5.99 0 Lys Glu
+0.010000 5.143 0.131 0.071 0.000 0.000 2.8500 0.4800 1.6100 13.7000 5.680 3.150 -1.000 0.200 4 0.04 1.16 1.00 1.00 0.20 1.93 1.24 2.20 0.13 0.26 0.0100 4.150000 3.66 2.00 0.00 0.00 26.41 1.34 1.99 0.0398 1.0000 1.0000 14.6000 5.279 4.000 8.92 0 Lys Asp
+0.000056 7.189 0.132 0.139 -0.998 0.039 0.1139 13.4212 12.6255 4.2295 4.250 7.990 -0.119 0.058 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 3.171840 0.98 1.99 2.76 1.34 0.00 0.075 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys His
+0.431851 3.889 0.036 0.352 0.998 0.625 0.8968 0.0685 1.4970 13.7330 4.284 7.724 0.058 0.077 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.80 0.00 0.70 0.30 0.0070 3.295780 4.34 0.47 0.00 0.00 0.00 0.016 0.041 79.6633 0.6422 0.4326 4.5546 0.690 0.774 1.00 0 Lys Arg
+0.000542 5.582 0.397 0.397 0.257 0.257 0.3000 -0.5100 10.2600 33.0000 5.129 5.129 -0.160 -0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.70 0.70 0.0001 3.000000 2.11 2.11 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 87.6000 64.0000 36.7000 21.2000 2.510 0.000 1.00 0 Lys Lys
+0.012840 5.650 0.188 0.065 0.121 -0.670 0.3100 12.0700 11.6700 4.5000 6.440 3.430 0.089 0.061 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Cys
+0.704308 4.079 0.343 0.456 0.464 -0.390 1.5888 1.7915 2.0459 31.6076 5.462 7.583 0.204 0.138 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Met
+0.056000 4.810 0.476 0.462 0.955 0.408 3.0600 0.2200 0.9900 32.9000 6.360 8.010 0.090 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Phe
+0.022467 5.934 0.219 0.216 0.181 0.556 12.1155 -0.1817 0.7221 31.2463 5.457 7.579 0.119 0.001 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Ile
+0.022467 5.934 0.219 0.216 0.181 0.556 12.1155 -0.1817 0.7221 31.2463 5.457 7.579 0.119 0.001 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Leu
+0.373600 4.730 0.407 0.079 0.663 -0.564 1.8900 2.9400 2.8800 33.1000 5.160 7.160 0.210 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Val
+0.062836 4.579 0.534 0.500 0.507 0.998 7.4018 -0.3757 0.6282 9.6398 7.830 4.610 0.092 0.019 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Trp
+0.002120 6.040 0.163 0.120 0.128 -0.998 0.1850 10.7400 11.1900 4.3000 8.030 4.270 -0.052 -0.073 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Tyr
+0.020800 5.364 0.127 0.127 -0.390 0.318 5.76770 0.4129 1.0912 31.2598 5.085 7.060 0.044 0.385 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Ala
+0.000040 7.830 0.030 -0.008 -0.997 -0.042 13.2100 -0.1400 0.7500 31.3000 4.560 6.330 0.180 -0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Gly
+0.017800 5.780 0.196 0.036 0.185 -0.813 0.3300 12.4200 11.5200 4.5000 6.550 3.480 0.100 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Thr
+0.019200 5.462 0.192 0.089 0.115 -0.581 0.3500 12.4300 11.1400 4.5000 6.330 3.370 0.110 0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Ser
+0.004400 6.180 0.172 0.101 0.214 -0.998 0.2300 12.1000 12.4300 4.5000 3.610 6.800 0.100 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Gln
+0.008869 5.727 0.102 0.153 -0.607 0.025 0.2550 12.9010 11.5140 4.4149 3.660 6.890 0.120 0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Asn
+0.002180 6.839 0.154 -0.157 0.202 -0.998 2.6700 1.5700 2.2200 13.6000 7.106 3.942 0.084 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.60 0.0000 0.000000 2.93 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 1.09 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Glu
+0.001150 7.132 0.143 -0.171 0.134 -0.998 2.7500 1.7000 2.2300 13.6000 6.812 3.778 0.105 -0.006 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.50 0.0000 0.000000 2.29 0.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Asp
+0.000270 7.490 0.113 0.046 0.012 -0.998 0.2150 10.2300 10.6900 4.4000 7.250 3.860 -0.005 0.088 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro His
+0.000150 7.600 0.137 0.141 0.314 -0.998 2.5500 0.5100 1.3300 13.6000 8.000 4.440 -0.080 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.30 0.0000 0.000000 2.18 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Arg
+0.000816 7.265 0.251 0.124 -0.143 -0.998 2.6400 0.7700 1.6200 13.5822 7.608 4.220 -0.002 -0.143 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.70 0.0000 0.000000 2.12 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Lys
+0.010200 4.710 0.349 0.349 0.535 0.535 49.9300 -0.5300 0.4670 5.7100 7.810 7.810 0.170 0.170 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Pro
+0.006280 5.701 0.286 0.003 0.207 -0.998 0.1875 10.4300 10.8900 4.4000 7.570 4.030 0.043 -0.039 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Cys
+0.222400 4.390 0.587 0.587 0.892 0.892 9.1300 -0.2700 0.6570 33.0700 9.590 0.000 0.210 0.210 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Met
+0.003194 6.010 0.374 0.370 -0.487 0.078 0.2127 12.9137 11.7580 4.5435 7.777 3.784 0.279 0.172 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Phe
+0.010800 5.450 0.464 0.444 0.960 0.419 13.5000 -0.2200 0.6900 32.7000 7.040 6.900 0.210 0.270 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Ile
+0.043412 5.454 0.444 0.464 0.419 0.960 13.4913 -0.2275 0.6761 32.7382 6.897 7.040 0.267 0.213 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Leu
+0.067200 5.210 0.253 0.586 0.531 0.969 4.5500 1.4100 2.1100 11.0000 6.420 4.630 -0.070 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Val
+0.007200 5.460 0.411 0.481 0.191 -0.505 0.2072 12.7699 12.4181 4.4804 3.970 8.160 0.150 0.220 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Trp
+0.000140 7.130 0.203 0.062 0.074 -0.998 0.2000 12.8000 11.0300 3.9000 9.810 5.220 -0.070 -0.200 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Tyr
+0.029696 4.997 0.383 0.377 0.386 0.821 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 7.464 5.388 0.831 0.099 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Ala
+0.000002 9.490 -0.006 0.124 -0.085 -0.997 12.1500 -0.3600 0.5900 31.3000 7.160 5.160 -0.120 0.230 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Gly
+0.005600 6.080 0.240 -0.032 0.063 -0.998 0.2100 10.4100 10.6400 4.4000 7.380 3.930 0.080 0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Thr
+0.000480 7.040 0.220 -0.008 0.061 -0.998 0.1700 12.7200 12.4300 4.4000 7.080 3.770 0.080 0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Ser
+0.000400 7.400 0.201 0.044 0.217 -0.998 0.2000 11.4100 10.8600 4.2000 8.310 4.420 -0.050 -0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Gln
+0.007708 5.605 0.296 0.043 0.285 -0.998 0.1800 10.5948 10.7968 4.3661 7.660 4.070 0.000 0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Asn
+0.006550 6.004 0.205 -0.311 0.011 -0.998 2.4000 1.1648 1.9383 13.5638 7.954 4.412 0.150 -0.250 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.0000 0.000000 3.52 2.80 0.00 0.00 0.00 0.00 1.26 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Glu
+0.007600 5.530 0.266 -0.594 -0.224 -0.998 2.3150 0.0300 1.3700 13.7000 6.540 3.630 0.340 -0.110 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.0000 0.000000 3.29 2.53 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Asp
+0.003400 5.670 0.294 0.081 0.160 -0.998 0.1175 11.9600 13.7300 4.3200 7.700 4.090 -0.040 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met His
+0.000080 7.830 0.130 -0.131 -0.346 -0.998 2.4000 0.3700 1.1600 13.4000 9.660 5.360 -0.050 -0.110 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.0000 0.000000 4.87 4.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Arg
+0.150000 4.810 -0.152 -0.206 -0.566 -0.998 2.3000 0.5100 1.3000 13.4000 5.730 10.260 -0.660 -1.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.0000 0.000000 0.17 2.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Lys
+0.704308 4.079 0.456 0.343 -0.390 0.464 1.5888 1.7915 2.0459 31.6076 7.583 5.462 0.138 0.204 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Pro
+0.222400 4.390 0.587 0.587 0.892 0.892 9.1300 -0.2700 0.6570 33.0700 9.590 0.000 0.210 0.210 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Met
+0.000080 7.550 0.167 -0.011 -0.036 -0.998 0.1100 0.1380 6.2041 4.6801 6.670 3.550 0.203 0.027 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Cys
+0.003194 6.010 0.370 0.374 0.078 -0.487 0.2127 12.9137 11.7580 4.5435 3.784 7.777 0.172 0.279 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Met
+0.235600 4.760 0.581 0.581 0.914 0.914 0.8380 2.8800 2.8400 33.0900 10.830 0.000 0.157 0.157 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Phe
+0.000600 6.790 0.279 0.346 0.371 -0.372 0.2700 13.2400 11.8100 4.5000 3.890 8.000 0.130 0.250 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Ile
+0.002156 6.778 0.346 0.278 -0.372 0.371 0.2682 13.2550 11.8186 4.4958 8.000 3.893 0.254 0.128 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Leu
+0.007200 6.020 0.414 0.308 0.314 0.734 0.3300 8.3600 7.5100 3.8000 8.040 4.280 0.200 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Val
+0.179176 4.690 0.664 0.589 0.993 0.849 0.1885 13.8793 12.6256 4.2956 4.389 9.020 0.349 0.167 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Trp
+0.000116 8.160 0.129 0.015 0.056 -0.998 0.1625 15.3200 13.7100 3.8000 9.830 5.230 -0.360 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Tyr
+0.000272 7.170 0.206 0.142 -0.750 -0.006 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 7.330 3.899 0.092 0.074 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Ala
+0.000010 6.930 0.033 0.423 0.225 -0.997 15.3800 -1.3100 -0.0500 31.4000 4.620 3.330 -0.040 0.530 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Gly
+0.000078 8.080 0.146 -0.019 -0.056 -0.998 0.1125 0.1100 5.9200 4.7000 6.450 3.430 0.210 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Thr
+0.000060 7.910 0.109 -0.063 -0.248 -0.998 0.1100 0.0300 5.9500 4.7000 6.450 3.430 0.270 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Ser
+0.000093 7.683 0.148 0.086 -0.042 -0.998 0.1150 7.8500 11.6600 4.4000 7.700 4.090 0.090 0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Gln
+0.000106 7.428 0.158 0.014 -0.051 -0.998 0.1175 0.2640 6.2841 4.6946 6.600 3.510 0.198 0.055 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Asn
+0.003800 6.250 0.150 -0.422 -0.300 -0.998 2.4600 0.0900 1.3900 13.6000 7.320 4.060 0.260 -0.230 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.0000 0.000000 2.72 2.07 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Glu
+0.003590 6.230 0.162 -0.445 -0.255 -0.998 1.9500 0.1500 1.5700 13.7000 6.860 3.810 0.310 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.0000 0.000000 2.99 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Asp
+0.004080 5.550 0.299 0.100 0.325 -0.998 0.1400 10.5400 11.5200 4.3000 8.280 4.410 -0.000 -0.150 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe His
+0.000060 7.502 0.161 0.105 0.244 -0.998 2.5900 0.4000 1.3100 13.5000 8.119 4.503 -0.076 -0.084 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.0000 0.000000 2.18 0.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Arg
+0.000045 7.980 0.125 0.002 0.067 -0.998 2.7000 0.2000 1.0800 13.4000 8.800 4.880 -0.130 -0.330 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.0000 0.000000 2.12 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Lys
+0.056000 4.810 0.462 0.476 0.408 0.955 3.0600 0.2200 0.9900 32.9000 8.010 6.360 0.040 0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Pro
+0.003194 6.010 0.370 0.374 0.078 -0.487 0.2127 12.9137 11.7580 4.5435 3.784 7.777 0.172 0.279 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Met
+0.235600 4.760 0.581 0.581 0.914 0.914 0.8380 2.8800 2.8400 33.0900 10.830 0.000 0.157 0.157 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Phe
+0.008364 5.626 0.013 0.186 -0.998 0.118 0.3450 11.8400 11.0800 4.6000 3.240 6.080 0.090 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Cys
+0.029696 4.997 0.377 0.383 0.821 0.386 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 5.388 7.464 0.099 0.831 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Met
+0.000272 7.170 0.142 0.206 -0.006 -0.750 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 3.899 7.330 0.074 0.092 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Phe
+0.001472 7.202 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.341 7.415 0.096 0.126 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ile
+0.000400 7.200 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.340 7.410 0.100 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Leu
+0.002052 7.006 0.317 0.111 0.869 0.121 9.3652 0.2400 0.9894 32.0718 7.046 5.075 0.066 0.081 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Val
+0.000236 7.034 0.103 0.324 -0.290 -0.096 0.1648 13.1732 11.7606 4.4984 3.898 8.010 0.084 -0.175 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Trp
+0.000165 7.120 0.100 0.099 0.023 -0.998 0.1400 13.1600 12.7400 4.2000 8.010 4.260 -0.100 -0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Tyr
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+0.000020 7.920 0.005 0.039 0.002 -0.997 13.6700 -0.0500 0.8100 31.3000 5.880 4.240 0.010 0.190 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Gly
+0.014760 5.570 0.176 0.042 0.079 -0.732 0.3500 11.9100 11.2500 4.5000 6.100 3.250 0.070 0.150 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Thr
+0.016000 5.390 0.158 0.093 -0.061 -0.554 0.4400 11.7300 10.9400 4.6000 5.770 3.070 0.110 0.140 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ser
+0.003600 6.010 0.154 0.074 0.109 -0.998 0.2450 12.5600 11.6400 4.4300 6.850 3.640 -0.010 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Gln
+0.009459 5.433 0.148 0.123 -0.052 -0.495 0.2551 11.9224 11.4828 4.5211 6.309 3.356 0.024 0.127 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Asn
+0.000960 7.010 0.139 -0.149 0.184 -0.998 2.5500 1.4600 2.1500 13.6000 6.830 3.790 0.060 -0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.0000 0.000000 2.70 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Glu
+0.000640 7.240 0.136 -0.166 0.102 -0.998 2.6000 1.6500 2.2700 13.7000 6.380 3.540 0.110 0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.0000 0.000000 3.14 2.16 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Asp
+0.003216 5.682 0.150 0.089 0.072 -0.998 0.1450 11.8531 12.1434 4.4212 7.096 3.775 -0.065 0.129 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala His
+0.000260 6.863 0.083 0.122 0.396 -0.998 2.2500 0.2500 1.1000 13.5000 8.610 4.780 -0.220 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.0000 0.000000 2.13 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.59 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Arg
+0.000450 7.300 0.120 -0.080 0.263 -0.998 2.6250 0.7100 1.5400 13.6000 7.340 4.070 -0.050 -0.170 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.0000 0.000000 2.14 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Lys
+0.020800 5.364 0.127 0.127 0.318 -0.390 5.76770 0.4129 1.0912 31.2598 7.060 5.085 0.385 0.044 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Pro
+0.029696 4.997 0.377 0.383 0.821 0.386 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 5.388 7.464 0.099 0.831 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Met
+0.000272 7.170 0.142 0.206 -0.006 -0.750 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 3.899 7.330 0.074 0.092 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Phe
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+0.008364 5.626 0.013 0.186 -0.998 0.118 0.3450 11.8400 11.0800 4.6000 3.240 6.080 0.090 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Cys
+0.029696 4.997 0.377 0.383 0.821 0.386 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 5.388 7.464 0.099 0.831 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Met
+0.000272 7.170 0.142 0.206 -0.006 -0.750 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 3.899 7.330 0.074 0.092 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Phe
+0.001472 7.202 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.341 7.415 0.096 0.126 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ile
+0.000400 7.200 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.340 7.410 0.100 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Leu
+0.002052 7.006 0.317 0.111 0.869 0.121 9.3652 0.2400 0.9894 32.0718 7.046 5.075 0.066 0.081 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Val
+0.000236 7.034 0.103 0.324 -0.290 -0.096 0.1648 13.1732 11.7606 4.4984 3.898 8.010 0.084 -0.175 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Trp
+0.000165 7.120 0.100 0.099 0.023 -0.998 0.1400 13.1600 12.7400 4.2000 8.010 4.260 -0.100 -0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Tyr
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+0.000020 7.920 0.005 0.039 0.002 -0.997 13.6700 -0.0500 0.8100 31.3000 5.880 4.240 0.010 0.190 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Gly
+0.014760 5.570 0.176 0.042 0.079 -0.732 0.3500 11.9100 11.2500 4.5000 6.100 3.250 0.070 0.150 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Thr
+0.016000 5.390 0.158 0.093 -0.061 -0.554 0.4400 11.7300 10.9400 4.6000 5.770 3.070 0.110 0.140 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ser
+0.003600 6.010 0.154 0.074 0.109 -0.998 0.2450 12.5600 11.6400 4.4300 6.850 3.640 -0.010 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Gln
+0.009459 5.433 0.148 0.123 -0.052 -0.495 0.2551 11.9224 11.4828 4.5211 6.309 3.356 0.024 0.127 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Asn
+0.000960 7.010 0.139 -0.149 0.184 -0.998 2.5500 1.4600 2.1500 13.6000 6.830 3.790 0.060 -0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.0000 0.000000 2.70 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Glu
+0.000640 7.240 0.136 -0.166 0.102 -0.998 2.6000 1.6500 2.2700 13.7000 6.380 3.540 0.110 0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.0000 0.000000 3.14 2.16 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Asp
+0.003216 5.682 0.150 0.089 0.072 -0.998 0.1450 11.8531 12.1434 4.4212 7.096 3.775 -0.065 0.129 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala His
+0.000260 6.863 0.083 0.122 0.396 -0.998 2.2500 0.2500 1.1000 13.5000 8.610 4.780 -0.220 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.0000 0.000000 2.13 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.59 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Arg
+0.000450 7.300 0.120 -0.080 0.263 -0.998 2.6250 0.7100 1.5400 13.6000 7.340 4.070 -0.050 -0.170 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.0000 0.000000 2.14 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Lys
+0.020800 5.364 0.127 0.127 0.318 -0.390 5.76770 0.4129 1.0912 31.2598 7.060 5.085 0.385 0.044 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Pro
+0.029696 4.997 0.377 0.383 0.821 0.386 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 5.388 7.464 0.099 0.831 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Met
+0.000272 7.170 0.142 0.206 -0.006 -0.750 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 3.899 7.330 0.074 0.092 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Phe
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+2.76949E+00 4.11518E+00 -2.19532E-01 9.75111E-02 -7.01204E-01 -2.21605E-03 1.44301E+00 9.17819E+00 8.78757E-02 1.38940E+01 3.00690E+00 2.85388E+00 8.97030E-01 2.11029E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 5.52066E+00 2.29224 6.46080E-01 1.81936E+01 0 0 0 1.55425E+00 0.00000E+00 1.66509E+00 4.51753E+00 5.42677E+00 8.39671E-01 2.57920E+00 1.66083E+00 1.00000E+00 9.03969E-01
+3.49142E+00 2.67101E+00 3.17207E-02 9.00000E-01 -8.22461E-01 7.34550E-01 3.36493E+00 9.93085E+00 3.46581E-02 1.38700E+01 2.53670E+00 2.40761E+00 9.95528E-01 6.07569E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 4.71259E+00 3.85164 6.46080E-01 6.13848E-01 0 0 0 1.70368E+00 0.00000E+00 2.81819E+00 1.65648E+00 8.05822E-01 9.52858E-01 2.57920E+00 2.29756E+00 1.00000E+00 1.30771E+00
+2.80648E+00 4.78723E+00 -4.56319E-01 3.66512E-01 1.03797E-02 -9.69877E-02 5.12457E-01 8.56895E+00 3.65721E-02 1.39553E+01 2.87985E+00 2.73276E+00 9.13526E-01 7.98069E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 3.41326E+00 2.7368 6.46080E-01 5.14094E-01 0 0 0 1.51203E+00 0.00000E+00 1.35470E+00 2.34659E+00 4.48174E+00 4.50972E-02 2.57920E+00 3.77892E+00 1.00000E+00 1.37820E+00
+3.60777E+00 4.73543E+00 -5.13711E-02 1.25426E-01 9.59925E-02 6.81451E-02 1.40547E+00 9.39769E+00 5.64959E-02 1.38969E+01 2.65045E+00 2.51555E+00 9.99843E-01 4.28818E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 7.56067E+00 2.97734 6.46080E-01 6.79541E-01 0 0 0 1.66279E+00 0.00000E+00 1.70859E+00 1.10162E+00 2.32091E+00 3.47461E-02 2.57920E+00 3.91594E+00 1.00000E+00 1.27858E+00
+2.89113E+00 4.54911E+00 -1.75214E-01 2.25027E-01 5.93778E-01 1.69337E-01 1.09504E+00 1.00032E+01 3.44327E+00 1.39022E+01 2.23968E+00 2.12564E+00 9.95606E-01 6.46585E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 8.88164E+00 2.41329 6.46080E-01 7.54458E-01 0 0 0 1.48435E+00 0.00000E+00 1.30764E+00 9.69387E-01 3.10110E+00 2.77195E-01 2.57920E+00 3.67963E+00 1.00000E+00 1.15762E+00
+2.65651E+01 3.35401E+00 -1.02610E-01 4.04591E-01 1.29939E-01 -1.50823E-02 3.47499E+00 9.55608E+00 3.48335E-02 1.38338E+01 3.78534E+00 3.59265E+00 1.01067E-01 3.53718E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 7.73014E+00 2.60748 6.46080E-01 1.72368E+00 0 0 0 1.79174E+00 0.00000E+00 1.98014E+00 1.77578E+00 9.46203E-01 4.15097E+00 2.57920E+00 7.10184E-01 1.00000E+00 5.87420E-01
+1.96135E+00 4.99025E+00 -6.99437E-01 2.38982E-01 -1.27899E-01 -4.88811E-01 8.17297E-01 1.02587E+01 9.59277E-01 1.38990E+01 2.25277E+00 2.13786E+00 9.99897E-01 8.06004E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 5.65056E+00 3.80295 6.46080E-01 7.20323E-01 0 0 0 1.72045E+00 0.00000E+00 4.05155E-01 2.96841E-01 3.47638E+00 2.67430E+00 2.57920E+00 6.04896E-01 1.00000E+00 5.26274E-01
+2.60404E+00 4.74646E+00 -4.30790E-01 2.47141E-01 -1.93143E-01 -1.81949E-01 1.34034E+00 9.19226E+00 6.70729E-01 1.39084E+01 2.49061E+00 2.36377E+00 9.99996E-01 6.69760E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 1.21693E+01 3.20378 6.46080E-01 9.20684E-01 0 0 0 1.73896E+00 0.00000E+00 2.86385E+00 1.84109E+00 9.85916E-01 6.16113E-01 2.57920E+00 2.70845E+00 1.00000E+00 1.02339E+00
+1.12956E+01 3.27717E+00 -2.12331E-01 1.99816E-01 7.90680E-02 -1.73982E-01 2.05848E+00 9.46762E+00 3.46574E-02 1.53848E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 1.46990E-01 2.72701E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 6.43810E+00 2.25665 6.46080E-01 7.08521E-01 0 0 0 1.44160E+00 0.00000E+00 2.99721E+00 2.78118E+00 3.48629E-02 1.14440E+00 2.57920E+00 1.18068E+00 1.00000E+00 1.26483E+00
+1.12956E+01 3.27717E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 2.05848E+00 9.46762E+00 3.46574E-02 1.53848E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 0.00000E+00 0.00001E+00 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 6.43810E+00 2.25665 6.46080E-01 7.08521E-01 0 0 0 1.44160E+00 0.00000E+00 2.99721E+00 2.78118E+00 3.48629E-02 1.14440E+00 2.57920E+00 1.18068E+00 1.00000E+00 1.26483E+00
+3.67062E-01 3.72270E+00 -9.00000E-01 4.01748E-01 -2.53158E-01 -7.95863E-01 1.72951E+00 9.44994E+00 1.16166E-01 1.39041E+01 2.37516E+00 2.25427E+00 9.98225E-01 4.12016E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 1.05967E+01 2.77744 6.46080E-01 1.07875E+01 0 0 0 1.12433E+00 0.00000E+00 5.06611E+00 4.49748E+00 3.57269E-02 3.47061E-02 2.57920E+00 9.15639E-01 1.00000E+00 1.22621E+00
+8.08641E+00 3.88259E+00 -7.30284E-01 1.50687E-01 -2.49819E-01 -9.90828E-02 1.76855E+00 9.30432E+00 7.60883E-02 1.38533E+01 3.90604E+00 3.70722E+00 3.19852E-03 2.22829E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 3.58770E+00 2.16185 6.46080E-01 4.41545E-01 0 0 0 8.56516E-01 0.00000E+00 1.94127E+00 1.66565E+00 2.73218E+00 9.11433E-02 2.57920E+00 4.08601E+00 1.00000E+00 1.30111E+00
+1.72180E+00 4.75589E+00 -7.76471E-01 8.03936E-02 -1.27225E-01 -5.84384E-01 1.28533E+00 9.51526E+00 1.20332E+00 1.39111E+01 2.27990E+00 2.16387E+00 9.98820E-01 6.59977E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 9.24844E+00 3.00796 6.46080E-01 8.07295E+00 0 0 0 1.54152E+00 0.00000E+00 2.92975E+00 2.59502E+00 1.33115E+00 7.03262E-01 2.57920E+00 2.57270E+00 1.00000E+00 1.13188E+00
+2.38854E+00 4.05843E+00 -2.58502E-01 6.17741E-01 -1.43214E-01 -4.16010E-03 1.06086E+00 9.28241E+00 1.64651E+00 1.39045E+01 2.75811E+00 2.61772E+00 9.20140E-01 4.87422E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 1.51510E+01 2.24595 6.46080E-01 3.12347E+00 0 0 0 1.30720E+00 0.00000E+00 1.21094E+00 3.90261E+00 5.79418E+00 7.08793E-02 2.57920E+00 2.23900E+00 1.00000E+00 1.19516E+00
+4.56897E+00 4.00580E+00 -1.33174E-01 3.56871E-01 -5.93347E-01 1.86821E-01 2.01298E+00 9.49906E+00 3.48964E-02 1.38762E+01 3.18067E+00 3.01878E+00 8.41805E-01 3.02643E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 3.46579E-02 0 2.19070E-01 -2.67605E-01 6.89583E+00 3.23864 6.46080E-01 6.71150E-01 0 0 0 1.77717E+00 2.55816E-01 3.29987E+00 3.10430E+00 1.04080E+00 1.08280E+00 2.57920E+00 1.18101E+00 1.00000E+00 1.32747E+00
+4.82199E+00 4.10219E+00 -1.87692E-01 2.84600E-02 -5.20508E-01 -6.04961E-02 1.89996E+00 9.43553E+00 4.37588E-02 1.38751E+01 3.28271E+00 3.11563E+00 8.05444E-01 1.33579E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 1.69436E+00 0 2.19070E-01 5.96930E-02 9.17063E+00 2.19706 6.46080E-01 3.00299E-01 0 0 0 1.61747E+00 1.09355E+00 2.17069E+00 1.87179E+00 2.07305E+00 3.33331E+00 2.57920E+00 -3.22059E-03 1.00000E+00 1.91168E+00
+2.27701E+00 4.21930E+00 -4.01011E-01 3.24275E-01 -5.10169E-01 1.37730E-01 1.62808E+00 9.41070E+00 8.17851E-01 1.38995E+01 2.64818E+00 2.51339E+00 9.72097E-01 4.82355E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 6.98768E+00 2.66898 6.46080E-01 6.85725E-01 0 0 0 1.30362E+00 0.00000E+00 3.35185E+00 3.14360E+00 9.82486E-01 1.32296E+00 2.57920E+00 6.14393E-01 1.00000E+00 1.27894E+00
+6.00334E+00 3.75425E+00 -6.75460E-02 8.84346E-01 -4.93590E-01 8.95275E-01 2.02735E+00 9.48793E+00 1.37013E-01 1.38662E+01 3.49460E+00 3.31673E+00 6.95897E-01 5.40747E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 3.46719E-02 0 2.19070E-01 2.20307E+00 7.90555E+00 4.35192 6.46080E-01 6.73066E-01 0 0 0 1.60806E+00 1.56504E-01 3.04053E+00 2.83752E+00 1.29541E+00 3.46751E-02 2.57920E+00 3.23150E+00 1.00000E+00 1.27560E+00
+5.28667E+00 3.75461E+00 -1.07295E-01 4.04965E-01 -3.75987E-01 7.65648E-02 1.51589E+00 9.43552E+00 3.74231E-02 1.38797E+01 3.20558E+00 3.04242E+00 8.36788E-01 4.96190E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 2.09753E-01 0 2.19070E-01 1.05167E+00 8.09944E+00 3.87534 6.46080E-01 6.75869E-01 0 0 0 1.60330E+00 8.50288E-01 3.20894E+00 3.02836E+00 1.15197E+00 3.53699E-02 2.57920E+00 2.74970E+00 1.00000E+00 1.26315E+00
+8.10562E+00 3.46667E+00 -3.04148E-03 1.75730E-01 1.28855E-01 1.32885E-01 1.58239E+00 9.28803E+00 2.51168E-01 1.38849E+01 3.08327E+00 2.92634E+00 8.98397E-01 7.34233E-02 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 7.57579E+00 3.52432 6.46080E-01 6.80651E-01 0 0 0 1.73647E+00 0.00000E+00 3.42587E+00 3.16963E+00 8.98068E-01 3.47448E-02 2.57920E+00 2.54055E+00 1.00000E+00 1.28193E+00
+3.49142E+00 2.67101E+00 3.17207E-02 9.000000E-01 -8.22461E-01 7.34550E-01 3.36493E+00 9.93085E+00 3.46581E-02 1.38700E+01 2.53670E+00 2.40761E+00 9.95528E-01 6.07569E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 4.71259E+00 3.85164 6.46080E-01 6.13848E-01 0 0 0 1.70368E+00 0.00000E+00 2.81819E+00 1.65648E+00 8.05822E-01 9.52858E-01 2.57920E+00 2.29756E+00 1.00000E+00 1.30771E+00
+2.80648E+00 4.78723E+00 -4.56319E-01 3.66512E-01 1.03797E-02 -9.69877E-02 5.12457E-01 8.56895E+00 3.65721E-02 1.39553E+01 2.87985E+00 2.73276E+00 9.13526E-01 7.98069E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 3.41326E+00 2.7368 6.46080E-01 5.14094E-01 0 0 0 1.51203E+00 0.00000E+00 1.35470E+00 2.34659E+00 4.48174E+00 4.50972E-02 2.57920E+00 3.77892E+00 1.00000E+00 1.37820E+00
+1.12956E+01 3.27717E+00 -2.12331E-01 1.99816E-01 7.90680E-02 -1.73982E-01 2.05848E+00 9.46762E+00 3.46574E-02 1.53848E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 1.46990E-01 2.72701E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 6.43810E+00 2.25665 6.46080E-01 7.08521E-01 0 0 0 1.44160E+00 0.00000E+00 2.99721E+00 2.78118E+00 3.48629E-02 1.14440E+00 2.57920E+00 1.18068E+00 1.00000E+00 1.26483E+00
+1.12956E+01 3.27717E+00 -2.12331E-01 1.99816E-01 7.90680E-02 -1.73982E-01 2.05848E+00 9.46762E+00 3.46574E-02 1.53848E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 1.46990E-01 2.72701E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 6.43810E+00 2.25665 6.46080E-01 7.08521E-01 0 0 0 1.44160E+00 0.00000E+00 2.99721E+00 2.78118E+00 3.48629E-02 1.14440E+00 2.57920E+00 1.18068E+00 1.00000E+00 1.26483E+00
+4.02213E+00 4.14141E+00 -9.00000E-01 5.95668E-01 3.18830E-01 -3.54146E-01 1.96169E+00 9.48911E+00 7.09141E-01 1.38885E+01 2.88010E+00 2.73350E+00 9.98420E-01 6.08289E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 3.08394E+00 0 2.19070E-01 3.71284E-02 9.27714E+00 2.46406 6.46080E-01 4.33464E-01 0 0 0 1.60462E+00 1.30835E+00 3.19830E+00 2.92753E+00 1.09973E+00 2.00956E+00 2.57920E+00 8.50576E-02 1.00000E+00 1.84576E+00
+4.75537E+00 3.38384E+00 -1.51369E-02 7.01886E-01 3.36247E-01 5.31395E-01 1.25950E+00 9.32366E+00 3.46574E-02 1.38733E+01 3.55494E+00 3.37381E+00 -4.05005E-01 1.30331E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 4.57993E-01 3.36809 1.33880E+00 2.38403E-01 0 0 0 1.15575E+00 0.00000E+00 5.22636E+00 4.04260E+00 1.23858E-01 1.28488E+00 2.46360E+00 1.98385E-01 1.00000E+00 1.49132E+00
+7.91363E+00 3.05510E+00 4.79616E-01 -9.000000E-01 -8.25578E-02 9.000000E-01 4.38656E+00 1.00847E+01 8.51435E-01 1.38451E+01 2.96841E+00 2.81813E+00 -4.11046E-01 -2.87502E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 3.10784E+00 2.29302 1.33880E+00 1.38451E-01 0 0 0 9.48728E-01 0.00000E+00 3.49650E+00 2.36275E+00 1.90763E+00 8.29949E-01 2.46360E+00 1.69903E+00 1.00000E+00 1.66128E+00
+3.74861E+00 3.68665E+00 3.27277E-01 8.64036E-01 7.79242E-01 8.58133E-01 1.18445E+00 4.25785E+00 8.65261E+00 1.40684E+01 3.65437E+00 3.45591E+00 9.99998E-01 -3.06978E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 1.64839E+00 2.95403 1.33880E+00 6.32533E-01 0 0 0 1.47203E+00 0.00000E+00 5.30271E+00 3.06969E+00 8.14082E-01 1.20582E+00 2.46360E+00 5.67719E-01 1.00000E+00 2.09168E+00
+9.60231E+00 1.66049E+00 -1.47565E-01 7.12691E-01 -3.28156E-01 8.24847E-01 1.89505E+00 9.94033E+00 1.94539E-01 1.38301E+01 3.52283E+00 3.23863E+00 1.37188E-02 1.57889E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 4.43536E+00 3.18288 1.33880E+00 1.39236E+01 0 0 0 1.56736E+00 0.00000E+00 3.80403E+00 4.20638E+00 1.59364E+00 3.49864E-02 2.46360E+00 2.25777E+00 1.00000E+00 2.75588E-01
+2.30783E+01 2.81051E+00 -3.32350E-03 7.32579E-01 1.52374E-01 8.38549E-01 3.26318E+00 1.00625E+01 5.87947E-01 1.38163E+01 3.51978E+00 3.72648E+00 -1.29622E-01 -2.64538E-02 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 3.18804E+00 3.07709 1.33880E+00 2.18779E+01 0 0 0 1.55117E+00 0.00000E+00 5.34948E+00 2.82438E+00 3.46574E-02 3.46888E-02 2.46360E+00 2.50554E+00 1.00000E+00 3.01362E+00
+1.73130E+00 2.54579E+00 -1.25893E-01 9.00000E-01 1.97843E-01 8.56098E-01 4.96942E+00 9.08644E+00 1.35547E+00 1.39330E+01 3.12147E+00 2.96235E+00 -1.26219E-01 1.52191E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 8.34635E+00 2.52339 1.33880E+00 1.73979E-01 0 0 0 1.25073E+00 0.00000E+00 3.56563E+00 4.62700E+00 5.42587E-01 1.19662E+00 2.46360E+00 2.75423E+00 1.00000E+00 1.19656E+00
+6.71339E+00 3.43287E+00 3.79852E-01 4.23454E-01 -7.64425E-01 7.26083E-01 2.74194E+00 1.01072E+01 4.15874E-02 1.38289E+01 3.44526E+00 3.28516E+00 6.01677E-01 5.02609E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 8.25936E+00 3.27573 1.33880E+00 1.17414E-01 0 0 0 1.25155E+00 0.00000E+00 4.72710E+00 2.03358E+00 3.46574E-02 1.14437E-01 2.46360E+00 2.81274E+00 1.00000E+00 1.94338E+00
+5.13716E+00 3.11679E+00 2.60031E-02 6.82465E-01 4.37647E-02 3.31825E-01 2.24644E+01 2.29419E+00 2.57466E-01 1.38908E+01 4.13150E-01 5.08277E+00 7.34002E-01 -7.55198E-03 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 8.03123E+00 3.54461 1.33880E+00 3.23008E+00 0 0 0 9.01650E-01 0.00000E+00 4.05275E+00 7.88509E+00 2.46437E+00 2.05447E-01 2.46360E+00 3.11509E+00 1.00000E+00 3.73330E+00
+3.21546E+00 3.45408E+00 -5.34037E-02 6.60310E-01 3.63418E-01 3.81022E-01 1.22376E+00 9.19354E+00 6.74431E-02 1.92607E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 -4.97550E-01 2.12418E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 7.47902E+00 2.2909 1.33880E+00 1.73050E-01 0 0 0 1.18347E+00 0.00000E+00 3.03102E+00 3.10506E+00 1.40754E-01 5.29593E-01 2.46360E+00 1.86941E+00 1.00000E+00 1.31506E+00
+3.21546E+00 3.45408E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 1.22376E+00 9.19354E+00 6.74431E-02 1.92607E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 7.47902E+00 2.2909 1.33880E+00 1.73050E-01 0 0 0 1.18347E+00 0.00000E+00 3.03102E+00 3.10506E+00 1.40754E-01 5.29593E-01 2.46360E+00 1.86941E+00 1.00000E+00 1.31506E+00
+8.22196E-01 4.31546E+00 -2.86221E-01 2.45055E-01 -9.99479E-01 4.42862E-02 4.89254E+00 9.79089E+00 3.69290E-02 1.38944E+01 1.94716E+00 1.84870E+00 9.01956E-01 4.35468E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 2.13788E+00 2.89575 1.33880E+00 1.02711E-01 0 0 0 1.17689E+00 0.00000E+00 4.83647E+00 2.78265E+00 5.90224E-01 1.79498E+00 2.46360E+00 3.15127E-02 1.00000E+00 1.42176E+00
+1.23733E+00 3.92636E+00 -2.36705E-01 5.05627E-01 -4.58667E-01 2.41406E-02 2.31444E+00 9.54319E+00 8.63932E-01 1.39113E+01 2.01468E+00 1.91212E+00 8.74037E-01 4.40513E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 8.10832E+00 2.42823 1.33880E+00 1.73477E+00 0 0 0 1.16987E+00 0.00000E+00 2.60882E+00 3.90987E+00 1.32888E+00 3.51550E-01 2.46360E+00 2.11059E+00 1.00000E+00 1.27768E+00
+8.15991E+00 3.66611E+00 -7.78647E-02 7.36412E-01 6.26687E-01 6.40887E-01 6.84368E+00 9.91848E+00 7.29423E+00 1.38307E+01 3.86374E+00 3.66723E+00 -9.08165E-01 1.08625E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 1.40674E+00 4.17329 1.33880E+00 6.45557E-02 0 0 0 1.43121E+00 0.00000E+00 7.22868E+00 2.01821E+00 1.74933E-01 1.22273E+00 2.46360E+00 7.03377E-01 1.00000E+00 1.75729E+00
+3.61839E+00 3.35179E+00 -8.58424E-01 6.04867E-01 -7.03134E-01 -2.12579E-02 1.75328E+00 9.37840E+00 4.12064E-02 1.38798E+01 3.22338E+00 3.05927E+00 1.99482E-02 5.68709E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 3.13381E+00 2.49397 1.33880E+00 1.07134E+00 0 0 0 1.08624E+00 0.00000E+00 4.85117E+00 4.10152E+00 8.95494E-01 1.92227E+00 2.46360E+00 1.50641E-02 1.00000E+00 1.40467E+00
+1.06553E+01 3.00891E+00 -1.38791E-01 1.01159E-01 -2.03204E-01 -2.86709E-01 3.73219E+00 9.82936E+00 3.46574E-02 1.38554E+01 3.24149E+00 3.07650E+00 -1.62674E-03 2.88513E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 2.13347E+00 0 8.51560E-01 3.98179E-01 2.97006E+00 2.91216 1.33880E+00 4.02245E-01 0 0 0 1.29134E+00 1.06453E+00 4.61298E+00 4.45980E+00 3.70066E-02 6.81047E-02 2.46360E+00 9.30046E-01 1.00000E+00 1.08848E+00
+2.03612E+00 3.91179E+00 -2.51109E-01 4.63698E-01 -6.09105E-01 8.14658E-02 2.07759E+00 9.51936E+00 3.46574E-02 1.39012E+01 2.37242E+00 2.25167E+00 9.56140E-01 1.16919E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 9.11819E-01 0 8.51560E-01 3.62436E-01 2.67330E+00 3.11484 1.33880E+00 5.41942E-02 0 0 0 1.21348E+00 1.19053E+00 2.54335E+00 1.97873E+00 1.50731E+00 4.94470E-01 2.46360E+00 2.72561E+00 1.00000E+00 1.79561E+00
+7.53761E+00 3.62002E+00 -6.52109E-01 7.17105E-01 1.51061E-01 6.53100E-01 1.37724E+00 9.31625E+00 1.15651E-01 1.38553E+01 3.91116E+00 3.71217E+00 -3.37121E-01 2.53290E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 5.32259E+00 2.43199 1.33880E+00 1.67582E-01 0 0 0 1.17731E+00 0.00000E+00 5.49684E+00 3.36550E+00 2.37664E-01 8.82211E-01 2.46360E+00 7.24810E-01 1.00000E+00 4.32291E-01
+4.79629E+00 3.14365E+00 -2.19134E-01 2.67846E-01 -4.35642E-01 5.38275E-01 2.28941E+00 9.55024E+00 3.47518E-02 1.38964E+01 2.45905E+00 2.33388E+00 9.23376E-01 6.00372E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 1.74112E+00 0 8.51560E-01 9.86216E-01 7.61332E+00 4.27869 1.33880E+00 7.72375E-01 0 0 0 1.48048E+00 3.55476E-01 3.18955E+00 3.00516E+00 1.15864E+00 3.53266E-02 2.46360E+00 2.84226E+00 1.00000E+00 1.28593E+00
+1.21080E+01 3.66330E+00 -1.31893E-01 7.27242E-01 6.54647E-01 5.93303E-01 1.38161E+00 9.30743E+00 1.44434E-01 1.38407E+01 4.25646E+00 4.03983E+00 -9.88275E-01 2.98346E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 2.45562E+00 0 8.51560E-01 8.13472E-01 9.54483E+00 3.45381 1.33880E+00 1.35758E+00 0 0 0 1.36532E+00 9.56932E-01 3.51018E+00 3.37763E+00 9.40401E-01 3.47859E-02 2.46360E+00 2.69474E+00 1.00000E+00 2.09840E+00
+6.55711E+00 3.30109E+00 1.13025E-01 9.00000E-01 4.68036E-01 9.0000000E-01 1.91301E+00 9.49719E+00 9.67704E-02 1.38542E+01 3.44506E+00 3.32275E+00 -3.88157E-01 -1.51921E-02 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 3.49782E+00 3.94998 1.33880E+00 2.34728E-01 0 0 0 1.36746E+00 0.00000E+00 3.39549E+00 1.91776E+00 2.60411E+00 4.96390E-01 2.46360E+00 4.38413E+00 1.00000E+00 2.51647E+00
+7.91363E+00 3.05510E+00 4.79616E-01 -9.00000E-01 -8.25578E-02 9.000000E-01 4.38656E+00 1.00847E+01 8.51435E-01 1.38451E+01 2.96841E+00 2.81813E+00 -4.11046E-01 -2.87502E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 3.10784E+00 2.29302 1.33880E+00 1.38451E-01 0 0 0 9.48728E-01 0.00000E+00 3.49650E+00 2.36275E+00 1.90763E+00 8.29949E-01 2.46360E+00 1.69903E+00 1.00000E+00 1.66128E+00
+3.74861E+00 3.68665E+00 3.27277E-01 8.64036E-01 7.79242E-01 8.58133E-01 1.18445E+00 4.25785E+00 8.65261E+00 1.40684E+01 3.65437E+00 3.45591E+00 9.99998E-01 -3.06978E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 1.64839E+00 2.95403 1.33880E+00 6.32533E-01 0 0 0 1.47203E+00 0.00000E+00 5.30271E+00 3.06969E+00 8.14082E-01 1.20582E+00 2.46360E+00 5.67719E-01 1.00000E+00 2.09168E+00
+3.21546E+00 3.45408E+00 -5.34037E-02 6.60310E-01 3.63418E-01 3.81022E-01 1.22376E+00 9.19354E+00 6.74431E-02 1.92607E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 -4.97550E-01 2.12418E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 7.47902E+00 2.2909 1.33880E+00 1.73050E-01 0 0 0 1.18347E+00 0.00000E+00 3.03102E+00 3.10506E+00 1.40754E-01 5.29593E-01 2.46360E+00 1.86941E+00 1.00000E+00 1.31506E+00
+3.21546E+00 3.45408E+00 -5.34037E-02 6.60310E-01 3.63418E-01 3.81022E-01 1.22376E+00 9.19354E+00 6.74431E-02 1.92607E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 -4.97550E-01 2.12418E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 7.47902E+00 2.2909 1.33880E+00 1.73050E-01 0 0 0 1.18347E+00 0.00000E+00 3.03102E+00 3.10506E+00 1.40754E-01 5.29593E-01 2.46360E+00 1.86941E+00 1.00000E+00 1.31506E+00
+1.23393E+00 4.67195E+00 -2.61819E-01 -2.25263E-02 -9.99973E-01 -6.22555E-02 2.86523E+00 9.14958E+00 3.82848E+00 1.39207E+01 2.58073E+00 2.44939E+00 8.89129E-01 1.31225E-03 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 3.40571E+00 0 8.51560E-01 1.34391E+00 5.44556E-01 4.35377 1.33880E+00 1.14615E-01 0 0 0 1.39878E+00 1.21698E+00 4.00438E+00 4.08491E+00 5.34318E-01 5.00988E-01 2.46360E+00 2.45097E+00 1.00000E+00 3.95510E+00
+7.06420E-01 4.21154E+00 -3.98557E-02 -3.98557E-02 -3.70273E-01 -3.70273E-01 1.32625E+01 1.10219E+01 8.69927E-01 1.36960E+01 2.11509E+00 2.11509E+00 3.15842E-01 3.15842E-01 1 0 0 0 0 1.94101E+00 0 1.94101E+00 0 8.51560E-01 8.51560E-01 2.39897E+00 3.23986 1.33877E+00 1.33877E+00 0 0 0 1.25282E+00 1.25282E+00 9.97545E+00 9.97757E+00 1.00267E+01 1.00152E+01 2.46356E+00 2.46356E+00 1.00000E+00 1.31932E+00
+4.90353E+00 3.27225E+00 -4.70507E-02 3.12460E-01 -5.04224E-01 2.03239E-01 1.69727E+00 9.09877E+00 3.47331E-02 1.39045E+01 2.69070E+00 2.55375E+00 7.75226E-01 2.10633E-01 1 0 0 0 0 1.59944E+00 0 0.00000E+00 0 1.45326E+00 0.00000E+00 4.16582E+00 4.07222 7.55100E-01 6.17536E-01 0 0 0 1.50094E+00 0.00000E+00 3.05523E+00 2.12170E+00 4.67476E-01 1.38403E-01 3.78210E+00 2.47316E+00 1.00000E+00 1.30486E+00
+6.04918E+00 3.64643E+00 -3.37943E-01 6.47644E-01 -3.07416E-02 5.71348E-01 1.83339E+00 9.37560E+00 1.79203E+00 1.39149E+01 2.14024E+00 2.03132E+00 9.79172E-01 4.92591E-01 1 0 0 0 0 1.46578E+00 0 0.00000E+00 0 1.11644E+00 0.00000E+00 5.80389E+00 4.12539 7.55100E-01 2.66445E+00 0 0 0 1.52978E+00 0.00000E+00 5.58165E+00 3.57423E+00 3.46574E-02 3.46613E-02 3.78210E+00 1.84092E+00 1.00000E+00 1.24482E+00
+3.10492E+00 3.66816E+00 -3.38128E-01 6.32560E-01 -8.57082E-01 3.07945E-01 2.04255E+00 9.77494E+00 1.19532E+00 1.38780E+01 2.62648E+00 2.49279E+00 8.26246E-01 6.25759E-01 1 0 0 0 0 2.08269E+00 0 0.00000E+00 0 7.60267E-01 0.00000E+00 6.77859E+00 4.83805 7.55100E-01 6.59835E-01 0 0 0 1.73477E+00 0.00000E+00 4.00982E+00 2.03504E+00 3.47285E-02 4.26411E-02 3.78210E+00 3.12267E+00 1.00000E+00 1.27817E+00
+5.35847E+00 3.48906E+00 1.21070E-01 6.15933E-01 3.89427E-01 4.70455E-01 2.70879E+00 9.66743E+00 3.48997E-02 1.38654E+01 3.22010E+00 3.05604E+00 -9.78398E-02 1.21433E-01 1 0 0 0 0 2.28603E+00 0 0.00000E+00 0 1.33120E+00 0.00000E+00 3.81177E+00 4.69942 7.55100E-01 1.64365E+00 0 0 0 1.70745E+00 0.00000E+00 2.34964E+00 5.33747E+00 4.32094E+00 3.47617E-02 3.78210E+00 2.19819E+00 1.00000E+00 1.27964E+00
+5.23212E+00 2.84739E+00 -6.39629E-02 6.54034E-01 -3.71070E-02 5.53455E-01 1.52727E+00 9.43266E+00 3.46719E-02 1.38924E+01 2.82670E+00 2.68283E+00 4.77474E-01 3.58256E-01 1 0 0 0 0 1.61896E+00 0 0.00000E+00 0 1.57874E+00 0.00000E+00 1.44124E+00 4.48321 7.55100E-01 1.23466E+01 0 0 0 1.85541E+00 0.00000E+00 1.24057E+00 6.28722E+00 6.94432E+00 3.63675E-02 3.78210E+00 1.19579E+00 1.00000E+00 1.16806E+00
+2.98818E+00 3.59037E+00 3.46574E-02 5.22839E-01 3.46574E-02 1.65631E-01 1.14447E+00 9.50239E+00 2.73378E-01 1.38975E+01 2.48289E+00 2.35644E+00 7.91830E-01 4.59508E-01 1 0 0 0 0 1.90909E+00 0 0.00000E+00 0 1.35704E+00 0.00000E+00 1.06882E+01 4.04192 7.55100E-01 6.97094E-01 0 0 0 1.74602E+00 0.00000E+00 5.66076E+00 5.38727E+00 8.04780E-02 3.48382E-02 3.78210E+00 1.30114E+00 1.00000E+00 1.26553E+00
+1.01428E+01 2.77418E+00 -3.62927E-01 7.68508E-01 -2.09007E-01 -2.71710E-01 3.14471E+00 9.50887E+00 3.49713E-02 1.38332E+01 4.06893E+00 3.86092E+00 3.97160E-01 4.88141E-01 1 0 0 0 0 6.21744E-01 0 0.00000E+00 0 6.90652E-01 0.00000E+00 3.02533E+00 4.67263 7.55100E-01 7.76993E-01 0 0 0 1.58254E+00 0.00000E+00 1.23132E-01 7.50977E+00 1.02746E+01 1.72001E+00 3.78210E+00 2.60218E-01 1.00000E+00 1.18045E+00
+7.83328E+00 2.44458E+00 -3.58458E-01 8.55653E-01 -7.49992E-01 8.82040E-01 2.79355E+00 9.59072E+00 4.13748E-01 1.39052E+01 1.92145E+00 1.82360E+00 9.70082E-01 6.44655E-01 1 0 0 0 0 2.22544E+00 0 0.00000E+00 0 4.92840E-01 0.00000E+00 1.55173E+00 6.18211 7.55100E-01 5.97352E-01 0 0 0 1.83624E+00 0.00000E+00 1.25085E+00 5.46970E+00 6.41720E+00 3.61289E-02 3.78210E+00 1.80403E+00 1.00000E+00 1.25169E+00
+6.22992E+00 3.13390E+00 1.69930E-02 5.83415E-01 -2.65220E-01 4.11602E-01 1.47796E+00 9.43029E+00 3.73717E-02 1.38975E+01 2.68773E+00 2.55091E+00 7.73444E-01 2.13267E-01 1 0 0 0 0 1.67784E+00 0 0.00000E+00 0 1.41061E+00 0.00000E+00 6.82061E+00 4.1718 7.55100E-01 6.72855E-01 0 0 0 1.64957E+00 0.00000E+00 3.34986E+00 3.16473E+00 3.46574E-02 6.87432E-02 3.78210E+00 2.09930E+00 1.00000E+00 1.29004E+00
+6.22992E+00 3.13390E+00 0.00000E+00 0.00000E+00  0.00000E+00 0.0000000E+00 1.47796E+00 9.43029E+00 3.73717E-02 1.38975E+01 2.68773E+00 2.55091E+00 0.00000E+00 0.0000E+00 1 0 0 0 0 1.67784E+00 0 0.00000E+00 0 1.41061E+00 0.00000E+00 6.82061E+00 4.1718 7.55100E-01 6.72855E-01 0 0 0 1.64957E+00 0.00000E+00 3.34986E+00 3.16473E+00 3.46574E-02 6.87432E-02 3.78210E+00 2.09930E+00 1.00000E+00 1.29004E+00
+2.42514E+00 3.78454E+00 -2.31320E-01 2.61894E-01 -9.99988E-01 1.19287E-01 5.62239E+00 1.06668E+01 1.52279E-01 1.38221E+01 2.43030E+00 2.30660E+00 8.49478E-01 2.00753E-01 1 0 0 0 0 1.87796E+00 0 0.00000E+00 0 1.29968E+00 0.00000E+00 7.75331E+00 3.65355 7.55100E-01 5.58776E+00 0 0 0 1.43373E+00 0.00000E+00 3.42675E+00 3.60510E+00 1.12648E+00 8.39558E-02 3.78210E+00 1.93011E+00 1.00000E+00 1.20616E+00
+4.92350E+00 3.27415E+00 -9.88194E-02 5.53516E-01 -4.16850E-01 3.35922E-01 1.45639E+00 9.42731E+00 9.34415E-02 1.38980E+01 2.68910E+00 2.55221E+00 7.90031E-01 2.56357E-01 1 0 0 0 0 1.57460E+00 0 0.00000E+00 0 1.07279E+00 0.00000E+00 6.66834E+00 4.29521 7.55100E-01 6.95775E-01 0 0 0 1.58024E+00 0.00000E+00 2.96208E+00 2.76337E+00 3.46574E-02 5.47719E-02 3.78210E+00 2.31176E+00 1.00000E+00 1.28409E+00
+1.52651E+00 3.95915E+00 -5.07797E-01 6.42511E-01 -2.91594E-01 -2.38241E-01 2.62903E+00 9.66640E+00 2.48928E+00 1.38937E+01 2.63952E+00 2.50522E+00 4.57544E-01 8.01910E-01 1 0 0 0 0 2.54640E+00 0 0.00000E+00 0 3.65830E-01 0.00000E+00 8.02693E+00 3.98647 7.55100E-01 8.57803E-01 0 0 0 1.50303E+00 0.00000E+00 4.34126E+00 4.99168E+00 1.80027E+00 1.95873E+00 3.78210E+00 4.40408E+00 1.00000E+00 1.31141E+00
+3.19143E+00 3.69642E+00 -3.35686E-01 4.33270E-01 -7.13812E-01 1.91206E-01 1.28041E+00 9.33537E+00 3.72588E-02 1.38995E+01 2.73514E+00 2.59593E+00 7.94545E-01 4.33232E-01 1 0 0 0 0 1.70505E+00 0 0.00000E+00 0 5.39241E-01 0.00000E+00 7.37254E+00 4.29697 7.55100E-01 6.94257E-01 0 0 0 1.55441E+00 0.00000E+00 3.48085E+00 3.11983E+00 7.63501E-01 3.46650E-02 3.78210E+00 2.20474E+00 1.00000E+00 1.29093E+00
+7.60882E+00 3.73830E+00 -3.41226E-01 3.55099E-01 -6.23957E-01 2.40261E-01 4.23696E+00 1.00600E+01 3.60130E-02 1.38603E+01 2.59905E+00 2.46676E+00 9.35994E-01 3.03979E-01 1 0 0 0 0 2.13978E+00 0 1.14170E-01 0 6.42934E-01 1.46255E-01 5.20992E+00 4.17387 7.55100E-01 6.79460E-01 0 0 0 1.48631E+00 1.63309E+00 3.55888E+00 3.13038E+00 6.02062E-01 6.10391E-02 3.78210E+00 2.07254E+00 1.00000E+00 1.28689E+00
+6.13635E+00 3.44668E+00 -2.43524E-01 2.88157E-01 -2.94644E-01 1.98561E-01 1.78264E+00 9.46693E+00 3.58045E-02 1.38993E+01 2.53765E+00 2.40848E+00 9.60731E-01 2.18048E-01 1 0 0 0 0 1.73076E+00 0 1.42422E-01 0 1.19258E+00 2.48493E-01 7.20144E+00 3.802 7.55100E-01 6.86609E-01 0 0 0 1.48907E+00 1.26403E+00 4.51342E+00 4.03665E+00 3.46574E-02 8.19878E-02 3.78210E+00 1.54762E+00 1.00000E+00 1.37331E+00
+4.68290E+00 3.68599E+00 -7.41122E-01 4.74125E-01 -5.91462E-01 1.21208E-01 1.38844E+00 9.39590E+00 1.99876E-01 1.38767E+01 3.33382E+00 3.16413E+00 2.02868E-01 4.27565E-01 1 0 0 0 0 1.88585E+00 0 0.00000E+00 0 1.10185E+00 0.00000E+00 8.59210E+00 4.31918 7.55100E-01 6.82752E-01 0 0 0 1.36215E+00 0.00000E+00 3.79189E+00 3.63026E+00 6.02706E-01 3.47436E-02 3.78210E+00 2.14483E+00 1.00000E+00 1.29388E+00
+2.14240E+00 3.28874E+00 -8.04026E-01 3.70637E-01 1.82753E-02 -8.13204E-01 3.47138E-01 9.30905E+00 3.62906E-02 1.39122E+01 2.41152E+00 2.28877E+00 9.32494E-01 4.22412E-01 1 0 0 0 0 1.40432E+00 0 1.85372E+00 0 2.23342E+00 2.05118E+00 1.18089E+01 3.97577 7.55100E-01 6.94131E-01 0 0 0 1.36371E+00 1.01976E+00 5.07059E+00 4.69621E+00 6.07896E-02 9.06959E-02 3.78210E+00 1.22531E+00 1.00000E+00 1.22149E+00
+1.57084E+00 3.93270E+00 1.83795E-02 -9.000000E-01 -1.79970E-01 -7.75400E-01 1.95336E+00 9.42913E+00 3.46745E-02 1.39157E+01 1.91456E+00 1.81711E+00 9.41305E-01 4.32424E-01 1 0 0 0 0 1.38435E+00 0 1.51067E+00 0 1.46802E+00 1.69715E+00 1.04752E+01 4.02821 7.55100E-01 1.64386E-01 0 0 0 1.56518E+00 7.89374E-01 3.96098E+00 3.90965E+00 4.95994E-01 6.50098E-02 3.78210E+00 1.71574E+00 1.00000E+00 1.35960E+00
+4.17237E+00 3.41016E+00 -9.86914E-02 5.22151E-01 4.34466E-02 2.68851E-01 7.21979E-01 9.31407E+00 4.62179E-01 1.39070E+01 2.62056E+00 2.48718E+00 7.92454E-01 3.76972E-01 1 0 0 0 0 1.80933E+00 0 0.00000E+00 0 1.76731E+00 0.00000E+00 8.68913E+00 4.32349 7.55100E-01 8.28837E-01 0 0 0 1.71288E+00 0.00000E+00 4.72456E+00 3.77848E+00 7.13422E-02 3.48039E-02 3.78210E+00 1.82847E+00 1.00000E+00 1.27867E+00
+6.04918E+00 3.64643E+00 -3.37943E-01 6.47644E-01 -3.07416E-02 5.71348E-01 1.83339E+00 9.37560E+00 1.79203E+00 1.39149E+01 2.14024E+00 2.03132E+00 9.79172E-01 4.92591E-01 1 0 0 0 0 1.46578E+00 0 0.00000E+00 0 1.11644E+00 0.00000E+00 5.80389E+00 4.12539 7.55100E-01 2.66445E+00 0 0 0 1.52978E+00 0.00000E+00 5.58165E+00 3.57423E+00 3.46574E-02 3.46613E-02 3.78210E+00 1.84092E+00 1.00000E+00 1.24482E+00
+3.10492E+00 3.66816E+00 -3.38128E-01 6.32560E-01 -8.57082E-01 3.07945E-01 2.04255E+00 9.77494E+00 1.19532E+00 1.38780E+01 2.62648E+00 2.49279E+00 8.26246E-01 6.25759E-01 1 0 0 0 0 2.08269E+00 0 0.00000E+00 0 7.60267E-01 0.00000E+00 6.77859E+00 4.83805 7.55100E-01 6.59835E-01 0 0 0 1.73477E+00 0.00000E+00 4.00982E+00 2.03504E+00 3.47285E-02 4.26411E-02 3.78210E+00 3.12267E+00 1.00000E+00 1.27817E+00
+6.22992E+00 3.13390E+00 1.69930E-02 5.83415E-01 -2.65220E-01 4.11602E-01 1.47796E+00 9.43029E+00 3.73717E-02 1.38975E+01 2.68773E+00 2.55091E+00 7.73444E-01 2.13267E-01 1 0 0 0 0 1.67784E+00 0 0.00000E+00 0 1.41061E+00 0.00000E+00 6.82061E+00 4.1718 7.55100E-01 6.72855E-01 0 0 0 1.64957E+00 0.00000E+00 3.34986E+00 3.16473E+00 3.46574E-02 6.87432E-02 3.78210E+00 2.09930E+00 1.00000E+00 1.29004E+00
+6.22992E+00 3.13390E+00 1.69930E-02 5.83415E-01 -2.65220E-01 4.11602E-01 1.47796E+00 9.43029E+00 3.73717E-02 1.38975E+01 2.68773E+00 2.55091E+00 7.73444E-01 2.13267E-01 1 0 0 0 0 1.67784E+00 0 0.00000E+00 0 1.41061E+00 0.00000E+00 6.82061E+00 4.1718 7.55100E-01 6.72855E-01 0 0 0 1.64957E+00 0.00000E+00 3.34986E+00 3.16473E+00 3.46574E-02 6.87432E-02 3.78210E+00 2.09930E+00 1.00000E+00 1.29004E+00
+3.75543E+00 3.36136E+00 -6.33286E-02 7.35839E-01 -9.97527E-01 2.50147E-01 2.83782E+00 9.51220E+00 3.52073E-02 1.38996E+01 2.61450E+00 2.48138E+00 7.93823E-01 3.68392E-01 1 0 0 0 0 2.21760E+00 0 2.69356E+00 0 2.18590E+00 9.53745E-01 1.43051E+01 3.14675 7.55100E-01 1.55626E+00 0 0 0 1.75864E+00 1.26504E+00 8.38762E+00 7.74879E+00 2.34613E-01 2.18917E-01 3.78210E+00 1.27194E-01 1.00000E+00 1.65970E+00
+6.53448E+00 3.06497E+00 -1.23530E-01 -2.44882E-01 -4.71815E-01 -2.13773E-01 2.91274E+00 9.69125E+00 6.10683E-02 1.38750E+01 2.88858E+00 2.74155E+00 2.91243E-01 2.25591E-01 1 0 0 0 0 1.98732E+00 0 1.14543E+00 0 1.14429E+00 3.94402E-01 8.98237E+00 4.06894 7.55100E-01 6.99473E-01 0 0 0 1.55498E+00 1.34262E+00 4.26414E+00 3.85766E+00 3.56723E-02 8.29407E-02 3.78210E+00 1.66734E+00 1.00000E+00 1.41601E+00
+6.95211E+00 4.15350E+00 1.06100E-01 1.06100E-01 8.50956E-02 8.50956E-02 5.04585E+00 0.00000E+00 3.49565E-02 1.37241E+01 5.05597E+00 5.05597E+00 1.32002E-01 1.32002E-01 1 0 0 0 0 2.00522E+00 0 2.00522E+00 0 1.16310E+00 1.16310E+00 3.59225E+00 4.20321 7.55102E-01 7.55102E-01 0 0 0 1.48324E+00 1.48324E+00 8.78257E+00 8.90742E+00 1.13779E+01 1.02795E+01 3.78209E+00 3.78209E+00 1.00000E+00 1.37869E+00
diff --git a/PARAM/scparm.adam_24_08_12021 b/PARAM/scparm.adam_24_08_12021

new file mode 100644 (file)

index 0000000..9451cd8
--- /dev/null
+++ b/PARAM/scparm.adam_24_08_12021
@@ -0,0 +1,515 @@
+4 6 0                                         
+2 0 0 0 0 0 0 2 0 0 2 2 2 2 -1 -1 2 1 1 0 0 0 0 0 -1 -1 -1                 
+0.000197 7.877 0.080 0.080 -0.212 -0.212 0.3271 10.9336 9.3925 32.1007 5.930 5.930 0.080 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.95 183.96 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Cys Cys
+0.006280 5.701 0.286 0.003 0.207 -0.998 0.1875 10.4300 10.8900 4.4000 7.570 4.030 0.043 -0.039 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Cys
+0.222400 4.390 0.587 0.587 0.892 0.892 9.1300 -0.2700 0.6570 33.0700 9.590 0.000 0.210 0.210 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Met
+0.000080 7.550 0.167 -0.011 -0.036 -0.998 0.1100 0.1380 6.2041 4.6801 6.670 3.550 0.203 0.027 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Cys
+0.003194 6.010 0.370 0.374 0.078 -0.487 0.2127 12.9137 11.7580 4.5435 3.784 7.777 0.172 0.279 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Met
+0.235600 4.760 0.581 0.581 0.914 0.914 0.8380 2.8800 2.8400 33.0900 10.830 0.000 0.157 0.157 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Phe
+0.000290 7.360 -0.030 0.186 -0.998 0.225 0.2800 12.9400 12.4300 4.4000 3.730 7.020 0.040 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ile Cys
+0.010800 5.450 0.444 0.464 0.419 0.960 13.5000 -0.2200 0.6900 32.7000 6.900 7.040 0.270 0.210 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ile Met
+0.000600 6.790 0.346 0.279 -0.372 0.371 0.2700 13.2400 11.8100 4.5000 8.000 3.890 0.250 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ile Phe
+0.042804 6.204 0.322 0.322 0.546 0.546 135.4970 -0.5891 0.4237 14.3730 10.360 0.000 0.171 0.171 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ile Ile
+0.001160 7.365 0.186 -0.003 0.225 -0.998 0.3000 12.9400 12.4300 4.4000 7.017 3.733 0.080 0.041 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Leu Cys
+0.043412 5.454 0.464 0.444 0.960 0.419 13.4913 -0.2275 0.6761 32.7382 7.040 6.897 0.213 0.267 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Leu Met
+0.002156 6.778 0.278 0.346 0.371 -0.372 0.2682 13.2550 11.8186 4.4958 3.893 8.000 0.128 0.254 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Leu Phe
+0.042804 6.204 0.322 0.322 0.546 0.546 135.4970 -0.5891 0.4237 14.3730 10.360 0.000 0.171 0.171 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Leu Ile
+0.042804 6.204 0.322 0.322 0.546 0.546 135.4970 -0.5891 0.4237 14.3730 10.360 0.000 0.171 0.171 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Leu Leu
+0.009880 6.210 0.009 0.001 0.078 -0.998 0.3500 12.6700 11.7100 4.4000 6.760 3.600 0.053 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Cys
+0.067200 5.210 0.586 0.253 0.969 0.531 4.5500 1.4100 2.1100 11.0000 4.630 6.420 0.060 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Met
+0.007200 6.020 0.308 0.414 0.734 0.314 0.3300 8.3600 7.5100 3.8000 4.280 8.040 0.040 0.200 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Phe
+0.094380 5.685 0.425 0.245 0.990 0.250 9.6350 0.1459 0.9445 31.8673 5.686 7.894 0.067 -0.198 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Ile
+0.094380 5.685 0.425 0.245 0.990 0.250 9.6350 0.1459 0.9445 31.8673 5.686 7.894 0.067 -0.198 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Leu
+0.009271 7.054 0.158 0.158 0.267 0.267 149.7620 -0.5569 0.4477 5.8356 8.890 0.000 0.105 0.105 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Val Val
+0.000108 7.106 0.112 0.089 -0.998 -0.032 0.1223 11.8285 11.0475 4.0572 4.828 9.076 -0.098 -0.126 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Cys
+0.007200 5.460 0.481 0.411 -0.505 0.191 0.2072 12.7699 12.4181 4.4804 8.160 3.970 0.220 0.150 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Met
+0.179176 4.690 0.589 0.664 0.849 0.993 0.1885 13.8793 12.6256 4.2956 9.020 4.389 0.167 0.349 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Phe
+0.024976 5.334 0.547 0.445 0.428 0.978 0.2044 13.2230 12.1844 4.4618 8.227 4.003 0.234 0.017 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Ile
+0.024976 5.334 0.547 0.445 0.428 0.978 0.2044 13.2230 12.1844 4.4618 8.227 4.003 0.234 0.017 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Leu
+0.009600 5.720 0.505 0.310 0.424 0.779 0.2000 13.1600 12.2500 4.5000 8.230 4.000 0.190 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Val
+0.756400 3.864 0.750 0.750 0.992 0.992 6.8186 -1.0347 0.3512 32.7335 8.716 0.000 0.002 0.002 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Trp Trp
+0.003008 5.596 0.103 0.148 -0.997 0.121 0.1128 12.8934 13.3251 4.2332 4.299 8.082 -0.099 -0.065 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 1.69 179.36 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Cys
+0.000140 7.130 0.062 0.203 -0.998 0.074 0.2000 12.8000 11.0300 3.9000 5.220 9.810 -0.200 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Met
+0.000116 8.160 0.015 0.129 -0.998 0.056 0.1625 15.3200 13.7100 3.8000 5.230 9.830 -0.010 -0.360 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Phe
+0.000400 7.300 0.084 0.196 -0.998 0.199 0.1925 14.1200 13.2400 4.1000 4.580 8.610 -0.080 -0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Ile
+0.000400 7.300 0.084 0.196 -0.998 0.199 0.1925 14.1200 13.2400 4.1000 4.580 8.610 -0.080 -0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Leu
+0.000200 7.847 0.083 0.081 -0.998 0.059 0.1695 13.5461 13.3751 4.1859 4.368 8.210 -0.043 -0.009 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Val
+0.000057 8.490 0.091 0.027 -0.024 -0.998 0.1510 16.4500 13.8400 3.4000 10.950 5.820 -0.326 -0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Trp
+0.000324 7.329 0.063 0.063 -0.304 -0.304 0.2174 14.2600 11.6496 32.0500 8.598 8.598 -0.232 -0.232 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.58 183.50 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Tyr Tyr
+0.008364 5.626 0.013 0.186 -0.998 0.118 0.3450 11.8400 11.0800 4.6000 3.240 6.080 0.090 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Cys
+0.029696 4.997 0.377 0.383 0.821 0.386 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 5.388 7.464 0.099 0.831 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Met
+0.000272 7.170 0.142 0.206 -0.006 -0.750 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 3.899 7.330 0.074 0.092 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Phe
+0.001472 7.202 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.341 7.415 0.096 0.126 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ile
+0.000400 7.200 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.340 7.410 0.100 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Leu
+0.002052 7.006 0.317 0.111 0.869 0.121 9.3652 0.2400 0.9894 32.0718 7.046 5.075 0.066 0.081 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Val
+0.000236 7.034 0.103 0.324 -0.290 -0.096 0.1648 13.1732 11.7606 4.4984 3.898 8.010 0.084 -0.175 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Trp
+0.000165 7.120 0.100 0.099 0.023 -0.998 0.1400 13.1600 12.7400 4.2000 8.010 4.260 -0.100 -0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Tyr
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+0.016040 5.080 0.005 0.097 0.024 -0.588 0.3150 11.7200 10.8400 4.5815 3.104 5.835 0.105 -0.003 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Cys
+0.000002 9.490 0.124 -0.006 -0.997 -0.085 12.1500 -0.3600 0.5900 31.3000 5.160 7.160 0.230 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Met
+0.000010 6.930 0.423 0.033 -0.997 0.225 15.3800 -1.3100 -0.0500 31.4000 3.330 4.620 0.530 -0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Phe
+0.000020 8.790 0.018 -0.011 -0.997 -0.042 12.6200 -0.1500 0.7300 31.3000 4.940 6.860 0.150 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Ile
+0.000020 8.790 0.018 -0.011 -0.997 -0.042 12.6200 -0.1500 0.7300 31.3000 4.940 6.860 0.150 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Leu
+0.000100 7.690 -0.036 0.007 -0.997 0.000 12.8800 -0.0900 0.7700 31.3000 4.800 6.660 0.110 -0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Val
+0.000002 8.050 0.132 0.004 -0.997 0.014 15.6200 -1.0900 0.0900 31.4000 3.140 4.360 0.620 -0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Trp
+0.001400 5.530 -0.013 0.143 -0.062 -0.998 0.1175 11.1700 10.9600 4.3751 7.506 3.993 -0.075 0.004 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Tyr
+0.000020 7.920 0.039 0.005 -0.997 0.002 13.6700 -0.0500 0.8100 31.3000 4.240 5.880 0.190 0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Ala
+0.004000 5.130 0.000 0.000 0.000 0.000 90.0000 -39.9000 50.6000 0.0100 0.001 0.000 0.000 0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gly Gly
+0.013480 5.828 -0.032 0.161 -0.997 0.084 0.2731 11.9626 11.5580 4.5258 3.356 6.309 0.134 0.075 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.61 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Cys
+0.005600 6.080 -0.032 0.240 -0.998 0.063 0.2100 10.4100 10.6400 4.4000 3.930 7.380 0.090 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Met
+0.000078 8.080 -0.019 0.146 -0.998 -0.056 0.1125 0.1100 5.9200 4.7000 3.430 6.450 0.160 0.210 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Phe
+0.018120 6.100 -0.008 0.232 -0.998 0.259 0.3550 10.4200 10.3000 4.5000 3.720 7.000 0.110 0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Ile
+0.018120 6.100 -0.008 0.232 -0.998 0.259 0.3550 10.4200 10.3000 4.5000 3.720 7.000 0.110 0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Leu
+0.020280 6.130 0.043 0.078 -0.553 0.012 0.3600 12.7700 11.6800 4.4000 3.620 6.800 0.120 0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Val
+0.000024 8.230 0.115 0.128 0.073 -0.998 0.1120 0.0400 6.8500 4.7000 6.780 3.610 0.090 0.300 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Trp
+0.009648 5.192 0.030 0.326 -0.997 0.249 0.0859 10.2929 14.4122 4.4484 3.827 7.194 0.037 0.068 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.48 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Tyr
+0.014760 5.570 0.042 0.176 -0.732 0.079 0.3500 11.9100 11.2500 4.5000 3.250 6.100 0.150 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Ala
+0.015080 5.400 0.045 -0.036 -0.669 -0.071 0.3500 11.7900 10.8400 4.6000 3.100 5.830 0.170 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Gly
+0.000688 7.762 0.048 0.048 -0.250 -0.250 0.3906 11.4382 9.2197 32.0969 6.086 6.086 0.142 0.142 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 1.61 184.04 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Thr Thr
+0.015776 5.424 0.024 0.177 -0.997 0.124 0.2647 12.1584 11.1709 4.5274 3.318 6.237 0.103 0.081 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.59 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Cys
+0.000480 7.040 -0.008 0.220 -0.998 0.061 0.1700 12.7200 12.4300 4.4000 3.770 7.080 0.010 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Met
+0.000060 7.910 -0.063 0.109 -0.998 -0.248 0.1100 0.0300 5.9500 4.7000 3.430 6.450 0.060 0.270 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Phe
+0.002000 6.990 0.003 0.199 -0.998 0.262 0.2900 12.6200 12.1800 4.5000 3.580 6.730 0.060 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Ile
+0.002000 6.990 0.003 0.199 -0.998 0.262 0.2900 12.6200 12.1800 4.5000 3.580 6.730 0.060 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Leu
+0.026800 5.730 0.092 0.082 -0.410 0.019 0.3525 12.3500 11.5600 4.5000 3.460 6.500 0.100 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Val
+0.000087 7.110 0.100 0.108 -0.041 -0.998 0.1000 0.1600 5.7473 4.7378 6.290 3.350 0.490 0.470 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Trp
+0.000112 7.362 -0.032 0.190 -0.997 0.030 0.0685 9.1227 14.8259 4.5192 3.679 6.916 -0.025 0.059 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 1.56 179.40 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Tyr
+0.016000 5.390 0.093 0.158 -0.554 -0.061 0.4400 11.7300 10.9400 4.6000 3.070 5.770 0.140 0.110 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Ala
+0.024400 4.970 0.109 -0.032 -0.545 -0.079 0.3700 11.6600 10.5500 4.6000 2.980 5.600 0.160 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Gly
+0.010352 5.840 -0.001 0.131 -0.997 0.067 0.2772 12.0542 11.2851 4.5199 3.342 6.282 0.101 0.137 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.42 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Thr
+0.000528 7.070 0.068 0.068 -0.324 -0.324 0.3661 10.8060 8.7194 32.1058 5.522 5.522 0.134 0.134 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 2.30 184.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ser Ser
+0.010052 5.703 0.257 -0.013 0.249 -0.997 0.1875 12.1825 12.1306 4.4446 6.843 3.640 0.033 0.014 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.42 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Cys
+0.000400 7.400 0.044 0.201 -0.998 0.217 0.2000 11.4100 10.8600 4.2000 4.420 8.310 -0.000 -0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Met
+0.000093 7.683 0.086 0.148 -0.998 -0.042 0.1150 7.8500 11.6600 4.4000 4.090 7.700 0.020 0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Phe
+0.007320 6.360 0.105 0.218 -0.998 0.336 0.3100 11.0100 10.6000 4.4000 4.010 7.530 0.070 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Ile
+0.007320 6.360 0.105 0.218 -0.998 0.336 0.3100 11.0100 10.6000 4.4000 4.010 7.530 0.070 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Leu
+0.000800 7.690 0.069 0.081 -0.998 0.109 0.3500 10.7100 10.2600 4.5000 3.750 7.050 0.090 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Val
+0.000288 6.720 0.255 0.109 0.289 -0.998 0.1750 12.8300 10.9800 3.8000 9.900 5.270 -0.100 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Trp
+0.000180 7.336 0.186 0.037 0.044 -0.997 0.1452 14.4248 13.2877 4.0013 8.985 4.780 -0.051 -0.081 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.013 179.48 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Tyr
+0.003600 6.010 0.074 0.154 -0.998 0.109 0.2450 12.5600 11.6400 4.4300 3.640 6.850 0.060 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Ala
+0.003360 5.790 0.113 -0.112 -0.755 -0.409 0.2200 12.4000 11.2600 4.5000 3.460 6.500 0.150 0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Gly
+0.015524 5.754 0.278 -0.027 0.265 -0.997 0.2006 12.2612 11.9510 4.4501 6.780 3.610 0.121 0.125 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.51 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Thr
+0.009616 5.714 0.231 -0.015 0.182 -0.997 0.1950 12.1742 11.8768 4.4644 3.563 6.797 0.049 0.053 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.30 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Ser
+0.000697 7.245 0.118 0.118 -0.228 -0.228 0.2061 12.2797 11.0383 32.0897 6.725 6.725 0.060 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.014 183.35 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Gln Gln
+0.006096 5.806 0.164 -0.009 -0.039 -0.997 0.1973 12.1786 11.7390 4.4732 6.628 3.526 0.094 0.063 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.424 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Cys
+0.007708 5.605 0.043 0.296 -0.998 0.285 0.1800 10.5948 10.7968 4.3661 4.070 7.660 0.000 0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Met
+0.000106 7.428 0.014 0.158 -0.998 -0.051 0.1175 0.2640 6.2841 4.6946 3.510 6.600 0.055 0.198 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Phe
+0.011252 6.000 0.041 0.216 -0.998 0.217 0.2500 12.2800 12.4400 4.4000 3.666 6.874 0.086 0.061 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Ile
+0.011252 6.000 0.041 0.216 -0.998 0.217 0.2500 12.2800 12.4400 4.4000 3.666 6.874 0.086 0.061 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Leu
+0.006752 6.267 0.037 0.089 -0.998 0.058 0.2850 12.9700 11.8700 4.4000 3.720 6.980 0.120 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Val
+0.000143 7.175 0.117 0.082 0.035 -0.998 0.1450 12.6300 11.2200 3.9000 9.850 5.240 -0.050 -0.200 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Trp
+0.003332 5.556 0.192 0.106 0.140 -0.997 0.1008 11.2155 14.0582 4.3836 7.448 3.962 0.009 -0.002 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.35 179.43 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Tyr
+0.009459 5.433 0.123 0.148 -0.495 -0.052 0.2551 11.9224 11.4828 4.5211 3.356 6.309 0.127 0.024 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Ala
+0.009383 5.171 0.120 -0.062 -0.474 -0.218 0.2150 12.4599 10.8459 4.5009 3.365 6.326 0.163 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Gly
+0.011308 5.747 0.195 -0.019 0.081 -0.997 0.2110 11.9417 11.8032 4.4950 6.518 3.467 0.116 0.128 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.40 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Thr
+0.007644 5.648 0.184 0.006 0.031 -0.997 0.2223 12.1536 11.4410 4.4967 6.448 3.430 0.130 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.31 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Ser
+0.006264 5.872 0.022 0.231 -0.997 0.136 0.1547 11.3067 12.8547 4.828 3.597 6.762 0.085 0.066 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.016 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Gln
+0.000215 7.676 0.079 0.079 -0.270 -0.270 0.3700 2.9643 4.5246 32.1181 5.584 5.584 0.108 0.108 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.021 183.35 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asn Asn
+0.000090 7.820 0.033 0.126 -0.998 0.130 0.3700 12.4900 11.4300 4.5000 3.460 6.510 0.010 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 2.860000 1.14 2.08 0.00 1.15 0.00 0.69 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Cys
+0.006550 6.004 -0.311 0.205 -0.998 0.011 2.4000 1.1648 1.9383 13.5638 4.412 7.954 -0.250 0.150 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 2.80 3.52 0.00 0.00 0.00 1.26 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Met
+0.003800 6.250 -0.422 0.150 -0.998 -0.300 2.4600 0.0900 1.3900 13.6000 4.060 7.320 -0.230 0.260 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 2.07 2.72 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Phe
+0.001900 7.340 -0.150 0.195 -0.998 0.348 2.6200 1.6200 2.3200 13.6000 4.190 7.550 0.350 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 2.76 3.49 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Ile
+0.001900 7.340 -0.150 0.195 -0.998 0.348 2.6200 1.6200 2.3200 13.6000 4.190 7.550 0.350 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 2.76 3.49 0.00 0.00 0.00 1.29 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Leu
+0.000470 8.250 -0.117 0.079 -0.998 0.148 2.5000 1.8500 2.4300 13.6000 4.070 7.330 -0.080 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 1.86 2.96 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Val
+0.003250 5.950 -0.587 0.202 -0.998 -0.335 1.6500 0.1000 1.5500 13.7000 4.130 7.440 -0.290 0.290 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 1.45 2.63 0.00 0.00 0.00 1.16 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Trp
+0.000068 7.844 -0.048 0.165 -0.998 -0.014 0.0568 6.4976 15.7526 4.6377 3.459 6.502 -0.069 0.290 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 2.753050 1.01 2.01 -0.045 1.07 0.00 0.07 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Tyr
+0.000960 7.010 -0.149 0.139 -0.998 0.184 2.5500 1.4600 2.1500 13.6000 3.790 6.830 -0.130 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 1.68 2.70 0.00 0.00 0.00 0.98 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Ala
+0.000760 6.830 -0.140 -0.031 -0.998 -0.110 2.7000 1.4300 1.9500 13.6000 3.540 6.390 -0.050 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.0000 0.000000 1.60 2.65 0.00 0.00 0.00 0.82 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Gly
+0.000210 7.520 0.042 0.098 -0.998 0.129 0.2900 12.6400 11.5200 4.5000 3.550 6.670 0.040 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 2.960000 0.93 1.96 0.01 1.12 0.00 0.08 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Thr
+0.000270 6.910 0.050 0.098 -0.998 -0.026 0.2600 12.5900 11.0500 4.5000 3.410 6.420 0.110 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 3.370000 0.96 1.98 5.29 1.24 0.00 0.09 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Ser
+0.000150 7.510 0.035 0.195 -0.998 0.187 0.2500 13.1800 11.6900 4.4000 3.820 7.180 -0.010 0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 2.820000 1.05 2.03 0.00 1.19 0.00 0.18 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Gln
+0.002240 5.760 0.072 0.211 -0.998 0.162 0.2500 12.3600 11.7800 4.5000 3.570 6.720 -0.040 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.0100 2.960000 1.04 2.02 0.01 1.16 0.00 0.63 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Glu Asn
+0.000002 5.543 -0.991 -0.991 -0.990 -0.990 1.3764 2.6088 5.6220 1.3378 4.376 4.376 0.077 0.077 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.50 0.00 0.60 0.60 0.0166 4.917740 0.34 0.34 0.00 0.00 0.00 0.88 0.88 -2.6781 1.7077 2.6394 1.9437 8.025 0.000 1.00 0 Glu Glu
+0.002000 5.940 -0.019 0.151 -0.998 0.067 0.3800 12.2300 11.0100 4.5000 3.260 6.130 0.100 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 3.600000 2.96 3.97 0.13 0.99 0.00 0.86 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Cys
+0.007600 5.530 -0.594 0.266 -0.998 -0.224 2.3150 0.0300 1.3700 13.7000 3.630 6.540 -0.110 0.340 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 2.53 3.29 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Met
+0.003590 6.230 -0.445 0.162 -0.998 -0.255 1.9500 0.1500 1.5700 13.7000 3.810 6.860 -0.070 0.310 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 2.08 2.99 0.00 0.00 0.00 1.25 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Phe
+0.011110 6.150 -0.232 0.249 -0.998 0.356 2.5000 0.0000 1.4900 13.7000 3.580 6.450 -0.050 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 2.68 3.54 0.00 0.00 0.00 1.30 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Ile
+0.011110 6.150 -0.232 0.249 -0.998 0.356 2.5000 0.0000 1.4900 13.7000 3.580 6.450 -0.050 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 2.68 3.54 0.00 0.00 0.00 1.30 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Leu
+0.001800 7.270 -0.152 0.069 -0.998 0.084 2.6500 1.9100 2.4600 13.6000 3.880 6.990 0.010 0.080 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 0.42 2.19 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Val
+0.000100 6.890 -0.556 0.100 -0.599 -0.998 1.8500 0.0300 1.3500 13.7000 7.210 4.000 -0.150 0.370 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 0.56 2.36 0.00 0.00 0.00 1.11 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Trp
+0.000019 8.712 -0.089 0.140 -0.998 -0.108 0.0369 1.1387 16.2194 4.8019 3.053 5.740 0.132 0.549 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 4.683640 3.02 4.02 -0.039 0.9107 0.00 0.06 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Tyr
+0.000640 7.240 -0.166 0.136 -0.998 0.102 2.6000 1.6500 2.2700 13.7000 3.540 6.380 0.010 0.110 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 2.16 3.14 0.00 0.00 0.00 1.02 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Ala
+0.000560 6.950 -0.138 -0.017 -0.998 -0.047 2.7000 1.6200 2.1200 13.7000 3.320 5.980 0.060 0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 0.29 2.29 0.00 0.00 0.00 0.75 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Gly
+0.003760 5.730 -0.054 0.189 -0.998 0.123 0.2500 13.0500 11.2200 4.5000 3.490 6.880 0.080 0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 3.180000 3.05 3.82 1.69 1.18 0.00 0.10 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Thr
+0.000090 7.650 -0.019 0.123 -0.998 0.039 0.3400 12.4100 10.9500 4.5000 3.290 6.180 0.100 0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 2.810000 2.25 3.47 0.00 0.97 0.00 0.75 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Ser
+0.002110 5.890 -0.026 0.246 -0.998 0.156 0.2200 12.4800 11.4700 4.5000 3.520 6.610 0.030 0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.30 0.00 0.50 0.00 0.0100 4.070000 3.04 4.03 0.10 1.00 0.00 0.32 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Gln
+0.002910 5.530 0.030 0.199 -0.998 0.091 0.2300 12.0100 11.1100 4.5000 3.290 6.180 0.120 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 2.900000 2.05 3.03 0.16 1.08 0.00 0.35 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Asp Asn
+0.917580 3.967 0.083 0.059 0.992 0.395 2.3800 0.9900 1.6900 13.7000 3.500 6.300 0.480 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.50 0.00 0.50 0.60 0.0001 4.990000 4.37 0.68 0.00 0.00 0.00 0.04 0.64 79.7000 51.2000 34.5000 4.6000 0.610 0.690 1.00 0 Asp Glu
+0.000002 5.549 -0.279 -0.279 -0.990 -0.990 0.0300 -156.3600 15.7600 13.0000 4.440 4.440 0.070 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.50 0.00 0.50 0.50 0.0009 5.000000 0.34 0.34 0.00 0.00 0.00 0.94 0.94 13.2341 -1.0427 0.0983 33.2754 9.290 0.000 1.00 0 Asp Asp
+0.005160 5.560 0.216 0.002 0.024 -0.997 0.1350 6.9300 9.7000 4.6000 6.780 3.610 0.130 0.003 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.43 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Cys
+0.003400 5.670 0.081 0.294 -0.998 0.160 0.1175 11.9600 13.7300 4.3200 4.090 7.700 -0.090 -0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Met
+0.004080 5.550 0.100 0.299 -0.998 0.325 0.1400 10.5400 11.5200 4.3000 4.410 8.280 -0.150 -0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Phe
+0.004880 6.160 0.070 0.230 -0.998 0.209 0.1725 12.0700 13.2900 4.4000 3.960 7.430 0.020 -0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Ile
+0.004880 6.160 0.070 0.230 -0.998 0.209 0.1725 12.0700 13.2900 4.4000 3.960 7.430 0.020 -0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Leu
+0.000376 7.810 0.045 0.068 -0.998 0.034 0.2100 13.2400 12.2400 4.3000 4.030 7.570 0.050 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Val
+0.000360 7.000 0.168 0.073 0.190 -0.998 0.2400 10.4400 11.0000 4.3000 7.940 4.220 -0.360 -0.260 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Trp
+0.005976 5.487 0.244 0.115 0.291 -0.997 0.1560 12.4536 13.3776 4.3034 7.721 4.107 -0.175 -0.119 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.43 179.43 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Tyr
+0.003216 5.682 0.089 0.150 -0.998 0.072 0.1450 11.8531 12.1434 4.4212 3.775 7.096 0.129 -0.065 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Ala
+0.000056 7.620 0.055 -0.036 -0.998 -0.147 0.1350 6.7100 9.4100 4.7000 3.100 5.840 0.210 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Gly
+0.330940 4.205 0.439 0.092 0.886 -0.997 0.0246 -0.1247 17.0179 4.7732 6.062 3.225 0.335 0.096 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 1.88 179.43 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Thr
+0.000328 7.070 0.152 -0.026 0.002 -0.997 0.1238 11.8770 12.6687 4.4350 3.714 6.982 0.038 0.028 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.37 179.42 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Ser
+0.005392 5.709 0.204 0.108 0.130 -0.997 0.1300 11.7871 13.4240 4.3840 7.352 3.910 -0.013 0.013 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.36 179.43 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Gln
+0.000428 6.873 0.164 0.027 0.025 -0.997 0.1008 5.2468 10.7848 4.6802 6.349 3.477 0.140 0.111 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 -0.017 179.45 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Asn
+0.000090 7.800 0.005 0.160 -0.998 0.080 0.2100 13.5300 11.8900 4.3000 4.010 7.540 -0.100 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.00 0.60 0.0100 2.570000 1.15 2.08 0.00 1.07 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Glu
+0.000090 7.670 -0.043 0.153 -0.998 0.017 0.1800 12.8100 11.4700 4.4000 3.660 6.870 0.040 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.00 0.50 0.0100 2.610000 1.09 2.05 0.00 1.08 0.00 0.03 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His Asp
+0.000774 6.590 0.140 0.140 -0.155 -0.155 0.1475 13.9418 11.2867 32.0631 8.023 8.023 -0.033 -0.033 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.088 183.37 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 His His
+0.000266 6.268 0.149 0.144 -0.998 0.138 0.1314 13.1833 12.5436 4.2357 4.222 7.937 0.051 -0.110 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 2.905420 1.02 2.01 -0.047 1.38 0.00 0.14 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Cys
+0.000080 7.830 -0.131 0.130 -0.998 -0.346 2.4000 0.3700 1.1600 13.4000 5.360 9.660 -0.110 -0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 4.28 4.87 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Met
+0.000060 7.502 0.105 0.161 -0.998 0.244 2.5900 0.4000 1.3100 13.5000 4.503 8.119 -0.084 -0.076 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.53 2.18 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Phe
+0.000290 7.740 0.112 0.143 -0.998 0.355 2.3300 0.8200 1.5000 13.5000 5.160 9.300 0.020 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.53 2.18 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Ile
+0.000290 7.740 0.112 0.143 -0.998 0.355 2.3300 0.8200 1.5000 13.5000 5.160 9.300 0.020 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.53 2.18 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Leu
+0.000220 7.818 0.162 0.068 -0.998 0.115 2.4700 0.7000 1.4900 13.6000 4.460 8.040 0.163 -0.018 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.53 2.18 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Val
+0.000049 7.006 0.151 0.023 -0.001 -0.998 2.7300 1.1100 1.9300 13.6000 7.510 4.160 0.057 -0.074 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 5.02 4.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Trp
+0.000100 6.420 0.154 0.087 -0.998 0.060 0.2400 12.0400 12.6500 4.3000 3.950 7.430 0.040 -0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 3.280000 1.01 2.00 0.09 3.42 0.00 0.02 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Tyr
+0.000260 6.863 0.122 0.083 -0.998 0.396 2.2500 0.2500 1.1000 13.5000 4.780 8.610 0.030 -0.220 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.28 2.13 0.00 0.00 0.00 0.59 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Ala
+0.000075 7.150 0.141 -0.060 -0.998 -0.259 2.1500 0.1500 1.0200 13.6000 4.150 7.480 0.180 -0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.0000 0.000000 0.39 2.15 0.00 0.00 0.00 0.59 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Gly
+0.000058 7.383 0.129 0.109 -0.998 0.077 0.4945 3.4266 4.1466 1.6660 3.906 7.343 0.096 0.025 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 2.928930 0.53 2.18 0.0001 1.36 0.00 0.20 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Thr
+0.000141 6.477 0.145 0.152 -0.998 0.172 0.1312 12.5793 12.5274 4.3168 4.021 7.559 0.043 -0.176 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 2.829920 1.02 2.01 -0.024 1.45 0.00 0.16 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Ser
+0.000230 6.640 0.106 0.227 -0.998 0.340 0.1600 13.5100 12.6900 4.2000 4.390 8.250 0.030 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 3.100000 1.01 2.01 0.00 1.58 0.00 0.10 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Gln
+0.000059 7.222 0.010 0.146 -0.998 0.163 2.5624 0.0021 1.0296 13.5889 4.379 7.186 0.130 -0.052 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 2.866620 0.54 2.18 0.03 1.32 0.00 0.42 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg Asn
+0.080000 4.170 -0.279 0.227 0.000 0.000 5.6100 -0.1800 0.7600 13.2100 3.290 6.000 0.430 -0.990 4 1.24 0.47 1.00 1.00 0.10 2.27 0.50 1.84 0.03 0.83 0.0100 5.740000 3.34 2.51 0.00 0.00 39.77 1.55 1.34 0.1500 0.1500 0.1500 16.3800 4.000 7.790 2.28 0 Arg Glu
+0.010000 3.517 0.050 -0.924 0.000 0.000 3.6900 -0.4100 0.8800 13.6000 5.860 3.220 0.660 0.050 4 1.16 0.18 1.00 1.00 0.14 1.40 0.20 2.35 0.53 0.13 0.0100 5.537210 3.72 2.00 0.00 0.00 18.31 1.50 1.62 1.0000 1.0000 1.0000 34.0100 8.287 4.000 2.32 0 Arg Asp
+0.000210 6.210 0.134 0.215 -0.998 0.320 0.1300 13.6300 12.6500 4.1000 4.450 8.360 0.030 -0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.30 0.00 0.0100 3.030000 1.01 2.00 0.00 1.75 0.00 0.04 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Arg His
+0.000022 7.578 0.146 0.146 -0.107 -0.107 0.3600 7.8000 7.9600 33.0000 6.470 0.000 0.170 0.170 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.80 0.00 0.30 0.30 0.0100 3.180000 0.41 0.41 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 87.6000 0.7301 0.4193 21.2000 1.210 0.000 1.00 0 Arg Arg
+0.001410 6.110 0.119 0.163 -0.998 0.230 0.1100 11.3400 12.6400 4.5000 3.580 6.720 -0.150 -0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 2.950000 0.98 1.99 0.04 1.16 0.00 0.40 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Cys
+0.150000 4.810 -0.206 -0.152 -0.998 -0.566 2.3000 0.5100 1.3000 13.4000 10.260 5.730 -1.000 -0.660 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 2.41 0.17 0.00 0.00 0.00 0.94 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Met
+0.000045 7.980 0.002 0.125 -0.998 0.067 2.7000 0.2000 1.0800 13.4000 4.880 8.800 -0.330 -0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.16 2.12 0.00 0.00 0.00 0.71 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Phe
+0.009900 6.219 -0.072 0.206 -0.998 0.353 2.4863 0.1000 1.3347 13.6170 3.920 7.068 -0.160 0.028 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.56 2.18 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Ile
+0.009900 6.219 -0.072 0.206 -0.998 0.353 2.4863 0.1000 1.3347 13.6170 3.920 7.068 -0.160 0.028 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.56 2.18 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Leu
+0.005015 6.461 -0.030 -0.062 -0.998 0.096 2.7200 0.1000 1.3300 13.6000 3.900 7.030 -0.090 0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.50 2.17 0.00 0.00 0.00 1.03 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Val
+0.253010 3.820 0.150 0.296 -0.998 0.997 3.2000 0.3100 1.2900 13.6000 3.830 6.910 -1.000 -0.140 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 4.46 5.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Trp
+0.000040 7.140 0.131 0.202 -0.998 0.223 0.2000 13.2200 12.8900 4.2000 4.300 8.080 -0.250 0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 3.070000 1.00 1.20 1.10 1.72 0.00 0.04 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Tyr
+0.000450 7.300 -0.080 0.120 -0.998 0.263 2.6250 0.7100 1.5400 13.6000 4.070 7.340 -0.170 -0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.37 2.14 0.00 0.00 0.00 0.88 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Ala
+0.000270 7.141 -0.065 -0.057 -0.998 -0.161 2.5000 0.7400 1.4800 13.6000 3.773 6.801 -0.033 0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.00 0.0000 0.000000 0.22 2.12 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Gly
+0.023936 5.047 0.047 -0.052 -0.419 -0.998 0.0917 4.3851 15.5174 4.7736 5.724 3.045 -0.997 -0.033 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 2.976480 3.45 3.84 -0.147 1.63 0.00 1.03 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Thr
+0.000042 7.558 0.112 0.147 -0.998 0.139 0.0849 7.9696 14.3032 4.6636 3.225 6.068 0.070 -0.001 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 3.145200 0.92 1.96 1.15 1.37 0.00 0.64 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Ser
+0.000040 8.120 0.097 0.149 -0.998 0.225 0.1100 11.3600 13.1300 4.4000 3.730 7.010 -0.070 -0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 2.780000 1.40 2.23 3.29 1.23 0.00 0.72 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Gln
+0.000060 7.640 0.122 0.151 -0.998 0.182 0.1400 11.8600 12.4900 4.4000 3.840 7.210 -0.050 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 3.460000 4.83 5.09 3.02 2.50 0.00 1.16 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys Asn
+0.010000 5.489 0.200 -0.859 0.000 0.000 5.7400 -0.0300 0.9700 13.0400 6.790 3.730 0.230 0.010 4 0.20 1.41 1.00 1.00 0.20 2.25 1.30 2.25 0.13 1.13 0.0100 4.600000 3.43 2.00 0.00 0.00 43.61 1.72 1.80 0.0332 1.0000 1.0000 15.0452 3.350 4.000 5.99 0 Lys Glu
+0.010000 5.143 0.131 0.071 0.000 0.000 2.8500 0.4800 1.6100 13.7000 5.680 3.150 -1.000 0.200 4 0.04 1.16 1.00 1.00 0.20 1.93 1.24 2.20 0.13 0.26 0.0100 4.150000 3.66 2.00 0.00 0.00 26.41 1.34 1.99 0.0398 1.0000 1.0000 14.6000 5.279 4.000 8.92 0 Lys Asp
+0.000056 7.189 0.132 0.139 -0.998 0.039 0.1139 13.4212 12.6255 4.2295 4.250 7.990 -0.119 0.058 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.60 0.00 0.70 0.00 0.0100 3.171840 0.98 1.99 2.76 1.34 0.00 0.075 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Lys His
+0.431851 3.889 0.036 0.352 0.998 0.625 0.8968 0.0685 1.4970 13.7330 4.284 7.724 0.058 0.077 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.80 0.00 0.70 0.30 0.0070 3.295780 4.34 0.47 0.00 0.00 0.00 0.016 0.041 79.6633 0.6422 0.4326 4.5546 0.690 0.774 1.00 0 Lys Arg
+0.000542 5.582 0.397 0.397 0.257 0.257 0.3000 -0.5100 10.2600 33.0000 5.129 5.129 -0.160 -0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.70 0.70 0.0001 3.000000 2.11 2.11 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 87.6000 64.0000 36.7000 21.2000 2.510 0.000 1.00 0 Lys Lys
+0.012840 5.650 0.188 0.065 0.121 -0.670 0.3100 12.0700 11.6700 4.5000 6.440 3.430 0.089 0.061 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Cys
+0.704308 4.079 0.343 0.456 0.464 -0.390 1.5888 1.7915 2.0459 31.6076 5.462 7.583 0.204 0.138 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Met
+0.056000 4.810 0.476 0.462 0.955 0.408 3.0600 0.2200 0.9900 32.9000 6.360 8.010 0.090 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Phe
+0.022467 5.934 0.219 0.216 0.181 0.556 12.1155 -0.1817 0.7221 31.2463 5.457 7.579 0.119 0.001 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Ile
+0.022467 5.934 0.219 0.216 0.181 0.556 12.1155 -0.1817 0.7221 31.2463 5.457 7.579 0.119 0.001 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Leu
+0.373600 4.730 0.407 0.079 0.663 -0.564 1.8900 2.9400 2.8800 33.1000 5.160 7.160 0.210 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Val
+0.062836 4.579 0.534 0.500 0.507 0.998 7.4018 -0.3757 0.6282 9.6398 7.830 4.610 0.092 0.019 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Trp
+0.002120 6.040 0.163 0.120 0.128 -0.998 0.1850 10.7400 11.1900 4.3000 8.030 4.270 -0.052 -0.073 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Tyr
+0.020800 5.364 0.127 0.127 -0.390 0.318 5.76770 0.4129 1.0912 31.2598 5.085 7.060 0.044 0.385 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Ala
+0.000040 7.830 0.030 -0.008 -0.997 -0.042 13.2100 -0.1400 0.7500 31.3000 4.560 6.330 0.180 -0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Gly
+0.017800 5.780 0.196 0.036 0.185 -0.813 0.3300 12.4200 11.5200 4.5000 6.550 3.480 0.100 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Thr
+0.019200 5.462 0.192 0.089 0.115 -0.581 0.3500 12.4300 11.1400 4.5000 6.330 3.370 0.110 0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Ser
+0.004400 6.180 0.172 0.101 0.214 -0.998 0.2300 12.1000 12.4300 4.5000 3.610 6.800 0.100 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Gln
+0.008869 5.727 0.102 0.153 -0.607 0.025 0.2550 12.9010 11.5140 4.4149 3.660 6.890 0.120 0.050 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Asn
+0.002180 6.839 0.154 -0.157 0.202 -0.998 2.6700 1.5700 2.2200 13.6000 7.106 3.942 0.084 -0.120 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.60 0.0000 0.000000 2.93 2.03 0.00 0.00 0.00 0.00 1.09 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Glu
+0.001150 7.132 0.143 -0.171 0.134 -0.998 2.7500 1.7000 2.2300 13.6000 6.812 3.778 0.105 -0.006 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.50 0.0000 0.000000 2.29 0.79 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Asp
+0.000270 7.490 0.113 0.046 0.012 -0.998 0.2150 10.2300 10.6900 4.4000 7.250 3.860 -0.005 0.088 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro His
+0.000150 7.600 0.137 0.141 0.314 -0.998 2.5500 0.5100 1.3300 13.6000 8.000 4.440 -0.080 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.30 0.0000 0.000000 2.18 0.52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Arg
+0.000816 7.265 0.251 0.124 -0.143 -0.998 2.6400 0.7700 1.6200 13.5822 7.608 4.220 -0.002 -0.143 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.70 0.0000 0.000000 2.12 0.26 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Lys
+0.010200 4.710 0.349 0.349 0.535 0.535 49.9300 -0.5300 0.4670 5.7100 7.810 7.810 0.170 0.170 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Pro Pro
+0.006280 5.701 0.286 0.003 0.207 -0.998 0.1875 10.4300 10.8900 4.4000 7.570 4.030 0.043 -0.039 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Cys
+0.222400 4.390 0.587 0.587 0.892 0.892 9.1300 -0.2700 0.6570 33.0700 9.590 0.000 0.210 0.210 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Met
+0.003194 6.010 0.374 0.370 -0.487 0.078 0.2127 12.9137 11.7580 4.5435 7.777 3.784 0.279 0.172 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Phe
+0.010800 5.450 0.464 0.444 0.960 0.419 13.5000 -0.2200 0.6900 32.7000 7.040 6.900 0.210 0.270 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Ile
+0.043412 5.454 0.444 0.464 0.419 0.960 13.4913 -0.2275 0.6761 32.7382 6.897 7.040 0.267 0.213 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Leu
+0.067200 5.210 0.253 0.586 0.531 0.969 4.5500 1.4100 2.1100 11.0000 6.420 4.630 -0.070 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Val
+0.007200 5.460 0.411 0.481 0.191 -0.505 0.2072 12.7699 12.4181 4.4804 3.970 8.160 0.150 0.220 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Trp
+0.000140 7.130 0.203 0.062 0.074 -0.998 0.2000 12.8000 11.0300 3.9000 9.810 5.220 -0.070 -0.200 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Tyr
+0.029696 4.997 0.383 0.377 0.386 0.821 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 7.464 5.388 0.831 0.099 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Ala
+0.000002 9.490 -0.006 0.124 -0.085 -0.997 12.1500 -0.3600 0.5900 31.3000 7.160 5.160 -0.120 0.230 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Gly
+0.005600 6.080 0.240 -0.032 0.063 -0.998 0.2100 10.4100 10.6400 4.4000 7.380 3.930 0.080 0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Thr
+0.000480 7.040 0.220 -0.008 0.061 -0.998 0.1700 12.7200 12.4300 4.4000 7.080 3.770 0.080 0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Ser
+0.000400 7.400 0.201 0.044 0.217 -0.998 0.2000 11.4100 10.8600 4.2000 8.310 4.420 -0.050 -0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Gln
+0.007708 5.605 0.296 0.043 0.285 -0.998 0.1800 10.5948 10.7968 4.3661 7.660 4.070 0.000 0.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Asn
+0.006550 6.004 0.205 -0.311 0.011 -0.998 2.4000 1.1648 1.9383 13.5638 7.954 4.412 0.150 -0.250 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.0000 0.000000 3.52 2.80 0.00 0.00 0.00 0.00 1.26 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Glu
+0.007600 5.530 0.266 -0.594 -0.224 -0.998 2.3150 0.0300 1.3700 13.7000 6.540 3.630 0.340 -0.110 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.0000 0.000000 3.29 2.53 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Asp
+0.003400 5.670 0.294 0.081 0.160 -0.998 0.1175 11.9600 13.7300 4.3200 7.700 4.090 -0.040 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met His
+0.000080 7.830 0.130 -0.131 -0.346 -0.998 2.4000 0.3700 1.1600 13.4000 9.660 5.360 -0.050 -0.110 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.0000 0.000000 4.87 4.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Arg
+0.150000 4.810 -0.152 -0.206 -0.566 -0.998 2.3000 0.5100 1.3000 13.4000 5.730 10.260 -0.660 -1.000 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.0000 0.000000 0.17 2.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Lys
+0.704308 4.079 0.456 0.343 -0.390 0.464 1.5888 1.7915 2.0459 31.6076 7.583 5.462 0.138 0.204 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Pro
+0.222400 4.390 0.587 0.587 0.892 0.892 9.1300 -0.2700 0.6570 33.0700 9.590 0.000 0.210 0.210 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Met Met
+0.000080 7.550 0.167 -0.011 -0.036 -0.998 0.1100 0.1380 6.2041 4.6801 6.670 3.550 0.203 0.027 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Cys
+0.003194 6.010 0.370 0.374 0.078 -0.487 0.2127 12.9137 11.7580 4.5435 3.784 7.777 0.172 0.279 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Met
+0.235600 4.760 0.581 0.581 0.914 0.914 0.8380 2.8800 2.8400 33.0900 10.830 0.000 0.157 0.157 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Phe
+0.000600 6.790 0.279 0.346 0.371 -0.372 0.2700 13.2400 11.8100 4.5000 3.890 8.000 0.130 0.250 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Ile
+0.002156 6.778 0.346 0.278 -0.372 0.371 0.2682 13.2550 11.8186 4.4958 8.000 3.893 0.254 0.128 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Leu
+0.007200 6.020 0.414 0.308 0.314 0.734 0.3300 8.3600 7.5100 3.8000 8.040 4.280 0.200 0.040 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Val
+0.179176 4.690 0.664 0.589 0.993 0.849 0.1885 13.8793 12.6256 4.2956 4.389 9.020 0.349 0.167 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Trp
+0.000116 8.160 0.129 0.015 0.056 -0.998 0.1625 15.3200 13.7100 3.8000 9.830 5.230 -0.360 -0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Tyr
+0.000272 7.170 0.206 0.142 -0.750 -0.006 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 7.330 3.899 0.092 0.074 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Ala
+0.000010 6.930 0.033 0.423 0.225 -0.997 15.3800 -1.3100 -0.0500 31.4000 4.620 3.330 -0.040 0.530 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Gly
+0.000078 8.080 0.146 -0.019 -0.056 -0.998 0.1125 0.1100 5.9200 4.7000 6.450 3.430 0.210 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Thr
+0.000060 7.910 0.109 -0.063 -0.248 -0.998 0.1100 0.0300 5.9500 4.7000 6.450 3.430 0.270 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Ser
+0.000093 7.683 0.148 0.086 -0.042 -0.998 0.1150 7.8500 11.6600 4.4000 7.700 4.090 0.090 0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Gln
+0.000106 7.428 0.158 0.014 -0.051 -0.998 0.1175 0.2640 6.2841 4.6946 6.600 3.510 0.198 0.055 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Asn
+0.003800 6.250 0.150 -0.422 -0.300 -0.998 2.4600 0.0900 1.3900 13.6000 7.320 4.060 0.260 -0.230 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.0000 0.000000 2.72 2.07 0.00 0.00 0.00 0.00 1.24 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Glu
+0.003590 6.230 0.162 -0.445 -0.255 -0.998 1.9500 0.1500 1.5700 13.7000 6.860 3.810 0.310 -0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.0000 0.000000 2.99 2.08 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Asp
+0.004080 5.550 0.299 0.100 0.325 -0.998 0.1400 10.5400 11.5200 4.3000 8.280 4.410 -0.000 -0.150 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe His
+0.000060 7.502 0.161 0.105 0.244 -0.998 2.5900 0.4000 1.3100 13.5000 8.119 4.503 -0.076 -0.084 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.0000 0.000000 2.18 0.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Arg
+0.000045 7.980 0.125 0.002 0.067 -0.998 2.7000 0.2000 1.0800 13.4000 8.800 4.880 -0.130 -0.330 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.0000 0.000000 2.12 0.16 0.00 0.00 0.00 0.00 0.71 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Lys
+0.056000 4.810 0.462 0.476 0.408 0.955 3.0600 0.2200 0.9900 32.9000 8.010 6.360 0.040 0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Pro
+0.003194 6.010 0.370 0.374 0.078 -0.487 0.2127 12.9137 11.7580 4.5435 3.784 7.777 0.172 0.279 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Met
+0.235600 4.760 0.581 0.581 0.914 0.914 0.8380 2.8800 2.8400 33.0900 10.830 0.000 0.157 0.157 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Phe Phe
+0.008364 5.626 0.013 0.186 -0.998 0.118 0.3450 11.8400 11.0800 4.6000 3.240 6.080 0.090 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Cys
+0.029696 4.997 0.377 0.383 0.821 0.386 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 5.388 7.464 0.099 0.831 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Met
+0.000272 7.170 0.142 0.206 -0.006 -0.750 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 3.899 7.330 0.074 0.092 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Phe
+0.001472 7.202 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.341 7.415 0.096 0.126 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ile
+0.000400 7.200 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.340 7.410 0.100 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Leu
+0.002052 7.006 0.317 0.111 0.869 0.121 9.3652 0.2400 0.9894 32.0718 7.046 5.075 0.066 0.081 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Val
+0.000236 7.034 0.103 0.324 -0.290 -0.096 0.1648 13.1732 11.7606 4.4984 3.898 8.010 0.084 -0.175 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Trp
+0.000165 7.120 0.100 0.099 0.023 -0.998 0.1400 13.1600 12.7400 4.2000 8.010 4.260 -0.100 -0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Tyr
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+0.000020 7.920 0.005 0.039 0.002 -0.997 13.6700 -0.0500 0.8100 31.3000 5.880 4.240 0.010 0.190 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Gly
+0.014760 5.570 0.176 0.042 0.079 -0.732 0.3500 11.9100 11.2500 4.5000 6.100 3.250 0.070 0.150 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Thr
+0.016000 5.390 0.158 0.093 -0.061 -0.554 0.4400 11.7300 10.9400 4.6000 5.770 3.070 0.110 0.140 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ser
+0.003600 6.010 0.154 0.074 0.109 -0.998 0.2450 12.5600 11.6400 4.4300 6.850 3.640 -0.010 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Gln
+0.009459 5.433 0.148 0.123 -0.052 -0.495 0.2551 11.9224 11.4828 4.5211 6.309 3.356 0.024 0.127 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Asn
+0.000960 7.010 0.139 -0.149 0.184 -0.998 2.5500 1.4600 2.1500 13.6000 6.830 3.790 0.060 -0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.0000 0.000000 2.70 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Glu
+0.000640 7.240 0.136 -0.166 0.102 -0.998 2.6000 1.6500 2.2700 13.7000 6.380 3.540 0.110 0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.0000 0.000000 3.14 2.16 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Asp
+0.003216 5.682 0.150 0.089 0.072 -0.998 0.1450 11.8531 12.1434 4.4212 7.096 3.775 -0.065 0.129 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala His
+0.000260 6.863 0.083 0.122 0.396 -0.998 2.2500 0.2500 1.1000 13.5000 8.610 4.780 -0.220 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.0000 0.000000 2.13 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.59 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Arg
+0.000450 7.300 0.120 -0.080 0.263 -0.998 2.6250 0.7100 1.5400 13.6000 7.340 4.070 -0.050 -0.170 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.0000 0.000000 2.14 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Lys
+0.020800 5.364 0.127 0.127 0.318 -0.390 5.76770 0.4129 1.0912 31.2598 7.060 5.085 0.385 0.044 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Pro
+0.029696 4.997 0.377 0.383 0.821 0.386 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 5.388 7.464 0.099 0.831 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Met
+0.000272 7.170 0.142 0.206 -0.006 -0.750 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 3.899 7.330 0.074 0.092 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Phe
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+0.008364 5.626 0.013 0.186 -0.998 0.118 0.3450 11.8400 11.0800 4.6000 3.240 6.080 0.090 0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Cys
+0.029696 4.997 0.377 0.383 0.821 0.386 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 5.388 7.464 0.099 0.831 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Met
+0.000272 7.170 0.142 0.206 -0.006 -0.750 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 3.899 7.330 0.074 0.092 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Phe
+0.001472 7.202 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.341 7.415 0.096 0.126 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ile
+0.000400 7.200 0.154 0.249 0.088 0.704 12.2400 -0.1000 0.7600 31.3000 5.340 7.410 0.100 0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Leu
+0.002052 7.006 0.317 0.111 0.869 0.121 9.3652 0.2400 0.9894 32.0718 7.046 5.075 0.066 0.081 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Val
+0.000236 7.034 0.103 0.324 -0.290 -0.096 0.1648 13.1732 11.7606 4.4984 3.898 8.010 0.084 -0.175 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Trp
+0.000165 7.120 0.100 0.099 0.023 -0.998 0.1400 13.1600 12.7400 4.2000 8.010 4.260 -0.100 -0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Tyr
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+0.000020 7.920 0.005 0.039 0.002 -0.997 13.6700 -0.0500 0.8100 31.3000 5.880 4.240 0.010 0.190 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Gly
+0.014760 5.570 0.176 0.042 0.079 -0.732 0.3500 11.9100 11.2500 4.5000 6.100 3.250 0.070 0.150 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Thr
+0.016000 5.390 0.158 0.093 -0.061 -0.554 0.4400 11.7300 10.9400 4.6000 5.770 3.070 0.110 0.140 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ser
+0.003600 6.010 0.154 0.074 0.109 -0.998 0.2450 12.5600 11.6400 4.4300 6.850 3.640 -0.010 0.060 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Gln
+0.009459 5.433 0.148 0.123 -0.052 -0.495 0.2551 11.9224 11.4828 4.5211 6.309 3.356 0.024 0.127 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Asn
+0.000960 7.010 0.139 -0.149 0.184 -0.998 2.5500 1.4600 2.1500 13.6000 6.830 3.790 0.060 -0.130 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.0000 0.000000 2.70 1.68 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Glu
+0.000640 7.240 0.136 -0.166 0.102 -0.998 2.6000 1.6500 2.2700 13.7000 6.380 3.540 0.110 0.010 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.0000 0.000000 3.14 2.16 0.00 0.00 0.00 0.00 1.02 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Asp
+0.003216 5.682 0.150 0.089 0.072 -0.998 0.1450 11.8531 12.1434 4.4212 7.096 3.775 -0.065 0.129 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala His
+0.000260 6.863 0.083 0.122 0.396 -0.998 2.2500 0.2500 1.1000 13.5000 8.610 4.780 -0.220 0.030 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.0000 0.000000 2.13 0.28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.59 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Arg
+0.000450 7.300 0.120 -0.080 0.263 -0.998 2.6250 0.7100 1.5400 13.6000 7.340 4.070 -0.050 -0.170 1 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.70 0.0000 0.000000 2.14 0.37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Lys
+0.020800 5.364 0.127 0.127 0.318 -0.390 5.76770 0.4129 1.0912 31.2598 7.060 5.085 0.385 0.044 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Pro
+0.029696 4.997 0.377 0.383 0.821 0.386 12.1823 -0.2949 0.6215 31.2556 5.388 7.464 0.099 0.831 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Met
+0.000272 7.170 0.142 0.206 -0.006 -0.750 0.1790 12.6554 11.4120 4.3202 3.899 7.330 0.074 0.092 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Phe
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+0.002000 6.400 0.238 0.238 0.503 0.503 16.6000 -0.0800 0.7800 31.7000 7.460 0.000 0.160 0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.000000 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.000 1.00 0 Ala Ala
+2.76949E+00 4.11518E+00 -2.19532E-01 9.75111E-02 -7.01204E-01 -2.21605E-03 1.44301E+00 9.17819E+00 8.78757E-02 1.38940E+01 3.00690E+00 2.85388E+00 8.97030E-01 2.11029E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 5.52066E+00 2.29224 6.46080E-01 1.81936E+01 0 0 0 1.55425E+00 0.00000E+00 1.66509E+00 4.51753E+00 5.42677E+00 8.39671E-01 2.57920E+00 1.66083E+00 1.00000E+00 9.03969E-01
+3.49142E+00 2.67101E+00 3.17207E-02 9.00000E-01 -8.22461E-01 7.34550E-01 3.36493E+00 9.93085E+00 3.46581E-02 1.38700E+01 2.53670E+00 2.40761E+00 9.95528E-01 6.07569E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 4.71259E+00 3.85164 6.46080E-01 6.13848E-01 0 0 0 1.70368E+00 0.00000E+00 2.81819E+00 1.65648E+00 8.05822E-01 9.52858E-01 2.57920E+00 2.29756E+00 1.00000E+00 1.30771E+00
+2.80648E+00 4.78723E+00 -4.56319E-01 3.66512E-01 1.03797E-02 -9.69877E-02 5.12457E-01 8.56895E+00 3.65721E-02 1.39553E+01 2.87985E+00 2.73276E+00 9.13526E-01 7.98069E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 3.41326E+00 2.7368 6.46080E-01 5.14094E-01 0 0 0 1.51203E+00 0.00000E+00 1.35470E+00 2.34659E+00 4.48174E+00 4.50972E-02 2.57920E+00 3.77892E+00 1.00000E+00 1.37820E+00
+3.60777E+00 4.73543E+00 -5.13711E-02 1.25426E-01 9.59925E-02 6.81451E-02 1.40547E+00 9.39769E+00 5.64959E-02 1.38969E+01 2.65045E+00 2.51555E+00 9.99843E-01 4.28818E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 7.56067E+00 2.97734 6.46080E-01 6.79541E-01 0 0 0 1.66279E+00 0.00000E+00 1.70859E+00 1.10162E+00 2.32091E+00 3.47461E-02 2.57920E+00 3.91594E+00 1.00000E+00 1.27858E+00
+2.89113E+00 4.54911E+00 -1.75214E-01 2.25027E-01 5.93778E-01 1.69337E-01 1.09504E+00 1.00032E+01 3.44327E+00 1.39022E+01 2.23968E+00 2.12564E+00 9.95606E-01 6.46585E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 8.88164E+00 2.41329 6.46080E-01 7.54458E-01 0 0 0 1.48435E+00 0.00000E+00 1.30764E+00 9.69387E-01 3.10110E+00 2.77195E-01 2.57920E+00 3.67963E+00 1.00000E+00 1.15762E+00
+2.65651E+01 3.35401E+00 -1.02610E-01 4.04591E-01 1.29939E-01 -1.50823E-02 3.47499E+00 9.55608E+00 3.48335E-02 1.38338E+01 3.78534E+00 3.59265E+00 1.01067E-01 3.53718E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 7.73014E+00 2.60748 6.46080E-01 1.72368E+00 0 0 0 1.79174E+00 0.00000E+00 1.98014E+00 1.77578E+00 9.46203E-01 4.15097E+00 2.57920E+00 7.10184E-01 1.00000E+00 5.87420E-01
+1.96135E+00 4.99025E+00 -6.99437E-01 2.38982E-01 -1.27899E-01 -4.88811E-01 8.17297E-01 1.02587E+01 9.59277E-01 1.38990E+01 2.25277E+00 2.13786E+00 9.99897E-01 8.06004E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 5.65056E+00 3.80295 6.46080E-01 7.20323E-01 0 0 0 1.72045E+00 0.00000E+00 4.05155E-01 2.96841E-01 3.47638E+00 2.67430E+00 2.57920E+00 6.04896E-01 1.00000E+00 5.26274E-01
+2.60404E+00 4.74646E+00 -4.30790E-01 2.47141E-01 -1.93143E-01 -1.81949E-01 1.34034E+00 9.19226E+00 6.70729E-01 1.39084E+01 2.49061E+00 2.36377E+00 9.99996E-01 6.69760E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 1.21693E+01 3.20378 6.46080E-01 9.20684E-01 0 0 0 1.73896E+00 0.00000E+00 2.86385E+00 1.84109E+00 9.85916E-01 6.16113E-01 2.57920E+00 2.70845E+00 1.00000E+00 1.02339E+00
+1.12956E+01 3.27717E+00 -2.12331E-01 1.99816E-01 7.90680E-02 -1.73982E-01 2.05848E+00 9.46762E+00 3.46574E-02 1.53848E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 1.46990E-01 2.72701E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 6.43810E+00 2.25665 6.46080E-01 7.08521E-01 0 0 0 1.44160E+00 0.00000E+00 2.99721E+00 2.78118E+00 3.48629E-02 1.14440E+00 2.57920E+00 1.18068E+00 1.00000E+00 1.26483E+00
+1.12956E+01 3.27717E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 2.05848E+00 9.46762E+00 3.46574E-02 1.53848E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 0.00000E+00 0.00001E+00 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 6.43810E+00 2.25665 6.46080E-01 7.08521E-01 0 0 0 1.44160E+00 0.00000E+00 2.99721E+00 2.78118E+00 3.48629E-02 1.14440E+00 2.57920E+00 1.18068E+00 1.00000E+00 1.26483E+00
+3.67062E-01 3.72270E+00 -9.00000E-01 4.01748E-01 -2.53158E-01 -7.95863E-01 1.72951E+00 9.44994E+00 1.16166E-01 1.39041E+01 2.37516E+00 2.25427E+00 9.98225E-01 4.12016E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 1.05967E+01 2.77744 6.46080E-01 1.07875E+01 0 0 0 1.12433E+00 0.00000E+00 5.06611E+00 4.49748E+00 3.57269E-02 3.47061E-02 2.57920E+00 9.15639E-01 1.00000E+00 1.22621E+00
+8.08641E+00 3.88259E+00 -7.30284E-01 1.50687E-01 -2.49819E-01 -9.90828E-02 1.76855E+00 9.30432E+00 7.60883E-02 1.38533E+01 3.90604E+00 3.70722E+00 3.19852E-03 2.22829E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 3.58770E+00 2.16185 6.46080E-01 4.41545E-01 0 0 0 8.56516E-01 0.00000E+00 1.94127E+00 1.66565E+00 2.73218E+00 9.11433E-02 2.57920E+00 4.08601E+00 1.00000E+00 1.30111E+00
+1.72180E+00 4.75589E+00 -7.76471E-01 8.03936E-02 -1.27225E-01 -5.84384E-01 1.28533E+00 9.51526E+00 1.20332E+00 1.39111E+01 2.27990E+00 2.16387E+00 9.98820E-01 6.59977E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 9.24844E+00 3.00796 6.46080E-01 8.07295E+00 0 0 0 1.54152E+00 0.00000E+00 2.92975E+00 2.59502E+00 1.33115E+00 7.03262E-01 2.57920E+00 2.57270E+00 1.00000E+00 1.13188E+00
+2.38854E+00 4.05843E+00 -2.58502E-01 6.17741E-01 -1.43214E-01 -4.16010E-03 1.06086E+00 9.28241E+00 1.64651E+00 1.39045E+01 2.75811E+00 2.61772E+00 9.20140E-01 4.87422E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 1.51510E+01 2.24595 6.46080E-01 3.12347E+00 0 0 0 1.30720E+00 0.00000E+00 1.21094E+00 3.90261E+00 5.79418E+00 7.08793E-02 2.57920E+00 2.23900E+00 1.00000E+00 1.19516E+00
+4.56897E+00 4.00580E+00 -1.33174E-01 3.56871E-01 -5.93347E-01 1.86821E-01 2.01298E+00 9.49906E+00 3.48964E-02 1.38762E+01 3.18067E+00 3.01878E+00 8.41805E-01 3.02643E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 3.46579E-02 0 2.19070E-01 -2.67605E-01 6.89583E+00 3.23864 6.46080E-01 6.71150E-01 0 0 0 1.77717E+00 2.55816E-01 3.29987E+00 3.10430E+00 1.04080E+00 1.08280E+00 2.57920E+00 1.18101E+00 1.00000E+00 1.32747E+00
+4.82199E+00 4.10219E+00 -1.87692E-01 2.84600E-02 -5.20508E-01 -6.04961E-02 1.89996E+00 9.43553E+00 4.37588E-02 1.38751E+01 3.28271E+00 3.11563E+00 8.05444E-01 1.33579E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 1.69436E+00 0 2.19070E-01 5.96930E-02 9.17063E+00 2.19706 6.46080E-01 3.00299E-01 0 0 0 1.61747E+00 1.09355E+00 2.17069E+00 1.87179E+00 2.07305E+00 3.33331E+00 2.57920E+00 -3.22059E-03 1.00000E+00 1.91168E+00
+2.27701E+00 4.21930E+00 -4.01011E-01 3.24275E-01 -5.10169E-01 1.37730E-01 1.62808E+00 9.41070E+00 8.17851E-01 1.38995E+01 2.64818E+00 2.51339E+00 9.72097E-01 4.82355E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 6.98768E+00 2.66898 6.46080E-01 6.85725E-01 0 0 0 1.30362E+00 0.00000E+00 3.35185E+00 3.14360E+00 9.82486E-01 1.32296E+00 2.57920E+00 6.14393E-01 1.00000E+00 1.27894E+00
+6.00334E+00 3.75425E+00 -6.75460E-02 8.84346E-01 -4.93590E-01 8.95275E-01 2.02735E+00 9.48793E+00 1.37013E-01 1.38662E+01 3.49460E+00 3.31673E+00 6.95897E-01 5.40747E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 3.46719E-02 0 2.19070E-01 2.20307E+00 7.90555E+00 4.35192 6.46080E-01 6.73066E-01 0 0 0 1.60806E+00 1.56504E-01 3.04053E+00 2.83752E+00 1.29541E+00 3.46751E-02 2.57920E+00 3.23150E+00 1.00000E+00 1.27560E+00
+5.28667E+00 3.75461E+00 -1.07295E-01 4.04965E-01 -3.75987E-01 7.65648E-02 1.51589E+00 9.43552E+00 3.74231E-02 1.38797E+01 3.20558E+00 3.04242E+00 8.36788E-01 4.96190E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 2.09753E-01 0 2.19070E-01 1.05167E+00 8.09944E+00 3.87534 6.46080E-01 6.75869E-01 0 0 0 1.60330E+00 8.50288E-01 3.20894E+00 3.02836E+00 1.15197E+00 3.53699E-02 2.57920E+00 2.74970E+00 1.00000E+00 1.26315E+00
+8.10562E+00 3.46667E+00 -3.04148E-03 1.75730E-01 1.28855E-01 1.32885E-01 1.58239E+00 9.28803E+00 2.51168E-01 1.38849E+01 3.08327E+00 2.92634E+00 8.98397E-01 7.34233E-02 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 7.57579E+00 3.52432 6.46080E-01 6.80651E-01 0 0 0 1.73647E+00 0.00000E+00 3.42587E+00 3.16963E+00 8.98068E-01 3.47448E-02 2.57920E+00 2.54055E+00 1.00000E+00 1.28193E+00
+3.49142E+00 2.67101E+00 3.17207E-02 9.000000E-01 -8.22461E-01 7.34550E-01 3.36493E+00 9.93085E+00 3.46581E-02 1.38700E+01 2.53670E+00 2.40761E+00 9.95528E-01 6.07569E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 4.71259E+00 3.85164 6.46080E-01 6.13848E-01 0 0 0 1.70368E+00 0.00000E+00 2.81819E+00 1.65648E+00 8.05822E-01 9.52858E-01 2.57920E+00 2.29756E+00 1.00000E+00 1.30771E+00
+2.80648E+00 4.78723E+00 -4.56319E-01 3.66512E-01 1.03797E-02 -9.69877E-02 5.12457E-01 8.56895E+00 3.65721E-02 1.39553E+01 2.87985E+00 2.73276E+00 9.13526E-01 7.98069E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 3.41326E+00 2.7368 6.46080E-01 5.14094E-01 0 0 0 1.51203E+00 0.00000E+00 1.35470E+00 2.34659E+00 4.48174E+00 4.50972E-02 2.57920E+00 3.77892E+00 1.00000E+00 1.37820E+00
+1.12956E+01 3.27717E+00 -2.12331E-01 1.99816E-01 7.90680E-02 -1.73982E-01 2.05848E+00 9.46762E+00 3.46574E-02 1.53848E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 1.46990E-01 2.72701E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 6.43810E+00 2.25665 6.46080E-01 7.08521E-01 0 0 0 1.44160E+00 0.00000E+00 2.99721E+00 2.78118E+00 3.48629E-02 1.14440E+00 2.57920E+00 1.18068E+00 1.00000E+00 1.26483E+00
+1.12956E+01 3.27717E+00 -2.12331E-01 1.99816E-01 7.90680E-02 -1.73982E-01 2.05848E+00 9.46762E+00 3.46574E-02 1.53848E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 1.46990E-01 2.72701E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 0.00000E+00 0 2.19070E-01 0.00000E+00 6.43810E+00 2.25665 6.46080E-01 7.08521E-01 0 0 0 1.44160E+00 0.00000E+00 2.99721E+00 2.78118E+00 3.48629E-02 1.14440E+00 2.57920E+00 1.18068E+00 1.00000E+00 1.26483E+00
+4.02213E+00 4.14141E+00 -9.00000E-01 5.95668E-01 3.18830E-01 -3.54146E-01 1.96169E+00 9.48911E+00 7.09141E-01 1.38885E+01 2.88010E+00 2.73350E+00 9.98420E-01 6.08289E-01 1 0 0 0 0 1.49320E+00 0 3.08394E+00 0 2.19070E-01 3.71284E-02 9.27714E+00 2.46406 6.46080E-01 4.33464E-01 0 0 0 1.60462E+00 1.30835E+00 3.19830E+00 2.92753E+00 1.09973E+00 2.00956E+00 2.57920E+00 8.50576E-02 1.00000E+00 1.84576E+00
+4.75537E+00 3.38384E+00 -1.51369E-02 7.01886E-01 3.36247E-01 5.31395E-01 1.25950E+00 9.32366E+00 3.46574E-02 1.38733E+01 3.55494E+00 3.37381E+00 -4.05005E-01 1.30331E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 4.57993E-01 3.36809 1.33880E+00 2.38403E-01 0 0 0 1.15575E+00 0.00000E+00 5.22636E+00 4.04260E+00 1.23858E-01 1.28488E+00 2.46360E+00 1.98385E-01 1.00000E+00 1.49132E+00
+7.91363E+00 3.05510E+00 4.79616E-01 -9.000000E-01 -8.25578E-02 9.000000E-01 4.38656E+00 1.00847E+01 8.51435E-01 1.38451E+01 2.96841E+00 2.81813E+00 -4.11046E-01 -2.87502E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 3.10784E+00 2.29302 1.33880E+00 1.38451E-01 0 0 0 9.48728E-01 0.00000E+00 3.49650E+00 2.36275E+00 1.90763E+00 8.29949E-01 2.46360E+00 1.69903E+00 1.00000E+00 1.66128E+00
+3.74861E+00 3.68665E+00 3.27277E-01 8.64036E-01 7.79242E-01 8.58133E-01 1.18445E+00 4.25785E+00 8.65261E+00 1.40684E+01 3.65437E+00 3.45591E+00 9.99998E-01 -3.06978E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 1.64839E+00 2.95403 1.33880E+00 6.32533E-01 0 0 0 1.47203E+00 0.00000E+00 5.30271E+00 3.06969E+00 8.14082E-01 1.20582E+00 2.46360E+00 5.67719E-01 1.00000E+00 2.09168E+00
+9.60231E+00 1.66049E+00 -1.47565E-01 7.12691E-01 -3.28156E-01 8.24847E-01 1.89505E+00 9.94033E+00 1.94539E-01 1.38301E+01 3.52283E+00 3.23863E+00 1.37188E-02 1.57889E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 4.43536E+00 3.18288 1.33880E+00 1.39236E+01 0 0 0 1.56736E+00 0.00000E+00 3.80403E+00 4.20638E+00 1.59364E+00 3.49864E-02 2.46360E+00 2.25777E+00 1.00000E+00 2.75588E-01
+2.30783E+01 2.81051E+00 -3.32350E-03 7.32579E-01 1.52374E-01 8.38549E-01 3.26318E+00 1.00625E+01 5.87947E-01 1.38163E+01 3.51978E+00 3.72648E+00 -1.29622E-01 -2.64538E-02 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 3.18804E+00 3.07709 1.33880E+00 2.18779E+01 0 0 0 1.55117E+00 0.00000E+00 5.34948E+00 2.82438E+00 3.46574E-02 3.46888E-02 2.46360E+00 2.50554E+00 1.00000E+00 3.01362E+00
+1.73130E+00 2.54579E+00 -1.25893E-01 9.00000E-01 1.97843E-01 8.56098E-01 4.96942E+00 9.08644E+00 1.35547E+00 1.39330E+01 3.12147E+00 2.96235E+00 -1.26219E-01 1.52191E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 8.34635E+00 2.52339 1.33880E+00 1.73979E-01 0 0 0 1.25073E+00 0.00000E+00 3.56563E+00 4.62700E+00 5.42587E-01 1.19662E+00 2.46360E+00 2.75423E+00 1.00000E+00 1.19656E+00
+6.71339E+00 3.43287E+00 3.79852E-01 4.23454E-01 -7.64425E-01 7.26083E-01 2.74194E+00 1.01072E+01 4.15874E-02 1.38289E+01 3.44526E+00 3.28516E+00 6.01677E-01 5.02609E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 8.25936E+00 3.27573 1.33880E+00 1.17414E-01 0 0 0 1.25155E+00 0.00000E+00 4.72710E+00 2.03358E+00 3.46574E-02 1.14437E-01 2.46360E+00 2.81274E+00 1.00000E+00 1.94338E+00
+5.13716E+00 3.11679E+00 2.60031E-02 6.82465E-01 4.37647E-02 3.31825E-01 2.24644E+01 2.29419E+00 2.57466E-01 1.38908E+01 4.13150E-01 5.08277E+00 7.34002E-01 -7.55198E-03 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 8.03123E+00 3.54461 1.33880E+00 3.23008E+00 0 0 0 9.01650E-01 0.00000E+00 4.05275E+00 7.88509E+00 2.46437E+00 2.05447E-01 2.46360E+00 3.11509E+00 1.00000E+00 3.73330E+00
+3.21546E+00 3.45408E+00 -5.34037E-02 6.60310E-01 3.63418E-01 3.81022E-01 1.22376E+00 9.19354E+00 6.74431E-02 1.92607E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 -4.97550E-01 2.12418E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 7.47902E+00 2.2909 1.33880E+00 1.73050E-01 0 0 0 1.18347E+00 0.00000E+00 3.03102E+00 3.10506E+00 1.40754E-01 5.29593E-01 2.46360E+00 1.86941E+00 1.00000E+00 1.31506E+00
+3.21546E+00 3.45408E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 1.22376E+00 9.19354E+00 6.74431E-02 1.92607E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 0.00000E+00 0.00000E+00 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 7.47902E+00 2.2909 1.33880E+00 1.73050E-01 0 0 0 1.18347E+00 0.00000E+00 3.03102E+00 3.10506E+00 1.40754E-01 5.29593E-01 2.46360E+00 1.86941E+00 1.00000E+00 1.31506E+00
+8.22196E-01 4.31546E+00 -2.86221E-01 2.45055E-01 -9.99479E-01 4.42862E-02 4.89254E+00 9.79089E+00 3.69290E-02 1.38944E+01 1.94716E+00 1.84870E+00 9.01956E-01 4.35468E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 2.13788E+00 2.89575 1.33880E+00 1.02711E-01 0 0 0 1.17689E+00 0.00000E+00 4.83647E+00 2.78265E+00 5.90224E-01 1.79498E+00 2.46360E+00 3.15127E-02 1.00000E+00 1.42176E+00
+1.23733E+00 3.92636E+00 -2.36705E-01 5.05627E-01 -4.58667E-01 2.41406E-02 2.31444E+00 9.54319E+00 8.63932E-01 1.39113E+01 2.01468E+00 1.91212E+00 8.74037E-01 4.40513E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 8.10832E+00 2.42823 1.33880E+00 1.73477E+00 0 0 0 1.16987E+00 0.00000E+00 2.60882E+00 3.90987E+00 1.32888E+00 3.51550E-01 2.46360E+00 2.11059E+00 1.00000E+00 1.27768E+00
+8.15991E+00 3.66611E+00 -7.78647E-02 7.36412E-01 6.26687E-01 6.40887E-01 6.84368E+00 9.91848E+00 7.29423E+00 1.38307E+01 3.86374E+00 3.66723E+00 -9.08165E-01 1.08625E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 1.40674E+00 4.17329 1.33880E+00 6.45557E-02 0 0 0 1.43121E+00 0.00000E+00 7.22868E+00 2.01821E+00 1.74933E-01 1.22273E+00 2.46360E+00 7.03377E-01 1.00000E+00 1.75729E+00
+3.61839E+00 3.35179E+00 -8.58424E-01 6.04867E-01 -7.03134E-01 -2.12579E-02 1.75328E+00 9.37840E+00 4.12064E-02 1.38798E+01 3.22338E+00 3.05927E+00 1.99482E-02 5.68709E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 3.13381E+00 2.49397 1.33880E+00 1.07134E+00 0 0 0 1.08624E+00 0.00000E+00 4.85117E+00 4.10152E+00 8.95494E-01 1.92227E+00 2.46360E+00 1.50641E-02 1.00000E+00 1.40467E+00
+1.06553E+01 3.00891E+00 -1.38791E-01 1.01159E-01 -2.03204E-01 -2.86709E-01 3.73219E+00 9.82936E+00 3.46574E-02 1.38554E+01 3.24149E+00 3.07650E+00 -1.62674E-03 2.88513E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 2.13347E+00 0 8.51560E-01 3.98179E-01 2.97006E+00 2.91216 1.33880E+00 4.02245E-01 0 0 0 1.29134E+00 1.06453E+00 4.61298E+00 4.45980E+00 3.70066E-02 6.81047E-02 2.46360E+00 9.30046E-01 1.00000E+00 1.08848E+00
+2.03612E+00 3.91179E+00 -2.51109E-01 4.63698E-01 -6.09105E-01 8.14658E-02 2.07759E+00 9.51936E+00 3.46574E-02 1.39012E+01 2.37242E+00 2.25167E+00 9.56140E-01 1.16919E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 9.11819E-01 0 8.51560E-01 3.62436E-01 2.67330E+00 3.11484 1.33880E+00 5.41942E-02 0 0 0 1.21348E+00 1.19053E+00 2.54335E+00 1.97873E+00 1.50731E+00 4.94470E-01 2.46360E+00 2.72561E+00 1.00000E+00 1.79561E+00
+7.53761E+00 3.62002E+00 -6.52109E-01 7.17105E-01 1.51061E-01 6.53100E-01 1.37724E+00 9.31625E+00 1.15651E-01 1.38553E+01 3.91116E+00 3.71217E+00 -3.37121E-01 2.53290E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 5.32259E+00 2.43199 1.33880E+00 1.67582E-01 0 0 0 1.17731E+00 0.00000E+00 5.49684E+00 3.36550E+00 2.37664E-01 8.82211E-01 2.46360E+00 7.24810E-01 1.00000E+00 4.32291E-01
+4.79629E+00 3.14365E+00 -2.19134E-01 2.67846E-01 -4.35642E-01 5.38275E-01 2.28941E+00 9.55024E+00 3.47518E-02 1.38964E+01 2.45905E+00 2.33388E+00 9.23376E-01 6.00372E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 1.74112E+00 0 8.51560E-01 9.86216E-01 7.61332E+00 4.27869 1.33880E+00 7.72375E-01 0 0 0 1.48048E+00 3.55476E-01 3.18955E+00 3.00516E+00 1.15864E+00 3.53266E-02 2.46360E+00 2.84226E+00 1.00000E+00 1.28593E+00
+1.21080E+01 3.66330E+00 -1.31893E-01 7.27242E-01 6.54647E-01 5.93303E-01 1.38161E+00 9.30743E+00 1.44434E-01 1.38407E+01 4.25646E+00 4.03983E+00 -9.88275E-01 2.98346E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 2.45562E+00 0 8.51560E-01 8.13472E-01 9.54483E+00 3.45381 1.33880E+00 1.35758E+00 0 0 0 1.36532E+00 9.56932E-01 3.51018E+00 3.37763E+00 9.40401E-01 3.47859E-02 2.46360E+00 2.69474E+00 1.00000E+00 2.09840E+00
+6.55711E+00 3.30109E+00 1.13025E-01 9.00000E-01 4.68036E-01 9.0000000E-01 1.91301E+00 9.49719E+00 9.67704E-02 1.38542E+01 3.44506E+00 3.32275E+00 -3.88157E-01 -1.51921E-02 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 3.49782E+00 3.94998 1.33880E+00 2.34728E-01 0 0 0 1.36746E+00 0.00000E+00 3.39549E+00 1.91776E+00 2.60411E+00 4.96390E-01 2.46360E+00 4.38413E+00 1.00000E+00 2.51647E+00
+7.91363E+00 3.05510E+00 4.79616E-01 -9.00000E-01 -8.25578E-02 9.000000E-01 4.38656E+00 1.00847E+01 8.51435E-01 1.38451E+01 2.96841E+00 2.81813E+00 -4.11046E-01 -2.87502E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 3.10784E+00 2.29302 1.33880E+00 1.38451E-01 0 0 0 9.48728E-01 0.00000E+00 3.49650E+00 2.36275E+00 1.90763E+00 8.29949E-01 2.46360E+00 1.69903E+00 1.00000E+00 1.66128E+00
+3.74861E+00 3.68665E+00 3.27277E-01 8.64036E-01 7.79242E-01 8.58133E-01 1.18445E+00 4.25785E+00 8.65261E+00 1.40684E+01 3.65437E+00 3.45591E+00 9.99998E-01 -3.06978E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 1.64839E+00 2.95403 1.33880E+00 6.32533E-01 0 0 0 1.47203E+00 0.00000E+00 5.30271E+00 3.06969E+00 8.14082E-01 1.20582E+00 2.46360E+00 5.67719E-01 1.00000E+00 2.09168E+00
+3.21546E+00 3.45408E+00 -5.34037E-02 6.60310E-01 3.63418E-01 3.81022E-01 1.22376E+00 9.19354E+00 6.74431E-02 1.92607E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 -4.97550E-01 2.12418E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 7.47902E+00 2.2909 1.33880E+00 1.73050E-01 0 0 0 1.18347E+00 0.00000E+00 3.03102E+00 3.10506E+00 1.40754E-01 5.29593E-01 2.46360E+00 1.86941E+00 1.00000E+00 1.31506E+00
+3.21546E+00 3.45408E+00 -5.34037E-02 6.60310E-01 3.63418E-01 3.81022E-01 1.22376E+00 9.19354E+00 6.74431E-02 1.92607E+01 3.46574E-02 4.79870E+00 -4.97550E-01 2.12418E-01 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 0.00000E+00 0 8.51560E-01 0.00000E+00 7.47902E+00 2.2909 1.33880E+00 1.73050E-01 0 0 0 1.18347E+00 0.00000E+00 3.03102E+00 3.10506E+00 1.40754E-01 5.29593E-01 2.46360E+00 1.86941E+00 1.00000E+00 1.31506E+00
+1.23393E+00 4.67195E+00 -2.61819E-01 -2.25263E-02 -9.99973E-01 -6.22555E-02 2.86523E+00 9.14958E+00 3.82848E+00 1.39207E+01 2.58073E+00 2.44939E+00 8.89129E-01 1.31225E-03 1 0 0 0 0 1.94100E+00 0 3.40571E+00 0 8.51560E-01 1.34391E+00 5.44556E-01 4.35377 1.33880E+00 1.14615E-01 0 0 0 1.39878E+00 1.21698E+00 4.00438E+00 4.08491E+00 5.34318E-01 5.00988E-01 2.46360E+00 2.45097E+00 1.00000E+00 3.95510E+00
+7.06420E-01 4.21154E+00 -3.98557E-02 -3.98557E-02 -3.70273E-01 -3.70273E-01 1.32625E+01 1.10219E+01 8.69927E-01 1.36960E+01 2.11509E+00 2.11509E+00 3.15842E-01 3.15842E-01 1 0 0 0 0 1.94101E+00 0 1.94101E+00 0 8.51560E-01 8.51560E-01 2.39897E+00 3.23986 1.33877E+00 1.33877E+00 0 0 0 1.25282E+00 1.25282E+00 9.97545E+00 9.97757E+00 1.00267E+01 1.00152E+01 2.46356E+00 2.46356E+00 1.00000E+00 1.31932E+00
+4.90353E+00 3.27225E+00 -4.70507E-02 3.12460E-01 -5.04224E-01 2.03239E-01 1.69727E+00 9.09877E+00 3.47331E-02 1.39045E+01 2.69070E+00 2.55375E+00 7.75226E-01 2.10633E-01 1 0 0 0 0 1.59944E+00 0 0.00000E+00 0 1.45326E+00 0.00000E+00 4.16582E+00 4.07222 7.55100E-01 6.17536E-01 0 0 0 1.50094E+00 0.00000E+00 3.05523E+00 2.12170E+00 4.67476E-01 1.38403E-01 3.78210E+00 2.47316E+00 1.00000E+00 1.30486E+00
+6.04918E+00 3.64643E+00 -3.37943E-01 6.47644E-01 -3.07416E-02 5.71348E-01 1.83339E+00 9.37560E+00 1.79203E+00 1.39149E+01 2.14024E+00 2.03132E+00 9.79172E-01 4.92591E-01 1 0 0 0 0 1.46578E+00 0 0.00000E+00 0 1.11644E+00 0.00000E+00 5.80389E+00 4.12539 7.55100E-01 2.66445E+00 0 0 0 1.52978E+00 0.00000E+00 5.58165E+00 3.57423E+00 3.46574E-02 3.46613E-02 3.78210E+00 1.84092E+00 1.00000E+00 1.24482E+00
+3.10492E+00 3.66816E+00 -3.38128E-01 6.32560E-01 -8.57082E-01 3.07945E-01 2.04255E+00 9.77494E+00 1.19532E+00 1.38780E+01 2.62648E+00 2.49279E+00 8.26246E-01 6.25759E-01 1 0 0 0 0 2.08269E+00 0 0.00000E+00 0 7.60267E-01 0.00000E+00 6.77859E+00 4.83805 7.55100E-01 6.59835E-01 0 0 0 1.73477E+00 0.00000E+00 4.00982E+00 2.03504E+00 3.47285E-02 4.26411E-02 3.78210E+00 3.12267E+00 1.00000E+00 1.27817E+00
+5.35847E+00 3.48906E+00 1.21070E-01 6.15933E-01 3.89427E-01 4.70455E-01 2.70879E+00 9.66743E+00 3.48997E-02 1.38654E+01 3.22010E+00 3.05604E+00 -9.78398E-02 1.21433E-01 1 0 0 0 0 2.28603E+00 0 0.00000E+00 0 1.33120E+00 0.00000E+00 3.81177E+00 4.69942 7.55100E-01 1.64365E+00 0 0 0 1.70745E+00 0.00000E+00 2.34964E+00 5.33747E+00 4.32094E+00 3.47617E-02 3.78210E+00 2.19819E+00 1.00000E+00 1.27964E+00
+5.23212E+00 2.84739E+00 -6.39629E-02 6.54034E-01 -3.71070E-02 5.53455E-01 1.52727E+00 9.43266E+00 3.46719E-02 1.38924E+01 2.82670E+00 2.68283E+00 4.77474E-01 3.58256E-01 1 0 0 0 0 1.61896E+00 0 0.00000E+00 0 1.57874E+00 0.00000E+00 1.44124E+00 4.48321 7.55100E-01 1.23466E+01 0 0 0 1.85541E+00 0.00000E+00 1.24057E+00 6.28722E+00 6.94432E+00 3.63675E-02 3.78210E+00 1.19579E+00 1.00000E+00 1.16806E+00
+2.98818E+00 3.59037E+00 3.46574E-02 5.22839E-01 3.46574E-02 1.65631E-01 1.14447E+00 9.50239E+00 2.73378E-01 1.38975E+01 2.48289E+00 2.35644E+00 7.91830E-01 4.59508E-01 1 0 0 0 0 1.90909E+00 0 0.00000E+00 0 1.35704E+00 0.00000E+00 1.06882E+01 4.04192 7.55100E-01 6.97094E-01 0 0 0 1.74602E+00 0.00000E+00 5.66076E+00 5.38727E+00 8.04780E-02 3.48382E-02 3.78210E+00 1.30114E+00 1.00000E+00 1.26553E+00
+1.01428E+01 2.77418E+00 -3.62927E-01 7.68508E-01 -2.09007E-01 -2.71710E-01 3.14471E+00 9.50887E+00 3.49713E-02 1.38332E+01 4.06893E+00 3.86092E+00 3.97160E-01 4.88141E-01 1 0 0 0 0 6.21744E-01 0 0.00000E+00 0 6.90652E-01 0.00000E+00 3.02533E+00 4.67263 7.55100E-01 7.76993E-01 0 0 0 1.58254E+00 0.00000E+00 1.23132E-01 7.50977E+00 1.02746E+01 1.72001E+00 3.78210E+00 2.60218E-01 1.00000E+00 1.18045E+00
+7.83328E+00 2.44458E+00 -3.58458E-01 8.55653E-01 -7.49992E-01 8.82040E-01 2.79355E+00 9.59072E+00 4.13748E-01 1.39052E+01 1.92145E+00 1.82360E+00 9.70082E-01 6.44655E-01 1 0 0 0 0 2.22544E+00 0 0.00000E+00 0 4.92840E-01 0.00000E+00 1.55173E+00 6.18211 7.55100E-01 5.97352E-01 0 0 0 1.83624E+00 0.00000E+00 1.25085E+00 5.46970E+00 6.41720E+00 3.61289E-02 3.78210E+00 1.80403E+00 1.00000E+00 1.25169E+00
+6.22992E+00 3.13390E+00 1.69930E-02 5.83415E-01 -2.65220E-01 4.11602E-01 1.47796E+00 9.43029E+00 3.73717E-02 1.38975E+01 2.68773E+00 2.55091E+00 7.73444E-01 2.13267E-01 1 0 0 0 0 1.67784E+00 0 0.00000E+00 0 1.41061E+00 0.00000E+00 6.82061E+00 4.1718 7.55100E-01 6.72855E-01 0 0 0 1.64957E+00 0.00000E+00 3.34986E+00 3.16473E+00 3.46574E-02 6.87432E-02 3.78210E+00 2.09930E+00 1.00000E+00 1.29004E+00
+6.22992E+00 3.13390E+00 0.00000E+00 0.00000E+00  0.00000E+00 0.0000000E+00 1.47796E+00 9.43029E+00 3.73717E-02 1.38975E+01 2.68773E+00 2.55091E+00 0.00000E+00 0.0000E+00 1 0 0 0 0 1.67784E+00 0 0.00000E+00 0 1.41061E+00 0.00000E+00 6.82061E+00 4.1718 7.55100E-01 6.72855E-01 0 0 0 1.64957E+00 0.00000E+00 3.34986E+00 3.16473E+00 3.46574E-02 6.87432E-02 3.78210E+00 2.09930E+00 1.00000E+00 1.29004E+00
+2.42514E+00 3.78454E+00 -2.31320E-01 2.61894E-01 -9.99988E-01 1.19287E-01 5.62239E+00 1.06668E+01 1.52279E-01 1.38221E+01 2.43030E+00 2.30660E+00 8.49478E-01 2.00753E-01 1 0 0 0 0 1.87796E+00 0 0.00000E+00 0 1.29968E+00 0.00000E+00 7.75331E+00 3.65355 7.55100E-01 5.58776E+00 0 0 0 1.43373E+00 0.00000E+00 3.42675E+00 3.60510E+00 1.12648E+00 8.39558E-02 3.78210E+00 1.93011E+00 1.00000E+00 1.20616E+00
+4.92350E+00 3.27415E+00 -9.88194E-02 5.53516E-01 -4.16850E-01 3.35922E-01 1.45639E+00 9.42731E+00 9.34415E-02 1.38980E+01 2.68910E+00 2.55221E+00 7.90031E-01 2.56357E-01 1 0 0 0 0 1.57460E+00 0 0.00000E+00 0 1.07279E+00 0.00000E+00 6.66834E+00 4.29521 7.55100E-01 6.95775E-01 0 0 0 1.58024E+00 0.00000E+00 2.96208E+00 2.76337E+00 3.46574E-02 5.47719E-02 3.78210E+00 2.31176E+00 1.00000E+00 1.28409E+00
+1.52651E+00 3.95915E+00 -5.07797E-01 6.42511E-01 -2.91594E-01 -2.38241E-01 2.62903E+00 9.66640E+00 2.48928E+00 1.38937E+01 2.63952E+00 2.50522E+00 4.57544E-01 8.01910E-01 1 0 0 0 0 2.54640E+00 0 0.00000E+00 0 3.65830E-01 0.00000E+00 8.02693E+00 3.98647 7.55100E-01 8.57803E-01 0 0 0 1.50303E+00 0.00000E+00 4.34126E+00 4.99168E+00 1.80027E+00 1.95873E+00 3.78210E+00 4.40408E+00 1.00000E+00 1.31141E+00
+3.19143E+00 3.69642E+00 -3.35686E-01 4.33270E-01 -7.13812E-01 1.91206E-01 1.28041E+00 9.33537E+00 3.72588E-02 1.38995E+01 2.73514E+00 2.59593E+00 7.94545E-01 4.33232E-01 1 0 0 0 0 1.70505E+00 0 0.00000E+00 0 5.39241E-01 0.00000E+00 7.37254E+00 4.29697 7.55100E-01 6.94257E-01 0 0 0 1.55441E+00 0.00000E+00 3.48085E+00 3.11983E+00 7.63501E-01 3.46650E-02 3.78210E+00 2.20474E+00 1.00000E+00 1.29093E+00
+7.60882E+00 3.73830E+00 -3.41226E-01 3.55099E-01 -6.23957E-01 2.40261E-01 4.23696E+00 1.00600E+01 3.60130E-02 1.38603E+01 2.59905E+00 2.46676E+00 9.35994E-01 3.03979E-01 1 0 0 0 0 2.13978E+00 0 1.14170E-01 0 6.42934E-01 1.46255E-01 5.20992E+00 4.17387 7.55100E-01 6.79460E-01 0 0 0 1.48631E+00 1.63309E+00 3.55888E+00 3.13038E+00 6.02062E-01 6.10391E-02 3.78210E+00 2.07254E+00 1.00000E+00 1.28689E+00
+6.13635E+00 3.44668E+00 -2.43524E-01 2.88157E-01 -2.94644E-01 1.98561E-01 1.78264E+00 9.46693E+00 3.58045E-02 1.38993E+01 2.53765E+00 2.40848E+00 9.60731E-01 2.18048E-01 1 0 0 0 0 1.73076E+00 0 1.42422E-01 0 1.19258E+00 2.48493E-01 7.20144E+00 3.802 7.55100E-01 6.86609E-01 0 0 0 1.48907E+00 1.26403E+00 4.51342E+00 4.03665E+00 3.46574E-02 8.19878E-02 3.78210E+00 1.54762E+00 1.00000E+00 1.37331E+00
+4.68290E+00 3.68599E+00 -7.41122E-01 4.74125E-01 -5.91462E-01 1.21208E-01 1.38844E+00 9.39590E+00 1.99876E-01 1.38767E+01 3.33382E+00 3.16413E+00 2.02868E-01 4.27565E-01 1 0 0 0 0 1.88585E+00 0 0.00000E+00 0 1.10185E+00 0.00000E+00 8.59210E+00 4.31918 7.55100E-01 6.82752E-01 0 0 0 1.36215E+00 0.00000E+00 3.79189E+00 3.63026E+00 6.02706E-01 3.47436E-02 3.78210E+00 2.14483E+00 1.00000E+00 1.29388E+00
+2.14240E+00 3.28874E+00 -8.04026E-01 3.70637E-01 1.82753E-02 -8.13204E-01 3.47138E-01 9.30905E+00 3.62906E-02 1.39122E+01 2.41152E+00 2.28877E+00 9.32494E-01 4.22412E-01 1 0 0 0 0 1.40432E+00 0 1.85372E+00 0 2.23342E+00 2.05118E+00 1.18089E+01 3.97577 7.55100E-01 6.94131E-01 0 0 0 1.36371E+00 1.01976E+00 5.07059E+00 4.69621E+00 6.07896E-02 9.06959E-02 3.78210E+00 1.22531E+00 1.00000E+00 1.22149E+00
+1.57084E+00 3.93270E+00 1.83795E-02 -9.000000E-01 -1.79970E-01 -7.75400E-01 1.95336E+00 9.42913E+00 3.46745E-02 1.39157E+01 1.91456E+00 1.81711E+00 9.41305E-01 4.32424E-01 1 0 0 0 0 1.38435E+00 0 1.51067E+00 0 1.46802E+00 1.69715E+00 1.04752E+01 4.02821 7.55100E-01 1.64386E-01 0 0 0 1.56518E+00 7.89374E-01 3.96098E+00 3.90965E+00 4.95994E-01 6.50098E-02 3.78210E+00 1.71574E+00 1.00000E+00 1.35960E+00
+4.17237E+00 3.41016E+00 -9.86914E-02 5.22151E-01 4.34466E-02 2.68851E-01 7.21979E-01 9.31407E+00 4.62179E-01 1.39070E+01 2.62056E+00 2.48718E+00 7.92454E-01 3.76972E-01 1 0 0 0 0 1.80933E+00 0 0.00000E+00 0 1.76731E+00 0.00000E+00 8.68913E+00 4.32349 7.55100E-01 8.28837E-01 0 0 0 1.71288E+00 0.00000E+00 4.72456E+00 3.77848E+00 7.13422E-02 3.48039E-02 3.78210E+00 1.82847E+00 1.00000E+00 1.27867E+00
+6.04918E+00 3.64643E+00 -3.37943E-01 6.47644E-01 -3.07416E-02 5.71348E-01 1.83339E+00 9.37560E+00 1.79203E+00 1.39149E+01 2.14024E+00 2.03132E+00 9.79172E-01 4.92591E-01 1 0 0 0 0 1.46578E+00 0 0.00000E+00 0 1.11644E+00 0.00000E+00 5.80389E+00 4.12539 7.55100E-01 2.66445E+00 0 0 0 1.52978E+00 0.00000E+00 5.58165E+00 3.57423E+00 3.46574E-02 3.46613E-02 3.78210E+00 1.84092E+00 1.00000E+00 1.24482E+00
+3.10492E+00 3.66816E+00 -3.38128E-01 6.32560E-01 -8.57082E-01 3.07945E-01 2.04255E+00 9.77494E+00 1.19532E+00 1.38780E+01 2.62648E+00 2.49279E+00 8.26246E-01 6.25759E-01 1 0 0 0 0 2.08269E+00 0 0.00000E+00 0 7.60267E-01 0.00000E+00 6.77859E+00 4.83805 7.55100E-01 6.59835E-01 0 0 0 1.73477E+00 0.00000E+00 4.00982E+00 2.03504E+00 3.47285E-02 4.26411E-02 3.78210E+00 3.12267E+00 1.00000E+00 1.27817E+00
+6.22992E+00 3.13390E+00 1.69930E-02 5.83415E-01 -2.65220E-01 4.11602E-01 1.47796E+00 9.43029E+00 3.73717E-02 1.38975E+01 2.68773E+00 2.55091E+00 7.73444E-01 2.13267E-01 1 0 0 0 0 1.67784E+00 0 0.00000E+00 0 1.41061E+00 0.00000E+00 6.82061E+00 4.1718 7.55100E-01 6.72855E-01 0 0 0 1.64957E+00 0.00000E+00 3.34986E+00 3.16473E+00 3.46574E-02 6.87432E-02 3.78210E+00 2.09930E+00 1.00000E+00 1.29004E+00
+6.22992E+00 3.13390E+00 1.69930E-02 5.83415E-01 -2.65220E-01 4.11602E-01 1.47796E+00 9.43029E+00 3.73717E-02 1.38975E+01 2.68773E+00 2.55091E+00 7.73444E-01 2.13267E-01 1 0 0 0 0 1.67784E+00 0 0.00000E+00 0 1.41061E+00 0.00000E+00 6.82061E+00 4.1718 7.55100E-01 6.72855E-01 0 0 0 1.64957E+00 0.00000E+00 3.34986E+00 3.16473E+00 3.46574E-02 6.87432E-02 3.78210E+00 2.09930E+00 1.00000E+00 1.29004E+00
+3.75543E+00 3.36136E+00 -6.33286E-02 7.35839E-01 -9.97527E-01 2.50147E-01 2.83782E+00 9.51220E+00 3.52073E-02 1.38996E+01 2.61450E+00 2.48138E+00 7.93823E-01 3.68392E-01 1 0 0 0 0 2.21760E+00 0 2.69356E+00 0 2.18590E+00 9.53745E-01 1.43051E+01 3.14675 7.55100E-01 1.55626E+00 0 0 0 1.75864E+00 1.26504E+00 8.38762E+00 7.74879E+00 2.34613E-01 2.18917E-01 3.78210E+00 1.27194E-01 1.00000E+00 1.65970E+00
+6.53448E+00 3.06497E+00 -1.23530E-01 -2.44882E-01 -4.71815E-01 -2.13773E-01 2.91274E+00 9.69125E+00 6.10683E-02 1.38750E+01 2.88858E+00 2.74155E+00 2.91243E-01 2.25591E-01 1 0 0 0 0 1.98732E+00 0 1.14543E+00 0 1.14429E+00 3.94402E-01 8.98237E+00 4.06894 7.55100E-01 6.99473E-01 0 0 0 1.55498E+00 1.34262E+00 4.26414E+00 3.85766E+00 3.56723E-02 8.29407E-02 3.78210E+00 1.66734E+00 1.00000E+00 1.41601E+00
+6.95211E+00 4.15350E+00 1.06100E-01 1.06100E-01 8.50956E-02 8.50956E-02 5.04585E+00 0.00000E+00 3.49565E-02 1.37241E+01 5.05597E+00 5.05597E+00 1.32002E-01 1.32002E-01 1 0 0 0 0 2.00522E+00 0 2.00522E+00 0 1.16310E+00 1.16310E+00 3.59225E+00 4.20321 7.55102E-01 7.55102E-01 0 0 0 1.48324E+00 1.48324E+00 8.78257E+00 8.90742E+00 1.13779E+01 1.02795E+01 3.78209E+00 3.78209E+00 1.00000E+00 1.37869E+00
+
+   2.252000       2.758289       2.828747       2.573807    
+   2.573807       2.314337       3.329045       3.123838    
+   1.679138       1.245463       2.417517       2.138542    
+   2.902927       2.675567       2.916240       2.690005    
+   2.934561       3.360153       2.904943       2.252400    
+   2.822849       3.512073       2.021838       2.021838    
+   0.000000       0.000000       0.000000
+  
+   3.378400       3.464698       3.152444       3.152444    
+   2.834641       4.077473       3.826132       2.056637    
+   1.525464       2.961017       2.619323       3.555555    
+   3.277081       3.571861       3.294765       3.594301    
+   4.115573       3.558025       2.758779       3.457474    
+   4.301648       2.476383       2.476383       0.000000
+   0.000000       0.000000    
+  
+   3.553200       3.232970       3.232970       2.907049    
+   4.181627       3.923866       2.109172       1.564431    
+   3.036654       2.686231       3.646378       3.360790    
+   3.663100       3.378926       3.686114       4.220702    
+   3.648911       2.829249       3.545792       4.411529    
+   2.539639       2.539639       0.000000       0.000000
+   0.000000           
+  
+   2.941600       2.941600       2.645052       3.804760    
+   3.570230       1.919084       1.423437       2.762977    
+   2.444136       3.317750       3.057901       3.332965    
+   3.074402       3.353905       3.840313       3.320055    
+   2.574264       3.226230       4.013942       2.310756    
+   2.310756       0.000000       0.000000       0.000000
+
+  
+   2.941600       2.645052       3.804760       3.570230    
+   1.919084       1.423437       2.762977       2.444136    
+   3.317750       3.057901       3.332965       3.074402    
+   3.353905       3.840313       3.320055       2.574264    
+   3.226230       4.013942       2.310756       2.310756    
+   0.000000       0.000000       0.000000
+  
+   2.378400       3.421196       3.210309       1.725618    
+   1.279938       2.484436       2.197739       2.983282    
+   2.749629       2.996964       2.764467       3.015792    
+   3.453165       2.985354       2.314748       2.900988    
+   3.609290       2.077805       2.077805       0.000000
+   0.000000       0.000000
+      
+   4.921200       4.617850       2.482205       1.841120    
+   3.573723       3.161325       4.291286       3.955188    
+   4.310965       3.976531       4.338049       4.967185    
+   4.294266       3.329637       4.172909       5.191762    
+   2.988806       2.988806       0.000000       0.000000 
+   0.000000
+  
+   4.333200       2.329199       1.727631       3.353434    
+   2.966456       4.026765       3.711385       4.045231    
+   3.731412       4.070646       4.661001       4.029562    
+   3.124393       3.915686       4.871735       2.804572
+   2.804572       0.000000       0.000000       0.000000
+  
+   1.252000      0.9286429       1.802551       1.594541    
+   2.164482       1.994958       2.174409       2.005723    
+   2.188069       2.505400       2.165986       1.679436    
+   2.104775       2.618674       1.507524       1.507524    
+   0.000000       0.000000       0.000000
+  
+  0.6888000       1.337002       1.182715       1.605456    
+   1.479715       1.612819       1.487700       1.622951    
+   1.858324       1.606571       1.245684       1.561169    
+   1.942343       1.118173       1.118173       0.000000
+   0.000000       0.000000
+  
+   2.595200       2.295720       3.116286       2.872216    
+   3.130577       2.887715       3.150245       3.607117    
+   3.118450       2.417947       3.030323       3.770203    
+   2.170439       2.170439       0.000000       0.000000   
+   0.000000
+  
+   2.030800       2.756675       2.540769       2.769316    
+   2.554480       2.786715       3.190865       2.758589    
+   2.138922       2.680631       3.335131       1.919976    
+   1.919976       0.000000       0.000000       0.000000
+  
+   3.742000       3.448923       3.759161       3.467535    
+   3.782778       4.331384       3.744599       2.903442    
+   3.638776       4.527216       2.606238       2.606238    
+   0.000000       0.000000       0.000000
+  
+   3.178800       3.464740       3.195954       3.486507    
+   3.992146       3.451319       2.676042       3.353784    
+   4.172640       2.402115       2.402115       0.000000
+   0.000000       0.000000
+
+   -7.2938        -4.0239         3.800125       5.9101
+   3.8743         2.916757        3.655463       4.547977
+   2.618191       2.618191        0.000000       0.000000
+   0.000000
+
+  -3.0057         3.505321       6.0636         3.5303
+   2.690483       3.371882       4.195157       2.415078
+   2.415078       0.000000       0.000000       0.000000
+
+   3.824000       4.378585       3.785405       2.935082
+   3.678429       4.576550       2.634640       2.634640
+   0.000000       0.000000       0.000000
+
+  -0.1779        -3.4493         3.360749       4.211903
+   5.240276       3.016734       3.016734       0.000000  
+   0.000000       0.000000
+
+  -9.4378         2.905459       3.641304       4.530360
+   2.608049       2.608049       0.000000       0.000000  
+   0.000000
+
+   2.252800       2.823350       3.512697       2.022197
+   2.022197       0.000000       0.000000       0.000000
+
+
+   3.538400       4.402332       2.534345       2.534345
+   0.000000       0.000000       0.000000
+
+   5.477200       3.153127       3.153127       0.000000   
+   0.000000       0.000000
+
+   1.815200       1.815200       0.000000       0.000000   
+   0.000000
+
+   1.815200       0.000000       0.000000       0.000000
+
+   0.000000       0.000000       0.000000
+
+   0.000000       0.000000   
+
+   0.000000
+
diff --git a/PARAM/xlinks_parameters.dat b/PARAM/xlinks_parameters.dat

new file mode 100644 (file)

index 0000000..08e8ffa
--- /dev/null
+++ b/PARAM/xlinks_parameters.dat
@@ -0,0 +1,72 @@
+10
+Calpha-SC
+Xlinks       n a1     k1      d1    a2    k2      d2     a3    k3      d3
+Glu Glu ADH  2 2.9930 81.7300 3.112 0.516 289.782 3.840
+             2 2.9930 81.7300 3.112 0.516 289.782 3.840
+Glu Asp ADH  2 2.9930 81.7300 3.112 0.516 289.782 3.840
+             1 2.2840 241.025 2.490
+Asp Glu ADH  1 2.2840 241.025 2.490
+             2 2.9930 81.7300 3.112 0.516 289.782 3.840
+Asp Asp ADH  1 2.2840 241.025 2.490
+             1 2.2840 241.025 2.490
+Glu Glu PDH  2 2.8600 85.3370 3.120 0.611 277.283 3.841
+             2 2.8600 85.3370 3.120 0.611 277.283 3.841
+Glu Asp PDH  2 2.8600 85.3370 3.120 0.611 277.283 3.841
+             1 0.4800 226.446 2.486
+Asp Glu PDH  1 0.4800 226.446 2.486
+             2 2.8600 85.3370 3.120 0.611 277.283 3.841
+Asp Asp PDH  1 0.4800 226.446 2.486
+             1 0.4800 226.446 2.486
+Lys Lys BS2G 3 12.571 53.0540 3.411 2.445 8.78000 5.325 3.549 653.591 6.346
+             3 12.571 53.0540 3.411 2.445 8.78000 5.325 3.549 653.591 6.346
+Lys Lys BS3  3 10.819 99.0490 3.526 2.449 8.56000 5.319 3.444 671.396 6.349
+             3 10.819 99.0490 3.526 2.449 8.56000 5.319 3.444 671.396 6.349
+
+SC-SC
+Xlinks       n a1    k1     d1    a2    k2    d2         a3    k3  d3
+Glu Glu ADH  3 5.103 11.597 4.225 3.150 1.158 8.325 2.322 3.817 11.707
+Glu Asp ADH  3 5.103 11.597 4.225 3.150 1.158 8.325 2.322 3.817 11.707
+Asp Glu ADH  3 5.103 11.597 4.225 3.150 1.158 8.325 2.322 3.817 11.707
+Asp Asp ADH  3 5.103 11.597 4.225 3.150 1.158 8.325 2.322 3.817 11.707
+Glu Glu PDH  3 6.811 38.486 4.490 7.703 1.361 7.797 2.159 0.800 12.634
+Glu Asp PDH  3 6.811 38.486 4.490 7.703 1.361 7.797 2.159 0.800 12.634
+Asp Glu PDH  3 6.811 38.486 4.490 7.703 1.361 7.797 2.159 0.800 12.634
+Asp Asp PDH  3 6.811 38.486 4.490 7.703 1.361 7.797 2.159 0.800 12.634
+Lys Lys BS2G 2 1.988 11.083 3.851 1.155 5.098 6.018
+Lys Lys BS3  2 2.943 2.6020 5.435 2.562 1.320 8.838
+
+Calpha-SC-SC
+Xlinks       n  vt0    a1     b1      a2      b2        a3       b3      a4      b4      a5      b5       a6      b6
+Glu Glu ADH  3 14.942 2.010 -11.207 -5.40500 4.255000  2.1080  -3.83200
+             3 14.942 2.010 -11.207 -5.40500 4.255000  2.1080  -3.83200
+Glu Asp ADH  3 14.942 2.010 -11.207 -5.40500 4.255000  2.1080  -3.83200
+             3 12.360 2.002 -9.5410 -2.39400 2.144000  2.6400  -0.78500
+Asp Glu ADH  3 12.360 2.002 -9.5410 -2.39400 2.144000  2.6400  -0.78500
+             3 14.942 2.010 -11.207 -5.40500 4.255000  2.1080  -3.83200
+Asp Asp ADH  3 12.360 2.002 -9.5410 -2.39400 2.144000  2.6400  -0.78500
+             3 12.360 2.002 -9.5410 -2.39400 2.144000  2.6400  -0.78500
+Glu Glu PDH  3 12.254 2.261 -9.2560 -2.77800 2.383000  2.0560  -0.96900
+             3 12.254 2.261 -9.2560 -2.77800 2.383000  2.0560  -0.96900
+Glu Asp PDH  3 12.254 2.261 -9.2560 -2.77800 2.383000  2.0560  -0.96900
+             3 13.282 2.569 -9.4350 -3.89000 3.168000  1.7440  -2.62900
+Asp Glu PDH  3 13.282 2.569 -9.4350 -3.89000 3.168000  1.7440  -2.62900
+             3 12.254 2.261 -9.2560 -2.77800 2.383000  2.0560  -0.96900
+Asp Asp PDH  3 13.282 2.569 -9.4350 -3.89000 3.168000  1.7440  -2.62900
+             3 13.282 2.569 -9.4350 -3.89000 3.168000  1.7440  -2.62900
+Lys Lys BS2G 6  3.001 1.985 -30.788 -89.7250 283.1590 -12.632  -269.469 34.2420 47.6250 22.775 -76.32600 71.6070 46.108
+             6  3.001 1.985 -30.788 -89.7250 283.1590 -12.632  -269.469 34.2420 47.6250 22.775 -76.32600 71.6070 46.108
+Lys Lys BS3  6  2.680 0.553 -38.961 -453.759 1038.061 -6.3910  -867.092 136.004 363.329 9.5760 -1175.067 326.224 680.570
+             6  2.680 0.553 -38.961 -453.759 1038.061 -6.3910  -867.092 136.004 363.329 9.5760 -1175.067 326.224 680.570
+
+Calpha-SC-SC-Calpha
+Xlinks       n  V0     V1     V2
+Glu Glu ADH  2 4.031 -0.675 -0.105
+Glu Asp ADH  2 4.031 -0.675 -0.105
+Asp Glu ADH  2 4.087 -0.822 -0.121
+Asp Asp ADH  2 4.087 -0.822 -0.121
+Glu Glu PDH  2 4.069 -0.793 -0.056
+Glu Asp PDH  2 4.069 -0.793 -0.056
+Asp Glu PDH  2 4.043 -0.723 -0.053
+Asp Asp PDH  2 4.043 -0.723 -0.053
+Lys Lys BS2G 2 4.017 -0.662  0.057
+Lys Lys BS3  2 3.942 -0.314  0.164
diff --git a/PARAM/zn-param b/PARAM/zn-param

new file mode 100644 (file)

index 0000000..1a96d83
--- /dev/null
+++ b/PARAM/zn-param
@@ -0,0 +1,7 @@
+4
+4.8145165473 3.5528019374 3.2426142541 0.1142767990
+ 1.87522 1.85046 -0.64470 4.9954535118  3.7932544509  1.9933872463 -1.0921591284 0.0          0.00         0.00         1.69662189233974 -0.326393632332379 10.83 0.75  2.7 -1 -1
+ 3.64162 2.32415 -0.85998 11.1506843871 15.8228933951 13.5905673219 8.3590616586 6.3577371874 3.1112702080 2.6914479943 2.34588070776756 -0.499385994897528 8.22 2.0 2 2.5 2.3
+ 3.72238 2.49887 -0.70149 5.8726343445  6.9080612227  5.1499398383  2.3313407803 1.2221152324 0.00         0.00         1.82271008395223 -0.624308346384547 13.33 0.45 2.7 -1 -1
+ 6.13014 4.13445  0.67449 8.5600130976 10.8455773951 9.3360538054 4.9738498593 3.1673115608   0.00         0.00         2.02224064965703 -1.64432052951488 8.17 1.4 3.1 -1 -1
+
diff --git a/source/cluster/io_clust.F90 b/source/cluster/io_clust.F90

index 3b3a134..312b9f8 100644 (file)
--- a/source/cluster/io_clust.F90
+++ b/source/cluster/io_clust.F90
@@ -894,15 +894,15 @@
        call int_from_cart1(.false.)
        do j=nnt+1,nct-1
          mnum=molnum(j)
-!        write (iout,*) "Check atom",j
+        write (iout,*) "Check atom",j,itype(j,mnum),vbld(j)
          if (mnum.ne.1) cycle
          if (itype(j,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) cycle
-        if (itype(j+1,molnum(j+1)).eq.ntyp1_molec(molnum(j+1))) cycle
+        if (itype(j-1,molnum(j-1)).eq.ntyp1_molec(molnum(j-1))) cycle
  
          if ((vbld(j).lt.2.0d0 .or. vbld(j).gt.5.0d0).and.(mnum.ne.5)) then
           if (j.gt.2) then
            if (itel(j).ne.0 .and. itel(j-1).ne.0) then
-          write (iout,*) "Conformation",jjj,jj+1
+          write (iout,*) "Conformation",jjj,jj+1,itype(j-1,molnum(j-1)),itype(j,mnum)
            write (iout,*) "Bad CA-CA bond length",j," ",vbld(j),itel(j),&
         chalen
            write (iout,*) "The Cartesian geometry is:"
@@ -1281,7 +1281,10 @@
        use control_data, only: titel,outpdb,outmol2,refstr,pdbref,&
                   iscode,symetr,punch_dist,print_dist,nstart,nend,&
                   caonly,iopt,efree,lprint_cart,lprint_int,rlamb_ele,&
-                 r_cut_ele,nclust,tor_mode,scelemode
+                 r_cut_ele,nclust,tor_mode,scelemode,r_cut_mart,r_cut_ang,&
+                 rlamb_mart
+      use geometry_data, only:bordliptop,bordlipbot,&
+          bufliptop,buflipbot,lipthick,lipbufthick
  !      implicit none
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'sizesclu.dat'
@@ -1339,6 +1342,23 @@
        call reada(controlcard,'BOXX',boxxsize,100.0d0)
        call reada(controlcard,'BOXY',boxysize,100.0d0)
        call reada(controlcard,'BOXZ',boxzsize,100.0d0)
+      call reada(controlcard,"LIPTHICK",lipthick,0.0d0)
+      call reada(controlcard,"LIPAQBUF",lipbufthick,0.0d0)
+      if (lipthick.gt.0.0d0) then
+       bordliptop=(boxzsize+lipthick)/2.0
+       bordlipbot=bordliptop-lipthick
+      if ((bordliptop.gt.boxzsize).or.(bordlipbot.lt.0.0)) &
+      write(iout,*) "WARNING WRONG SIZE OF LIPIDIC PHASE"
+      buflipbot=bordlipbot+lipbufthick
+      bufliptop=bordliptop-lipbufthick
+      if ((lipbufthick*2.0d0).gt.lipthick) &
+       write(iout,*) "WARNING WRONG SIZE OF LIP AQ BUF"
+      endif !lipthick.gt.0
+      write(iout,*) "bordliptop=",bordliptop
+      write(iout,*) "bordlipbot=",bordlipbot
+      write(iout,*) "bufliptop=",bufliptop
+      write(iout,*) "buflipbot=",buflipbot
+
        call readi(controlcard,'NCLUST',nclust,5)
  !      ions=index(controlcard,"IONS").gt.0
        call readi(controlcard,"SCELEMODE",scelemode,0)
@@ -1349,6 +1369,9 @@
        call reada(controlcard,"R_CUT_ELE",r_cut_ele,25.0d0)
        call reada(controlcard,"LAMBDA_ELE",rlamb_ele,0.3d0)
        write(iout,*) "R_CUT_ELE=",r_cut_ele
+      call reada(controlcard,"R_CUT_MART",r_cut_mart,15.0d0)
+      call reada(controlcard,"LAMBDA_MART",rlamb_mart,0.3d0)
+      call reada(controlcard,"R_CUT_ANG",r_cut_ang,4.2d0)
        call readi(controlcard,'NEND',nend,0)
        call reada(controlcard,'ECUT',ecut,10.0d0)
        call reada(controlcard,'PROB',prob_limit,0.99d0)
@@ -1494,7 +1517,7 @@
        call reada(weightcard,'WSCPHO',wscpho,0.0d0)
        call reada(weightcard,'WPEPPHO',wpeppho,0.0d0)
        call reada(weightcard,'WCATNUCL',wcatnucl,0.0d0)
-
+      call reada(weightcard,'WCATTRAN',wcat_tran,0.0d0)
        call reada(weightcard,"D0CM",d0cm,3.78d0)
        call reada(weightcard,"AKCM",akcm,15.1d0)
        call reada(weightcard,"AKTH",akth,11.0d0)
@@ -1509,6 +1532,8 @@
        call reada(weightcard,"DTRISS",dtriss,1.001D0)
        call reada(weightcard,"SSSCALE",ssscale,1.0D0)
        dyn_ss=(index(weightcard,'DYN_SS').gt.0)
+      call reada(weightcard,"LIPSCALE",lipscale,1.0D0)
+      call reada(weightcard,"WTL",wliptran,1.0D0)
  
        call reada(weightcard,"HT",Ht,0.0D0)
        if (dyn_ss) then
@@ -1565,7 +1590,8 @@
            weights(48)=wpeppho
            weights(49)=wpeppho
            weights(50)=wcatnucl
-
+          weights(56)=wcat_tran
+          weights(22)=wliptran
  
        write (iout,10) wsc,wscp,welec,wvdwpp,wbond,wang,wscloc,wtor,&
          wtor_d,wstrain,wel_loc,wcorr,wcorr5,wcorr6,wturn3,&
@@ -1875,6 +1901,9 @@ write(iout,*)"po setup var"
        open (iion,file=ionname,status='old')
        call getenv('IONPAR_NUCL',ionnuclname)
        open (iionnucl,file=ionnuclname,status='old')
+      call getenv('IONPAR_TRAN',iontranname)
+      open (iiontran,file=iontranname,status='old')
+
  
  #ifndef OLDSCP
  !
@@ -1909,7 +1938,7 @@ write(iout,*)"po setup var"
        character(len=50) :: tytul
        character(len=1) :: chainid(10)=(/'A','B','C','D','E','F',&
                                                 'G','H','I','J'/)
-      integer :: ica(nres),k,iti1
+      integer :: ica(nres),k,iti1,ki
        real(kind=8) :: etot,rmsd
        integer :: iatom,ichain,ires,i,j,iti,mnum,mnum1,boxxxshift(3)
        real(kind=8) :: boxxxx(3),cbeg(3),Rdist(3)
@@ -1951,11 +1980,21 @@ write(iout,*)"po setup var"
            write (ipdb,'(a)') 'TER'
          else
          ires=ires+1
-        if ((ires.eq.2).and.(mnum.ne.5)) then
-         do j=1,3
-         cbeg(j)=c(j,i-1)
-         enddo
-        endif
+!         if (molnum(i).ge.1) then
+          if (i.le.3) then
+           ki=2
+          else
+          if (itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)) then
+          ki=ki+1
+          endif
+         endif
+!        endif
+!          print *,"tu2",i,k
+          if (itype(ki,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) ki=ki+1
+          if (itype(ki,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) ki=ki+1
+        do j=1,3
+        cbeg(j)=c(j,ki)
+        enddo
          iatom=iatom+1
          ica(i)=iatom
          call to_box(c(1,i),c(2,i),c(3,i))
diff --git a/source/unres/MD.F90 b/source/unres/MD.F90

index 3bb57e0..983c469 100644 (file)
--- a/source/unres/MD.F90
+++ b/source/unres/MD.F90
@@ -663,7 +663,7 @@
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
        real(kind=8) :: KE_total,mscab
                                                               
-      integer :: i,j,k,iti,mnum
+      integer :: i,j,k,iti,mnum,term
        real(kind=8) :: KEt_p,KEt_sc,KEr_p,KEr_sc,incr(3),&
         mag1,mag2,v(3) 
  #ifdef DEBUG
@@ -680,13 +680,21 @@
        do j=1,3
          incr(j)=d_t(j,0)
        enddo
-      do i=nnt,nct-1
+      term=nct-1
+!      if (molnum(nct).gt.3) term=nct
+      do i=nnt,term
         mnum=molnum(i)
-       if (mnum.eq.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
-!        write (iout,*) "Kinetic trp:",i,(incr(j),j=1,3) 
+       if (mnum.ge.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
+!        write (iout,*) "Kinetic trp:",i,(incr(j),j=1,3),mp(mnum) 
+        if (mnum.gt.4) then
+        do j=1,3
+          v(j)=incr(j)+d_t(j,i)
+        enddo
+        else
          do j=1,3
            v(j)=incr(j)+0.5d0*d_t(j,i)
-       enddo
+        enddo
+        endif
          vtot(i)=v(1)*v(1)+v(2)*v(2)+v(3)*v(3)
          KEt_p=KEt_p+mp(mnum)*(v(1)*v(1)+v(2)*v(2)+v(3)*v(3))           
          do j=1,3
@@ -703,14 +711,14 @@
        do i=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
          iti=iabs(itype(i,mnum))
-        if (mnum.eq.5) then
-         mscab=0.0d0
-        else
+!        if (mnum.ge.4) then
+!         mscab=0.0d0
+!        else
           mscab=msc(iti,mnum)
-        endif
+!        endif
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).eq.10 .or. itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)&
-          .or.(mnum.eq.5)) then
+          .or.(mnum.ge.4)) then
            do j=1,3
              v(j)=incr(j)
           enddo   
@@ -720,7 +728,7 @@
           enddo
          endif
  !        write (iout,*) "Kinetic trsc:",i,(incr(j),j=1,3) 
-!        write (iout,*) "i",i," msc",msc(iti)," v",(v(j),j=1,3) 
+!        write (iout,*) "i",i," msc",msc(iti,mnum)," v",(v(j),j=1,3) 
          KEt_sc=KEt_sc+mscab*(v(1)*v(1)+v(2)*v(2)+v(3)*v(3))            
          vtot(i+nres)=v(1)*v(1)+v(2)*v(2)+v(3)*v(3)
          do j=1,3
@@ -751,7 +759,7 @@
          iti=iabs(itype(i,mnum))
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
          do j=1,3
           incr(j)=d_t(j,nres+i)
         enddo
@@ -989,8 +997,9 @@
          itime_mat=itime
          if (ntwe.ne.0) then
           if (mod(itime,ntwe).eq.0) then
+           call returnbox
              call statout(itime)
-            call returnbox
+!            call returnbox
  !            call  check_ecartint 
           endif
  #ifdef VOUT
@@ -1006,7 +1015,7 @@
          enddo
          do i=nnt,nct
            mnum=molnum(i)
-          if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1.and.mnum.ne.5) then
+          if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1.and.mnum.lt.4) then
              do j=1,3
                ind=ind+1
                v_work(ind)=d_t(j,i+nres)
@@ -1836,7 +1845,7 @@
           mnum=molnum(i)
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            inres=i+nres
            do j=1,3
              d_t(j,inres)=d_t(j,inres)+0.5d0*d_a(j,inres)*d_time
@@ -1891,7 +1900,7 @@
           mnum=molnum(i)
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            inres=i+nres
            do j=1,3    
              adt=d_a_old(j,inres)*d_time
@@ -1942,7 +1951,7 @@
  !        iti=iabs(itype(i,mnum))
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            inres=i+nres
            do j=1,3
              d_t(j,inres)=d_t_new(j,inres)+0.5d0*d_a(j,inres)*d_time
@@ -2053,7 +2062,7 @@
  !        iti=iabs(itype(i,mnum))
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            inres=i+nres
            do j=1,3    
              adt=(d_a_old(j,inres)+d_af_work(ind+j))*d_time
@@ -2126,7 +2135,7 @@
  !        iti=iabs(itype(i,mnum))
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            inres=i+nres
            do j=1,3
              d_t(j,inres)=d_t_new(j,inres)+(0.5d0*(d_a(j,inres) &
@@ -2200,7 +2209,7 @@
  !        iti=iabs(itype(i,mnum))
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            do j=1,3 
  !            accel(j)=accel(j)+d_a(j,i+nres)-d_a_old(j,i+nres)
              accel_old(j)=accel_old(j)+d_a_old(j,i+nres)
@@ -2258,7 +2267,7 @@
          endif
  ! Side chains
          if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1.and.&
-        molnum(i).ne.5) then
+        molnum(i).lt.4) then
            do j=1,3 
              epdriftij= &
               dabs((d_a(j,i+nres)-d_a_old(j,i+nres))*gxcart(j,i))
@@ -2311,7 +2320,7 @@
  !        iti=iabs(itype(i,mnum))
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            inres=i+nres
            do j=1,3
              d_t(j,inres)=fact*d_t(j,inres)
@@ -2553,9 +2562,13 @@
             call minimize(etot,varia,iretcode,nfun)
             call var_to_geom(nvar,varia)
            endif
+            write(iout,*) "just before minimin"
+          call cartprint
            if(me.eq.king.or..not.out1file) &
               write(iout,*) 'SUMSL return code is',iretcode,' eval ',nfun
           endif
+          write(iout,*) "just after minimin"
+          call cartprint
           if(iranconf.ne.0) then
  !c 8/22/17 AL Loop to produce a low-energy random conformation
            DO iranmin=1,40
@@ -2584,7 +2597,8 @@
            endif
            if(me.eq.king.or..not.out1file) &
              write(iout,*) 'SUMSL return code is',iretcode,' eval ',nfun
-
+            write(iout,*) "just after minimin"
+          call cartprint
            if (isnan(etot) .or. etot.gt.4.0d6) then
              write (iout,*) "Energy too large",etot, &
               " trying another random conformation"
@@ -2638,11 +2652,14 @@
        endif      
        call chainbuild_cart
        call kinetic(EK)
+            write(iout,*) "just after kinetic"
+          call cartprint
        if (tbf) then
          call verlet_bath
        endif     
        kinetic_T=2.0d0/(dimen3*Rb)*EK
        if(me.eq.king.or..not.out1file)then
+            write(iout,*) "just after verlet_bath"
         call cartprint
         call intout
        endif
@@ -3047,11 +3064,11 @@
        do i=nnt,nct
  !        if (itype(i,1).eq.10) then
           mnum=molnum(i)
-          if (mnum.eq.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
+          if (mnum.ge.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
          iti=iabs(itype(i,mnum))
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).eq.10 .or. itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)&
-          .or.(mnum.eq.5)) then
+          .or.(mnum.ge.4)) then
            j=ii+3
          else
            j=ii+6
@@ -3064,14 +3081,14 @@
            enddo
          endif
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) ii=ii+3
+          .and.(mnum.lt.4)) ii=ii+3
          write (iout,*) "i",i," itype",itype(i,mnum)," mass",msc(itype(i,mnum),mnum)
          write (iout,*) "ii",ii
          do k=1,3
            ii=ii+1
            write (iout,*) "k",k," ii",ii,"EK1",EK1
            if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5))&
+          .and.(mnum.lt.4))&
             Ek1=Ek1+0.5d0*Isc(iabs(itype(i,mnum)),mnum)*(d_t_work(ii)-d_t_work(ii-3))**2
            Ek1=Ek1+0.5d0*msc(iabs(itype(i,mnum)),mnum)*d_t_work(ii)**2
          enddo
@@ -3099,7 +3116,7 @@
          enddo
           mnum=molnum(j)
           if (itype(j,1).ne.10 .and. itype(j,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            do k=1,3
              d_t(k,j+nres)=d_t_work(ind)
              ind=ind+1
@@ -3122,7 +3139,7 @@
  !        if (itype(i,1).eq.10) then
           mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).eq.10 .or. itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)&
-          .or.(mnum.eq.5)) then
+          .or.(mnum.ge.4)) then
            do j=1,3
              d_t(j,i)=d_t(j,i+1)-d_t(j,i)
            enddo
@@ -3173,7 +3190,7 @@
           mnum=molnum(i)
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            do j=1,3
              ind=ind+1
              d_t(j,i+nres)=d_t_work(ind)
@@ -3417,7 +3434,7 @@
           mnum=molnum(i)
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            do j=1,3
              dc_work(ind+j)=dc_old(j,i+nres)
              d_t_work(ind+j)=d_t_old(j,i+nres)
@@ -3468,7 +3485,7 @@
           mnum=molnum(i)
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            inres=i+nres
            do j=1,3
              dc(j,inres)=dc_work(ind+j)
@@ -3537,7 +3554,7 @@
           mnum=molnum(i)
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            inres=i+nres
            do j=1,3
              d_t(j,inres)=d_t_work(ind+j)
@@ -3718,8 +3735,8 @@
          " vrand_mat2"
        do i=1,dimen
          do j=1,dimen
-          write (iout,'(2i5,6e15.5)') i,j,pfric_mat(i,j),&
-            vfric_mat(i,j),afric_mat(i,j),&
+                 write (iout,'(2i5,6e15.5)') i,j,pfric_mat(i,j),&
+                   vfric_mat(i,j),afric_mat(i,j),&
              prand_mat(i,j),vrand_mat1(i,j),vrand_mat2(i,j)
          enddo
        enddo
@@ -3753,7 +3770,7 @@
           mnum=molnum(i)
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            inres=i+nres
            do j=1,3
              dc(j,inres)=dc_work(ind+j)
@@ -3821,7 +3838,7 @@
        do i=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5))
+          .and.(mnum.lt.4))
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
            inres=i+nres
            do j=1,3
@@ -3879,9 +3896,10 @@
          M_PEP=0.0d0
          do i=nnt,nct-1
            mnum=molnum(i)
-          if (mnum.eq.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
-          if (itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) cycle
+          if (mnum.ge.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
+!          if (itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) cycle
            M_PEP=M_PEP+mp(mnum)
+       
            do j=1,3
              cm(j)=cm(j)+(c(j,i)+0.5d0*dc(j,i))*mp(mnum)
            enddo
@@ -3892,7 +3910,7 @@
          M_SC=0.0d0                             
          do i=nnt,nct
             mnum=molnum(i)
-           if (mnum.eq.5) cycle
+           if (mnum.ge.5) cycle
             iti=iabs(itype(i,mnum))              
            M_SC=M_SC+msc(iabs(iti),mnum)
             inres=i+nres
@@ -3906,7 +3924,7 @@
         
          do i=nnt,nct-1
             mnum=molnum(i)
-          if (mnum.eq.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
+          if (mnum.ge.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
            do j=1,3
              pr(j)=c(j,i)+0.5d0*dc(j,i)-cm(j)
            enddo
@@ -3921,7 +3939,7 @@
         do i=nnt,nct    
             mnum=molnum(i)
             iti=iabs(itype(i,mnum))
-           if (mnum.eq.5) cycle
+           if (mnum.ge.5) cycle
             inres=i+nres
             do j=1,3
               pr(j)=c(j,inres)-cm(j)        
@@ -3955,7 +3973,7 @@
                mnum=molnum(i)
  !         if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
             iti=iabs(itype(i,mnum))              
             inres=i+nres
            Im(1,1)=Im(1,1)+Isc(iti,mnum)*(1-dc_norm(1,inres)* &
@@ -4034,13 +4052,15 @@
         do i=nnt,nct-1
           call vecpr(vrot(1),dc(1,i),vp)  
          do j=1,3
+!           print *,"HERE2",d_t(j,i),vp(j)
             d_t(j,i)=d_t(j,i)-vp(j)
+!           print *,"HERE2",d_t(j,i),vp(j)
            enddo
          enddo
          do i=nnt,nct 
                mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
  !         if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)) then
  !       if(itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
             inres=i+nres
@@ -4084,7 +4104,7 @@
         enddo                  
         do i=nnt,nct-1
            mnum=molnum(i)
-          if (mnum.eq.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
+          if (mnum.ge.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
            do j=1,3
              pr(j)=c(j,i)+0.5d0*dc(j,i)-cm(j)
            enddo
@@ -4097,12 +4117,14 @@
            call vecpr(pr(1),v(1),vp)
            do j=1,3
              L(j)=L(j)+mp(mnum)*vp(j)
+!            print *,"HERE3",J,i,L(j),mp(mnum),Ip(mnum),mnum
            enddo
            do j=1,3
               pr(j)=0.5d0*dc(j,i)
               pp(j)=0.5d0*d_t(j,i)                
            enddo
           call vecpr(pr(1),pp(1),vp)
+!         print *,vp,"vp"
           do j=1,3               
               L(j)=L(j)+Ip(mnum)*vp(j)   
            enddo
@@ -4114,7 +4136,7 @@
            mnum=molnum(i)
           iti=iabs(itype(i,mnum))
           inres=i+nres
-        if (mnum.eq.5) then
+        if (mnum.gt.4) then
           mscab=0.0d0
          else
           mscab=msc(iti,mnum)
@@ -4122,8 +4144,9 @@
           do j=1,3
             pr(j)=c(j,inres)-cm(j)          
           enddo
+         !endif
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
             do j=1,3
               v(j)=incr(j)+d_t(j,inres)
             enddo
@@ -4132,6 +4155,7 @@
               v(j)=incr(j)
             enddo
           endif
+!         print *,i,pr,"pr",v
           call vecpr(pr(1),v(1),vp)
  !         write (iout,*) "i",i," iti",iti," pr",(pr(j),j=1,3),&
  !           " v",(v(j),j=1,3)," vp",(vp(j),j=1,3)
@@ -4139,8 +4163,10 @@
              L(j)=L(j)+mscab*vp(j)
           enddo
  !         write (iout,*) "L",(l(j),j=1,3)
+!          print *,"L",(l(j),j=1,3),i,vp(1)
+
           if (itype(i,mnum).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            do j=1,3
              v(j)=incr(j)+d_t(j,inres)
             enddo
@@ -4180,21 +4206,22 @@
         summas=0.0d0
         do i=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
-         if (mnum.eq.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
+         if (mnum.ge.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
           if (i.lt.nct) then
             summas=summas+mp(mnum)
             do j=1,3
               vcm(j)=vcm(j)+mp(mnum)*(vv(j)+0.5d0*d_t(j,i))
+!             print *,i,j,vv(j),d_t(j,i)
             enddo
           endif
-         if (mnum.ne.5) then 
+         if (mnum.ne.4) then 
           amas=msc(iabs(itype(i,mnum)),mnum)
           else
           amas=0.0d0
           endif
           summas=summas+amas                     
           if (itype(i,mnum).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
             do j=1,3
               vcm(j)=vcm(j)+amas*(vv(j)+d_t(j,i+nres))
             enddo
@@ -4265,7 +4292,7 @@
        do i=nnt,nct
         mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) nbond=nbond+1
+          .and.(mnum.lt.4)) nbond=nbond+1
        enddo
  ! Make a folded form of the Ginv-matrix
        ind=0
@@ -4286,7 +4313,7 @@
            do k=nnt,nct
            mnum=molnum(k)
           if (itype(k,1).ne.10 .and. itype(k,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
                jj=jj+1
                do l=1,3
                  ind1=ind1+1
@@ -4299,7 +4326,7 @@
        do i=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5))
+          .and.(mnum.lt.4))
            ii=ii+1
            do j=1,3
              ind=ind+1
@@ -4397,7 +4424,7 @@
          do i=nnt,nct
            mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
  
              ind=ind+1
              write (iout,'(2i5,3f10.5,5x,e15.5)') &
@@ -4480,7 +4507,7 @@
          do i=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5))
+          .and.(mnum.lt.4))
              ind=ind+1
              xx=vbld(i+nres)**2-vbldsc0(1,itype(i,1))**2
              write (iout,'(i5,3f10.5,5x,f10.5,e15.5)') &
@@ -4572,7 +4599,7 @@
          do k=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
              ind=ind+1
              do j=1,3
                gdc(j,i,ind)=GGinv(i,ind)*dC(j,k+nres)
@@ -4603,7 +4630,7 @@
        do i=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            ind=ind+1
            do j=1,nbond
              Cmat(ind,j)=0.0d0
@@ -4622,7 +4649,7 @@
        do i=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            ind=ind+1
            x(ind)=scalar(d_t(1,i+nres),dC(1,i+nres))
          endif
@@ -4638,7 +4665,7 @@
          do i=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
              ind=ind+1
              write (iout,'(2i5,3f10.5,5x,e15.5)') &
               i+nres,ind,(d_t(j,i+nres),j=1,3),x(ind)
@@ -4675,7 +4702,7 @@
        do i=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5)) then
+          .and.(mnum.lt.4)) then
            ind=ind+1
            do j=1,3
              xx=0.0d0
@@ -4698,7 +4725,7 @@
          do i=nnt,nct
           mnum=molnum(i)
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.(mnum.ne.5))
+          .and.(mnum.lt.4))
              ind=ind+1
              write (iout,'(2i5,3f10.5,5x,2e15.5)') &
                i+nres,ind,(d_t(j,i+nres),j=1,3),x(ind),&
@@ -5063,7 +5090,7 @@
        do i=nnt,nct
          mnum=molnum(i)
          if ((itype(i,1).ne.10).and.(itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum))&
-        .and.(mnum.ne.5)) then
+        .and.(mnum.lt.4)) then
            do j=1,3
              d_t_work(ind+j)=d_t(j,i+nres)
            enddo
@@ -5094,7 +5121,7 @@
        do i=nnt,nct
          mnum=molnum(i)
          if ((itype(i,1).ne.10).and.(itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum))&
-        .and.(mnum.ne.5)) then
+        .and.(mnum.lt.4)) then
  !        if ((itype(i,1).ne.10).and.(itype(i,1).ne.ntyp1)) then
            do j=1,3
              friction(j,i+nres)=fric_work(ind+j)
@@ -5253,6 +5280,12 @@
          ind1=ind1+1
          gamvec(ind1)=gamp(mnum)
        enddo
+!HERE TEST
+      if (molnum(nct).eq.5) then
+        mnum=molnum(i)
+        ind1=ind1+1
+        gamvec(ind1)=gamp(mnum)
+      endif
  !  Load the friction coefficients corresponding to side chains
        m=nct-nnt
        ind=0
@@ -5521,7 +5554,7 @@
        do i=nnt,nct
          mnum=molnum(i)
          if ((itype(i,1).ne.10).and.(itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum))&
-        .and.(mnum.ne.5)) then
+        .and.(mnum.lt.4)) then
  !        if ((itype(i,1).ne.10).and.(itype(i,1).ne.ntyp1)) then
            do j=1,3
              stochforc(j,i+nres)=force(j,i+nres)
@@ -5542,7 +5575,7 @@
        do i=nnt,nct
          mnum=molnum(i)
          if ((itype(i,1).ne.10).and.(itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum))&
-        .and.(mnum.ne.5)) then
+        .and.(mnum.lt.4)) then
  !        if ((itype(i,1).ne.10).and.(itype(i,1).ne.ntyp1)) then
            do j=1,3
              stochforcvec(ind+j)=stochforc(j,i+nres)
diff --git a/source/unres/MREMD.F90 b/source/unres/MREMD.F90

index 003d67b..e9297eb 100644 (file)
--- a/source/unres/MREMD.F90
+++ b/source/unres/MREMD.F90
@@ -571,7 +571,15 @@
          itime_mat=itime
          if(ntwe.ne.0) then
            if (mod(itime,ntwe).eq.0) then
+!              energy_dec=.true.
+!              write(iout,*) "before returnbox"
+!              call etotal(potEcomp)
+!              call enerprint(potEcomp)
+              call returnbox
+!              write(iout,*) "after returnbox"
                call statout(itime)
+!              call etotal(potEcomp)
+!              energy_dec=.false.
                call enerprint(potEcomp)
            endif
          endif
@@ -582,6 +590,7 @@
               call secondary2(.true.)
               call pdbout(potE,tytul,ipdb)
            else 
+              call returnbox
               call cartout(totT)
            endif
          endif
diff --git a/source/unres/REMD.F90 b/source/unres/REMD.F90

index 699631c..f8e75f6 100644 (file)
--- a/source/unres/REMD.F90
+++ b/source/unres/REMD.F90
@@ -63,7 +63,7 @@
          write (iout,*) "Potential forces sidechain"
          do i=nnt,nct
            mnum=molnum(i)
-          if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1.and.mnum.eq.5)&
+          if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1.and.mnum.lt.4)&
              write (iout,'(i5,3e15.5,5x,3e15.5)') i,(-gxcart(j,i),j=1,3)
          enddo
        endif
@@ -71,7 +71,7 @@
           ind=1
           do i=nnt,nct
             mnum=molnum(i)     
-           if (itype(i,1).eq.10 .or. itype(i,1).eq.ntyp1 .or. mnum.eq.5)then
+           if (itype(i,1).eq.10 .or. itype(i,1).eq.ntyp1 .or. mnum.ge.4)then
             rs(ind)=-gcart(j,i)-gxcart(j,i)
              ind=ind+1
            else
@@ -125,7 +125,7 @@
          ind=1
           do i=nnt,nct
            mnum=molnum(i)
-         if (itype(i,1).eq.10 .or. itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum))then 
+         if (itype(i,1).eq.10 .or. itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum).or. mnum.ge.4)then 
            d_a(j,i)=xsolv(ind)
            ind=ind+1
           else
@@ -149,7 +149,7 @@
         do i=nnt,nct
            mnum=molnum(i)
  !         if (itype(i,1).eq.10 .or. itype(i,1).eq.ntyp1) then
-          if (itype(i,1).eq.10 .or. itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum))then
+          if (itype(i,1).eq.10 .or. itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum).or. mnum.ge.4)then
             do j=1,3
              d_a(j,i)=d_a(j,i+1)-d_a(j,i)
             enddo
@@ -195,7 +195,7 @@
        do i=nnt,nct
            mnum=molnum(i)
          if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.mnum.ne.5) then
+          .and.mnum.lt.4) then
            if (lprn) write (iout,'(i5,3e15.5,5x,3e15.5)') &
               i,(-gxcart(j,i),j=1,3)
            do j=1,3
@@ -221,7 +221,7 @@
         mnum=molnum(i)
  !        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,1).ne.ntyp1) then
           if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)&
-          .and.mnum.ne.5) then
+          .and.mnum.lt.4) then
            do j=1,3
              ind=ind+1
              d_a(j,i+nres)=d_a_work(ind)
@@ -361,7 +361,7 @@
  !         if (iabs(itype(i,1)).eq.ntyp1) cycle
           DM(ind)=2*ip4+mp/2
          if (iabs(itype(i,1)).eq.10 .or. &
-          iabs(itype(i,mnum)).eq.ntyp1_molec(mnum) .or. mnum.eq.5) then
+          iabs(itype(i,mnum)).eq.ntyp1_molec(mnum) .or. mnum.ge.4) then
             if (iabs(itype(i,1)).eq.10) DM(ind)=DM(ind)+msc(10)
             ind=ind+1
           else
@@ -387,7 +387,7 @@
          do i=nnt,nct
          mnum=molnum(i)
         if (iabs(itype(i,1)).ne.10 .and.iabs(itype((i))).ne.ntyp1 &
-          .and.mnum.eq.5) then
+          .and.mnum.lt.4) then
            DU1(ind)=-isc(iabs(itype(i,1)))
            DU1(ind+1)=0.0d0
           ind=ind+2
@@ -403,7 +403,7 @@
  !        if (iabs(itype(i,1)).eq.ntyp1) cycle
          write (iout,*) "i",i," itype",itype(i,1),ntyp1
         if (iabs(itype(i,1)).ne.10 .and. &
-          iabs(itype(i,mnum)).ne.ntyp1_molec(mnum) .and. mnum.ne.5) then
+          iabs(itype(i,mnum)).ne.ntyp1_molec(mnum) .and. mnum.lt.4) then
           DU2(ind)=mp/4-ip4
           DU2(ind+1)=0.0d0
           ind=ind+2
@@ -416,13 +416,14 @@
  #else
         ip4=ip(1)/4
         DM(1)=mp(1)/4+ip4
+       mnum=molnum(nnt)
         if (iabs(itype(nnt,1)).eq.10) then
           DM(1)=DM(1)+msc(10,1)
           ind=2
           nind=1
         else
-         DM(1)=DM(1)+isc(iabs(itype(nnt,1)),1)
-         DM(2)=msc(iabs(itype(nnt,1)),1)+isc(iabs(itype(nnt,1)),1)
+         DM(1)=DM(1)+isc(iabs(itype(nnt,mnum)),mnum)
+         DM(2)=msc(iabs(itype(nnt,mnum)),mnum)+isc(iabs(itype(nnt,mnum)),mnum)
           ind=3
           nind=2
         endif     
@@ -431,12 +432,13 @@
           mnum=molnum(i)
           DM(ind)=2*ip4+mp(1)/2
         if (iabs(itype(i,1)).eq.10 .or. &
-          iabs(itype(i,mnum)).eq.ntyp1_molec(mnum) .or. mnum.eq.5) then
+          iabs(itype(i,mnum)).eq.ntyp1_molec(mnum) .or. mnum.ge.4) then
             if (iabs(itype(i,1)).eq.10) DM(ind)=DM(ind)+msc(10,1)
+           if (mnum.eq.5) DM(ind)=DM(ind)+msc(itype(i,mnum),mnum)
             ind=ind+1
           else
-           DM(ind)=DM(ind)+isc(iabs(itype(i,1)),1)
-           DM(ind+1)=msc(iabs(itype(i,1)),1)+isc(iabs(itype(i,1)),1)
+           DM(ind)=DM(ind)+isc(iabs(itype(i,mnum)),mnum)
+           DM(ind+1)=msc(iabs(itype(i,mnum)),mnum)+isc(iabs(itype(i,mnum)),mnum)
             ind=ind+2
           endif 
         enddo
@@ -446,8 +448,9 @@
           DM(ind)=DM(ind)+msc(10,1)
           nind=ind
         else
-         DM(ind)=DM(ind)+isc(iabs(itype(nct,1)),1)
-         DM(ind+1)=msc(iabs(itype(nct,1)),1)+isc(iabs(itype(nct,1)),1)
+         mnum=molnum(nct)
+         DM(ind)=DM(ind)+isc(iabs(itype(nct,mnum)),mnum)
+         DM(ind+1)=msc(iabs(itype(nct,mnum)),mnum)+isc(iabs(itype(nct,mnum)),mnum)
           nind=ind+1
         endif
          endif
@@ -459,11 +462,14 @@
  !       if (iabs(itype(i,1)).ne.10 .and.iabs(itype(i,mnum)).ne.ntyp1 &
  !          .and.mnum.eq.5) then
         if (iabs(itype(i,1)).ne.10 .and. &
-          iabs(itype(i,mnum)).ne.ntyp1_molec(mnum) .and. mnum.ne.5) then
+          iabs(itype(i,mnum)).ne.ntyp1_molec(mnum) .and. mnum.lt.4) then
            DU1(ind)=-isc(iabs(itype(i,1)),1)
            DU1(ind+1)=0.0d0
           ind=ind+2
         else
+         if (mnum.eq.5) then
+         DU1(ind)=msc(itype(i,mnum),5))
+         else
           DU1(ind)=mp(1)/4-ip4
           ind=ind+1
         endif
@@ -475,7 +481,7 @@
  !        if (iabs(itype(i,1)).eq.ntyp1) cycle
          write (iout,*) "i",i," itype",itype(i,1),ntyp1
         if (iabs(itype(i,1)).ne.10 .and. &
-          iabs(itype(i,mnum)).ne.ntyp1_molec(mnum) .and. mnum.ne.5) then
+          iabs(itype(i,mnum)).ne.ntyp1_molec(mnum) .and. mnum.lt.4) then
           DU2(ind)=mp(1)/4-ip4
           DU2(ind+1)=0.0d0
           ind=ind+2
@@ -599,8 +605,9 @@
          ind=ind+1
          ind1=ind1+1
          coeff=0.25d0*IP(mnum)
-        if (mnum.eq.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
-        print *,i,coeff,mp(mnum)
+        print *,"TU",i,itype(i,mnum),mnum
+        if (mnum.ge.5) mp(mnum)=msc(itype(i,mnum),mnum)
+        print *,"TU2",i,coeff,mp(mnum)
          massvec(ind1)=mp(mnum)
          Gmat(ind,ind)=coeff
  !        print *,"i",mp(mnum)
@@ -622,6 +629,9 @@
        do i=1,2
        msc(ntyp1_molec(i),i)=1.0d0
        enddo
+      msc(ntyp1_molec(4),4)=1.0d0
+!      print *,"TU3",ntyp1_molec(4)-1
+       msc(ntyp1_molec(4)-1,4)=1.0d0
        do i=nnt,nct
          ind=ind+1
          ii = ind+m
@@ -634,7 +644,7 @@
  !        endif
          massvec(ii)=mscab
  
-        if (iti.ne.10 .and. iti.ne.ntyp1_molec(mnum) .and. mnum.ne.5) then
+        if (iti.ne.10 .and. iti.ne.ntyp1_molec(mnum) .and. mnum.lt.4) then
            ind1=ind1+1
            ii1= ind1+m1
            A(ii,ii1)=1.0d0
@@ -645,7 +655,8 @@
        ind=0
        k=nct-nnt
        do i=nnt,nct
-        iti=itype(i,1)
+        mnum=molnum(i)
+        iti=itype(i,mnum)
          ind=ind+1
          do j=nnt,i
            ii = ind
@@ -698,7 +709,7 @@
        do i=nnt,nct
          mnum=molnum(i)
          if ((itype(i,1).eq.10).or.(itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum))&
-          .or.(mnum.eq.5)) then
+          .or.(mnum.ge.4)) then
            Bmat(i-nnt+2,j-1)=-1
            Bmat(i-nnt+2,j)=1
            j=j+1
@@ -771,6 +782,8 @@
  #endif
        if (osob) then
          write (iout,*) "The G matrix is singular."
+        write (iout,'(//a)') "Gmat-transformed"
+        call matout(dimen,dimen,nres2,nres2,Gcopy)
          stop
        endif
  ! Compute G**(-1/2) and G**(1/2) 
diff --git a/source/unres/compare.F90 b/source/unres/compare.F90

index 45ed3e5..1199b65 100644 (file)
--- a/source/unres/compare.F90
+++ b/source/unres/compare.F90
@@ -311,7 +311,7 @@
        ncont=0
        ees=0.0
        evdw=0.0
-      print *, "nntt,nct",nnt,nct-2
+!      print *, "nntt,nct",nnt,nct-2
        do 1 i=nnt,nct-2
          if (itype(i,1).eq.ntyp1 .or. itype(i+1,1).eq.ntyp1) goto 1
          xi=c(1,i)
@@ -504,7 +504,7 @@
        enddo
  
        call elecont(lprint,ncont,icont)
-      print *,"after elecont"
+!      print *,"after elecont"
        if (nres_molec(1).eq.0) return
  
  ! finding parallel beta
@@ -861,7 +861,7 @@
  
  !el local variables
        real(kind=8) :: drms,rminroz,roznica
-      integer :: i,j,iatom,kkk,iti,k
+      integer :: i,j,iatom,kkk,iti,k,mnum
  
  !el      allocate(ccopy(3,2*nres+2),crefcopy(3,2*nres+2))      !(3,maxres2+2) maxres2=2*maxres
  
@@ -892,15 +892,18 @@
  !      else
  !      do kkk=1,nperm
        iatom=0
-      print *,nz_start,nz_end,nstart_seq-nstart_sup
+!      print *,nz_start,nz_end,nstart_seq-nstart_sup
        do i=nz_start,nz_end
+!        iatom=iatom+1
+        iti=itype(i+nstart_seq-nstart_sup,molnum(i))
+        if (iti.eq.ntyp1_molec(molnum(i))) cycle
          iatom=iatom+1
-        iti=itype(i,1)
+        mnum=molnum(i+nstart_seq-nstart_sup)
          do k=1,3
           ccopy(k,iatom)=c(k,i+nstart_seq-nstart_sup)
           crefcopy(k,iatom)=cref(k,i,kkk)
          enddo
-        if (iz_sc.eq.1.and.iti.ne.10) then
+        if (iz_sc.eq.1.and.iti.ne.10.and.mnum.lt.4) then
            iatom=iatom+1
            do k=1,3
             ccopy(k,iatom)=c(k,nres+i+nstart_seq-nstart_sup)
@@ -4546,19 +4549,19 @@
        if(.not.allocated(bfrag)) allocate(bfrag(4,nres/3)) !(4,maxres/3)
        if(.not.allocated(hfrag)) allocate(hfrag(2,nres/3)) !(2,maxres/3)
  !      COMMON /WAGI/
-      allocate(w(maxres22),d0(maxres22)) !(maxres22)
+      if(.not.allocated(w)) allocate(w(maxres22),d0(maxres22)) !(maxres22)
  !      COMMON /POCHODNE/
  !el      allocate(DRDG(maxres22,maxres22)) !(MAXRES22,MAXRES)
-      allocate(DDD(maxres22))  !(maxres22)
-      allocate(H(nres,nres)) !(MAXRES,MAXRES)
-      allocate(XX(nres)) !(MAXRES)
+      if (.not.allocated(DDD)) allocate(DDD(maxres22)) !(maxres22)
+      if (.not.allocated(H)) allocate(H(nres,nres)) !(MAXRES,MAXRES)
+      if (.not.allocated(XX)) allocate(XX(nres)) !(MAXRES)
  !      COMMON /frozen/
-      allocate(mask(nres)) !(maxres)
+      if (.not.allocated(mask)) allocate(mask(nres)) !(maxres)
  ! common.thread
  !      common /thread/
-      allocate(iexam(2,maxthread),ipatt(2,maxthread)) !(2,maxthread)
+      if (.not.allocated(iexam))allocate(iexam(2,maxthread),ipatt(2,maxthread)) !(2,maxthread)
  !      common /thread1/
-      allocate(ener0(n_ene+2,maxthread),ener(n_ene+2,maxthread)) !(n_ene+2,maxthread)
+      if (.not.allocated(ener0)) allocate(ener0(n_ene+2,maxthread),ener(n_ene+2,maxthread)) !(n_ene+2,maxthread)
  
        return
        end subroutine alloc_compare_arrays
diff --git a/source/unres/control.F90 b/source/unres/control.F90

index 1952c9a..828a199 100644 (file)
--- a/source/unres/control.F90
+++ b/source/unres/control.F90
@@ -244,10 +244,15 @@
        isidep_peppho=144
  
        iliptranpar=60
+      
        itube=61
+!     LIPID MARTINI
+      ilipbond=301
+      ilipnonbond=302
  !     IONS
        iion=401
        iionnucl=402
+      iiontran=403 ! this is parameter file for transition metals
  #if defined(WHAM_RUN) || defined(CLUSTER)
  !
  ! setting the mpi variables for WHAM
@@ -509,12 +514,13 @@
              nscp_int_tot,my_scp_inds,my_scp_inde,ind_scpint,&
              ind_scpint_old,nsumgrad,nlen,ngrad_start,ngrad_end,&
              ierror,k,ierr,iaux,ncheck_to,ncheck_from,ind_typ,&
-            ichunk,int_index_old
+            ichunk,int_index_old,ibra
        integer :: nele_int_tot_nucl,my_ele_inds_nucl,my_ele_inde_nucl,&
              ind_eleint_old_nucl,ind_eleint_nucl,nele_int_tot_vdw_nucl,&
              my_ele_inds_vdw_nucl,my_ele_inde_vdw_nucl,ind_eleint_vdw_nucl,&
              ind_eleint_vdw_old_nucl,nscp_int_tot_nucl,my_scp_inds_nucl,&
              my_scp_inde_nucl,ind_scpint_nucl,ind_scpint_old_nucl,impishi
+       integer,dimension(nres,nres) :: remmat
  !      integer,dimension(5) :: nct_molec,nnt_molec
  !el      allocate(itask_cont_from(0:nfgtasks-1)) !(0:max_fg_procs-1)
  !el      allocate(itask_cont_to(0:nfgtasks-1)) !(0:max_fg_procs-1)
@@ -992,6 +998,7 @@
        iturn3_end=iturn3_end+nnt
        iphi_end=iturn3_end+2
        iturn3_start=iturn3_start-1
+      if (iturn3_start.eq.0) iturn3_start=1
        iturn3_end=iturn3_end-1
        call int_bounds(nct_molec(2)-nnt_molec(2)-2,iphi_nucl_start,iphi_nucl_end)
        iphi_nucl_start=iphi_nucl_start+nnt_molec(2)+2
@@ -1010,6 +1017,7 @@
        iphid_end=iturn4_end+2
        iturn4_start=iturn4_start-1
        iturn4_end=iturn4_end-1
+      if (iturn4_start.eq.0) iturn4_start=1
  !      print *,"TUTUTU",nres_molec(1),nres
        call int_bounds(nres_molec(1)-2,ibond_start,ibond_end) 
        ibond_start=ibond_start+1
@@ -1024,9 +1032,9 @@
        print *,"NUCLibond",ibond_nucl_start,ibond_nucl_end
        if (nres_molec(2).ne.0) then
        print *, "before devision",nnt_molec(2),nct_molec(2)-nnt_molec(2)
-      call int_bounds(nct_molec(2)-nnt_molec(2),ibondp_nucl_start,ibondp_nucl_end)
-      ibondp_nucl_start=ibondp_nucl_start+nnt_molec(2)
-      ibondp_nucl_end=ibondp_nucl_end+nnt_molec(2)
+      call int_bounds(nres_molec(2)-1,ibondp_nucl_start,ibondp_nucl_end)
+      ibondp_nucl_start=ibondp_nucl_start+nnt_molec(2)-1
+      ibondp_nucl_end=ibondp_nucl_end+nnt_molec(2)-1
         else
         ibondp_nucl_start=1
         ibondp_nucl_end=0
@@ -1058,7 +1066,64 @@
          call int_bounds &
         (ntheta_constr,ithetaconstr_start,ithetaconstr_end)
        endif
-
+!     HERE MAKING LISTS FOR MARTINI
+      itmp=0
+      do i=1,3
+       itmp=itmp+nres_molec(i)
+      enddo
+!First bonding
+!       call int_bounds(nres_molec(4)-1,ilipbond_start,ilipbond_end)
+       ilipbond_start=1+itmp
+       ilipbond_end=nres_molec(4)-1+itmp
+!angles
+!       call int_bounds(nres_molec(4)-2,ilipang_start,ilipang_end)
+       ilipang_start=2+itmp
+       ilipang_end=itmp+nres_molec(4)-1
+!      create LJ LIST MAXIMUM
+!      Eliminate branching from list
+          remmat=0
+       do i=1+itmp,nres_molec(4)-1+itmp
+        if (itype(i,4).eq.12) ibra=i
+        if (itype(i,4).eq.ntyp1_molec(4)-1) then
+!        remmat(ibra-1,i+1)=1
+        remmat(ibra,i+1)=1
+!        remmat(ibra+1,i+1)=1
+        endif
+       enddo
+       maxljliplist=0
+       allocate (mlipljlisti(nres_molec(4)*nres_molec(4)/2))
+       allocate (mlipljlistj(nres_molec(4)*nres_molec(4)/2))
+       do i=1+itmp,nres_molec(4)-1+itmp
+        do j=i+2,nres_molec(4)+itmp
+        if ((itype(i,4).le.ntyp_molec(4)).and.(itype(j,4).le.ntyp_molec(4))&
+        .and.(remmat(i,j).eq.0)) then
+        maxljliplist=maxljliplist+1
+        mlipljlisti(maxljliplist)=i
+        mlipljlistj(maxljliplist)=j
+        if (energy_dec) print *,i,j,remmat(i,j),"lj lip list"
+        endif
+        enddo
+       enddo
+!      split the bound of the list
+       call int_bounds(maxljliplist,iliplj_start,iliplj_end)
+       iliplj_start=iliplj_start
+       iliplj_end=iliplj_end
+!      now the electrostatic list
+       maxelecliplist=0
+       allocate (mlipeleclisti(nres_molec(4)*nres_molec(4)/2))
+       allocate (mlipeleclistj(nres_molec(4)*nres_molec(4)/2))
+       do i=1+itmp,nres_molec(4)-1+itmp
+        do j=i+2,nres_molec(4)+itmp
+        if ((itype(i,4).le.4).and.(itype(j,4).le.4)) then
+        maxelecliplist=maxelecliplist+1
+        mlipeleclisti(maxelecliplist)=i
+        mlipeleclistj(maxelecliplist)=j
+        endif
+        enddo
+       enddo
+       call int_bounds(maxelecliplist,ilip_elec_start,ilipelec_end)
+       ilip_elec_start=ilip_elec_start
+       ilipelec_end=ilipelec_end
  !      nsumgrad=(nres-nnt)*(nres-nnt+1)/2
  !      nlen=nres-nnt+1
        nsumgrad=(nres-nnt)*(nres-nnt+1)/2
@@ -1169,6 +1234,10 @@
          write (iout,*) "iturn4_end_all",&
            (iturn4_end_all(i),i=0,nfgtasks-1)
          write (iout,*) "The ielstart_all array"
+!        do i=0,nfgtasks-1
+!         if (iturn3_start_all(i).le.0) iturn3_start_all(i)=1
+!         if (iturn4_start_all(i).le.0) iturn4_start_all(i)=1
+!        enddo
          do i=nnt,nct
            write (iout,'(20i4)') i,(ielstart_all(i,j),j=0,nfgtasks-1)
          enddo
@@ -1345,6 +1414,7 @@
          do i=1,nat_sent
            ii=iat_sent(i)
            iaux=4*(ielend(ii)-ielstart(ii)+1)
+          if (iaux.lt.0) iaux=0 
            call MPI_Group_translate_ranks(fg_group,iaux,&
              iint_sent(1,ielstart(ii),i),CONT_TO_GROUP,&
              iint_sent_local(1,ielstart(ii),i),IERR )
@@ -1352,10 +1422,12 @@
  !          call flush(iout)
          enddo
          iaux=4*(iturn3_end-iturn3_start+1)
+          if (iaux.lt.0) iaux=0
          call MPI_Group_translate_ranks(fg_group,iaux,&
             iturn3_sent(1,iturn3_start),CONT_TO_GROUP,&
             iturn3_sent_local(1,iturn3_start),IERR)
          iaux=4*(iturn4_end-iturn4_start+1)
+          if (iaux.lt.0) iaux=0
          call MPI_Group_translate_ranks(fg_group,iaux,&
             iturn4_sent(1,iturn4_start),CONT_TO_GROUP,&
             iturn4_sent_local(1,iturn4_start),IERR)
@@ -1367,6 +1439,7 @@
              j=ielstart(ii),ielend(ii))
            call flush(iout)
          enddo
+        if (iturn3_end.gt.0) then
          write (iout,*) "iturn3_sent_local iturn3_start",iturn3_start,&
            " iturn3_end",iturn3_end
          write (iout,'(20i4)') (i,(iturn3_sent_local(j,i),j=1,4),&
@@ -1377,6 +1450,7 @@
             i=iturn4_start,iturn4_end)
          call flush(iout)
          endif
+        endif
          call MPI_Group_free(fg_group,ierr)
          call MPI_Group_free(cont_from_group,ierr)
          call MPI_Group_free(cont_to_group,ierr)
@@ -1943,7 +2017,7 @@
  #ifdef WHAM_RUN
          if (itype(i,1).ne.10) then
  #else
-        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum) .and. mnum.ne.5) then
+        if (itype(i,1).ne.10 .and. itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum) .and. mnum.lt.4) then
  #endif
           nside=nside+1
            ialph(i,1)=nvar+nside
diff --git a/source/unres/data/control_data.F90 b/source/unres/data/control_data.F90

index 541a507..36afc1a 100644 (file)
--- a/source/unres/data/control_data.F90
+++ b/source/unres/data/control_data.F90
@@ -30,7 +30,7 @@
  !      common /cntrl/
        integer :: modecalc,iscode,indpdb,indback,indphi,iranconf,&
         icheckgrad,iprint,i2ndstr,mucadyn,constr_dist,symetr,shield_mode,&
-       tubemode,genconstr,afmlog,selfguide,scelemode,tor_mode,oldion
+       tubemode,genconstr,afmlog,selfguide,scelemode,tor_mode,oldion,DRY_MARTINI
        logical :: minim,refstr,pdbref,overlapsc,&
         energy_dec,sideadd,lsecondary,read_cart,unres_pdb,&
         vdisulf,searchsc,lmuca,dccart,extconf,out1file,&
@@ -52,7 +52,8 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
  ! common.spitele
  !      common /splitele/
-      real(kind=8) :: r_cut,rlamb,r_cut_ele,rlamb_ele
+      real(kind=8) :: r_cut,rlamb,r_cut_ele,rlamb_ele,r_cut_mart,rlamb_mart,&
+                      r_cut_ang
  !-----------------------------------------------------------------------------
  ! common.time1
  !     FOUND_NAN - set by calcf to stop sumsl via stopx
diff --git a/source/unres/data/energy_data.F90 b/source/unres/data/energy_data.F90

index 1a1a646..b0bfc71 100644 (file)
--- a/source/unres/data/energy_data.F90
+++ b/source/unres/data/energy_data.F90
@@ -3,7 +3,7 @@
        use names
  !-----------------------------------------------------------------------------
  ! Max. number of energy intervals
-      integer,parameter :: max_ene=50 !10
+      integer,parameter :: max_ene=57 !10
  !-----------------------------------------------------------------------------
  ! Maximum number of terms in SC bond-stretching potential
        integer,parameter :: maxbondterm=3
@@ -73,7 +73,7 @@
         wturn6,wvdwpp,wliptran,wshield,lipscale,wtube, &
         wbond_nucl,wang_nucl,wcorr_nucl,wcorr3_nucl,welpp,wtor_nucl,&
         wtor_d_nucl,welsb,wsbloc,wvdwsb,welpsb,wvdwpp_nucl,wvdwpsb,wcatprot,&
-       wcatcat,wscbase,wpepbase,wscpho,wpeppho,wdihc,wcatnucl
+       wcatcat,wscbase,wpepbase,wscpho,wpeppho,wdihc,wcatnucl,wcat_tran,wcat_ang
  #ifdef CLUSTER
        real(kind=8) :: scalscp
  #endif
@@ -426,9 +426,51 @@
  
  !end of ions parameters by Agnieszka Lipska (Ca, K, Na, Mg, Cl)-----------------------
  !
+
+! Parameters for transistion ions
+       real(kind=8),dimension(:,:,:),allocatable:: agamacattran,&
+       athetacattran
+       real(kind=8),dimension(:,:),allocatable::acatshiftdsc,&
+       bcatshiftdsc,demorsecat,alphamorsecat,x0catleft,x0catright,&
+       x0cattrans,aomicattr
+       real(kind=8),dimension(:),allocatable::ntrantyp
+
  ! FRAGMENT FOR INTERACTION LIST
          integer,dimension(:),allocatable :: newcontlistppi,newcontlistppj,&
-        newcontlisti,newcontlistj,  newcontlistscpi,newcontlistscpj
+        newcontlisti,newcontlistj,  newcontlistscpi,newcontlistscpj,&
+        newcontlistcatscnormi,newcontlistcatscnormj,&
+        newcontlistcatpnormi,newcontlistcatpnormj,&
+        newcontlistcatsctrani,newcontlistcatsctranj,&
+        newcontlistcatptrani,newcontlistcatptranj,&
+        newcontlistcatscangi,newcontlistcatscangj,&
+        newcontlistcatscangfi,newcontlistcatscangfj,&
+        newcontlistcatscangfk,&
+        newcontlistcatscangti,newcontlistcatscangtj,&
+        newcontlistcatscangtk,newcontlistcatscangtl
+
+
+
+
          integer :: g_listpp_start,g_listpp_end,g_listscp_start,g_listscp_end,&
-        g_listscsc_start,g_listscsc_end   
+        g_listscsc_start,g_listscsc_end, &
+        g_listcatsctran_start,g_listcatsctran_end,&
+        g_listcatscnorm_start,g_listcatscnorm_end,&
+        g_listcatptran_start,g_listcatptran_end,&
+        g_listcatpnorm_start,g_listcatpnorm_end,&
+        g_ilist_catscnorm,g_ilist_catsctran,g_ilist_catpnorm,&
+        g_ilist_catptran,g_ilist_catscang,g_ilist_catscangf,g_ilist_catscangt,&
+        g_listcatscang_start,g_listcatscang_end,&
+        g_listcatscangf_start,g_listcatscangf_end,&
+        g_listcatscangt_start,g_listcatscangt_end
+
+
+! MARTINI FORCE FIELD
+        integer :: ilipbond_start,ilipbond_end,ilipang_start,ilipang_end, &
+        maxelecliplist,ilip_elec_start,ilipelec_end,maxljliplist,iliplj_start,iliplj_end
+        integer,dimension(:),allocatable :: mlipljlisti,mlipljlistj,&
+        mlipeleclisti,mlipeleclistj
+        real(kind=8),dimension(:,:,:),allocatable :: lip_angle_force,lip_angle_angle
+        real(kind=8),dimension(:,:),allocatable :: lip_bond,lip_eps,lip_sig
+        integer,dimension(:),allocatable :: ichargelipid     
+        real(kind=8) :: kjtokcal,krad,k_coulomb_lip,kbondlip 
        end module energy_data
diff --git a/source/unres/data/io_units.F90 b/source/unres/data/io_units.F90

index 764889b..484ccd9 100644 (file)
--- a/source/unres/data/io_units.F90
+++ b/source/unres/data/io_units.F90
@@ -17,7 +17,7 @@
         ithep_pdb,irotam_pdb,iliptranpar,itube,   &
         ibond_nucl,ithep_nucl,irotam_nucl,itorp_nucl,itordp_nucl,     &
         isidep_nucl,iscpp_nucl,isidep_scbase,isidep_pepbase,isidep_scpho,&
-       isidep_peppho,iion,iionnucl      
+       isidep_peppho,iion,iionnucl,iiontran,ilipbond,ilipnonbond      
  #ifdef WHAM_RUN
  ! el wham iounits
        integer :: isidep1,ihist,iweight,izsc,idistr
@@ -50,7 +50,7 @@
         bondname_nucl,thetname_nucl,rotname_nucl,torname_nucl, &
         tordname_nucl,sidename_nucl,scpname_nucl,              &
         sidename_scbase,pepname_pepbase,pepname_scpho,pepname_peppho, &
-       ionname,ionnuclname
+       ionname,ionnuclname,iontranname,lipbondname,lipnonbondname
  !-----------------------------------------------------------------------
  ! INP    - main input file
  ! IOUT   - list file
diff --git a/source/unres/data/names.F90 b/source/unres/data/names.F90

index aa37125..140580b 100644 (file)
--- a/source/unres/data/names.F90
+++ b/source/unres/data/names.F90
@@ -3,7 +3,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
  ! Number of AA types (at present only natural AA's will be handled
        integer,parameter :: ntyp=27,ntyp1=ntyp+1,ntyp11=2*ntyp1+1
-      integer,dimension(5) :: ntyp_molec=(/27,5,0,0,5/),ntyp1_molec=(/28,6,0,0,6/)
+      integer,dimension(5) :: ntyp_molec=(/27,5,0,18,6/),ntyp1_molec=(/28,6,0,20,7/)
        integer,parameter ::maxmolec=5
  
  !-----------------------------------------------------------------------------
@@ -27,28 +27,28 @@
         '   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
-       'A  ','G  ','C  ','T  ','U  ','X  ','   ','   ','   ',&
-       '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
-       '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
+       'A  ','G  ','C  ','T  ','U  ','X  ','   ','   ','   ',& !9
+       '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',& !9
+       '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',& !10 end of nucleic acid
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ', &
         '   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
-       '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
+       '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&!end of sugars
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ', &
         '   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
-       '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
-       '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
-       '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
+       'QDA','QD ','QA ','Q0 ','P5 ','P4 ','P3 ','P2 ','P1 ',&
+       'NDA','ND ','NA ','N0 ','C5 ','C4 ','C3 ','C2 ','C1 ',&
+       'BRA','Z  ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&!end of lipids
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ', &
         '   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
-       'NA+','MG2','K+ ','CA2','CL-','   ','   ','   ',&
+       'NA+','MG2','K+ ','CA2','CL-','ZN2','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ',&
         '   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   ','   '&
         /))
@@ -66,7 +66,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
  !-----------------------------------------------------------------------------
  ! Number of energy components
-      integer,parameter :: n_ene=50
+      integer,parameter :: n_ene=57
        integer :: n_ene2=2*n_ene
  !-----------------------------------------------------------------------------
  ! common.names
@@ -96,7 +96,8 @@
          "ETORSD    ","ECORR     ","ECORR3    ","NULL      ","NULL      ",&
          "ECATPROT  ","ECATCAT   ","NULL      ","NULL      ","NULL      ",&
          "ESCBASE   ","EPEPBASE  ","ESCPHO    ","EPEPPHO   ",&
-        "ECATION_NUCL"/)
+        "ECATION_NUCL","EHOMOL  ","ELIPBOND  ","ELIPANG   ","ELIPELEC  ",&
+        "ELIPLJ    ","ECATTRAN  ","ECATANG   "/)
  
        character(len=10),dimension(n_ene) :: wname = &
        (/"WSC       ","WSCP      ","WELEC     ","WCORR     ","WCORR5    ","WCORR6    ","WEL_LOC   ",&
@@ -107,13 +108,15 @@
          "WELSB     ","WBOND_NUCL","WANG_NUCL ","WSBLOC    ","WTOR_NUCL ",&
          "WTORD_NUCL","WCORR_NUCL","WCORR3_NUC","WNULL     ","WNULL     ",&
          "WCATPROT  ","WCATCAT   ","WNULL     ","WNULL     ","WNULL     ",&
-        "WSCBASE   ","WPEPBASE  ","WSCPHO    ","WPEPPHO   ","WCATNUCL  "/)
+        "WSCBASE   ","WPEPBASE  ","WSCPHO    ","WPEPPHO   ","WCATNUCL  ",&
+        "WNULL     ","WNULL     ","WNULL     ","WNULL     ","WNULL     ",&
+        "WCATTRAN  ","WCATANG   "/)
  
        integer :: nprint_ene = 21
        integer,dimension(n_ene) :: print_order = &
           (/1,2,3,18,11,12,13,14,4,5,6,7,8,9,10,19,16,15,17,20,21,22,23,24,25,&
           26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,&
-         48,49,50/)
+         48,49,50,51,52,53,54,55,56,57/)
  
        character(len=1), dimension(2) :: sugartyp = (/'D',' '/)
  !#endif
diff --git a/source/unres/energy.F90 b/source/unres/energy.F90

index 677e970..dfdea4e 100644 (file)
--- a/source/unres/energy.F90
+++ b/source/unres/energy.F90
@@ -137,9 +137,12 @@
           gvdwc_peppho
  !------------------------------IONS GRADIENT
          real(kind=8),dimension(:,:),allocatable  ::  gradcatcat, &
-          gradpepcat,gradpepcatx,gradnuclcat,gradnuclcatx
+          gradpepcat,gradpepcatx,gradnuclcat,gradnuclcatx,gradcattranx,&
+          gradcattranc,gradcatangc,gradcatangx
  !      real(kind=8),dimension(:,:),allocatable :: gloc,gloc_x !(maxvar,2)
-
+!---------------------------------------- 
+        real(kind=8),dimension(:,:),allocatable  ::gradlipelec,gradlipbond,&
+          gradlipang,gradliplj
  
        real(kind=8),dimension(:,:),allocatable :: gel_loc,gel_loc_long,&
          gcorr3_turn,gcorr4_turn,gcorr6_turn,gradb,gradbx !(3,maxres)
@@ -209,7 +212,7 @@
  ! energy_p_new_barrier.F
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine etotal(energia)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
        use MD_data
  #ifndef ISNAN
@@ -248,9 +251,11 @@
                        ecorr3_nucl
  ! energies for ions 
        real(kind=8) :: ecation_prot,ecationcation,ecations_prot_amber,&
-                      ecation_nucl
+                      ecation_nucl,ecat_prottran,ecation_protang
  ! energies for protein nucleic acid interaction
        real(kind=8) :: escbase,epepbase,escpho,epeppho
+! energies for MARTINI
+       real(kind=8) :: elipbond,elipang,elipelec,eliplj
  
  #ifdef MPI      
        real(kind=8) :: weights_(n_ene) !,time_Bcast,time_Bcastw
@@ -335,6 +340,8 @@
            weights_(48)=wscpho
            weights_(49)=wpeppho
            weights_(50)=wcatnucl          
+          weights_(56)=wcat_tran
+
  !          wcatcat= weights(41)
  !          wcatprot=weights(42)
  
@@ -384,6 +391,8 @@
            wscpho=weights(48)
            wpeppho=weights(49)
            wcatnucl=weights(50)
+          wcat_tran=weights(56)
+
  !      welpsb=weights(28)*fact(1)
  !
  !      wcorr_nucl= weights(37)*fact(1)
@@ -407,6 +416,12 @@
  !       write (iout,*) "after make_SCSC_inter_list"
  
         if (mod(itime_mat,imatupdate).eq.0) call make_pp_inter_list
+       if (nres_molec(5).gt.0) then
+       if (mod(itime_mat,imatupdate).eq.0) then
+!      print *,'Processor',myrank,' calling etotal ipot=',ipot
+        call  make_cat_pep_list
+       endif
+       endif
         endif
  !       write (iout,*) "after make_pp_inter_list"
  
@@ -424,6 +439,7 @@
  ! Compute the side-chain and electrostatic interaction energy
  !        print *, "Before EVDW"
  !      goto (101,102,103,104,105,106) ipot
+      if (nres_molec(1).gt.0) then
        select case(ipot)
  ! Lennard-Jones potential.
  !  101 call elj(evdw)
@@ -815,6 +831,40 @@
        else
         eliptran=0.0d0
        endif
+      else
+      eliptran=0.0d0
+      evdw=0.0d0
+#ifdef SCP14
+      evdw2=0.0d0
+      evdw2_14=0.0d0
+#else
+      evdw2=0.0d0
+#endif
+#ifdef SPLITELE
+      ees=0.0d0
+      evdw1=0.0d0
+#else
+      ees=0.0d0
+      evdw1=0.0d0
+#endif
+      ecorr=0.0d0
+      ecorr5=0.0d0
+      ecorr6=0.0d0
+      eel_loc=0.0d0
+      eello_turn3=0.0d0
+      eello_turn4=0.0d0
+      eturn6=0.0d0
+      ebe=0.0d0
+      escloc=0.0d0
+      etors=0.0d0
+      etors_d=0.0d0
+      ehpb=0.0d0
+      edihcnstr=0.0d0
+      estr=0.0d0
+      Uconst=0.0d0
+      esccor=0.0d0
+    
+      endif !nres_molec(1)
        if (fg_rank.eq.0) then
        if (AFMlog.gt.0) then
          call AFMforce(Eafmforce)
@@ -866,22 +916,33 @@
  !      write(iout,*) ecorr_nucl,"ecorr_nucl",nres_molec(2)
  !      print *,"before ecatcat",wcatcat
        if (nres_molec(5).gt.0) then
+      if (g_ilist_catsctran.gt.0) then
+        call ecat_prot_transition(ecat_prottran)
+      else
+       ecat_prottran=0.0d0
+      endif
+      if (g_ilist_catscang.gt.0) then
+         call ecat_prot_ang(ecation_protang)
+      else
+       ecation_protang=0.0d0
+      endif
        if (nfgtasks.gt.1) then
        if (fg_rank.eq.0) then
-      call ecatcat(ecationcation)
+       if (nres_molec(5).gt.1)  call ecatcat(ecationcation)
        endif
        else
-      call ecatcat(ecationcation)
+        if (nres_molec(5).gt.1) call ecatcat(ecationcation)
        endif
        if (oldion.gt.0) then
-      call ecat_prot(ecation_prot)
+      if (g_ilist_catpnorm.gt.0) call ecat_prot(ecation_prot)
        else
-      call ecats_prot_amber(ecation_prot)
+      if (g_ilist_catpnorm.gt.0) call ecats_prot_amber(ecation_prot)
        endif
        else
        ecationcation=0.0d0
        ecation_prot=0.0d0
        endif
+      if (g_ilist_catscnorm.eq.0) ecation_prot=0.0d0
        if ((nres_molec(2).gt.0).and.(nres_molec(1).gt.0)) then
        call eprot_sc_base(escbase)
        call epep_sc_base(epepbase)
@@ -893,6 +954,25 @@
        escpho=0.0
        epeppho=0.0
        endif
+! MARTINI FORCE FIELD ENERGY TERMS
+      if (nres_molec(4).gt.0) then
+      if (nfgtasks.gt.1) then
+      if (fg_rank.eq.0) then
+        call lipid_bond(elipbond)
+        call lipid_angle(elipang)
+      endif
+      else
+        call lipid_bond(elipbond)
+        call lipid_angle(elipang)
+      endif
+        call lipid_LJ(eliplj)
+        call lipid_elec(elipelec)
+      else
+        elipbond=0.0d0
+        elipang=0.0d0
+        eliplj=0.0d0
+        elipelec=0.0d0
+       endif
  !      call ecatcat(ecationcation)
  !      print *,"after ebend", wtor_nucl 
  #ifdef TIMING
@@ -966,6 +1046,16 @@
        energia(49)=epeppho
  !      energia(50)=ecations_prot_amber
        energia(50)=ecation_nucl
+!     energia(51)=homology
+      energia(52)=elipbond
+      energia(53)=elipang
+      energia(54)=eliplj
+      energia(55)=elipelec
+      energia(56)=ecat_prottran
+      energia(57)=ecation_protang
+!      write(iout,*) elipelec,"elipelec"
+!      write(iout,*) elipang,"elipang"
+!      write(iout,*) eliplj,"eliplj"
        call sum_energy(energia,.true.)
        if (dyn_ss) call dyn_set_nss
  !      print *," Processor",myrank," left SUM_ENERGY"
@@ -978,7 +1068,7 @@
        end subroutine etotal
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine sum_energy(energia,reduce)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  #ifndef ISNAN
        external proc_proc
@@ -1009,9 +1099,10 @@
                        ebe_nucl,esbloc,etors_nucl,etors_d_nucl,ecorr_nucl,&
                        ecorr3_nucl
        real(kind=8) :: ecation_prot,ecationcation,ecations_prot_amber,&
-                      ecation_nucl
+                      ecation_nucl,ecat_prottran,ecation_protang
        real(kind=8) :: escbase,epepbase,escpho,epeppho
        integer :: i
+      real(kind=8) :: elipbond,elipang,eliplj,elipelec
  #ifdef MPI
        integer :: ierr
        real(kind=8) :: time00
@@ -1094,6 +1185,12 @@
        escpho=energia(48)
        epeppho=energia(49)
        ecation_nucl=energia(50)
+      elipbond=energia(52)
+      elipang=energia(53)
+      eliplj=energia(54)
+      elipelec=energia(55)
+      ecat_prottran=energia(56)
+      ecation_protang=energia(57)
  !      ecations_prot_amber=energia(50)
  
  !      energia(41)=ecation_prot
@@ -1113,7 +1210,8 @@
         +wvdwsb*evdwsb+welsb*eelsb+wsbloc*esbloc+wtor_nucl*etors_nucl&
         +wtor_d_nucl*etors_d_nucl+wcorr_nucl*ecorr_nucl+wcorr3_nucl*ecorr3_nucl&
         +wcatprot*ecation_prot+wcatcat*ecationcation+wscbase*escbase&
-       +wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+wcatnucl*ecation_nucl
+       +wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+wcatnucl*ecation_nucl&
+       +elipbond+elipang+eliplj+elipelec+wcat_tran*ecat_prottran+ecation_protang
  #else
        etot=wsc*evdw+wscp*evdw2+welec*(ees+evdw1) &
         +wang*ebe+wtor*etors+wscloc*escloc &
@@ -1127,7 +1225,8 @@
         +wvdwsb*evdwsb+welsb*eelsb+wsbloc*esbloc+wtor_nucl*etors_nucl&
         +wtor_d_nucl*etors_d_nucl+wcorr_nucl*ecorr_nucl+wcorr3_nucl*ecorr3_nucl&
         +wcatprot*ecation_prot+wcatcat*ecationcation+wscbase*escbase&
-       +wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+wcatnucl*ecation_nucl
+       +wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+wcatnucl*ecation_nucl&
+       +elipbond+elipang+eliplj+elipelec+wcat_tran*ecat_prottran+ecation_protang
  #endif
        energia(0)=etot
  ! detecting NaNQ
@@ -1155,7 +1254,7 @@
        end subroutine sum_energy
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine rescale_weights(t_bath)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  #ifdef MPI
        include 'mpif.h'
  #endif
@@ -1245,7 +1344,7 @@
        end subroutine rescale_weights
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine enerprint(energia)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.FFIELD'
@@ -1261,9 +1360,9 @@
                        ebe_nucl,esbloc,etors_nucl,etors_d_nucl,ecorr_nucl,&
                        ecorr3_nucl
        real(kind=8) :: ecation_prot,ecationcation,ecations_prot_amber,&
-                      ecation_nucl
+                      ecation_nucl,ecat_prottran,ecation_protang
        real(kind=8) :: escbase,epepbase,escpho,epeppho
-
+      real(kind=8) :: elipbond,elipang,eliplj,elipelec
        etot=energia(0)
        evdw=energia(1)
        evdw2=energia(2)
@@ -1316,6 +1415,12 @@
        escpho=energia(48)
        epeppho=energia(49)
        ecation_nucl=energia(50)
+      elipbond=energia(52)
+      elipang=energia(53)
+      eliplj=energia(54)
+      elipelec=energia(55)
+      ecat_prottran=energia(56)
+      ecation_protang=energia(57)
  !      ecations_prot_amber=energia(50)
  #ifdef SPLITELE
        write (iout,10) evdw,wsc,evdw2,wscp,ees,welec,evdw1,wvdwpp,&
@@ -1330,9 +1435,12 @@
          evdwpp,wvdwpp_nucl,eespp,welpp,evdwpsb,wvdwpsb,eelpsb,welpsb,&
          evdwsb,wvdwsb,eelsb,welsb,esbloc,wsbloc,etors_nucl,wtor_nucl,&
          etors_d_nucl,wtor_d_nucl,ecorr_nucl,wcorr_nucl,&
-        ecorr3_nucl,wcorr3_nucl,ecation_prot,wcatprot,ecationcation,wcatcat, &
+        ecorr3_nucl,wcorr3_nucl,ecation_prot,wcatprot,&
+        ecat_prottran,wcat_tran,ecation_protang,wcat_ang,&
+        ecationcation,wcatcat, &
          escbase,wscbase,epepbase,wpepbase,escpho,wscpho,epeppho,wpeppho,&
-        ecation_nucl,wcatnucl,etot
+        ecation_nucl,wcatnucl,&
+        elipbond,elipang,eliplj,elipelec,etot
     10 format (/'Virtual-chain energies:'// &
         'EVDW=  ',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,' (SC-SC)'/ &
         'EVDW2= ',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,' (SC-p)'/ &
@@ -1374,12 +1482,18 @@
         'ECORR_nucl=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(multibody 4th order)'/ &
         'ECORR3_nucl=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(multibody 3th order)'/ &
         'ECATPROT=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(cation prot)'/ &
+       'ECATPTRAN=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(cation prot tran)'/ &
+       'ECATPANG=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(cation prot angle)'/ &
         'ECATCAT=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(cation cation)'/ &
         'ESCBASE=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(sc-prot nucl-base)'/ &
         'EPEPBASE=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(pep-prot nucl-base)'/ &
         'ESCPHO=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(sc-prot nucl-phosphate)'/&
         'EPEPPHO=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(pep-prot nucl-phosphate)'/&
         'ECATBASE=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(cation nucl-base)'/&
+       'ELIPBOND=',1pE16.6,'(matrini bond energy)'/&
+       'ELIPANG=',1pE16.6,'(matrini angle energy)'/&
+       'ELIPLJ=',1pE16.6,'(matrini Lennard-Jones energy)'/&
+       'ELIPELEC=',1pE16.6,'(matrini electrostatic energy)'/&
         'ETOT=  ',1pE16.6,' (total)')
  #else
        write (iout,10) evdw,wsc,evdw2,wscp,ees,welec,&
@@ -1443,6 +1557,10 @@
         'ESCPHO=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(sc-prot nucl-phosphate)'/&
         'EPEPPHO=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(pep-prot nucl-phosphate)'/&
         'ECATBASE=',1pE16.6,' WEIGHT=',1pD16.6,'(cation nucl-base)'/&
+       'ELIPBOND=',1pE16.6,'(matrini bond energy)'/&
+       'ELIPANG=',1pE16.6,'(matrini angle energy)'/&
+       'ELIPLJ=',1pE16.6,'(matrini Lennard-Jones energy)'/&
+       'ELIPELEC=',1pE16.6,'(matrini electrostatic energy)'/&
         'ETOT=  ',1pE16.6,' (total)')
  #endif
        return
@@ -1453,7 +1571,7 @@
  ! This subroutine calculates the interaction energy of nonbonded side chains
  ! assuming the LJ potential of interaction.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
        real(kind=8),parameter :: accur=1.0d-10
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -1634,7 +1752,7 @@
  ! This subroutine calculates the interaction energy of nonbonded side chains
  ! assuming the LJK potential of interaction.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -1738,7 +1856,7 @@
  !
        use comm_srutu
        use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -1880,7 +1998,7 @@
  ! assuming the Gay-Berne potential of interaction.
  !
        use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -2129,7 +2247,7 @@
  !
        use comm_srutu
        use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -2276,7 +2394,7 @@
  ! This subroutine calculates the interaction energy of nonbonded side chains
  ! assuming the LJ potential of interaction.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
        real(kind=8),parameter :: accur=1.0d-10
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -2359,7 +2477,7 @@
  !
  ! Soft-sphere potential of p-p interaction
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CONTROL'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
@@ -2459,7 +2577,7 @@
        end subroutine eelec_soft_sphere
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine vec_and_deriv
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  #ifdef MPI
        include 'mpif.h'
@@ -2646,7 +2764,7 @@
        end subroutine vec_and_deriv
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine check_vecgrad
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -2734,7 +2852,7 @@
        end subroutine check_vecgrad
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine set_matrices
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  #ifdef MPI
        include "mpif.h"
@@ -3378,7 +3496,7 @@
  ! the orientation of the CA-CA virtual bonds.
  !
        use comm_locel
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  #ifdef MPI
        include 'mpif.h'
  #endif
@@ -3610,7 +3728,7 @@
        subroutine eelecij(i,j,ees,evdw1,eel_loc)
  
        use comm_locel
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  #ifdef MPI
        include "mpif.h"
@@ -4671,7 +4789,7 @@
  ! Third- and fourth-order contributions from turns
  
        use comm_locel
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -4888,7 +5006,7 @@
  ! Third- and fourth-order contributions from turns
  
        use comm_locel
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -5270,7 +5388,7 @@
  ! peptide-group centers and side chains and its gradient in virtual-bond and
  ! side-chain vectors.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -5377,7 +5495,7 @@
  ! peptide-group centers and side chains and its gradient in virtual-bond and
  ! side-chain vectors.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -5522,7 +5640,7 @@
  ! 
  ! Evaluate bridge-strain energy and its gradient in virtual-bond and SC vectors.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.SBRIDGE'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -5672,7 +5790,7 @@
  !
  ! A. Liwo and U. Kozlowska, 11/24/03
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.SBRIDGE'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -5769,7 +5887,7 @@
  !
  ! Evaluate the energy of stretching of the CA-CA and CA-SC virtual bonds
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.LOCAL'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -5882,7 +6000,7 @@
  ! angles gamma and its derivatives in consecutive thetas and gammas.
  !
        use comm_calcthet
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.LOCAL'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -6023,7 +6141,7 @@
        subroutine theteng(thetai,thet_pred_mean,theta0i,ethetai,E_theta,E_tc)
  
        use comm_calcthet
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.LOCAL'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
@@ -6118,7 +6236,7 @@
  ! ab initio-derived potentials from
  ! Kozlowska et al., J. Phys.: Condens. Matter 19 (2007) 285203
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.LOCAL'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -6329,7 +6447,7 @@
  ! ALPHA and OMEGA.
  !
        use comm_sccalc
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.LOCAL'
@@ -6454,7 +6572,7 @@
        subroutine enesc(x,escloci,dersc,ddersc,mixed)
  
        use comm_sccalc
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.LOCAL'
@@ -6563,7 +6681,7 @@
        subroutine enesc_bound(x,escloci,dersc,dersc12,mixed)
  
        use comm_sccalc
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.LOCAL'
@@ -6644,7 +6762,7 @@
  ! added by Urszula Kozlowska. 07/11/2007
  !
        use comm_sccalc
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.LOCAL'
@@ -7055,7 +7173,7 @@
        end subroutine gcont
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine splinthet(theti,delta,ss,ssder)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.VAR'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -7104,7 +7222,7 @@
  #ifdef CRYST_TOR
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine etor(etors,edihcnstr)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.VAR'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -7208,7 +7326,7 @@
  #else
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine etor(etors)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.VAR'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -7464,7 +7582,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine etor_d(etors_d)
  ! 6/23/01 Compute double torsional energy
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.VAR'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -7628,7 +7746,7 @@
  !        residues) and the torsional potentials dependent on all 20 types
  !        of residues computed from AM1  energy surfaces of terminally-blocked
  !        amino-acid residues.
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.VAR'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -7709,7 +7827,7 @@
  ! the idea of Skolnick et al. If side chains I and J make a contact and
  ! at the same time side chains I+1 and J+1 make a contact, an extra 
  ! contribution equal to sqrt(eps(i,j)*eps(i+1,j+1)) is added.
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.DERIV'
@@ -7767,7 +7885,7 @@
        end subroutine multibody
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function esccorr(i,j,k,l,jj,kk)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.DERIV'
@@ -7809,7 +7927,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine multibody_hb(ecorr,ecorr5,ecorr6,n_corr,n_corr1)
  ! This subroutine calculates multi-body contributions to hydrogen-bonding 
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  #ifdef MPI
@@ -8122,7 +8240,7 @@
        end subroutine multibody_hb
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine add_hb_contact(ii,jj,itask)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include "DIMENSIONS"
  !      include "COMMON.IOUNITS"
  !      include "COMMON.CONTACTS"
@@ -8179,7 +8297,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine multibody_eello(ecorr,ecorr5,ecorr6,eturn6,n_corr,n_corr1)
  ! This subroutine calculates multi-body contributions to hydrogen-bonding 
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
        integer,parameter :: max_dim=70
@@ -8573,7 +8691,7 @@
        end subroutine multibody_eello
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine add_hb_contact_eello(ii,jj,itask)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include "DIMENSIONS"
  !      include "COMMON.IOUNITS"
  !      include "COMMON.CONTACTS"
@@ -8628,7 +8746,7 @@
        end subroutine add_hb_contact_eello
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function ehbcorr(i,j,k,l,jj,kk,coeffp,coeffm)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.DERIV'
@@ -8795,7 +8913,7 @@
  #ifdef MOMENT
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine dipole(i,j,jj)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -8868,7 +8986,7 @@
  ! the fourth-, fifth-, and sixth-order local-electrostatic terms.
  !
        use comm_kut
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -9249,7 +9367,7 @@
        end subroutine kernel
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function eello4(i,j,k,l,jj,kk)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -9364,7 +9482,7 @@
        end function eello4
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function eello5(i,j,k,l,jj,kk)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -9772,7 +9890,7 @@
        end function eello5
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function eello6(i,j,k,l,jj,kk)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -9917,7 +10035,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function eello6_graph1(i,j,k,l,imat,swap)
        use comm_kut
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -10025,7 +10143,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function eello6_graph2(i,j,k,l,jj,kk,swap)
        use comm_kut
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -10212,7 +10330,7 @@
        end function eello6_graph2
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function eello6_graph3(i,j,k,l,jj,kk,swap)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -10330,7 +10448,7 @@
        end function eello6_graph3
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function eello6_graph4(i,j,k,l,jj,kk,imat,swap)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -10577,7 +10695,7 @@
        end function eello6_graph4
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function eello_turn6(i,jj,kk)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -10913,7 +11031,7 @@
  #ifndef OSF
  !DEC$ ATTRIBUTES FORCEINLINE::MATVEC2
  #endif
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
        real(kind=8),dimension(2) :: V1,V2
        real(kind=8),dimension(2,2) :: A1
@@ -10936,7 +11054,7 @@
  #ifndef OSF
  !DEC$ ATTRIBUTES FORCEINLINE::MATMAT2  
  #endif
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
        real(kind=8),dimension(2,2) :: A1,A2,A3
        real(kind=8) :: ai3_11,ai3_12,ai3_21,ai3_22
@@ -11048,7 +11166,7 @@
  ! energy_p_new_barrier.F
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine sum_gradient
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
        use io_base, only: pdbout
  !      include 'DIMENSIONS'
  #ifndef ISNAN
@@ -11168,7 +11286,9 @@
                       wscbase*gvdwc_scbase(j,i)+ &
                       wpepbase*gvdwc_pepbase(j,i)+&
                       wscpho*gvdwc_scpho(j,i)+   &
-                     wpeppho*gvdwc_peppho(j,i)+wcatnucl*gradnuclcat(j,i)
+                     wpeppho*gvdwc_peppho(j,i)+wcatnucl*gradnuclcat(j,i)+ &
+                     gradlipbond(j,i)+gradlipang(j,i)+gradliplj(j,i)+gradlipelec(j,i)+&
+                     wcat_tran*gradcattranc(j,i)+gradcatangc(j,i)
  
         
  
@@ -11206,7 +11326,10 @@
                       wscbase*gvdwc_scbase(j,i)+ &
                       wpepbase*gvdwc_pepbase(j,i)+&
                       wscpho*gvdwc_scpho(j,i)+&
-                     wpeppho*gvdwc_peppho(j,i)+wcatnucl*gradnuclcat(j,i)
+                     wpeppho*gvdwc_peppho(j,i)+wcatnucl*gradnuclcat(j,i)+&
+                     gradlipbond(j,i)+gradlipang(j,i)+gradliplj(j,i)+gradlipelec(j,i)+&
+                     wcat_tran*gradcattranc(j,i)+gradcatangc(j,i)
+
  
  
          enddo
@@ -11367,7 +11490,8 @@
                       +wtube*gg_tube(j,i) &
                       +0.5d0*(wvdwpp_nucl*gvdwpp_nucl(j,i)+welpp*gelpp(j,i)&
                       +wvdwpsb*gvdwpsb1(j,i))&
-                     +wbond_nucl*gradb_nucl(j,i)+wsbloc*gsbloc(j,i)
+                     +wbond_nucl*gradb_nucl(j,i)+wsbloc*gsbloc(j,i)!&
+!                     + gradcattranc(j,i)
  !                      if (i.eq.21) then
  !                      print *,"in sum",gradc(j,i,icg),wturn4*gcorr4_turn(j,i),&
  !                      wturn4*gshieldc_t4(j,i), &
@@ -11447,7 +11571,8 @@
                       +wbond_nucl*gradb_nucl(j,i) &
                       +0.5d0*(wvdwpp_nucl*gvdwpp_nucl(j,i)+welpp*gelpp(j,i)&
                       +wvdwpsb*gvdwpsb1(j,i))&
-                     +wsbloc*gsbloc(j,i)+wcatnucl*gradnuclcat(j,i)
+                     +wsbloc*gsbloc(j,i)+wcatnucl*gradnuclcat(j,i)!&
+!                     + gradcattranc(j,i)
  
  
  
@@ -11474,7 +11599,8 @@
                         +wcatprot* gradpepcatx(j,i)&
                         +wscbase*gvdwx_scbase(j,i) &
                         +wpepbase*gvdwx_pepbase(j,i)&
-                       +wscpho*gvdwx_scpho(j,i)+wcatnucl*gradnuclcatx(j,i)
+                       +wscpho*gvdwx_scpho(j,i)+wcatnucl*gradnuclcatx(j,i)&
+                       +wcat_tran*gradcattranx(j,i)+gradcatangx(j,i)
  !              if (i.eq.3) print *,"tu?", wscpho,gvdwx_scpho(j,i)
  
          enddo
@@ -11679,7 +11805,7 @@
        end subroutine sum_gradient
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine sc_grad
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
        use calc_data
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -11835,7 +11961,7 @@
        subroutine mixder(thetai,thet_pred_mean,theta0i,E_tc_t)
  
        use comm_calcthet
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.LOCAL'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
@@ -11912,7 +12038,7 @@
  ! Version of March '95, based on an early version of November '91.
  !
  !********************************************************************** 
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.VAR'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -12204,7 +12330,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine check_cartgrad
  ! Check the gradient of Cartesian coordinates in internal coordinates.
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -12380,7 +12506,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine check_ecart
  ! Check the gradient of the energy in Cartesian coordinates.
-!     implicit real*8 (a-h,o-z)
+!     implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !     include 'DIMENSIONS'
  !     include 'COMMON.CHAIN'
  !     include 'COMMON.DERIV'
@@ -12467,7 +12593,7 @@
        subroutine check_ecartint
  ! Check the gradient of the energy in Cartesian coordinates. 
        use io_base, only: intout
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CONTROL'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -12700,7 +12826,7 @@
        subroutine check_ecartint
  ! Check the gradient of the energy in Cartesian coordinates. 
        use io_base, only: intout
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CONTROL'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -12744,7 +12870,7 @@
        if (.not.split_ene) then
          call etotal(energia)
          etot=energia(0)
-!el        call enerprint(energia)
+!        call enerprint(energia)
          call cartgrad
          icall =1
          do i=1,nres
@@ -12846,6 +12972,7 @@
            if (.not.split_ene) then
                    call zerograd
              call etotal(energia1)
+!            call enerprint(energia1)
              etot2=energia1(0)
            ggg(j)=(etot1-etot2)/(2*aincr)
            else
@@ -12877,7 +13004,9 @@
            if (.not.split_ene) then
              call zerograd
              call etotal(energia1)
+!            call enerprint(energia1)
              etot1=energia1(0)
+!            print *,"ene",energia1(0),energia1(57)
            else
  !- split gradient
              call etotal_long(energia1)
@@ -12901,6 +13030,8 @@
              call zerograd
              call etotal(energia1)
              etot2=energia1(0)
+!            call enerprint(energia1)
+!            print *,"ene",energia1(0),energia1(57)
            ggg(j+3)=(etot1-etot2)/(2*aincr)
            else
  !- split gradient
@@ -12933,7 +13064,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine check_eint
  ! Check the gradient of energy in internal coordinates.
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
  !      include 'COMMON.DERIV'
@@ -13023,7 +13154,7 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine Econstr_back
  !     MD with umbrella_sampling using Wolyne's distance measure as a constraint
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CONTROL'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -13149,6 +13280,66 @@
        endif
        return
        end function sscale_grad
+!SCALINING MARTINI
+      real(kind=8) function sscale_martini(r)
+!      include "COMMON.SPLITELE"
+      real(kind=8) :: r,gamm
+!      print *,"here2",r_cut_mart,r
+      if(r.lt.r_cut_mart-rlamb_mart) then
+        sscale_martini=1.0d0
+      else if(r.le.r_cut_mart.and.r.ge.r_cut_mart-rlamb_mart) then
+        gamm=(r-(r_cut_mart-rlamb_mart))/rlamb_mart
+        sscale_martini=1.0d0+gamm*gamm*(2*gamm-3.0d0)
+      else
+        sscale_martini=0.0d0
+      endif
+      return
+      end function sscale_martini
+      real(kind=8) function sscale_grad_martini(r)
+!      include "COMMON.SPLITELE"
+      real(kind=8) :: r,gamm
+      if(r.lt.r_cut_mart-rlamb_mart) then
+        sscale_grad_martini=0.0d0
+      else if(r.le.r_cut_mart.and.r.ge.r_cut_mart-rlamb_mart) then
+        gamm=(r-(r_cut_mart-rlamb_mart))/rlamb_mart
+        sscale_grad_martini=gamm*(6*gamm-6.0d0)/rlamb_mart
+      else
+        sscale_grad_martini=0.0d0
+      endif
+      return
+      end function sscale_grad_martini
+      real(kind=8) function sscale_martini_angle(r)
+!      include "COMMON.SPLITELE"
+      real(kind=8) :: r,gamm,r_cut_angle,rlamb_angle
+!      print *,"here2",r_cut_angle,r
+       r_cut_angle=3.12d0
+       rlamb_angle=0.1d0
+      if(r.lt.r_cut_angle-rlamb_angle) then
+        sscale_martini_angle=1.0d0
+      else if(r.le.r_cut_angle.and.r.ge.r_cut_angle-rlamb_angle) then
+        gamm=(r-(r_cut_angle-rlamb_angle))/rlamb_angle
+        sscale_martini_angle=1.0d0+gamm*gamm*(2*gamm-3.0d0)
+      else
+        sscale_martini_angle=0.0d0
+      endif
+      return
+      end function sscale_martini_angle
+      real(kind=8) function sscale_grad_martini_angle(r)
+!      include "COMMON.SPLITELE"
+      real(kind=8) :: r,gamm,r_cut_angle,rlamb_angle
+       r_cut_angle=3.12d0
+       rlamb_angle=0.1d0
+      if(r.lt.r_cut_angle-rlamb_angle) then
+        sscale_grad_martini_angle=0.0d0
+      else if(r.le.r_cut_angle.and.r.ge.r_cut_angle-rlamb_angle) then
+        gamm=(r-(r_cut_angle-rlamb_angle))/rlamb_angle
+        sscale_grad_martini_angle=gamm*(6*gamm-6.0d0)/rlamb_angle
+      else
+        sscale_grad_martini_angle=0.0d0
+      endif
+      return
+      end function sscale_grad_martini_angle
+
  
  !!!!!!!!!! PBCSCALE
        real(kind=8) function sscale_ele(r)
@@ -13178,6 +13369,35 @@
        endif
        return
        end function sscagrad_ele
+!!!!!!!!!! PBCSCALE
+      real(kind=8) function sscale2(r,r_cc,r_ll)
+!      include "COMMON.SPLITELE"
+      real(kind=8) :: r,gamm,r_cc,r_ll
+      if(r.lt.r_cc-r_ll) then
+        sscale2=1.0d0
+      else if(r.le.r_cc.and.r.ge.r_cc-r_ll) then
+        gamm=(r-(r_cc-r_ll))/r_ll
+        sscale2=1.0d0+gamm*gamm*(2*gamm-3.0d0)
+      else
+        sscale2=0d0
+      endif
+      return
+      end function sscale2
+           
+      real(kind=8)  function sscagrad2(r,r_cc,r_ll)
+      real(kind=8) :: r,gamm,r_cc,r_ll
+!      include "COMMON.SPLITELE"
+      if(r.lt.r_cc-r_ll) then
+        sscagrad2=0.0d0
+      else if(r.le.r_cc.and.r.ge.r_cc-r_ll) then
+        gamm=(r-(r_cc-r_ll))/r_ll
+        sscagrad2=gamm*(6*gamm-6.0d0)/r_ll
+      else 
+        sscagrad2=0.0d0
+      endif
+      return
+      end function sscagrad2
+
        real(kind=8) function sscalelip(r)
        real(kind=8) r,gamm
          sscalelip=1.0d0+r*r*(2.0d0*r-3.0d0)
@@ -13197,7 +13417,7 @@
  ! This subroutine calculates the interaction energy of nonbonded side chains
  ! assuming the LJ potential of interaction.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -13299,7 +13519,7 @@
  ! This subroutine calculates the interaction energy of nonbonded side chains
  ! assuming the LJ potential of interaction.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -13395,7 +13615,7 @@
  ! This subroutine calculates the interaction energy of nonbonded side chains
  ! assuming the LJK potential of interaction.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -13489,7 +13709,7 @@
  ! This subroutine calculates the interaction energy of nonbonded side chains
  ! assuming the LJK potential of interaction.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -13588,7 +13808,7 @@
  ! assuming the Berne-Pechukas potential of interaction.
  !
         use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -13718,7 +13938,7 @@ chip1=chip(itypi)
          ! assuming the Berne-Pechukas potential of interaction.
          !
          use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
          !      include 'DIMENSIONS'
          !      include 'COMMON.GEO'
          !      include 'COMMON.VAR'
@@ -13851,7 +14071,7 @@ chip1=chip(itypi)
  ! assuming the Gay-Berne potential of interaction.
  !
        use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -14050,7 +14270,7 @@ chip1=chip(itypi)
  ! assuming the Gay-Berne potential of interaction.
  !
        use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -14252,7 +14472,7 @@ chip1=chip(itypi)
  ! assuming the Gay-Berne-Vorobjev potential of interaction.
  !
        use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -14394,7 +14614,7 @@ chip1=chip(itypi)
  ! assuming the Gay-Berne-Vorobjev potential of interaction.
  !
        use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -14537,7 +14757,7 @@ chip1=chip(itypi)
  ! The potential depends both on the distance of peptide-group centers and on 
  ! the orientation of the CA-CA virtual bonds.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  
        use comm_locel
  #ifdef MPI
@@ -14733,7 +14953,7 @@ chip1=chip(itypi)
        end subroutine eelec_scale
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine eelecij_scale(i,j,ees,evdw1,eel_loc)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  
        use comm_locel
  !      include 'DIMENSIONS'
@@ -15508,7 +15728,7 @@ chip1=chip(itypi)
  !
  ! Compute Evdwpp
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CONTROL'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
@@ -15639,7 +15859,7 @@ chip1=chip(itypi)
  ! peptide-group centers and side chains and its gradient in virtual-bond and
  ! side-chain vectors.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -15759,7 +15979,7 @@ chip1=chip(itypi)
  ! peptide-group centers and side chains and its gradient in virtual-bond and
  ! side-chain vectors.
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -15881,7 +16101,7 @@ chip1=chip(itypi)
  ! energy_p_new-sep_barrier.F
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine sc_grad_scale(scalfac)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
        use calc_data
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -15945,7 +16165,7 @@ chip1=chip(itypi)
  !
  ! Compute the long-range slow-varying contributions to the energy
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
        use MD_data, only: totT,usampl,eq_time
  #ifndef ISNAN
@@ -16193,7 +16413,7 @@ chip1=chip(itypi)
  !
  ! Compute the short-range fast-varying contributions to the energy
  !
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  #ifndef ISNAN
        external proc_proc
@@ -16556,7 +16776,7 @@ chip1=chip(itypi)
        subroutine gradient(n,x,nf,g,uiparm,urparm,ufparm)
  
        use io_base, only:intout,briefout
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CHAIN'
  !      include 'COMMON.DERIV'
@@ -16662,7 +16882,7 @@ chip1=chip(itypi)
        subroutine func(n,x,nf,f,uiparm,urparm,ufparm) !from minimize_p.F
  
        use comm_chu
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.DERIV'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
@@ -16698,7 +16918,7 @@ chip1=chip(itypi)
        end subroutine func
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine cartgrad
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
        use energy_data
        use MD_data, only: totT,usampl,eq_time
@@ -16730,13 +16950,13 @@ chip1=chip(itypi)
  #endif
  !#define DEBUG
  !el      write (iout,*) "After sum_gradient"
-!#ifdef DEBUG
-!      write (iout,*) "After sum_gradient"
-!      do i=1,nres-1
-!        write (iout,*) i," gradc  ",(gradc(j,i,icg),j=1,3)
-!        write (iout,*) i," gradx  ",(gradx(j,i,icg),j=1,3)
-!      enddo
-!#endif
+#ifdef DEBUG
+      write (iout,*) "After sum_gradient"
+      do i=1,nres-1
+        write (iout,*) i," gradc  ",(gradc(j,i,icg),j=1,3)
+        write (iout,*) i," gradx  ",(gradx(j,i,icg),j=1,3)
+      enddo
+#endif
  !#undef DEBUG
  ! If performing constraint dynamics, add the gradients of the constraint energy
        if(usampl.and.totT.gt.eq_time) then
@@ -16831,7 +17051,7 @@ chip1=chip(itypi)
            end subroutine cartgrad
        !-----------------------------------------------------------------------------
            subroutine zerograd
-      !      implicit real*8 (a-h,o-z)
+      !      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
        !      include 'DIMENSIONS'
        !      include 'COMMON.DERIV'
        !      include 'COMMON.CHAIN'
@@ -16964,6 +17184,14 @@ chip1=chip(itypi)
              gvdwc_peppho(j,i)=0.0d0
              gradnuclcatx(j,i)=0.0d0
              gradnuclcat(j,i)=0.0d0
+            gradlipbond(j,i)=0.0d0
+            gradlipang(j,i)=0.0d0
+            gradliplj(j,i)=0.0d0
+            gradlipelec(j,i)=0.0d0
+            gradcattranc(j,i)=0.0d0
+            gradcattranx(j,i)=0.0d0
+            gradcatangx(j,i)=0.0d0
+            gradcatangc(j,i)=0.0d0
            enddo
             enddo
            do i=0,nres
@@ -17028,7 +17256,7 @@ chip1=chip(itypi)
        ! intcartderiv.F
        !-----------------------------------------------------------------------------
            subroutine intcartderiv
-      !      implicit real*8 (a-h,o-z)
+      !      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
        !      include 'DIMENSIONS'
  #ifdef MPI
            include 'mpif.h'
@@ -17119,7 +17347,7 @@ chip1=chip(itypi)
  #else
            do i=3,nres
  #endif
-          if ((itype(i-1,1).ne.10).and.(itype(i-1,1).ne.ntyp1).and.molnum(i).ne.5) then
+          if ((itype(i-1,1).ne.10).and.(itype(i-1,1).ne.ntyp1).and.molnum(i).ge.4) then
            cost1=dcos(omicron(1,i))
            sint1=sqrt(1-cost1*cost1)
            cost2=dcos(omicron(2,i))
@@ -17668,7 +17896,7 @@ chip1=chip(itypi)
            end subroutine intcartderiv
        !-----------------------------------------------------------------------------
            subroutine checkintcartgrad
-      !      implicit real*8 (a-h,o-z)
+      !      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
        !      include 'DIMENSIONS'
  #ifdef MPI
            include 'mpif.h'
@@ -17829,7 +18057,7 @@ chip1=chip(itypi)
  ! q_measure.F
  !-----------------------------------------------------------------------------
        real(kind=8) function qwolynes(seg1,seg2,flag,seg3,seg4)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN' 
@@ -17905,7 +18133,7 @@ chip1=chip(itypi)
        end function qwolynes
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine qwolynes_prim(seg1,seg2,flag,seg3,seg4)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN' 
@@ -18018,7 +18246,7 @@ chip1=chip(itypi)
        end subroutine qwolynes_prim
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine qwol_num(seg1,seg2,flag,seg3,seg4)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.CHAIN' 
@@ -18065,7 +18293,7 @@ chip1=chip(itypi)
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine EconstrQ
  !     MD with umbrella_sampling using Wolyne's distance measure as a constraint
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CONTROL'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -18201,7 +18429,7 @@ chip1=chip(itypi)
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine dEconstrQ_num
  ! Calculating numerical dUconst/ddc and dUconst/ddx
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.CONTROL'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -20447,6 +20675,14 @@ chip1=chip(itypi)
        allocate(gradcatcat(3,-1:nres))
        allocate(gradnuclcat(3,-1:nres))
        allocate(gradnuclcatx(3,-1:nres))
+      allocate(gradlipbond(3,-1:nres))
+      allocate(gradlipang(3,-1:nres))
+      allocate(gradliplj(3,-1:nres))
+      allocate(gradlipelec(3,-1:nres))
+      allocate(gradcattranc(3,-1:nres))
+      allocate(gradcattranx(3,-1:nres))
+      allocate(gradcatangx(3,-1:nres))
+      allocate(gradcatangc(3,-1:nres))
  !(3,maxres)
        allocate(grad_shield_side(3,maxcontsshi,-1:nres))
        allocate(grad_shield_loc(3,maxcontsshi,-1:nres))
@@ -20636,6 +20872,25 @@ chip1=chip(itypi)
        allocate(newcontlistppj(300*nres))
        allocate(newcontlistscpj(350*nres))
        allocate(newcontlistj(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatsctrani(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatsctranj(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatptrani(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatptranj(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatscnormi(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatscnormj(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatpnormi(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatpnormj(300*nres))
+
+      allocate(newcontlistcatscangi(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatscangj(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatscangfi(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatscangfj(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatscangfk(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatscangti(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatscangtj(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatscangtk(300*nres))
+      allocate(newcontlistcatscangtl(300*nres))
+
  
        return
        end subroutine alloc_ener_arrays
@@ -20655,8 +20910,22 @@ chip1=chip(itypi)
        write (iout,*) "ibondp_start,ibondp_end",&
         ibondp_nucl_start,ibondp_nucl_end
        do i=ibondp_nucl_start,ibondp_nucl_end
-      if (itype(i-1,2).eq.ntyp1_molec(2) .or. &
-       itype(i,2).eq.ntyp1_molec(2)) cycle
+        
+        if (itype(i-1,2).eq.ntyp1_molec(2)&
+            .and.itype(i,2).eq.ntyp1_molec(2)) cycle
+        if (itype(i-1,2).eq.ntyp1_molec(2)&
+            .or. itype(i,2).eq.ntyp1_molec(2)) then
+!C          estr1=estr1+gnmr1(vbld(i),-1.0d0,distchainmax)
+!C          do j=1,3
+!C          gradb(j,i-1)=gnmr1prim(vbld(i),-1.0d0,distchainmax) &
+!C            *dc(j,i-1)/vbld(i)
+!C          enddo
+!C          if (energy_dec) write(iout,*) &
+!C             "estr1",i,gnmr1(vbld(i),-1.0d0,distchainmax)
+        diff = vbld(i)-vbldpDUM
+        else
+        diff = vbld(i)-vbldp0_nucl
+        endif
  !          estr1=estr1+gnmr1(vbld(i),-1.0d0,distchainmax)
  !          do j=1,3
  !          gradb(j,i-1)=gnmr1prim(vbld(i),-1.0d0,distchainmax)
@@ -20666,7 +20935,6 @@ chip1=chip(itypi)
  !     &       "estr1",i,vbld(i),distchainmax,
  !     &       gnmr1(vbld(i),-1.0d0,distchainmax)
  
-        diff = vbld(i)-vbldp0_nucl
          if(energy_dec)write(iout,*) "estr_nucl_bb" , i,vbld(i),&
          vbldp0_nucl,diff,AKP_nucl*diff*diff
          estr_nucl=estr_nucl+diff*diff
@@ -20917,7 +21185,7 @@ chip1=chip(itypi)
        end subroutine ebend_nucl
  !----------------------------------------------------
        subroutine etor_nucl(etors_nucl)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.VAR'
  !      include 'COMMON.GEO'
@@ -21696,7 +21964,7 @@ chip1=chip(itypi)
        esbloc = esbloc + sumene
        sumene2= enesc_nucl(x,xx,yy,0.0d0,cost2tab(i+1),sint2tab(i+1))
  !        print *,"enecomp",sumene,sumene2
-!        if (energy_dec) write(iout,*) "i",i," esbloc",sumene,esbloc,xx,yy,zz
+        if (energy_dec) write(iout,*) "i",i," esbloc",sumene,esbloc,xx,yy,zz
  !        if (energy_dec) write(iout,*) "x",(x(k),k=1,9)
  #ifdef DEBUG
        write (2,*) "x",(x(k),k=1,9)
@@ -22051,7 +22319,7 @@ chip1=chip(itypi)
        end subroutine multibody_hb_nucl
  !-----------------------------------------------------------
        real(kind=8) function ehbcorr_nucl(i,j,k,l,jj,kk,coeffp,coeffm)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.DERIV'
@@ -22126,7 +22394,7 @@ chip1=chip(itypi)
  !-------------------------------------------------------------------------
  
       real(kind=8) function ehbcorr3_nucl(i,j,k,l,jj,kk,coeffp,coeffm)
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.IOUNITS'
  !      include 'COMMON.DERIV'
@@ -22256,7 +22524,7 @@ chip1=chip(itypi)
        gg,r
  
        ecationcation=0.0d0
-      if (nres_molec(5).eq.0) return
+      if (nres_molec(5).le.1) return
        rcat0=3.472
        epscalc=0.05
        r06 = rcat0**6
@@ -22319,7 +22587,7 @@ chip1=chip(itypi)
          gradcatcat(k,i)=gradcatcat(k,i)-gg(k)
          gradcatcat(k,j)=gradcatcat(k,j)+gg(k)
        enddo
-      if (energy_dec) write (iout,*) i,j,Evan1cat,Evan2cat,Eeleccat,&
+      if (energy_dec) write (iout,*) "ecatcat",i,j,Evan1cat,Evan2cat,Eeleccat,&
         r012,rcal**6,ichargecat(itypi)*ichargecat(itypj)
  !        write(iout,*) "ecatcat",i,j, ecationcation,xj,yj,zj
        ecationcation=ecationcation+Evan1cat+Evan2cat+Eeleccat
@@ -23591,7 +23859,9 @@ chip1=chip(itypi)
         do i=1,4
            itmp=itmp+nres_molec(i)
         enddo
-       do i=iatsc_s_nucl,iatsc_e_nucl
+!       print *,nres_molec(2),"nres2"
+      do i=ibond_nucl_start,ibond_nucl_end
+!       do i=iatsc_s_nucl,iatsc_e_nucl
            if ((itype(i,2).eq.ntyp1_molec(2))) cycle ! leave dummy atoms
            xi=(c(1,i+nres))
            yi=(c(2,i+nres))
@@ -23606,6 +23876,7 @@ chip1=chip(itypi)
               yj=c(2,j)
               zj=c(3,j)
        call to_box(xj,yj,zj)
+!      print *,i,j,itmp
  !      write(iout,*) "xi,yi,zi,xj,yj,zj", xi,yi,zi,xj,yj,zj
  !      call lipid_layer(xj,yj,zj,sslipj,ssgradlipj)
  !      aa=aa_lip(itypi,itypj)*(sslipi+sslipj)/2.0d0 &
@@ -23783,7 +24054,7 @@ chip1=chip(itypi)
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine eprot_sc_base(escbase)
        use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -23861,6 +24132,7 @@ chip1=chip(itypi)
  !          BetaT = 1.0d0 / (298.0d0 * Rb)
  ! Gay-berne var's
          sig0ij = sigma_scbase( itypi,itypj )
+        if (sig0ij.lt.0.2) print *,"KURWA",sig0ij,itypi,itypj
          chi1   = chi_scbase( itypi, itypj,1 )
          chi2   = chi_scbase( itypi, itypj,2 )
  !          chi1=0.0d0
@@ -23986,8 +24258,10 @@ chip1=chip(itypi)
          pom = 1.0d0 - chis1 * chis2 * sqom12
          Lambf = (1.0d0 - (fac / pom))
          Lambf = dsqrt(Lambf)
-        sparrow = 1.0d0 / dsqrt(sig1**2.0d0 + sig2**2.0d0)
-!       write (*,*) "sparrow = ", sparrow
+        sparrow=dsqrt(sig1**2.0d0 + sig2**2.0d0)
+        if (b1.eq.0.0d0) sparrow=1.0d0
+        sparrow = 1.0d0 / sparrow
+!        write (*,*) "sparrow = ", sparrow,sig1,sig2,b1
          Chif = 1.0d0/rij * sparrow
          ChiLambf = Chif * Lambf
          eagle = dsqrt(ChiLambf)
@@ -24244,6 +24518,9 @@ chip1=chip(itypi)
         endif
  !       print *,i,j,evdwij,epol,Fcav,ECL
         escbase=escbase+evdwij+epol+Fcav+ECL
+       if (energy_dec) write (iout,'(a22,2i5,4f8.3,f16.3)'), &
+      "escbase:evdw,pol,cav,CL",i,j,evdwij,epol,Fcav,ECL,escbase
+       if (energy_dec) write (iout,*) "evdwij,", evdwij, 1.0/rij, sig, sig0ij
         call sc_grad_scbase
         enddo
        enddo
@@ -24294,6 +24571,7 @@ chip1=chip(itypi)
        gvdwc_scbase(k,i)=gvdwc_scbase(k,i)-gg(k)
        gvdwc_scbase(k,j)=gvdwc_scbase(k,j)+gg(k)
         END DO
+
         RETURN
        END SUBROUTINE sc_grad_scbase
  
@@ -24607,6 +24885,8 @@ chip1=chip(itypi)
         END DO
  !       print *,i,j,evdwij,Fcav,ECL,"vdw,cav,ecl"
         epepbase=epepbase+evdwij+Fcav+ECL
+       if (energy_dec) write (iout,'(a22,2i5,4f8.3,f16.3)'), &
+      "epepbase:evdw,pol,cav,CL",i,j,evdwij,epol,Fcav,ECL,epepbase
         call sc_grad_pepbase
         enddo
         enddo
@@ -24670,7 +24950,7 @@ chip1=chip(itypi)
        END SUBROUTINE sc_grad_pepbase
        subroutine eprot_sc_phosphate(escpho)
        use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -25148,7 +25428,7 @@ chip1=chip(itypi)
        END SUBROUTINE sc_grad_scpho
        subroutine eprot_pep_phosphate(epeppho)
        use calc_data
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -25337,6 +25617,9 @@ chip1=chip(itypi)
        gvdwc_peppho(k,i+1)= gvdwc_peppho(k,i+1) - 0.5*( gg(k))  &
               + (eom1*(erij(k)-om1*dc_norm(k,i)))*dsci_inv*2.0
        enddo
+       if (energy_dec) write (iout,'(a22,2i5,4f8.3,f16.3)'), &
+      "epeppho:evdw,pol,cav,CL",i,j,evdwij,epol,Fcav,ECL,epeppho
+
         epeppho=epeppho+evdwij+Fcav+ECL
  !          print *,i,j,evdwij,Fcav,ECL,rij_shift
         enddo
@@ -25346,7 +25629,7 @@ chip1=chip(itypi)
        subroutine emomo(evdw)
        use calc_data
        use comm_momo
-!      implicit real*8 (a-h,o-z)
+!      implicit real(kind=8) (a-h,o-z)
  !      include 'DIMENSIONS'
  !      include 'COMMON.GEO'
  !      include 'COMMON.VAR'
@@ -25515,11 +25798,14 @@ chip1=chip(itypi)
        ctail(k,1)=c(k,i+nres)-dtail(1,itypi,itypj)*dc_norm(k,nres+i)
        ctail(k,2)=c(k,j+nres)-dtail(2,itypi,itypj)*dc_norm(k,nres+j)
         END DO
+       call to_box (ctail(1,1),ctail(2,1),ctail(3,1))
+       call to_box (ctail(1,2),ctail(2,2),ctail(3,2))
+
  !c! tail distances will be themselves usefull elswhere
  !c1 (in Gcav, for example)
-       Rtail_distance(1) = ctail( 1, 2 ) - ctail( 1,1 )
-       Rtail_distance(2) = ctail( 2, 2 ) - ctail( 2,1 )
-       Rtail_distance(3) = ctail( 3, 2 ) - ctail( 3,1 )
+       Rtail_distance(1)=boxshift(ctail( 1, 2 ) - ctail( 1,1 ),boxxsize)
+       Rtail_distance(2)=boxshift(ctail( 2, 2 ) - ctail( 2,1 ),boxysize)
+       Rtail_distance(3)=boxshift(ctail( 3, 2 ) - ctail( 3,1 ),boxzsize)
         Rtail = dsqrt( &
          (Rtail_distance(1)*Rtail_distance(1)) &
        + (Rtail_distance(2)*Rtail_distance(2)) &
@@ -25537,11 +25823,26 @@ chip1=chip(itypi)
  ! see unres publications for very informative images
        chead(k,1) = c(k, i+nres) + d1 * dc_norm(k, i+nres)
        chead(k,2) = c(k, j+nres) + d2 * dc_norm(k, j+nres)
-! distance 
+! distance
+      enddo
+       if (energy_dec) write(iout,*) "before",chead(1,1),chead(2,1),chead(3,1)
+       if (energy_dec) write(iout,*) "before",chead(1,2),chead(2,2),chead(3,2)
+       call to_box (chead(1,1),chead(2,1),chead(3,1))
+       call to_box (chead(1,2),chead(2,2),chead(3,2))
+
+!c! head distances will be themselves usefull elswhere
+!c1 (in Gcav, for example)
+       if (energy_dec) write(iout,*) "after",chead(1,1),chead(2,1),chead(3,1)
+       if (energy_dec) write(iout,*) "after",chead(1,2),chead(2,2),chead(3,2)
+
+       Rhead_distance(1)=boxshift(chead( 1, 2 ) - chead( 1,1 ),boxxsize)
+       Rhead_distance(2)=boxshift(chead( 2, 2 ) - chead( 2,1 ),boxysize)
+       Rhead_distance(3)=boxshift(chead( 3, 2 ) - chead( 3,1 ),boxzsize)
+       if (energy_dec) write(iout,*) "after,rdi",(Rhead_distance(k),k=1,3)
  !        Rsc_distance(k) = dabs(c(k, i+nres) - c(k, j+nres))
  !        Rsc(k) = Rsc_distance(k) * Rsc_distance(k)
-      Rhead_distance(k) = chead(k,2) - chead(k,1)
-       END DO
+!      Rhead_distance(k) = chead(k,2) - chead(k,1)
+!       END DO
  ! pitagoras (root of sum of squares)
         Rhead = dsqrt( &
          (Rhead_distance(1)*Rhead_distance(1)) &
@@ -26291,16 +26592,40 @@ chip1=chip(itypi)
        jj = istate/ii
        d1 = dhead(1,ii,itypi,itypj)
        d2 = dhead(2,jj,itypi,itypj)
-      DO k = 1,3
-       chead(k,1) = c(k, i+nres) + d1 * dc_norm(k, i+nres)
-       chead(k,2) = c(k, j+nres) + d2 * dc_norm(k, j+nres)
-       Rhead_distance(k) = chead(k,2) - chead(k,1)
-      END DO
+      do k=1,3
+      chead(k,1) = c(k, i+nres) + d1 * dc_norm(k, i+nres)
+      chead(k,2) = c(k, j+nres) + d2 * dc_norm(k, j+nres)
+! distance
+      enddo
+       call to_box (chead(1,1),chead(2,1),chead(3,1))
+       call to_box (chead(1,2),chead(2,2),chead(3,2))
+
+!c! head distances will be themselves usefull elswhere
+!c1 (in Gcav, for example)
+
+       Rhead_distance(1)=boxshift(chead( 1, 2 ) - chead( 1,1 ),boxxsize)
+       Rhead_distance(2)=boxshift(chead( 2, 2 ) - chead( 2,1 ),boxysize)
+       Rhead_distance(3)=boxshift(chead( 3, 2 ) - chead( 3,1 ),boxzsize)
+!        Rsc_distance(k) = dabs(c(k, i+nres) - c(k, j+nres))
+!        Rsc(k) = Rsc_distance(k) * Rsc_distance(k)
+!      Rhead_distance(k) = chead(k,2) - chead(k,1)
+!       END DO
+! pitagoras (root of sum of squares)
+       Rhead = dsqrt( &
+        (Rhead_distance(1)*Rhead_distance(1)) &
+      + (Rhead_distance(2)*Rhead_distance(2)) &
+      + (Rhead_distance(3)*Rhead_distance(3)))
+
+!      DO k = 1,3
+!       chead(k,1) = c(k, i+nres) + d1 * dc_norm(k, i+nres)
+!       chead(k,2) = c(k, j+nres) + d2 * dc_norm(k, j+nres)
+!       Rhead_distance(k) = chead(k,2) - chead(k,1)
+!      END DO
  !c! pitagoras (root of sum of squares)
-      Rhead = dsqrt( &
-             (Rhead_distance(1)*Rhead_distance(1))  &
-           + (Rhead_distance(2)*Rhead_distance(2))  &
-           + (Rhead_distance(3)*Rhead_distance(3))) 
+!      Rhead = dsqrt( &
+!             (Rhead_distance(1)*Rhead_distance(1))  &
+!           + (Rhead_distance(2)*Rhead_distance(2))  &
+!           + (Rhead_distance(3)*Rhead_distance(3))) 
        END IF
        Rhead_sq = Rhead * Rhead
  
@@ -27681,11 +28006,237 @@ chip1=chip(itypi)
        gradtschebyshev=aux
        return
        end function gradtschebyshev
+!!!!!!!!!--------------------------------------------------------------
+      subroutine lipid_bond(elipbond)
+      real(kind=8) :: elipbond,fac,dist_sub,sumdist
+      real(kind=8), dimension(3):: dist
+      integer(kind=8) :: i,j,k,ibra,ityp,jtyp,ityp1
+      elipbond=0.0d0
+!      print *,"before",ilipbond_start,ilipbond_end
+      do i=ilipbond_start,ilipbond_end 
+!       print *,i,i+1,"i,i+1"
+       ityp=itype(i,4)
+       ityp1=itype(i+1,4)
+!       print *,ityp,ityp1,"itype"
+       j=i+1
+       if (ityp.eq.12) ibra=i
+       if ((ityp.eq.ntyp1_molec(4)).or.(ityp1.ge.ntyp1_molec(4)-1)) cycle
+       if (ityp.eq.(ntyp1_molec(4)-1)) then
+       !cofniecie do ostatnie GL1
+!       i=ibra
+       j=ibra
+       else
+       j=i
+       endif 
+       jtyp=itype(j,4)
+       do k=1,3
+        dist(k)=c(k,j)-c(k,i+1)
+       enddo
+       sumdist=0.0d0
+       do k=1,3
+       sumdist=sumdist+dist(k)**2
+       enddo
+       dist_sub=sqrt(sumdist)
+!       print *,"before",i,j,ityp1,ityp,jtyp
+       elipbond=elipbond+kbondlip*((dist_sub-lip_bond(jtyp,ityp1))**2)
+       fac=kbondlip*(dist_sub-lip_bond(jtyp,ityp1))
+       do k=1,3
+        gradlipbond(k,i+1)= gradlipbond(k,i+1)-fac*dist(k)/dist_sub
+        gradlipbond(k,j)=gradlipbond(k,j)+fac*dist(k)/dist_sub
+       enddo
+      if (energy_dec) write(iout,*) "lipbond",j,i+1,dist_sub,lip_bond(jtyp,ityp1),kbondlip,fac
+      enddo 
+      elipbond=elipbond*0.5d0
+      return
+      end subroutine lipid_bond
+!---------------------------------------------------------------------------------------
+      subroutine lipid_angle(elipang)
+      real(kind=8) :: elipang,alfa,xa(3),xb(3),alfaact,alfa0,force,fac,&
+      scalara,vnorm,wnorm,sss,sss_grad,eangle
+      integer :: i,j,k,l,m,ibra,ityp1,itypm1,itypp1
+      elipang=0.0d0
+!      print *,"ilipang_start,ilipang_end",ilipang_start,ilipang_end
+      do i=ilipang_start,ilipang_end 
+!       do i=4,4
+
+! the loop is centered on the central residue
+      itypm1=itype(i-1,4)
+      ityp1=itype(i,4)
+      itypp1=itype(i+1,4)
+!         print *,i,i,j,"processor",fg_rank
+      j=i-1
+      k=i
+      l=i+1
+      if (ityp1.eq.12) ibra=i
+      if ((itypm1.eq.ntyp1_molec(4)).or.(ityp1.eq.ntyp1_molec(4))&
+         .or.(itypp1.eq.ntyp1_molec(4))) cycle !cycle if any of the angles is dummy
+      if ((itypm1.eq.ntyp1_molec(4)-1).or.(itypp1.eq.ntyp1_molec(4)-1)) cycle
+     ! branching is only to one angle
+      if (ityp1.eq.ntyp1_molec(4)-1) then
+      k=ibra
+      j=ibra-1
+      endif
+      itypm1=itype(j,4)
+      ityp1=itype(k,4)
+      do m=1,3
+      xa(m)=c(m,j)-c(m,k)
+      xb(m)=c(m,l)-c(m,k)
+!      xb(m)=1.0d0
+      enddo
+      vnorm=dsqrt(xa(1)*xa(1)+xa(2)*xa(2)+xa(3)*xa(3))
+      wnorm=dsqrt(xb(1)*xb(1)+xb(2)*xb(2)+xb(3)*xb(3))
+      scalara=(xa(1)*xb(1)+xa(2)*xb(2)+xa(3)*xb(3))/(vnorm*wnorm)
+!      if (((scalar*scalar).gt.0.99999999d0).and.(alfa0.eq.180.0d0)) cycle
+      
+      alfaact=scalara
+!      sss=sscale_martini_angle(alfaact) 
+!      sss_grad=sscale_grad_martini_angle(alfaact)
+!      print *,sss_grad,"sss_grad",sss
+!      if (sss.le.0.0) cycle
+!      if (sss_grad.ne.0.0) print *,sss_grad,"sss_grad"
+      force=lip_angle_force(itypm1,ityp1,itypp1)
+      alfa0=lip_angle_angle(itypm1,ityp1,itypp1)
+      eangle=force*(alfaact-dcos(alfa0))*(alfaact-dcos(alfa0))*0.5d0
+      elipang=elipang+eangle!*(1001.0d0-1000.0d0*sss)
+      fac=force*(alfaact-dcos(alfa0))!*(1001.0d0-1000.0d0*sss)-sss_grad*eangle*1000.0d0
+      do m=1,3
+      gradlipang(m,j)=gradlipang(m,j)+(fac &!/dsqrt(1.0d0-scalar*scalar)&
+        *(xb(m)-scalara*wnorm*xa(m)/vnorm)&
+       /(vnorm*wnorm))!-sss_grad*eangle*xa(m)/vnorm
+
+      gradlipang(m,l)=gradlipang(m,l)+(fac & !/dsqrt(1.0d0-scalar*scalar)&
+       *(xa(m)-scalara*vnorm*xb(m)/wnorm)&
+       /(vnorm*wnorm))!+sss_grad*eangle*xb(m)/wnorm
+
+      gradlipang(m,k)=gradlipang(m,k)-(fac)&  !/dsqrt(1.0d0-scalar*scalar)&
+        *(xb(m)-scalara*wnorm*xa(m)/vnorm)&
+       /((vnorm*wnorm))-(fac & !/dsqrt(1.0d0-scalar*scalar)&
+       *(xa(m)-scalara*vnorm*xb(m)/wnorm)&
+       /(vnorm*wnorm))!-sss_grad*eangle*xa(m)/vnorm&
+                      !-sss_grad*eangle*xb(m)/wnorm
+
  
+!        *(xb(m)*vnorm*wnorm)&
+
+!-xa(m)*xa(m)*xb(m)*wnorm/vnorm)&
+      enddo
+      if (energy_dec) write(iout,*) "elipang",j,k,l,force,alfa0,alfaact,elipang
+      enddo
+      return
+      end subroutine lipid_angle
+!--------------------------------------------------------------------
+      subroutine lipid_lj(eliplj)
+      real(kind=8) :: eliplj,fac,sumdist,dist_sub,LJ1,LJ2,LJ,&
+                      xj,yj,zj,xi,yi,zi,sss,sss_grad
+      real(kind=8), dimension(3):: dist
+      integer :: i,j,k,inum,ityp,jtyp
+        do inum=iliplj_start,iliplj_end
+        i=mlipljlisti(inum)
+        j=mlipljlistj(inum)
+!         print *,inum,i,j,"processor",fg_rank
+        ityp=itype(i,4)
+        jtyp=itype(j,4)
+        xi=c(1,i)
+        yi=c(2,i)
+        zi=c(3,i)
+        call to_box(xi,yi,zi)
+        xj=c(1,j)
+        yj=c(2,j)
+        zj=c(3,j)
+      call to_box(xj,yj,zj)
+      xj=boxshift(xj-xi,boxxsize)
+      yj=boxshift(yj-yi,boxysize)
+      zj=boxshift(zj-zi,boxzsize)
+         dist(1)=xj
+         dist(2)=yj
+         dist(3)=zj
+       !  do k=1,3
+       !   dist(k)=c(k,j)-c(k,i)
+       !  enddo
+         sumdist=0.0d0
+         do k=1,3
+          sumdist=sumdist+dist(k)**2
+         enddo
+         
+         dist_sub=sqrt(sumdist)
+         sss=sscale_martini(dist_sub)
+         if (energy_dec) write(iout,*) "LJ LIP bef",i,j,ityp,jtyp,dist_sub
+         if (sss.le.0.0) cycle
+         sss_grad=sscale_grad_martini(dist_sub)
+          LJ1 = (lip_sig(ityp,jtyp)/dist_sub)**6
+          LJ2 = LJ1**2
+          LJ = LJ2 - LJ1
+          LJ = 4.0d0*lip_eps(ityp,jtyp)*LJ
+          eliplj = eliplj + LJ*sss
+          fac=4.0d0*lip_eps(ityp,jtyp)*(-6.0d0*LJ1/dist_sub+12.0d0*LJ2/dist_sub)
+         do k=1,3
+         gradliplj(k,i)=gradliplj(k,i)+fac*dist(k)/dist_sub*sss-sss_grad*LJ*dist(k)/dist_sub
+         gradliplj(k,j)=gradliplj(k,j)-fac*dist(k)/dist_sub*sss+sss_grad*LJ*dist(k)/dist_sub
+         enddo
+         if (energy_dec) write(iout,*) "LJ LIP",i,j,ityp,jtyp,LJ,dist_sub
+        enddo
+      return
+      end subroutine lipid_lj
+!--------------------------------------------------------------------------------------
+      subroutine lipid_elec(elipelec)
+      real(kind=8) :: elipelec,fac,sumdist,dist_sub,xj,yj,zj,xi,yi,zi,EQ,&
+      sss,sss_grad
+      real(kind=8), dimension(3):: dist
+      integer :: i,j,k,inum,ityp,jtyp
+        elipelec=0.0d0
+!        print *,"processor",fg_rank,ilip_elec_start,ilipelec_end
+        do inum=ilip_elec_start,ilipelec_end
+         i=mlipeleclisti(inum)
+         j=mlipeleclistj(inum)
+!         print *,inum,i,j,"processor",fg_rank
+         ityp=itype(i,4)
+         jtyp=itype(j,4)
+        xi=c(1,i)
+        yi=c(2,i)
+        zi=c(3,i)
+        call to_box(xi,yi,zi)
+        xj=c(1,j)
+        yj=c(2,j)
+        zj=c(3,j)
+      call to_box(xj,yj,zj)
+      xj=boxshift(xj-xi,boxxsize)
+      yj=boxshift(yj-yi,boxysize)
+      zj=boxshift(zj-zi,boxzsize)
+         dist(1)=xj
+         dist(2)=yj
+         dist(3)=zj
+!         do k=1,3
+!          dist(k)=c(k,j)-c(k,i)
+!         enddo
+         sumdist=0.0d0
+         do k=1,3
+          sumdist=sumdist+dist(k)**2
+         enddo
+         dist_sub=sqrt(sumdist)
+         sss=sscale_martini(dist_sub)
+!         print *,sss,dist_sub
+          if (energy_dec) write(iout,*) "EQ LIP",sss,dist_sub,i,j
+         if (sss.le.0.0) cycle
+         sss_grad=sscale_grad_martini(dist_sub)
+!         print *,"sss",sss,sss_grad
+         EQ=k_coulomb_lip*(ichargelipid(ityp)*ichargelipid(jtyp)/dist_sub)
+              elipelec=elipelec+EQ*sss
+         fac=k_coulomb_lip*(ichargelipid(ityp)*ichargelipid(jtyp)/sumdist)*sss
+         do k=1,3
+         gradlipelec(k,i)=gradlipelec(k,i)+fac*dist(k)/dist_sub&
+                                          -sss_grad*EQ*dist(k)/dist_sub
+         gradlipelec(k,j)=gradlipelec(k,j)-fac*dist(k)/dist_sub&
+                                          +sss_grad*EQ*dist(k)/dist_sub
+         enddo
+          if (energy_dec) write(iout,*) "EQ LIP",i,j,ityp,jtyp,EQ,dist_sub,elipelec
+        enddo
+      return
+      end subroutine lipid_elec
+!-------------------------------------------------------------------------
        subroutine make_SCSC_inter_list
        include 'mpif.h'
-      real*8 :: xi,yi,zi,xj,yj,zj,xj_safe,yj_safe,zj_safe,xj_temp,yj_temp,zj_temp
-      real*8 :: dist_init, dist_temp,r_buff_list
+      real(kind=8) :: xi,yi,zi,xj,yj,zj,xj_safe,yj_safe,zj_safe,xj_temp,yj_temp,zj_temp
+      real(kind=8) :: dist_init, dist_temp,r_buff_list
        integer:: contlisti(250*nres),contlistj(250*nres)
  !      integer :: newcontlisti(200*nres),newcontlistj(200*nres) 
        integer i,j,itypi,itypj,subchap,xshift,yshift,zshift,iint,ilist_sc,g_ilist_sc
@@ -27789,8 +28340,8 @@ chip1=chip(itypi)
        use MD_data,  only: itime_mat
  
        include 'mpif.h'
-      real*8 :: xi,yi,zi,xj,yj,zj,xj_safe,yj_safe,zj_safe,xj_temp,yj_temp,zj_temp
-      real*8 :: dist_init, dist_temp,r_buff_list
+      real(kind=8) :: xi,yi,zi,xj,yj,zj,xj_safe,yj_safe,zj_safe,xj_temp,yj_temp,zj_temp
+      real(kind=8) :: dist_init, dist_temp,r_buff_list
        integer:: contlistscpi(350*nres),contlistscpj(350*nres)
  !      integer :: newcontlistscpi(200*nres),newcontlistscpj(200*nres)
        integer i,j,itypi,itypj,subchap,xshift,yshift,zshift,iint,ilist_scp,g_ilist_scp
@@ -27915,10 +28466,10 @@ chip1=chip(itypi)
  
        subroutine make_pp_inter_list
        include 'mpif.h'
-      real*8 :: xi,yi,zi,xj,yj,zj,xj_safe,yj_safe,zj_safe,xj_temp,yj_temp,zj_temp
-      real*8 :: xmedj,ymedj,zmedj,sslipi,ssgradlipi,faclipij2,sslipj,ssgradlipj
-      real*8 :: dist_init, dist_temp,r_buff_list,dxi,dyi,dzi,xmedi,ymedi,zmedi
-      real*8 :: dx_normi,dy_normi,dz_normi,dxj,dyj,dzj,dx_normj,dy_normj,dz_normj
+      real(kind=8) :: xi,yi,zi,xj,yj,zj,xj_safe,yj_safe,zj_safe,xj_temp,yj_temp,zj_temp
+      real(kind=8) :: xmedj,ymedj,zmedj,sslipi,ssgradlipi,faclipij2,sslipj,ssgradlipj
+      real(kind=8) :: dist_init, dist_temp,r_buff_list,dxi,dyi,dzi,xmedi,ymedi,zmedi
+      real(kind=8) :: dx_normi,dy_normi,dz_normi,dxj,dyj,dzj,dx_normj,dy_normj,dz_normj
        integer:: contlistppi(250*nres),contlistppj(250*nres)
  !      integer :: newcontlistppi(200*nres),newcontlistppj(200*nres)
        integer i,j,itypi,itypj,subchap,xshift,yshift,zshift,iint,ilist_pp,g_ilist_pp
@@ -28025,76 +28576,1505 @@ chip1=chip(itypi)
  #endif
        return
        end subroutine make_pp_inter_list
+!---------------------------------------------------------------------------
+      subroutine make_cat_pep_list
+      include 'mpif.h'
+      real(kind=8) :: xi,yi,zi,xj,yj,zj,xj_safe,yj_safe,zj_safe,xj_temp,yj_temp,zj_temp
+      real(kind=8) :: xmedj,ymedj,zmedj,sslipi,ssgradlipi,faclipij2,sslipj,ssgradlipj
+      real(kind=8) :: dist_init, dist_temp,r_buff_list,dxi,dyi,dzi,xmedi,ymedi,zmedi
+      real(kind=8) :: dx_normi,dy_normi,dz_normi,dxj,dyj,dzj,dx_normj,dy_normj,dz_normj
+      real(kind=8) :: xja,yja,zja
+      integer:: contlistcatpnormi(250*nres),contlistcatpnormj(250*nres)
+      integer:: contlistcatscnormi(250*nres),contlistcatscnormj(250*nres)
+      integer:: contlistcatptrani(250*nres),contlistcatptranj(250*nres)
+      integer:: contlistcatsctrani(250*nres),contlistcatsctranj(250*nres)
+      integer:: contlistcatscangi(250*nres),contlistcatscangj(250*nres)
+      integer:: contlistcatscangfi(250*nres),contlistcatscangfj(250*nres),&
+                contlistcatscangfk(250*nres)
+      integer:: contlistcatscangti(250*nres),contlistcatscangtj(250*nres)
+      integer:: contlistcatscangtk(250*nres),contlistcatscangtl(250*nres)
  
-!-----------------------------------------------------------------------------
-      double precision function boxshift(x,boxsize)
-      implicit none
-      double precision x,boxsize
-      double precision xtemp
-      xtemp=dmod(x,boxsize)
-      if (dabs(xtemp-boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
-        boxshift=xtemp-boxsize
-      else if (dabs(xtemp+boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
-        boxshift=xtemp+boxsize
-      else
-        boxshift=xtemp
-      endif
-      return
-      end function boxshift
-!-----------------------------------------------------------------------------
-      subroutine to_box(xi,yi,zi)
-      implicit none
-!      include 'DIMENSIONS'
-!      include 'COMMON.CHAIN'
-      double precision xi,yi,zi
-      xi=dmod(xi,boxxsize)
-      if (xi.lt.0.0d0) xi=xi+boxxsize
-      yi=dmod(yi,boxysize)
-      if (yi.lt.0.0d0) yi=yi+boxysize
-      zi=dmod(zi,boxzsize)
-      if (zi.lt.0.0d0) zi=zi+boxzsize
-      return
-      end subroutine to_box
-!--------------------------------------------------------------------------
-      subroutine lipid_layer(xi,yi,zi,sslipi,ssgradlipi)
-      implicit none
-!      include 'DIMENSIONS'
-!      include 'COMMON.IOUNITS'
-!      include 'COMMON.CHAIN'
-      double precision xi,yi,zi,sslipi,ssgradlipi
-      double precision fracinbuf
-!      double precision sscalelip,sscagradlip
-#ifdef DEBUG
-      write (iout,*) "bordlipbot",bordlipbot," bordliptop",bordliptop
-      write (iout,*) "buflipbot",buflipbot," lipbufthick",lipbufthick
-      write (iout,*) "xi yi zi",xi,yi,zi
-#endif
-      if ((zi.gt.bordlipbot).and.(zi.lt.bordliptop)) then
-! the energy transfer exist
-        if (zi.lt.buflipbot) then
-! what fraction I am in
-          fracinbuf=1.0d0-((zi-bordlipbot)/lipbufthick)
-! lipbufthick is thickenes of lipid buffore
-          sslipi=sscalelip(fracinbuf)
-          ssgradlipi=-sscagradlip(fracinbuf)/lipbufthick
-        elseif (zi.gt.bufliptop) then
-          fracinbuf=1.0d0-((bordliptop-zi)/lipbufthick)
-          sslipi=sscalelip(fracinbuf)
-          ssgradlipi=sscagradlip(fracinbuf)/lipbufthick
-        else
-          sslipi=1.0d0
-          ssgradlipi=0.0
-        endif
-      else
-        sslipi=0.0d0
-        ssgradlipi=0.0
-      endif
-#ifdef DEBUG
-      write (iout,*) "sslipi",sslipi," ssgradlipi",ssgradlipi
-#endif
-      return
-      end subroutine lipid_layer
  
-!-------------------------------------------------------------------------- 
+!      integer :: newcontlistppi(200*nres),newcontlistppj(200*nres)
+      integer i,j,itypi,itypj,subchap,xshift,yshift,zshift,iint,ilist_catscnorm,&
+              ilist_catsctran,ilist_catpnorm,ilist_catptran,itmp,ilist_catscang,&
+              ilist_catscangf,ilist_catscangt,k
+      integer displ(0:nprocs),i_ilist_catscnorm(0:nprocs),ierr,&
+             i_ilist_catpnorm(0:nprocs),i_ilist_catsctran(0:nprocs),&
+             i_ilist_catptran(0:nprocs),i_ilist_catscang(0:nprocs),&
+             i_ilist_catscangf(0:nprocs),i_ilist_catscangt(0:nprocs)
+!            write(iout,*),"START make_pp",iatel_s,iatel_e,r_cut_ele+r_buff_list
+            ilist_catpnorm=0
+            ilist_catscnorm=0
+            ilist_catptran=0
+            ilist_catsctran=0
+            ilist_catscang=0
+
+
+      r_buff_list=6.0
+      itmp=0
+      do i=1,4
+      itmp=itmp+nres_molec(i)
+      enddo
+!        go to 17
+!        do i=1,nres_molec(1)-1  ! loop over all peptide groups needs parralelization
+      do i=ibond_start,ibond_end
+
+!        print *,"I am in EVDW",i
+      itypi=iabs(itype(i,1))
+
+!        if (i.ne.47) cycle
+      if ((itypi.eq.ntyp1).or.(itypi.eq.10)) cycle
+!      itypi1=iabs(itype(i+1,1))
+      xi=c(1,nres+i)
+      yi=c(2,nres+i)
+      zi=c(3,nres+i)
+      call to_box(xi,yi,zi)
+      dxi=dc_norm(1,nres+i)
+      dyi=dc_norm(2,nres+i)
+      dzi=dc_norm(3,nres+i)
+        xmedi=c(1,i)+0.5d0*dxi
+        ymedi=c(2,i)+0.5d0*dyi
+        zmedi=c(3,i)+0.5d0*dzi
+        call to_box(xmedi,ymedi,zmedi)
+
+!      dsci_inv=vbld_inv(i+nres)
+       do j=itmp+1,itmp+nres_molec(5)
+          dxj=dc(1,j)
+          dyj=dc(2,j)
+          dzj=dc(3,j)
+          dx_normj=dc_norm(1,j)
+          dy_normj=dc_norm(2,j)
+          dz_normj=dc_norm(3,j)
+          xj=c(1,j)
+          yj=c(2,j)
+          zj=c(3,j)
+          call to_box(xj,yj,zj)
+!          call lipid_layer(xj,yj,zj,sslipj,ssgradlipj)
+!          faclipij2=(sslipi+sslipj)/2.0d0*lipscale**2+1.0d0
+          xja=boxshift(xj-xmedi,boxxsize)
+          yja=boxshift(yj-ymedi,boxysize)
+          zja=boxshift(zj-zmedi,boxzsize)
+          dist_init=xja**2+yja**2+zja**2
+      if (sqrt(dist_init).le.(r_cut_ele+r_buff_list)) then
+! Here the list is created
+              if (itype(j,5).le.5) then
+                 ilist_catpnorm=ilist_catpnorm+1
+! this can be substituted by cantor and anti-cantor
+                 contlistcatpnormi(ilist_catpnorm)=i
+                 contlistcatpnormj(ilist_catpnorm)=j
+              else
+                 ilist_catptran=ilist_catptran+1
+! this can be substituted by cantor and anti-cantor
+                 contlistcatptrani(ilist_catptran)=i
+                 contlistcatptranj(ilist_catptran)=j
+              endif
+       endif
+          xja=boxshift(xj-xi,boxxsize)
+          yja=boxshift(yj-yi,boxysize)
+          zja=boxshift(zj-zi,boxzsize)
+          dist_init=xja**2+yja**2+zja**2
+      if (sqrt(dist_init).le.(r_cut_ele+r_buff_list)) then
+! Here the list is created
+              if (itype(j,5).le.5) then
+                 ilist_catscnorm=ilist_catscnorm+1
+! this can be substituted by cantor and anti-cantor
+                 contlistcatscnormi(ilist_catscnorm)=i
+                 contlistcatscnormj(ilist_catscnorm)=j
+              else
+                 ilist_catsctran=ilist_catsctran+1
+! this can be substituted by cantor and anti-cantor
+                 contlistcatsctrani(ilist_catsctran)=i
+                 contlistcatsctranj(ilist_catsctran)=j
+!                 print *,"KUR**",i,j,itype(i,1)
+               if (((itype(i,1).eq.1).or.(itype(i,1).eq.15).or.&
+                   (itype(i,1).eq.16).or.(itype(i,1).eq.17)).and.&
+                   ((sqrt(dist_init).le.(r_cut_ang+r_buff_list)))) then
+!                   print *,"KUR**2",i,j,itype(i,1),ilist_catscang+1
+
+                   ilist_catscang=ilist_catscang+1
+                   contlistcatscangi(ilist_catscang)=i
+                   contlistcatscangj(ilist_catscang)=j
+                endif
+
+              endif
+      endif
+!             enddo
+             enddo
+             enddo
+#ifdef DEBUG
+      write (iout,*) "before MPIREDUCE",ilist_catsctran,ilist_catptran,&
+      ilist_catscnorm,ilist_catpnorm,ilist_catscang
+
+      do i=1,ilist_catsctran
+      write (iout,*) i,contlistcatsctrani(i),contlistcatsctranj(i)
+      enddo
+      do i=1,ilist_catptran
+      write (iout,*) i,contlistcatptrani(i),contlistcatsctranj(i)
+      enddo
+      do i=1,ilist_catscnorm
+      write (iout,*) i,contlistcatscnormi(i),contlistcatsctranj(i)
+      enddo
+      do i=1,ilist_catpnorm
+      write (iout,*) i,contlistcatpnormi(i),contlistcatsctranj(i)
+      enddo
+      do i=1,ilist_catscang
+      write (iout,*) i,contlistcatscangi(i),contlistcatscangi(i)
+      enddo
+
+
+#endif
+      if (nfgtasks.gt.1)then
+
+        call MPI_Reduce(ilist_catsctran,g_ilist_catsctran,1,&
+          MPI_INTEGER,MPI_SUM,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+        call MPI_Gather(ilist_catsctran,1,MPI_INTEGER,&
+                        i_ilist_catsctran,1,MPI_INTEGER,king,FG_COMM,IERR)
+        displ(0)=0
+        do i=1,nfgtasks-1,1
+          displ(i)=i_ilist_catsctran(i-1)+displ(i-1)
+        enddo
+!        write(iout,*) "before gather",displ(0),displ(1)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatsctrani,ilist_catsctran,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatsctrani,i_ilist_catsctran,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatsctranj,ilist_catsctran,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatsctranj,i_ilist_catsctran,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(g_ilist_catsctran,1,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+!        call MPI_Bcast(g_ilist_sc,1,MPI_INT,king,FG_COMM)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatsctrani,g_ilist_catsctran,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatsctranj,g_ilist_catsctran,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+
+
+        call MPI_Reduce(ilist_catptran,g_ilist_catptran,1,&
+          MPI_INTEGER,MPI_SUM,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+        call MPI_Gather(ilist_catptran,1,MPI_INTEGER,&
+                        i_ilist_catptran,1,MPI_INTEGER,king,FG_COMM,IERR)
+        displ(0)=0
+        do i=1,nfgtasks-1,1
+          displ(i)=i_ilist_catptran(i-1)+displ(i-1)
+        enddo
+!        write(iout,*) "before gather",displ(0),displ(1)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatptrani,ilist_catptran,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatptrani,i_ilist_catptran,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatptranj,ilist_catptran,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatptranj,i_ilist_catptran,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(g_ilist_catptran,1,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+!        call MPI_Bcast(g_ilist_sc,1,MPI_INT,king,FG_COMM)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatptrani,g_ilist_catptran,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatptranj,g_ilist_catptran,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+
+!        call MPI_Bcast(g_ilist_sc,1,MPI_INT,king,FG_COMM)
+
+        call MPI_Reduce(ilist_catscnorm,g_ilist_catscnorm,1,&
+          MPI_INTEGER,MPI_SUM,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+        call MPI_Gather(ilist_catscnorm,1,MPI_INTEGER,&
+                        i_ilist_catscnorm,1,MPI_INTEGER,king,FG_COMM,IERR)
+        displ(0)=0
+        do i=1,nfgtasks-1,1
+          displ(i)=i_ilist_catscnorm(i-1)+displ(i-1)
+        enddo
+!        write(iout,*) "before gather",displ(0),displ(1)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscnormi,ilist_catscnorm,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscnormi,i_ilist_catscnorm,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscnormj,ilist_catscnorm,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscnormj,i_ilist_catscnorm,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(g_ilist_catscnorm,1,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+!        call MPI_Bcast(g_ilist_sc,1,MPI_INT,king,FG_COMM)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscnormi,g_ilist_catscnorm,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscnormj,g_ilist_catscnorm,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+
+
+
+        call MPI_Reduce(ilist_catpnorm,g_ilist_catpnorm,1,&
+          MPI_INTEGER,MPI_SUM,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+        call MPI_Gather(ilist_catpnorm,1,MPI_INTEGER,&
+                        i_ilist_catpnorm,1,MPI_INTEGER,king,FG_COMM,IERR)
+        displ(0)=0
+        do i=1,nfgtasks-1,1
+          displ(i)=i_ilist_catpnorm(i-1)+displ(i-1)
+        enddo
+!        write(iout,*) "before gather",displ(0),displ(1)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatpnormi,ilist_catpnorm,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatpnormi,i_ilist_catpnorm,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatpnormj,ilist_catpnorm,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatpnormj,i_ilist_catpnorm,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(g_ilist_catpnorm,1,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+!        call MPI_Bcast(g_ilist_sc,1,MPI_INT,king,FG_COMM)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatpnormi,g_ilist_catpnorm,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatpnormj,g_ilist_catpnorm,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+
+
+
+        call MPI_Reduce(ilist_catscang,g_ilist_catscang,1,&
+          MPI_INTEGER,MPI_SUM,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+        call MPI_Gather(ilist_catscang,1,MPI_INTEGER,&
+                        i_ilist_catscang,1,MPI_INTEGER,king,FG_COMM,IERR)
+        displ(0)=0
+        do i=1,nfgtasks-1,1
+          displ(i)=i_ilist_catscang(i-1)+displ(i-1)
+        enddo
+!        write(iout,*) "before gather",displ(0),displ(1)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscangi,ilist_catscang,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscangi,i_ilist_catscang,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscangj,ilist_catscang,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscangj,i_ilist_catscang,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(g_ilist_catscang,1,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+!        call MPI_Bcast(g_ilist_sc,1,MPI_INT,king,FG_COMM)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscangi,g_ilist_catscang,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscangj,g_ilist_catscang,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+
+
+        else
+        g_ilist_catscnorm=ilist_catscnorm
+        g_ilist_catsctran=ilist_catsctran
+        g_ilist_catpnorm=ilist_catpnorm
+        g_ilist_catptran=ilist_catptran
+        g_ilist_catscang=ilist_catscang
+
+
+        do i=1,ilist_catscnorm
+        newcontlistcatscnormi(i)=contlistcatscnormi(i)
+        newcontlistcatscnormj(i)=contlistcatscnormj(i)
+        enddo
+        do i=1,ilist_catpnorm
+        newcontlistcatpnormi(i)=contlistcatpnormi(i)
+        newcontlistcatpnormj(i)=contlistcatpnormj(i)
+        enddo
+        do i=1,ilist_catsctran
+        newcontlistcatsctrani(i)=contlistcatsctrani(i)
+        newcontlistcatsctranj(i)=contlistcatsctranj(i)
+        enddo
+        do i=1,ilist_catptran
+        newcontlistcatptrani(i)=contlistcatptrani(i)
+        newcontlistcatptranj(i)=contlistcatptranj(i)
+        enddo
+
+        do i=1,ilist_catscang
+        newcontlistcatscangi(i)=contlistcatscangi(i)
+        newcontlistcatscangj(i)=contlistcatscangj(i)
+        enddo
+
+
+        endif
+        call int_bounds(g_ilist_catsctran,g_listcatsctran_start,g_listcatsctran_end)
+        call int_bounds(g_ilist_catptran,g_listcatptran_start,g_listcatptran_end)
+        call int_bounds(g_ilist_catscnorm,g_listcatscnorm_start,g_listcatscnorm_end)
+        call int_bounds(g_ilist_catpnorm,g_listcatpnorm_start,g_listcatpnorm_end)
+        call int_bounds(g_ilist_catscang,g_listcatscang_start,g_listcatscang_end)
+! make new ang list
+        ilist_catscangf=0
+        do i=g_listcatscang_start,g_listcatscang_end
+         do j=2,g_ilist_catscang
+!          print *,"RWA",i,j,contlistcatscangj(i),contlistcatscangj(j)
+          if (j.le.i) cycle
+          if (newcontlistcatscangj(i).ne.newcontlistcatscangj(j)) cycle
+                   ilist_catscangf=ilist_catscangf+1
+                   contlistcatscangfi(ilist_catscangf)=newcontlistcatscangi(i)
+                   contlistcatscangfj(ilist_catscangf)=newcontlistcatscangj(i)
+                   contlistcatscangfk(ilist_catscangf)=newcontlistcatscangi(j)
+!          print *,"TUTU",g_listcatscang_start,g_listcatscang_end,i,j,g_ilist_catscangf,myrank
+         enddo
+        enddo
+      if (nfgtasks.gt.1)then
+
+        call MPI_Reduce(ilist_catscangf,g_ilist_catscangf,1,&
+          MPI_INTEGER,MPI_SUM,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+        call MPI_Gather(ilist_catscangf,1,MPI_INTEGER,&
+                        i_ilist_catscangf,1,MPI_INTEGER,king,FG_COMM,IERR)
+        displ(0)=0
+        do i=1,nfgtasks-1,1
+          displ(i)=i_ilist_catscangf(i-1)+displ(i-1)
+        enddo
+!        write(iout,*) "before gather",displ(0),displ(1)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscangfi,ilist_catscangf,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscangfi,i_ilist_catscangf,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscangfj,ilist_catscangf,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscangfj,i_ilist_catscangf,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscangfk,ilist_catscangf,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscangfk,i_ilist_catscangf,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+
+        call MPI_Bcast(g_ilist_catscangf,1,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+!        call MPI_Bcast(g_ilist_sc,1,MPI_INT,king,FG_COMM)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscangfi,g_ilist_catscangf,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscangfj,g_ilist_catscangf,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscangfk,g_ilist_catscangf,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        else
+        g_ilist_catscangf=ilist_catscangf
+        do i=1,ilist_catscangf
+        newcontlistcatscangfi(i)=contlistcatscangfi(i)
+        newcontlistcatscangfj(i)=contlistcatscangfj(i)
+        newcontlistcatscangfk(i)=contlistcatscangfk(i)
+        enddo
+        endif
+        call int_bounds(g_ilist_catscangf,g_listcatscangf_start,g_listcatscangf_end)
+
+
+        ilist_catscangt=0
+        do i=g_listcatscang_start,g_listcatscang_end
+         do j=1,g_ilist_catscang
+         do k=1,g_ilist_catscang
+!          print *,"TUTU1",g_listcatscang_start,g_listcatscang_end,i,j
+
+          if (newcontlistcatscangj(i).ne.newcontlistcatscangj(j)) cycle
+          if (newcontlistcatscangj(i).ne.newcontlistcatscangj(k)) cycle
+          if (newcontlistcatscangj(k).ne.newcontlistcatscangj(j)) cycle
+          if (newcontlistcatscangi(i).eq.newcontlistcatscangi(j)) cycle
+          if (newcontlistcatscangi(i).eq.newcontlistcatscangi(k)) cycle
+          if (newcontlistcatscangi(k).eq.newcontlistcatscangi(j)) cycle
+!          print *,"TUTU2",g_listcatscang_start,g_listcatscang_end,i,j
+
+                   ilist_catscangt=ilist_catscangt+1
+                   contlistcatscangti(ilist_catscangt)=newcontlistcatscangi(i)
+                   contlistcatscangtj(ilist_catscangt)=newcontlistcatscangj(i)
+                   contlistcatscangtk(ilist_catscangt)=newcontlistcatscangi(j)
+                   contlistcatscangtl(ilist_catscangt)=newcontlistcatscangi(k)
+
+         enddo
+        enddo
+       enddo
+      if (nfgtasks.gt.1)then
+
+        call MPI_Reduce(ilist_catscangt,g_ilist_catscangt,1,&
+          MPI_INTEGER,MPI_SUM,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+        call MPI_Gather(ilist_catscangt,1,MPI_INTEGER,&
+                        i_ilist_catscangt,1,MPI_INTEGER,king,FG_COMM,IERR)
+        displ(0)=0
+        do i=1,nfgtasks-1,1
+          displ(i)=i_ilist_catscangt(i-1)+displ(i-1)
+        enddo
+!        write(iout,*) "before gather",displ(0),displ(1)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscangti,ilist_catscangt,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscangti,i_ilist_catscangt,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscangtj,ilist_catscangt,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscangtj,i_ilist_catscangt,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscangtk,ilist_catscangt,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscangtk,i_ilist_catscangt,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Gatherv(contlistcatscangtl,ilist_catscangt,MPI_INTEGER,&
+                         newcontlistcatscangtl,i_ilist_catscangt,displ,MPI_INTEGER,&
+                         king,FG_COMM,IERR)
+
+        call MPI_Bcast(g_ilist_catscangt,1,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+!        write(iout,*) "before bcast",g_ilist_sc
+!        call MPI_Bcast(g_ilist_sc,1,MPI_INT,king,FG_COMM)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscangti,g_ilist_catscangt,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscangtj,g_ilist_catscangt,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscangtk,g_ilist_catscangt,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+        call MPI_Bcast(newcontlistcatscangtl,g_ilist_catscangt,MPI_INT,king,FG_COMM,IERR)
+
+        else
+        g_ilist_catscangt=ilist_catscangt
+        do i=1,ilist_catscangt
+        newcontlistcatscangti(i)=contlistcatscangti(i)
+        newcontlistcatscangtj(i)=contlistcatscangtj(i)
+        newcontlistcatscangtk(i)=contlistcatscangtk(i)
+        newcontlistcatscangtl(i)=contlistcatscangtl(i)
+        enddo
+        endif
+        call int_bounds(g_ilist_catscangt,g_listcatscangt_start,g_listcatscangt_end)
+
+
+
+
+
+#ifdef DEBUG
+      write (iout,*) "after MPIREDUCE",ilist_catsctran,ilist_catptran, &
+      ilist_catscnorm,ilist_catpnorm
+
+      do i=1,g_ilist_catsctran
+      write (iout,*) i,newcontlistcatsctrani(i),newcontlistcatsctranj(i)
+      enddo
+      do i=1,g_ilist_catptran
+      write (iout,*) i,newcontlistcatptrani(i),newcontlistcatsctranj(i)
+      enddo
+      do i=1,g_ilist_catscnorm
+      write (iout,*) i,newcontlistcatscnormi(i),newcontlistcatscnormj(i)
+      enddo
+      do i=1,g_ilist_catpnorm
+      write (iout,*) i,newcontlistcatpnormi(i),newcontlistcatscnormj(i)
+      enddo
+      do i=1,g_ilist_catscang
+      write (iout,*) i,newcontlistcatscangi(i),newcontlistcatscangj(i)
+      enddo
+#endif
+      return
+      end subroutine make_cat_pep_list
+
+
+
+!-----------------------------------------------------------------------------
+      double precision function boxshift(x,boxsize)
+      implicit none
+      double precision x,boxsize
+      double precision xtemp
+      xtemp=dmod(x,boxsize)
+      if (dabs(xtemp-boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        boxshift=xtemp-boxsize
+      else if (dabs(xtemp+boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        boxshift=xtemp+boxsize
+      else
+        boxshift=xtemp
+      endif
+      return
+      end function boxshift
+!-----------------------------------------------------------------------------
+      subroutine to_box(xi,yi,zi)
+      implicit none
+!      include 'DIMENSIONS'
+!      include 'COMMON.CHAIN'
+      double precision xi,yi,zi
+      xi=dmod(xi,boxxsize)
+      if (xi.lt.0.0d0) xi=xi+boxxsize
+      yi=dmod(yi,boxysize)
+      if (yi.lt.0.0d0) yi=yi+boxysize
+      zi=dmod(zi,boxzsize)
+      if (zi.lt.0.0d0) zi=zi+boxzsize
+      return
+      end subroutine to_box
+!--------------------------------------------------------------------------
+      subroutine lipid_layer(xi,yi,zi,sslipi,ssgradlipi)
+      implicit none
+!      include 'DIMENSIONS'
+!      include 'COMMON.IOUNITS'
+!      include 'COMMON.CHAIN'
+      double precision xi,yi,zi,sslipi,ssgradlipi
+      double precision fracinbuf
+!      double precision sscalelip,sscagradlip
+#ifdef DEBUG
+      write (iout,*) "bordlipbot",bordlipbot," bordliptop",bordliptop
+      write (iout,*) "buflipbot",buflipbot," lipbufthick",lipbufthick
+      write (iout,*) "xi yi zi",xi,yi,zi
+#endif
+      if ((zi.gt.bordlipbot).and.(zi.lt.bordliptop)) then
+! the energy transfer exist
+        if (zi.lt.buflipbot) then
+! what fraction I am in
+          fracinbuf=1.0d0-((zi-bordlipbot)/lipbufthick)
+! lipbufthick is thickenes of lipid buffore
+          sslipi=sscalelip(fracinbuf)
+          ssgradlipi=-sscagradlip(fracinbuf)/lipbufthick
+        elseif (zi.gt.bufliptop) then
+          fracinbuf=1.0d0-((bordliptop-zi)/lipbufthick)
+          sslipi=sscalelip(fracinbuf)
+          ssgradlipi=sscagradlip(fracinbuf)/lipbufthick
+        else
+          sslipi=1.0d0
+          ssgradlipi=0.0
+        endif
+      else
+        sslipi=0.0d0
+        ssgradlipi=0.0
+      endif
+#ifdef DEBUG
+      write (iout,*) "sslipi",sslipi," ssgradlipi",ssgradlipi
+#endif
+      return
+      end subroutine lipid_layer
+!-------------------------------------------------------------
+      subroutine ecat_prot_transition(ecation_prottran)
+      integer:: itypi,itypj,ityptrani,ityptranj,k,l,i,j
+      real(kind=8),dimension(3):: cjtemp,citemp,diff,dsctemp,vecsc,&
+                  diffnorm,boxx,r,dEvan1Cm,dEvan2Cm,dEtotalCm
+      real(kind=8):: ecation_prottran,dista,sdist,De,ene,x0left,&
+                    alphac,grad,sumvec,simplesum,pom,erdxi,facd1,&
+                    sss_ele_cut,sss_ele_cut_grad,sss2min,sss2mingrad,&
+                    ene1,ene2,grad1,grad2,evan1,evan2,rcal,r4,r7,r0p,&
+                    r06,r012,epscalc,rocal,ract
+      ecation_prottran=0.0d0
+      boxx(1)=boxxsize
+      boxx(2)=boxysize
+      boxx(3)=boxzsize
+      do k=g_listcatsctran_start,g_listcatsctran_end
+        i=newcontlistcatsctrani(k)
+        j=newcontlistcatsctranj(k)
+!        print *,i,j,"in new tran"
+        do  l=1,3
+          citemp(l)=c(l,i+nres)
+          cjtemp(l)=c(l,j)
+         enddo
+
+         itypi=itype(i,1) !as the first is the protein part
+         itypj=itype(j,5) !as the second part is always cation
+! remapping to internal types
+!       read (iiontran,*,err=123,end=123) (agamacattran(k,j,i),k=1,3),&
+!       (athetacattran(k,j,i),k=1,6),acatshiftdsc(j,i),bcatshiftdsc(j,i),&
+!       demorsecat(j,i),alphamorsecat(j,i),x0catleft(j,i),x0catright(j,i),&
+!       x0cattrans(j,i)
+      
+         if (itypj.eq.6) then
+          ityptranj=1 !as now only Zn2+ is this needs to be modified for other ions
+         endif
+         if (itypi.eq.16) then
+          ityptrani=1
+         elseif (itypi.eq.1)  then
+          ityptrani=2
+         elseif (itypi.eq.15) then 
+          ityptrani=3
+         elseif (itypi.eq.17) then 
+          ityptrani=4
+         elseif (itypi.eq.2)  then 
+          ityptrani=5
+         else
+          ityptrani=6
+         endif
+
+         if (ityptrani.gt.ntrantyp(ityptranj)) then 
+!         do l=1,3
+!         write(iout,*),gradcattranc(l,j),gradcattranx(l,i)
+!         enddo
+!volume excluded
+         call to_box(cjtemp(1),cjtemp(2),cjtemp(3))
+         call to_box(citemp(1),citemp(2),citemp(3))
+         rcal=0.0d0
+         do l=1,3
+         r(l)=boxshift(cjtemp(l)-citemp(l),boxx(l))
+         rcal=rcal+r(l)*r(l)
+         enddo
+         ract=sqrt(rcal)
+         if (ract.gt.r_cut_ele) cycle
+         sss_ele_cut=sscale_ele(ract)
+         sss_ele_cut_grad=sscagrad_ele(ract)
+          rocal=1.5
+          epscalc=0.2
+          r0p=0.5*(rocal+sig0(itype(i,1)))
+          r06 = r0p**6
+          r012 = r06*r06
+          Evan1=epscalc*(r012/rcal**6)
+          Evan2=epscalc*2*(r06/rcal**3)
+          r4 = rcal**4
+          r7 = rcal**7
+          do l=1,3
+            dEvan1Cm(l) = 12*r(l)*epscalc*r012/r7
+            dEvan2Cm(l) = 12*r(l)*epscalc*r06/r4
+          enddo
+          do l=1,3
+            dEtotalCm(l)=(dEvan1Cm(l)+dEvan2Cm(l))*sss_ele_cut-&
+                         (Evan1+Evan2)*sss_ele_cut_grad*r(l)/ract
+          enddo
+             ecation_prottran = ecation_prottran+&
+             (Evan1+Evan2)*sss_ele_cut
+          do  l=1,3
+            gradcattranx(l,i)=gradcattranx(l,i)+dEtotalCm(l)
+            gradcattranc(l,i)=gradcattranc(l,i)+dEtotalCm(l)
+            gradcattranc(l,j)=gradcattranc(l,j)-dEtotalCm(l)
+           enddo
+
+         ene=0.0d0
+         else
+!         cycle
+         sumvec=0.0d0
+         simplesum=0.0d0
+         do l=1,3
+         vecsc(l)=citemp(l)-c(l,i)
+         sumvec=sumvec+vecsc(l)**2
+         simplesum=simplesum+vecsc(l)
+         enddo
+         sumvec=dsqrt(sumvec)
+         call to_box(cjtemp(1),cjtemp(2),cjtemp(3))
+         call to_box(citemp(1),citemp(2),citemp(3))
+!         sumvec=2.0d0
+         do l=1,3
+         dsctemp(l)=c(l,i+nres)&
+                    +(acatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)-1.0d0)*vecsc(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)*vecsc(l)/sumvec
+         enddo
+         call to_box(dsctemp(1),dsctemp(2),dsctemp(3))
+         sdist=0.0d0
+         do l=1,3
+            diff(l)=boxshift(dsctemp(l)-cjtemp(l),boxx(l))
+           sdist=sdist+diff(l)*diff(l)
+         enddo
+         dista=sqrt(sdist)
+         if (dista.gt.r_cut_ele) cycle
+         
+         sss_ele_cut=sscale_ele(dista)
+         sss_ele_cut_grad=sscagrad_ele(dista)
+         sss2min=sscale2(dista,x0cattrans(ityptrani,ityptranj)-0.1d0,0.2d0)
+         De=demorsecat(ityptrani,ityptranj)
+         alphac=alphamorsecat(ityptrani,ityptranj)
+         if (sss2min.eq.1.0d0) then
+!         print *,"ityptrani",ityptrani,ityptranj
+         x0left=x0catleft(ityptrani,ityptranj) ! to mn
+         ene=sss_ele_cut*(-De+De*(1.0d0-dexp(-alphac*(dista-x0left)))**2)
+         grad=2.0d0*alphac*De*dexp(-alphac*(dista-x0left))*&
+              (1.0d0-dexp(-alphac*(dista-x0left)))*sss_ele_cut&
+              +ene/sss_ele_cut*sss_ele_cut_grad
+          else if (sss2min.eq.0.0d0) then
+         x0left=x0catright(ityptrani,ityptranj)
+         ene=sss_ele_cut*(-De+De*(1.0d0-dexp(-alphac*(dista-x0left)))**2)
+         grad=2.0d0*alphac*De*dexp(-alphac*(dista-x0left))*&
+              (1.0d0-dexp(-alphac*(dista-x0left)))*sss_ele_cut&
+              +ene/sss_ele_cut*sss_ele_cut_grad
+          else
+         sss2mingrad=sscagrad2(dista,x0cattrans(ityptrani,ityptranj)-0.1d0,0.2d0)
+         x0left=x0catleft(ityptrani,ityptranj)
+         ene1=sss_ele_cut*(-De+De*(1.0d0-dexp(-alphac*(dista-x0left)))**2)
+         grad1=2.0d0*alphac*De*dexp(-alphac*(dista-x0left))*&
+              (1.0d0-dexp(-alphac*(dista-x0left)))*sss_ele_cut&
+              +ene/sss_ele_cut*sss_ele_cut_grad
+         x0left=x0catright(ityptrani,ityptranj)
+         ene2=sss_ele_cut*(-De+De*(1.0d0-dexp(-alphac*(dista-x0left)))**2)
+         grad2=2.0d0*alphac*De*dexp(-alphac*(dista-x0left))*&
+              (1.0d0-dexp(-alphac*(dista-x0left)))*sss_ele_cut&
+              +ene/sss_ele_cut*sss_ele_cut_grad
+         ene=sss2min*ene1+(1.0d0-sss2min)*ene2
+         grad=sss2min*grad1+(1.0d0-sss2min)*grad2+sss2mingrad*(ene1-ene2)
+         endif
+         do l=1,3
+           diffnorm(l)= diff(l)/dista
+          enddo
+          erdxi=scalar(diffnorm(1),dc_norm(1,i+nres))
+          facd1=bcatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)/sumvec
+
+         do l=1,3
+!       DO k= 1, 3
+!      ertail(k) = Rtail_distance(k)/Rtail
+!       END DO
+!       erdxi = scalar( ertail(1), dC_norm(1,i+nres) )
+!       erdxj = scalar( ertail(1), dC_norm(1,j+nres) )
+!      facd1 = dtail(1,itypi,itypj) * vbld_inv(i+nres)
+!       facd2 = dtail(2,itypi,itypj) * vbld_inv(j+nres)
+!       DO k = 1, 3
+!c!      write (*,*) "Gvdwc(",k,",",i,")=", gvdwc(k,i)
+!c!      write (*,*) "Gvdwc(",k,",",j,")=", gvdwc(k,j)
+!      pom = ertail(k)-facd1*(ertail(k)-erdxi*dC_norm(k,i+nres))
+!      gvdwx(k,i) = gvdwx(k,i) &
+!              - (( dFdR + gg(k) ) * pom)
+         pom=diffnorm(l)+facd1*(diffnorm(l)-erdxi*dc_norm(l,i+nres))
+!         write(iout,*),gradcattranc(l,j),gradcattranx(l,i),grad*diff(l)/dista
+        
+         gradcattranx(l,i)=gradcattranx(l,i)+grad*pom&
+         +grad*diffnorm(l)*(acatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)-1.0d0)
+!         *( bcatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)*&
+!          (1.0d0/sumvec-(vecsc(l)*simplesum)*(sumvec**(-3.0d0))))
+         gradcattranc(l,i)=gradcattranc(l,i)+grad*diff(l)/dista
+!                          +sss_ele_cut_grad*ene*diff(l)/dista/sss_ele_cut
+         gradcattranc(l,j)=gradcattranc(l,j)-grad*diff(l)/dista
+!         -sss_ele_cut_grad*ene*diff(l)/dista/sss_ele_cut
+         enddo
+         ecation_prottran=ecation_prottran+ene  
+         if (energy_dec) write(iout,*) "etrancat",i,j,ene,x0left,De,dista,&
+         alphac 
+         endif
+      enddo
+!      do k=g_listcatptran_start,g_listcatptran_end
+!      ene=0.0d0 this will be used if peptide group interaction is needed
+!      enddo
+
+
+      return
+      end subroutine 
+      subroutine ecat_prot_ang(ecation_protang)
+      integer:: itypi,itypj,ityptrani,ityptranj,k,l,i,j,n,m,&
+                ityptrani1,ityptranj1,ityptrani2,ityptranj2,&
+                i1,i2,j1,j2,k1,k2,k3,i3,j3,ityptrani3,ityptranj3
+
+      real(kind=8),dimension(3):: cjtemp,citemp,diff,dsctemp,vecsc,&
+                  diffnorm,boxx,dscvec,dscvecnorm,diffnorm2,&
+                  dscvec2,dscvecnorm2,cjtemp2,citemp2,diff2,dsctemp2,&
+                  vecsc2,diff1,diffnorm1,diff3,mindiffnorm2
+      real(kind=8),dimension(3):: dscvec1,dscvecnorm1,cjtemp1,citemp1,vecsc1,dsctemp1,&
+                  dscvec3,dscvecnorm3,cjtemp3,citemp3,vecsc3,dsctemp3,&
+                  diffnorm3,diff4,diffnorm4
+
+      real(kind=8):: ecation_protang,dista,sdist,De,ene,x0left,&
+                    alphac,grad,sumvec,sumdscvec,pom,erdxi,facd1,&
+                    sss_ele_cut,sss_ele_cut_grad,sss2min,sss2mingrad,&
+                    simplesum,cosval,part1,part2a,part2,part2b,part3,&
+                    part4a,part4b,part4,bottom,dista2,sdist2,sumvec2,&
+                    sumdscvec2,simplesum2,dista1,sdist1,sumvec1,simplesum1,&
+                    sumdscvec1,facd2,scal1a,scal1b,scal2a,scal2b,&
+                    sss2mingrad1,sss2mingrad2,sss2min1,sss2min2,pom1,pom2,&
+                    det1ij,det2ij,cosom1,cosom2,cosom12,cosphij,dista3,&
+                    sumvec3
+      real(kind=8):: sinom1,sinom2,sinaux,dephiij,sumdscvec3,sumscvec3,&
+                     cosphi,sdist3,simplesum3,det1t2ij,sss2mingrad3,sss2min3,&
+                     scal1c,scal2c,scal3a,scal3b,scal3c,facd3,facd2b,scal3d,&
+                     scal3e,dista4,sdist4,pom3,sssmintot
+                              
+      ecation_protang=0.0d0
+      boxx(1)=boxxsize
+      boxx(2)=boxysize
+      boxx(3)=boxzsize
+!      print *,"KUR**3",g_listcatscang_start,g_listcatscang_end
+!      go to 19
+!      go to 21
+      do k=g_listcatscang_start,g_listcatscang_end
+        ene=0.0d0
+        i=newcontlistcatscangi(k)
+        j=newcontlistcatscangj(k)
+         itypi=itype(i,1) !as the first is the protein part
+         itypj=itype(j,5) !as the second part is always cation
+!         print *,"KUR**4",i,j,itypi,itypj
+! remapping to internal types
+!       read (iiontran,*,err=123,end=123) (agamacattran(k,j,i),k=1,3),&
+!       (athetacattran(k,j,i),k=1,6),acatshiftdsc(j,i),bcatshiftdsc(j,i),&
+!       demorsecat(j,i),alphamorsecat(j,i),x0catleft(j,i),x0catright(j,i),&
+!       x0cattrans(j,i)
+         if (itypj.eq.6) then
+          ityptranj=1 !as now only Zn2+ is this needs to be modified for other ions
+         endif
+         if (itypi.eq.16) then
+          ityptrani=1
+         elseif (itypi.eq.1)  then
+          ityptrani=2
+         elseif (itypi.eq.15) then
+          ityptrani=3
+         elseif (itypi.eq.17) then
+          ityptrani=4
+         elseif (itypi.eq.2)  then
+          ityptrani=5
+         else
+          ityptrani=6
+         endif
+         if (ityptrani.gt.ntrantyp(ityptranj)) cycle
+         do  l=1,3
+          citemp(l)=c(l,i+nres)
+          cjtemp(l)=c(l,j)
+         enddo
+         sumvec=0.0d0
+         simplesum=0.0d0
+         do l=1,3
+         vecsc(l)=citemp(l)-c(l,i)
+         sumvec=sumvec+vecsc(l)**2
+         simplesum=simplesum+vecsc(l)
+         enddo
+         sumvec=dsqrt(sumvec)
+         sumdscvec=0.0d0 
+        do l=1,3
+          dsctemp(l)=c(l,i)&
+!                     +1.0d0
+                    +(acatshiftdsc(ityptrani,ityptranj))*vecsc(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)*vecsc(l)/sumvec
+          dscvec(l)= &
+!1.0d0
+                     (acatshiftdsc(ityptrani,ityptranj))*vecsc(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)*vecsc(l)/sumvec
+          sumdscvec=sumdscvec+dscvec(l)**2 
+         enddo
+         sumdscvec=dsqrt(sumdscvec)
+         do l=1,3
+         dscvecnorm(l)=dscvec(l)/sumdscvec
+         enddo
+         call to_box(dsctemp(1),dsctemp(2),dsctemp(3))
+         call to_box(cjtemp(1),cjtemp(2),cjtemp(3))
+         sdist=0.0d0
+          do l=1,3
+            diff(l)=boxshift(dsctemp(l)-cjtemp(l),boxx(l))
+            sdist=sdist+diff(l)*diff(l)
+         enddo
+         dista=sqrt(sdist)
+         do l=1,3
+         diffnorm(l)= diff(l)/dista
+         enddo
+         cosval=scalar(diffnorm(1),dc_norm(1,i+nres))
+         grad=0.0d0
+         sss2min=sscale2(dista,r_cut_ang,1.0d0)
+         sss2mingrad=sscagrad2(dista,r_cut_ang,1.0d0)
+         ene=ene&
+         +tschebyshev(1,6,athetacattran(1,ityptrani,ityptranj),cosval)
+         grad=gradtschebyshev(0,5,athetacattran(1,ityptrani,ityptranj),cosval)*sss2min
+              
+         facd1=bcatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)/sumvec
+         erdxi=scalar(diffnorm(1),dc_norm(1,i+nres))
+         part1=0.0d0
+         part2=0.0d0
+         part3=0.0d0
+         part4=0.0d0
+         do l=1,3
+         bottom=sumvec**2*sdist
+         part1=diff(l)*sumvec*dista
+         part2a=(acatshiftdsc(ityptrani,ityptranj))*vecsc(l)
+         part2b=0.0d0
+         !bcatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)/sumvec*&
+         !(vecsc(l)-cosval*dista*dc_norm(l,i+nres))
+         part2=(part2a+part2b)*sumvec*dista
+         part3=cosval*sumvec*dista*dc_norm(l,i+nres)*dista
+         part4a=diff(l)*acatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)
+         part4b=bcatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)/sumvec*&
+         (diff(l)-cosval*dista*dc_norm(l,i+nres))
+         part4=cosval*sumvec*(part4a+part4b)*sumvec
+!      gradlipang(m,l)=gradlipang(m,l)+(fac & 
+!       *(xa(m)-scalar*vnorm*xb(m)/wnorm)&
+!       /(vnorm*wnorm))
+
+!       DO k= 1, 3
+!      ertail(k) = Rtail_distance(k)/Rtail
+!       END DO
+!       erdxi = scalar( ertail(1), dC_norm(1,i+nres) )
+!       erdxj = scalar( ertail(1), dC_norm(1,j+nres) )
+!      facd1 = dtail(1,itypi,itypj) * vbld_inv(i+nres)
+!       facd2 = dtail(2,itypi,itypj) * vbld_inv(j+nres)
+!       DO k = 1, 3
+!c!      write (*,*) "Gvdwc(",k,",",i,")=", gvdwc(k,i)
+!c!      write (*,*) "Gvdwc(",k,",",j,")=", gvdwc(k,j)
+!      pom = ertail(k)-facd1*(ertail(k)-erdxi*dC_norm(k,i+nres))
+!      gvdwx(k,i) = gvdwx(k,i) &
+!              - (( dFdR + gg(k) ) * pom)
+         pom=diffnorm(l)+facd1*(diffnorm(l)-erdxi*dc_norm(l,i+nres))
+
+         gradcatangc(l,j)=gradcatangc(l,j)-grad*&
+         (dscvec(l)-cosval*diffnorm(l)*sumdscvec)/(sumdscvec*dista)-&
+         ene*sss2mingrad*diffnorm(l)
+
+         gradcatangc(l,i)=gradcatangc(l,i)+grad*&
+         (dscvec(l)-cosval*diffnorm(l)*sumdscvec)/(sumdscvec*dista)+&
+         ene*sss2mingrad*diffnorm(l)
+
+         gradcatangx(l,i)=gradcatangx(l,i)+grad*&
+         (part1+part2-part3-part4)/bottom+&
+         ene*sss2mingrad*pom+&
+         ene*sss2mingrad*diffnorm(l)*(acatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)-1.0d0)
+!         +grad*(dscvec(l)-cosval*diffnorm(l)*sumdscvec)/(sumdscvec*dista)&
+!         +grad*pom+grad*diffnorm(l)*(acatshiftdsc(ityptrani,ityptranj)-1.0d0)
+!&
+!         (diff(l)-cosval*dscvecnorm(l)*dista)/(sumdscvec*dista)
+
+
+
+
+
+        enddo
+!       print *,i,j,cosval,tschebyshev(1,3,aomicattr(1,ityptranj),cosval)&
+!              ,aomicattr(0,ityptranj),ene
+       if (energy_dec) write(iout,*) i,j,ityptrani,ityptranj,ene,cosval
+       ecation_protang=ecation_protang+ene*sss2min
+      enddo
+ 19   continue
+!         print *,"KUR**",g_listcatscangf_start,g_listcatscangf_end
+            do k=g_listcatscangf_start,g_listcatscangf_end
+        ene=0.0d0
+        i1=newcontlistcatscangfi(k)
+        j1=newcontlistcatscangfj(k)
+         itypi=itype(i1,1) !as the first is the protein part
+         itypj=itype(j1,5) !as the second part is always cation
+         if (itypj.eq.6) then
+          ityptranj1=1 !as now only Zn2+ is this needs to be modified for other ions
+         endif
+         if (itypi.eq.16) then
+          ityptrani1=1
+         elseif (itypi.eq.1)  then
+          ityptrani1=2
+         elseif (itypi.eq.15) then
+          ityptrani1=3
+         elseif (itypi.eq.17) then
+          ityptrani1=4
+         elseif (itypi.eq.2)  then
+          ityptrani1=5
+         else
+          ityptrani1=6
+         endif
+         do  l=1,3
+          citemp1(l)=c(l,i1+nres)
+          cjtemp1(l)=c(l,j1)
+         enddo
+         sumvec1=0.0d0
+         simplesum1=0.0d0
+         do l=1,3
+         vecsc1(l)=citemp1(l)-c(l,i1)
+         sumvec1=sumvec1+vecsc1(l)**2
+         simplesum1=simplesum1+vecsc1(l)
+         enddo
+         sumvec1=dsqrt(sumvec1)
+         sumdscvec1=0.0d0
+        do l=1,3
+          dsctemp1(l)=c(l,i1)&
+!                     +1.0d0
+                    +(acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1))*vecsc1(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)*vecsc1(l)/sumvec1
+          dscvec1(l)= &
+!1.0d0
+                     (acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1))*vecsc1(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)*vecsc1(l)/sumvec1
+          sumdscvec1=sumdscvec1+dscvec1(l)**2
+         enddo
+         sumdscvec1=dsqrt(sumdscvec1)
+         do l=1,3
+         dscvecnorm1(l)=dscvec1(l)/sumdscvec1
+         enddo
+         call to_box(dsctemp1(1),dsctemp1(2),dsctemp1(3))
+         call to_box(cjtemp1(1),cjtemp1(2),cjtemp1(3))
+         sdist1=0.0d0
+          do l=1,3
+            diff1(l)=boxshift(dsctemp1(l)-cjtemp1(l),boxx(l))
+            sdist1=sdist1+diff1(l)*diff1(l)
+         enddo
+         dista1=sqrt(sdist1)
+         do l=1,3
+         diffnorm1(l)= diff1(l)/dista1
+         enddo
+         sss2min1=sscale2(dista1,r_cut_ang,1.0d0)
+         sss2mingrad1=sscagrad2(dista1,r_cut_ang,1.0d0)
+         if (ityptrani1.gt.ntrantyp(ityptranj1)) cycle
+
+!-----------------------------------------------------------------
+!             do m=k+1,g_listcatscang_end
+             ene=0.0d0
+             i2=newcontlistcatscangfk(k)
+             j2=j1
+              if (j1.ne.j2) cycle
+               itypi=itype(i2,1) !as the first is the protein part
+               itypj=itype(j2,5) !as the second part is always cation
+              if (itypj.eq.6) then
+              ityptranj2=1 !as now only Zn2+ is this needs to be modified for other ions
+              endif
+             if (itypi.eq.16) then
+              ityptrani2=1
+             elseif (itypi.eq.1)  then
+              ityptrani2=2
+             elseif (itypi.eq.15) then
+              ityptrani2=3
+             elseif (itypi.eq.17) then
+              ityptrani2=4
+             elseif (itypi.eq.2)  then
+              ityptrani2=5
+             else
+              ityptrani2=6
+             endif
+         if (ityptrani2.gt.ntrantyp(ityptranj2)) cycle
+
+           do  l=1,3
+          citemp2(l)=c(l,i2+nres)
+          cjtemp2(l)=c(l,j2)
+         enddo
+         sumvec2=0.0d0
+         simplesum2=0.0d0
+         do l=1,3
+         vecsc2(l)=citemp2(l)-c(l,i2)
+         sumvec2=sumvec2+vecsc2(l)**2
+         simplesum2=simplesum2+vecsc2(l)
+         enddo
+         sumvec2=dsqrt(sumvec2)
+         sumdscvec2=0.0d0
+        do l=1,3
+          dsctemp2(l)=c(l,i2)&
+!                     +1.0d0
+                    +(acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2))*vecsc2(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*vecsc2(l)/sumvec2
+          dscvec2(l)= &
+!1.0d0
+                     (acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2))*vecsc2(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*vecsc2(l)/sumvec2
+          sumdscvec2=sumdscvec2+dscvec2(l)**2
+         enddo
+         sumdscvec2=dsqrt(sumdscvec2)
+         do l=1,3
+         dscvecnorm2(l)=dscvec2(l)/sumdscvec2
+         enddo
+         call to_box(dsctemp2(1),dsctemp2(2),dsctemp2(3))
+         call to_box(cjtemp2(1),cjtemp2(2),cjtemp2(3))
+         sdist2=0.0d0
+          do l=1,3
+            diff2(l)=boxshift(dsctemp2(l)-cjtemp2(l),boxx(l))
+!            diff2(l)=1.0d0
+            sdist2=sdist2+diff2(l)*diff2(l)
+         enddo
+         dista2=sqrt(sdist2)
+         do l=1,3
+         diffnorm2(l)= diff2(l)/dista2
+         enddo
+!         print *,i1,i2,diffnorm2(1)
+         cosval=scalar(diffnorm1(1),diffnorm2(1))
+         grad=0.0d0
+         sss2min2=sscale2(dista2,r_cut_ang,1.0d0)
+         sss2mingrad2=sscagrad2(dista2,r_cut_ang,1.0d0)
+         ene=ene+tschebyshev(1,3,aomicattr(1,ityptranj1),cosval)
+         grad=gradtschebyshev(0,2,aomicattr(1,ityptranj1),cosval)*sss2min2*sss2min1
+         part1=0.0d0
+         part2=0.0d0
+         part3=0.0d0
+         part4=0.0d0
+         ecation_protang=ecation_protang+ene*sss2min2*sss2min1
+         facd1=bcatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)/sumvec1
+         facd2=bcatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)/sumvec2
+         scal1a=scalar(diffnorm1(1),dc_norm(1,i1+nres))
+         scal1b=scalar(diffnorm2(1),dc_norm(1,i1+nres))
+         scal2a=scalar(diffnorm1(1),dc_norm(1,i2+nres))
+         scal2b=scalar(diffnorm2(1),dc_norm(1,i2+nres))
+
+       if (energy_dec) write(iout,*) "omi", i,j,ityptrani,ityptranj,ene,cosval,aomicattr(1,ityptranj1),&
+             aomicattr(2,ityptranj1),aomicattr(3,ityptranj1),tschebyshev(1,3,aomicattr(1,ityptranj1),cosval)
+
+!*sss2min
+         do l=1,3
+         pom1=diffnorm1(l)+facd1*(diffnorm1(l)-scal1a*dc_norm(l,i1+nres))
+         pom2=diffnorm2(l)+facd2*(diffnorm2(l)-scal2b*dc_norm(l,i2+nres))
+
+
+         gradcatangc(l,i1)=gradcatangc(l,i1)+grad*(diff2(l)-&
+         cosval*diffnorm1(l)*dista2)/(dista2*dista1)+&
+          ene*sss2mingrad1*diffnorm1(l)*sss2min2
+
+         
+         gradcatangx(l,i1)=gradcatangx(l,i1)+grad/(dista2*dista1)*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)*diff2(l)+&
+         facd1*(diff2(l)-scal1b*dc_norm(l,i1+nres)*dista2)-&
+         cosval*dista2/dista1*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)*diff1(l)+&
+         facd1*(diff1(l)-scal1a*dc_norm(l,i1+nres)*dista1)))+&
+         ene*sss2mingrad1*sss2min2*(pom1+&
+         diffnorm1(l)*(acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)-1.0d0))
+
+
+         gradcatangx(l,i2)=gradcatangx(l,i2)+grad/(dista2*dista1)*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*diff1(l)+&
+         facd2*(diff1(l)-scal2a*dc_norm(l,i2+nres)*dista1)-&
+         cosval*dista1/dista2*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*diff2(l)+&
+         facd2*(diff2(l)-scal2b*dc_norm(l,i2+nres)*dista2)))+&
+         ene*sss2mingrad2*sss2min1*(pom2+&
+         diffnorm2(l)*(acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)-1.0d0))
+
+
+         gradcatangx(l,i2)=gradcatangx(l,i2)
+         gradcatangc(l,i2)=gradcatangc(l,i2)+grad*(diff1(l)-&
+         cosval*diffnorm2(l)*dista1)/(dista2*dista1)+&
+          ene*sss2mingrad2*diffnorm2(l)*sss2min1
+
+         gradcatangc(l,j2)=gradcatangc(l,j2)-grad*(diff2(l)/dista2/dista1-&
+         cosval*diff1(l)/dista1/dista1+diff1(l)/dista2/dista1-&
+         cosval*diff2(l)/dista2/dista2)-&
+         ene*sss2mingrad1*diffnorm1(l)*sss2min2-&
+         ene*sss2mingrad2*diffnorm2(l)*sss2min1
+
+
+         enddo
+
+              enddo
+!            enddo
+!#ifdef DUBUG
+  21  continue
+!       do k1=g_listcatscang_start,g_listcatscang_end
+!        print *,"KURNA",g_listcatscangt_start,g_listcatscangt_end
+        do k1=g_listcatscangt_start,g_listcatscangt_end
+        i1=newcontlistcatscangti(k1)
+        j1=newcontlistcatscangtj(k1)
+        itypi=itype(i1,1) !as the first is the protein part
+        itypj=itype(j1,5) !as the second part is always cation
+        if (itypj.eq.6) then
+         ityptranj1=1 !as now only Zn2+ is this needs to be modified for other ions
+        endif
+        if (itypi.eq.16) then
+         ityptrani1=1
+        elseif (itypi.eq.1)  then
+         ityptrani1=2
+        elseif (itypi.eq.15) then
+         ityptrani1=3
+        elseif (itypi.eq.17) then
+         ityptrani1=4
+        elseif (itypi.eq.2)  then
+         ityptrani1=5
+        else
+         ityptrani1=6
+        endif
+        do  l=1,3
+          citemp1(l)=c(l,i1+nres)
+          cjtemp1(l)=c(l,j1)
+        enddo
+        sumvec1=0.0d0
+        simplesum1=0.0d0
+        do l=1,3
+         vecsc1(l)=citemp1(l)-c(l,i1)
+         sumvec1=sumvec1+vecsc1(l)**2
+         simplesum1=simplesum1+vecsc1(l)
+        enddo
+        sumvec1=dsqrt(sumvec1)
+        sumdscvec1=0.0d0
+        do l=1,3
+          dsctemp1(l)=c(l,i1)&
+                    +(acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1))*vecsc1(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)*vecsc1(l)/sumvec1
+          dscvec1(l)= &
+                     (acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1))*vecsc1(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)*vecsc1(l)/sumvec1
+          sumdscvec1=sumdscvec1+dscvec1(l)**2
+        enddo
+        sumdscvec1=dsqrt(sumdscvec1)
+        do l=1,3
+        dscvecnorm1(l)=dscvec1(l)/sumdscvec1
+        enddo
+        call to_box(dsctemp1(1),dsctemp1(2),dsctemp1(3))
+        call to_box(cjtemp1(1),cjtemp1(2),cjtemp1(3))
+        sdist1=0.0d0
+          do l=1,3
+            diff1(l)=boxshift(dsctemp1(l)-cjtemp1(l),boxx(l))
+            sdist1=sdist1+diff1(l)*diff1(l)
+         enddo
+         dista1=sqrt(sdist1)
+         do l=1,3
+         diffnorm1(l)= diff1(l)/dista1
+         enddo
+         sss2min1=sscale2(dista1,r_cut_ang,1.0d0)
+         sss2mingrad1=sscagrad2(dista1,r_cut_ang,1.0d0)
+         if (ityptrani1.gt.ntrantyp(ityptranj1)) cycle
+!---------------before second loop
+!        do k2=k1+1,g_listcatscang_end
+         i2=newcontlistcatscangtk(k1)
+         j2=j1
+!         print *,"TUTU3",i1,i2,j1,j2
+         if (i2.eq.i1) cycle
+         if (j2.ne.j1) cycle
+         itypi=itype(i2,1) !as the first is the protein part
+         itypj=itype(j2,5) !as the second part is always cation
+         if (itypj.eq.6) then
+           ityptranj2=1 !as now only Zn2+ is this needs to be modified for other ions
+          endif
+          if (itypi.eq.16) then
+           ityptrani2=1
+          elseif (itypi.eq.1)  then
+           ityptrani2=2
+          elseif (itypi.eq.15) then
+           ityptrani2=3
+          elseif (itypi.eq.17) then
+           ityptrani2=4
+          elseif (itypi.eq.2)  then
+           ityptrani2=5
+          else
+           ityptrani2=6
+          endif
+          if (ityptrani2.gt.ntrantyp(ityptranj2)) cycle
+          do  l=1,3
+           citemp2(l)=c(l,i2+nres)
+           cjtemp2(l)=c(l,j2)
+          enddo
+          sumvec2=0.0d0
+          simplesum2=0.0d0
+          do l=1,3
+           vecsc2(l)=citemp2(l)-c(l,i2)
+           sumvec2=sumvec2+vecsc2(l)**2
+           simplesum2=simplesum2+vecsc2(l)
+          enddo
+          sumvec2=dsqrt(sumvec2)
+          sumdscvec2=0.0d0
+          do l=1,3
+           dsctemp2(l)=c(l,i2)&
+                    +(acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2))*vecsc2(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*vecsc2(l)/sumvec2
+           dscvec2(l)= &
+                     (acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2))*vecsc2(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*vecsc2(l)/sumvec2
+           sumdscvec2=sumdscvec2+dscvec2(l)**2
+          enddo
+          sumdscvec2=dsqrt(sumdscvec2)
+          do l=1,3
+           dscvecnorm2(l)=dscvec2(l)/sumdscvec2
+          enddo
+          call to_box(dsctemp2(1),dsctemp2(2),dsctemp2(3))
+          call to_box(cjtemp2(1),cjtemp2(2),cjtemp2(3))
+         sdist2=0.0d0
+          do l=1,3
+            diff2(l)=boxshift(dsctemp2(l)-cjtemp2(l),boxx(l))
+!            diff2(l)=1.0d0
+            sdist2=sdist2+diff2(l)*diff2(l)
+         enddo
+         dista2=sqrt(sdist2)
+         do l=1,3
+         diffnorm2(l)= diff2(l)/dista2
+         mindiffnorm2(l)=-diffnorm2(l)
+         enddo
+!         print *,i1,i2,diffnorm2(1)
+         cosom1=scalar(diffnorm1(1),diffnorm2(1))
+         sss2min2=sscale2(dista2,r_cut_ang,1.0d0)
+         sss2mingrad2=sscagrad2(dista2,r_cut_ang,1.0d0)
+
+!---------------- before third loop
+!          do k3=g_listcatscang_start,g_listcatscang_end
+           ene=0.0d0
+           i3=newcontlistcatscangtl(k1)
+           j3=j1
+!            print *,"TUTU4",i1,i2,i3,j1,j2,j3
+
+           if (i3.eq.i2) cycle
+           if (i3.eq.i1) cycle
+           if (j3.ne.j1) cycle
+           itypi=itype(i3,1) !as the first is the protein part
+           itypj=itype(j3,5) !as the second part is always cation
+           if (itypj.eq.6) then
+            ityptranj3=1 !as now only Zn2+ is this needs to be modified for other ions
+           endif
+           if (itypi.eq.16) then
+            ityptrani3=1
+           elseif (itypi.eq.1)  then
+            ityptrani3=2
+           elseif (itypi.eq.15) then
+            ityptrani3=3
+           elseif (itypi.eq.17) then
+            ityptrani3=4
+           elseif (itypi.eq.2)  then
+            ityptrani3=5
+           else
+            ityptrani3=6
+           endif
+           if (ityptrani3.gt.ntrantyp(ityptranj3)) cycle
+           do  l=1,3
+            citemp3(l)=c(l,i3+nres)
+            cjtemp3(l)=c(l,j3)
+          enddo
+          sumvec3=0.0d0
+          simplesum3=0.0d0
+          do l=1,3
+           vecsc3(l)=citemp3(l)-c(l,i3)
+           sumvec3=sumvec3+vecsc3(l)**2
+           simplesum3=simplesum3+vecsc3(l)
+          enddo
+          sumvec3=dsqrt(sumvec3)
+          sumdscvec3=0.0d0
+          do l=1,3
+           dsctemp3(l)=c(l,i3)&
+                    +(acatshiftdsc(ityptrani3,ityptranj3))*vecsc3(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani3,ityptranj3)*vecsc3(l)/sumvec3
+           dscvec3(l)= &
+                     (acatshiftdsc(ityptrani3,ityptranj3))*vecsc3(l)&
+                    +bcatshiftdsc(ityptrani3,ityptranj3)*vecsc3(l)/sumvec3
+           sumdscvec3=sumdscvec3+dscvec3(l)**2
+          enddo
+          sumdscvec3=dsqrt(sumdscvec3)
+          do l=1,3
+           dscvecnorm3(l)=dscvec3(l)/sumdscvec3
+          enddo
+          call to_box(dsctemp3(1),dsctemp3(2),dsctemp3(3))
+          call to_box(cjtemp3(1),cjtemp3(2),cjtemp3(3))
+          sdist3=0.0d0
+          do l=1,3
+            diff3(l)=boxshift(dsctemp3(l)-dsctemp2(l),boxx(l))
+            sdist3=sdist3+diff3(l)*diff3(l)
+         enddo
+         dista3=sqrt(sdist3)
+         do l=1,3
+         diffnorm3(l)= diff3(l)/dista3
+         enddo
+         sdist4=0.0d0
+          do l=1,3
+            diff4(l)=boxshift(dsctemp3(l)-cjtemp2(l),boxx(l))
+!            diff2(l)=1.0d0
+            sdist4=sdist4+diff4(l)*diff4(l)
+         enddo
+         dista4=sqrt(sdist4)
+         do l=1,3
+         diffnorm4(l)= diff4(l)/dista4
+         enddo
+
+         sss2min3=sscale2(dista4,r_cut_ang,1.0d0)
+         sss2mingrad3=sscagrad2(dista4,r_cut_ang,1.0d0)
+         sssmintot=sss2min3*sss2min2*sss2min1
+         if (ityptrani3.gt.ntrantyp(ityptranj3)) cycle
+         cosom12=scalar(diffnorm3(1),diffnorm1(1))
+         cosom2=scalar(diffnorm3(1),mindiffnorm2(1))
+         sinom1=dsqrt(1.0d0-cosom1*cosom1)
+         sinom2=dsqrt(1.0d0-cosom2*cosom2)
+         cosphi=cosom12-cosom1*cosom2
+         sinaux=sinom1*sinom2
+         ene=ene+mytschebyshev(1,3,agamacattran(1,ityptrani2,ityptranj2),cosphi,sinaux)
+         call mygradtschebyshev(1,3,agamacattran(1,ityptrani2,ityptranj2)&
+          ,cosphi,sinaux,dephiij,det1t2ij)
+         
+          det1ij=-det1t2ij*sinom2*cosom1/sinom1-dephiij*cosom2
+          det2ij=-det1t2ij*sinom1*cosom2/sinom2-dephiij*cosom1
+          facd1=bcatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)/sumvec1
+          facd2=bcatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)/sumvec2
+!          facd2b=bcatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)/sumvec3
+          facd3=bcatshiftdsc(ityptrani3,ityptranj3)/sumvec3
+          scal1a=scalar(diffnorm1(1),dc_norm(1,i1+nres))
+          scal1b=scalar(diffnorm2(1),dc_norm(1,i1+nres))
+          scal1c=scalar(diffnorm3(1),dc_norm(1,i1+nres))
+          scal2a=scalar(diffnorm1(1),dc_norm(1,i2+nres))
+          scal2b=scalar(diffnorm2(1),dc_norm(1,i2+nres))
+          scal2c=scalar(diffnorm3(1),dc_norm(1,i2+nres))
+          scal3a=scalar(diffnorm1(1),dc_norm(1,i3+nres))
+          scal3b=scalar(mindiffnorm2(1),dc_norm(1,i3+nres))
+          scal3d=scalar(diffnorm2(1),dc_norm(1,i3+nres))
+          scal3c=scalar(diffnorm3(1),dc_norm(1,i3+nres))
+          scal3e=scalar(diffnorm4(1),dc_norm(1,i3+nres))
+
+
+          do l=1,3
+         pom1=diffnorm1(l)+facd1*(diffnorm1(l)-scal1a*dc_norm(l,i1+nres))
+         pom2=diffnorm2(l)+facd2*(diffnorm2(l)-scal2b*dc_norm(l,i2+nres))
+         pom3=diffnorm4(l)+facd3*(diffnorm4(l)-scal3e*dc_norm(l,i3+nres))
+
+          gradcatangc(l,i1)=gradcatangc(l,i1)&
+          +det1ij*sssmintot*(diff2(l)-diffnorm1(l)*cosom1*dista2)/(dista2*dista1)+&
+          dephiij*sssmintot*(diff3(l)-diffnorm1(l)*cosom12*dista3)/(dista3*dista1)&
+         +ene*sss2mingrad1*diffnorm1(l)*sss2min2*sss2min3
+
+
+          gradcatangc(l,i2)=gradcatangc(l,i2)+(&
+          det1ij*(diff1(l)-diffnorm2(l)*cosom1*dista1)/(dista2*dista1)+&
+          det2ij*(-diff3(l)+mindiffnorm2(l)*cosom2*dista3)/(dista3*dista2)&
+          -det2ij*(-diff2(l)-diffnorm3(l)*cosom2*dista2)/(dista3*dista2)&
+          -dephiij*(diff1(l)-diffnorm3(l)*cosom12*dista1)/(dista3*dista1))*sssmintot&
+         +ene*sss2mingrad2*diffnorm2(l)*sss2min1*sss2min3
+
+
+
+          gradcatangc(l,i3)=gradcatangc(l,i3)&
+          +det2ij*(-diff2(l)-diffnorm3(l)*cosom2*dista2)/(dista3*dista2)*sssmintot&
+          +dephiij*(diff1(l)-diffnorm3(l)*cosom12*dista1)/(dista3*dista1)*sssmintot&
+         +ene*sss2mingrad3*diffnorm4(l)*sss2min1*sss2min2
+
+
+          gradcatangc(l,j1)=gradcatangc(l,j1)-&
+          sssmintot*(det1ij*(diff2(l)-diffnorm1(l)*cosom1*dista2)/(dista2*dista1)+&
+          dephiij*(diff3(l)-diffnorm1(l)*cosom12*dista3)/(dista3*dista1))&
+          -(det1ij*(diff1(l)-diffnorm2(l)*cosom1*dista1)/(dista1*dista2)+&
+          det2ij*(-diff3(l)+mindiffnorm2(l)*cosom2*dista3)/(dista3*dista2))*sssmintot&
+         -ene*sss2mingrad1*diffnorm1(l)*sss2min2*sss2min3&
+         -ene*sss2mingrad2*diffnorm2(l)*sss2min1*sss2min3&
+         -ene*sss2mingrad3*diffnorm4(l)*sss2min1*sss2min2
+
+
+         gradcatangx(l,i1)=gradcatangx(l,i1)+(det1ij/(dista2*dista1)*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)*diff2(l)+&
+         facd1*(diff2(l)-scal1b*dc_norm(l,i1+nres)*dista2)-&
+         cosom1*dista2/dista1*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)*diff1(l)+&
+         facd1*(diff1(l)-scal1a*dc_norm(l,i1+nres)*dista1)))&
+         +dephiij/(dista3*dista1)*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)*diff3(l)+&
+         facd1*(diff3(l)-scal1c*dc_norm(l,i1+nres)*dista3)-&
+         cosom12*dista3/dista1*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)*diff1(l)+&
+         facd1*(diff1(l)-scal1a*dc_norm(l,i1+nres)*dista1))))*sssmintot&
+         +ene*sss2mingrad1*sss2min2*sss2min3*(pom1+&
+          diffnorm1(l)*(acatshiftdsc(ityptrani1,ityptranj1)-1.0d0))
+
+
+         gradcatangx(l,i3)=gradcatangx(l,i3)+(&
+         det2ij/(dista3*dista2)*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani3,ityptranj3)*(-diff2(l))+&
+         facd3*(-diff2(l)-scal3b*dc_norm(l,i3+nres)*dista2)-&
+         cosom2*dista2/dista3*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani3,ityptranj3)*diff3(l)+&
+         facd3*(diff3(l)-scal3c*dc_norm(l,i3+nres)*dista3)))&
+         +dephiij/(dista3*dista1)*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani3,ityptranj3)*diff1(l)+&
+         facd3*(diff1(l)-scal3a*dc_norm(l,i3+nres)*dista1)-&
+         cosom12*dista1/dista3*&
+         (acatshiftdsc(ityptrani3,ityptranj3)*diff3(l)+&
+         facd3*(diff3(l)-scal3c*dc_norm(l,i3+nres)*dista3))))*sssmintot&
+         +ene*sss2mingrad3*sss2min2*sss2min1*(pom3+&
+          diffnorm4(l)*(acatshiftdsc(ityptrani3,ityptranj3)-1.0d0))
+
+
+         gradcatangx(l,i2)=gradcatangx(l,i2)+(&!
+         det1ij/(dista2*dista1)*&!
+         (acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*diff1(l)&!
+         +facd2*(diff1(l)-scal2a*dc_norm(l,i2+nres)*dista1)&
+         -cosom1*dista1/dista2*&!
+         (acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*diff2(l)+&!
+         facd2*(diff2(l)-scal2b*dc_norm(l,i2+nres)*dista2)))+&
+         det2ij/(dista3*dista2)*&!
+         (acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*diff2(l)+&!
+         facd2*(diff2(l)-scal2b*dc_norm(l,i2+nres)*dista2)&
+         -(acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*diff3(l)+&!
+          facd2*(diff3(l)-scal2c*dc_norm(l,i2+nres)*dista3))&
+         -cosom2*dista3/dista2*&!
+         (acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*diff2(l)+&!
+          facd2*(diff2(l)-scal2b*dc_norm(l,i2+nres)*dista2))&
+         +cosom2*dista2/dista3*&!
+         (acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*diff3(l)+&!
+         facd2*(diff3(l)-scal2c*dc_norm(l,i2+nres)*dista3)))&
+         +dephiij/(dista3*dista1)*&!
+         (-(acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*diff1(l)+&!
+         facd2*(diff1(l)-scal2a*dc_norm(l,i2+nres)*dista1))+&
+         cosom12*dista1/dista3*&!
+         (acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)*diff3(l)+&!
+          facd2*(diff3(l)-scal2c*dc_norm(l,i2+nres)*dista3))))*sssmintot&
+         +ene*sss2mingrad2*sss2min3*sss2min1*(pom2+&
+          diffnorm2(l)*(acatshiftdsc(ityptrani2,ityptranj2)-1.0d0))
+
+
+          enddo
+!          print *,i1,i2,i3,j1,j2,j3,"tors",ene,sinaux,cosphi
+!          print *,"param",agamacattran(1,ityptrani2,ityptranj2),ityptranj2,ityptrani2
+          ecation_protang=ecation_protang+ene*sssmintot
+         enddo
+!        enddo
+!       enddo 
+!#endif
+      return
+      end subroutine 
+!-------------------------------------------------------------------------- 
+!c------------------------------------------------------------------------------
+      double precision function mytschebyshev(m,n,x,y,yt)
+      implicit none
+      integer i,m,n
+      double precision x(n),y,yt,yy(0:100),aux
+!c Tschebyshev polynomial in y multiplied by sin(t1)sin(t2) (yt). 
+!c Note that the first term is omitted
+!c m=0: the constant term is included
+!c m=1: the constant term is not included
+      yy(0)=1.0d0
+      yy(1)=y
+      do i=2,n
+        yy(i)=2*yy(1)*yy(i-1)-yy(i-2)*yt*yt
+      enddo
+      aux=0.0d0
+      do i=m,n
+        aux=aux+x(i)*yy(i)
+      enddo
+!c      print *,(yy(i),i=1,n)
+      mytschebyshev=aux
+      return
+      end function
+!C--------------------------------------------------------------------------
+!C--------------------------------------------------------------------------
+      subroutine mygradtschebyshev(m,n,x,y,yt,fy,fyt)
+      implicit none
+      integer i,m,n
+      double precision x(n+1),y,yt,fy,fyt,yy(0:100),yb(0:100), &
+      ybt(0:100)
+!c Derivative of Tschebyshev polynomial in y multiplied by sin(t1)sin(t2) (yt). 
+!c Note that the first term is omitted
+!c m=0: the constant term is included
+!c m=1: the constant term is not included
+      yy(0)=1.0d0
+      yy(1)=y
+      yb(0)=0.0d0
+      yb(1)=1.0d0
+      ybt(0)=0.0d0
+      ybt(1)=0.0d0
+      do i=2,n
+        yy(i)=2*yy(1)*yy(i-1)-yy(i-2)*yt*yt
+        yb(i)=2*yy(i-1)+2*yy(1)*yb(i-1)-yb(i-2)*yt*yt
+        ybt(i)=2*yy(1)*ybt(i-1)-ybt(i-2)*yt*yt-2*yy(i-2)*yt
+      enddo
+      fy=0.0d0
+      fyt=0.0d0
+      do i=m,n
+        fy=fy+x(i)*yb(i)
+        fyt=fyt+x(i)*ybt(i)
+      enddo
+      return
+      end subroutine
+
  !--------------------------------------------------------------------------
        end module energy
diff --git a/source/unres/geometry.F90 b/source/unres/geometry.F90

index 59a7972..787f2a0 100644 (file)
--- a/source/unres/geometry.F90
+++ b/source/unres/geometry.F90
@@ -453,7 +453,7 @@
  !        print *,i,vbld(i),"vbld(i)"
          vbld_inv(i)=1.0d0/vbld(i)
          vbld(nres+i)=dist(nres+i,i)
-        if ((itype(i,1).ne.10).and.(molnum(i).ne.5)) then
+        if ((itype(i,1).ne.10).and.(molnum(i).lt.4)) then
            vbld_inv(nres+i)=1.0d0/vbld(nres+i)
          else
            vbld_inv(nres+i)=0.0d0
@@ -1468,7 +1468,7 @@
          do ires=1,ioverlap_last 
            i=ioverlap(ires)
            iti=iabs(itype(i,1))
-          if ((iti.ne.10).and.(molnum(i).ne.5).and.(iti.ne.ntyp1)) then
+          if ((iti.ne.10).and.(molnum(i).lt.3).and.(iti.ne.ntyp1)) then
              nsi=0
              fail=.true.
              do while (fail.and.nsi.le.maxsi)
@@ -1756,6 +1756,11 @@
        integer :: total_ints,lower_bound,upper_bound,nint
        integer,dimension(0:nfgtasks) :: int4proc,sint4proc      !(0:max_fg_procs)
        integer :: i,nexcess
+      if (total_ints.le.0) then
+      lower_bound=1
+      upper_bound=0
+      return
+      endif
        nint=total_ints/nfgtasks
        do i=1,nfgtasks
          int4proc(i-1)=nint
@@ -3317,7 +3322,7 @@
             +gloc(nres-2,icg)*dtheta(j,1,3)      
  !         write(iout,*) "pierwszy gcart", gcart(j,2)
            if ((itype(2,1).ne.10).and.&
-          (itype(2,molnum(2)).ne.ntyp1_molec(molnum(2)).and.(molnum(2).ne.5))) then
+          (itype(2,molnum(2)).ne.ntyp1_molec(molnum(2)).and.(molnum(2).lt.3))) then
            gcart(j,1)=gcart(j,1)+gloc(ialph(2,1),icg)*dalpha(j,1,2)+ &
            gloc(ialph(2,1)+nside,icg)*domega(j,1,2)             
          endif
@@ -3327,7 +3332,7 @@
           gcart(j,2)=gcart(j,2)+gloc(1,icg)*dphi(j,2,4)+ &
          gloc(nres-2,icg)*dtheta(j,2,3)+gloc(nres-1,icg)*dtheta(j,1,4)
  !         write(iout,*) "drugi gcart", gcart(j,2)
-        if((itype(2,1).ne.10).and.(molnum(2).ne.5)) then
+        if((itype(2,1).ne.10).and.(molnum(2).lt.3)) then
            gcart(j,2)=gcart(j,2)+gloc(ialph(2,1),icg)*dalpha(j,2,2)+ &
            gloc(ialph(2,1)+nside,icg)*domega(j,2,2)
          endif
@@ -3367,7 +3372,7 @@
            +gloc(i-1,icg)*dphi(j,2,i+2)+ &
            gloc(i,icg)*dphi(j,1,i+3)+gloc(nres+i-4,icg)*dtheta(j,2,i+1)+ &
            gloc(nres+i-3,icg)*dtheta(j,1,i+2)
-          if((itype(i,1).ne.10).and.(molnum(nres-1).ne.5)) then
+          if((itype(i,1).ne.10).and.(molnum(nres-1).lt.3)) then
             gcart(j,i)=gcart(j,i)+gloc(ialph(i,1),icg)*dalpha(j,2,i)+ &
             gloc(ialph(i,1)+nside,icg)*domega(j,2,i)
            endif
@@ -3385,12 +3390,12 @@
            dphi(j,3,nres-1)+gloc(nres-3,icg)*dphi(j,2,nres) &
             +gloc(2*nres-6,icg)* &
             dtheta(j,2,nres-1)+gloc(2*nres-5,icg)*dtheta(j,1,nres)
-          if((itype(nres-2,1).ne.10).and.(molnum(nres-1).ne.5)) then
+          if((itype(nres-2,1).ne.10).and.(molnum(nres-1).lt.3)) then
                gcart(j,nres-2)=gcart(j,nres-2)+gloc(ialph(nres-2,1),icg)* &
               dalpha(j,2,nres-2)+gloc(ialph(nres-2,1)+nside,icg)* &
                domega(j,2,nres-2)
            endif
-          if((itype(nres-1,1).ne.10).and.(molnum(nres-1).ne.5)) then
+          if((itype(nres-1,1).ne.10).and.(molnum(nres-1).lt.3)) then
               gcart(j,nres-2)=gcart(j,nres-2)+gloc(ialph(nres-1,1),icg)* &
              dalpha(j,1,nres-1)+gloc(ialph(nres-1,1)+nside,icg)* &
               domega(j,1,nres-1)
@@ -3417,7 +3422,7 @@
  !
  !#endif
  !#undef DEBUG
-        if((itype(nres-1,1).ne.10).and.(molnum(nres-1).ne.5)) then
+        if((itype(nres-1,1).ne.10).and.(molnum(nres-1).lt.3)) then
            gcart(j,nres-1)=gcart(j,nres-1)+gloc(ialph(nres-1,1),icg)* &
           dalpha(j,2,nres-1)+gloc(ialph(nres-1,1)+nside,icg)* &
            domega(j,2,nres-1)
@@ -3436,7 +3441,7 @@
          do i=2,nres-1
           if(itype(i,1).ne.10 .and.  &
             itype(i,molnum(i)).ne.ntyp1_molec(molnum(i)).and.&
-             (molnum(i).ne.5)) then    
+             (molnum(i).lt.3)) then    
              do j=1,3   
                gxcart(j,i)=gxcart(j,i)+gloc(ialph(i,1),icg)*dalpha(j,3,i) &
                +gloc(ialph(i,1)+nside,icg)*domega(j,3,i)
@@ -3464,7 +3469,7 @@
         if (nres.lt.2) return
         if ((nres.lt.3).and.(itype(1,1).eq.10)) return
         if ((itype(1,1).ne.10).and. &
-        (itype(1,molnum(1)).ne.ntyp1_molec(molnum(1))).and.(molnum(1).ne.5)) then
+        (itype(1,molnum(1)).ne.ntyp1_molec(molnum(1))).and.(molnum(1).lt.3)) then
          do j=1,3
  !c Derviative was calculated for oposite vector of side chain therefore
  ! there is "-" sign before gloc_sc
@@ -3473,7 +3478,7 @@
           gcart(j,1)=gcart(j,1)+gloc_sc(1,0,icg)* &
             dtauangle(j,1,2,3)
            if ((itype(2,1).ne.10).and. &
-        (itype(2,molnum(2)).ne.ntyp1_molec(molnum(2))).and.(molnum(2).ne.5)) then
+        (itype(2,molnum(2)).ne.ntyp1_molec(molnum(2))).and.(molnum(2).lt.3)) then
           gxcart(j,1)= gxcart(j,1) &
                       -gloc_sc(3,0,icg)*dtauangle(j,3,1,3)
           gcart(j,1)=gcart(j,1)+gloc_sc(3,0,icg)* &
@@ -3497,12 +3502,12 @@
  !     Calculating the remainder of dE/ddc2
         do j=1,3
           if((itype(2,1).ne.10).and. &
-           (itype(2,molnum(2)).ne.ntyp1_molec(molnum(2)).and.(molnum(2).ne.5))) then
+           (itype(2,molnum(2)).ne.ntyp1_molec(molnum(2)).and.(molnum(2).lt.3))) then
             if ((itype(1,1).ne.10).and.&
-              ((itype(1,molnum(1)).ne.ntyp1_molec(molnum(1)))).and.(molnum(1).ne.5))&
+              ((itype(1,molnum(1)).ne.ntyp1_molec(molnum(1)))).and.(molnum(1).lt.3))&
              gxcart(j,2)=gxcart(j,2)+ &
                                 gloc_sc(3,0,icg)*dtauangle(j,3,3,3)
-        if ((itype(3,1).ne.10).and.(nres.ge.3).and.(itype(3,molnum(3)).ne.ntyp1_molec(3)).and.molnum(3).ne.5) &
+        if ((itype(3,1).ne.10).and.(nres.ge.3).and.(itype(3,molnum(3)).ne.ntyp1_molec(3)).and.molnum(3).lt.3) &
           then
             gxcart(j,2)=gxcart(j,2)-gloc_sc(3,1,icg)*dtauangle(j,3,1,4)
  !c                  the   - above is due to different vector direction
@@ -3519,15 +3524,15 @@
            endif
           endif
           if ((itype(1,1).ne.10).and.&
-         (itype(1,molnum(1)).ne.ntyp1_molec(molnum(1))).and.(molnum(1).ne.5)) then
+         (itype(1,molnum(1)).ne.ntyp1_molec(molnum(1))).and.(molnum(1).lt.3)) then
            gcart(j,2)=gcart(j,2)+gloc_sc(1,0,icg)*dtauangle(j,1,3,3)
  !           write(iout,*)  gloc_sc(1,0,icg),dtauangle(j,1,3,3)
          endif
-         if ((itype(3,1).ne.10).and.(nres.ge.3).and.(molnum(3).ne.5)) then
+         if ((itype(3,1).ne.10).and.(nres.ge.3).and.(molnum(3).lt.3)) then
            gcart(j,2)=gcart(j,2)+gloc_sc(2,1,icg)*dtauangle(j,2,2,4)
  !           write(iout,*) gloc_sc(2,1,icg),dtauangle(j,2,2,4)
           endif
-         if ((itype(4,1).ne.10).and.(nres.ge.4).and.(molnum(4).ne.5)) then
+         if ((itype(4,1).ne.10).and.(nres.ge.4).and.(molnum(4).lt.3)) then
            gcart(j,2)=gcart(j,2)+gloc_sc(2,2,icg)*dtauangle(j,2,1,5)
  !           write(iout,*) gloc_sc(2,2,icg),dtauangle(j,2,1,5)
           endif
@@ -3542,7 +3547,7 @@
           do j=1,3
  !          write(iout,*) "before", gcart(j,i)
            if ((itype(i,1).ne.10).and.&
-          (itype(i,molnum(i)).ne.ntyp1_molec(molnum(i))).and.(molnum(i).ne.5)) then
+          (itype(i,molnum(i)).ne.ntyp1_molec(molnum(i))).and.(molnum(i).lt.3)) then
            gxcart(j,i)=gxcart(j,i)+gloc_sc(2,i-2,icg) &
            *dtauangle(j,2,3,i+1) &
            -gloc_sc(1,i-1,icg)*dtauangle(j,1,1,i+2)
@@ -3560,7 +3565,7 @@
  !          if (itype(i+1,1).ne.10) then
            if ((itype(i+1,1).ne.10).and.&
            (itype(i+1,molnum(i+1)).ne.ntyp1_molec(molnum(i+1))).and.&
-           (molnum(i+1).ne.5)) then
+           (molnum(i+1).lt.3)) then
            gxcart(j,i)=gxcart(j,i)-gloc_sc(3,i-1,icg) &
        *dtauangle(j,3,1,i+2)
             gcart(j,i)=gcart(j,i)+gloc_sc(3,i-1,icg) &
@@ -3570,14 +3575,14 @@
  !          if (itype(i-1,1).ne.10) then
            if ((itype(i-1,1).ne.10).and.&
            (itype(i-1,molnum(i-1)).ne.ntyp1_molec(molnum(i-1))).and.&
-         (molnum(i-1).ne.5)) then
+         (molnum(i-1).lt.3)) then
             gcart(j,i)=gcart(j,i)+gloc_sc(1,i-2,icg)* &
             dtauangle(j,1,3,i+1)
            endif
  !          if (itype(i+1,1).ne.10) then
            if ((itype(i+1,1).ne.10).and.&
            (itype(i+1,molnum(i+1)).ne.ntyp1_molec(molnum(i+1)))&
-       .and. (molnum(i+1).ne.5)) then
+       .and. (molnum(i+1).lt.3)) then
             gcart(j,i)=gcart(j,i)+gloc_sc(2,i-1,icg)* &
             dtauangle(j,2,2,i+2)
  !          write(iout,*) "numer",i,gloc_sc(2,i-1,icg),
@@ -3585,7 +3590,7 @@
            endif
  !          if (itype(i+2,1).ne.10) then
            if ((itype(i+2,1).ne.10).and.&
-          (itype(i+2,molnum(i+2)).ne.ntyp1_molec(molnum(i+2))).and.(molnum(i+2).ne.5)) then
+          (itype(i+2,molnum(i+2)).ne.ntyp1_molec(molnum(i+2))).and.(molnum(i+2).lt.3)) then
             gcart(j,i)=gcart(j,i)+gloc_sc(2,i,icg)* &
             dtauangle(j,2,1,i+3)
            endif
@@ -3596,19 +3601,19 @@
        if(nres.ge.4) then
           do j=1,3
           if ((itype(nres-1,1).ne.10).and.&
-       (itype(nres-1,molnum(nres-1)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres-1))).and.(molnum(nres-1).ne.5)) then
+       (itype(nres-1,molnum(nres-1)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres-1))).and.(molnum(nres-1).lt.3)) then
           gxcart(j,nres-1)=gxcart(j,nres-1)+gloc_sc(2,nres-3,icg) &
            *dtauangle(j,2,3,nres)
  !          write (iout,*) "gxcart(nres-1)", gloc_sc(2,nres-3,icg),
  !     &     dtauangle(j,2,3,nres), gxcart(j,nres-1)
  !         if (itype(nres-2,1).ne.10) then
           if ((itype(nres-2,1).ne.10).and.&
-       (itype(nres-2,molnum(nres-2)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres-2))).and.(molnum(nres-2).ne.5)) then
+       (itype(nres-2,molnum(nres-2)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres-2))).and.(molnum(nres-2).lt.3)) then
         gxcart(j,nres-1)=gxcart(j,nres-1)+gloc_sc(3,nres-3,icg) &
            *dtauangle(j,3,3,nres)
            endif
           if ((itype(nres,1).ne.10).and.&
-         (itype(nres,molnum(nres)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres))).and.(molnum(nres).ne.5)) then
+         (itype(nres,molnum(nres)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres))).and.(molnum(nres).lt.3)) then
          gxcart(j,nres-1)=gxcart(j,nres-1)-gloc_sc(3,nres-2,icg) &
            *dtauangle(j,3,1,nres+1)
          gcart(j,nres-1)=gcart(j,nres-1)+gloc_sc(3,nres-2,icg) &
@@ -3616,11 +3621,11 @@
            endif
           endif
           if ((itype(nres-2,1).ne.10).and.&
-         (itype(nres-2,molnum(nres-2)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres-2))).and.(molnum(nres-2).ne.5)) then
+         (itype(nres-2,molnum(nres-2)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres-2))).and.(molnum(nres-2).lt.3)) then
              gcart(j,nres-1)=gcart(j,nres-1)+gloc_sc(1,nres-3,icg)* &
           dtauangle(j,1,3,nres)
           endif
-          if ((itype(nres,1).ne.10).and.(itype(nres,molnum(nres)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres))).and.(molnum(nres).ne.5)) then
+          if ((itype(nres,1).ne.10).and.(itype(nres,molnum(nres)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres))).and.(molnum(nres).lt.3)) then
              gcart(j,nres-1)=gcart(j,nres-1)+gloc_sc(2,nres-2,icg)* &
             dtauangle(j,2,2,nres+1)
  !           write (iout,*) "gcart(nres-1)", gloc_sc(2,nres-2,icg),
@@ -3630,7 +3635,7 @@
        endif
  !  Settind dE/ddnres       
         if ((nres.ge.3).and.(itype(nres,1).ne.10).and. &
-          (itype(nres,molnum(nres)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres))).and.(molnum(nres).ne.5))then
+          (itype(nres,molnum(nres)).ne.ntyp1_molec(molnum(nres))).and.(molnum(nres).lt.3))then
         do j=1,3
          gxcart(j,nres)=gxcart(j,nres)+gloc_sc(3,nres-2,icg) &
         *dtauangle(j,3,3,nres+1)+gloc_sc(2,nres-2,icg) &
@@ -3821,255 +3826,148 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine returnbox
        integer :: allareout,i,j,k,nojumpval,chain_beg,mnum
-      integer :: chain_end,ireturnval
-      real*8 :: difference
+      integer :: chain_end,ireturnval,idum,mnumi1
+      real*8 :: difference,xi,boxsize,x,xtemp,box2shift
+      real(kind=8),dimension(3) :: boxx
+      real(kind=8),dimension(3,100) :: xorg
+      integer,dimension(100) :: posdummy
+
  !C change suggested by Ana - end
          j=1
          chain_beg=1
-!C        do i=1,nres
-!C       write(*,*) 'initial', i,j,c(j,i)
-!C        enddo
+        boxx(1)=boxxsize
+        boxx(2)=boxysize
+        boxx(3)=boxzsize
+        idum=0
+!        if(me.eq.king.or..not.out1file) then
+!        do i=1,nres
+!          write(iout,'(a6,2i3,6f9.3)') 'initial', i,j,(c(j,i),j=1,3),(c(j,i+nres),j=1,3)
+!        enddo
+!        endif
  !C change suggested by Ana - begin
          allareout=1
+        chain_end=0
  !C change suggested by Ana -end
-        do i=1,nres-1
-           mnum=molnum(i)
-         if ((itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum))&
-            .and.(itype(i+1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum))) then
-          chain_end=i
-          if (allareout.eq.1) then
-            ireturnval=int(c(j,i)/boxxsize)
-            if (c(j,i).le.0) ireturnval=ireturnval-1
-            do k=chain_beg,chain_end
-              c(j,k)=c(j,k)-ireturnval*boxxsize
-              c(j,k+nres)=c(j,k+nres)-ireturnval*boxxsize
-            enddo
-!C Suggested by Ana
-            if (chain_beg.eq.1) &
-            dc_old(1,0)=dc_old(1,0)-ireturnval*boxxsize
-!C Suggested by Ana -end
-           endif
-           chain_beg=i+1
-           allareout=1
-         else
-          if (int(c(j,i)/boxxsize).eq.0) allareout=0
-         endif
-        enddo
-         if (allareout.eq.1) then
-            ireturnval=int(c(j,i)/boxxsize)
-            if (c(j,i).le.0) ireturnval=ireturnval-1
-            do k=chain_beg,nres
-              c(j,k)=c(j,k)-ireturnval*boxxsize
-              c(j,k+nres)=c(j,k+nres)-ireturnval*boxxsize
-            enddo
-          endif
-!C NO JUMP 
-!C        do i=1,nres
-!C        write(*,*) 'befor no jump', i,j,c(j,i)
-!C        enddo
-        nojumpval=0
-        do i=2,nres
-           mnum=molnum(i)
-           if (itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)&
-              .and. itype(i-1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) then
-             difference=abs(c(j,i-1)-c(j,i))
-!C             print *,'diff', difference
-             if (difference.gt.boxxsize/2.0) then
-                if (c(j,i-1).gt.c(j,i)) then
-                  nojumpval=1
-                 else
-                   nojumpval=-1
-                 endif
-              else
-              nojumpval=0
-              endif
-              endif
-              c(j,i)=c(j,i)+nojumpval*boxxsize
-              c(j,i+nres)=c(j,i+nres)+nojumpval*boxxsize
+        do i=1,nres
+          mnum=molnum(i)
+         if (itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) then
+         idum=idum+1
+         posdummy(idum)=i
+         if (i.ne.nres) then
+         mnumi1=molnum(i+1)
+         if ((itype(i+1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)).or.(mnum.ne.mnumi1)) then
+         do j=1,3
+         xorg(j,idum)=c(j,i)-c(j,i-1)
           enddo
-       nojumpval=0
-        do i=2,nres
-           mnum=molnum(i)
-           if (itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum) .and. itype(i-1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) then
-             difference=abs(c(j,i-1)-c(j,i))
-             if (difference.gt.boxxsize/2.0) then
-                if (c(j,i-1).gt.c(j,i)) then
-                  nojumpval=1
-                 else
-                   nojumpval=-1
-                 endif
-              else
-              nojumpval=0
-              endif
-             endif
-              c(j,i)=c(j,i)+nojumpval*boxxsize
-              c(j,i+nres)=c(j,i+nres)+nojumpval*boxxsize
+         else
+         do j=1,3
+         xorg(j,idum)=c(j,i)-c(j,i+1)
           enddo
-
-!C        do i=1,nres
-!C        write(*,*) 'after no jump', i,j,c(j,i)
-!C        enddo
-
-!C NOW Y dimension
-!C suggesed by Ana begins
-        allareout=1
-        j=2
-        chain_beg=1
-        do i=1,nres-1
-           mnum=molnum(i)
-         if ((itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum))&
-           .and.(itype(i+1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum))) then
-          chain_end=i
-          if (allareout.eq.1) then
-            ireturnval=int(c(j,i)/boxysize)
-            if (c(j,i).le.0) ireturnval=ireturnval-1
-            do k=chain_beg,chain_end
-              c(j,k)=c(j,k)-ireturnval*boxysize
-             c(j,k+nres)=c(j,k+nres)-ireturnval*boxysize
-            enddo
-!C Suggested by Ana
-            if (chain_beg.eq.1) &
-            dc_old(1,0)=dc_old(1,0)-ireturnval*boxxsize
-!C Suggested by Ana -end
-           endif
-           chain_beg=i+1
-           allareout=1
+         endif
           else
-          if (int(c(j,i)/boxysize).eq.0) allareout=0
+         do j=1,3
+         xorg(j,idum)=c(j,i)-c(j,i-1)
+         enddo
+         endif
           endif
          enddo
-         if (allareout.eq.1) then
-            ireturnval=int(c(j,i)/boxysize)
-            if (c(j,i).le.0) ireturnval=ireturnval-1
-            do k=chain_beg,nres
-              c(j,k)=c(j,k)-ireturnval*boxysize
-              c(j,k+nres)=c(j,k+nres)-ireturnval*boxysize
-            enddo
+ 12     continue
+        do i=1,nres
+         mnum=molnum(i)
+         if (molnum(i).ge.1) then
+          if (i.le.3) then
+           k=2
+          else
+          if (itype(i,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)) then
+          k=k+1
            endif
-        nojumpval=0
-        do i=2,nres
-           mnum=molnum(i)
-           if (itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)&
-              .and. itype(i-1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) then
-             difference=abs(c(j,i-1)-c(j,i))
-             if (difference.gt.boxysize/2.0) then
-                if (c(j,i-1).gt.c(j,i)) then
-                  nojumpval=1
-                 else
-                   nojumpval=-1
-                 endif
-             else
-              nojumpval=0
-              endif
-           endif
-              c(j,i)=c(j,i)+nojumpval*boxysize
-              c(j,i+nres)=c(j,i+nres)+nojumpval*boxysize
+          endif
+!          print *,"tu2",i,k
+          if (itype(k,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) k=k+1
+          if (itype(k,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) k=k+1
+!          print *,"tu2",i,k
+
+          do j=1,3
+          c(j,i)=dmod(c(j,i),boxx(j))
+!          if (c(1,i).lt.0) c(1,i)=c(1,i)+boxxsize
+          x=c(j,i)-c(j,k)
+!          print *,"return box,before wrap",c(1,i)
+         boxsize=boxx(j)
+           xtemp=dmod(x,boxsize)
+      if (dabs(xtemp-boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        box2shift=xtemp-boxsize
+      else if (dabs(xtemp+boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        box2shift=xtemp+boxsize
+      else
+        box2shift=xtemp
+      endif
+          xi=box2shift
+!          print *,c(1,2),xi,xtemp,box2shift
+          c(j,i)=c(j,k)+xi
           enddo
-      nojumpval=0
-        do i=2,nres
-           mnum=molnum(i)
-           if (itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)&
-             .and. itype(i-1,mnum).eq.ntyp1) then
-             difference=abs(c(j,i-1)-c(j,i))
-             if (difference.gt.boxysize/2.0) then
-                if (c(j,i-1).gt.c(j,i)) then
-                  nojumpval=1
-                 else
-                   nojumpval=-1
-                 endif
-              else
-              nojumpval=0
-              endif
-            endif
-              c(j,i)=c(j,i)+nojumpval*boxysize
-              c(j,i+nres)=c(j,i+nres)+nojumpval*boxysize
+          do j=1,3
+          c(j,i+nres)=dmod(c(j,i+nres),boxx(j))
+!          if (c(1,i).lt.0) c(1,i)=c(1,i)+boxxsize
+          x=c(j,i+nres)-c(j,i)
+!          print *,"return box,before wrap",c(1,i)
+         boxsize=boxx(j)
+           xtemp=dmod(x,boxsize)
+      if (dabs(xtemp-boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        box2shift=xtemp-boxsize
+      else if (dabs(xtemp+boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        box2shift=xtemp+boxsize
+      else
+        box2shift=xtemp
+      endif
+          xi=box2shift
+!          print *,c(1,2),xi,xtemp,box2shift
+          c(j,i+nres)=c(j,i)+xi
           enddo
-!C Now Z dimension
-!C Suggested by Ana -begins
-        allareout=1
-!C Suggested by Ana -ends
-       j=3
-        chain_beg=1
-        do i=1,nres-1
-           mnum=molnum(i)
-         if ((itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum))&
-           .and.(itype(i+1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum))) then
-          chain_end=i
-          if (allareout.eq.1) then
-            ireturnval=int(c(j,i)/boxysize)
-            if (c(j,i).le.0) ireturnval=ireturnval-1
-            do k=chain_beg,chain_end
-              c(j,k)=c(j,k)-ireturnval*boxzsize
-              c(j,k+nres)=c(j,k+nres)-ireturnval*boxzsize
-            enddo
-!C Suggested by Ana
-            if (chain_beg.eq.1) dc_old(1,0)=dc_old(1,0)-ireturnval*boxxsize
-!C Suggested by Ana -end
-           endif
-           chain_beg=i+1
-           allareout=1
-         else
-          if (int(c(j,i)/boxzsize).eq.0) allareout=0
           endif
          enddo
-         if (allareout.eq.1) then
-            ireturnval=int(c(j,i)/boxzsize)
-            if (c(j,i).le.0) ireturnval=ireturnval-1
-            do k=chain_beg,nres
-              c(j,k)=c(j,k)-ireturnval*boxzsize
-              c(j,k+nres)=c(j,k+nres)-ireturnval*boxzsize
+        do i=1,idum
+          k=posdummy(i)
+          mnum=molnum(k)
+        if(me.eq.king.or..not.out1file) then
+          write(iout,*),"posdummy",i,k,(xorg(j,i),j=1,3)
+        endif
+!          do j=1,3
+!           if (dabs(xorg(j,i)).gt.boxx(j))then
+!           x=xorg(j,i)
+!           boxsize=boxx(j)
+!           xtemp=dmod(x,boxsize)
+!           if (dabs(-boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+!             box2shift=xtemp-boxsize
+!           else if (dabs(xtemp+boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+!          box2shift=xtemp+boxsize
+!!        else
+!           box2shift=xtemp
+!          endif
+!           xorg(j,i)=box2shift
+!           endif
+!          enddo
+          if (k.eq.nres) then
+           do j=1,3
+           c(j,k)=c(j,k-1)+xorg(j,i)
+           enddo
+          else
+           mnumi1=molnum(k+1)
+           if ((itype(k+1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)).or.(mnum.ne.mnumi1)) then
+           do j=1,3
+             c(j,k)=c(j,k-1)+xorg(j,i)
+           enddo
+           else
+            do j=1,3
+             c(j,k)=c(j,k+1)+xorg(j,i)
              enddo
-          endif
-        nojumpval=0
-        do i=2,nres
-           mnum=molnum(i)
-           if (itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum) .and. itype(i-1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) then
-             difference=abs(c(j,i-1)-c(j,i))
-             if (difference.gt.(boxzsize/2.0)) then
-                if (c(j,i-1).gt.c(j,i)) then
-                  nojumpval=1
-                 else
-                   nojumpval=-1
-                 endif
-              else
-              nojumpval=0
-              endif
-            endif
-              c(j,i)=c(j,i)+nojumpval*boxzsize
-              c(j,i+nres)=c(j,i+nres)+nojumpval*boxzsize
-         enddo
-       nojumpval=0
-        do i=2,nres
-           mnum=molnum(i)
-           if (itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum) &
-            .and. itype(i-1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) then
-             difference=abs(c(j,i-1)-c(j,i))
-             if (difference.gt.boxzsize/2.0) then
-                if (c(j,i-1).gt.c(j,i)) then
-                  nojumpval=1
-                 else
-                   nojumpval=-1
-                 endif
-              else
-              nojumpval=0
-              endif
-            endif
-             c(j,i)=c(j,i)+nojumpval*boxzsize
-              c(j,i+nres)=c(j,i+nres)+nojumpval*boxzsize
-         enddo
-        do i=1,nres
-         if (molnum(i).eq.5) then
-          c(1,i)=dmod(c(1,i),boxxsize)
-          if (c(1,i).lt.0) c(1,i)=c(1,i)+boxxsize
-          c(2,i)=dmod(c(2,i),boxysize)
-          if (c(2,i).lt.0) c(2,i)=c(2,i)+boxysize
-          c(3,i)=dmod(c(3,i),boxzsize)
-          if (c(3,i).lt.0) c(3,i)=c(3,i)+boxzsize
-          c(1,i+nres)=dmod(c(1,i+nres),boxxsize)
-          c(2,i+nres)=dmod(c(2,i+nres),boxysize)
-          c(3,i+nres)=dmod(c(3,i+nres),boxzsize)
+           endif
           endif
          enddo
+!        if(me.eq.king.or..not.out1file) then
+!        do i=1,nres
+!          write(iout,'(a6,2i3,6f9.3)') 'final', i,j,(c(j,i),j=1,3),(c(j,i+nres),j=1,3)
+!        enddo
+!        endif
          return
          end       subroutine returnbox
  !-------------------------------------------------------------------------------------------------------
diff --git a/source/unres/io.F90 b/source/unres/io.F90

index e51d259..e0bac89 100644 (file)
--- a/source/unres/io.F90
+++ b/source/unres/io.F90
@@ -732,7 +732,7 @@
  !      integer ilen
  !el      external ilen
  !el local varables
-      integer :: i,j,l,k,kkk,ii,i1,i2,it1,it2
+      integer :: i,j,l,k,kkk,ii,i1,i2,it1,it2,mnum
  
        real(kind=8),dimension(3,maxres2+2) :: c_alloc
        real(kind=8),dimension(3,0:maxres2) :: dc_alloc
@@ -808,6 +808,7 @@
        call reada(weightcard,'WCATCAT',wcatcat,0.0d0)
        call reada(weightcard,'WCATPROT',wcatprot,0.0d0)
        call reada(weightcard,'WCATNUCL',wcatnucl,0.0d0)
+      call reada(weightcard,'WCATTRAN',wcat_tran,0.0d0)
        call reada(weightcard,'WPEPBASE',wpepbase,1.0d0)
        call reada(weightcard,'WSCPHO',wscpho,0.0d0)
        call reada(weightcard,'WPEPPHO',wpeppho,0.0d0)
@@ -854,7 +855,7 @@
            weights(48)=wscpho
            weights(49)=wpeppho
            weights(50)=wcatnucl
-
+          weights(56)=wcat_tran
        if(me.eq.king.or..not.out1file) &
         write (iout,10) wsc,wscp,welec,wvdwpp,wbond,wang,wscloc,wtor,&
          wtor_d,wstrain,wel_loc,wcorr,wcorr5,wcorr6,wsccor,wturn3,&
@@ -1105,13 +1106,20 @@
          endif
          if(.not.allocated(vbld_inv)) allocate(vbld_inv(2*nres))
          do i=2,nres
+           mnum=molnum(i)
            if (molnum(i).eq.1) then
            vbld(i)=vbl
            vbld_inv(i)=vblinv
  
            else
-          vbld(i)=7.0
-          vbld_inv(i)=1.0/7.0
+          write(iout,*) "typy",itype(i,mnum),ntyp1_molec(mnum),i
+          vbld(i)=6.0
+          vbld_inv(i)=1.0/6.0
+          if ((itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)).or.&
+          (itype(i-1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum))) then
+          vbld(i)=1.9
+          vbld_inv(i)=1.0/1.9
+          endif
            endif
          enddo
          do i=2,nres-1
@@ -1353,7 +1361,7 @@
                    'Error - sequences to be superposed do not match.'
          endif
    111   continue
-        if (nsup.eq.0) nsup=nct-nnt
+        if (nsup.eq.0) nsup=nct-nnt+1
          if (nstart_sup.eq.0) nstart_sup=nnt
          if (nstart_seq.eq.0) nstart_seq=nnt
          if(me.eq.king.or..not.out1file) &
@@ -1369,7 +1377,7 @@
        endif
        if(me.eq.king.or..not.out1file)then
         write (iout,*) 'NZ_START=',nz_start,' NZ_END=',nz_end
-       write (iout,*) 'IZ_SC=',iz_sc
+       write (iout,*) 'IZ_SC=',iz_sc, 'NCT=',nct
        endif
  !----------------------
        call init_int_table
@@ -1475,15 +1483,19 @@
            write (iout,'(a)') 'Extended chain initial geometry.'
           do i=3,nres
            theta(i)=90d0*deg2rad
+          if (molnum(i).eq.2) theta(i)=160d0*deg2rad
           enddo
           do i=4,nres
            phi(i)=180d0*deg2rad
+          if (molnum(i).eq.2) phi(i)=30d0*deg2rad
           enddo
           do i=2,nres-1
            alph(i)=110d0*deg2rad
+          if (molnum(i).eq.2) alph(i)=30d0*deg2rad
           enddo
           do i=2,nres-1
            omeg(i)=-120d0*deg2rad
+          if (molnum(i).eq.2) omeg(i)=60d0*deg2rad
            if (itype(i,1).le.0) omeg(i)=-omeg(i)
           enddo
           call chainbuild
diff --git a/source/unres/io_base.F90 b/source/unres/io_base.F90

index a8729a7..198fb1f 100644 (file)
--- a/source/unres/io_base.F90
+++ b/source/unres/io_base.F90
@@ -958,8 +958,9 @@
  !-----------------------------------------------------------------------------
        subroutine pdbout(etot,tytul,iunit)
  
-      use geometry_data, only: c,nres
+      use geometry_data, only: c,nres,boxxsize,boxysize,boxzsize
        use energy_data
+!      use energy, only: to_box
  !     use control
        use compare_data
        use MD_data
@@ -975,7 +976,10 @@
  !      include 'COMMON.MD'
  !el      character(len=50) :: tytul
        character*(*) :: tytul
-      character(len=1),dimension(10) :: chainid=  (/'A','B','C','D','E','F','G','H','I','J'/)
+      character(len=1),dimension(58) :: chainid=  (/'A','B','C','D','E','F','G','H','I','J',&
+         'K','L','M','O','Q','P','R','S','T','U','W','X','Y','Z','a','b','c','d','e','f',&
+            'g','h','i','j','k','l','m','n','o','p','r','s','t','u','w','x','y','z',&
+            '0','1','2','3','4','5','6','7','8','9'/)
  #ifdef XDRFPDB
        integer,dimension(maxres) :: ica !(maxres)
  #else
@@ -984,13 +988,14 @@
        integer :: iti1
  !el  local variables
        integer :: j,iti,itj,itk,itl,i,iatom,ichain,ires,iunit
-      real(kind=8) :: etot
+      real(kind=8) :: etot,xi,yi,zi
        integer :: nres2
        nres2=2*nres
  #ifdef XDRFPDB
        if(.not.allocated(molnum)) allocate(molnum(maxres))
-      molnum(:)=1
+!      molnum(:)=mnumi(:)
        if(.not.allocated(vtot)) allocate(vtot(maxres*2)) !(maxres2)
+      if(.not.allocated(istype)) allocate(istype(maxres))
  #else
        if(.not.allocated(vtot)) allocate(vtot(nres2)) !(maxres2)
  #endif
@@ -1091,6 +1096,7 @@
          endif
          if (iti.eq.ntyp1_molec(molnum(i))) then
            ichain=ichain+1
+          if (ichain.gt.58) ichain=1
  !          ires=0
            write (iunit,'(a)') 'TER'
          else
@@ -1105,7 +1111,19 @@
             if (istype(i).eq.0) istype(i)=1
          write (iunit,40) iatom,sugartyp(istype(i)),restyp(iti,2), &
            chainid(ichain),ires,(c(j,i),j=1,3),vtot(i)
-        else
+        elseif (molnum(i).eq.4) then
+        xi=c(1,i)
+        yi=c(2,i)
+        zi=c(3,i)
+        xi=dmod(xi,boxxsize)
+        if (xi.lt.0.0d0) xi=xi+boxxsize
+        yi=dmod(yi,boxysize)
+        if (yi.lt.0.0d0) yi=yi+boxysize
+        zi=dmod(zi,boxzsize)
+        if (zi.lt.0.0d0) zi=zi+boxzsize
+        write (iunit,60) iatom,restyp(iti,molnum(i)),chainid(ichain),&
+           ires,xi,yi,zi,vtot(i)
+        else 
          write (iunit,60) iatom,restyp(iti,molnum(i)),chainid(ichain),&
             ires,(c(j,i),j=1,3),vtot(i)
          endif
@@ -1562,6 +1580,29 @@
        endif
        return
        end function sugarcode
+      integer function rescode_lip(res,ires)
+      character(len=3):: res
+      integer ires
+       rescode_lip=0
+       if  (res.eq.'NC3')  rescode_lip =4
+       if  (res.eq.'NH3')  rescode_lip =2
+       if  (res.eq.'PO4')  rescode_lip =3
+       if  (res.eq.'GL1')  rescode_lip =12
+       if  (res.eq.'GL2')  rescode_lip =12
+       if  (res.eq.'C1A')  rescode_lip =18
+       if  (res.eq.'C2A')  rescode_lip =18
+       if  (res.eq.'C3A')  rescode_lip =18
+       if  (res.eq.'C4A')  rescode_lip =18
+       if  (res.eq.'C1B')  rescode_lip =18
+       if  (res.eq.'C2B')  rescode_lip =18
+       if  (res.eq.'C3B')  rescode_lip =18
+       if  (res.eq.'C4B')  rescode_lip =18
+       if  (res.eq.'D2A')  rescode_lip =16
+       if  (res.eq.'D2B')  rescode_lip =16
+
+        if (rescode_lip.eq.0) write(iout,*) "UNKNOWN RESIDUE",ires,res
+      return
+      end function
  !-----------------------------------------------------------------------------
  !-----------------------------------------------------------------------------
        end module io_base
diff --git a/source/unres/io_config.F90 b/source/unres/io_config.F90

index 0d92898..51bfd65 100644 (file)
--- a/source/unres/io_config.F90
+++ b/source/unres/io_config.F90
@@ -745,10 +745,10 @@
                  dwa16,rjunk,akl,v0ij,rri,epsij,rrij,sigeps,sigt1sq,&
                  sigt2sq,sigii1,sigii2,ratsig1,ratsig2,rsum_max,r_augm,&
                  res1,epsijlip,epspeptube,epssctube,sigmapeptube,      &
-                sigmasctube
+                sigmasctube,krad2
        integer :: ichir1,ichir2,ijunk
        character*3 string
-
+      character*80 temp1
  !      real(kind=8),dimension(maxterm,-maxtor:maxtor,-maxtor:maxtor,2) :: v1_el,v2_el !(maxterm,-maxtor:maxtor,-maxtor:maxtor,2)
  !el      allocate(v1_el(maxterm,-maxtor:maxtor,-maxtor:maxtor,2))
  !el      allocate(v2_el(maxterm,-maxtor:maxtor,-maxtor:maxtor,2))
@@ -2702,6 +2702,9 @@
         print *,eps(i,j),sigma(i,j),"SIGMAP",i,j,sigmap1(i,j),sigmap2(j,i), wqdip(1,i,j)
         END DO
        END DO
+        do i=1,ntyp
+         read (isidep,*,end=117,err=117)(epslip(i,j),j=i,ntyp)
+        enddo
        do i=1,ntyp
         do j=1,i
          IF ((LaTeX).and.(i.gt.24)) then
@@ -3010,14 +3013,14 @@
        allocate(alphapol_scbase(ntyp_molec(1),ntyp_molec(2)))
        allocate(epsintab_scbase(ntyp_molec(1),ntyp_molec(2)))
  
-
+      write (iout,*) "ESCBASEPARM"
        do i=1,ntyp_molec(1)
-       do j=1,ntyp_molec(2)-1 ! without U then we will take T for U
-        write (*,*) "Im in ", i, " ", j
+       do j=1,ntyp_molec(2) ! without U then we will take T for U
+!        write (*,*) "Im in ", i, " ", j
          read(isidep_scbase,*) &
          eps_scbase(i,j),sigma_scbase(i,j),chi_scbase(i,j,1),&
          chi_scbase(i,j,2),chipp_scbase(i,j,1),chipp_scbase(i,j,2)
-         write(*,*) "eps",eps_scbase(i,j)
+!         write(*,*) "eps",eps_scbase(i,j)
          read(isidep_scbase,*) &
         (alphasur_scbase(k,i,j),k=1,4),sigmap1_scbase(i,j),sigmap2_scbase(i,j), &
         chis_scbase(i,j,1),chis_scbase(i,j,2)
@@ -3031,7 +3034,52 @@
          read(isidep_scbase,*) &
         alphapol_scbase(i,j), &
         epsintab_scbase(i,j) 
+        if (chi_scbase(i,j,2).gt.0.9) chi_scbase(i,j,2)=0.9
+        if (chi_scbase(i,j,1).gt.0.9) chi_scbase(i,j,1)=0.9
+        if (chipp_scbase(i,j,2).gt.0.9) chipp_scbase(i,j,2)=0.9
+        if (chipp_scbase(i,j,1).gt.0.9) chipp_scbase(i,j,1)=0.9
+        if (chi_scbase(i,j,2).lt.-0.9) chi_scbase(i,j,2)=-0.9
+        if (chi_scbase(i,j,1).lt.-0.9) chi_scbase(i,j,1)=-0.9
+        if (chipp_scbase(i,j,2).lt.-0.9) chipp_scbase(i,j,2)=-0.9
+        if (chipp_scbase(i,j,1).lt.-0.9) chipp_scbase(i,j,1)=-0.9
+        write(iout,*) &
+        eps_scbase(i,j),sigma_scbase(i,j),chi_scbase(i,j,1),&
+        chi_scbase(i,j,2),chipp_scbase(i,j,1),chipp_scbase(i,j,2)
+         write(*,*) "eps",eps_scbase(i,j)
+        write(iout,*) &
+       (alphasur_scbase(k,i,j),k=1,4),sigmap1_scbase(i,j),sigmap2_scbase(i,j), &
+       chis_scbase(i,j,1),chis_scbase(i,j,2)
+        write(iout,*) &
+       dhead_scbasei(i,j), &
+       dhead_scbasej(i,j), &
+       rborn_scbasei(i,j),rborn_scbasej(i,j)
+        write(iout,*) &
+       (wdipdip_scbase(k,i,j),k=1,3), &
+       (wqdip_scbase(k,i,j),k=1,2)
+        write(iout,*) &
+       alphapol_scbase(i,j), &
+       epsintab_scbase(i,j)
+
         END DO
+        j=4
+        write(iout,*) &
+        eps_scbase(i,j),sigma_scbase(i,j),chi_scbase(i,j,1),&
+        chi_scbase(i,j,2),chipp_scbase(i,j,1),chipp_scbase(i,j,2)
+         write(*,*) "eps",eps_scbase(i,j)
+        write(iout,*) &
+       (alphasur_scbase(k,i,j),k=1,4),sigmap1_scbase(i,j),sigmap2_scbase(i,j), &
+       chis_scbase(i,j,1),chis_scbase(i,j,2)
+        write(iout,*) &
+       dhead_scbasei(i,j), &
+       dhead_scbasej(i,j), &
+       rborn_scbasei(i,j),rborn_scbasej(i,j)
+        write(iout,*) &
+       (wdipdip_scbase(k,i,j),k=1,3), &
+       (wqdip_scbase(k,i,j),k=1,2)
+        write(iout,*) &
+       alphapol_scbase(i,j), &
+       epsintab_scbase(i,j)
+
        END DO
        allocate(aa_scbase(ntyp_molec(1),ntyp_molec(2)))
        allocate(bb_scbase(ntyp_molec(1),ntyp_molec(2)))
@@ -3061,19 +3109,46 @@
        allocate(chis_pepbase(ntyp_molec(2),2))
        allocate(wdipdip_pepbase(3,ntyp_molec(2)))
  
+      write (iout,*) "EPEPBASEPARM"
  
-       do j=1,ntyp_molec(2)-1 ! without U then we will take T for U
+       do j=1,ntyp_molec(2) ! without U then we will take T for U
          write (*,*) "Im in ", i, " ", j
          read(isidep_pepbase,*) &
          eps_pepbase(j),sigma_pepbase(j),chi_pepbase(j,1),&
          chi_pepbase(j,2),chipp_pepbase(j,1),chipp_pepbase(j,2)
+        if (chi_pepbase(j,2).gt.0.9) chi_pepbase(j,2)=0.9
+        if (chi_pepbase(j,1).gt.0.9) chi_pepbase(j,1)=0.9
+        if (chipp_pepbase(j,2).gt.0.9) chipp_pepbase(j,2)=0.9
+        if (chipp_pepbase(j,1).gt.0.9) chipp_pepbase(j,1)=0.9
+        if (chi_pepbase(j,2).lt.-0.9) chi_pepbase(j,2)=-0.9
+        if (chi_pepbase(j,1).lt.-0.9) chi_pepbase(j,1)=-0.9
+        if (chipp_pepbase(j,2).lt.-0.9) chipp_pepbase(j,2)=-0.9
+        if (chipp_pepbase(j,1).lt.-0.9) chipp_pepbase(j,1)=-0.9
+
           write(*,*) "eps",eps_pepbase(j)
          read(isidep_pepbase,*) &
         (alphasur_pepbase(k,j),k=1,4),sigmap1_pepbase(j),sigmap2_pepbase(j), &
         chis_pepbase(j,1),chis_pepbase(j,2)
          read(isidep_pepbase,*) &
         (wdipdip_pepbase(k,j),k=1,3)
+        write(iout,*) eps_pepbase(j),sigma_pepbase(j),chi_pepbase(j,1),&
+        chi_pepbase(j,2),chipp_pepbase(j,1),chipp_pepbase(j,2)
+        write(iout,*) &
+       (alphasur_pepbase(k,j),k=1,4),sigmap1_pepbase(j),sigmap2_pepbase(j), &
+       chis_pepbase(j,1),chis_pepbase(j,2)
+        write(iout,*) &
+       (wdipdip_pepbase(k,j),k=1,3)
+
         END DO
+        j=4
+        write(iout,*) eps_pepbase(j),sigma_pepbase(j),chi_pepbase(j,1),&
+        chi_pepbase(j,2),chipp_pepbase(j,1),chipp_pepbase(j,2)
+        write(iout,*) &
+       (alphasur_pepbase(k,j),k=1,4),sigmap1_pepbase(j),sigmap2_pepbase(j), &
+       chis_pepbase(j,1),chis_pepbase(j,2)
+        write(iout,*) &
+       (wdipdip_pepbase(k,j),k=1,3)
+
        allocate(aa_pepbase(ntyp_molec(2)))
        allocate(bb_pepbase(ntyp_molec(2)))
  
@@ -3123,6 +3198,15 @@
          read(isidep_scpho,*) &
           epsintab_scpho(j),alphapol_scpho(j),rborn_scphoi(j),rborn_scphoj(j), &
           alphi_scpho(j)
+        if (chi_scpho(j,2).gt.0.9) chi_scpho(j,2)=0.9
+        if (chi_scpho(j,1).gt.0.9) chi_scpho(j,1)=0.9
+        if (chipp_scpho(j,2).gt.0.9) chipp_scpho(j,2)=0.9
+        if (chipp_scpho(j,1).gt.0.9) chipp_scpho(j,1)=0.9
+        if (chi_scpho(j,2).lt.-0.9) chi_scpho(j,2)=-0.9
+        if (chi_scpho(j,1).lt.-0.9) chi_scpho(j,1)=-0.9
+        if (chipp_scpho(j,2).lt.-0.9) chipp_scpho(j,2)=-0.9
+        if (chipp_scpho(j,1).lt.-0.9) chipp_scpho(j,1)=-0.9
+
         
         END DO
        allocate(aa_scpho(ntyp_molec(1)))
@@ -3254,6 +3338,97 @@
  !      v1ss=0.0d0
  !      v2ss=0.0d0
  !      v3ss=0.0d0
+! MARTINI PARAMETER
+      allocate(ichargelipid(ntyp_molec(4)))
+      allocate(lip_angle_force(ntyp_molec(4),ntyp_molec(4),ntyp_molec(4)))
+      allocate(lip_angle_angle(ntyp_molec(4),ntyp_molec(4),ntyp_molec(4)))
+      allocate(lip_bond(ntyp_molec(4),ntyp_molec(4)))
+      allocate(lip_eps(ntyp_molec(4),ntyp_molec(4)))
+      allocate(lip_sig(ntyp_molec(4),ntyp_molec(4)))
+      kjtokcal=0.2390057361
+      krad=57.295779513
+      !HERE THE MASS of MARTINI
+      write(*,*) "before MARTINI PARAM"
+      do i=1,ntyp_molec(4)
+       msc(i,4)=0.0d0
+       mp(4)=72.0d0
+       isc(i,4)=0.d0
+      enddo
+      ip(4)=0.0
+      !relative dielectric constant = 15 for implicit screening
+      k_coulomb_lip=332.0d0/15.0d0
+      !kbond = 1250 kJ/(mol*nm*2)
+      kbondlip=1250.0d0*kjtokcal/100.0d0
+      krad2=krad**2.0
+      lip_angle_force=0.0d0
+      if (DRY_MARTINI.gt.0) then
+      lip_angle_force(3,12,12)=35.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(3,12,18)=35.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(3,18,16)=35.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(12,18,16)=35.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(18,16,18)=45.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(16,18,18)=35.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(12,18,18)=35.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(18,18,18)=35.0*kjtokcal!*krad2
+      else
+      lip_angle_force(3,12,12)=25.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(3,12,18)=25.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(3,18,16)=25.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(12,18,16)=25.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(18,16,18)=45.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(16,18,18)=25.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(12,18,18)=25.0*kjtokcal!*krad2
+      lip_angle_force(18,18,18)=25.0*kjtokcal!*krad2
+      endif
+      lip_angle_angle=0.0d0
+      lip_angle_angle(3,12,12)=120.0/krad
+      lip_angle_angle(3,12,18)=180.0/krad
+      lip_angle_angle(3,18,16)=180.0/krad
+      lip_angle_angle(12,18,16)=180.0/krad
+      lip_angle_angle(18,16,18)=120.0/krad
+      lip_angle_angle(16,18,18)=180.0/krad
+      lip_angle_angle(12,18,18)=180.0/krad
+      lip_angle_angle(18,18,18)=180.0/krad
+       read(ilipbond,*) temp1
+      do i=1,18
+        read(ilipbond,*) temp1, lip_bond(i,1), &
+        lip_bond(i,2),lip_bond(i,3),lip_bond(i,4),lip_bond(i,5), &
+        lip_bond(i,6),lip_bond(i,7),lip_bond(i,8),lip_bond(i,9), &
+        lip_bond(i,10),lip_bond(i,11),lip_bond(i,12),lip_bond(i,13), &
+        lip_bond(i,14),lip_bond(i,15),lip_bond(i,16),lip_bond(i,17), &
+        lip_bond(i,18)
+        do j=1,18
+          lip_bond(i,j)=lip_bond(i,j)*10
+        enddo
+      enddo
+
+       read(ilipnonbond,*) (ichargelipid(i),i=1,ntyp_molec(4))
+       read(ilipnonbond,*) temp1
+      do i=1,18
+        read(ilipnonbond,*) temp1, lip_eps(i,1), &
+        lip_eps(i,2),lip_eps(i,3),lip_eps(i,4),lip_eps(i,5), &
+        lip_eps(i,6),lip_eps(i,7),lip_eps(i,8),lip_eps(i,9), &
+        lip_eps(i,10),lip_eps(i,11),lip_eps(i,12),lip_eps(i,13), &
+        lip_eps(i,14),lip_eps(i,15),lip_eps(i,16),lip_eps(i,17), &
+        lip_eps(i,18)
+!        write(*,*) i, lip_eps(i,18)
+        do j=1,18
+          lip_eps(i,j)=lip_eps(i,j)*kjtokcal
+        enddo
+      enddo
+       read(ilipnonbond,*) temp1
+      do i=1,18
+        read(ilipnonbond,*) temp1,lip_sig(i,1), &
+        lip_sig(i,2),lip_sig(i,3),lip_sig(i,4),lip_sig(i,5), &
+        lip_sig(i,6),lip_sig(i,7),lip_sig(i,8),lip_sig(i,9), &
+        lip_sig(i,10),lip_sig(i,11),lip_sig(i,12),lip_sig(i,13), &
+        lip_sig(i,14),lip_sig(i,15),lip_sig(i,16),lip_sig(i,17), &
+        lip_sig(i,18)
+        do j=1,18
+          lip_sig(i,j)=lip_sig(i,j)*10.0
+        enddo
+      enddo
+      write(*,*) "after MARTINI PARAM"
  
  ! Ions by Aga
  
@@ -3279,6 +3454,8 @@
  
  
              if (.not.allocated(ichargecat)) allocate (ichargecat(ntyp_molec(5)))
+      write(*,*) "before ions",oldion
+
  ! i to SC, j to jon, isideocat - nazwa pliku z ktorego czytam parametry
         if (oldion.eq.0) then
              if (.not.allocated(icharge)) then ! this mean you are oprating in old sc-sc mode
@@ -3287,16 +3464,16 @@
              else
               read(iion,*) ijunk
              endif
-
+            print *,ntyp_molec(5)
              do i=1,ntyp_molec(5)
               read(iion,*) msc(i,5),restok(i,5),ichargecat(i)
               print *,msc(i,5),restok(i,5)
              enddo
              ip(5)=0.2
             ! mp(5)=0.2
-           ! pstok(5)=1.0
+             pstok(5)=3.0
  !DIR$ NOUNROLL 
-      do j=1,ntyp_molec(5)
+      do j=1,ntyp_molec(5)-1 ! this is without Zn will be modified for ALL tranistion metals
         do i=1,ntyp
  !       do j=1,ntyp_molec(5)
  !        write (*,*) "Im in ALAB", i, " ", j
@@ -3369,7 +3546,7 @@
         enddo
  
         do i=1,ntyp
-       do j=1,ntyp_molec(5)
+       do j=1,ntyp_molec(5)-1
        if (i.eq.10) then
        write (iout,*) 'i= ', i, ' j= ', j
        write (iout,*) 'epsi0= ', epscat(i,j)
@@ -3410,8 +3587,37 @@
         enddo
  
        endif
-
-      
+! read number of Zn2+
+! here two denotes the Zn2+ and Cu2+
+      write(iout,*) "before TRANPARM"
+      allocate(aomicattr(0:3,2))
+      allocate(athetacattran(0:6,5,2))
+      allocate(agamacattran(3,5,2))
+      allocate(acatshiftdsc(5,2))
+      allocate(bcatshiftdsc(5,2))
+      allocate(demorsecat(5,2))
+      allocate(alphamorsecat(5,2))
+      allocate(x0catleft(5,2))
+      allocate(x0catright(5,2))
+      allocate(x0cattrans(5,2))
+      allocate(ntrantyp(2))
+      do i=1,1 ! currently only Zn2+
+
+      read(iiontran,*) ntrantyp(i)
+!ntrantyp=4
+!| ao0 ao1 ao2 ao3
+!ASP| a1 a2 a3 aa0 aa1 aa2 aa3 aa4 aa5 aa6 ad bd De alpha x0 -1 -.5
+!CYS| a1 a2 a3 aa0 aa1 aa2 aa3 aa4 aa5 aa6 ad bd De alpha x0left x0right x0transi
+!GLU| a1 a2 a3 aa0 aa1 aa2 aa3 aa4 aa5 aa6 ad bd De alpha x0 -1 -0.5
+!HIS| a1 a2 a3 aa0 aa1 aa2 aa3 aa4 aa5 aa6 ad bd De alpha x0 -1 -.5
+      read(iiontran,*) (aomicattr(j,i),j=0,3)
+      do j=1,ntrantyp(i)
+       read (iiontran,*,err=123,end=123) (agamacattran(k,j,i),k=1,3),&
+       (athetacattran(k,j,i),k=0,6),acatshiftdsc(j,i),bcatshiftdsc(j,i),&
+       demorsecat(j,i),alphamorsecat(j,i),x0catleft(j,i),x0catright(j,i),&
+       x0cattrans(j,i)
+      enddo 
+      enddo
        if(me.eq.king) then
        write (iout,'(/a)') "Disulfide bridge parameters:"
        write (iout,'(a,f10.2)') 'S-S bridge energy: ',ebr
@@ -3466,6 +3672,8 @@
    119 write (iout,*) "Error reading SCCOR parameters"
        go to 999
    121 write (iout,*) "Error in Czybyshev parameters"
+      go to 999
+  123 write(iout,*) "Error in transition metal parameters"
    999 continue
  #ifdef MPI
        call MPI_Finalize(Ierror)
@@ -3603,6 +3811,7 @@
            itype(ires_old,molecule)=ntyp1_molec(molecule)
            itype(ires_old-1,molecule)=ntyp1_molec(molecule)
            nres_molec(molecule)=nres_molec(molecule)+2
+!          if (molecule.eq.4) ires=ires+2
            ibeg=2
  !          write (iout,*) "Chain ended",ires,ishift,ires_old
            if (unres_pdb) then
@@ -3614,6 +3823,13 @@
  !          iii=0
            endif
            iii=0
+        else if (card(:3).eq.'BRA') then
+         molecule=4
+          ires=ires+1
+          ires_old=ires+1
+          itype(ires,molecule)=ntyp1_molec(molecule)-1
+          nres_molec(molecule)=nres_molec(molecule)+1
+        
          endif
  ! Read free energy
          if (index(card,"FREE ENERGY").gt.0) read(card(35:),*) efree_temp
@@ -3625,6 +3841,31 @@
            read (card(12:16),*) atom
  !          write (iout,*) "! ",atom," !",ires
  !          if (atom.eq.'CA' .or. atom.eq.'CH3') then
+         if (card(14:16).eq.'LIP') then
+! reading lipid
+          if (ibeg.eq.1) then
+          molecule=4
+          ires=ires+1
+                nres_molec(molecule)=nres_molec(molecule)+1
+                   itype(ires,molecule)=ntyp1_molec(molecule)
+          ibeg=0
+          endif
+         if (ibeg.eq.2) then
+         ibeg=0
+         ires=ires+2 
+         endif
+
+          molecule=4 
+                nres_molec(molecule)=nres_molec(molecule)+1
+          read (card(18:20),'(a3)') res
+          ires=ires+1
+          read(card(31:54),'(3f8.3)') (c(j,ires),j=1,3)
+          if (UNRES_PDB) then!
+              itype(ires,molecule)=rescode(ires,res,0,molecule)
+          else
+             itype(ires,molecule)=rescode_lip(res,ires)
+          endif
+         else 
            read (card(23:26),*) ires
            read (card(18:20),'(a3)') res
  !          write (iout,*) "ires",ires,ires-ishift+ishift1,
@@ -3788,6 +4029,7 @@
              read(card(31:54),'(3f8.3)') (sccor(j,iii),j=1,3)
                endif
            endif
+          endif !LIP
  !         print *,"IONS",ions,card(1:6)
          else if ((ions).and.(card(1:6).eq.'HETATM')) then
         if (firstion.eq.0) then 
@@ -3805,7 +4047,7 @@
            read (card(18:20),'(a3)') res
            if ((atom(1:2).eq.'NA').or.(atom(1:2).eq.'CL').or.&
            (atom(1:2).eq.'CA').or.(atom(1:2).eq.'MG')           &
-          .or.(atom(1:2).eq.'K ')) &
+          .or.(atom(1:2).eq.'K '.or.(atom(1:2).eq.'ZN'))) &
            then
             ires=ires+1
             if (molecule.ne.5) molecprev=molecule
@@ -3921,6 +4163,7 @@
  !      print *,"molecule",molecule
        if ((itype(nres,1).ne.10)) then
          nres=nres+1
+        nsup=nsup+1
            if (molecule.eq.5) molecule=molecprev
          itype(nres,molecule)=ntyp1_molec(molecule)
          nres_molec(molecule)=nres_molec(molecule)+1
@@ -4078,7 +4321,6 @@
            do j=1,3
            c_temporary(j,seqalingbegin)=c(j,i)
            c_temporary(j,seqalingbegin+nres)=c(j,i+nres)
-
            enddo
            itype_temporary(seqalingbegin,k)=itype(i,k)
            print *,i,k,itype(i,k),itype_temporary(seqalingbegin,k),seqalingbegin
@@ -4091,6 +4333,9 @@
         do i=1,2*nres
          do j=1,3
          c(j,i)=c_temporary(j,i)
+        if (i.gt.nres) then
+        if ((molnum(i-nres).eq.4)) c(j,i)=0.0d0
+        endif
          enddo
         enddo
         do k=1,5
@@ -4472,7 +4717,11 @@
        call reada(controlcard,"R_CUT_ELE",r_cut_ele,25.0d0)
        call reada(controlcard,"LAMBDA_ELE",rlamb_ele,0.3d0)
        write(iout,*) "R_CUT_ELE=",r_cut_ele
-! Lipidic parameters
+      call reada(controlcard,"R_CUT_MART",r_cut_mart,15.0d0)
+      call reada(controlcard,"LAMBDA_MART",rlamb_mart,0.3d0)
+      call reada(controlcard,"R_CUT_ANG",r_cut_ang,4.2d0)
+
+! Lipidec parameters
        call reada(controlcard,"LIPTHICK",lipthick,0.0d0)
        call reada(controlcard,"LIPAQBUF",lipbufthick,0.0d0)
        if (lipthick.gt.0.0d0) then
@@ -4709,7 +4958,7 @@
  !
  ! Read MD settings
  !
-      use control_data, only: r_cut,rlamb,out1file
+      use control_data, only: r_cut,rlamb,out1file,r_cut_mart,rlamb_mart
        use energy_data
        use geometry_data, only: pi
        use MPI_data
@@ -4865,14 +5114,17 @@
          enddo
  
          if(me.eq.king.or..not.out1file)then
+         do j=1,5
           write (iout,'(/2a/)') &
           "Radii of site types and friction coefficients and std's of",&
           " stochastic forces of fully exposed sites"
-         write (iout,'(a5,f5.2,2f10.5)')'p',pstok,gamp(1),stdfp*dsqrt(gamp(1))
+         write (iout,'(a5,f5.2,2f10.5)')'p',pstok,gamp(j),stdfp*dsqrt(gamp(j))
+        
           do i=1,ntyp
-          write (iout,'(a5,f5.2,2f10.5)') restyp(i,1),restok(i,1),&
-           gamsc(i,1),stdfsc(i,1)*dsqrt(gamsc(i,1))
+          write (iout,'(a5,f5.2,2f10.5)') restyp(i,j),restok(i,j),&
+           gamsc(i,j),stdfsc(i,j)*dsqrt(gamsc(i,j))
           enddo
+        enddo
          endif
        else if (tbf) then
          if(me.eq.king.or..not.out1file)then
@@ -5316,7 +5568,8 @@
        open (itube,file=tubename,status='old',action='read')
        call getenv_loc('IONPAR',ionname)
        open (iion,file=ionname,status='old',action='read')
-
+      call getenv_loc('IONPAR_TRAN',iontranname)
+      open (iiontran,file=iontranname,status='old',action='read')
  !      print *,"Processor",myrank," opened file ISIDEP" 
  !      print *,"Processor",myrank," opened parameter files" 
  #elif (defined G77)
@@ -5364,6 +5617,8 @@
        open (iion,file=ionname,status='old')
        call getenv_loc('IONPAR_NUCL',ionnuclname)
        open (iionnucl,file=ionnuclname,status='old')
+      call getenv_loc('IONPAR_TRAN',iontranname)
+      open (iiontran,file=iontranname,status='old')
  #else
        open(1,file=pref_orig(:ilen(pref_orig))//'.inp',status='old',&
          readonly)
@@ -5419,12 +5674,19 @@
  
        call getenv_loc('LIPTRANPAR',liptranname)
        open (iliptranpar,file=liptranname,status='old',action='read')
+      call getenv_loc('LIPBOND',lipbondname)
+      open (ilipbond,file=lipbondname,status='old',action='read')
+      call getenv_loc('LIPNONBOND',lipnonbondname)
+      open (ilipnonbond,file=lipnonbondname,status='old',action='read')
        call getenv_loc('TUBEPAR',tubename)
        open (itube,file=tubename,status='old',action='read')
        call getenv_loc('IONPAR',ionname)
        open (iion,file=ionname,status='old',action='read')
        call getenv_loc('IONPAR_NUCL',ionnuclname)
        open (iionnucl,file=ionnuclname,status='old',action='read')
+      call getenv_loc('IONPAR_TRAN',iontranname)
+      open (iiontran,file=iontranname,status='old',action='read')
+
  
  #ifndef CRYST_SC
        call getenv_loc('ROTPARPDB',rotname_pdb)
diff --git a/source/unres/unres.F90 b/source/unres/unres.F90

index 4a8e7a6..2946b66 100644 (file)
--- a/source/unres/unres.F90
+++ b/source/unres/unres.F90
@@ -126,6 +126,7 @@
          call exec_softreg
        else if (modecalc.eq.12) then
          call exec_MD
+        call exec_checkgrad
        else if (modecalc.eq.14) then
          call exec_MREMD
        else
@@ -155,9 +156,10 @@
        subroutine exec_MD
        use MPI_data     !include 'COMMON.SETUP'
        use control_data !include 'COMMON.CONTROL'
-      use geometry, only:chainbuild
+      use geometry, only:chainbuild,chainbuild_cart
        use MDyn
        use io_units     !include 'COMMON.IOUNITS'
+      use compare, only:alloc_compare_arrays
  !      use io_common
        implicit none
  !      include 'DIMENSIONS'
@@ -166,10 +168,15 @@
  #endif
        print *,'Start MD'
        call alloc_MD_arrays
+      call alloc_compare_arrays
        print *,'After MD alloc'
        if (me.eq.king .or. .not. out1file) &
           write (iout,*) "Calling chainbuild"
+      if (extconf) then
        call chainbuild
+      else
+      call chainbuild_cart
+      endif
        call MD
        return
        end subroutine exec_MD
@@ -182,6 +189,7 @@
        use REMD_data     !include 'COMMON.REMD'
        use geometry, only:chainbuild
        use MREMDyn
+      use compare, only:alloc_compare_arrays
  
        implicit none
  !      include 'DIMENSIONS'
@@ -192,7 +200,7 @@
        integer :: i
        call alloc_MD_arrays
        call alloc_MREMD_arrays
-
+      call alloc_compare_arrays
  !     if (me.eq.king .or. .not. out1file) &
  !         write (iout,*) "Calling chainbuild"
  !      call chainbuild
diff --git a/source/wham/CMakeLists.txt b/source/wham/CMakeLists.txt

index 803755a..f9bd6a4 100644 (file)
--- a/source/wham/CMakeLists.txt
+++ b/source/wham/CMakeLists.txt
@@ -52,13 +52,13 @@ set(UNRES_WHAM_SRC0
  if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
    set (CMAKE_Fortran_FLAGS_RELEASE " -CB -g")
    set (CMAKE_Fortran_FLAGS_DEBUG   "-O0 -g -traceback")
-  set(FFLAGS0 "-fpp -mcmodel=medium -shared-intel  " ) 
+  set(FFLAGS0 "-fpp -mcmodel=large -shared-intel  " ) 
  elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
-  set(FFLAGS0 "-fpp -std=legacy -mcmodel=medium -g ")
+  set(FFLAGS0 "-fpp -std=legacy -mcmodel=large -g ")
  elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "pgF90")
    set(FFLAGS0 "-fpp -mcmodel=medium -Mlarge_arrays ")
  else ()
-  set(FFLAGS0 "-fpp -g -mcmodel=medium " )
+  set(FFLAGS0 "-fpp -g -mcmodel=large " )
  endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  
  
diff --git a/source/wham/enecalc.F90 b/source/wham/enecalc.F90

index d0bd838..cdec63a 100644 (file)
--- a/source/wham/enecalc.F90
+++ b/source/wham/enecalc.F90
@@ -405,7 +405,7 @@ write(iout,*)"enecalc_ i ntot",i,ntot
              endif
            endif
            potE(iii+1,iparm)=energia(0)
-          do k=1,50
+          do k=1,max_ene
              enetb(k,iii+1,iparm)=energia(k)
            enddo
  !           write (iout,'(2i5,21f8.2)') "debug",k,iii+1,(enetb(k,iii+1,iparm),k=1,21)
@@ -1231,7 +1231,10 @@ write(iout,*)"end of store_parm"
              eello_turn6,eel_loc,edihcnstr,etors_d,estr,evdw2_14,esccor,tt, &
              ecation_prot, ecationcation,evdwpp,eespp,evdwpsb,eelpsb,evdwsb, &
              eelsb,estr_nucl,ebe_nucl,esbloc,etors_nucl,etors_d_nucl,&
-            ecorr_nucl,ecorr3_nucl,escbase, epepbase,escpho, epeppho,ecation_nucl
+            ecorr_nucl,ecorr3_nucl,escbase, epepbase,escpho, epeppho,ecation_nucl,&
+            elipbond,elipang,eliplj,elipelec,ecat_prottran,ecation_protang, &
+            eliptran
+
  
        integer :: i,ii,ik,iproc,iscor,j,k,l,ib,iparm,iprot,nlist
        real(kind=8) :: qfree,sumprob,eini,efree,rmsdev
@@ -1402,6 +1405,13 @@ write(iout,*)"end of store_parm"
              epepbase=  enetb(47,i,iparm)
              escbase=   enetb(46,i,iparm)
              ecation_nucl=enetb(50,i,iparm)
+            elipbond=enetb(52,i,iparm)
+            elipang=enetb(53,i,iparm)
+            eliplj=enetb(54,i,iparm)
+            elipelec=enetb(55,i,iparm)
+            ecat_prottran=enetb(56,i,iparm)
+            ecation_protang=enetb(57,i,iparm)
+            eliptran=enetb(22,i,iparm)
  !      wscbase=ww(46)
  !      wpepbase=ww(47)
  !      wscpho=ww(48)
@@ -1445,7 +1455,10 @@ write(iout,*)"end of store_parm"
              +wtor_d_nucl*etors_d_nucl+wcorr_nucl*ecorr_nucl+wcorr3_nucl*ecorr3_nucl&
              +wscbase*escbase&
              +wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho&
-            +wcatnucl*ecation_nucl
+            +wcatnucl*ecation_nucl&
+            +elipbond+elipang+eliplj+elipelec+wcat_tran*ecat_prottran+ecation_protang+&
+             wliptran*eliptran
+
  
  #else
              etot=wsc*evdw+wscp*evdw2 &
@@ -1463,7 +1476,11 @@ write(iout,*)"end of store_parm"
              +wtor_d_nucl*etors_d_nucl+wcorr_nucl*ecorr_nucl+wcorr3_nucl*ecorr3_nucl&
              +wscbase*escbase&
              +wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho&
-            +wcatnucl*ecation_nucl
+            +wcatnucl*ecation_nucl&
+            +elipbond+elipang+eliplj+elipelec+wcat_tran*ecat_prottran+ecation_protang&
+            +wliptran*eliptran
+
+
  
  #endif
  
diff --git a/source/wham/io_database.F90 b/source/wham/io_database.F90

index c28ad78..41deaff 100644 (file)
--- a/source/wham/io_database.F90
+++ b/source/wham/io_database.F90
@@ -543,6 +543,7 @@ write(iout,*) "end of read database"
  #else
        print *,"before xdrf3dcoord"
        call xdrf3dfcoord(ixdrf, xoord, itmp, prec, iret)
+      print *,"after xdrf3dcoord", iret
  #endif
  #ifdef DEBUG
        write (iout,'(10f8.3)') ((xoord(j,i),j=1,3),i=1,2*nres+2)
@@ -1501,6 +1502,11 @@ write(iout,*) "end of read database"
          endif
        enddo
        do j=3,nres
+        mnum=molnum(j)
+        itj=itype(j,mnum)
+        if (itype(j,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) cycle
+        if (itype(j-1,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) cycle
+        if (itype(j-2,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) cycle
          if (theta(j).le.0.0d0) then
            if (iprint.gt.0) &
            write (iout,*) "Zero theta angle(s) in conformation",ii
diff --git a/source/wham/io_wham.F90 b/source/wham/io_wham.F90

index fee1e46..c2049de 100644 (file)
--- a/source/wham/io_wham.F90
+++ b/source/wham/io_wham.F90
@@ -100,6 +100,8 @@
        open (iscpp_nucl,file=scpname_nucl,status='old')
        call mygetenv('IONPAR_NUCL',ionnuclname)
        open (iionnucl,file=ionnuclname,status='old')
+      call mygetenv('IONPAR_TRAN',iontranname)
+      open (iiontran,file=iontranname,status='old',action='read')
  
  
  #ifndef OLDSCP
@@ -464,7 +466,7 @@
        call reada(controlcard,"DTRISS",dtriss,1.001D0)
        call reada(controlcard,"SSSCALE",ssscale,1.0D0)
        dyn_ss=(index(controlcard,'DYN_SS').gt.0)
-
+      call reada(controlcard,"LIPSCALE",lipscale,1.0D0)
  allocate(ww(max_eneW))
        do i=1,n_eneW
          key = wname(i)(:ilen(wname(i)))
@@ -517,6 +519,7 @@ allocate(ww(max_eneW))
        wscpho=ww(48)
        wpeppho=ww(49)
        wcatnucl=ww(50)
+      wcat_tran=ww(56)
  !      print *,"KURWA",ww(48)
  !        "WSCBASE   ","WPEPBASE  ","WSCPHO    ","WPEPPHO   "
  !        "WVDWPP    ","WELPP     ","WVDWPSB   ","WELPSB    ","WVDWSB    ",&
@@ -574,6 +577,7 @@ allocate(ww(max_eneW))
        weights(48) =wscpho
        weights(49) =wpeppho
        weights(50) =wcatnucl
+      weights(56)=wcat_tran
  
  ! el--------
        call card_concat(controlcard,.false.)
@@ -2764,7 +2768,7 @@ allocate(ww(max_eneW))
              enddo
              ip(5)=0.2
  !DIR$ NOUNROLL 
-      do j=1,ntyp_molec(5)
+      do j=1,ntyp_molec(5)-1
         do i=1,ntyp
  !       do j=1,ntyp_molec(5)
  !        write (*,*) "Im in ALAB", i, " ", j
@@ -2792,7 +2796,7 @@ allocate(ww(max_eneW))
        END DO
        allocate(aa_aq_cat(-ntyp:ntyp,ntyp),bb_aq_cat(-ntyp:ntyp,ntyp))
        do i=1,ntyp
-        do j=1,ntyp_molec(5)
+        do j=1,ntyp_molec(5)-1 !without zinc
            epsij=epscat(i,j)
            rrij=sigmacat(i,j)
            rrij=rrij**expon
@@ -2844,7 +2848,36 @@ allocate(ww(max_eneW))
         enddo
  
        endif
-
+! here two denotes the Zn2+ and Cu2+
+      write(iout,*) "before TRANPARM"
+      allocate(aomicattr(0:3,2))
+      allocate(athetacattran(0:6,5,2))
+      allocate(agamacattran(3,5,2))
+      allocate(acatshiftdsc(5,2))
+      allocate(bcatshiftdsc(5,2))
+      allocate(demorsecat(5,2))
+      allocate(alphamorsecat(5,2))
+      allocate(x0catleft(5,2))
+      allocate(x0catright(5,2))
+      allocate(x0cattrans(5,2))
+      allocate(ntrantyp(2))
+      do i=1,1 ! currently only Zn2+
+
+      read(iiontran,*) ntrantyp(i)
+!ntrantyp=4
+!| ao0 ao1 ao2 ao3
+!ASP| a1 a2 a3 aa0 aa1 aa2 aa3 aa4 aa5 aa6 ad bd De alpha x0 -1 -.5
+!CYS| a1 a2 a3 aa0 aa1 aa2 aa3 aa4 aa5 aa6 ad bd De alpha x0left x0right x0transi
+!GLU| a1 a2 a3 aa0 aa1 aa2 aa3 aa4 aa5 aa6 ad bd De alpha x0 -1 -0.5
+!HIS| a1 a2 a3 aa0 aa1 aa2 aa3 aa4 aa5 aa6 ad bd De alpha x0 -1 -.5
+      read(iiontran,*) (aomicattr(j,i),j=0,3)
+      do j=1,ntrantyp(i)
+       read (iiontran,*) (agamacattran(k,j,i),k=1,3),&
+       (athetacattran(k,j,i),k=0,6),acatshiftdsc(j,i),bcatshiftdsc(j,i),&
+       demorsecat(j,i),alphamorsecat(j,i),x0catleft(j,i),x0catright(j,i),&
+       x0cattrans(j,i)
+      enddo
+      enddo
  #ifdef CLUSTER
  !
  ! Define the SC-p interaction constants
@@ -3077,11 +3110,13 @@ allocate(ww(max_eneW))
        subroutine read_general_data(*)
  
        use control_data, only:indpdb,symetr,r_cut_ele,rlamb_ele,ions,&
-          scelemode,TUBEmode,tor_mode,energy_dec
+          scelemode,TUBEmode,tor_mode,energy_dec,r_cut_ang,r_cut_mart,&
+          rlamb_mart
           
        use energy_data, only:distchainmax,tubeR0,tubecenter,dyn_ss
        use geometry_data, only:boxxsize,boxysize,boxzsize,bordtubetop,&
-          bordtubebot,tubebufthick,buftubebot,buftubetop
+          bordtubebot,tubebufthick,buftubebot,buftubetop,buflipbot, bufliptop,bordlipbot,bordliptop,     &
+        lipbufthick,lipthick
  !      implicit none
  !      include "DIMENSIONS"
  !      include "DIMENSIONS.ZSCOPT"
@@ -3100,6 +3135,7 @@ allocate(ww(max_eneW))
  !      include "COMMON.FREE"
  !      include "COMMON.CONTROL"
  !      include "COMMON.ENERGIES"
+       
        character(len=800) :: controlcard
        integer :: i,j,k,ii,n_ene_found
        integer :: ind,itype1,itype2,itypf,itypsc,itypp
@@ -3161,6 +3197,23 @@ allocate(ww(max_eneW))
        call reada(controlcard,'BOXX',boxxsize,100.0d0)
        call reada(controlcard,'BOXY',boxysize,100.0d0)
        call reada(controlcard,'BOXZ',boxzsize,100.0d0)
+      call reada(controlcard,"LIPTHICK",lipthick,0.0d0)
+      call reada(controlcard,"LIPAQBUF",lipbufthick,0.0d0)
+      if (lipthick.gt.0.0d0) then
+       bordliptop=(boxzsize+lipthick)/2.0
+       bordlipbot=bordliptop-lipthick
+      if ((bordliptop.gt.boxzsize).or.(bordlipbot.lt.0.0)) &
+      write(iout,*) "WARNING WRONG SIZE OF LIPIDIC PHASE"
+      buflipbot=bordlipbot+lipbufthick
+      bufliptop=bordliptop-lipbufthick
+      if ((lipbufthick*2.0d0).gt.lipthick) &
+       write(iout,*) "WARNING WRONG SIZE OF LIP AQ BUF"
+      endif !lipthick.gt.0
+      write(iout,*) "bordliptop=",bordliptop
+      write(iout,*) "bordlipbot=",bordlipbot
+      write(iout,*) "bufliptop=",bufliptop
+      write(iout,*) "buflipbot=",buflipbot
+
        energy_dec=(index(controlcard,'ENERGY_DEC').gt.0)
        call readi(controlcard,"SCELEMODE",scelemode,0)
        call readi(controlcard,"OLDION",oldion,0)
@@ -3187,6 +3240,9 @@ allocate(ww(max_eneW))
        call reada(controlcard,"R_CUT_ELE",r_cut_ele,25.0d0)
        call reada(controlcard,"LAMBDA_ELE",rlamb_ele,0.3d0)
        write(iout,*) "R_CUT_ELE=",r_cut_ele
+      call reada(controlcard,"R_CUT_MART",r_cut_mart,15.0d0)
+      call reada(controlcard,"LAMBDA_MART",rlamb_mart,0.3d0)
+      call reada(controlcard,"R_CUT_ANG",r_cut_ang,4.2d0)
        check_conf=index(controlcard,"NO_CHECK_CONF").eq.0
        call reada(controlcard,'DISTCHAINMAX',distchainmax,50.0d0)
        call readi(controlcard,'SYM',symetr,1)
@@ -3939,8 +3995,8 @@ allocate(ww(max_eneW))
        do i=nnt,nct
          mnum=molnum(i)
          iti=itype(i,mnum)
-        if (iti.eq.ntyp1) then
-          if (itype(i-1,molnum(i-1)).eq.ntyp1) then
+        if (iti.eq.ntyp1_molec(mnum)) then
+          if (itype(i-1,molnum(i-1)).eq.ntyp1_molec(mnum)) then
            ichain=ichain+1
            ires=0
            write (ipdb,'(a)') 'TER'
@@ -3969,7 +4025,7 @@ allocate(ww(max_eneW))
        write (ipdb,'(a)') 'TER'
        do i=nnt,nct-1
          mnum=molnum(i)
-        if (itype(i,mnum).eq.ntyp1) cycle
+        if (itype(i,mnum).eq.ntyp1_molec(mnum)) cycle
          if (itype(i,mnum).eq.10 .and. itype(i+1,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)) then
            write (ipdb,30) ica(i),ica(i+1)
          else if (itype(i,mnum).ne.10 .and. itype(i+1,mnum).ne.ntyp1_molec(mnum)) then
diff --git a/source/wham/wham_calc.F90 b/source/wham/wham_calc.F90

index 102e8e4..497ba0c 100644 (file)
--- a/source/wham/wham_calc.F90
+++ b/source/wham/wham_calc.F90
@@ -107,7 +107,9 @@
          eello_turn6,eel_loc,edihcnstr,etors_d,estr,evdw2_14,esccor, &
          ecationcation,ecation_prot, evdwpp,eespp ,evdwpsb,eelpsb, &
          evdwsb, eelsb, estr_nucl,ebe_nucl,esbloc,etors_nucl,etors_d_nucl,&
-        ecorr_nucl, ecorr3_nucl,epeppho, escpho, epepbase,escbase,ecation_nucl
+        ecorr_nucl, ecorr3_nucl,epeppho, escpho, epepbase,escbase,ecation_nucl,&
+        elipbond,elipang,eliplj,elipelec,ecat_prottran,ecation_protang,eliptran
+
  
  
        integer :: ind_point(maxpoint),upindE,indE
@@ -374,6 +376,13 @@
              epepbase=  enetb(47,i,iparm)
              escbase=   enetb(46,i,iparm)
              ecation_nucl= enetb(50,i,iparm)
+            elipbond=enetb(52,i,iparm)
+            elipang=enetb(53,i,iparm)
+            eliplj=enetb(54,i,iparm)
+            elipelec=enetb(55,i,iparm)
+            ecat_prottran=enetb(56,i,iparm)
+            ecation_protang=enetb(57,i,iparm)
+            eliptran=enetb(22,i,iparm)
  #ifdef DEBUG
              write (iout,'(3i5,6f5.2,15f12.3)') i,ib,iparm,(ft(l),l=1,6),&
               evdw+evdw_t,evdw2,ees,evdw1,ecorr,eel_loc,estr,ebe,escloc,&
@@ -417,8 +426,9 @@
              +wvdwsb*evdwsb+welsb*eelsb+wsbloc*esbloc+wtor_nucl*etors_nucl&
              +wtor_d_nucl*etors_d_nucl+wcorr_nucl*ecorr_nucl+wcorr3_nucl*ecorr3_nucl&
              +wscbase*escbase&
-            +wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+wcatnucl*ecation_nucl
-
+            +wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+wcatnucl*ecation_nucl&
+            +elipbond+elipang+eliplj+elipelec+wcat_tran*ecat_prottran+ecation_protang&
+            +wliptran*eliptran
  
  
  #else
@@ -436,7 +446,10 @@
              +wvdwsb*evdwsb+welsb*eelsb+wsbloc*esbloc+wtor_nucl*etors_nucl&
              +wtor_d_nucl*etors_d_nucl+wcorr_nucl*ecorr_nucl+wcorr3_nucl*ecorr3_nucl&
              +wscbase*escbase&
-            +wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+wcatnucl*ecation_nucl
+            +wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+wcatnucl*ecation_nucl&
+            +elipbond+elipang+eliplj+elipelec+wcat_tran*ecat_prottran+ecation_protang&
+            +wliptran*eliptran
+
  
  
  
@@ -807,6 +820,13 @@
              epepbase=  enetb(47,i,iparm)
              escbase=   enetb(46,i,iparm)
              ecation_nucl=enetb(50,i,iparm)
+            elipbond=enetb(52,i,iparm)
+            elipang=enetb(53,i,iparm)
+            eliplj=enetb(54,i,iparm)
+            elipelec=enetb(55,i,iparm)
+            ecat_prottran=enetb(56,i,iparm)
+            ecation_protang=enetb(57,i,iparm)
+            eliptran=enetb(22,i,iparm)
  #ifdef SPLITELE
              etot=wsc*(evdw+ft(6)*evdw_t)+wscp*evdw2+ft(1)*welec*ees &
              +wvdwpp*evdw1 &
@@ -823,7 +843,10 @@
              *ft(1)+wtor_d_nucl*ft(2)*etors_d_nucl+wcorr_nucl*ecorr_nucl &
              +wcorr3_nucl*ecorr3_nucl&
              +wscbase*escbase&
-            +ft(1)*wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+ wcatnucl*ecation_nucl
+            +ft(1)*wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+ wcatnucl*ecation_nucl&
+            +elipbond+elipang+eliplj+elipelec+wcat_tran*ecat_prottran+ecation_protang&
+            +wliptran*eliptran
+
  
  #else
              etot=wsc*(evdw+ft(6)*evdw_t)+wscp*evdw2 &
@@ -841,7 +864,10 @@
              *ft(1)+wtor_d_nucl*ft(2)*etors_d_nucl+wcorr_nucl*ecorr_nucl &
              +wcorr3_nucl*ecorr3_nucl&
              +wscbase*escbase&
-            +ft(1)*wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+ wcatnucl*ecation_nucl
+            +ft(1)*wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho+ wcatnucl*ecation_nucl&
+            +elipbond+elipang+eliplj+elipelec+wcat_tran*ecat_prottran+ecation_protang&
+            +wliptran*eliptran
+
  
  
  #endif
@@ -1095,7 +1121,13 @@
              epepbase=  enetb(47,t,iparm)
              escbase=   enetb(46,t,iparm)
              ecation_nucl=enetb(50,t,iparm)
-
+            elipbond=enetb(52,t,iparm)
+            elipang=enetb(53,t,iparm)
+            eliplj=enetb(54,t,iparm)
+            elipelec=enetb(55,t,iparm)
+            ecat_prottran=enetb(56,t,iparm)
+            ecation_protang=enetb(57,t,iparm)
+            eliptran=enetb(22,t,iparm)
            do k=0,nGridT
              betaT=startGridT+k*delta_T
              temper=betaT
@@ -1194,7 +1226,10 @@
              +wcorr3_nucl*ecorr3_nucl&
              +wscbase*escbase&
              +ft(1)*wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho &
-            + wcatnucl*ecation_nucl
+            + wcatnucl*ecation_nucl&
+            +elipbond+elipang+eliplj+elipelec+wcat_tran*ecat_prottran+ecation_protang&
+            +wliptran*eliptran
+
  
  
              eprim=ftprim(6)*evdw_t+ftprim(1)*welec*ees &
@@ -1229,7 +1264,10 @@
              +wcorr3_nucl*ecorr3_nucl&
              +wscbase*escbase&
              +ft(1)*wpepbase*epepbase+wscpho*escpho+wpeppho*epeppho&
-            + wcatnucl*ecation_nucl
+            + wcatnucl*ecation_nucl&
+            +elipbond+elipang+eliplj+elipelec+wcat_tran*ecat_prottran+ecation_protang&
+            +wliptran*eliptran
+
  
  
              eprim=ftprim(6)*evdw_t+ftprim(1)*welec*(ees+evdw1) &
diff --git a/source/wham/wham_data.F90 b/source/wham/wham_data.F90

index 38f613a..f308eef 100644 (file)
--- a/source/wham/wham_data.F90
+++ b/source/wham/wham_data.F90
@@ -1,7 +1,7 @@
        module wham_data
  !---------------------------------------------------------------------------
  !---------------------------------------------------------------------------
-      integer,parameter :: max_eneW=50
+      integer,parameter :: max_eneW=57
        integer,parameter :: maxQ=1
        integer,parameter :: maxQ1=MaxQ+2
        integer,parameter :: max_parm=1
diff --git a/source/xdrfpdb/Makefile_ifort b/source/xdrfpdb/Makefile_ifort

index 72bbe83..bc89d8c 100644 (file)
--- a/source/xdrfpdb/Makefile_ifort
+++ b/source/xdrfpdb/Makefile_ifort
@@ -16,9 +16,9 @@
  #
  # 9/23/2010 A. Liwo
  
-#FC=ifort
+FC=ifort
  INSTALL_DIR = /users/software/mpich2-1.4.1p1_intel
-FC= ${INSTALL_DIR}/bin/mpif90
+#FC= ${INSTALL_DIR}/bin/mpif90
  BINDIR = ../../bin
  
  #OPT =  -fast
@@ -26,7 +26,7 @@ OPT = #-CA -CB
  
  FFLAGS = -fpp -c ${OPT} 
  
-CPPFLAGS = -DLINUX -DUNRES -DMP -DMPI -DSPLITELE -DPROCOR -DNEWUNRES -DXDRFPDB
+CPPFLAGS = -DLINUX -DUNRES -DMP -DMPI -DSPLITELE -DPROCOR -DNEWUNRES -DXDRFPDB -CB -g
  
  M4     = m4
  M4FILE = underscore.m4
@@ -51,7 +51,7 @@ xdrf2pdb: ${data} io_base.o xdrf2pdb.o xdrf/libxdrf.a
  #      ${FC} -Bstatic -o ${BINDIR}/xdrf2pdb1-mult xdrf2pdb1.o geomout.o rescode.o misc.o nazwy.o xdrf/libxdrf.a
  
  xdrf2pdb-m: ${data} io_base.o xdrf2pdb-m.o xdrf/libxdrf.a
-       ${FC} -Bstatic -o ${BINDIR}/xdrf2pdb-m-mult ${data} io_base.o xdrf2pdb-m.o xdrf/libxdrf.a
+       ${FC} -Bstatic -o ${BINDIR}/xdrf2pdb-m-mult ${data} io_base.o  xdrf2pdb-m.o  xdrf/libxdrf.a
  
  xdrf2x: ${data2} xdrf2x.o xdrf/libxdrf.a
         ${FC} -o ${BINDIR}/xdrf2x-mult ${data2} xdrf2x.o xdrf/libxdrf.a
@@ -86,3 +86,6 @@ MD_data.o: ${DATA_FILE}/MD_data.F90
  
  io_base.o: ../unres/io_base.F90
         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ../unres/io_base.F90
+geometry.o: ../unres/geometry.F90
+       ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ../unres/geometry.F90
+
diff --git a/source/xdrfpdb/xdrf2pdb-m.F90 b/source/xdrfpdb/xdrf2pdb-m.F90

index 2fed947..f254b25 100644 (file)
--- a/source/xdrfpdb/xdrf2pdb-m.F90
+++ b/source/xdrfpdb/xdrf2pdb-m.F90
@@ -4,15 +4,15 @@
  !      include 'COMMON.CHAIN'
  !      include 'COMMON.INTERACT'
  !      include 'COMMON.SBRIDGE'
-      use geometry_data, only: nres,c,nfrag
-      use energy_data, only: itype,nnt,nct,nss,ihpb,jhpb,uconst_back
+      use geometry_data, only: nres,c,nfrag,boxxsize,boxysize,boxzsize
+      use energy_data, only: itype,nnt,nct,nss,ihpb,jhpb,uconst_back,molnum
        use io_base!, only: maxres,ucase,iblnk,rescode,pdbout
-
+!      use geometry, only: returnbox
        implicit none
        real(kind=4),allocatable,dimension(:,:) :: coord !(3,2*maxres)
        real(kind=4) :: prec,time,potE,uconst,t_bath,qfrag(100)
        real(kind=8) :: etot
-      character(len=80) :: arg,seqfile,pdbfileX
+      character(len=80) :: arg,seqfile,pdbfileX,boxtraj
        character(len=3),allocatable,dimension(:) :: sequenc !(maxres)
        character(len=50) :: tytul
        character(len=8) :: onethree,cfreq,cntraj,citraj
@@ -23,17 +23,19 @@
  !      external rescode
        integer :: i,ii,j,k,kk,is,ie,ifreq,mnum,molec,iext,isize
        integer :: iret,ixdrf,itraj,ntraj
-      
+      print *,"begin program"
+!      if(.not.allocated(molnum)) allocate(molnum(maxres))
        ifreq=1
        nres=0
        mnum=1
        molec=1
        allocate(sequenc(maxres))
+      allocate(molnum(maxres))
        allocate(itype(maxres,5))
-      if (iargc().lt.5) then
+      if (iargc().lt.6) then
          print '(2a)',&
           "Usage: xdrf2pdb-m one/three seqfile cxfile ntraj itraj",&
-         " [pdbfile] [freq]"
+         "boxsize [pdbfile] [freq]"
          stop
        endif
        call getarg(1,onethree)
@@ -60,7 +62,7 @@
            itype(i,mnum)=rescode(i,sequenc(i),1,molec)
          enddo
        else
-        read(1,'(20(a3,1x))',end=11,err=11) (sequenc(i),i=1,maxres)
+        read(1,'(20(a3,i1))',end=11,err=11) (sequenc(i),molnum(i),i=1,maxres)
     11   continue
          nres=i
          i=0
@@ -69,7 +71,7 @@
          enddo 
          nres=i
          do i=1,nres
-          itype(i,mnum)=rescode(i,sequenc(i),0,molec)
+          itype(i,molnum(i))=rescode(i,sequenc(i),0,molnum(i))
          enddo
          print *,nres
          print '(20(a3,1x))',(sequenc(i),i=1,nres)
@@ -84,21 +86,27 @@
        read (cntraj,*) ntraj
        call getarg(5,citraj)
        read (citraj,*) itraj
-      if (iargc().gt.5) then
-        call getarg(6,pdbfileX)
+      call getarg(6,boxtraj)
+      read (boxtraj,*) boxxsize
+      boxysize=boxxsize
+      boxzsize=boxxsize
+      if (iargc().gt.6) then
+        call getarg(7,pdbfileX)
        else
          write(licz,'(bz,i3.3)') itraj
          pdbfileX=arg(:iext)//'_'//licz//'.pdb'
        endif
-      if (iargc().gt.6) then
-        call getarg(7,cfreq)
+      if (iargc().gt.7) then
+        call getarg(8,cfreq)
          read (cfreq,*) ifreq
        endif
  !      print *,"ifreq",ifreq," ntraj",ntraj," itraj",itraj
        open(9,file=pdbfileX)
        nnt = 1
+      mnum=molnum(1)
        if (itype(1,mnum).eq.ntyp1) nnt = 2
        nct=nres
+      mnum=molnum(nct)
        if (itype(nres,mnum).eq.ntyp1) nct = nres-1
        print *,"nnt",nnt," nct",nct
        call xdrfopen(ixdrf,arg, "r", iret)
@@ -133,7 +141,9 @@
  !       write (*,'(e15.8,2e15.5,f12.5,$)') time,potE,uconst,t_bath
  !       write (*,'(i4,$)') nss,(ihpb(j),jhpb(j),j=1,nss)
  !       write (*,'(i4,20f7.4)') nfrag,(qfrag(i),i=1,nfrag)
-!       write (*,'(8f10.5)') ((coord(k,j),k=1,3),j=1,isize)
+       do j=1,isize
+       write (*,'(3f10.5,i3)') (coord(k,j),k=1,3),j
+       enddo
         if (mod(kk/ntraj,ifreq).eq.0 .and. mod(kk,ntraj).eq.itraj) then
           if (isize .ne. nres+nct-nnt+1) then
             print *,"Error: inconsistent sizes",isize,nres+nct-nnt+1
@@ -150,6 +160,7 @@
               c(j,i+nres)=coord(j,ii+nres)
             enddo
           enddo
+         call returnbox
           etot=potE
           write (tytul,'(a,i6)') "Structure",kk
           call pdbout(etot,tytul,9)
@@ -157,3 +168,68 @@
        enddo
       
        end
+      subroutine returnbox
+      use geometry_data, only: nres,c,nfrag,boxxsize,boxysize,boxzsize
+      use energy_data, only: itype,nnt,nct,nss,ihpb,jhpb,uconst_back,molnum
+      use io_base!, only: maxres,ucase,iblnk,rescode,pdbout
+      integer :: allareout,i,j,k,nojumpval,chain_beg,mnum
+      integer :: chain_end,ireturnval
+      real*8 :: difference,xi,boxsize,x,xtemp,box2shift
+
+       do i=1,nres
+         if (molnum(i).eq.5) then
+          c(1,i)=dmod(c(1,i),boxxsize)
+!          if (c(1,i).lt.0) c(1,i)=c(1,i)+boxxsize
+          x=c(1,i)-c(1,2)
+          print *,"return box,before wrap",c(1,i)
+         boxsize=boxxsize
+           xtemp=dmod(x,boxsize)
+      if (dabs(xtemp-boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        box2shift=xtemp-boxsize
+      else if (dabs(xtemp+boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        box2shift=xtemp+boxsize
+      else
+        box2shift=xtemp
+      endif
+          xi=box2shift
+!          print *,c(1,2),xi,xtemp,box2shift
+          c(1,i)=c(1,2)+xi
+          print *,"after",c(1,2),xi,xtemp,box2shift,c(1,i)
+
+          c(2,i)=dmod(c(2,i),boxysize)
+!          if (c(2,i).lt.0) c(2,i)=c(2,i)+boxysize
+          x=c(2,i)-c(2,2)
+         boxsize=boxysize
+           xtemp=dmod(x,boxsize)
+      if (dabs(xtemp-boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        box2shift=xtemp-boxsize
+      else if (dabs(xtemp+boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        box2shift=xtemp+boxsize
+      else
+        box2shift=xtemp
+      endif
+          xi=box2shift
+          c(2,i)=c(2,2)+xi
+!         c(3,i)=dmod(c(3,i),boxzsize)
+          if (c(3,i).lt.0) c(3,i)=c(3,i)+boxzsize
+          x=c(3,i)-c(3,2)
+         boxsize=boxzsize
+           xtemp=dmod(x,boxsize)
+      if (dabs(xtemp-boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        box2shift=xtemp-boxsize
+      else if (dabs(xtemp+boxsize).lt.dabs(xtemp)) then
+        box2shift=xtemp+boxsize
+      else
+        box2shift=xtemp
+      endif
+          xi=box2shift
+          c(3,i)=c(3,2)+xi
+
+          c(1,i+nres)=dmod(c(1,i+nres),boxxsize)
+          c(2,i+nres)=dmod(c(2,i+nres),boxysize)
+          c(3,i+nres)=dmod(c(3,i+nres),boxzsize)
+         endif
+        enddo
+        return
+        end       subroutine returnbox
+
diff --git a/source/xdrfpdb/xdrf2pdb.F90 b/source/xdrfpdb/xdrf2pdb.F90

index f211501..45160f1 100644 (file)
--- a/source/xdrfpdb/xdrf2pdb.F90
+++ b/source/xdrfpdb/xdrf2pdb.F90
@@ -152,7 +152,9 @@
  !       write (*,'(e15.8,2e15.5,f12.5,$)') time,potE,uconst,t_bath
  !       write (*,'(i4,$)') nss,(ihpb(j),jhpb(j),j=1,nss)
  !       write (*,'(i4,20f7.4)') nfrag,(qfrag(i),i=1,nfrag)
-!       write (*,'(8f10.5)') ((coord(k,j),k=1,3),j=1,isize)
+       do j=1,isize
+       write (*,'(3f10.5,i3)') (coord(k,j),k=1,3),j
+       enddo
         if (kk.ge.is .and. mod(kk,ifreq).eq.0) then
           if (isize .ne. nres+nct-nnt+1) then
             print *,"Error: inconsistent sizes",isize,nres+nct-nnt+1
author	Adam Sieradzan <adasko@piasek4.chem.univ.gda.pl>
	Wed, 19 Jan 2022 09:28:05 +0000 (10:28 +0100)
committer	Adam Sieradzan <adasko@piasek4.chem.univ.gda.pl>
	Wed, 19 Jan 2022 09:28:05 +0000 (10:28 +0100)
PARAM/DNA-PROT_scbase.parm.bak		patch \| blob \| history
PARAM/DNA_PROT_pepbase.parm2	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/DNA_PROT_scbase.parm2	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/base-GB-Yi-20110420-corr-thermo-pp.parm	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/base-GB-Yi-adasko-test.parm	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/bond_nucl.parm	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/cation_nucl_param.parm		patch \| blob \| history
PARAM/ions_fin_4_12_20.parm		patch \| blob \| history
PARAM/lipid_LJ_nonbond.parm	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/lipids_bonds_DryMartini.parm	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/lipids_bonds_Martini.parm	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/lipids_dryMARTINI_nonbond.parm	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/nmr.parm	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/rotamers_nucl.parm	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/scparm.adam_12_05_2021	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/scparm.adam_24_08_12021	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/xlinks_parameters.dat	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
PARAM/zn-param	[new file with mode: 0644]	patch \| blob
source/cluster/io_clust.F90		patch \| blob \| history
source/unres/MD.F90		patch \| blob \| history
source/unres/MREMD.F90		patch \| blob \| history
source/unres/REMD.F90		patch \| blob \| history
source/unres/compare.F90		patch \| blob \| history
source/unres/control.F90		patch \| blob \| history
source/unres/data/control_data.F90		patch \| blob \| history
source/unres/data/energy_data.F90		patch \| blob \| history
source/unres/data/io_units.F90		patch \| blob \| history
source/unres/data/names.F90		patch \| blob \| history
source/unres/energy.F90		patch \| blob \| history
source/unres/geometry.F90		patch \| blob \| history
source/unres/io.F90		patch \| blob \| history
source/unres/io_base.F90		patch \| blob \| history
source/unres/io_config.F90		patch \| blob \| history
source/unres/unres.F90		patch \| blob \| history
source/wham/CMakeLists.txt		patch \| blob \| history
source/wham/enecalc.F90		patch \| blob \| history
source/wham/io_database.F90		patch \| blob \| history
source/wham/io_wham.F90		patch \| blob \| history
source/wham/wham_calc.F90		patch \| blob \| history
source/wham/wham_data.F90		patch \| blob \| history
source/xdrfpdb/Makefile_ifort		patch \| blob \| history
source/xdrfpdb/xdrf2pdb-m.F90		patch \| blob \| history
source/xdrfpdb/xdrf2pdb.F90		patch \| blob \| history