X-Git-Url: http://mmka.chem.univ.gda.pl/gitweb/?a=blobdiff_plain;ds=sidebyside;f=qcg%2Fforms.py;h=2798c952a0bb54226d3e1ccb4173859217a8407d;hb=9f0267486fef6a929c431db5cb76a36e2f93ed54;hp=9c804a268348ced7265938e032c15e6be150bd68;hpb=464ad78b761f869b12d38102d08a49b01620faaa;p=qcg-portal.git diff --git a/qcg/forms.py b/qcg/forms.py index 9c804a2..2798c95 100644 --- a/qcg/forms.py +++ b/qcg/forms.py @@ -91,7 +91,8 @@ class JobDescriptionForm(forms.Form): APPLICATION_CHOICES = ( CHOICES_PLACEHOLDER, - ('unres32', 'UNRES 3.2'), + ('unres-gab', 'UNRES GAB'), + ('unres-e0ll2y', 'UNRES E0LL2Y'), ) QUEUE_CHOICES = ( @@ -101,8 +102,7 @@ class JobDescriptionForm(forms.Form): ('plgrid-testing', 'plgrid-testing'), ) MODULES_CHOICES = ( - ('plgrid/apps/python', 'plgrid/apps/python'), - ('plgrid/apps/matlab', 'plgrid/apps/matlab'), + CHOICES_PLACEHOLDER, ) PROTOCOL_CHOICES = ( ('', u'Brak'), @@ -121,14 +121,15 @@ class JobDescriptionForm(forms.Form): dt = forms.DecimalField(label=u"DT", help_text=u"Krok czasowy. Wartość kroku równa jedności to 48.9 fs", max_digits=5, decimal_places=2, min_value=0.01, initial=0.1, required=False) damax = forms.DecimalField(label=u"DAMAX", help_text=u"Maksymalna dopuszczalna zmiana przyspieszenia podczas jednego kroku czasowego", max_digits=5, decimal_places=2, min_value=0.01, initial=1.0, required=False) force_field = forms.ChoiceField(choices=FORCE_FIELD_CHOICES, label=u"Pole siłowe", required=False, initial='GAB') - nrep = forms.IntegerField(label=u"NREP", help_text=u"Liczba replik", min_value=2, initial=16, required=False) - nstex = forms.IntegerField(label=u"NSTEX", help_text=u"Liczba kroków po których następuje wymiana replik", min_value=2, initial=1000, required=False) + pdb_file = forms.CharField(label=u"Plik PDB", max_length=500, required=False) - retmin = forms.IntegerField(label=u"RETMIN", help_text=u"Dolny zakres temparatur dla wymiany replik", min_value=2, initial=250, required=False) - retmax = forms.IntegerField(label=u"RETMAX", help_text=u"Górny zakres temperatur dla wymiany replik", min_value=2, initial=450, required=False) + #retmin = forms.IntegerField(label=u"RETMIN", help_text=u"Dolny zakres temparatur dla wymiany replik", min_value=2, initial=250, required=False) + #retmax = forms.IntegerField(label=u"RETMAX", help_text=u"Górny zakres temperatur dla wymiany replik", min_value=2, initial=450, required=False) + sequence = forms.CharField(label=u"Sekwencja", help_text=u"Sekwencja aminokwasów w zapisie jednoliterowym", widget=forms.Textarea(attrs={'rows': 2, 'cols': 40}), required=False) - application = forms.ChoiceField(choices=APPLICATION_CHOICES, label=u"Aplikacja", required=False, initial='unres32') # TODO choices - master_file = forms.CharField(label=u"Plik główny", max_length=500, required=False) + + application = forms.ChoiceField(choices=APPLICATION_CHOICES, label=u"Aplikacja", required=False, initial='unres-gab') # TODO choices + #master_file = forms.CharField(label=u"Plik główny", max_length=500, required=False) executable = forms.CharField(label=u"Plik wykonywalny", max_length=500, required=False) script = forms.CharField(label=u"Skrypt", widget=forms.Textarea(attrs={'rows': 2, 'cols': 40}), required=False) arguments = forms.MultipleChoiceField(label=u"Argumenty", required=False) @@ -177,17 +178,24 @@ class JobDescriptionForm(forms.Form): self._init_user_choices('arguments', data, initial) self._init_user_choices('native', data, initial) self._init_user_choices('stage_in', data, initial) + self._init_user_choices('force_field', data, initial) def clean(self): data = super(JobDescriptionForm, self).clean() + + force_field = data.get('force_field') + + if force_field == u'GAB': + data['application'] = [u'unres-gab'] + else: + data['application'] = [u'unres-e0ll2y'] - if bool(data['application']) + bool(data['executable']) + bool(data['script']) != 1: - self.add_error(None, u"Dokładnie jedno z następujących pól jest wymagane do uruchomienia zadania: " - u"Aplikacja, Plik wykonywalny lub Skrypt.") - - if data['application'] and not data['master_file']: - self.add_error('master_file', u"W trybie uruchamiania aplikacji należy podać plik główny") + if data['pdb_file']== None: + self.add_error('pdb_file', u"Należy podać plik PDB.") + if data['sequence']== '': + self.add_error('sequence', u"Należy podać sekwencję aminokwasów.") + if data['procs'] and data['nodes']: self.add_error(None, u"Zdefiniuj tylko jedno z pól: liczbę procesów lub topologię węzłów") @@ -241,6 +249,9 @@ class JobDescriptionForm(forms.Form): def clean_pdb_file(self): return self._gsiftp_suffix(self.cleaned_data['pdb_file']) + + def clean_sequence(self): + return self.cleaned_data['sequence'].strip(' \t\n\r') @staticmethod def _gsiftp_suffix(url):