switch for respa, D aminoacids, saxs tutorial, license
[django_unres.git] / django_simple / todo / templates / about.html
index 1bc49fb..62d24d9 100644 (file)
@@ -55,6 +55,14 @@ medium-resolution force field.
 </li>
 
 <li>
+A. Liwo, S. Ołdziej, C. Czaplewski, D. Kleinerman, P. Blood and H.A.
+Scheraga. Implementation of molecular dynamics and its extensions with the
+coarse-grained UNRES force field on massively parallel systems; towards
+millisecond-scale simulations of protein structure, dynamics, and
+thermodynamics. <i>J. Chem. Theory Comput.<i> 2010, 6, 890-909.
+</li>
+
+<li>
 A. Liwo, M. Baranowski, C. Czaplewski, E. Gołaś, Y. He, D. Jagieła, 
 P. Krupa, M. Maciejczyk, M. Makowski, M.A. Mozolewska, A. Niadzvedtski, 
 S. Ołdziej, H.A. Scheraga, A.K. Sieradzan, R. Ślusarz, T. Wirecki, Y. Yin, 
@@ -79,8 +87,44 @@ Protein Structure and Dynamics.
 <i>J. Chem. Inf. Model.</i> 2017, 57, 2364–2377.
 </li>
 
+<li>
+A. Karczyńska, M.A. Mozolewska, P. Krupa, A. Giełdoń, A. Liwo, C.
+Czaplewski.Prediction of protein structure with the coarse-grained UNRES
+force field assisted by small X-ray scattering data and knowledge-based
+information.
+<i>Proteins: Struct. Funct. Bioinf.</i> 2017, CASP12 special issue DOI: 10.1002/prot.25421
+</li>
+
 </ol>
 
+<p>
+License terms of UNRES package implemented in the server
+<ul>
+<li>
+     This software is provided free of charge to academic users, subject to
+     the condition that no part of it be sold or used otherwise for
+     commercial purposes, including, but not limited to its incorporation
+     into commercial software packages, without written consent from the
+     authors. For permission contact Prof. H. A. Scheraga, Cornell
+     University.
+<li>
+     This software package is provided on an "as is" basis. We in no way
+     warrant either this software or results it may produce.
+<li>             
+     Reports or publications using this software package must
+     contain an acknowledgment to the authors and the NIH Resource
+     in the form commonly used in academic research.
+</ul>             
+
+Third party software employed in the server
+<ul> 
+<li> <a href="http://pymol.org"> pymol </a>
+<li> convpdb.pl from <a href="http://www.mmtsb.org/">MMTSB Tool Set</a>
+<li> tleap, sander and ambpdb from <a href="ambermd.org">Amber Tools</a>
+<li> <a href="http://cssb.biology.gatech.edu/PULCHRA"> pulchra </a>
+<li> <a href="http://dunbrack.fccc.edu/scwrl4/"> Scwrl4</a>
+<li> <a href="https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/TM-score/">tmscore</a>
+</ul>
 </div>
 
 </div>