tutorial update, d-amino correction

[django_unres.git] / django_simple / todo / jobfiles.py

diff --git a/django_simple/todo/jobfiles.py b/django_simple/todo/jobfiles.py
index 9284dd3..44cf4a4 100644 (file)
--- a/django_simple/todo/jobfiles.py
+++ b/django_simple/todo/jobfiles.py
@@ -368,6 +368,13 @@ CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000"""
            f2.write(line.replace('$temperatures','"'+" ".join(tmp1)+'" '+str(nreplicas)))
       f1.close()
       f2.close()
+
+      f1 = open('file.seq', 'w')
+      for i in range(0,len(seq),80):
+             f1.write(seq[i:i+80]+'\n')
+      f1.write('\n')       
+      f1.close()
+      
       os.chdir('..')  
 
 # write wham & cluster input