Merge branch 'UCGM' of mmka.chem.univ.gda.pl:unres4 into UCGM

[unres4.git] / PARAM / scparm.adam_30_10_2013

diff --git a/PARAM/scparm.adam_30_10_2013 b/PARAM/scparm.adam_30_10_2013
index 82dacd1..bc11a3a 100644 (file)
--- a/PARAM/scparm.adam_30_10_2013
+++ b/PARAM/scparm.adam_30_10_2013
@@ -132,7 +132,7 @@
 0.000560 6.950 -0.138 -0.017 -0.998 -0.047    2.7000    1.6200    2.1200   13.7000  3.320  5.980  0.060  0.020 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.0000 0.000000 0.29 2.29   0.00   0.00  0.00  0.75  0.00   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000  0.000  0.000 1.00 Asp Gly 
 0.003760 5.730 -0.054  0.189 -0.998  0.123    0.2500   13.0500   11.2200    4.5000  3.490  6.880  0.080  0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 3.180000 3.05 3.82   1.69   1.18  0.00  0.10  0.00   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000  0.000  0.000 1.00 Asp Thr 
 0.000090 7.650 -0.019  0.123 -0.998  0.039    0.3400   12.4100   10.9500    4.5000  3.290  6.180  0.100  0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 2.810000 2.25 3.47   0.00   0.97  0.00  0.75  0.00   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000  0.000  0.000 1.00 Asp Ser 
-0.002110 5.890 -0.026  0.246 -0.998  0.156    0.2200   12.4800   11.4700    4.5000  3.520  6.610  0.030  0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 4.070000 3.04 4.03   0.10   1.00  0.00  0.32  0.00   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000  0.000  0.000 1.00 Asp Gln 
+0.002110 5.890 -0.026  0.246 -0.998  0.156    0.2200   12.4800   11.4700    4.5000  3.520  6.610  0.030  0.100 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.00 0.30 0.00 0.50 0.00 0.0100 4.070000 3.04 4.03   0.10   1.00  0.00  0.32  0.00   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000  0.000  0.000 1.00 Asp Gln !dhead divided by half 
 0.002910 5.530  0.030  0.199 -0.998  0.091    0.2300   12.0100   11.1100    4.5000  3.290  6.180  0.120  0.160 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.60 0.00 0.50 0.00 0.0100 2.900000 2.05 3.03   0.16   1.08  0.00  0.35  0.00   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000  0.000  0.000 1.00 Asp Asn 
 0.917580 3.967  0.083  0.059  0.992  0.395    2.3800    0.9900    1.6900   13.7000  3.500  6.300  0.480 -0.090 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.50 0.00 0.50 0.60 0.0001 4.990000 4.37 0.68   0.00   0.00  0.00  0.04  0.64  79.7000  51.2000  34.5000   4.6000  0.610  0.690 1.00 Asp Glu 
 0.000002 5.549 -0.279 -0.279 -0.990 -0.990    0.0300 -156.3600   15.7600   13.0000  4.440  4.440  0.070  0.070 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.50 0.00 0.50 0.50 0.0009 5.000000 0.34 0.34   0.00   0.00  0.00  0.94  0.94  13.2341  -1.0427   0.0983  33.2754  9.290  0.000 1.00 Asp Asp 
@@ -350,7 +350,7 @@
   0.0347  4.9555 -0.1115  0.4550 -0.8819  0.7342  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.9312  7.0874 -0.1922  0.1141  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.6344  0.0000  0.0000  0.0000  0.5564  0.0531  0.0000  5.0000  0.2736  1.5702  0.0000  0.0000  0.0000  1.1690  0.0000  7.6197  0.1701  1.0347 13.6260  0.0000  1.0000  1.0000
   0.0347  4.9555 -0.1115  0.4550 -0.8819  0.7342  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.9312  7.0874 -0.1922  0.1141  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.6344  0.0000  0.0000  0.0000  0.5564  0.0531  0.0000  5.0000  0.2736  1.5702  0.0000  0.0000  0.0000  1.1690  0.0000  7.6197  0.1701  1.0347 13.6260  0.0000  1.0000  1.0000
   0.4409  7.0124 -0.7792 -0.9026 -0.9824  0.9981  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  4.2163  6.7741 -0.9979 -0.6323  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.2736  0.0000  0.0000  0.0000  6.9619 -0.0105  0.0000  5.0000  0.3624  1.4965  0.0000  0.0000  0.0000  1.5081  0.0000  6.4201  0.1437  0.1181 13.7010  0.0000  1.0000  1.0000
-  1.2808  3.6212  0.2182  0.8105  0.9442 -0.8842  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.8965  3.4196  0.1846  0.7056  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.2281  0.0000  0.0000  0.0000 -0.0631 -0.2997  0.0000  5.0000  1.1189  1.3499  0.0000  0.0000  0.0000  1.3003  0.0000 13.2550 11.0080  0.0349 13.4380  0.0000  1.0000  1.0000  !OThr 1/8 epsilon i +1A sigma
+  1.2808  2.6212  0.2182  0.8105  0.9442 -0.8842  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.8965  3.4196  0.1846  0.7056  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.2281  0.0000  0.0000  0.0000 -0.0631 -0.2997  0.0000  5.0000  1.1189  1.3499  0.0000  0.0000  0.0000  1.3003  0.0000 13.2550 11.0080  0.0349 13.4380  0.0000  1.0000  1.0000  !OThr 1/8 epsilon i 
   0.0354  4.5650  0.4668  0.4668  0.8709  0.8709  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  6.2755  6.2755  0.0232  0.0232  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.0870  0.0000  0.0000  0.0000  0.0538  0.0538  0.0000  5.0000  1.7567  1.7567  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  7.6397  0.1745  1.1729 13.6680  0.0000  1.0000  1.0000
   0.1567  4.6094  0.4496  0.1023 -0.9998 -0.1723  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.4369  3.9490 -0.8774  0.3148  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.8745  0.0000  0.0000  0.0000  3.0813  0.2333  0.0000  5.0000  1.8847  2.0403  0.0000  0.0000  0.0000  1.7847  0.0000 12.0140  7.4670  6.1026 13.6260  0.0000  1.0000  1.0000
   0.6738  4.5858 -0.0217  0.3581 -0.9436  0.8502  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.1814  5.1114 -0.9830 -0.9396  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.0907  0.0000  0.0000  0.0000  1.2890  0.1120  0.0000  5.0000  0.4529  1.6272  0.0000  0.0000  0.0000  1.6273  0.0000  7.4321  0.0349  1.5069 13.7270  0.0000  1.0000  1.0000
@@ -366,16 +366,16 @@
   0.1417  4.8884 -0.2926  0.4970 -0.9400  0.8171  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.1872  5.7460 -0.5543  0.2264  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.3365  0.0000  0.0000  0.0000  1.4606  0.4057  0.0000  5.0000  0.5642  1.6707  0.0000  0.0000  0.0000  1.4013  0.0000  7.5552  0.0347  1.2370 13.6970  0.0000  1.0000  1.0000
   0.0940  4.5688 -0.2020  0.4840 -0.9134  0.9551  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.4958  6.3024 -0.8345  0.1499  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.0309  0.0000  0.0000  0.0000  1.5365  0.4282  0.0000  5.0000  0.5823  1.6751  0.0000  0.0000  0.0000  1.3502  0.0000  7.4961  0.0347  1.1008 13.6710  0.0000  1.0000  1.0000
   2.3189  5.8392  0.4300 -0.9999 -0.2172  0.9664 15.8700 12.6080 -0.6907  8.2270  3.9121  7.5361  0.3601 -1.0000  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.1544  0.0000  2.6660  0.0000  0.0058  0.8814  0.0100  5.0000  0.3810  0.3766  0.0000  0.0000  0.0000  0.0775  0.0000  0.5697 14.2080  3.8969 11.2460  3.2164  1.0000  1.0000
-  0.0347  4.6020  0.5833  1.0000  0.3677  0.9991  5.8569 21.0430 16.0120  8.1515  3.2521  6.1059 -0.1580  0.4130  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.9253  0.0000 -0.0017  0.0000  1.1051  0.6858  0.0100  5.0000  0.3810  0.3766  0.0000  0.0000  0.0000  0.3454  0.0000  0.2876  9.1192 13.9850 11.7170  6.2102  1.0000  1.0000 ! THIS LINE MODIFIED
-  4.1279  4.8014  0.6467 -1.0000  0.3064  0.9796 7.9620 12.5980 -0.6847  8.2577  3.5941  6.1286  0.5130 -0.6287  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.8843  0.0000  3.0353  0.0000  0.0045 -1.0018  0.0100  5.0000  0.3810  0.3766  0.0000  0.0000  0.0000  0.1035  0.0000  0.5770 19.6020  6.8981 18.2520  0.8539  1.0000  1.0000 !THIS LINE MODIFIED
-  4.4737  5.4774  0.0181 -0.9999  0.0493  0.9407 17.8620 12.5980 -0.6845  8.2581  4.7768  8.9679 -0.0259 -0.9108  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.6692  0.0000  0.6391  0.0000  0.0137 -3.1452  0.0100  5.0000  0.3810  0.3766  0.0000  0.0000  0.0000  0.0203  0.0000  0.1738 27.9170  0.5064 17.6720  1.9348  1.0000  1.0000
-  3.2875  4.5882  0.7067 -1.0000  0.5922  0.9812 15.8620 12.5980 -0.6847  8.2577  3.7986  6.4772  0.3813 -0.1511  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.4581  0.0000  2.6420  0.0000 -0.0305 -1.8705  0.0100  5.0000  0.3810  0.3766  0.0000  0.0000  0.0000  0.1948  0.0000  0.3185 19.6100  6.8603 18.2340  0.8539  1.0000  1.0000
-  1.4866  3.9380  0.0846  0.4369  0.8657  0.0849  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  4.1170  6.2087  0.3330  0.0081  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.3702  0.0000  0.0000  0.0000  1.2309  0.1579  0.0000  5.0000  0.6976  1.4252  0.0000  0.0000  0.0000  1.5132  0.0000  7.4036  0.0363  0.8952 13.6840  0.0000  1.0000  1.0000
-  0.1567  4.6094  0.4496  0.1023 -0.9998 -0.1723  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.4369  3.9490 -0.8774  0.3148  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.8745  0.0000  0.0000  0.0000  3.0813  0.2333  0.0000  5.0000  1.8847  2.0403  0.0000  0.0000  0.0000  1.7847  0.0000 12.0140  7.4670  6.1026 13.6260  0.0000  1.0000  1.0000
-  0.6738  4.5858 -0.0217  0.3581 -0.9436  0.8502  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.1814  5.1114 -0.9830 -0.9396  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.0907  0.0000  0.0000  0.0000  1.2890  0.1120  0.0000  5.0000  0.4529  1.6272  0.0000  0.0000  0.0000  1.6273  0.0000  7.4321  0.0349  1.5069 13.7270  0.0000  1.0000  1.0000
-  0.0348  4.5057 -0.0451  0.4687 -0.8778  0.8696  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.4849  6.2828 -0.6420  0.0521  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.9028  0.0000  0.0000  0.0000  1.0944 -0.0122  0.0000  5.0000  0.4864  1.6491  0.0000  0.0000  0.0000  1.4593  0.0000  7.6639  0.2351  1.2506 13.6680  0.0000  1.0000  1.0000
-  0.0348  4.5057 -0.0451  0.4687 -0.8778  0.8696  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.4849  6.2828 -0.6420  0.0521  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.9028  0.0000  0.0000  0.0000  1.0944 -0.0122  0.0000  5.0000  0.4864  1.6491  0.0000  0.0000  0.0000  1.4593  0.0000  7.6639  0.2351  1.2506 13.6680  0.0000  1.0000  1.0000
-  4.9515  4.7443 -0.0940  0.2015  0.0937  0.9851  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  4.0676  6.5907 -0.9954  0.5256  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.6615  0.0000  0.0000  0.0000  0.4109 -0.0124  0.0000  5.0000  0.7624  1.7559  0.0000  0.0000  0.0000  2.1980  0.0000  7.7462  0.0464  1.2286 13.6510  0.0000  1.0000  1.0000
-  1.3756  5.7507 -0.3328  0.2807  0.1076  0.9840  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.8237  5.4904 -0.9852  0.3500  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.5274  0.0000  0.0000  0.0000 -0.6671 -0.1529  0.0000  5.0000  0.8136  1.7791  0.0000  0.0000  0.0000  1.6484  0.0000  7.5686  0.0357  1.6118 13.7170  0.0000  1.0000  1.0000
+  0.0347  4.6020  0.5833  1.0000  0.3677  0.9991  5.8569 21.0430 16.0120  8.1515  3.2521  6.1059 -0.1580  0.4130  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.9253  0.0000 -0.0017  0.0000  1.1051  0.6858  0.0100  5.0000  0.3810  0.3766  0.0000  0.0000  0.0000  0.3454  0.0000  0.2876  9.1192 13.9850 11.7170  6.2102  1.0000  1.0000 ! THIS LINE MODIFIED  Asp hafl cavity term and epsilon change to 0.0347
+  4.1279  4.8014  0.6467 -1.0000  0.3064  0.9796 7.9620 12.5980 -0.6847  8.2577  3.5941  6.1286  0.5130 -0.6287  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.8843  0.0000  3.0353  0.0000  0.0045 -1.0018  0.0100  5.0000  0.3810  0.3766  0.0000  0.0000  0.0000  0.1035  0.0000  0.5770 19.6020  6.8981 18.2520  0.8539  1.0000  1.0000 !THIS LINE MODIFIED His half cativity term due to high acceleration
+  4.4737  5.4774  0.0181 -0.9999  0.0493  0.9407 17.8620 12.5980 -0.6845  8.2581  4.7768  8.9679 -0.0259 -0.9108  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.6692  0.0000  0.6391  0.0000  0.0137 -3.1452  0.0100  5.0000  0.3810  0.3766  0.0000  0.0000  0.0000  0.0203  0.0000  0.1738 27.9170  0.5064 17.6720  1.9348  1.0000  1.0000  Arg
+  3.2875  4.5882  0.7067 -1.0000  0.5922  0.9812 15.8620 12.5980 -0.6847  8.2577  3.7986  6.4772  0.3813 -0.1511  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.4581  0.0000  2.6420  0.0000 -0.0305 -1.8705  0.0100  5.0000  0.3810  0.3766  0.0000  0.0000  0.0000  0.1948  0.0000  0.3185 19.6100  6.8603 18.2340  0.8539  1.0000  1.0000  Lys 
+  1.4866  3.9380  0.0846  0.4369  0.8657  0.0849  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  4.1170  6.2087  0.3330  0.0081  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.3702  0.0000  0.0000  0.0000  1.2309  0.1579  0.0000  5.0000  0.6976  1.4252  0.0000  0.0000  0.0000  1.5132  0.0000  7.4036  0.0363  0.8952 13.6840  0.0000  1.0000  1.0000  Pro
+  0.1567  4.6094  0.4496  0.1023 -0.9998 -0.1723  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.4369  3.9490 -0.8774  0.3148  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  2.8745  0.0000  0.0000  0.0000  3.0813  0.2333  0.0000  5.0000  1.8847  2.0403  0.0000  0.0000  0.0000  1.7847  0.0000 12.0140  7.4670  6.1026 13.6260  0.0000  1.0000  1.0000  SMet
+  0.6738  4.5858 -0.0217  0.3581 -0.9436  0.8502  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.1814  5.1114 -0.9830 -0.9396  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.0907  0.0000  0.0000  0.0000  1.2890  0.1120  0.0000  5.0000  0.4529  1.6272  0.0000  0.0000  0.0000  1.6273  0.0000  7.4321  0.0349  1.5069 13.7270  0.0000  1.0000  1.0000   Dap
+  0.0348  4.5057 -0.0451  0.4687 -0.8778  0.8696  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.4849  6.2828 -0.6420  0.0521  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.9028  0.0000  0.0000  0.0000  1.0944 -0.0122  0.0000  5.0000  0.4864  1.6491  0.0000  0.0000  0.0000  1.4593  0.0000  7.6639  0.2351  1.2506 13.6680  0.0000  1.0000  1.0000   Aib
+  0.0348  4.5057 -0.0451  0.4687 -0.8778  0.8696  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.4849  6.2828 -0.6420  0.0521  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  1.9028  0.0000  0.0000  0.0000  1.0944 -0.0122  0.0000  5.0000  0.4864  1.6491  0.0000  0.0000  0.0000  1.4593  0.0000  7.6639  0.2351  1.2506 13.6680  0.0000  1.0000  1.0000   Osep Abu
+  4.9515  4.7443 -0.0940  0.2015  0.0937  0.9851  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  4.0676  6.5907 -0.9954  0.5256  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.6615  0.0000  0.0000  0.0000  0.4109 -0.0124  0.0000  5.0000  0.7624  1.7559  0.0000  0.0000  0.0000  2.1980  0.0000  7.7462  0.0464  1.2286 13.6510  0.0000  1.0000  1.0000   OSep OTyr
+  1.3756  5.7507 -0.3328  0.2807  0.1076  0.9840  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.8237  5.4904 -0.9852  0.3500  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.5274  0.0000  0.0000  0.0000 -0.6671 -0.1529  0.0000  5.0000  0.8136  1.7791  0.0000  0.0000  0.0000  1.6484  0.0000  7.5686  0.0357  1.6118 13.7170  0.0000  1.0000  1.0000   OSer Othr 
   2.5864  5.3061 -0.0998 -0.9451 -0.6240  0.9845  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  3.6271  6.2568 -0.9769  0.2448  1  0.0000  0.0000  0.0000  0.0000  0.4465  0.0000  0.0000  0.0000 -0.7541 -0.4657  0.0000  5.0000  1.1404  1.8306  0.0000  0.0000  0.0000  2.0027  0.0000  7.5890  0.0347  1.4591 13.6770  0.0000  1.0000  1.0000   !OSer