13	21:02	cd ..
    14	21:02	/users2/CASP12/EXAMPLES/all-atom/amber_files/refine.sh T0892_wfCPUNK_allatom-1.pdb
    15	21:02	ls -lt | more
    16	21:02	mv RST.dat zakresy.csv casp_opt/
    17	21:02	vi noh.pdb
    18	21:03	mv noh.pdb casp_opt/
    19	21:03	cp T0892_wfCPUNK_allatom-1.pdb casp_opt/
    20	21:03	cd casp_opt/
    21	21:03	ls
    22	4:42	cd MAXLIK
    23	4:42	ls
    24	4:43	cd
    25	4:43	cd unres
    26	4:43	ls
    27	4:43	cd source
    28	4:43	ls
    29	4:43	cd maxlik
    30	4:43	ls -lt | more
    31	4:43	cd rc_MD_T_maxlik-NEWCORR
    32	4:43	cd src_MD_T_maxlik-NEWCORR
    33	4:43	ls -lt | more
    34	4:43	more ~/INTEL
    35	4:43	source /opt/intel/Compiler/11.1/046/bin/ifortvars.csh intel64
    36	4:43	vi Makefile
    37	4:44	ls -lt | more
    38	4:44	vi zscorez.F
    39	5:10	vi zscorez.F
    40	5:16	cd ..
    41	5:16	ls
    42	5:18	cd ..
    43	5:18	ls
    44	5:36	cd maxlik
    45	5:36	ls
    46	5:36	cd src_MD_T_maxlik-NEWCORR/
    47	5:38	vi zscorez.F
    48	5:39	vi zscorez.F
    49	5:49	ls
    50	5:49	make clean
    51	5:49	ls
    52	5:50	cd ..
    53	5:50	ls
    54	5:50	cp -rp src_MD_T_maxlik-NEWCORR src_FPy
    55	5:50	cd src_FPy/
    56	5:50	ls
    57	5:50	ls
    58	5:51	f2py -h
    59	5:51	f2py -h zscorez.pyf zscorez.F
    60	5:52	ls -lt | more
    61	5:52	vi zscorez.pyf
    62	5:54	vi Makefile
    63	5:56	make
    64	5:56	łs
    65	5:56	ls -l Makefile*
    66	5:56	rm Makefile
    67	5:57	ln -s Makefile-piasek Makefile
    68	5:57	make
    69	5:57	vi Makefile
    70	5:58	make clean
    71	5:58	make
    72	5:58	ls -lt | more
    73	6:02	f2py -c --fcompiler=intelem *.o --verbose zscore.pyf
    74	6:03	ls zsco*
    75	6:03	f2py -c --fcompiler=intelem *.o --verbose zscorez.pyf
    76	6:03	vi *.pyf
    77	6:05	vi *.pyf
    78	6:07	vi *.pyf
    79	6:08	cp zscorez.pyf zscorez.pyf.safe
    80	6:08	vi zscorez.pyf
    81	6:09	f2py -c --fcompiler=intelem *.o --verbose zscorez.pyf
    82	6:09	vi zscorez.pyf
    83	6:11	f2py -c --fcompiler=intelem *.o --verbose zscorez.pyf
    84	6:12	ls
    85	6:12	f2py -c --fcompiler=intelem *.o --verbose zscorez.pyf
    86	6:15	vi zscorez.pyf
    87	6:16	f2py -c --fcompiler=intelem *.o --verbose zscorez.pyf -m zscore
    88	6:16	ll -tr
    89	6:16	ls -tr
    90	6:16	f2py -c --fcompiler=intelem *.o --verbose zscorez.pyf -m zscore
    91	6:18	vi zscorez.pyf
    92	6:18	f2py -c --fcompiler=intelem *.o --verbose zscorez.pyf
    93	6:20	vi zscorez.pyf
    94	6:21	vi DIMENSIONS
    95	6:22	f2py -h DIMENSIONS.pyf DIMENSIONS
    96	6:22	vi DIMENSIONS.pyf
    97	6:22	vi zscorez.F
    98	6:24	vi zscorez.pyf
    99	6:25	vi zscorez.F
   100	6:26	vi zscorez.F
   101	6:27	f2py -h zscorez.pyf zscorez
   102	6:27	ls -lt | more
   103	6:27	f2py -h zscorez.pyf zscorez.F
   104	6:27	f2py --overwrite -h zscorez.pyf zscorez.F
   105	6:28	f2py --overwrite-signature -h zscorez.pyf zscorez.F
   106	6:28	vi zscorez.pyf
   107	6:29	vi zscorez.F
   108	6:29	vi zscorez.pyf
   109	6:30	vi DIMENSIONS
   110	6:32	vi zscorez.F
   111	6:39	history
   112	6:41	history > commands.txt