#PBS -N test_server
#PBS -q express
#PBS -l nodes=1:ppn=4

#-----------------------------------------------------------------------------
setenv UNRES_BIN /users2/czarek/UNRES/run/ADAM/unres-mult-symetr_KCC_ifort_MPICH-NEWCORR-SAXS-NMRAMB-Bfac.exe
#-----------------------------------------------------------------------------
setenv DD /users2/czarek/UNRES/PARAM
setenv BONDPAR $DD/bond_AM1_ext_dum.parm
setenv THETPAR $DD/theta_opt.parm.OPT_TRP1_FSD_Villin_E0L_QHK_N9L_LX7_BDD_I18
setenv THETPARPDB $DD/thetaml_ext.5parm
setenv ROTPARPDB $DD/scgauss_ext.parm
setenv ROTPAR $DD/rotamers_AM1_aura_ext.10022007.parm
setenv TORPAR $DD/torsion_abinitio.parm-2d-all-DL-03-02-2cos
setenv TORDPAR $DD/pot_tord_G631_DIL_ext.parm
setenv ELEPAR $DD/electr_631Gdp_ext.parm
setenv SIDEPAR $DD/scinter_GB_ext_lip.parm
setenv FOURIER $DD/fourier_opt.parm.OPT_TRP1_FSD_Villin_E0L_QHK_N9L_LX7_BDD_I18
setenv SCCORPAR $DD/sccor_am1_pawel_ext.dat
setenv SCPPAR $DD/scp_ext.parm
setenv PATTERN $DD/patterns.cart
setenv LIPTRANPAR $DD/Lip_tran_initial_ext.parm
#-----------------------------------------------------------------------------
cd $PBS_O_WORKDIR

setenv MPIRUN "/users2/local/mpich2-1.4.1p1_intel/bin/mpirun "
set NPROCS=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l`

setenv FGPROCS 4
setenv POT GB
setenv PREFIX file
setenv OUT1FILE YES

$MPIRUN -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS $UNRES_BIN

/users2/local/pymol_1.6/pymol -c ../files/pdb.pml

touch finished
