#PBS -N test_MREMD
#PBS -q infiniband
#PBS -l nodes=2:ppn=8
#PBS -l walltime=4:00:00

setenv FGPROCS 1
setenv POT GB
#ssetenv PREFIX min_UNRES
#setenv PREFIX 1L2Y_min-rand-oneletter
#setenv PREFIX 1L2Y_min-rand
#setenv PREFIX 1L2Y_min-fulloutput
#setenv PREFIX 1L2Y_checkgrad0
#setenv PREFIX 1L2Y_ene
setenv PREFIX 1L2Y_MREMD
setenv OUT1FILE YES
#-----------------------------------------------------------------------------
setenv UNRES_BIN /users2/emilial/unres_package/bin/unres_E0LL2Y_F90_EL.exe
#----------------------------------------------------------------------
setenv DD /users/emilial/unres_devel/unres_MD-M/PARAM
#setenv DD /users/aks255/newUNRES/unres/PARAM
setenv BONDPAR $DD/bond_AM1_ext.parm
setenv THETPARPDB $DD/thetaml_ext.5parm
setenv THETPAR $DD/pot_theta_G631_DIL_ext.parm
setenv ROTPARPDB $DD/scgauss_ext.parm
setenv ROTPAR $DD/rotamers_AM1_aura_ext.10022007.parm
setenv TORPAR $DD//pot_tor_G631_DIL_ext.parm
setenv TORDPAR $DD/pot_tord_G631_DIL_ext.parm
setenv ELEPAR $DD/electr_631Gdp_ext.parm
setenv SIDEPAR $DD/scinter_${POT}_ext.parm
#setenv SIDEPAR $DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
setenv FOURIER $DD/fourier_opt_ext.parm.1igd_hc_iter3_3
#setenv FOURIER fourier_opt.parm.1e0l_1enh_PAR5-Sq2-14-ufree_q14sig_shan1e9-a03
#setenv SCCORPAR /users/pk376/unres-git2/unres/PARAM/sccor_am1_pawel_ext.dat
setenv SCCORPAR $DD/sccor_am1_pawel_ext.dat
setenv SCPPAR $DD/scp_ext.parm
setenv PATTERN $DD/patterns.cart
#----------------------------------------------------------------------

setenv MPIRUN "/users/software/mpich2-1.4.1p1_intel/bin/mpirun"
setenv NPROCS `cat $PBS_NODEFILE | wc -l`

cd $PBS_O_WORKDIR
$MPIRUN -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS $UNRES_BIN