start.mat

   1 #PBS -N PROTA
   2 #PBS -q dque
   3 #PBS -l nodes=26:ppn=2
   4 #PBS -l walltime=3:00:00
   5 set NPROCS=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l`
   6
   7 echo $NPROCS processors used
   8
   9 time mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS -nolocal -p4wd $PBS_O_WORKDIR \
  10 $PBS_O_WORKDIR/unresproteinA.csh
  11