source/xdrfpdb/Makefile_ifort

   1 # Set of programs to convert UNRES xdrf format (compressed Cartesian coordinates) to PDF
   2 # or raw-Cartesian format (*.x) or to extract backbone angular coordinates (*.ang)
   3 # The pdb files can be constructed from canonical or MREMD trajectories.
   4 #
   5 # The xdrf library is required
   6 #
   7 # Programs
   8 #
   9 # xdrf2pdb   : converts a single cx trajectory file to PDB format
  10 # xdrf2x     : converts a single cx trajectory file to raw-coordinate (x) format
  11 # xdrf2ang   : extracts backbone angles from a cx trajectory file
  12 # xdrf2pdb-m : converts a selected trajectory of a MREMD run dumpend into a cx file to PDB format
  13 #
  14 # xdrf2pdb1  : converts conformation(s) selected from a wham post-processing run into PDB format
  15 # xdrf2x1    : converts conformation(s) selected from a wham post-processing run into raw (x) format.
  16 #
  17 # 9/23/2010 A. Liwo
  18
  19 FC=ifort
  20 INSTALL_DIR = /users/software/mpich2-1.4.1p1_intel
  21 #FC= ${INSTALL_DIR}/bin/mpif90
  22 BINDIR = ../../bin
  23
  24 #OPT =  -fast
  25 OPT = #-CA -CB
  26
  27 FFLAGS = -fpp -c ${OPT}
  28
  29 CPPFLAGS = -DLINUX -DUNRES -DMP -DMPI -DSPLITELE -DPROCOR -DNEWUNRES -DXDRFPDB -CB -g
  30
  31 M4      = m4
  32 M4FILE  = underscore.m4
  33
  34 .SUFFIXES: .F90
  35 .F90.o:
  36         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} $*.F90
  37 .f90.o:
  38         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} $*.f90
  39 .c.o:
  40         ${CC} -c  ${CPPFLAGS} $*.c
  41
  42 DATA_FILE= ../unres/data
  43
  44 data = names.o io_units.o compare_data.o energy_data.o geometry_data.o MD_data.o
  45 data2 = names.o energy_data.o geometry_data.o
  46
  47 xdrf2pdb: ${data} io_base.o xdrf2pdb.o xdrf/libxdrf.a
  48         ${FC} -Bstatic -o ${BINDIR}/xdrf2pdb-mult ${data} io_base.o xdrf2pdb.o xdrf/libxdrf.a
  49
  50 #xdrf2pdb1: xdrf2pdb1.o geomout.o misc.o rescode.o nazwy.o xdrf/libxdrf.a
  51 #       ${FC} -Bstatic -o ${BINDIR}/xdrf2pdb1-mult xdrf2pdb1.o geomout.o rescode.o misc.o nazwy.o xdrf/libxdrf.a
  52
  53 xdrf2pdb-m: ${data} io_base.o xdrf2pdb-m.o xdrf/libxdrf.a
  54         ${FC} -Bstatic -o ${BINDIR}/xdrf2pdb-m-mult ${data} io_base.o  xdrf2pdb-m.o  xdrf/libxdrf.a
  55
  56 xdrf2x: ${data2} xdrf2x.o xdrf/libxdrf.a
  57         ${FC} -o ${BINDIR}/xdrf2x-mult ${data2} xdrf2x.o xdrf/libxdrf.a
  58
  59 #xdrf2x1: xdrf2x1.o xdrf/libxdrf.a
  60 #       ${FC} -o xdrf2x1-mult xdrf2x1.o xdrf/libxdrf.a
  61
  62 xdrf/libxdrf.a:
  63         cd xdrf && make
  64
  65 clean:
  66         rm -f *.o *.mod
  67
  68
  69 names.o: ${DATA_FILE}/names.F90
  70         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${DATA_FILE}/names.F90
  71
  72 io_units.o: ${DATA_FILE}/io_units.F90
  73         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${DATA_FILE}/io_units.F90
  74
  75 compare_data.o: ${DATA_FILE}/compare_data.F90
  76         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${DATA_FILE}/compare_data.F90
  77
  78 energy_data.o: ${DATA_FILE}/energy_data.F90
  79         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${DATA_FILE}/energy_data.F90
  80
  81 geometry_data.o: ${DATA_FILE}/geometry_data.F90
  82         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${DATA_FILE}/geometry_data.F90
  83
  84 MD_data.o: ${DATA_FILE}/MD_data.F90
  85         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${DATA_FILE}/MD_data.F90
  86
  87 io_base.o: ../unres/io_base.F90
  88         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ../unres/io_base.F90
  89 geometry.o: ../unres/geometry.F90
  90         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ../unres/geometry.F90
  91