source/cluster/Makefile

   1 INSTALL_DIR = /users/software/mpich2-1.4.1p1_intel
   2 #INSTALL_DIR = /users/software/mpich-1.2.7p1_intel-10.1_em64_ssh
   3 #BIN=../bin
   4 #FC = ifort
   5 FC= ${INSTALL_DIR}/bin/mpif90
   6 OPT = -O3 -ip -w
   7 DEB = -g -CA -CB -check pointer #-check uninit
   8 #OPT =  -O3 #-ip
   9 FFLAGS = -fpp -c ${DEB} #${OPT} #-I. -I./include_unres -I$(INSTALL_DIR)/include
  10 FFLAGSE = -fpp -c ${DEB} #${OPT} #-I. -I./include_unres -I$(INSTALL_DIR)/include
  11 FFLAGS2 = -fpp -c -g -CA -CB #-O0
  12 #OPT = -CB -g
  13 #FFLAGS =  ${OPT} -c -I. -Iinclude_unres -I$(INSTALL_DIR)/include
  14 #CPPFLAGS = -DLINUX -DPGI -DSPLITELE -DPROCOR -DMP -DMPI
  15 #LIBS = -L$(INSTALL_DIR)/lib -lmpich xdrf/libxdrf.a -g -d2 -CA -CB
  16
  17 #.c.o:
  18 #       cc -c -DLINUX -DPGI $*.c
  19
  20 #.f.o:
  21 #       ${FC} ${FFLAGS} $*.f
  22
  23 #.F.o:
  24 #       ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${FFLAGS} $*.F
  25 #UNRES_FILE= ../../UNRESS/unres_f90/source/unres_MD-M
  26 UNRES_FILE= ../unres
  27 UNRES_DATA_FILE= ../unres/data
  28 WHAM_FILE= ../wham
  29
  30 data = clust_data.o
  31 #w_compar_data.o w_comm_local.o
  32
  33 data_unres = names.o io_units.o control_data.o calc_data.o \
  34         compare_data.o control_data.o minim_data.o MD_data.o\
  35         energy_data.o geometry_data.o MPI_data.o MCM_data.o comm_local.o
  36
  37 objects_unres = xdrf/*.o math.o geometry.o \
  38         io_base.o energy.o regularize.o control.o io_config.o
  39
  40
  41 #compare_data.o control_data.o minim_data.o CSA_data.o
  42 objects_wham = wham_data.o conform_compar.o io_wham.o work_partition.o
  43
  44 objects = track.o hc.o io_clust.o probabl.o cluster.o
  45
  46 all: no_option
  47         @echo "Specify force field: GAB or E0LL2Y"
  48
  49 no_option:
  50
  51 GAB: CPPFLAGS = -DPROCOR -DLINUX -DPGI -DUNRES -DISNAN -DMP -DMPI \
  52         -DSPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DCLUSTER
  53 GAB: EXE_FILE = ../../bin/cluster_GAB_F90_EL.exe
  54 GAB: ${data} ${data_unres} ${objects_unres} ${objects_wham} ${objects}
  55         $(FC) ${OPT} ${data} ${data_unres} ${objects_unres} ${objects_wham} ${objects} -o ${EXE_FILE}
  56 #       $(FC) ${OPT} ${objects} ${LIBS} -o ${BIN}/unres_clustMD-mult_MPICH-GAB.exe
  57
  58 E0LL2Y: CPPFLAGS = -DPROCOR -DLINUX -DPGI -DUNRES -DISNAN -DMP -DMPI \
  59         -DSPLITELE -DLANG0 -DCLUSTER
  60 E0LL2Y: EXE_FILE = ../../bin/cluster_E0LL2Y_F90_EL.exe
  61 E0LL2Y: ${data} ${data_unres} ${objects_unres} ${objects_wham} ${objects}
  62         $(FC) ${OPT} ${data} ${data_unres} ${objects_unres} ${objects_wham} ${objects} -o ${EXE_FILE}
  63 #       $(FC) ${OPT} ${objects} ${LIBS} -o ${BIN}/unres_clustMD-mult_MPICH-E0LL2Y.exe
  64
  65 xdrf/*.o:
  66         cd xdrf && make
  67
  68 clean:
  69         rm -f *.o && rm -f *.mod && rm -f compinfo && cd xdrf && make clean
  70 #       rm -f *.o && rm -f *.mod && rm ${EXE_FILE} && rm -f compinfo && cd xdrf && make clean
  71
  72
  73 clust_data.o: clust_data.f90
  74         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} clust_data.f90
  75
  76 wham_data.o: ${WHAM_FILE}/wham_data.f90
  77         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${WHAM_FILE}/wham_data.f90
  78
  79
  80 names.o: ${UNRES_DATA_FILE}/names.f90
  81         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/names.f90
  82
  83 io_units.o: ${UNRES_DATA_FILE}/io_units.f90
  84         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/io_units.f90
  85
  86 calc_data.o: ${UNRES_DATA_FILE}/calc_data.f90
  87         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/calc_data.f90
  88
  89 compare_data.o: ${UNRES_DATA_FILE}/compare_data.f90
  90         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/compare_data.f90
  91
  92 control_data.o: ${UNRES_DATA_FILE}/control_data.f90
  93         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/control_data.f90
  94
  95 energy_data.o: ${UNRES_DATA_FILE}/energy_data.f90
  96         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/energy_data.f90
  97
  98 geometry_data.o: ${UNRES_DATA_FILE}/geometry_data.f90
  99         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/geometry_data.f90
 100
 101 map_data.o: ${UNRES_DATA_FILE}/map_data.f90
 102         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/map_data.f90
 103
 104 MCM_data.o: ${UNRES_DATA_FILE}/MCM_data.f90
 105         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/MCM_data.f90
 106
 107 MD_data.o: ${UNRES_DATA_FILE}/MD_data.f90
 108         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/MD_data.f90
 109
 110 minim_data.o: ${UNRES_DATA_FILE}/minim_data.f90
 111         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/minim_data.f90
 112
 113 MPI_data.o: ${UNRES_DATA_FILE}/MPI_data.f90
 114         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/MPI_data.f90
 115
 116 comm_local.o: ${UNRES_DATA_FILE}/comm_local.f90
 117         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_DATA_FILE}/comm_local.f90
 118
 119 math.o: ${UNRES_FILE}/math.f90
 120         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_FILE}/math.f90
 121
 122 geometry.o: ${UNRES_FILE}/geometry.f90
 123         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_FILE}/geometry.f90
 124
 125 io_base.o: ${UNRES_FILE}/io_base.f90
 126         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_FILE}/io_base.f90
 127
 128 energy.o: ${UNRES_FILE}/energy.f90
 129         ${FC} ${FFLAGSE} ${CPPFLAGS} ${UNRES_FILE}/energy.f90
 130
 131 control.o: ${UNRES_FILE}/control.f90
 132         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_FILE}/control.f90
 133
 134 io_config.o: ${UNRES_FILE}/io_config.f90
 135         ${FC} ${FFLAGS2} ${CPPFLAGS} ${UNRES_FILE}/io_config.f90
 136
 137 regularize.o: ${UNRES_FILE}/regularize.f90
 138         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${UNRES_FILE}/regularize.f90
 139
 140
 141 proc_proc.o: proc_proc.c
 142         ${CC} ${CPPFLAGS} -O -c proc_proc.c
 143
 144 io_wham.o: ${WHAM_FILE}/io_wham.f90
 145         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${WHAM_FILE}/io_wham.f90
 146
 147 conform_compar.o: ${WHAM_FILE}/conform_compar.f90
 148         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${WHAM_FILE}/conform_compar.f90
 149
 150 work_partition.o: ${WHAM_FILE}/work_partition.f90
 151         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} ${WHAM_FILE}/work_partition.f90
 152
 153 probabl.o: probabl.f90
 154         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} probabl.f90
 155
 156 track.o: track.f90
 157         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} track.f90
 158
 159 hc.o: hc.f90
 160         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} hc.f90
 161
 162 io_clust.o: io_clust.f90
 163         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} io_clust.f90
 164
 165 cluster.o: cluster.f90
 166         ${FC} ${FFLAGS} ${CPPFLAGS} cluster.f90