files/pdb.pml

   1 import show_UNRES
   2
   3 load file_GB000.pdb,unres
   4
   5 zoom buffer=10
   6
   7 hide all
   8 bg_color white
   9 color grey
  10
  11 show unres,unres
  12 show stick, unres
  13 png unres.png,500,400,ray=1
  14
  15 save unres.pse
  16
  17 load plik.pdb,ref
  18
  19
  20 hide all
  21 align unres,ref
  22
  23 zoom
  24
  25
  26 spectrum count,rainbow,ref
  27 spectrum count,rainbow,unres
  28 show cartoon,ref
  29 show sticks,ref and (cys/ca+cb+sg) and byres (cys/sg and bound_to cys/sg)
  30 show sticks,unres and name CA
  31 show sticks,unres and (CYS/CA+CB) and byres (CYS/CB and bound_to CYS/CB)
  32 png unres_overlap.png,500,400,ray=1
  33
  34