CMakeLists.txt

   1 #
   2 # CMake project file for WHAM single chain version
   3 #
   4
   5 enable_language (Fortran)
   6
   7 #================================
   8 # Set source file lists
   9 #================================
  10 set(UNRES_WHAM_SRC0
  11         wham_multparm.F
  12         bxread.F
  13         xread.F
  14         cxread.F
  15         enecalc1.F
  16         energy_p_new.F
  17         initialize_p.F
  18         molread_zs.F
  19         openunits.F
  20         readrtns.F
  21         arcos.f
  22         cartder.f
  23         cartprint.f
  24         chainbuild.f
  25         geomout.F
  26         gnmr1.f
  27         icant.f
  28         intcor.f
  29         int_from_cart.f
  30         make_ensemble1.F
  31         matmult.f
  32         misc.f
  33         mygetenv.F
  34         parmread.F
  35         pinorm.f
  36         printmat.f
  37         rescode.f
  38         setup_var.f
  39         slices.F
  40         ssMD.F
  41         store_parm.F
  42         timing.F
  43         wham_calc1.F
  44         readrtns_compar.F
  45         readpdb.f
  46         fitsq.f
  47         contact.f
  48         elecont.f
  49         contfunc.f
  50         cont_frag.f
  51         conf_compar.F
  52         match_contact.f
  53         angnorm.f
  54         odlodc.f
  55         promienie.f
  56         qwolynes.f
  57         read_ref_str.F
  58         rmscalc.f
  59         secondary.f
  60         proc_cont.f
  61         define_pairs.f
  62         mysort.f
  63 )
  64
  65 set(UNRES_WHAM_PP_SRC
  66         bxread.F
  67         chainbuild.F
  68         conf_compar.F
  69         cxread.F
  70         enecalc1.F
  71         energy_p_new.F
  72         geomout.F
  73         initialize_p.F
  74         make_ensemble1.F
  75         molread_zs.F
  76         mygetenv.F
  77         openunits.F
  78         parmread.F
  79         read_ref_str.F
  80         readrtns_compar.F
  81         readrtns.F
  82         slices.F
  83         ssMD.F
  84         store_parm.F
  85         timing.F
  86         wham_calc1.F
  87         wham_multparm.F
  88         xread.F
  89         proc_proc.c
  90 )
  91
  92
  93 #================================================
  94 # Set comipiler flags for different sourcefiles
  95 #================================================
  96 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
  97   set(FFLAGS0 "-mcmodel=medium -g -CB -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
  98 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
  99   set(FFLAGS0 "-std=legacy -g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 100 else ()
 101   set(FFLAGS0 "-g -I. -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/include_unres" )
 102 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 103
 104
 105 #=========================================
 106 # Add MPI compiler flags
 107 #=========================================
 108 if(UNRES_WITH_MPI)
 109   set(FFLAGS0 "${FFLAGS0} -I${MPI_Fortran_INCLUDE_PATH}")
 110 endif(UNRES_WITH_MPI)
 111
 112 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_SRC0} PROPERTY COMPILE_FLAGS ${FFLAGS0} )
 113
 114 #=========================================
 115 #  Settings for GAB force field
 116 #=========================================
 117
 118 if(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB" )
 119   # set preprocesor flags
 120   set(CPPFLAGS "PROCOR -DSPLITELE -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC  -DSCCORPDB" )
 121
 122 #=========================================
 123 #  Settings for E0LL2Y force field
 124 #=========================================
 125 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "E0LL2Y")
 126   # set preprocesor flags
 127   set(CPPFLAGS "PROCOR  -DSPLITELE -DSCCORPDB" )
 128 elseif(UNRES_MD_FF STREQUAL "4P")
 129   set(CPPFLAGS "SPLITELE -DLANG0 -DCRYST_BOND -DCRYST_THETA -DCRYST_SC -DSCCORPDB" )
 130 endif(UNRES_MD_FF STREQUAL "GAB")
 131
 132
 133 #=========================================
 134 # Additional flags
 135 #=========================================
 136 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DUNRES -DISNAN -DWHAM ")
 137
 138
 139 #=========================================
 140 # System specific flags
 141 #=========================================
 142 if(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 143   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DLINUX")
 144 endif(${CMAKE_SYSTEM_NAME} MATCHES "Linux")
 145
 146 #=========================================
 147 # Compiler specific flags
 148 #=========================================
 149
 150 if (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 151   # Add ifort preprocessor flags
 152   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DPGI")
 153 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "f95")
 154   # Add new gfortran flags
 155   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 156 elseif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "gfortran")
 157   # Add old gfortran flags
 158   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DG77")
 159 endif (Fortran_COMPILER_NAME STREQUAL "ifort")
 160
 161 #=========================================
 162 # Add MPI preprocessor flags
 163 #=========================================
 164 set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DMPI")
 165
 166 #=========================================
 167 # Add 64-bit specific preprocessor flags
 168 #=========================================
 169 if (architektura STREQUAL "64")
 170   set(CPPFLAGS "${CPPFLAGS} -DAMD64")
 171 endif (architektura STREQUAL "64")
 172
 173 #=========================================
 174 # Apply preprocesor flags to *.F files
 175 #=========================================
 176 set_property(SOURCE ${UNRES_WHAM_PP_SRC} PROPERTY COMPILE_DEFINITIONS ${CPPFLAGS} )
 177
 178
 179 #========================================
 180 #  Setting binary name
 181 #========================================
 182 set(UNRES_WHAM_BIN "wham_${Fortran_COMPILER_NAME}_MPI_${UNRES_MD_FF}.exe")
 183
 184 #=========================================
 185 # cinfo.f workaround for CMake
 186 #=========================================
 187 # get the current date
 188 TODAY(DATE)
 189 # generate cinfo.f
 190
 191 set(CINFO "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f")
 192 FILE(WRITE ${CINFO}
 193 "C CMake generated file
 194        subroutine cinfo
 195        include 'COMMON.IOUNITS'
 196        write(iout,*)'++++ Compile info ++++'
 197        write(iout,*)'Version ${UNRES_MAJOR}.${UNRES_MINOR} build ${UNRES_PATCH}'
 198 ")
 199
 200 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled" "${DATE}" )
 201 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Compiled by" "$ENV{USER}@$ENV{HOST}" )
 202 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS name:" "${CMAKE_SYSTEM_NAME}" )
 203 CINFO_FORMAT(${CINFO} "OS release:" "${CMAKE_SYSTEM}" )
 204 CINFO_FORMAT(${CINFO} "Fortran Compiler:" "${CMAKE_Fortran_COMPILER}" )
 205 CINFO_FORMAT(${CINFO} "MD Force field:" "${UNRES_MD_FF}" )
 206 CINFO_FORMAT(${CINFO} "CPPFLAGS =" "${CPPFLAGS}")
 207
 208 FILE(APPEND ${CINFO}
 209 "       write(iout,*)'++++ End of compile info ++++'
 210        return
 211        end ")
 212
 213 # set include path
 214 set_property(SOURCE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f PROPERTY COMPILE_FLAGS "${FFLAGS0} -I${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}" )
 215
 216 #=========================================
 217 # Set full unres CSA sources
 218 #=========================================
 219 set(UNRES_WHAM_SRCS ${UNRES_WHAM_SRC0} ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cinfo.f proc_proc.c)
 220
 221 #=========================================
 222 # Build the binary
 223 #=========================================
 224 add_executable(UNRES_WHAM_BIN ${UNRES_WHAM_SRCS} )
 225 set_target_properties(UNRES_WHAM_BIN PROPERTIES OUTPUT_NAME ${UNRES_WHAM_BIN})
 226 set_property(TARGET UNRES_WHAM_BIN PROPERTY RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${CMAKE_BINARY_DIR}/bin )
 227 #add_dependencies (${UNRES_BIN} ${UNRES_XDRFLIB})
 228
 229 #=========================================
 230 # Link libraries
 231 #=========================================
 232 # link MPI libraries
 233 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN ${MPI_Fortran_LIBRARIES} )
 234 # link libxdrf.a
 235 target_link_libraries( UNRES_WHAM_BIN xdrf )
 236
 237 #=========================================
 238 # Install Path
 239 #=========================================
 240 install(TARGETS UNRES_WHAM_BIN DESTINATION ${CMAKE_INSTALL_PREFIX}/wham)
 241
 242
 243 #=========================================
 244 # TESTS
 245 #=========================================
 246
 247 #-- Copy all the data files from the test directory into the source directory
 248 #SET(UNRES_TEST_FILES
 249 #       ala10.inp
 250 #    )
 251
 252 #FOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 253 #      SET (unres_test_dest "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${UNRES_TEST_FILE}")
 254 #      MESSAGE (STATUS " Copying ${UNRES_TEST_FILE} from ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} to ${unres_test_dest}")
 255 #      ADD_CUSTOM_COMMAND (
 256 #          TARGET     ${UNRES_BIN}
 257 #          POST_BUILD
 258 #          COMMAND    ${CMAKE_COMMAND} -E copy ${CMAKE_SOURCE_DIR}/examples/unres/MD/ff_gab/${UNRES_TEST_FILE} ${unres_test_dest}
 259 #      )
 260 #ENDFOREACH (UNRES_TEST_FILE ${UNRES_TEST_FILES})
 261
 262 #=========================================
 263 # Generate data test files
 264 #=========================================
 265 #  test_single_ala.sh
 266 #=========================================
 267
 268 #FILE(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh
 269 #"#!/bin/sh
 270 #export POT=GB
 271 #export PREFIX=ala10
 272 #-----------------------------------------------------------------------------
 273 #UNRES_BIN=./${UNRES_BIN}
 274 #-----------------------------------------------------------------------------
 275 #DD=${CMAKE_SOURCE_DIR}/PARAM
 276 #export BONDPAR=$DD/bond.parm
 277 #export THETPAR=$DD/thetaml.5parm
 278 #export ROTPAR=$DD/scgauss.parm
 279 #export TORPAR=$DD/torsion_631Gdp.parm
 280 #export TORDPAR=$DD/torsion_double_631Gdp.parm
 281 #export ELEPAR=$DD/electr_631Gdp.parm
 282 #export SIDEPAR=$DD/sc_GB_opt.1gab_3S_qclass5no310-shan2-sc-16-10-8k
 283 #export FOURIER=$DD/fourier_opt.parm.1igd_hc_iter3_3
 284 #export SCPPAR=$DD/scp.parm
 285 #export SCCORPAR=$DD/rotcorr_AM1.parm
 286 #export PATTERN=$DD/patterns.cart
 287 #-----------------------------------------------------------------------------
 288 #$UNRES_BIN
 289 #")
 290
 291 #=========================================
 292 #  ala10.inp
 293 #=========================================
 294
 295 #file(WRITE ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/ala10.inp
 296 #"ala10 unblocked
 297 #SEED=-1111333 MD ONE_LETTER rescale_mode=2 PDBOUT
 298 #nstep=15000 ntwe=100 ntwx=1000 dt=0.1 lang=0 tbf t_bath=300 damax=1.0          &
 299 #reset_moment=1000 reset_vel=1000 MDPDB
 300 #WLONG=1.35279 WSCP=1.59304 WELEC=0.71534 WBOND=1.00000 WANG=1.13873            &
 301 #WSCLOC=0.16258 WTOR=1.98599 WTORD=1.57069 WCORRH=0.42887 WCORR5=0.00000        &
 302 #WCORR6=0.00000 WEL_LOC=0.16036 WTURN3=1.68722 WTURN4=0.66230 WTURN6=0.00000    &
 303 #WVDWPP=0.11371 WHPB=1.00000                                                    &
 304 #CUTOFF=7.00000 WCORR4=0.00000
 305 #12
 306 #XAAAAAAAAAAX
 307 # 0
 308 # 0
 309 #   90.0000   90.0000   90.0000  90.000   90.000   90.000   90.000   90.000
 310 #   90.0000   90.0000
 311 #  180.0000  180.0000  180.0000 180.000  180.000  180.000  180.000  180.000
 312 #  180.0000
 313 #  110.0000  110.0000  110.0000 100.000  110.000  100.000  110.000  110.000
 314 #  110.0000  110.0000
 315 # -120.0000 -120.0000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000 -120.000
 316 # -120.0000 -120.0000
 317 #")
 318
 319
 320 # Add tests
 321
 322 #if(NOT UNRES_WITH_MPI)
 323
 324 #  add_test(NAME UNRES_MD_Ala10 COMMAND sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_single_ala.sh )
 325
 326 #endif(NOT UNRES_WITH_MPI)